Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9752
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9752, 607 aa
1>>>pF1KB9752 607 - 607 aa - 607 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2676+/-0.000932; mu= 8.3168+/- 0.057
mean_var=204.8215+/-41.827, 0's: 0 Z-trim(113.3): 30 B-trim: 90 in 1/51
Lambda= 0.089616
statistics sampled from 13916 (13945) to 13916 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.428), width: 16
Scan time: 3.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6 ( 607) 4083 540.5 2.3e-153
CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 602) 1557 213.9 4.8e-55
CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 496) 1555 213.6 4.9e-55
CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX ( 520) 1210 169.0 1.4e-41
CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7 ( 447) 947 134.9 2.1e-31
CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 495) 846 121.9 1.9e-27
CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 398) 835 120.4 4.4e-27
CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 372) 834 120.3 4.6e-27
CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11 ( 385) 805 116.5 6.3e-26
CCDS10670.1 TBX6 gene_id:6911|Hs108|chr16 ( 436) 800 115.9 1.1e-25
CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 546) 793 115.1 2.4e-25
CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 545) 786 114.2 4.5e-25
CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17 ( 712) 784 114.0 6.6e-25
CCDS9173.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 518) 766 111.6 2.6e-24
CCDS9175.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 723) 764 111.5 4e-24
CCDS9174.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 468) 745 108.8 1.6e-23
CCDS55960.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (2856) 687 102.0 1.1e-20
CCDS55959.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (3065) 687 102.0 1.2e-20
CCDS33310.1 TBR1 gene_id:10716|Hs108|chr2 ( 682) 650 96.7 1e-19
CCDS2646.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 686) 643 95.8 2e-19
CCDS63585.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 705) 643 95.8 2e-19
CCDS11514.1 TBX21 gene_id:30009|Hs108|chr17 ( 535) 638 95.1 2.6e-19
CCDS9176.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 743) 503 77.7 5.9e-14
CCDS59045.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 377) 494 76.3 7.9e-14
CCDS5290.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 435) 494 76.4 8.8e-14
CCDS1272.1 TBX19 gene_id:9095|Hs108|chr1 ( 448) 480 74.6 3.2e-13
CCDS63584.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 410) 479 74.4 3.2e-13
>>CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6 (607 aa)
initn: 4083 init1: 4083 opt: 4083 Z-score: 2866.7 bits: 540.5 E(32554): 2.3e-153
Smith-Waterman score: 4083; 99.8% identity (99.8% similar) in 607 aa overlap (1-607:1-607)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAEKRRGSPCSMLSLKAHAFSVEALIGAEKQQQLQKKRRKLGAEEAARAVDDGGCSRGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS34 MAEKRRGSPCSMLSLKAHAFSVEALIGAEKQQQLQKKRRKLGAEEAAGAVDDGGCSRGGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AGEKGSSEGDEGAALPPPAGATSGPARSGADLERGAAGGCEDGFQQGASPLASPGGSPKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AGEKGSSEGDEGAALPPPAGATSGPARSGADLERGAAGGCEDGFQQGASPLASPGGSPKG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SPARSLARPGTPLPSPQAPRVDLQGAELWKRFHEIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKISGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SPARSLARPGTPLPSPQAPRVDLQGAELWKRFHEIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKISGLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 PHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSPASGETWMRQVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSPASGETWMRQVI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDCGDDLSPIKPVPSGEGVKAFSFPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDCGDDLSPIKPVPSGEGVKAFSFPE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 TVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRMGLEALVESYAFWRPSLRTLTFEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRMGLEALVESYAFWRPSLRTLTFEDI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 PGIPKQGNASSSTLLQGTGNGVPATHPHLLSGSSCSSPAFHLGPNTSQLCSLAPADYSAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PGIPKQGNASSSTLLQGTGNGVPATHPHLLSGSSCSSPAFHLGPNTSQLCSLAPADYSAC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 ARSGLTLNRYSTSLAETYNRLTNQAGETFAPPRTPSYVGVSSSTSVNMSMGGTDGDTFSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ARSGLTLNRYSTSLAETYNRLTNQAGETFAPPRTPSYVGVSSSTSVNMSMGGTDGDTFSC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 PQTSLSMQISGMSPQLQYIMPSPSSNAFATNQTHQGSYNTFRLHSPCALYGYNFSTSPKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PQTSLSMQISGMSPQLQYIMPSPSSNAFATNQTHQGSYNTFRLHSPCALYGYNFSTSPKL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 AASPEKIVSSQGSFLGSSPSGTMTDRQMLPPVEGVHLLSSGGQQSFFDSRTLGSLTLSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AASPEKIVSSQGSFLGSSPSGTMTDRQMLPPVEGVHLLSSGGQQSFFDSRTLGSLTLSSS
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 QVSAHMV
:::::::
CCDS34 QVSAHMV
>>CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 (602 aa)
initn: 1866 init1: 1405 opt: 1557 Z-score: 1101.8 bits: 213.9 E(32554): 4.8e-55
Smith-Waterman score: 1991; 55.2% identity (73.7% similar) in 636 aa overlap (1-607:1-602)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAEKRRGSPCSMLSLKAHAFSVEALIGAEKQQQLQKKRRKLGAEEAARAVDDGGCSRGGG
:.:.::.. :: .:::::::::::..:...:. ..: : . . .:.. .: :
CCDS81 MSERRRSA--VALSSRAHAFSVEALIGSNKKRKLRDWEEK-GLDLSMEALSPAG---PLG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AGEKGSSEGDEGAALPPPAGATSGPARSGADLERGAAGGCEDGFQQGASPLASPGGSPKG
: ....: : : : . : . : . :: . : .:. . ::: ...:
CCDS81 DTEDAAAHGLE----PHPDSEQSTGSDSEVLTERTS---C--SFSTH-TDLASGAAGP--
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SPARSLARPGTPLPSPQAPRVDLQGAELWKRFHEIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKISGLD
:: . : . .:.:: :.::::::.::::::::::::::::::::::.:::
CCDS81 VPA--------AMSSMEEIQVELQCADLWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKITGLD
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 PHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSPASGETWMRQVI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.::::::.
