Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0399
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0399, 1105 aa
1>>>pF1KE0399 1105 - 1105 aa - 1105 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.1945+/-0.00129; mu= -9.4765+/- 0.078
mean_var=601.7840+/-123.686, 0's: 0 Z-trim(116.2): 49 B-trim: 446 in 1/53
Lambda= 0.052282
statistics sampled from 16785 (16828) to 16785 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.78), E-opt: 0.2 (0.517), width: 16
Scan time: 5.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2758.1 SMARCC1 gene_id:6599|Hs108|chr3 (1105) 7547 585.0 3.2e-166
CCDS8907.1 SMARCC2 gene_id:6601|Hs108|chr12 (1214) 4059 321.9 5.3e-87
CCDS8908.1 SMARCC2 gene_id:6601|Hs108|chr12 (1130) 2812 227.9 1e-58
CCDS55835.1 SMARCC2 gene_id:6601|Hs108|chr12 (1152) 2812 227.9 1.1e-58
CCDS81698.1 SMARCC2 gene_id:6601|Hs108|chr12 (1245) 2812 227.9 1.1e-58
>>CCDS2758.1 SMARCC1 gene_id:6599|Hs108|chr3 (1105 aa)
initn: 7547 init1: 7547 opt: 7547 Z-score: 3097.8 bits: 585.0 E(32554): 3.2e-166
Smith-Waterman score: 7547; 100.0% identity (100.0% similar) in 1105 aa overlap (1-1105:1-1105)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAAAGGGGPGTAVGATGSGIAAAAAGLAVYRRKDGGPATKFWESPETVSQLDSVRVWLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MAAAAGGGGPGTAVGATGSGIAAAAAGLAVYRRKDGGPATKFWESPETVSQLDSVRVWLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KHYKKYVHADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGALCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KHYKKYVHADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGALCH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ILGAAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ILGAAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ANKLKDIIKRHQGTFTDEKSKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ANKLKDIIKRHQGTFTDEKSKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DTWVHSNDVDAEIEDPPIPEKPWKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DTWVHSNDVDAEIEDPPIPEKPWKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 STKNEEPVRSPERRDRKASANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRSQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 STKNEEPVRSPERRDRKASANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRSQKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 EDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNLKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVTAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 EDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNLKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVTAGG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 KEDEDPAKGDQSRSVDLGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEFFNGKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KEDEDPAKGDQSRSVDLGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEFFNGKNK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 SKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGLVNYQVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGLVNYQVD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 PESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPEKNKEKPVDLQNFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 PESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQVPAAQQMLNFPEKNKEKPVDLQNFG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 LRTDIYSKKTLAKSKGASAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LRTDIYSKKTLAKSKGASAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 FLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 FLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKAALE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE0 EFSRVREEVPLELVEAHVKKVQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLEGAEEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 EFSRVREEVPLELVEAHVKKVQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLEGAEEEK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE0 MEADPDGQQPEKAENKVENETDEGDKAQDGENEKNSEKEQDSEVSEDTKSEEKETEENKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MEADPDGQQPEKAENKVENETDEGDKAQDGENEKNSEKEQDSEVSEDTKSEEKETEENKE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE0 LTDTCKERESDTGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LTDTCKERESDTGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE0 ETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 ETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQRQQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE0 QQHGQNPQQAHQHSGGPGLAPLGAAGHPGMMPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QQHGQNPQQAHQHSGGPGLAPLGAAGHPGMMPHQQPPPYPLMHHQMPPPHPPQPGQIPGP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE0 GSMMPGQHMPGRMIPTVAANIHPSGSGPTPPGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPPQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 GSMMPGQHMPGRMIPTVAANIHPSGSGPTPPGMPPMPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPPQQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KE0 QPPPPPPADGVPPPPAPGPPASAAP
