Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9761
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9761, 766 aa
1>>>pF1KB9761 766 - 766 aa - 766 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7743+/-0.000966; mu= 13.2785+/- 0.058
mean_var=104.0406+/-21.108, 0's: 0 Z-trim(107.5): 50 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.125740
statistics sampled from 9581 (9630) to 9581 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.296), width: 16
Scan time: 3.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5045.1 SIM1 gene_id:6492|Hs108|chr6 ( 766) 5206 955.6 0
CCDS13646.1 SIM2 gene_id:6493|Hs108|chr21 ( 667) 2245 418.4 1.9e-116
CCDS9754.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 ( 735) 916 177.3 7.6e-44
CCDS9753.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 ( 826) 916 177.4 8.4e-44
CCDS58324.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 ( 850) 916 177.4 8.6e-44
CCDS1825.1 EPAS1 gene_id:2034|Hs108|chr2 ( 870) 835 162.7 2.3e-39
CCDS12682.1 HIF3A gene_id:64344|Hs108|chr19 ( 667) 782 153.0 1.4e-36
CCDS12681.2 HIF3A gene_id:64344|Hs108|chr19 ( 669) 782 153.0 1.4e-36
CCDS9645.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 901) 553 111.5 6e-24
CCDS55912.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 903) 553 111.5 6e-24
CCDS53892.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 920) 553 111.5 6.1e-24
CCDS53891.1 NPAS3 gene_id:64067|Hs108|chr14 ( 933) 553 111.5 6.2e-24
CCDS42580.2 HIF3A gene_id:64344|Hs108|chr19 ( 600) 510 103.6 9.4e-22
CCDS12694.1 NPAS1 gene_id:4861|Hs108|chr19 ( 590) 392 82.2 2.6e-15
CCDS8138.1 NPAS4 gene_id:266743|Hs108|chr11 ( 802) 323 69.8 2e-11
CCDS1713.1 NCOA1 gene_id:8648|Hs108|chr2 (1399) 324 70.1 2.8e-11
CCDS42660.1 NCOA1 gene_id:8648|Hs108|chr2 (1440) 324 70.1 2.9e-11
CCDS1712.1 NCOA1 gene_id:8648|Hs108|chr2 (1441) 324 70.1 2.9e-11
>>CCDS5045.1 SIM1 gene_id:6492|Hs108|chr6 (766 aa)
initn: 5206 init1: 5206 opt: 5206 Z-score: 5106.3 bits: 955.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5206; 100.0% identity (100.0% similar) in 766 aa overlap (1-766:1-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MKEKSKNAARTRREKENSEFYELAKLLPLPSAITSQLDKASIIRLTTSYLKMRVVFPEGL
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CCDS50 MKEKSKNAARTRREKENSEFYELAKLLPLPSAITSQLDKASIIRLTTSYLKMRVVFPEGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GEAWGHSSRTSPLDNVGRELGSHLLQTLDGFIFVVAPDGKIMYISETASVHLGLSQVELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 GEAWGHSSRTSPLDNVGRELGSHLLQTLDGFIFVVAPDGKIMYISETASVHLGLSQVELT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 GNSIYEYIHPADHDEMTAVLTAHQPYHSHFVQEYEIERSFFLRMKCVLAKRNAGLTCGGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 GNSIYEYIHPADHDEMTAVLTAHQPYHSHFVQEYEIERSFFLRMKCVLAKRNAGLTCGGY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KVIHCSGYLKIRQYSLDMSPFDGCYQNVGLVAVGHSLPPSAVTEIKLHSNMFMFRASLDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 KVIHCSGYLKIRQYSLDMSPFDGCYQNVGLVAVGHSLPPSAVTEIKLHSNMFMFRASLDM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KLIFLDSRVAELTGYEPQDLIEKTLYHHVHGCDTFHLRCAHHLLLVKGQVTTKYYRFLAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 KLIFLDSRVAELTGYEPQDLIEKTLYHHVHGCDTFHLRCAHHLLLVKGQVTTKYYRFLAK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 