CCDS81 PHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSLASGDTWMRQVV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 SFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDCGDDLSPIKPVPSGEGVKAFSFPE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..:::: :::: :.:::.:.:::
CCDS81 SFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDFSSDLSPTKPVPVGDGVKTFNFPE
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 TVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRMGLEALVESYAFWRPSLRTLTFEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::..:.:::::: .:::::::.
CCDS81 TVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRTGLEAIMETYAFWRPPVRTLTFEDF
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410
pF1KB9 PGIPKQ--GNASSSTLLQGTGNGVPATHPHLLSGSSCSSPAFHLGPNT-------SQLCS
. :: :....: ..::. :.. :::: ::: :.:::.::: ::::.
CCDS81 TTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPSASSHLLS-PSCSPPTFHLAPNTFNVGCRESQLCN
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460
pF1KB9 LAPADYSACARSGLTLNRYSTSLAET-YNRLTN------QAGETFAPPRTPSYV-GVSSS
: .:: ::::... . .:... :::: . : .::: : :::: . :. .
CCDS81 LNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSGYNRLQSGTTSATQPSETFMPQRTPSLISGIPTP
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510
pF1KB9 TSV--NMSM---GGTDGDTFSCPQTSLSMQISGMSPQLQYIMPSPSSNAFATNQTHQGSY
:. : .: :: : .: : . :: .. . . : : . :. .. .:.::
CCDS81 PSLPGNSKMEAYGGQLG-SFPTSQFQYVMQAGNAASS------SSSPHMFGGSHMQQSSY
460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KB9 NTFRLHSPCALYGYNFSTSPKLAASPEKIVSSQGSFLGSSPS-GTMTDRQMLPP-VE-GV
:.: ::.: :::::: :::.:::::::. .::...: :::: :.. .::.:: .: ..
CCDS81 NAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPEKLSASQSTLLCSSPSNGAFGERQYLPSGMEHSM
510 520 530 540 550 560
580 590 600
pF1KB9 HLLSSG--GQQSF--FDSRTLGSLTLSSSQVSAHMV
:..: . .::. :.: :.. ::::.:.:::
CCDS81 HMISPSPNNQQATNTCDGRQYGAVPGSSSQMSVHMV
570 580 590 600
>>CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 (496 aa)
initn: 1758 init1: 1405 opt: 1555 Z-score: 1101.5 bits: 213.6 E(32554): 4.9e-55
Smith-Waterman score: 1897; 61.5% identity (78.4% similar) in 504 aa overlap (133-607:1-496)
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 GFQQGASPLASPGGSPKGSPARSLARPGTPLPSPQAPRVDLQGAELWKRFHEIGTEMIIT
. : . .:.:: :.::::::.::::::::
CCDS30 MSSMEEIQVELQCADLWKRFHDIGTEMIIT
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 KAGRRMFPAMRVKISGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRV
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KAGRRMFPAMRVKITGLDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRV
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 YIHPDSPASGETWMRQVISFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDCGDDLS
:::::: :::.::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..:::
CCDS30 YIHPDSLASGDTWMRQVVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDFSSDLS
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 PIKPVPSGEGVKAFSFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRMGLEALV
: :::: :.:::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::..
