Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0399
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0399, 1105 aa
1>>>pF1KE0399 1105 - 1105 aa - 1105 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.4092+/-0.000514; mu= -22.4963+/- 0.032
mean_var=700.7142+/-148.598, 0's: 0 Z-trim(124.3): 58 B-trim: 2355 in 2/59
Lambda= 0.048451
statistics sampled from 45699 (45838) to 45699 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.797), E-opt: 0.2 (0.537), width: 16
Scan time: 12.560
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003065 (OMIM: 601732) SWI/SNF complex subunit S (1105) 7547 543.5 2.5e-153
XP_011532336 (OMIM: 601732) PREDICTED: SWI/SNF com ( 996) 6819 492.6 4.9e-138
XP_005269160 (OMIM: 601734) PREDICTED: SWI/SNF com (1213) 4071 300.6 3.8e-80
XP_016875375 (OMIM: 601734) PREDICTED: SWI/SNF com (1099) 4064 300.0 4.9e-80
NP_003066 (OMIM: 601734) SWI/SNF complex subunit S (1214) 4059 299.7 6.8e-80
XP_016875374 (OMIM: 601734) PREDICTED: SWI/SNF com (1121) 4057 299.6 7e-80
NP_620706 (OMIM: 601734) SWI/SNF complex subunit S (1130) 2812 212.5 1.1e-53
NP_001123892 (OMIM: 601734) SWI/SNF complex subuni (1152) 2812 212.5 1.1e-53
NP_001317217 (OMIM: 601734) SWI/SNF complex subuni (1245) 2812 212.6 1.2e-53
XP_016875373 (OMIM: 601734) PREDICTED: SWI/SNF com (1129) 2810 212.4 1.2e-53
XP_005269161 (OMIM: 601734) PREDICTED: SWI/SNF com (1151) 2810 212.4 1.2e-53
XP_005269159 (OMIM: 601734) PREDICTED: SWI/SNF com (1244) 2810 212.4 1.3e-53
XP_016875376 (OMIM: 601734) PREDICTED: SWI/SNF com ( 963) 2766 209.3 9.2e-53
XP_011536995 (OMIM: 601734) PREDICTED: SWI/SNF com ( 994) 1398 113.7 5.7e-24
>>NP_003065 (OMIM: 601732) SWI/SNF complex subunit SMARC (1105 aa)
initn: 7547 init1: 7547 opt: 7547 Z-score: 2873.6 bits: 543.5 E(85289): 2.5e-153
Smith-Waterman score: 7547; 100.0% identity (100.0% similar) in 1105 aa overlap (1-1105:1-1105)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAAAGGGGPGTAVGATGSGIAAAAAGLAVYRRKDGGPATKFWESPETVSQLDSVRVWLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MAAAAGGGGPGTAVGATGSGIAAAAAGLAVYRRKDGGPATKFWESPETVSQLDSVRVWLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KHYKKYVHADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGALCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KHYKKYVHADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGALCH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ILGAAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ILGAAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ANKLKDIIKRHQGTFTDEKSKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ANKLKDIIKRHQGTFTDEKSKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DTWVHSNDVDAEIEDPPIPEKPWKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DTWVHSNDVDAEIEDPPIPEKPWKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 STKNEEPVRSPERRDRKASANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRSQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 STKNEEPVRSPERRDRKASANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRSQKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 EDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNLKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVTAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNLKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVTAGG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 KEDEDPAKGDQSRSVDLGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEFFNGKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KEDEDPAKGDQSRSVDLGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEFFNGKNK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 SKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGLVNYQVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGLVNYQVD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 PESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPEKNKEKPVDLQNFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPEKNKEKPVDLQNFG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 LRTDIYSKKTLAKSKGASAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LRTDIYSKKTLAKSKGASAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 FLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 FLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 EFSRVREEVPLELVEAHVKKVQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLEGAEEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EFSRVREEVPLELVEAHVKKVQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLEGAEEEK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 MEADPDGQQPEKAENKVENETDEGDKAQDGENEKNSEKEQDSEVSEDTKSEEKETEENKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MEADPDGQQPEKAENKVENETDEGDKAQDGENEKNSEKEQDSEVSEDTKSEEKETEENKE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 LTDTCKERESDTGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LTDTCKERESDTGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 ETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 QQHGQNPQQAHQHSGGPGLAPLGAAGHPGMMPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QQHGQNPQQAHQHSGGPGLAPLGAAGHPGMMPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE0 GSMMPGQHMPGRMIPTVAANIHPSGSGPTPPGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPPQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GSMMPGQHMPGRMIPTVAANIHPSGSGPTPPGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPPQQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KE0 QPPPPPPADGVPPPPAPGPPASAAP
:::::::::::::::::::::::::
NP_003 QPPPPPPADGVPPPPAPGPPASAAP
1090 1100
