FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0498, 1054 aa
1>>>pF1KE0498 1054 - 1054 aa - 1054 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2473+/-0.00105; mu= 18.4412+/- 0.063
mean_var=107.0717+/-21.019, 0's: 0 Z-trim(106.9): 66 B-trim: 7 in 1/49
Lambda= 0.123947
statistics sampled from 9164 (9227) to 9164 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 4.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1054) 6969 1257.8 0
CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1070) 6927 1250.3 0
CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058) 3600 655.4 1.8e-187
CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052) 2887 527.9 4.4e-149
CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302) 1166 220.4 3.5e-56
CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581) 1166 220.5 3.8e-56
CCDS45485.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2881) 1155 218.5 1.6e-55
CCDS76865.1 CHD9 gene_id:80205|Hs108|chr16 (2897) 1155 218.5 1.6e-55
CCDS47865.1 CHD7 gene_id:55636|Hs108|chr8 (2997) 1146 216.9 5.1e-55
CCDS13317.1 CHD6 gene_id:84181|Hs108|chr20 (2715) 1143 216.4 6.9e-55
CCDS927.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 897) 1089 206.3 2.4e-52
CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230) 916 175.8 1.3e-42
CCDS72882.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 797) 867 166.6 1.9e-40
CCDS54218.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1613) 758 147.3 2.4e-34
CCDS54217.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1614) 758 147.3 2.4e-34
CCDS45973.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1616) 758 147.3 2.4e-34
CCDS45972.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1617) 758 147.3 2.4e-34
CCDS12253.1 SMARCA4 gene_id:6597|Hs108|chr19 (1647) 758 147.4 2.5e-34
CCDS32555.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (1966) 733 142.9 6.3e-33
CCDS32554.1 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2000) 733 142.9 6.4e-33
CCDS32553.2 CHD3 gene_id:1107|Hs108|chr17 (2059) 733 143.0 6.5e-33
CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572) 724 141.3 1.6e-32
CCDS34977.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1590) 724 141.3 1.6e-32
CCDS10374.2 CHD2 gene_id:1106|Hs108|chr15 (1828) 714 139.5 6.3e-32
CCDS57.1 CHD5 gene_id:26038|Hs108|chr1 (1954) 690 135.2 1.3e-30
CCDS7229.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1493) 686 134.4 1.7e-30
CCDS76510.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1905) 686 134.5 2.1e-30
CCDS8552.1 CHD4 gene_id:1108|Hs108|chr12 (1912) 686 134.5 2.1e-30
CCDS34204.1 CHD1 gene_id:1105|Hs108|chr5 (1710) 676 132.7 6.6e-30
CCDS31929.2 EP400 gene_id:57634|Hs108|chr12 (3123) 676 132.9 1.1e-29
CCDS83338.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1514) 628 124.1 2.3e-27
CCDS73164.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 700) 434 89.1 3.5e-17
CCDS73165.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 714) 434 89.1 3.6e-17
CCDS73163.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 740) 434 89.2 3.7e-17
CCDS7434.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 838) 434 89.2 4.1e-17
CCDS73162.1 HELLS gene_id:3070|Hs108|chr10 ( 884) 434 89.2 4.2e-17
CCDS58022.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 616) 400 83.0 2.2e-15
CCDS58021.1 CHD1L gene_id:9557|Hs108|chr1 ( 693) 400 83.1 2.4e-15
CCDS532.1 RAD54L gene_id:8438|Hs108|chr1 ( 747) 385 80.4 1.6e-14
CCDS10071.1 INO80 gene_id:54617|Hs108|chr15 (1556) 383 80.3 3.6e-14
CCDS33765.2 RAD54L2 gene_id:23132|Hs108|chr3 (1467) 328 70.4 3.2e-11
CCDS35329.1 ERCC6L gene_id:54821|Hs108|chrX (1250) 326 70.0 3.6e-11
CCDS7419.1 BTAF1 gene_id:9044|Hs108|chr10 (1849) 325 70.0 5.5e-11
CCDS75768.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8 ( 726) 316 68.0 8.2e-11
CCDS6262.1 RAD54B gene_id:25788|Hs108|chr8 ( 910) 316 68.1 9.7e-11
>>CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1054 aa)
initn: 6969 init1: 6969 opt: 6969 Z-score: 6734.9 bits: 1257.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6969; 100.0% identity (100.0% similar) in 1054 aa overlap (1-1054:1-1054)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDEH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 IVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 IVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEE
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550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 REDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQQSNKL
610 620 630 640 650 660
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP
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790 800 810 820 830 840
pF1KE0 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP
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850 860 870 880 890 900
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAREVEGKSPEEVMEYSA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQYGTSKGK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIKSRTAMEFQRRCNTLI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050
pF1KE0 SLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMVKFSAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMVKFSAFS
1030 1040 1050
>>CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1070 aa)
