Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9739
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9739, 507 aa
1>>>pF1KB9739 507 - 507 aa - 507 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1598+/-0.000891; mu= -3.1282+/- 0.054
mean_var=262.9104+/-52.624, 0's: 0 Z-trim(115.0): 37 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.079099
statistics sampled from 15485 (15512) to 15485 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.774), E-opt: 0.2 (0.477), width: 16
Scan time: 2.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43467.2 RUNX2 gene_id:860|Hs108|chr6 ( 521) 3409 402.0 8.1e-112
CCDS64443.1 RUNX2 gene_id:860|Hs108|chr6 ( 485) 2247 269.4 6.3e-72
CCDS43468.2 RUNX2 gene_id:860|Hs108|chr6 ( 499) 2213 265.5 9.5e-71
CCDS42922.1 RUNX1 gene_id:861|Hs108|chr21 ( 453) 1229 153.2 5.6e-37
CCDS13639.1 RUNX1 gene_id:861|Hs108|chr21 ( 480) 1229 153.2 5.9e-37
CCDS46646.1 RUNX1 gene_id:861|Hs108|chr21 ( 250) 1025 129.8 3.5e-30
CCDS257.1 RUNX3 gene_id:864|Hs108|chr1 ( 415) 1000 127.1 3.8e-29
CCDS30633.1 RUNX3 gene_id:864|Hs108|chr1 ( 429) 1000 127.1 3.9e-29
>>CCDS43467.2 RUNX2 gene_id:860|Hs108|chr6 (521 aa)
initn: 3409 init1: 3409 opt: 3409 Z-score: 2120.9 bits: 402.0 E(32554): 8.1e-112
Smith-Waterman score: 3409; 100.0% identity (100.0% similar) in 502 aa overlap (6-507:20-521)
10 20 30 40
pF1KB9 MRIPVDPSTSRRFSPPSSSLQPGKMSDVSPVVAAQQQQQQQQQQQQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MASNSLFSTVTPCQQNFFWDPSTSRRFSPPSSSLQPGKMSDVSPVVAAQQQQQQQQQQQQ
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 QQQQQQQQQQQEAAAAAAAAAAAAAAAAAVPRLRPPHDNRTMVEIIADHPAELVRTDSPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QQQQQQQQQQQEAAAAAAAAAAAAAAAAAVPRLRPPHDNRTMVEIIADHPAELVRTDSPN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 FLCSVLPSHWRCNKTLPVAFKVVALGEVPDGTVVTVMAGNDENYSAELRNASAVMKNQVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FLCSVLPSHWRCNKTLPVAFKVVALGEVPDGTVVTVMAGNDENYSAELRNASAVMKNQVA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 RFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKVTVDGPREPRRHRQKLDDSKPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKVTVDGPREPRRHRQKLDDSKPS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 LFSDRLSDLGRIPHPSMRVGVPPQNPRPSLNSAPSPFNPQGQSQITDPRQAQSSPPWSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LFSDRLSDLGRIPHPSMRVGVPPQNPRPSLNSAPSPFNPQGQSQITDPRQAQSSPPWSYD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 QSYPSYLSQMTSPSIHSTTPLSSTRGTGLPAITDVPRRISDDDTATSDFCLWPSTLSKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QSYPSYLSQMTSPSIHSTTPLSSTRGTGLPAITDVPRRISDDDTATSDFCLWPSTLSKKS
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 QAGASELGPFSDPRQFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFTYTPPVTSGMSLGMSATTHYHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QAGASELGPFSDPRQFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFTYTPPVTSGMSLGMSATTHYHT
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 YLPPPYPGSSQSQSGPFQTSSTPYLYYGTSSGSYQFPMVPGGDRSPSRMLPPCTTTSNGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YLPPPYPGSSQSQSGPFQTSSTPYLYYGTSSGSYQFPMVPGGDRSPSRMLPPCTTTSNGS
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500
pF1KB9 TLLNPNLPNQNDGVDADGSHSSSPTVLNSSGRMDESVWRPY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TLLNPNLPNQNDGVDADGSHSSSPTVLNSSGRMDESVWRPY
490 500 510 520
>>CCDS64443.1 RUNX2 gene_id:860|Hs108|chr6 (485 aa)
initn: 2185 init1: 2185 opt: 2247 Z-score: 1404.8 bits: 269.4 E(32554): 6.3e-72
Smith-Waterman score: 3237; 95.7% identity (95.7% similar) in 507 aa overlap (1-507:1-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MRIPVDPSTSRRFSPPSSSLQPGKMSDVSPVVAAQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQEAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MRIPVDPSTSRRFSPPSSSLQPGKMSDVSPVVAAQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQEAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AAAAAAAAAAAAAAAVPRLRPPHDNRTMVEIIADHPAELVRTDSPNFLCSVLPSHWRCNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AAAAAAAAAAAAAAAVPRLRPPHDNRTMVEIIADHPAELVRTDSPNFLCSVLPSHWRCNK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 