Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0293
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0293, 329 aa
1>>>pF1KE0293 329 - 329 aa - 329 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0358+/-0.000397; mu= 18.9430+/- 0.025
mean_var=86.6896+/-17.940, 0's: 0 Z-trim(113.2): 58 B-trim: 2 in 1/53
Lambda= 0.137750
statistics sampled from 22441 (22499) to 22441 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.609), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 7.920
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_653200 (OMIM: 600363,608145) magnesium transpor ( 329) 2092 425.7 6.7e-119
NP_001135747 (OMIM: 600363,608145) magnesium trans ( 254) 1633 334.3 1.6e-91
XP_016878136 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_016878134 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_005272604 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_006720427 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_005272603 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_016878140 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_011542179 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_011542181 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_011542182 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_011542180 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_016878138 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_005272605 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_016878137 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_016878135 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_005272609 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
NP_001008892 (OMIM: 608146) magnesium transporter ( 360) 881 185.0 2e-46
NP_001008860 (OMIM: 608146) magnesium transporter ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_016878141 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_006720429 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
NP_001171818 (OMIM: 608146) magnesium transporter ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_005272607 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_016878143 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
NP_112184 (OMIM: 608146) magnesium transporter NIP ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_006720428 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_016878139 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_005272610 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
XP_016878142 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 360) 881 185.0 2e-46
NP_001092757 (OMIM: 609383,612281) magnesium trans ( 466) 813 171.6 2.8e-42
XP_016878149 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 341) 736 156.2 9.1e-38
XP_006720430 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 341) 736 156.2 9.1e-38
XP_016878146 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 341) 736 156.2 9.1e-38
XP_016878147 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 341) 736 156.2 9.1e-38
NP_001171817 (OMIM: 608146) magnesium transporter ( 341) 736 156.2 9.1e-38
XP_016878150 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 341) 736 156.2 9.1e-38
XP_016878151 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 341) 736 156.2 9.1e-38
NP_001008894 (OMIM: 608146) magnesium transporter ( 341) 736 156.2 9.1e-38
XP_016878145 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 341) 736 156.2 9.1e-38
XP_016878148 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 341) 736 156.2 9.1e-38
XP_016878152 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 341) 736 156.2 9.1e-38
XP_016878144 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium t ( 341) 736 156.2 9.1e-38
XP_011532854 (OMIM: 609383,612281) PREDICTED: magn ( 301) 722 153.4 5.8e-37
NP_001165763 (OMIM: 609383,612281) magnesium trans ( 447) 689 147.0 7.2e-35
>>NP_653200 (OMIM: 600363,608145) magnesium transporter (329 aa)
initn: 2092 init1: 2092 opt: 2092 Z-score: 2255.6 bits: 425.7 E(85289): 6.7e-119