initn: 6927 init1: 6927 opt: 6927 Z-score: 6694.2 bits: 1250.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6927; 100.0% identity (100.0% similar) in 1047 aa overlap (1-1047:1-1047)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSP
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVF
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDEH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 REDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQV
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pF1KE0 DLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQQSNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQQSNKL
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pF1KE0 AKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRM
670 680 690 700 710 720
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pF1KE0 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP
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CCDS76 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP
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pF1KE0 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP
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850 860 870 880 890 900
pF1KE0 LTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAREVEGKSPEEVMEYSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAREVEGKSPEEVMEYSA
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910 920 930 940 950 960
pF1KE0 VFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQYGTSKGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQYGTSKGK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 NYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIKSRTAMEFQRRCNTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIKSRTAMEFQRRCNTLI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050
pF1KE0 SLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMVKFSAFS
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMSQKRKAESATESSGKKDVKKVKS
1030 1040 1050 1060 1070
>>CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058 aa)
initn: 3600 init1: 3600 opt: 3600 Z-score: 3479.0 bits: 655.4 E(32554): 1.8e-187
Smith-Waterman score: 6814; 98.9% identity (98.9% similar) in 1047 aa overlap (1-1047:1-1035)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 GPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 KSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 VFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 KMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 KMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDEH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 IVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 IVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 REDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQV
:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RE------------EAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQV
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610 620 630 640 650 660
pF1KE0 DLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQQSNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQQSNKL
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 AKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 AKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRM
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRP
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pF1KE0 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEP
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 LTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAREVEGKSPEEVMEYSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 LTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAREVEGKSPEEVMEYSA
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 VFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQYGTSKGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 VFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQYGTSKGK
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 NYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIKSRTAMEFQRRCNTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 NYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIKSRTAMEFQRRCNTLI
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050
pF1KE0 SLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMVKFSAFS
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 SLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMSQKRKAESATESSGKKDVKKVKS
1010 1020 1030 1040 1050
>>CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KE0 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKG--EKKKE
: : .. . ::. :. .. ...:: :
CCDS37 MSSAAEPPPPPPPESAPSKPAASIASGGSNSSNKGGPEGVAA
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KE0 KNVSSFQLKLAAKA----------PKSEKEM---DPEYEEKMKADRAKRFEFLLKQTELF
. :.: : : : ..::. :: :::::..:::.:::.::::::::
CCDS37 QAVASAASAGPADAEMEEIFDDASPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANRFEYLLKQTELF
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 AHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTS
::::::.:::.:::::.:: :::::::::::.:.:.:::::::::::::::::.:: :..
CCDS37 AHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKDEKQNLLSVGDYRHRRTEQEEDEELLTESSKAT
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 NVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYL
::: ::: :::::: : :::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::.::::.