HGGWVWVQSYATIVHNSRSSRPHCIVSVNYVLTDTEYKGLQLSLDQISASKPAFSYTSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 HGGWVWVQSYATIVHNSRSSRPHCIVSVNYVLTDTEYKGLQLSLDQISASKPAFSYTSSS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 TPTMTDNRKGAKSRLSSSKSKSRTSPYPQYSGFHTERSESDHDSQWGGSPLTDTASPQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 TPTMTDNRKGAKSRLSSSKSKSRTSPYPQYSGFHTERSESDHDSQWGGSPLTDTASPQLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 DPADRPGSQHDASCAYRQFSDRSSLCYGFALDHSRLVEERHFHTQACEGGRCEAGRYFLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 DPADRPGSQHDASCAYRQFSDRSSLCYGFALDHSRLVEERHFHTQACEGGRCEAGRYFLG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 TPQAGREPWWGSRAALPLTKASPESREAYENSMPHIASVHRIHGRGHWDEDSVVSSPDPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 TPQAGREPWWGSRAALPLTKASPESREAYENSMPHIASVHRIHGRGHWDEDSVVSSPDPG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 SASESGDRYRTEQYQSSPHEPSKIETLIRATQQMIKEEENRLQLRKAPSDQLASINGAGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 SASESGDRYRTEQYQSSPHEPSKIETLIRATQQMIKEEENRLQLRKAPSDQLASINGAGK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 KHSLCFANYQQPPPTGEVCHGSALANTSPCDHIQQREGKMLSPHENDYDNSPTALSRISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 KHSLCFANYQQPPPTGEVCHGSALANTSPCDHIQQREGKMLSPHENDYDNSPTALSRISS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB9 PNSDRISKSSLILAKDYLHSDISPHQTAGDHPTVSPNCFGSHRQYFDKHAYTLTGYALEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 PNSDRISKSSLILAKDYLHSDISPHQTAGDHPTVSPNCFGSHRQYFDKHAYTLTGYALEH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB9 LYDSETIRNYSLGCNGSHFDVTSHLRMQPDPAQGHKGTSVIITNGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS50 LYDSETIRNYSLGCNGSHFDVTSHLRMQPDPAQGHKGTSVIITNGS
730 740 750 760
>>CCDS13646.1 SIM2 gene_id:6493|Hs108|chr21 (667 aa)
initn: 2200 init1: 2070 opt: 2245 Z-score: 2204.3 bits: 418.4 E(32554): 1.9e-116
Smith-Waterman score: 2245; 69.5% identity (84.9% similar) in 511 aa overlap (1-503:1-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MKEKSKNAARTRREKENSEFYELAKLLPLPSAITSQLDKASIIRLTTSYLKMRVVFPEGL
:::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS13 MKEKSKNAAKTRREKENGEFYELAKLLPLPSAITSQLDKASIIRLTTSYLKMRAVFPEGL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 GEAWGHSSRTSPLDNVGRELGSHLLQTLDGFIFVVAPDGKIMYISETASVHLGLSQVELT
:.:::. ::..:::.:..:::::::::::::.:::: :::::::::::::::::::::::
CCDS13 GDAWGQPSRAGPLDGVAKELGSHLLQTLDGFVFVVASDGKIMYISETASVHLGLSQVELT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 GNSIYEYIHPADHDEMTAVLTAHQPYHSHFVQEYEIERSFFLRMKCVLAKRNAGLTCGGY
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CCDS13 GNSIYEYIHPSDHDEMTAVLTAHQPLHHHLLQEYEIERSFFLRMKCVLAKRNAGLTCSGY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KVIHCSGYLKIRQYSLDMSPFDGCYQNVGLVAVGHSLPPSAVTEIKLHSNMFMFRASLDM
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CCDS13 KVIHCSGYLKIRQYMLDMSLYDSCYQIVGLVAVGQSLPPSAITEIKLYSNMFMFRASLDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KLIFLDSRVAELTGYEPQDLIEKTLYHHVHGCDTFHLRCAHHLLLVKGQVTTKYYRFLAK
:::::::::.:.:::::::::::::::::::::.:::: :::::::::::::::::.:.:
CCDS13 KLIFLDSRVTEVTGYEPQDLIEKTLYHHVHGCDVFHLRYAHHLLLVKGQVTTKYYRLLSK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 HGGWVWVQSYATIVHNSRSSRPHCIVSVNYVLTDTEYKGLQLSLDQISASKPAFSYTSSS
