Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9440
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9440, 660 aa
1>>>pF1KB9440 660 - 660 aa - 660 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8996+/-0.00104; mu= 15.6373+/- 0.062
mean_var=64.7628+/-12.763, 0's: 0 Z-trim(102.6): 33 B-trim: 15 in 1/51
Lambda= 0.159372
statistics sampled from 7029 (7041) to 7029 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11734.1 ACOX1 gene_id:51|Hs108|chr17 ( 660) 4389 1018.5 0
CCDS11735.1 ACOX1 gene_id:51|Hs108|chr17 ( 660) 4176 969.5 0
CCDS33775.1 ACOX2 gene_id:8309|Hs108|chr3 ( 681) 1850 434.7 2e-121
CCDS47017.1 ACOX3 gene_id:8310|Hs108|chr4 ( 624) 621 152.2 2.1e-36
CCDS3401.1 ACOX3 gene_id:8310|Hs108|chr4 ( 700) 621 152.2 2.4e-36
CCDS46389.1 ACOXL gene_id:55289|Hs108|chr2 ( 580) 591 145.2 2.4e-34
>>CCDS11734.1 ACOX1 gene_id:51|Hs108|chr17 (660 aa)
initn: 4389 init1: 4389 opt: 4389 Z-score: 5448.8 bits: 1018.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4389; 99.7% identity (99.8% similar) in 660 aa overlap (1-660:1-660)
10 20 30 40 50 60
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CCDS11 MNPDLRRERDSASFNPELLTHILDGSPEKTRRRREIENMILNDPDFQHEDLNFLTRSQRY
10 20 30 40 50 60
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CCDS11 EVAVRKSAIMVKKMREFGIADPDEIMWFKNFVHRGRPEPLDLHLGMFLPTLLHQATAEQQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ERFFMPAWNLEIIGTYAQTEMGHGTHLRGLETTATYDPETQEFILNSPTVTSIKWWPGGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GKTSNHAIVLAQLITKGKCYGLHAFIVPIREIGTHKPLPGITVGDIGPKFGYDEIDNGYL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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CCDS11 KMDNHRIPRENMLMKYAQVKPDGTYVKPLSNKLTYGTMVFVRSFLVGEAARALSKACTIA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IRYSAVRHQSEIKPGEPEPQILDFQTQQYKLFPLLATAYAFQFVGAYMKETYHRINEGIG
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370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QGDLSELPELHALTAGLKAFTSWTANTGIEACRMACGGHGYSHCSGLPNIYVNFTPSCTF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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CCDS11 EGENTVMMLQTARFLMKSYDQVHSGKLVCGMVSYLNDLPSQRIQPQQVAVWPTMVDINSP
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490 500 510 520 530 540
pF1KB9 ESLTEAYKLRAARLVEIAAKNLQKEVIHRKSKEVAWNLTSVDLVRASEAHCHYVVVKLFS
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CCDS11 ESLTEAYKLRAARLVEIAAKNLQKEVIHRKSKEVAWNLTSVDLVRASEAHCHYVVVKLFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 EKLLKIQDKAIQAVLRSLCLLYSLYGISQNAGDFLQGSIMTEPQITQVNQRVKELLTLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EKLLKIQDKAIQAVLRSLCLLYSLYGISQNAGDFLQGSIMTEPQITQVNQRVKELLTLIR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 SDAVALVDAFDFQDVTLGSVLGRYDGNVYENLFEWAKNSPLNKAEVHESYKHLKSLQSKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SDAVALVDAFDFQDVTLGSVLGRYDGNVYENLFEWAKNSPLNKAEVHESYKHLKSLQSKL
610 620 630 640 650 660
>>CCDS11735.1 ACOX1 gene_id:51|Hs108|chr17 (660 aa)
initn: 4176 init1: 4176 opt: 4176 Z-score: 5184.1 bits: 969.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4176; 95.5% identity (98.3% similar) in 660 aa overlap (1-660:1-660)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MNPDLRRERDSASFNPELLTHILDGSPEKTRRRREIENMILNDPDFQHEDLNFLTRSQRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MNPDLRRERDSASFNPELLTHILDGSPEKTRRRREIENMILNDPDFQHEDLNFLTRSQRY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 EVAVRKSAIMVKKMREFGIADPDEIMWFKNFVHRGRPEPLDLHLGMFLPTLLHQATAEQQ
:::::::::::::::::::::::::::::.. . ::. :. .::.::::.:.:. :.