CCDS37 NVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWLISLYENGINGILADEMGLGKTLQTISLLGYM
170 180 190 200 210 220
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pF1KE0 KHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDV
:::::::::::::::::::::::.:::::::.:: .:..:::. ::::.:: ..::::::
CCDS37 KHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKRWVPTLRSVCLIGDKEQRAAFVRDVLLPGEWDV
230 240 250 260 270 280
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pF1KE0 CVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQN
:::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS37 CVTSYEMLIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTNRLLLTGTPLQN
290 300 310 320 330 340
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pF1KE0 NLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEK
::::::.::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::.::::::::.::::
CCDS37 NLHELWSLLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTNNCLGDQKLVERLHMVLRPFLLRRIKADVEK
350 360 370 380 390 400
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pF1KE0 SLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYL
:::::::.:::.:::::::::::.:::::::.:::.::::::::::::::::::::::::
CCDS37 SLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYL
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 FDGAEPGPPYTTDEHIVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWR
::::::::::::: :.:.:::::::::::: :::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS37 FDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLIFSQMTRVLDILEDYCMWR
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 GYEYCRLDGQTPHEEREDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLAS
.::::::::::::.::.: .:.:.: :::.::.:::::::::::::::.
CCDS37 NYEYCRLDGQTPHDERQD------------SINAYNEPNSTKFVFMLSTRAGGLGINLAT
530 540 550 560 570
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pF1KE0 ADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSI
:::::::::::::::::::::::::::: : :::::.:::::::::::::::.:::::::
CCDS37 ADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEMKLRLDSI
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KE0 VIQQGRLIDQQSNKLAKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKTAEMNE
:::::::.::. ::..:.::::::::::::::::::::.::::: ::::: ::::::::
CCDS37 VIQQGRLVDQNLNKIGKDEMLQMIRHGATHVFASKESEITDEDIDGILERGAKKTAEMNE
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KE0 RLQKMGESSLRNFRMDIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFRE
.:.:::::::::: :: :.:.:.:::::::::::....::::::::::::::::::::::
CCDS37 KLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFEGEDYREKQKIAFTEWIEPPKRERKANYAVDAYFRE
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KE0 ALRVSEPKIPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPA
:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::..:: :
CCDS37 ALRVSEPKAPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELLEKEILFYRKTIGYKVPRNPELPNAA
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860 870 880
pF1KE0 LAQREEQKKIDGAEPLTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAR
::.::: ::: :: :. :: ::::::::::::::.:::::::::::::.:::::.::::
CCDS37 QAQKEEQLKIDEAESLNDEELEEKEKLLTQGFTNWNKRDFNQFIKANEKWGRDDIENIAR
820 830 840 850 860 870
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pF1KE0 EVEGKSPEEVMEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKA
:::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::
CCDS37 EVEGKTPEEVIEYSAVFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDTKIGRYKA
880 890 900 910 920 930
950 960 970 980 990 1000
pF1KE0 PFHQLRIQYGTSKGKNYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRFDWFIK
:::::::.:::.:::::::::::::::::::.:::.::::.:::::.::.::::::::.:
CCDS37 PFHQLRISYGTNKGKNYTEEEDRFLICMLHKLGFDKENVYDELRQCIRNSPQFRFDWFLK
940 950 960 970 980 990
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE0 SRTAMEFQRRCNTLISLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMVKFSAFS
::::::.::::::::.:::.::::.::.:.::::::. :
CCDS37 SRTAMELQRRCNTLITLIERENMELEEKEKAEKKKRGPKPSTQKRKMDGAPDGRGRKKKL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
CCDS37 KL
>>CCDS45081.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2302 aa)
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10 20 30
pF1KE0 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQP-GPSTSQEE----
: .: . .. ... : : : : ::
CCDS45 PILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEFFVK
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40 50 60 70 80 90
pF1KE0 --GAAAAATE-ATAATEKGEKKKEKNVSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKR
. . : :: . . .:. ..... :. :.: ... .: . ...::
CCDS45 YKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHEDEEPFNPDYVEVDR---
400 410 420 430 440
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 FEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKD-EKQSLISAGDYRHRRTEQEE
.: .. : :. . . : . : . : . .. : :. . : .