CCDS30 PTKPVPVGDGVKTFNFPETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRTGLEAIM
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 ESYAFWRPSLRTLTFEDIPGIPKQ--GNASSSTLLQGTGNGVPATHPHLLSGSSCSSPAF
:.:::::: .:::::::. . :: :....: ..::. :.. :::: ::: :.:
CCDS30 ETYAFWRPPVRTLTFEDFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPSASSHLLS-PSCSPPTF
220 230 240 250 260
410 420 430 440
pF1KB9 HLGPNT-------SQLCSLAPADYSACARSGLTLNRYSTSLAET-YNRLTN------QAG
::.::: ::::.: .:: ::::... . .:... :::: . : .
CCDS30 HLAPNTFNVGCRESQLCNLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSGYNRLQSGTTSATQPS
270 280 290 300 310 320
450 460 470 480 490 500
pF1KB9 ETFAPPRTPSYV-GVSSSTSV--NMSM---GGTDGDTFSCPQTSLSMQISGMSPQLQYIM
::: : :::: . :. . :. : .: :: : .: : . :: .. . .
CCDS30 ETFMPQRTPSLISGIPTPPSLPGNSKMEAYGGQLG-SFPTSQFQYVMQAGNAASS-----
330 340 350 360 370 380
510 520 530 540 550 560
pF1KB9 PSPSSNAFATNQTHQGSYNTFRLHSPCALYGYNFSTSPKLAASPEKIVSSQGSFLGSSPS
: : . :. .. .:.:::.: ::.: :::::: :::.:::::::. .::...: ::::
CCDS30 -SSSPHMFGGSHMQQSSYNAFSLHNPYNLYGYNFPTSPRLAASPEKLSASQSTLLCSSPS
390 400 410 420 430 440
570 580 590 600
pF1KB9 -GTMTDRQMLPP-VE-GVHLLSSG--GQQSF--FDSRTLGSLTLSSSQVSAHMV
:.. .::.:: .: ..:..: . .::. :.: :.. ::::.:.:::
CCDS30 NGAFGERQYLPSGMEHSMHMISPSPNNQQATNTCDGRQYGAVPGSSSQMSVHMV
450 460 470 480 490
>>CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX (520 aa)
initn: 725 init1: 618 opt: 1210 Z-score: 860.1 bits: 169.0 E(32554): 1.4e-41
Smith-Waterman score: 1239; 43.4% identity (65.2% similar) in 557 aa overlap (13-554:3-502)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MAEKRRGSPCSMLSLKAHAFSVEALIGAEKQQQLQKKRRKLGAEEAARAVDDGGCSRGGG
:: .:.:::::::.: ....:: . ::. . ::
CCDS14 MALSSRARAFSVEALVGRPSKRKLQDP---IQAEQPELR------EKKGG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AGEKGSSEGDEGAALPPPAGATSGPARSGADLERGAAGGCEDGFQQGASPLASPGGSPKG
:. . : . : . :. : :..:: : ..: :
CCDS14 EEEEERRSSAAGKSEPLEKQPKTEPSTS-------ASSGC--GSDSGY-----------G
50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SPARSLARPGTPLPSPQAPRVDLQGAELWKRFHEIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKISGLD
. ..:: . . .:::.:::::::.::::::::::::::::..:::..:::
CCDS14 NSSESLEEKDIQM--------ELQGSELWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPSVRVKVKGLD
90 100 110 120 130
190 200 210 220 230
pF1KB9 PHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSP-VPPRVYIHPDSPASGETWMRQV
: .::..:.:.::::.::::::::::.::::::.: . :: :.::::: ::::::::.
CCDS14 PGKQYHVAIDVVPVDSKRYRYVYHSSQWMVAGNTDHLCIIPRFYVHPDSPCSGETWMRQI
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 ISFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDCGDDLSPIKPVPSGEGVKAFSFP
::::..::::::.::.:::::.:::::.::::::.. . ::: :. .:. ::::.:::
CCDS14 ISFDRMKLTNNEMDDKGHIILQSMHKYKPRVHVIEQGSSVDLSQIQSLPT-EGVKTFSFK
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 ETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRMGLEALVESYAFWRPSLRTLTFED
:: :::::::::::::.:::.::::::::::.:::: :..:.:.: ::::. :: :.