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CCDS13 RGGWVWVQSYATVVHNSRSSRPHCIVSVNYVLTEIEYKELQLSLEQVSTAKSQDSWRTAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB9 TPTMTDNRKGAKSRLSSSKSKSRTSPYP--QYSGFHTERSESDHDSQWGGSPLTDTASPQ
. : ..:: .: . .. :.: ::.::: :::.:. .. : . ..: .:: ...:.:
CCDS13 S-TSQETRKLVKPKNTKMKTKLRTNPYPPQQYSSFQMDKLECGQLGNWRASPPASAAAP-
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 LLDPADRPGSQHDASCAYRQFSDRSSLCYG-FALDHSRLVEERHFHTQAC----EGGRCE
: .: :. . ..: : :: : :: :.. .. : .:. ::
CCDS13 ---PELQPHSESSDLLYTPSYSLPFSYHYGHFPLD-SHVFSSKKPMLPAKFGQPQGSPCE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB9 AGRYFLGT-PQAGREPWWGSRAALPLTKASPESREAYENSMPHIASVHRIHGRGHWDEDS
..:.::.: : .:. : . .: ...::
CCDS13 VARFFLSTLPASGECQWHYANPLVP-SSSSPAKNPPEPPANTARHSLVPSYEAPAAAVRR
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB9 VVSSPDPGSASESGDRYRTEQYQSSPHEPSKIETLIRATQQMIKEEENRLQLRKAPSDQL
CCDS13 FGEDTAPPSFPSCGHYREEPALGPAKAARQAARDGARLALARAAPECCAPPTPEAPGAPA
540 550 560 570 580 590
>>CCDS9754.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 (735 aa)
initn: 947 init1: 426 opt: 916 Z-score: 900.7 bits: 177.3 E(32554): 7.6e-44
Smith-Waterman score: 916; 40.7% identity (71.2% similar) in 371 aa overlap (2-365:19-376)
10 20 30 40
pF1KB9 MKEKSKNAARTRREKENSEFYELAKLLPLPSAITSQLDKASII
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CCDS97 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 RLTTSYLKMRVVFPEGLGEAWGHSSRTSPLDNVGRELGSHLLQTLDGFIFVVAPDGKIMY
::: :::..: .. : . :.. ... :..::::..:.. :: ..:
CCDS97 RLTISYLRVRKLLDAG---------DLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIY
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 ISETASVHLGLSQVELTGNSIYEYIHPADHDEMTAVLTAHQPYHSHFVQEYEIERSFFLR
::.... ..::.: ::::.:.... :: ::.:: .:: :. . .: . .::::::
CCDS97 ISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLT-HRNGLVKKGKEQNTQRSFFLR
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB9 MKCVLAKRN--AGLTCGGYKVIHCSGYLKIRQYSLDMSPFDGCYQN---VGLVAVGHSLP
:::.:..:. .. . .::.::.:.... :. . . . :.. . :: . . .:
CCDS97 MKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHV--YDTNSNQPQCGYKKPPMTCLVLICEPIP
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 -PSAVTEIKLHSNMFMFRASLDMKLIFLDSRVAELTGYEPQDLIEKTLYHHVHGCDTFHL
:: . :: : :. :. : :::::. . : :..:: ::::..:. ...:.. :. :. ::
CCDS97 HPSNI-EIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHL
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 RCAHHLLLVKGQVTTKYYRFLAKHGGWVWVQSYATIVHNSRSSRPHCIVSVNYVLTDTEY
.:: ...:::::: ::.:::.::.:::.. ::...:...:.:.::: ::::..
CCDS97 TKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQ
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 KGLQLSLDQISAS-KPAFSYTSSSTPTMTDNRKGAKSRLSSSKSKSRTSPYPQYSGFHTE
. : .::.: ::. : . : .:
CCDS97 HDLIFSLQQTECVLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDT
350 360 370 380 390 400
>>CCDS9753.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 (826 aa)
initn: 947 init1: 426 opt: 916 Z-score: 899.9 bits: 177.4 E(32554): 8.4e-44
Smith-Waterman score: 916; 40.7% identity (71.2% similar) in 371 aa overlap (2-365:19-376)
10 20 30 40
pF1KB9 MKEKSKNAARTRREKENSEFYELAKLLPLPSAITSQLDKASII
::::..:::.:: ::. :::::. :::: ..:.:::::..