Smith-Waterman score: 2092; 100.0% identity (100.0% similar) in 329 aa overlap (1-329:1-329)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGTAAAAAAAAAAAAAGEGARSPSPAAVSLGLGVAVVSSLVNGSTFVLQKKGIVRAKRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_653 MGTAAAAAAAAAAAAAGEGARSPSPAAVSLGLGVAVVSSLVNGSTFVLQKKGIVRAKRRG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 TSYLTDIVWWAGTIAMAVGQIGNFLAYTAVPTVLVTPLGALGVPFGSILASYLLKEKLNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_653 TSYLTDIVWWAGTIAMAVGQIGNFLAYTAVPTVLVTPLGALGVPFGSILASYLLKEKLNI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LGKLGCLLSCAGSVVLIIHSPKSESVTTQAELEEKLTNPVFVGYLCIVLLMLLLLIFWIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_653 LGKLGCLLSCAGSVVLIIHSPKSESVTTQAELEEKLTNPVFVGYLCIVLLMLLLLIFWIA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PAHGPTNIMVYISICSLLGSFTVPSTKGIGLAAQDILHNNPSSQRALCLCLVLLAVLGCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_653 PAHGPTNIMVYISICSLLGSFTVPSTKGIGLAAQDILHNNPSSQRALCLCLVLLAVLGCS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IIVQFRYINKALECFDSSVFGAIYYVVFTTLVLLASAILFREWSNVGLVDFLGMACGFTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_653 IIVQFRYINKALECFDSSVFGAIYYVVFTTLVLLASAILFREWSNVGLVDFLGMACGFTT
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE0 VSVGIVLIQVFKEFNFNLGEMNKSNMKTD
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_653 VSVGIVLIQVFKEFNFNLGEMNKSNMKTD
310 320
>>NP_001135747 (OMIM: 600363,608145) magnesium transport (254 aa)
initn: 1633 init1: 1633 opt: 1633 Z-score: 1764.0 bits: 334.3 E(85289): 1.6e-91
Smith-Waterman score: 1633; 100.0% identity (100.0% similar) in 254 aa overlap (76-329:1-254)
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 FVLQKKGIVRAKRRGTSYLTDIVWWAGTIAMAVGQIGNFLAYTAVPTVLVTPLGALGVPF
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAVGQIGNFLAYTAVPTVLVTPLGALGVPF
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 GSILASYLLKEKLNILGKLGCLLSCAGSVVLIIHSPKSESVTTQAELEEKLTNPVFVGYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSILASYLLKEKLNILGKLGCLLSCAGSVVLIIHSPKSESVTTQAELEEKLTNPVFVGYL
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 CIVLLMLLLLIFWIAPAHGPTNIMVYISICSLLGSFTVPSTKGIGLAAQDILHNNPSSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CIVLLMLLLLIFWIAPAHGPTNIMVYISICSLLGSFTVPSTKGIGLAAQDILHNNPSSQR
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 ALCLCLVLLAVLGCSIIVQFRYINKALECFDSSVFGAIYYVVFTTLVLLASAILFREWSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALCLCLVLLAVLGCSIIVQFRYINKALECFDSSVFGAIYYVVFTTLVLLASAILFREWSN
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320
pF1KE0 VGLVDFLGMACGFTTVSVGIVLIQVFKEFNFNLGEMNKSNMKTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGLVDFLGMACGFTTVSVGIVLIQVFKEFNFNLGEMNKSNMKTD
220 230 240 250
>>XP_016878136 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium trans (360 aa)
initn: 914 init1: 579 opt: 881 Z-score: 954.4 bits: 185.0 E(85289): 2e-46
Smith-Waterman score: 881; 43.5% identity (75.3% similar) in 308 aa overlap (30-329:12-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGTAAAAAAAAAAAAAGEGARSPSPAAVSLGLGVAVVSSLVNGSTFVLQKKGIVRAKRRG
.:::.:. ::. :..:.:.:::..: :.:
XP_016 MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 T--------SYLTDIVWWAGTIAMAVGQIGNFLAYTAVPTVLVTPLGALGVPFGSILASY
. .:: . .:::: ..:..:...:: ::. .:..::::::::.: ..::.::
XP_016 SMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LLKEKLNILGKLGCLLSCAGSVVLIIHSPKSESVTTQAELEEKLTNPVFVGYLCIVLLML
.:.:.::. ::.::::: ::.:..::.:: : . : :. .:: .: :: . .:...
XP_016 FLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LLLIFWIAPAHGPTNIMVYISICSLLGSFTVPSTKGIGLAAQDILHNNPSSQRALCLCLV
:.::: ..: :: :::.:::.:::..:.:.: .::.:.: .... ..: .. : ..
XP_016 LILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLRHPLAW-IL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LLAVLGCSIIVQFRYINKALECFDSSVFGAIYYVVFTTLVLLASAILFREWSNVGLVDFL
::... : . .:. :.:.::. :..:. :::: ::: :: :::::.::... . : .
XP_016 LLSLIVC-VSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVI
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE0 GMACGFTTVSVGIVLIQVFKEFNFNLGEMNKSNMKTD
: :: :. ::: :...::. .:.:. . : : .
XP_016 GTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGNLSNMYEVLNNNEESLTC
290 300 310 320 330 340
XP_016 GIEQHTGENVSRRNGNLTAF
350 360
>>XP_016878134 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium trans (360 aa)
initn: 914 init1: 579 opt: 881 Z-score: 954.4 bits: 185.0 E(85289): 2e-46
Smith-Waterman score: 881; 43.5% identity (75.3% similar) in 308 aa overlap (30-329:12-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGTAAAAAAAAAAAAAGEGARSPSPAAVSLGLGVAVVSSLVNGSTFVLQKKGIVRAKRRG
.:::.:. ::. :..:.:.:::..: :.:
XP_016 MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 T--------SYLTDIVWWAGTIAMAVGQIGNFLAYTAVPTVLVTPLGALGVPFGSILASY
. .:: . .:::: ..:..:...:: ::. .:..::::::::.: ..::.::
XP_016 SMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LLKEKLNILGKLGCLLSCAGSVVLIIHSPKSESVTTQAELEEKLTNPVFVGYLCIVLLML
.:.:.::. ::.::::: ::.:..::.:: : . : :. .:: .: :: . .:...