>>XP_011532336 (OMIM: 601732) PREDICTED: SWI/SNF complex (996 aa)
initn: 6819 init1: 6819 opt: 6819 Z-score: 2599.2 bits: 492.6 E(85289): 4.9e-138
Smith-Waterman score: 6819; 100.0% identity (100.0% similar) in 996 aa overlap (110-1105:1-996)
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 LVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGALCHILGAAYKYKNEQGWRRFDL
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MDFKAGGALCHILGAAYKYKNEQGWRRFDL
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 QNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKLANKLKDIIKRHQGTFTDEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKLANKLKDIIKRHQGTFTDEK
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 SKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSYDTWVHSNDVDAEIEDPPIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSYDTWVHSNDVDAEIEDPPIP
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 EKPWKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRISTKNEEPVRSPERRDRKAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKPWKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRISTKNEEPVRSPERRDRKAS
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 ANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRSQKEEDEQEDLTKDMEDPTPVPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRSQKEEDEQEDLTKDMEDPTPVPN
220 230 240 250 260 270
380 390 400 410 420 430
pF1KE0 IEEVVLPKNVNLKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVTAGGKEDEDPAKGDQSRSVDLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IEEVVLPKNVNLKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVTAGGKEDEDPAKGDQSRSVDLGE
280 290 300 310 320 330
440 450 460 470 480 490
pF1KE0 DNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEFFNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYR
340 350 360 370 380 390
500 510 520 530 540 550
pF1KE0 LNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGLVNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGLVNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVL
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KE0 ADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPEKNKEKPVDLQNFGLRTDIYSKKTLAKSKGASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPEKNKEKPVDLQNFGLRTDIYSKKTLAKSKGASA
460 470 480 490 500 510
620 630 640 650 660 670
pF1KE0 GREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLG
520 530 540 550 560 570
680 690 700 710 720 730
pF1KE0 PLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALEEFSRVREEVPLELVEAHVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALEEFSRVREEVPLELVEAHVK
580 590 600 610 620 630
740 750 760 770 780 790
pF1KE0 KVQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLEGAEEEKMEADPDGQQPEKAENKVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLEGAEEEKMEADPDGQQPEKAENKVEN
640 650 660 670 680 690
800 810 820 830 840 850
pF1KE0 ETDEGDKAQDGENEKNSEKEQDSEVSEDTKSEEKETEENKELTDTCKERESDTGKKKVEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ETDEGDKAQDGENEKNSEKEQDSEVSEDTKSEEKETEENKELTDTCKERESDTGKKKVEH
700 710 720 730 740 750
860 870 880 890 900 910
pF1KE0 EISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELET
760 770 780 790 800 810
920 930 940 950 960 970
pF1KE0 IMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQQHGQNPQQAHQHSGGPGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQQHGQNPQQAHQHSGGPGL
820 830 840 850 860 870
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE0 APLGAAGHPGMMPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGPGSMMPGQHMPGRMIPTVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APLGAAGHPGMMPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGPGSMMPGQHMPGRMIPTVAA
880 890 900 910 920 930
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE0 NIHPSGSGPTPPGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPPQQQPPPPPPADGVPPPPAPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NIHPSGSGPTPPGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPPQQQPPPPPPADGVPPPPAPGP
940 950 960 970 980 990
1100
pF1KE0 PASAAP
::::::
XP_011 PASAAP
>>XP_005269160 (OMIM: 601734) PREDICTED: SWI/SNF complex (1213 aa)
initn: 2847 init1: 1791 opt: 4071 Z-score: 1559.9 bits: 300.6 E(85289): 3.8e-80
Smith-Waterman score: 4608; 64.1% identity (82.8% similar) in 1111 aa overlap (28-1093:1-1097)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAAAGGGGPGTAVGATGSGIAAAAAGLAVYRRKDGGPATKFWESPETVSQLDSVRVWLG
.:: :.::::: .:..:. .::.:.:.::.:::
XP_005 MAV-RKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KHYKKYVHADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGALCH
:.::::..:. ::::.:..::::::::::..:::::.: .:::: :::.::::::.:::
XP_005 KNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCH
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ILGAAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKL
::.::::.:..:::::.:.::::::::::::::.:::.:::::::.::::.: :.:. ::
XP_005 ILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ANKLKDIIKRHQGTFTDEKSKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSY
.:::::::::::: :..:..::: .:: .. ..:::.::::...::::.:::.:::::
XP_005 LGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVMKRDKQVLLHWGYYPDSY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DTWVHSNDVDAEIEDPPIPEKPWKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRI
:::. .....: .:: : :::: :::.::::::: ::::::::::::.....::: :..:
XP_005 DTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE0 STKN-EEPVRSPE--RRDRKASANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRS
:.:. . : ::. :::.:.. : .:::.:::: : :: :..::..::: .. : : .