CCDS11 EVAVRKSAIMVKKMREFGIADPDEIMWFKKLHLVNFVEPVGLNYSMFIPTLLNQGTTAQK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 ERFFMPAWNLEIIGTYAQTEMGHGTHLRGLETIATYDPETQEFILNSPTVTSIKWWPGGL
:.... . .:.::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EKWLLSSKGLQIIGTYAQTEMGHGTHLRGLETTATYDPETQEFILNSPTVTSIKWWPGGL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 GKTSNHAIVLAQLITKGKCYGLHAFIVPIREIGTHKPLPGITVGDIGPKFGYDEIDNGYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GKTSNHAIVLAQLITKGKCYGLHAFIVPIREIGTHKPLPGITVGDIGPKFGYDEIDNGYL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 KMDNHRIPRENMLMKYAQVKPDGTYVKPLSNKLTYGTMVFVRSFLVGEAARALSKACTIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KMDNHRIPRENMLMKYAQVKPDGTYVKPLSNKLTYGTMVFVRSFLVGEAARALSKACTIA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 IRYSAVRHQSEMKPGEPEPQILDFQTQQYKLFPLLATAYAFQFVGAYMKETYHRINEGIG
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IRYSAVRHQSEIKPGEPEPQILDFQTQQYKLFPLLATAYAFQFVGAYMKETYHRINEGIG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 QGDLSELPELHALTAGLKAFTSWTANTGIEACRMACGGHGYSHCSGLPNIYVNFTPSCTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QGDLSELPELHALTAGLKAFTSWTANTGIEACRMACGGHGYSHCSGLPNIYVNFTPSCTF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 EGENTVMMLQTARFLMKSYDQVHSGKLVCGMVSYLNDLPSQRIQPQQVAVWPTMVDINSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EGENTVMMLQTARFLMKSYDQVHSGKLVCGMVSYLNDLPSQRIQPQQVAVWPTMVDINSP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 ESLTEAYKLRAARLVEIAAKNLQKEVIHRKSKEVAWNLTSVDLVRASEAHCHYVVVKLFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ESLTEAYKLRAARLVEIAAKNLQKEVIHRKSKEVAWNLTSVDLVRASEAHCHYVVVKLFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 EKLLKIQDKAIQAVLRSLCLLYSLYGISQNAGDFLQGSIMTEPQITQVNQRVKELLTLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EKLLKIQDKAIQAVLRSLCLLYSLYGISQNAGDFLQGSIMTEPQITQVNQRVKELLTLIR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB9 SDAVALVDAFDFQDVTLGSVLGRYDGNVYENLFEWAKNSPLNKAEVHESYKHLKSLQSKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SDAVALVDAFDFQDVTLGSVLGRYDGNVYENLFEWAKNSPLNKAEVHESYKHLKSLQSKL
610 620 630 640 650 660
>>CCDS33775.1 ACOX2 gene_id:8309|Hs108|chr3 (681 aa)
initn: 1809 init1: 685 opt: 1850 Z-score: 2293.5 bits: 434.7 E(32554): 2e-121
Smith-Waterman score: 1850; 45.3% identity (72.9% similar) in 675 aa overlap (1-660:18-681)
10 20 30 40
pF1KB9 MNPDLRRERDSASFNPELLTHILDGSPEKTRRRREIENMILND
:.::.. :: ::. : ::.::::. ..: ::..:..: .
CCDS33 MGSPVHRVSLGDTWSRQMHPDIESERYMQSFDVERLTNILDGGAQNTALRRKVESIIHSY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB9 PDFQHEDLNFLTRSQRYEVAVRKSAIMVKKM-REFG-IADPDEIMWFKNFVHRGRPEPLD
:.:. .: :.:...::..:.:. :. .. . :..: . : :. ....:. .