XP_016 FLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LLLIFWIAPAHGPTNIMVYISICSLLGSFTVPSTKGIGLAAQDILHNNPSSQRALCLCLV
:.::: ..: :: :::.:::.:::..:.:.: .::.:.: .... ..: .. : ..
XP_016 LILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLRHPLAW-IL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LLAVLGCSIIVQFRYINKALECFDSSVFGAIYYVVFTTLVLLASAILFREWSNVGLVDFL
::... : . .:. :.:.::. :..:. :::: ::: :: :::::.::... . : .
XP_016 LLSLIVC-VSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVI
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE0 GMACGFTTVSVGIVLIQVFKEFNFNLGEMNKSNMKTD
: :: :. ::: :...::. .:.:. . : : .
XP_016 GTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGNLSNMYEVLNNNEESLTC
290 300 310 320 330 340
XP_016 GIEQHTGENVSRRNGNLTAF
350 360
>>XP_005272604 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium trans (360 aa)
initn: 914 init1: 579 opt: 881 Z-score: 954.4 bits: 185.0 E(85289): 2e-46
Smith-Waterman score: 881; 43.5% identity (75.3% similar) in 308 aa overlap (30-329:12-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGTAAAAAAAAAAAAAGEGARSPSPAAVSLGLGVAVVSSLVNGSTFVLQKKGIVRAKRRG
.:::.:. ::. :..:.:.:::..: :.:
XP_005 MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 T--------SYLTDIVWWAGTIAMAVGQIGNFLAYTAVPTVLVTPLGALGVPFGSILASY
. .:: . .:::: ..:..:...:: ::. .:..::::::::.: ..::.::
XP_005 SMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LLKEKLNILGKLGCLLSCAGSVVLIIHSPKSESVTTQAELEEKLTNPVFVGYLCIVLLML
.:.:.::. ::.::::: ::.:..::.:: : . : :. .:: .: :: . .:...
XP_005 FLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LLLIFWIAPAHGPTNIMVYISICSLLGSFTVPSTKGIGLAAQDILHNNPSSQRALCLCLV
:.::: ..: :: :::.:::.:::..:.:.: .::.:.: .... ..: .. : ..
XP_005 LILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLRHPLAW-IL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LLAVLGCSIIVQFRYINKALECFDSSVFGAIYYVVFTTLVLLASAILFREWSNVGLVDFL
::... : . .:. :.:.::. :..:. :::: ::: :: :::::.::... . : .
XP_005 LLSLIVC-VSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVI
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE0 GMACGFTTVSVGIVLIQVFKEFNFNLGEMNKSNMKTD
: :: :. ::: :...::. .:.:. . : : .
XP_005 GTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGNLSNMYEVLNNNEESLTC
290 300 310 320 330 340
XP_005 GIEQHTGENVSRRNGNLTAF
350 360
>>XP_006720427 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium trans (360 aa)
initn: 914 init1: 579 opt: 881 Z-score: 954.4 bits: 185.0 E(85289): 2e-46
Smith-Waterman score: 881; 43.5% identity (75.3% similar) in 308 aa overlap (30-329:12-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGTAAAAAAAAAAAAAGEGARSPSPAAVSLGLGVAVVSSLVNGSTFVLQKKGIVRAKRRG
.:::.:. ::. :..:.:.:::..: :.:
XP_006 MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 T--------SYLTDIVWWAGTIAMAVGQIGNFLAYTAVPTVLVTPLGALGVPFGSILASY
. .:: . .:::: ..:..:...:: ::. .:..::::::::.: ..::.::
XP_006 SMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LLKEKLNILGKLGCLLSCAGSVVLIIHSPKSESVTTQAELEEKLTNPVFVGYLCIVLLML
.:.:.::. ::.::::: ::.:..::.:: : . : :. .:: .: :: . .:...
XP_006 FLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LLLIFWIAPAHGPTNIMVYISICSLLGSFTVPSTKGIGLAAQDILHNNPSSQRALCLCLV
:.::: ..: :: :::.:::.:::..:.:.: .::.:.: .... ..: .. : ..
XP_006 LILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLRHPLAW-IL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LLAVLGCSIIVQFRYINKALECFDSSVFGAIYYVVFTTLVLLASAILFREWSNVGLVDFL
::... : . .:. :.:.::. :..:. :::: ::: :: :::::.::... . : .