XP_005 SAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGG-NYKKRKRSPSPSP-TP-EAKKKNAKKGPSTPYTKSKR
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 QKEEDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNLKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVT
..:.:::::::::..:.::::.:::.:::.:: :::::..::::::..:::::..:..
XP_005 GHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESME
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 AGGK-EDEDPA--KGDQSRSVDLGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEF
. :: :::. . ::.:... :: ::::::::.::::::::.::::: .:.:::::::::
XP_005 TTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEF
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::
XP_005 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGL
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 VNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPEKNKEKPV
.::::: :::: :::::: ::.::::::::::::. ..::. :.:::::::.:.::::.
XP_005 INYQVDAESRPTPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQTSASQQMLNFPDKGKEKPT
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 DLQNFGLRTDIYSKKTL-AKSKGA-SAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSR
:.::::::::.:.::.. .:::.: :: ::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DMQNFGLRTDMYTKKNVPSKSKAAASATREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSR
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 TQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVAS
::::::::::::::::::::.:.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGPLAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVAS
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::::.::::::...:::: ::::::.::.:::...::.::..::::: :::: ::::.
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.: : .: ..:.. .. : : . .:.:. : .:...:..::.:
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:: . : :. . ..: :: .:. ::.... :: : :::..:.:::..::::::
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::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: :::
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:::..:: ::::::::::.::::: ::.: : :: . :: . : :::: :..
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: : : : : : :. :: ...: : .:: . : :
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:. ::.: :.. :: ::: . : : .: :. : . ::::::: .. :
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pF1KE0 PAPGPPASAAP
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XP_016 ILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKL
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pF1KE0 ANKLKDIIKRHQGTFTDEKSKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSY
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XP_016 SAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGG-NYKKRKRSPSPSP-TP-EAKKKNAKKGPSTPYTKSKR
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pF1KE0 QKEEDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNLKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVT
..:.:::::::::..:.::::.:::.:::.:: :::::..::::::..:::::..:..
XP_016 GHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESME
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 AGGK-EDEDPA--KGDQSRSVDLGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEF
. :: :::. . ::.:... :: ::::::::.::::::::.::::: .:.:::::::::
XP_016 TTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEF
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::
XP_016 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGL
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 VNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQ-VPAAQQMLNFPEKNKEKP
.::::: :::: :::::: ::.::::::::::::. ..:: . :.:::::::.:.::::
XP_016 INYQVDAESRPTPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQQTSASQQMLNFPDKGKEKP
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 VDLQNFGLRTDIYSKKTL-AKSKGA-SAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGS
.:.::::::::.:.::.. .:::.: :: :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TDMQNFGLRTDMYTKKNVPSKSKAAASATREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGS
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 RTQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVA
:::::::::::::::::::::.:.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGPLAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVA
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 SAAAKAALEEFSRVREEVPLELVEAHVKKVQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPE
:::::.::::::...:::: ::::::.::.:::...::.::..::::: :::: ::::
XP_016 SAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRKVEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTTSDEPE
690 700 710 720 730 740
780 790 800 810
pF1KE0 KLE--GAEEEKMEADPDGQQPEKAENK-----VENETDEG---------DKAQDGENEKN
..: : .: ..:.. .. : : . .:.:. : .:...:..::.