CCDS14 ETEFTTVTAYQNQQITKLKIERNPFAKGFRDTGRNRGVLDGLLETYP-WRPSF-TLDFKT
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 IPGIPKQGNASSSTLLQGTGNGVPATHPHLLSGSSCSSPAFHLGPNTS--QLCSLA----
. : :...:.:. . ..: :.:. ::: : :: ::: :..: . : :
CCDS14 F-GADTQSGSSGSSPVTSSG-GAPSPLNSLLS-PLCFSPMFHL-PTSSLGMPCPEAYLPN
320 330 340 350 360
420 430 440 450 460
pF1KB9 ---PADYSACARSGLTLNRYSTSLAETYNRL-TNQAGETFAPPRTPSYVGVSSSTSVNMS
: :. : . . . . . . .:: ........:: : . :: .:. :
CCDS14 VNLPLCYKICPTN---FWQQQPLVLPAPERLASSNSSQSLAPLMME--VPMLSSLGVTNS
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KB9 MGGTDGDTFSCPQTSLSMQISGMSPQLQYIMPSPSSNAFATNQ-THQGSYNTFRLHSPCA
.:.. :. .. .: . . :. : . ::. : : :. : .. .: :
CCDS14 KSGSSEDS-----SDQYLQAPNSTNQMLYGLQSPG-NIFLPNSITPEALSCSF--HPSYD
430 440 450 460 470
530 540 550 560 570 580
pF1KB9 LYGYNFSTSPKLAASPEKIV---SSQGSFLGSSPSGTMTDRQMLPPVEGVHLLSSGGQQS
.: :::: .: .. ... .:: ::
CCDS14 FYRYNFSMPSRLISGSNHLKVNDDSQVSFGEGKCNHVHWYPAINHYL
480 490 500 510 520
>>CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7 (447 aa)
initn: 927 init1: 680 opt: 947 Z-score: 677.2 bits: 134.9 E(32554): 2.1e-31
Smith-Waterman score: 961; 46.9% identity (70.5% similar) in 369 aa overlap (115-457:69-421)
90 100 110 120 130
pF1KB9 PARSGADLERGAAGGCEDGFQQGASPLASPGGSPKGSPARSLAR----PGTPL-PSPQAP
::: .. . :: : ::. :: .
CCDS43 IKPLEQFVEKSSCAQPLGELTSLDAHGEFGGGSGSSPSSSSLCTEPLIPTTPIIPSEEMA
40 50 60 70 80 90
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CCDS43 KIACSLETKELWDKFHELGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNK
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CCDS43 RYRYAYHRSSWLVAGKADPPLPARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHGH
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CCDS43 IILNSMHKYQPRVHIIKKK--DHTASLLNLKS-EEFRTFIFPETVFTAVTAYQNQLITKL
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CCDS43 SAFTTSDNLSLSSWVSSSSSFPGFQHPQSLTALGTSTASIATPI-PHPIQ-GSLPP--YS
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: :. :. ...: ... .: :: . : :
CCDS43 ---RLGMPLT--PSAIASSMQ----GSGPTFPSFHMPRYHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAV
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CCDS43 MTPFV
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CCDS13 SNPFAKGFRDCDPEDWPRNHRPGALPLMSAFARSRNPVASPT--QPSGTEKDAAEARREF
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. .:. : :: :.::.
CCDS13 QRDAGGPAVLGDPAHPPQLLARVLSPSLPGAGGAGGLVPLPGAPGGRPSPPNPELRLEAP
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CCDS13 MHFSTVTRDMEAFTASSLSSLGAAGGFPGAASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCA
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CCDS13 SNPFAKGFRDCDPEDWPRNHRPGALPLMSAFARSRNPVASPT--QPSGTEKGGHVLKDKE
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... :. ..: . .:: ....:
CCDS13 VKAETSRNTPEREVELLRDAGGCVNLGLPCPAECQPFNTQGLVAGRTAGDRLC
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::
CCDS13 LQPGLLDVLLKPPSKKSESLRPPHCKDT
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pF1KB9 AGATSGPARSGADLERGAAGGCEDGFQQGASPLASPGGSPKGSPARSLARPGTPLP-SPQ
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CCDS31 VSRVTVQLEMKPLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPLD
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.:::::..::: :.:::.:: .: ::..::::::.: ::::..:::::::::: :::.
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.::: ::::::::.: . : . : : ..: ....: : .
CCDS31 QLKIASNPFAKGFRESDLDS------------WPVAPRPLL-----SVPARSHSSLSPCV
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CCDS31 HLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQGGLPLPAGLGLLSPTVVCLGPGQDSQ
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pF1KB9 AVDDGGCSRGGGAGEKGSSEGDEGAALPPPAGATSGPARSGADLERGAAGGCEDGFQQGA
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CCDS10 SGKAEPRLPDRVYIHPDSPATGAHWMRQPVSFHRVKLTNSTLDPHGHLILHSMHKYQPRI
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CCDS10 HLVRAAQLCSQHWG---------GMASFRFPETTFISVTAYQNPQITQLKIAANPFAKGF
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CCDS10 RENGRNCKRERDARVKRKLRGPEPAATEAYGSGDTPGGPCDSTLGGDIRESDPEQAPAPG
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CCDS10 EATAAPAPLCGGPSAEAYLLHPAAFHGAP--SHLPTRSPS-FPEAPDSGRSAP-YSAAFL
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CCDS10 ELPHG-SGGSGYPAAPPAVPFAPHFLQGGPFPLPYTAPGGYLDVGSKPMY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]