:::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QPPPPPPADGVPPPPAPGPPASAAP
1090 1100
>>CCDS8907.1 SMARCC2 gene_id:6601|Hs108|chr12 (1214 aa)
initn: 2846 init1: 1791 opt: 4059 Z-score: 1675.4 bits: 321.9 E(32554): 5.3e-87
Smith-Waterman score: 4596; 64.0% identity (82.7% similar) in 1112 aa overlap (28-1093:1-1098)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAAAGGGGPGTAVGATGSGIAAAAAGLAVYRRKDGGPATKFWESPETVSQLDSVRVWLG
.:: :.::::: .:..:. .::.:.:.::.:::
CCDS89 MAV-RKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KHYKKYVHADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGALCH
:.::::..:. ::::.:..::::::::::..:::::.: .:::: :::.::::::.:::
CCDS89 KNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCH
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ILGAAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKL
::.::::.:..:::::.:.::::::::::::::.:::.:::::::.::::.: :.:. ::
CCDS89 ILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ANKLKDIIKRHQGTFTDEKSKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSY
.:::::::::::: :..:..::: .:: .. ..:::.::::...::::.:::.:::::
CCDS89 LGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVMKRDKQVLLHWGYYPDSY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DTWVHSNDVDAEIEDPPIPEKPWKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRI
:::. .....: .:: : :::: :::.::::::: ::::::::::::.....::: :..:
CCDS89 DTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE0 STKN-EEPVRSPE--RRDRKASANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRS
:.:. . : ::. :::.:.. : .:::.:::: : :: :..::..::: .. : : .
CCDS89 SAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGG-NYKKRKRSPSPSP-TP-EAKKKNAKKGPSTPYTKSKR
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 QKEEDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNLKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVT
..:.:::::::::..:.::::.:::.:::.:: :::::..::::::..:::::..:..
CCDS89 GHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESME
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 AGGK-EDEDPA--KGDQSRSVDLGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEF
. :: :::. . ::.:... :: ::::::::.::::::::.::::: .:.:::::::::
CCDS89 TTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEF
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::
CCDS89 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGL
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 VNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQ-VPAAQQMLNFPEKNKEKP
.::::: :::: :::::: ::.::::::::::::. ..:: . :.:::::::.:.::::
CCDS89 INYQVDAESRPTPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQQTSASQQMLNFPDKGKEKP
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KE0 VDLQNFGLRTDIYSKKTL-AKSKGA-SAGREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGS
.:.::::::::.:.::.. .:::.: :: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS89 TDMQNFGLRTDMYTKKNVPSKSKAAASATREWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGS
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KE0 RTQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGPLAYQPVPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVA
:::::::::::::::::::::.:.::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS89 RTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGPLAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVA
630 640 650 660 670 680
720 730 740 750 760 770
pF1KE0 SAAAKAALEEFSRVREEVPLELVEAHVKKVQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPE
:::::.::::::...:::: ::::::.::.:::...::.::..::::: :::: ::::
CCDS89 SAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRKVEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTTSDEPE
690 700 710 720 730 740
780 790 800 810
pF1KE0 KLE--GAEEEKMEADPDGQQPEKAENK-----VENETDEG---------DKAQDGENEKN
..: : .: ..:.. .. : : . .:.:. : .:...:..::.
CCDS89 RIEESGNDEARVEGQATDEKKEPKEPREGGGAIEEEAKEKTSEAPKKDEEKGKEGDSEKE
750 760 770 780 790 800
820 830 840 850 860 870
pF1KE0 SEK-EQDSEVSEDTKSEEKETEEN--KELTDTCKERESDTGKKKVEHEISEGNVATAAAA
::: . : :. . ..: :: .:. ::.... :: : :::..:.:::..:::::
CCDS89 SEKSDGDPIVDPEKEKEPKEGQEEVLKEVVESEGER-----KTKVERDIGEGNLSTAAAA
810 820 830 840 850 860
880 890 900 910 920 930
pF1KE0 ALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREKEALEQQR
:::.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::
CCDS89 ALAAAAVKAKHLAAVEERKIKSLVALLVETQMKKLEIKLRHFEELETIMDREREALEYQR
870 880 890 900 910 920
940 950 960 970 980
pF1KE0 QQLLTERQNFHMEQLKYAELRARQQMEQQQHGQNPQQAHQHSGGPG---LAPLGAAGHPG
::::..:: ::::::::::.::::: ::.: : :: . :: . : :::: :.