CCDS45 ---ILDES----HSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQSR
450 460 470 480 490 500
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 DEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLG
:: .: ... ..:.: : . . ::.::..:.:::. . : : :::::::::
CCDS45 HPELKRVNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLG
510 520 530 540 550 560
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 KTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAF
::.:.::.: . . .: :: .:..: ::. :: ::. :. . .: . :. .: .
CCDS45 KTIQSIAFLQEVYNV-GIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTE-MNTIVYHGSLASRQMI
570 580 590 600 610 620
280 290 300 310 320
pF1KE0 IRDEM---------MPG--EWDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSK
. :: .:: ..:. .:..::.... .....:: ..::::::.::.. :
CCDS45 QQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCK
630 640 650 660 670 680
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 LSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQK
: . .... ...:::::::::...::..::.:: :. : : ..: . : : ..
CCDS45 LLDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGD---LKTEE
690 700 710 720 730
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 LVERLHAVLKPFLLRRIKTDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTKILMKDIDVLNS-S
:..:.:.:::..:::.: ::::.: ::.: : . :...:...: :: :... :.. .
CCDS45 QVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKQETIIEVELTNIQKKYYRAILEKNFSFLSKGA
740 750 760 770 780 790
450 460 470 480
pF1KE0 GKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPG--PPYTTDEHI----------VSNSGKMV
:. . ::: .:.::::::::::..::: . :: : ..::.:
CCDS45 GHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLV
800 810 820 830 840 850
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 VLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEEREDKFLEVE
..:::: ::: : .:::::::.: ::::::: . : : : :.::.. . :.
CCDS45 LIDKLLPKLKAGGHKVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRRYLYERIDGRVRGNLRQ-------
860 870 880 890 900 910
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 FLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAH
::. :. :.:..:.:.: ::::::::::..::. :..::::::: ::::. : :
CCDS45 -----AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAADTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCH
920 930 940 950 960
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 RIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQ--GRLIDQQS-NKLAKEEML
::::.: :.:.:::: :. :... ..: .:: ::. :.:. :: . . ....:.:.
CCDS45 RIGQSKAVKVYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAVLQSMSGRDGNITGIQQFSKKEIE
970 980 990 1000 1010 1020
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 QMIRHGATHVFASKESE---LTDEDITTILERGEKKTAEMNERLQKMGESSLRNFRMDIE
...:.:: .. ...: . .::: :: :
CCDS45 DLLRKGAYAAIMEEDDEGSKFCEEDIDQILLRRTTTITIESEGKGSTFAKASFVASENRT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 QSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRPPKQ
CCDS45 DISLDDPNFWQKWAKKADLDMDLLNSKNNLVIDTPRVRKQTRHFSTLKDDDLVEFSDLES
1090 1100 1110 1120 1130 1140
>>CCDS53885.1 CHD8 gene_id:57680|Hs108|chr14 (2581 aa)
initn: 1006 init1: 405 opt: 1166 Z-score: 1121.4 bits: 220.5 E(32554): 3.8e-56
Smith-Waterman score: 1354; 36.3% identity (64.5% similar) in 722 aa overlap (13-695:642-1336)
10 20 30
pF1KE0 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQP-GPSTSQEE----
: .: . .. ... : : : : ::
CCDS53 PILPEPVQEPDGETLPSMQFFVENPSEEDAAIVDKVLSMRIVKKELPSGQYTEAEEFFVK
620 630 640 650 660 670
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 --GAAAAATE-ATAATEKGEKKKEKNVSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKR
. . : :: . . .:. ..... :. :.: ... .: . ...::
CCDS53 YKNYSYLHCEWATISQLEKDKRIHQKLKRFKTKMAQMRHFFHEDEEPFNPDYVEVDR---
680 690 700 710 720
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 FEFLLKQTELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKD-EKQSLISAGDYRHRRTEQEE
.: .. : :. . . : . : . : . .. : :. . : .