CCDS97 MEGAGGANDKKKISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPHNVSSHLDKASVM
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 RLTTSYLKMRVVFPEGLGEAWGHSSRTSPLDNVGRELGSHLLQTLDGFIFVVAPDGKIMY
::: :::..: .. : . :.. ... :..::::..:.. :: ..:
CCDS97 RLTISYLRVRKLLDAG---------DLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGFVMVLTDDGDMIY
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 ISETASVHLGLSQVELTGNSIYEYIHPADHDEMTAVLTAHQPYHSHFVQEYEIERSFFLR
::.... ..::.: ::::.:.... :: ::.:: .:: :. . .: . .::::::
CCDS97 ISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLT-HRNGLVKKGKEQNTQRSFFLR
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB9 MKCVLAKRN--AGLTCGGYKVIHCSGYLKIRQYSLDMSPFDGCYQN---VGLVAVGHSLP
:::.:..:. .. . .::.::.:.... :. . . . :.. . :: . . .:
CCDS97 MKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHV--YDTNSNQPQCGYKKPPMTCLVLICEPIP
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 -PSAVTEIKLHSNMFMFRASLDMKLIFLDSRVAELTGYEPQDLIEKTLYHHVHGCDTFHL
:: . :: : :. :. : :::::. . : :..:: ::::..:. ...:.. :. :. ::
CCDS97 HPSNI-EIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSIYEYYHALDSDHL
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 RCAHHLLLVKGQVTTKYYRFLAKHGGWVWVQSYATIVHNSRSSRPHCIVSVNYVLTDTEY
.:: ...:::::: ::.:::.::.:::.. ::...:...:.:.::: ::::..
CCDS97 TKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCIVCVNYVVSGIIQ
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 KGLQLSLDQISAS-KPAFSYTSSSTPTMTDNRKGAKSRLSSSKSKSRTSPYPQYSGFHTE
. : .::.: ::. : . : .:
CCDS97 HDLIFSLQQTECVLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPDALTLLAPAAGDT
350 360 370 380 390 400
>>CCDS58324.1 HIF1A gene_id:3091|Hs108|chr14 (850 aa)
initn: 947 init1: 426 opt: 916 Z-score: 899.7 bits: 177.4 E(32554): 8.6e-44
Smith-Waterman score: 916; 40.7% identity (71.2% similar) in 371 aa overlap (2-365:43-400)
10 20 30
pF1KB9 MKEKSKNAARTRREKENSEFYELAKLLPLPS
::::..:::.:: ::. :::::. ::::
CCDS58 VFLKEGLGNSKPEELEEIRIENGRISSERRKEKSRDAARSRRSKESEVFYELAHQLPLPH
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 AITSQLDKASIIRLTTSYLKMRVVFPEGLGEAWGHSSRTSPLDNVGRELGSHLLQTLDGF
..:.:::::..::: :::..: .. : . :.. ... :..::::
CCDS58 NVSSHLDKASVMRLTISYLRVRKLLDAG---------DLDIEDDMKAQMNCFYLKALDGF
80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 IFVVAPDGKIMYISETASVHLGLSQVELTGNSIYEYIHPADHDEMTAVLTAHQPYHSHFV
..:.. :: ..:::.... ..::.: ::::.:.... :: ::.:: .:: :. .
CCDS58 VMVLTDDGDMIYISDNVNKYMGLTQFELTGHSVFDFTHPCDHEEMREMLT-HRNGLVKKG
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KB9 QEYEIERSFFLRMKCVLAKRN--AGLTCGGYKVIHCSGYLKIRQYSLDMSPFDGCYQN--
.: . .:::::::::.:..:. .. . .::.::.:.... :. . . . :..
CCDS58 KEQNTQRSFFLRMKCTLTSRGRTMNIKSATWKVLHCTGHIHV--YDTNSNQPQCGYKKPP
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB9 -VGLVAVGHSLP-PSAVTEIKLHSNMFMFRASLDMKLIFLDSRVAELTGYEPQDLIEKTL
. :: . . .: :: . :: : :. :. : :::::. . : :..:: ::::..:. ...
CCDS58 MTCLVLICEPIPHPSNI-EIPLDSKTFLSRHSLDMKFSYCDERITELMGYEPEELLGRSI
250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 YHHVHGCDTFHLRCAHHLLLVKGQVTTKYYRFLAKHGGWVWVQSYATIVHNSRSSRPHCI
:.. :. :. :: .:: ...:::::: ::.:::.::.:::.. ::...:...:.:.::
CCDS58 YEYYHALDSDHLTKTHHDMFTKGQVTTGQYRMLAKRGGYVWVETQATVIYNTKNSQPQCI
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 VSVNYVLTDTEYKGLQLSLDQISAS-KPAFSYTSSSTPTMTDNRKGAKSRLSSSKSKSRT
: ::::.. . : .::.: ::. : . : .:
CCDS58 VCVNYVVSGIIQHDLIFSLQQTECVLKPVESSDMKMTQLFTKVESEDTSSLFDKLKKEPD
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
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:::....:. ..: . .::.::.: .:. . . . : . . :. . . .