TLPVAFKVVALGEVPDGTVVTVMAGNDENYSAELRNASAVMKNQVARFNDLRFVGRSGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TLPVAFKVVALGEVPDGTVVTVMAGNDENYSAELRNASAVMKNQVARFNDLRFVGRSGRG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 KSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKVTVDGPREPRRHRQKLDDSKPSLFSDRLSDLGRIPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKVTVDGPREPRRHRQKLDDSKPSLFSDRLSDLGRIPH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 PSMRVGVPPQNPRPSLNSAPSPFNPQGQSQITDPRQAQSSPPWSYDQSYPSYLSQMTSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PSMRVGVPPQNPRPSLNSAPSPFNPQGQSQITDPRQAQSSPPWSYDQSYPSYLSQMTSPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 IHSTTPLSSTRGTGLPAITDVPRRISDDDTATSDFCLWPSTLSKKSQAGASELGPFSDPR
:::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS64 IHSTTPLSSTRGTGLPAITDVPRRIS----------------------GASELGPFSDPR
310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 QFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFTYTPPVTSGMSLGMSATTHYHTYLPPPYPGSSQSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFTYTPPVTSGMSLGMSATTHYHTYLPPPYPGSSQSQS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 GPFQTSSTPYLYYGTSSGSYQFPMVPGGDRSPSRMLPPCTTTSNGSTLLNPNLPNQNDGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GPFQTSSTPYLYYGTSSGSYQFPMVPGGDRSPSRMLPPCTTTSNGSTLLNPNLPNQNDGV
400 410 420 430 440 450
490 500
pF1KB9 DADGSHSSSPTVLNSSGRMDESVWRPY
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DADGSHSSSPTVLNSSGRMDESVWRPY
460 470 480
>>CCDS43468.2 RUNX2 gene_id:860|Hs108|chr6 (499 aa)
initn: 2151 init1: 2151 opt: 2213 Z-score: 1383.6 bits: 265.5 E(32554): 9.5e-71
Smith-Waterman score: 3203; 95.6% identity (95.6% similar) in 502 aa overlap (6-507:20-499)
10 20 30 40
pF1KB9 MRIPVDPSTSRRFSPPSSSLQPGKMSDVSPVVAAQQQQQQQQQQQQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MASNSLFSTVTPCQQNFFWDPSTSRRFSPPSSSLQPGKMSDVSPVVAAQQQQQQQQQQQQ
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 QQQQQQQQQQQEAAAAAAAAAAAAAAAAAVPRLRPPHDNRTMVEIIADHPAELVRTDSPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QQQQQQQQQQQEAAAAAAAAAAAAAAAAAVPRLRPPHDNRTMVEIIADHPAELVRTDSPN
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 FLCSVLPSHWRCNKTLPVAFKVVALGEVPDGTVVTVMAGNDENYSAELRNASAVMKNQVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FLCSVLPSHWRCNKTLPVAFKVVALGEVPDGTVVTVMAGNDENYSAELRNASAVMKNQVA
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 RFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKVTVDGPREPRRHRQKLDDSKPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKVTVDGPREPRRHRQKLDDSKPS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 LFSDRLSDLGRIPHPSMRVGVPPQNPRPSLNSAPSPFNPQGQSQITDPRQAQSSPPWSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LFSDRLSDLGRIPHPSMRVGVPPQNPRPSLNSAPSPFNPQGQSQITDPRQAQSSPPWSYD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB9 QSYPSYLSQMTSPSIHSTTPLSSTRGTGLPAITDVPRRISDDDTATSDFCLWPSTLSKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QSYPSYLSQMTSPSIHSTTPLSSTRGTGLPAITDVPRRIS--------------------
310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB9 QAGASELGPFSDPRQFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFTYTPPVTSGMSLGMSATTHYHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 --GASELGPFSDPRQFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFTYTPPVTSGMSLGMSATTHYHT
350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 YLPPPYPGSSQSQSGPFQTSSTPYLYYGTSSGSYQFPMVPGGDRSPSRMLPPCTTTSNGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YLPPPYPGSSQSQSGPFQTSSTPYLYYGTSSGSYQFPMVPGGDRSPSRMLPPCTTTSNGS
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500
pF1KB9 TLLNPNLPNQNDGVDADGSHSSSPTVLNSSGRMDESVWRPY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TLLNPNLPNQNDGVDADGSHSSSPTVLNSSGRMDESVWRPY
460 470 480 490
>>CCDS42922.1 RUNX1 gene_id:861|Hs108|chr21 (453 aa)
initn: 1807 init1: 880 opt: 1229 Z-score: 777.4 bits: 153.2 E(32554): 5.6e-37
Smith-Waterman score: 1936; 60.5% identity (77.5% similar) in 519 aa overlap (1-507:1-453)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MRIPVDPSTSRRFSPPSSSLQPGKMSDVSPVVAAQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQEAA
:::::: ::::::.:::..:.:::::.. :.
