Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9420
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9420, 523 aa
1>>>pF1KB9420 523 - 523 aa - 523 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1200+/-0.00136; mu= 4.0153+/- 0.078
mean_var=259.6150+/-58.622, 0's: 0 Z-trim(107.1): 676 B-trim: 3 in 1/50
Lambda= 0.079599
statistics sampled from 8568 (9358) to 8568 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.287), width: 16
Scan time: 3.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 3468 412.7 5.4e-115
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 3391 403.8 2.5e-112
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 2318 280.6 2.9e-75
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 2318 280.6 3e-75
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 2318 280.6 3.2e-75
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 2133 259.3 7.1e-69
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 2094 254.8 1.6e-67
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 1237 156.3 6.2e-38
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 1237 156.4 6.5e-38
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 1237 156.4 6.7e-38
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 1149 146.2 6.4e-35
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 1134 144.3 1.8e-34
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 1126 143.6 4.3e-34
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 1122 143.1 5.7e-34
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 1099 140.3 2.9e-33
CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 340) 1091 139.5 6e-33
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 1079 138.0 1.5e-32
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 1050 134.7 1.4e-31
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 808 107.4 6.1e-23
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 808 107.4 6.3e-23
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 808 107.4 6.3e-23
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 801 106.6 1.1e-22
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 801 106.6 1.1e-22
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 801 106.6 1.1e-22
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 801 106.6 1.1e-22
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 790 104.9 1.6e-22
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 752 100.5 3.2e-21
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 745 100.0 7.8e-21
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 745 100.0 8.2e-21
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 745 100.1 8.4e-21
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 726 97.9 3.7e-20
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 709 95.6 9.8e-20
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 684 92.7 6.9e-19
CCDS32514.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 272) 680 92.2 8.4e-19
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 665 90.6 3.3e-18
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 667 91.0 3.5e-18
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 667 91.0 3.8e-18
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 646 88.8 2.6e-17
CCDS8953.1 CDK4 gene_id:1019|Hs108|chr12 ( 303) 637 87.3 2.8e-17
CCDS8899.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 264) 634 86.9 3.2e-17
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 631 86.7 5.2e-17
CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 631 86.8 5.8e-17
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 627 86.2 6.9e-17
CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 631 86.9 6.9e-17
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 624 85.8 8e-17
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 625 86.0 8e-17
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 618 85.0 1.2e-16
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 620 85.9 2.3e-16
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 620 85.9 2.4e-16
CCDS55184.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 260) 596 82.5 6.6e-16
>>CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 (523 aa)
initn: 3468 init1: 3468 opt: 3468 Z-score: 2178.0 bits: 412.7 E(32554): 5.4e-115
Smith-Waterman score: 3468; 100.0% identity (100.0% similar) in 523 aa overlap (1-523:1-523)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB9 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
490 500 510 520
>>CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 (523 aa)
initn: 3391 init1: 3391 opt: 3391 Z-score: 2130.3 bits: 403.8 E(32554): 2.5e-112
Smith-Waterman score: 3391; 100.0% identity (100.0% similar) in 512 aa overlap (1-512:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB9 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGVFVINHFTCRS
490 500 510 520
>>CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX (496 aa)
initn: 2384 init1: 2312 opt: 2318 Z-score: 1464.6 bits: 280.6 E(32554): 2.9e-75
Smith-Waterman score: 2352; 69.5% identity (86.9% similar) in 512 aa overlap (1-512:4-485)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSF
:::.::.::.::::.. ::.. . ::. ..:... .: :
CCDS14 MDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKT-NGAPEQIGLDESGGG-------GGSDPG-------
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 LHQYTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSS
. : : . . .. : . . : .::::.:::::::::::::.:::
CCDS14 ---------EAPTRAAPGELRSARGPLSSAP------EIVHEDLKMGSDGESDQASATSS
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 DEVQSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSR
::::::. : .::. :.:: ::.:::::::::::.:.:::::: .::: ::.:.::: :
CCDS14 DEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 RASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR
:.:::::::::.::::::.:::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 RVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIR
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 EVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQI
:::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::.::::::..::::::::.:.