XP_006 LLSLIVC-VSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVI
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE0 GMACGFTTVSVGIVLIQVFKEFNFNLGEMNKSNMKTD
: :: :. ::: :...::. .:.:. . : : .
XP_006 GTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGNLSNMYEVLNNNEESLTC
290 300 310 320 330 340
XP_006 GIEQHTGENVSRRNGNLTAF
350 360
>>XP_005272603 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium trans (360 aa)
initn: 914 init1: 579 opt: 881 Z-score: 954.4 bits: 185.0 E(85289): 2e-46
Smith-Waterman score: 881; 43.5% identity (75.3% similar) in 308 aa overlap (30-329:12-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGTAAAAAAAAAAAAAGEGARSPSPAAVSLGLGVAVVSSLVNGSTFVLQKKGIVRAKRRG
.:::.:. ::. :..:.:.:::..: :.:
XP_005 MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 T--------SYLTDIVWWAGTIAMAVGQIGNFLAYTAVPTVLVTPLGALGVPFGSILASY
. .:: . .:::: ..:..:...:: ::. .:..::::::::.: ..::.::
XP_005 SMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LLKEKLNILGKLGCLLSCAGSVVLIIHSPKSESVTTQAELEEKLTNPVFVGYLCIVLLML
.:.:.::. ::.::::: ::.:..::.:: : . : :. .:: .: :: . .:...
XP_005 FLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LLLIFWIAPAHGPTNIMVYISICSLLGSFTVPSTKGIGLAAQDILHNNPSSQRALCLCLV
:.::: ..: :: :::.:::.:::..:.:.: .::.:.: .... ..: .. : ..
XP_005 LILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLRHPLAW-IL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LLAVLGCSIIVQFRYINKALECFDSSVFGAIYYVVFTTLVLLASAILFREWSNVGLVDFL
::... : . .:. :.:.::. :..:. :::: ::: :: :::::.::... . : .
XP_005 LLSLIVC-VSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVI
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE0 GMACGFTTVSVGIVLIQVFKEFNFNLGEMNKSNMKTD
: :: :. ::: :...::. .:.:. . : : .
XP_005 GTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGNLSNMYEVLNNNEESLTC
290 300 310 320 330 340
XP_005 GIEQHTGENVSRRNGNLTAF
350 360
>>XP_016878140 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium trans (360 aa)
initn: 914 init1: 579 opt: 881 Z-score: 954.4 bits: 185.0 E(85289): 2e-46
Smith-Waterman score: 881; 43.5% identity (75.3% similar) in 308 aa overlap (30-329:12-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGTAAAAAAAAAAAAAGEGARSPSPAAVSLGLGVAVVSSLVNGSTFVLQKKGIVRAKRRG
.:::.:. ::. :..:.:.:::..: :.:
XP_016 MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 T--------SYLTDIVWWAGTIAMAVGQIGNFLAYTAVPTVLVTPLGALGVPFGSILASY
. .:: . .:::: ..:..:...:: ::. .:..::::::::.: ..::.::
XP_016 SMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LLKEKLNILGKLGCLLSCAGSVVLIIHSPKSESVTTQAELEEKLTNPVFVGYLCIVLLML
.:.:.::. ::.::::: ::.:..::.:: : . : :. .:: .: :: . .:...
XP_016 FLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LLLIFWIAPAHGPTNIMVYISICSLLGSFTVPSTKGIGLAAQDILHNNPSSQRALCLCLV
:.::: ..: :: :::.:::.:::..:.:.: .::.:.: .... ..: .. : ..
XP_016 LILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLRHPLAW-IL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LLAVLGCSIIVQFRYINKALECFDSSVFGAIYYVVFTTLVLLASAILFREWSNVGLVDFL
::... : . .:. :.:.::. :..:. :::: ::: :: :::::.::... . : .
XP_016 LLSLIVC-VSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVI
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE0 GMACGFTTVSVGIVLIQVFKEFNFNLGEMNKSNMKTD
: :: :. ::: :...::. .:.:. . : : .