CCDS42 MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPL-----------------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AAAAAAAAAAAAAAAVPRLRPPHDNRTMVEIIADHPAELVRTDSPNFLCSVLPSHWRCNK
.: :.:: . .:: .:.:::..::::.::::::::::::::::.::::::
CCDS42 ------GAPDAGAALAGKLRS--GDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNK
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 TLPVAFKVVALGEVPDGTVVTVMAGNDENYSAELRNASAVMKNQVARFNDLRFVGRSGRG
:::.::::::::.:::::.::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::
CCDS42 TLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRG
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230
pF1KB9 KSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKVTVDGPREPRRHRQKLDD-SKP-SL-FSDRLSDLGR
::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: .:: :: ::.:::.: .
CCDS42 KSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQ
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 IPHPSMRVG----VPPQNPRPSLNSAPSPFNPQGQSQITDPRQAQSSPPWSYDQSYPSYL
. . .:::. .: ::: ::: . . :::: :::. : :: : :::::::::: .::
CCDS42 LRRTAMRVSPHHPAPTPNPRASLNHS-TAFNPQPQSQMQDTRQIQPSPPWSYDQSY-QYL
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 SQMTSPSIHSTTPLSSTRGTGLPAITDVPRRISDDDTATSDFCLWPSTLSKKSQAGASEL
....:::.: .::.: :..:. ... . ::.. .. : .:
CCDS42 GSIASPSVHPATPISPGRASGMTTLS--------------------AELSSRLST-APDL
270 280 290 300
360 370 380 390 400
pF1KB9 GPFSDPRQFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFTYTP-PVTSGMSLGMSA---TTHYHTYLP
::::::::.. :. :.::::::..:::.: :::::...:::: .:.::::::
CCDS42 TAFSDPRQFPALPSI-----SDPRMHYPGAFTYSPTPVTSGIGIGMSAMGSATRYHTYLP
310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KB9 PPYPGSSQSQSGPFQTSSTPY-LYYGTSSGSYQFPMVPGGDRSPSRMLPPCTTTSNGSTL
::::::::.:.::::.:: : ::::.:.::::: :: ::.::: :.:::::..:.::.:
CCDS42 PPYPGSSQAQGGPFQASSPSYHLYYGASAGSYQFSMV-GGERSPPRILPPCTNASTGSAL
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500
pF1KB9 LNPNLPNQNDGVDADGSHSSSPTVLNSSGRMDESVWRPY
:::.::::.: :.:.::::.::: . :.:..:.:::::
CCDS42 LNPSLPNQSDVVEAEGSHSNSPTNMAPSARLEEAVWRPY
420 430 440 450
>>CCDS13639.1 RUNX1 gene_id:861|Hs108|chr21 (480 aa)
initn: 1766 init1: 880 opt: 1229 Z-score: 777.0 bits: 153.2 E(32554): 5.9e-37
Smith-Waterman score: 1902; 60.0% identity (76.7% similar) in 515 aa overlap (6-507:33-480)
10 20 30
pF1KB9 MRIPVDPSTSRRFSPPSSSLQPGKMSDVSPVVAAQ
: ::::::.:::..:.:::::.. :.