XP_016 RIEESGNDEARVEGQATDEKKEPKEPREGGGAIEEEAKEKTSEAPKKDEEKGKEGDSEKE
750 760 770 780 790 800
820 830 840 850 860 870
pF1KE0 SEK-EQDSEVSEDTKSEEKETEEN--KELTDTCKERESDTGKKKVEHEISEGNVATAAAA
::: . : :. . ..: :: .:. ::.... :: : :::..:.:::..:::::
XP_016 SEKSDGDPIVDPEKEKEPKEGQEEVLKEVVESEGER-----KTKVERDIGEGNLSTAAAA
810 820 830 840 850 860
880 890 900 910 920 930
pF1KE0 ALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQR
:::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::
XP_016 ALAAAAVKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREREALEYQR
870 880 890 900 910 920
940 950 960 970 980
pF1KE0 QQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQQHGQNPQQAHQHSGGPG---LAPLGAAGHPG
::::..:: ::::::::::.::::: ::.: : :: . :: . : :::: :.
XP_016 QQLLADRQAFHMEQLKYAEMRARQQHFQQMHQQ--QQQPPPALPPGSQPIPPTGAAGPPA
930 940 950 960 970 980
990 1000 1010 1020 1030
pF1KE0 MMPHQQPP----PYPLMHHQMPPPHPP-----QPGQIPGPGSMMP-GQHMPGRMIPTVAA
. : : : : : : :. :: ...: : .:: . : :
XP_016 VHGLAVAPASVVPAPAGSGAPPGSLGPSEQIGQAGSTAGPQQQQPAGAPQPGAVPPGVPP
990 1000 1010 1020 1030 1040
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE0 NIHPSGSGPTP-PGM--PP--MPGNILG---PRVPLTAPNGMYPPPPQQQPPPPP-PADG
:. ::.: :.. :: ::: . : : : .: . . : : : :
XP_016 ---PGPHGPSPFPNQQTPPSMMPGAVPGSGHPGVAAQSPAIVAAVQGNLLPSASPLPDPG
1050 1060 1070 1080 1090
1100
pF1KE0 VPPPPAPGPPASAAP
.: :: : :
XP_016 TPLPPDPTAPSPGTVTPVPPPQ
1100 1110 1120
>>NP_620706 (OMIM: 601734) SWI/SNF complex subunit SMARC (1130 aa)
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10 20 30 40 50 60
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.:: :.::::: .:..:. .::.:.:.::.:::
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10 20 30
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pF1KE0 KHYKKYVHADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGALCH
:.::::..:. ::::.:..::::::::::..:::::.: .:::: :::.::::::.:::
NP_620 KNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCH
40 50 60 70 80 90
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pF1KE0 ILGAAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKL
::.::::.:..:::::.:.::::::::::::::.:::.:::::::.::::.: :.:. ::
NP_620 ILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKL
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pF1KE0 ANKLKDIIKRHQGTFTDEKSKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSY
.:::::::::::: :..:..::: .:: .. ..:::.::::...::::.:::.:::::
NP_620 LGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVMKRDKQVLLHWGYYPDSY
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pF1KE0 DTWVHSNDVDAEIEDPPIPEKPWKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRI
:::. .....: .:: : :::: :::.::::::: ::::::::::::.....::: :..:
NP_620 DTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE0 STKN-EEPVRSPE--RRDRKASANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRS
:.:. . : ::. :::.:.. : .:::.:::: : :: :..::..::: .. : : .
NP_620 SAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGG-NYKKRKRSPSPSP-TP-EAKKKNAKKGPSTPYTKSKR
280 290 300 310 320
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pF1KE0 QKEEDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNLKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVT
..:.:::::::::..:.::::.:::.:::.:: :::::..::::::..:::::..:..