CCDS53 ---ILDES----HSIDKDNGEPVIYYLVKWCSLPYEDSTWELKEDVDEGKIREFKRIQSR
730 740 750 760 770 780
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 DEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLG
:: .: ... ..:.: : . . ::.::..:.:::. . : : :::::::::
CCDS53 HPELKRVNRPQASAWKKLELSHEYKNRNQLREYQLEGVNWLLFNWYNRQNCILADEMGLG
790 800 810 820 830 840
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 KTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAF
::.:.::.: . . .: :: .:..: ::. :: ::. :. . .: . :. .: .
CCDS53 KTIQSIAFLQEVYNV-GIHGPFLVIAPLSTITNWEREFNTWTE-MNTIVYHGSLASRQMI
850 860 870 880 890
280 290 300 310 320
pF1KE0 IRDEM---------MPG--EWDVCVTSYEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSK
. :: .:: ..:. .:..::.... .....:: ..::::::.::.. :
CCDS53 QQYEMYCKDSRGRLIPGAYKFDALITTFEMILSDCPELREIEWRCVIIDEAHRLKNRNCK
900 910 920 930 940 950
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 LSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQK
: . .... ...:::::::::...::..::.:: :. : : ..: . : : ..
CCDS53 LLDSLKHMDLEHKVLLTGTPLQNTVEELFSLLHFLEPSQFPSESEFLKDFGD---LKTEE
960 970 980 990 1000 1010
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:..:.:.:::..:::.: ::::.: ::.: : . :...:...: :: :... :.. .
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CCDS53 GHTNMPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILTEFREACHIIPHDFHLQAMVRSAGKLV
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...:.:: .. ...: . .::: :: :
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. ....:. . : :: :: .: :: : .::. ..:
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CCDS76 GSTFAKASFVASGNRTDI--SL-----DDPNFWQK-----W------AKKAEIDIEAISG
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CCDS47 EIEDELFNPDYVE---VDRIMDFARSTDDRGEPVTHYLVKWCSLPYEDSTWERRQDIDQA
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CCDS47 KIEEFEKLMS------REPETERVERPPADDWKKS------ESSREYKNNNKLREYQLEG
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CCDS47 SRFPSETTFMQEFGD---LKTEEQVQKLQAILKPMMLRRLKEDVEKNLAPKEETIIEVEL
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CCDS47 TNIQKKYYRAILEKNFTFLSKGGGQANVPNLLNTMMELRKCCNHPYLINGAEEKILEEFK
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: . ... .::.:..:::: ::: : ::::::::.: ::::::: . :
CCDS47 ETHNAESPDFQLQAMIQAAGKLVLIDKLLPKLKAGGHRVLIFSQMVRCLDILEDYLIQRR
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CCDS47 YPYERIDGRVRGNLRQ------------AAIDRFSKPDSDRFVFLLCTRAGGLGINLTAA
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CCDS47 DTCIIFDSDWNPQNDLQAQARCHRIGQSKSVKIYRLITRNSYEREMFDKASLKLGLDKAV
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pF1KE0 IQQGRLIDQQSN---KLAKEEMLQMIRHGATHVFASKESE---LTDEDITTIL-ERGEKK
.:. .. .: .:.:.:. ...:.:: .. ..:.: . .::: :: .: .
CCDS47 LQSMSGRENATNGVQQLSKKEIEDLLRKGAYGALMDEEDEGSKFCEEDIDQILLRRTHTI
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pF1KE0 TAEMNERLQKMGESSL--RNFRMDIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANY
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CCDS47 TIESEGKGSTFAKASFVASGNRTDI--SL-----DDPNFWQK-----WA------KKAEL
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CCDS47 DIDALNGRNNLVIDTPRVRKQTRLYSAVKEDELMEFSDLESDSEEKPCAKPRRPQDKSQG
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CCDS13 KDAETGEEVTHYLVKWCSLPYEESTWELEEDVDPAKVKEFESLQVLPEIKHVERPASDSW
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CCDS13 QKLEKSREYKNSNQLREYQLEGMNWLLFNWYNRKNCILADEMGLGKTIQSITFLSEI-FL
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