CCDS89 QQLLADRQAFHMEQLKYAEMRARQQHFQQMHQQ--QQQPPPALPPGSQPIPPTGAAGPPA
930 940 950 960 970 980
990 1000 1010 1020 1030
pF1KE0 MMPHQQPP----PYPLMHHQMPPPHPP-----QPGQIPGPGSMMP-GQHMPGRMIPTVAA
. : : : : : : :. :: ...: : .:: . : :
CCDS89 VHGLAVAPASVVPAPAGSGAPPGSLGPSEQIGQAGSTAGPQQQQPAGAPQPGAVPPGVPP
990 1000 1010 1020 1030 1040
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE0 NIHPSGSGPTP-PGM--PP--MPGNILGPRVPLTAPNGMYPPPPQQQPPPPPPADGVPPP
:. ::.: :.. :: ::: . : : .: :. : . ::::::: .. :
CCDS89 ---PGPHGPSPFPNQQTPPSMMPGAVPGSGHPGVAGNAPLGLPFGMPPPPPPPAPSIIPF
1050 1060 1070 1080 1090
1100
pF1KE0 PAPGPPASAAP
CCDS89 GSLADSISINLPAPPNLHGHHHHLPFAPGTLPPPNLPVSMANPLHPNLPATTTMPSSLPL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
>>CCDS8908.1 SMARCC2 gene_id:6601|Hs108|chr12 (1130 aa)
initn: 2782 init1: 1791 opt: 2812 Z-score: 1167.5 bits: 227.9 E(32554): 1e-58
Smith-Waterman score: 4499; 62.5% identity (80.6% similar) in 1133 aa overlap (28-1098:1-1103)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAAAGGGGPGTAVGATGSGIAAAAAGLAVYRRKDGGPATKFWESPETVSQLDSVRVWLG
.:: :.::::: .:..:. .::.:.:.::.:::
CCDS89 MAV-RKKDGGPNVKYYEAADTVTQFDNVRLWLG
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 KHYKKYVHADAPTNKTLAGLVVQLLQFQEDAFGKHVTNPAFTKLPAKCFMDFKAGGALCH
:.::::..:. ::::.:..::::::::::..:::::.: .:::: :::.::::::.:::
CCDS89 KNYKKYIQAEPPTNKSLSSLVVQLLQFQEEVFGKHVSNAPLTKLPIKCFLDFKAGGSLCH
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ILGAAYKYKNEQGWRRFDLQNPSRMDRNVEMFMNIEKTLVQNNCLTRPNIYLIPDIDLKL
::.::::.:..:::::.:.::::::::::::::.:::.:::::::.::::.: :.:. ::
CCDS89 ILAAAYKFKSDQGWRRYDFQNPSRMDRNVEMFMTIEKSLVQNNCLSRPNIFLCPEIEPKL
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ANKLKDIIKRHQGTFTDEKSKASHHIYPYSSSQDDEEWLRPVMRKEKQVLVHWGFYPDSY
.:::::::::::: :..:..::: .:: .. ..:::.::::...::::.:::.:::::
CCDS89 LGKLKDIIKRHQGTVTEDKNNASHVVYPVPGNLEEEEWVRPVMKRDKQVLLHWGYYPDSY
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DTWVHSNDVDAEIEDPPIPEKPWKVHVKWILDTDIFNEWMNEEDYEVDENRKPVSFRQRI
:::. .....: .:: : :::: :::.::::::: ::::::::::::.....::: :..:
CCDS89 DTWIPASEIEASVEDAPTPEKPRKVHAKWILDTDTFNEWMNEEDYEVNDDKNPVSRRKKI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE0 STKN-EEPVRSPE--RRDRKASANARKRKHSPSPPPPTPTESRKKSGKKGQASLYGKRRS
:.:. . : ::. :::.:.. : .:::.:::: : :: :..::..::: .. : : .
CCDS89 SAKTLTDEVNSPDSDRRDKKGG-NYKKRKRSPSPSP-TP-EAKKKNAKKGPSTPYTKSKR
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 QKEEDEQEDLTKDMEDPTPVPNIEEVVLPKNVNLKKDSENTPVKGGTVADLDEQDEETVT
..:.:::::::::..:.::::.:::.:::.:: :::::..::::::..:::::..:..