NP_620 GHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESME
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 AGGK-EDEDPA--KGDQSRSVDLGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEF
. :: :::. . ::.:... :: ::::::::.::::::::.::::: .:.:::::::::
NP_620 TTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEF
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pF1KE0 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::
NP_620 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGL
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540 550 560 570
pF1KE0 VNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQ-------------------
.::::: :::: :::::: ::.::::::::::::. ..::
NP_620 INYQVDAESRPTPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQGRQVDADTKAGRKGKELDD
510 520 530 540 550 560
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pF1KE0 -VP------------AAQQMLNFPEKNKEKPVDLQNFGLRTDIYSKKTL-AKSKGA-SAG
:: :.:::::::.:.::::.:.::::::::.:.::.. .:::.: ::
NP_620 LVPETAKGKPELQTSASQQMLNFPDKGKEKPTDMQNFGLRTDMYTKKNVPSKSKAAASAT
570 580 590 600 610 620
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pF1KE0 REWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::
NP_620 REWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGP
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KE0 LAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALEEFSRVREEVPLELVEAHVKK
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::...:::: ::::::.:
NP_620 LAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRK
690 700 710 720 730 740
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pF1KE0 VQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLE--GAEEEKMEADPDGQQPEKAENK--
:.:::...::.::..::::: :::: ::::..: : .: ..:.. .. : : .
NP_620 VEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTTSDEPERIEESGNDEARVEGQATDEKKEPKEPREG
750 760 770 780 790 800
800 810 820 830 840
pF1KE0 ---VENETDEG---------DKAQDGENEKNSEK-EQDSEVSEDTKSEEKETEEN--KEL
.:.:. : .:...:..::.::: . : :. . ..: :: .:. ::.
NP_620 GGAIEEEAKEKTSEAPKKDEEKGKEGDSEKESEKSDGDPIVDPEKEKEPKEGQEEVLKEV
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850 860 870 880 890 900
pF1KE0 TDTCKERESDTGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVE
... :: : :::..:.:::..::::::::.::.::::::::::::::::::::::
NP_620 VESEGER-----KTKVERDIGEGNLSTAAAAALAAAAVKAKHLAAVEERKIKSLVALLVE
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910 920 930 940 950 960
pF1KE0 TQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQ
:::::::::::::::::::::::.:::: ::::::..:: ::::::::::.::::: ::
NP_620 TQMKKLEIKLRHFEELETIMDREREALEYQRQQLLADRQAFHMEQLKYAEMRARQQHFQQ
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 QHGQNPQQAHQHSGGPGLAPLGAAGHPGMMPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGP-
.: : :: . :: :. .: : :: .: : . .:.:
NP_620 MHQQ--QQQPPPALPPGSQPIPPTGAAG------PPA---VHGLAVAP----ASVVPAPA
990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE0 GSMMPGQHMPGRMIPTVAANIHPSGSGPTP--PGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPP
:: : :: . :. . : .:: :. :.:: . : :: .:.: : :
NP_620 GSGAP----PGSLGPSEQIGQAGSTAGPQQQQPAGAPQPGAV-PPGVPPPGPHGPSPFPN
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100
pF1KE0 QQQPPPPPPADGVPPPPAPGPPASAAP
:: :: :. .:: ::
NP_620 QQTPPSMMPG-AVPGSGHPGVADPGTPLPPDPTAPSPGTVTPVPPPQ
1090 1100 1110 1120 1130
>>NP_001123892 (OMIM: 601734) SWI/SNF complex subunit SM (1152 aa)
initn: 2813 init1: 1791 opt: 2812 Z-score: 1084.6 bits: 212.5 E(85289): 1.1e-53
Smith-Waterman score: 4501; 62.3% identity (80.5% similar) in 1138 aa overlap (28-1103:1-1108)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAAAGGGGPGTAVGATGSGIAAAAAGLAVYRRKDGGPATKFWESPETVSQLDSVRVWLG
.:: :.::::: .:..:. .::.:.:.::.:::
NP_001 MAV-RKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KHYKKYVHADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGALCH
:.::::..:. ::::.:..::::::::::..:::::.: .:::: :::.::::::.:::
NP_001 KNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCH
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ILGAAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKL
::.::::.:..:::::.:.::::::::::::::.:::.:::::::.::::.: :.:. ::
NP_001 ILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ANKLKDIIKRHQGTFTDEKSKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSY
.:::::::::::: :..:..::: .:: .. ..:::.::::...::::.:::.:::::
NP_001 LGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVMKRDKQVLLHWGYYPDSY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DTWVHSNDVDAEIEDPPIPEKPWKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRI
:::. .....: .:: : :::: :::.::::::: ::::::::::::.....::: :..:
NP_001 DTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE0 STKN-EEPVRSPE--RRDRKASANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRS
:.:. . : ::. :::.:.. : .:::.:::: : :: :..::..::: .. : : .