CCDS33 PEFSCKDNYFMTQNERYKAAMRR-AFHIRLIARRLGWLEDGREL----GYAYRALSGDVA
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB9 LHLG-MFLPTLLHQATAEQQERFFMPAWNLEIIGTYAQTEMGHGTHLRGLETIATYDPET
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CCDS33 LNIHRVFVRALRSLGSEEQIAKWDPLCKNIQIIATYAQTELGHGTYLQGLETEATYDAAT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB9 QEFILNSPTVTSIKWWPGGLGKTSNHAIVLAQLITKGKCYGLHAFIVPIREIGTHKPLPG
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CCDS33 QEFVIHSPTLTATKWWPGDLGRSATHALVQAQLICSGARRGMHAFIVPIRSLQDHTPLPG
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB9 ITVGDIGPKFGYDEIDNGYLKMDNHRIPRENMLMKYAQVKPDGTYVKPLSNKLTYGTMVF
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CCDS33 IIIGDIGPKMDFDQTDNGFLQLNHVRVPRENMLSRFAQVLPDGTYVKLGTAQSNYLPMVV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB9 VR-SFLVGEAARALSKACTIAIRYSAVRHQSEMKPGEPEPQILDFQTQQYKLFPLLATAY
:: .: :: :.:::.::.:::..:.::...:..:: ..::.:::: :::: :: .:
CCDS33 VRVELLSGEILPILQKACVIAMRYSVIRRQSRLRPSDPEAKVLDYQTQQQKLFPQLAISY
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 AFQFVGAYMKETYHRINEGIGQGDLSELPELHALTAGLKAFTSWTANTGIEACRMACGGH
::.:... . : ... .: . :.: :::::::..:.::. : . : : :: :::::
CCDS33 AFHFLAVSLLEFFQHSYTAILNQDFSFLPELHALSTGMKAMMSEFCTQGAEMCRRACGGH
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GYSHCSGLPNIYVNFTPSCTFEGENTVMMLQTARFLMKSY--DQVHSG----KLVCGMVS
:::. ::::.. .... :::.::::::..::.::::.::: :. : . . :.
CCDS33 GYSKLSGLPSLVTKLSASCTYEGENTVLYLQVARFLVKSYLQTQMSPGSTPQRSLSPSVA
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 YLNDLPSQRIQPQQVAVWPTMVDINSPESLTEAYKLRAARLVEIAAKNLQKEVIHRKSKE
::. :. : : : .:. :: : :. :.::.. ....:: . ...
CCDS33 YLTA-PDLARCPAQRA-----ADFLCPELYTTAWAHVAVRLIKDSVQHLQTLTQSGADQH
480 490 500 510 520
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pF1KB9 VAWNLTSVDLVRASEAHCHYVVVKLFSEKLLKIQDK-AIQAVLRSLCLLYSLYGISQNAG
::: :.: ..:...::.::.:: :.: : :.... ::: ::. :: :....:: :.:
CCDS33 EAWNQTTVIHLQAAKVHCYYVTVKGFTEALEKLENEPAIQQVLKRLCDLHAIHGILTNSG
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KB9 DFLQGSIMTEPQITQVNQRVKELLTLIRSDAVALVDAFDFQDVTLGSVLGRYDGNVYENL
:::. .... :. .. .:: :::.::. :.::::: : :.:.:: ::::::: :
CCDS33 DFLHDAFLSGAQVDMARTAYLDLLRLIRKDAILLTDAFDFTDQCLNSALGCYDGNVYERL
590 600 610 620 630 640
640 650 660
pF1KB9 FEWAKNSPLNKAE--VHESYKH--LKSLQSKL
:.::..:: : : ..: : . :.: .:::
CCDS33 FQWAQKSPTNTQENPAYEEYIRPLLQSWRSKL
650 660 670 680
>>CCDS47017.1 ACOX3 gene_id:8310|Hs108|chr4 (624 aa)
initn: 723 init1: 242 opt: 621 Z-score: 767.0 bits: 152.2 E(32554): 2.1e-36
Smith-Waterman score: 883; 31.9% identity (62.5% similar) in 595 aa overlap (9-571:25-604)
10 20 30 40
pF1KB9 MNPDLRRERDSASFNPELLTHILDGSPEKTRRRREIENMILNDP
: :::. . :. . .: : .. : . . :::
CCDS47 MASTVEGGDTALLPEFPRGPLDAYRARASFSWKELALFTEGEGM-LRFKKTIFSALENDP
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KB9 DF-----------QHEDLNFLTRSQRYEVAVRKSAIMVKKMREFGIADPDEIMWFKNFVH
: ....:::: : .: . . . :. : . . : :. . .
CCDS47 LFARSPGADLSLEKYRELNFL-RCKRI---FEYDFLSVEDMFKSPLKVPALIQCLGMYDS
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 RGRPEPLDLHLGMFLPTLLHQATAEQQERFFMPAWNLEIIGTYAQTEMGHGTHLRGLETI
. : :: .. . . .... .:.. ... . .::.: .: ::..::.. ....:
CCDS47 SLAAKYL-LH-SLVFGSAVYSSGSERHLTYIQKIFRMEIFGCFALTELSHGSNTKAIRTT
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 ATYDPETQEFILNSPTVTSIKWWPGGLGKTSNHAIVLAQLITKG-KCYGLHAFIVPIREI
: ::: :.:::..:: . :.: :..:::..::.:.:.: . : .:.::: ::: ::.