XP_016 GTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGNLSNMYEVLNNNEESLTC
290 300 310 320 330 340
XP_016 GIEQHTGENVSRRNGNLTAF
350 360
>>XP_011542179 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium trans (360 aa)
initn: 914 init1: 579 opt: 881 Z-score: 954.4 bits: 185.0 E(85289): 2e-46
Smith-Waterman score: 881; 43.5% identity (75.3% similar) in 308 aa overlap (30-329:12-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGTAAAAAAAAAAAAAGEGARSPSPAAVSLGLGVAVVSSLVNGSTFVLQKKGIVRAKRRG
.:::.:. ::. :..:.:.:::..: :.:
XP_011 MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 T--------SYLTDIVWWAGTIAMAVGQIGNFLAYTAVPTVLVTPLGALGVPFGSILASY
. .:: . .:::: ..:..:...:: ::. .:..::::::::.: ..::.::
XP_011 SMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LLKEKLNILGKLGCLLSCAGSVVLIIHSPKSESVTTQAELEEKLTNPVFVGYLCIVLLML
.:.:.::. ::.::::: ::.:..::.:: : . : :. .:: .: :: . .:...
XP_011 FLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LLLIFWIAPAHGPTNIMVYISICSLLGSFTVPSTKGIGLAAQDILHNNPSSQRALCLCLV
:.::: ..: :: :::.:::.:::..:.:.: .::.:.: .... ..: .. : ..
XP_011 LILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLRHPLAW-IL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LLAVLGCSIIVQFRYINKALECFDSSVFGAIYYVVFTTLVLLASAILFREWSNVGLVDFL
::... : . .:. :.:.::. :..:. :::: ::: :: :::::.::... . : .
XP_011 LLSLIVC-VSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVI
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE0 GMACGFTTVSVGIVLIQVFKEFNFNLGEMNKSNMKTD
: :: :. ::: :...::. .:.:. . : : .
XP_011 GTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGNLSNMYEVLNNNEESLTC
290 300 310 320 330 340
XP_011 GIEQHTGENVSRRNGNLTAF
350 360
>>XP_011542181 (OMIM: 608146) PREDICTED: magnesium trans (360 aa)
initn: 914 init1: 579 opt: 881 Z-score: 954.4 bits: 185.0 E(85289): 2e-46
Smith-Waterman score: 881; 43.5% identity (75.3% similar) in 308 aa overlap (30-329:12-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MGTAAAAAAAAAAAAAGEGARSPSPAAVSLGLGVAVVSSLVNGSTFVLQKKGIVRAKRRG
.:::.:. ::. :..:.:.:::..: :.:
XP_011 MSQGRGKYDFYIGLGLAMSSSIFIGGSFILKKKGLLRLARKG
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KE0 T--------SYLTDIVWWAGTIAMAVGQIGNFLAYTAVPTVLVTPLGALGVPFGSILASY
. .:: . .:::: ..:..:...:: ::. .:..::::::::.: ..::.::
XP_011 SMRAGQGGHAYLKEWLWWAGLLSMGAGEVANFAAYAFAPATLVTPLGALSVLVSAILSSY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 LLKEKLNILGKLGCLLSCAGSVVLIIHSPKSESVTTQAELEEKLTNPVFVGYLCIVLLML
.:.:.::. ::.::::: ::.:..::.:: : . : :. .:: .: :: . .:...
XP_011 FLNERLNLHGKIGCLLSILGSTVMVIHAPKEEEIETLNEMSHKLGDPGFVVFATLVVIVA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LLLIFWIAPAHGPTNIMVYISICSLLGSFTVPSTKGIGLAAQDILHNNPSSQRALCLCLV
:.::: ..: :: :::.:::.:::..:.:.: .::.:.: .... ..: .. : ..
XP_011 LILIFVVGPRHGQTNILVYITICSVIGAFSVSCVKGLGIAIKELFAGKPVLRHPLAW-IL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 LLAVLGCSIIVQFRYINKALECFDSSVFGAIYYVVFTTLVLLASAILFREWSNVGLVDFL
::... : . .:. :.:.::. :..:. :::: ::: :: :::::.::... . : .
XP_011 LLSLIVC-VSTQINYLNRALDIFNTSIVTPIYYVFFTTSVLTCSAILFKEWQDMPVDDVI
230 240 250 260 270 280
300 310 320
pF1KE0 GMACGFTTVSVGIVLIQVFKEFNFNLGEMNKSNMKTD
: :: :. ::: :...::. .:.:. . : : .
XP_011 GTLSGFFTIIVGIFLLHAFKDVSFSLASLPVSFRKDEKAMNGNLSNMYEVLNNNEESLTC
290 300 310 320 330 340
XP_011 GIEQHTGENVSRRNGNLTAF
350 360
329 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 04:42:44 2016 done: Mon Nov 7 04:42:45 2016
Total Scan time: 7.920 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]