NP_001 SAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGG-NYKKRKRSPSPSP-TP-EAKKKNAKKGPSTPYTKSKR
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 QKEEDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNLKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVT
..:.:::::::::..:.::::.:::.:::.:: :::::..::::::..:::::..:..
NP_001 GHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESME
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 AGGK-EDEDPA--KGDQSRSVDLGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEF
. :: :::. . ::.:... :: ::::::::.::::::::.::::: .:.:::::::::
NP_001 TTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEF
390 400 410 420 430 440
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pF1KE0 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::
NP_001 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGL
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570
pF1KE0 VNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQ-------------------
.::::: :::: :::::: ::.::::::::::::. ..::
NP_001 INYQVDAESRPTPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQGRQVDADTKAGRKGKELDD
510 520 530 540 550 560
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pF1KE0 -VP------------AAQQMLNFPEKNKEKPVDLQNFGLRTDIYSKKTL-AKSKGA-SAG
:: :.:::::::.:.::::.:.::::::::.:.::.. .:::.: ::
NP_001 LVPETAKGKPELQTSASQQMLNFPDKGKEKPTDMQNFGLRTDMYTKKNVPSKSKAAASAT
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pF1KE0 REWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::
NP_001 REWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGP
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
pF1KE0 LAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALEEFSRVREEVPLELVEAHVKK
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::...:::: ::::::.:
NP_001 LAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRK
690 700 710 720 730 740
750 760 770 780 790
pF1KE0 VQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLE--GAEEEKMEADPDGQQPEKAENK--
:.:::...::.::..::::: :::: ::::..: : .: ..:.. .. : : .
NP_001 VEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTTSDEPERIEESGNDEARVEGQATDEKKEPKEPREG
750 760 770 780 790 800
800 810 820 830 840
pF1KE0 ---VENETDEG---------DKAQDGENEKNSEK-EQDSEVSEDTKSEEKETEEN--KEL
.:.:. : .:...:..::.::: . : :. . ..: :: .:. ::.
NP_001 GGAIEEEAKEKTSEAPKKDEEKGKEGDSEKESEKSDGDPIVDPEKEKEPKEGQEEVLKEV
810 820 830 840 850 860
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 TDTCKERESDTGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVE
... :: : :::..:.:::..::::::::.::.::::::::::::::::::::::
NP_001 VESEGER-----KTKVERDIGEGNLSTAAAAALAAAAVKAKHLAAVEERKIKSLVALLVE
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910 920 930 940 950 960
pF1KE0 TQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQ
:::::::::::::::::::::::.:::: ::::::..:: ::::::::::.::::: ::
NP_001 TQMKKLEIKLRHFEELETIMDREREALEYQRQQLLADRQAFHMEQLKYAEMRARQQHFQQ
930 940 950 960 970 980
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 QHGQNPQQAHQHSGGPGLAPLGAAGHPGMMPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGP-
.: : :: . :: :. .: : :: .: : . .:.:
NP_001 MHQQ--QQQPPPALPPGSQPIPPTGAAG------PPA---VHGLAVAP----ASVVPAPA
990 1000 1010 1020
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pF1KE0 GSMMPGQHMPGRMIPTVAANIHPSGSGPTP--PGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPP
:: : :: . :. . : .:: :. :.:: . : :: .:.: : :
NP_001 GSGAP----PGSLGPSEQIGQAGSTAGPQQQQPAGAPQPGAV-PPGVPPPGPHGPSPFPN
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100
pF1KE0 QQQPPPPPPADGVPPPPAPGPPASAAP
:: :: :. .:: :: :..