CCDS13 SDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPL----
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQEAAAAAAAAAAAAAAAAAVPRLRPPHDNRTMVEIIADH
.: :.:: . .:: .:.:::..:::
CCDS13 -------------------------------GAPDAGAALAGKLR--SGDRSMVEVLADH
60 70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 PAELVRTDSPNFLCSVLPSHWRCNKTLPVAFKVVALGEVPDGTVVTVMAGNDENYSAELR
:.::::::::::::::::.:::::::::.::::::::.:::::.::::::::::::::::
CCDS13 PGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELR
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 NASAVMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKVTVDGPREPRR
::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS13 NATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRR
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260
pF1KB9 HRQKLDD-SKP-SL-FSDRLSDLGRIPHPSMRVG----VPPQNPRPSLNSAPSPFNPQGQ
::::::: .:: :: ::.:::.: .. . .:::. .: ::: ::: . . :::: :
CCDS13 HRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRTAMRVSPHHPAPTPNPRASLNHS-TAFNPQPQ
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KB9 SQITDPRQAQSSPPWSYDQSYPSYLSQMTSPSIHSTTPLSSTRGTGLPAIT-DVPRRISD
::. : :: : :::::::::: .::....:::.: .::.: :..:. ... .. :.:
CCDS13 SQMQDTRQIQPSPPWSYDQSY-QYLGSIASPSVHPATPISPGRASGMTTLSAELSSRLST
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 DDTATSDFCLWPSTLSKKSQAGASELGPFSDPRQFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFTYT
: .: ::::::::.. :. :.::::::..:::.
CCDS13 ----------------------APDLTAFSDPRQFPALPSI-----SDPRMHYPGAFTYS
330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 P-PVTSGMSLGMSA---TTHYHTYLPPPYPGSSQSQSGPFQTSSTPY-LYYGTSSGSYQF
: :::::...:::: .:.::::::::::::::.:.::::.:: : ::::.:.:::::
CCDS13 PTPVTSGIGIGMSAMGSATRYHTYLPPPYPGSSQAQGGPFQASSPSYHLYYGASAGSYQF
360 370 380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KB9 PMVPGGDRSPSRMLPPCTTTSNGSTLLNPNLPNQNDGVDADGSHSSSPTVLNSSGRMDES
:: ::.::: :.:::::..:.::.::::.::::.: :.:.::::.::: . :.:..:.
CCDS13 SMV-GGERSPPRILPPCTNASTGSALLNPSLPNQSDVVEAEGSHSNSPTNMAPSARLEEA
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 VWRPY
:::::
CCDS13 VWRPY
480
>>CCDS46646.1 RUNX1 gene_id:861|Hs108|chr21 (250 aa)
initn: 1099 init1: 880 opt: 1025 Z-score: 655.3 bits: 129.8 E(32554): 3.5e-30
Smith-Waterman score: 1104; 63.4% identity (76.6% similar) in 290 aa overlap (1-283:1-248)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MRIPVDPSTSRRFSPPSSSLQPGKMSDVSPVVAAQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQEAA
:::::: ::::::.:::..:.:::::.. :.
CCDS46 MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPL-----------------------------
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 AAAAAAAAAAAAAAAVPRLRPPHDNRTMVEIIADHPAELVRTDSPNFLCSVLPSHWRCNK
.: :.:: . .:: .:.:::..::::.::::::::::::::::.::::::
CCDS46 ------GAPDAGAALAGKLR--SGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNK
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 TLPVAFKVVALGEVPDGTVVTVMAGNDENYSAELRNASAVMKNQVARFNDLRFVGRSGRG
:::.::::::::.:::::.::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::
CCDS46 TLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRG
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230
pF1KB9 KSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKVTVDGPREPRRHRQKLDD-SKP-SL-FSDRLSDLGR
::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: .:: :: ::.:::.: .
CCDS46 KSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQ
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 IPHPSMRVG----VPPQNPRPSLNSAPSPFNPQGQSQITDPRQAQSSPPWSYDQSYPSYL
. . .:::. .: ::: ::: . . :::: :::. : ... ::
CCDS46 LRRTAMRVSPHHPAPTPNPRASLNHS-TAFNPQPQSQM----QEEDTAPWRC
210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
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::.. : :: . :.::...::: .:::::::::::::::::::
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::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::.: .:: : ::..::
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:. ::: .:: :: :. : :. : :
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::::::: :.. .:::::: .:::::: :.: : :: :: :: :: ::.
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..: :::::::::. :.::::::.. .:: :::::::::::: :: : :::::.:::
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::... . ..:.::.: .:.:::.::::::.:::.:.. :::::.:::::
CCDS25 ASCTSSAASVAAGNLMNPSLGGQSDGVEADGSHSNSPTALSTPGRMDEAVWRPY
370 380 390 400 410
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::.. : :: . :.::...::: .:::::
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::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS30 NQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPTQVATYHRAIKVTVDGPREPRRHRQKLED
150 160 170 180 190 200
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::..
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CCDS30 DEAVWRPY
507 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]