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.:. : .::::.. ::.::::::.::... .:...: :. .:.::. :::::.. : .
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. .:.:: : :: . .: . .. ::: :. :.
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10 20 30 40
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..:. .: . .::..:::... . . :: :. :: . ...: .
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:: :::..: :::::. ::..:.:. ::.: ..:. . . :: :.......: :. ::
CCDS12 LLSKGQAVTGQYRFLARSGGYLWTQTQATVVSGGRGPQSESIVCVHFLISQVEETGVVLS
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:.:
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10 20 30 40
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:::.:
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. .. : :. : : . .: . .. :: :: .. ::. .. :
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: : :. ::: .:. . ..:.:: . . :. :.. . : . :: :
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::
CCDS96 FPSPQGGGGGGGGGGGLHVAIPDSVLTPPGADGAAARKTQFGASATAALAPVASDPLSPP
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pF1KB9 MKEKSKNAARTRREKENSEFYELAKLLPLPSAITSQLDKASIIRLTTS
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CCDS55 QDPSRRERLQALRKEKSRDAARSRRGKENFEFYELAKLLPLPAAITSQLDKASIIRLTIS
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CCDS55 YLKMRDFANQG-DPPWNLRMEGPPPNTSVKVIGAQRRRSPSALAIEVFEAHLGSHILQSL
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CCDS55 DGFVFALNQEGKFLYISETVSIYLGLSQVELTGSSVFDYVHPGDHVEMAEQLGMKLPPGR
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pF1KB9 ------TAH---------------QPYHSH----FVQEYEIERSFFLRMKCVLAKRNAGL
::. .: .: .. . .:::::.::: .:.::.. .
CCDS55 GLLSQGTAEDGASSASSSSQSETPEPVESTSPSLLTTDNTLERSFFIRMKSTLTKRGVHI
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pF1KB9 TCGGYKVIHCSGYLKIRQYSLDMSPFDGCYQNVGLVAVGHSLPPSAVTEIKLHSNMFMFR
.:::::: .: :..: ::. . : .:::.:.:.::: ...:... .::. :
CCDS55 KSSGYKVIHITGRLRLR-VSLSHGRTVPS-QIMGLVVVAHALPPPTINEVRIDCHMFVTR
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240 250 260 270 280 290
pF1KB9 ASLDMKLIFLDSRVAELTGYEPQDLIEKTLYHHVHGCDTFHLRCAHHLLLVKGQVTTKYY
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CCDS55 VNMDLNIIYCENRISDYMDLTPVDIVGKRCYHFIHAEDVEGIRHSHLDLLNKGQCVTKYY
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pF1KB9 RFLAKHGGWVWVQSYATIVHNSRSSRPHCIVSVNYVLTDTEYKGLQLSLDQISASKPAFS
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CCDS55 RWMQKNGGYIWIQSSATIAINAKNANEKNIIWVNYLLSNPEYKDTPMDIAQLPHLPEKTS
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CCDS55 MNCNDDGHSSSNPDSRDSDDSFEHSDFENPKAGEDGFGALGAMQIKVERYVESESDLRLQ
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pF1KB9 ACEGGRCEAGRYFLGTPQAG--------------REPWWGSRAALPLTKAS-PESREA--
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CCDS55 NCESLTSDSAKDSDSAGEAGAQASSKHQKRKKRRKRQKGGSASRRRLSSASSPGGLDAGL
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pF1KB9 YEN----SMPHIASVHRIHGRG----HWDEDSVVSSPDPGSA-SESGDRYRTEQYQSSPH
: : :. ::: .:. . ..:.:: . . :. :.. . : . :: :
CCDS55 VEPPRLLSSPNSASVLKIKTEISEPINFDNDSSIWNYPPNREISRNESPYSMTKPPSSEH
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pF1KB9 EPSKIETLIRATQQMIKEEENRLQLRKAPSDQLASINGAGKKHSLCFANYQQPPPTGEVC
::
CCDS55 FPSPQGGGGGGGGGGGLHVAIPDSVLTPPGADGAAARKTQFGASATAALAPVASDPLSPP
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766 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 03:38:30 2016 done: Mon Nov 7 03:38:31 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]