CCDS89 GHREEEQEDLTKDMDEPSPVPNVEEVTLPKTVNTKKDSESAPVKGGTMTDLDEQEDESME
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 AGGK-EDEDPA--KGDQSRSVDLGEDNVTEQTNHIIIPSYASWFDYNCIHVIERRALPEF
. :: :::. . ::.:... :: ::::::::.::::::::.::::: .:.:::::::::
CCDS89 TTGKDEDENSTGNKGEQTKNPDLHEDNVTEQTHHIIIPSYAAWFDYNSVHAIERRALPEF
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLTGDVCAVMRVHAFLEQWGL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::
CCDS89 FNGKNKSKTPEIYLAYRNFMIDTYRLNPQEYLTSTACRRNLAGDVCAIMRVHAFLEQWGL
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570
pF1KE0 VNYQVDPESRPMAMGPPPTPHFNVLADTPSGLVPLHLRSPQ-------------------
.::::: :::: :::::: ::.::::::::::::. ..::
CCDS89 INYQVDAESRPTPMGPPPTSHFHVLADTPSGLVPLQPKTPQGRQVDADTKAGRKGKELDD
510 520 530 540 550 560
580 590 600 610 620
pF1KE0 -VP------------AAQQMLNFPEKNKEKPVDLQNFGLRTDIYSKKTL-AKSKGA-SAG
:: :.:::::::.:.::::.:.::::::::.:.::.. .:::.: ::
CCDS89 LVPETAKGKPELQTSASQQMLNFPDKGKEKPTDMQNFGLRTDMYTKKNVPSKSKAAASAT
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KE0 REWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLENSDASLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::::
CCDS89 REWTEQETLLLLEALEMYKDDWNKVSEHVGSRTQDECILHFLRLPIEDPYLEDSEASLGP
630 640 650 660 670 680
690 700 710 720 730 740
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:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::...:::: ::::::.:
CCDS89 LAYQPIPFSQSGNPVMSTVAFLASVVDPRVASAAAKSALEEFSKMKEEVPTALVEAHVRK
690 700 710 720 730 740
750 760 770 780 790
pF1KE0 VQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLE--GAEEEKMEADPDGQQPEKAENK--
:.:::...::.::..::::: :::: ::::..: : .: ..:.. .. : : .
CCDS89 VEEAAKVTGKADPAFGLESSGIAGTTSDEPERIEESGNDEARVEGQATDEKKEPKEPREG
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800 810 820 830 840
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.:.:. : .:...:..::.::: . : :. . ..: :: .:. ::.
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850 860 870 880 890 900
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... :: : :::..:.:::..::::::::.::.::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::.:::: ::::::..:: ::::::::::.::::: ::
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:: : :: . :. . : .:: :. :.:: . : :: .:.: : :
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pF1KE0 VQEAARASGKVDPTYGLESSCIAGTGPDEPEKLE--GAEEEKMEADPDGQQPEKAENK--
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CCDS81 GGAIEEEAKEKTSEAPKKDEEKGKEGDSEKESEKSDGDPIVDPEKEKEPKEGQEEVLKEV
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pF1KE0 TDTCKERESDTGKKKVEHEISEGNVATAAAAALASAATKAKHLAAVEERKIKSLVALLVE
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CCDS81 VESEGER-----KTKVERDIGEGNLSTAAAAALAAAAVKAKHLAAVEERKIKSLVALLVE
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CCDS81 MHQQ--QQQPPPALPPGSQPIPPTGAAG------PPA---VHGLAVAP----ASVVPAPA
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CCDS81 GSGAP----PGSLGPSEQIGQAGSTAGPQQQQPAGAPQPGAV-PPGVPPPGPHGPSPFPN
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CCDS81 QQTPPSMMPG-AVPGSGHPGV-AGNAPLGLPFGMPPPPPPPAPSIIPFGSLADSISINLP
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1105 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 20:33:00 2016 done: Sun Nov 6 20:33:01 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]