CCDS47 AHYDPATEEFIIHSPDFEAAKFWVGNMGKTATHAVVFAKLCVPGDQCHGLHPFIVQIRDP
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 GTHKPLPGITVGDIGPKFGYDEIDNGYLKMDNHRIPRENMLMKYAQVKPDGTYVKPLSN-
: :.::. ::::: :.: . .:::. . . :.::...: ....: :.::::.:...
CCDS47 KTLLPMPGVMVGDIGKKLGQNGLDNGFAMFHKVRVPRQSLLNRMGDVTPEGTYVSPFKDV
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KB9 ----KLTYGTMVFVRSFLVGEAARALSKACTIAIRYSAVRHQSEMKPGEPEP-QILDFQT
. :.. : .:. : :. : .::.:.::.:.: . : : : .:..
CCDS47 RQRFGASLGSLSSGRVSIVSLAILNLKLAVAIALRFSATRRQ--FGPTEEEEIPVLEYPM
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB9 QQYKLFPLLATAYAFQFVGAYMKETYHRINEGIGQGDLS----ELP-ELHALTAGLKAFT
::..:.: ::..::.. . . ....:...:: : :: :.:::... : ..
CCDS47 QQWRLLPYLAAVYALDHFSKSLFLDLVELQRGLASGDRSARQAELGREIHALASASKPLA
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB9 SWTANTGIEACRMACGGHGYSHCSGLPNIYVNFTPSCTFEGENTVMMLQTARFLMKSY-D
:::.. ::. :: ::::::: . : . . :.::.::.:.... ::. .:.
CCDS47 SWTTQQGIQECREACGGHGYLAMNRLGVLRDDNDPNCTYEGDNNILLQQTSNYLLGLLAH
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KB9 QVHSGKLVC-----GMVSYLNDLPSQRIQPQQVAVWPTMVD-INSPESLTEAYKLRAARL
:::.: .: :..:. :. : :. : ...: ..: .:. ::: . :
CCDS47 QVHDG--ACFRSPLKSVDFLDAYPG--ILDQKFEV-SSVADCLDSAVALA-AYKWLVCYL
480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KB9 VEIAAKNLQKEVIHRKSKEVAWNLTSVDLVRA-SEAHCHYVVVKLFSEKLLKIQ-DKAIQ
.. . ..:..: .: : : .:. : . : . .::. : :.. . . ...
CCDS47 LRETYQKLNQEKRSGSSDFEARNKCQVSHGRPLALAFVELTVVQRFHEHVHQPSVPPSLR
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KB9 AVLRSLCLLYSLYGISQNAGDFLQGSIMTEPQITQVNQRVKELLTLIRSDAVALVDAFDF
::: : ::.:...:..:
CCDS47 AVLGRLSALYALWSLSRHAALLYRAERRCSCPGRRDRSS
590 600 610 620
>>CCDS3401.1 ACOX3 gene_id:8310|Hs108|chr4 (700 aa)
initn: 810 init1: 242 opt: 621 Z-score: 766.1 bits: 152.2 E(32554): 2.4e-36
Smith-Waterman score: 992; 32.2% identity (63.1% similar) in 656 aa overlap (9-633:25-667)
10 20 30 40
pF1KB9 MNPDLRRERDSASFNPELLTHILDGSPEKTRRRREIENMILNDP
: :::. . :. . .: : .. : . . :::
CCDS34 MASTVEGGDTALLPEFPRGPLDAYRARASFSWKELALFTEGEGM-LRFKKTIFSALENDP
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KB9 DF-----------QHEDLNFLTRSQRYEVAVRKSAIMVKKMREFGIADPDEIMWFKNFVH
: ....:::: : .: . . . :. : . . : :. . .
CCDS34 LFARSPGADLSLEKYRELNFL-RCKRI---FEYDFLSVEDMFKSPLKVPALIQCLGMYDS
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 RGRPEPLDLHLGMFLPTLLHQATAEQQERFFMPAWNLEIIGTYAQTEMGHGTHLRGLETI
. : :: .. . . .... .:.. ... . .::.: .: ::..::.. ....:
CCDS34 SLAAKYL-LH-SLVFGSAVYSSGSERHLTYIQKIFRMEIFGCFALTELSHGSNTKAIRTT
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 ATYDPETQEFILNSPTVTSIKWWPGGLGKTSNHAIVLAQLITKG-KCYGLHAFIVPIREI
: ::: :.:::..:: . :.: :..:::..::.:.:.: . : .:.::: ::: ::.
CCDS34 AHYDPATEEFIIHSPDFEAAKFWVGNMGKTATHAVVFAKLCVPGDQCHGLHPFIVQIRDP
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