NP_001 QQTPPSMMPG-AVPGSGHPGVAAQSPAIVAAVQGNLLPSASPLPDPGTPLPPDPTAPSPG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
>>NP_001317217 (OMIM: 601734) SWI/SNF complex subunit SM (1245 aa)
initn: 2846 init1: 1791 opt: 2812 Z-score: 1084.1 bits: 212.6 E(85289): 1.2e-53
Smith-Waterman score: 4503; 62.4% identity (80.4% similar) in 1140 aa overlap (28-1105:1-1109)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAAAGGGGPGTAVGATGSGIAAAAAGLAVYRRKDGGPATKFWESPETVSQLDSVRVWLG
.:: :.::::: .:..:. .::.:.:.::.:::
NP_001 MAV-RKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KHYKKYVHADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGALCH
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NP_001 KNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCH
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NP_001 ILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKL
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pF1KE0 ANKLKDIIKRHQGTFTDEKSKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSY
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NP_001 LGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVMKRDKQVLLHWGYYPDSY
160 170 180 190 200 210
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pF1KE0 DTWVHSNDVDAEIEDPPIPEKPWKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRI
:::. .....: .:: : :::: :::.::::::: ::::::::::::.....::: :..:
NP_001 DTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKI
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:.:. . : ::. :::.:.. : .:::.:::: : :: :..::..::: .. : : .
NP_001 SAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGG-NYKKRKRSPSPSP-TP-EAKKKNAKKGPSTPYTKSKR
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pF1KE0 QKEEDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNLKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVT
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. :: :::. . ::.:... :: ::::::::.::::::::.::::: .:.:::::::::
NP_001 TTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEF
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pF1KE0 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGL
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NP_001 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGL
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pF1KE0 VNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQ-------------------
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:: :.:::::::.:.::::.:.::::::::.:.::.. .:::.: ::
NP_001 LVPETAKGKPELQTSASQQMLNFPDKGKEKPTDMQNFGLRTDMYTKKNVPSKSKAAASAT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::
NP_001 REWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGP
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pF1KE0 LAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALEEFSRVREEVPLELVEAHVKK
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::...:::: ::::::.:
NP_001 LAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRK
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pF1KE0 VQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLE--GAEEEKMEADPDGQQPEKAENK--
:.:::...::.::..::::: :::: ::::..: : .: ..:.. .. : : .
NP_001 VEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTTSDEPERIEESGNDEARVEGQATDEKKEPKEPREG
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800 810 820 830 840
pF1KE0 ---VENETDEG---------DKAQDGENEKNSEK-EQDSEVSEDTKSEEKETEEN--KEL
.:.:. : .:...:..::.::: . : :. . ..: :: .:. ::.
NP_001 GGAIEEEAKEKTSEAPKKDEEKGKEGDSEKESEKSDGDPIVDPEKEKEPKEGQEEVLKEV
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pF1KE0 TDTCKERESDTGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVE
... :: : :::..:.:::..::::::::.::.::::::::::::::::::::::
NP_001 VESEGER-----KTKVERDIGEGNLSTAAAAALAAAAVKAKHLAAVEERKIKSLVALLVE
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pF1KE0 TQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQ
:::::::::::::::::::::::.:::: ::::::..:: ::::::::::.::::: ::
NP_001 TQMKKLEIKLRHFEELETIMDREREALEYQRQQLLADRQAFHMEQLKYAEMRARQQHFQQ
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 QHGQNPQQAHQHSGGPGLAPLGAAGHPGMMPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGP-
.: : :: . :: :. .: : :: .: : . .:.:
NP_001 MHQQ--QQQPPPALPPGSQPIPPTGAAG------PPA---VHGLAVAP----ASVVPAPA
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:: :: :. .:: :: :. ::
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10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAAAGGGGPGTAVGATGSGIAAAAAGLAVYRRKDGGPATKFWESPETVSQLDSVRVWLG
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XP_016 MAV-RKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KHYKKYVHADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGALCH
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XP_016 KNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCH
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pF1KE0 ILGAAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKL
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XP_016 ILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKL
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pF1KE0 ANKLKDIIKRHQGTFTDEKSKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSY
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XP_016 DTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKI
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XP_016 ESEGER-----KTKVERDIGEGNLSTAAAAALAAAAVKAKHLAAVEERKIKSLVALLVET
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 20:33:01 2016 done: Sun Nov 6 20:33:03 2016
Total Scan time: 12.560 Total Display time: 0.410
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]