CCDS14 EVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQL
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 LRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPP
:::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS14 LRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPP
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 DVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGIS
:.::::..::::::::::::::.:::.:::::::::::..::.:::.::::..::::::
CCDS14 DILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGIL
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 SNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLG
::::::.::.:::. . :..:::::::.: .:.::.::.:...:.:::.:::: .: :::
CCDS14 SNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLG
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KB9 PRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
::: ::...:::.::::::::. ..:.::.:..:
CCDS14 ERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
460 470 480 490
>>CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX (502 aa)
initn: 2384 init1: 2312 opt: 2318 Z-score: 1464.5 bits: 280.6 E(32554): 3e-75
Smith-Waterman score: 2352; 69.5% identity (86.9% similar) in 512 aa overlap (1-512:10-491)
10 20 30 40 50
pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTS
:::.::.::.::::.. ::.. . ::. ..:... .: :
CCDS48 MQSEIAMDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKT-NGAPEQIGLDESGGG-------GGSDPG-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 HSMHSFLHQYTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQ
. : : . . .. : . . : .::::.:::::::::::
CCDS48 ---------------EAPTRAAPGELRSARGPLSSAP------EIVHEDLKMGSDGESDQ
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 ASGTSSDEVQSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQP
::.:::::::::. : .::. :.:: ::.:::::::::::.:.:::::: .::: ::.:
CCDS48 ASATSSDEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPADIRLPEGYLEKLTLNSPIFDKP
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 MSRRSRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGA
.::: ::.:::::::::.::::::.:::::::::::::.::::.::::::::::::::::
CCDS48 LSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGKSKLTDNLVALKEIRLEHEEGA
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 PCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVK
:::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::.::::::..:::::
CCDS48 PCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYLDKDLKQYLDDCGNIINMHNVK
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 LFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVT
:::.:.:::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::
CCDS48 LFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSIPTKTYSNEVVT
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 LWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQE
:::::::.::::..::::::::::::::.:::.:::::::::::..::.:::.::::..:
CCDS48 LWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFPGSTVEEQLHFIFRILGTPTEE
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 TWPGISSNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHV
::::: ::::::.::.:::. . :..:::::::.: .:.::.::.:...:.:::.::::
CCDS48 TWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLLTKLLQFEGRNRISAEDAMKHP
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KB9 YFRSLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
.: ::: ::: ::...:::.::::::::. ..:.::.:..:
CCDS48 FFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPDSGRPAFRVVDTEF
460 470 480 490 500
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10 20 30
pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMT
:::.::.::.::::.. ::.. . ::.
CCDS55 AFPLDPNNPSLGPLPSISHLNLRTQIAMDRMKKIKRQLSMTLRGGRGIDKT-NGAPEQIG
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB9 IEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMHSFLHQYTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRN
..:... .: : . : : . . .. : . . :
CCDS55 LDESGGG-------GGSDPG----------------EAPTRAAPGELRSARGPLSSAP--
110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB9 GSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGTSSDEVQSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPAD
.::::.:::::::::::::.:::::::::. : .::. :.:: ::.:::::::::
CCDS55 ----EIVHEDLKMGSDGESDQASATSSDEVQSPVRVRMRNHPPRKISTEDINKRLSLPAD
150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 IRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRRSRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGR
::.:.:::::: .::: ::.:.::: ::.:::::::::.::::::.:::::::::::::.
CCDS55 IRLPEGYLEKLTLNSPIFDKPLSRRLRRVSLSEIGFGKLETYIKLDKLGEGTYATVYKGK
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 SKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYL
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::
CCDS55 SKLTDNLVALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIIHTEKSLTLVFEYL
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 DKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLA
:::::::.::::::..::::::::.:.:::::::::.::::::::::::::::.::::::
CCDS55 DKDLKQYLDDCGNIINMHNVKLFLFQLLRGLAYCHRQKVLHRDLKPQNLLINERGELKLA
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 DFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFP
:::::::::.::::::::::::::::::.::::..::::::::::::::.:::.::::::
CCDS55 DFGLARAKSIPTKTYSNEVVTLWYRPPDILLGSTDYSTQIDMWGVGCIFYEMATGRPLFP
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 GSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPGISSNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELI
:::::..::.:::.::::..:::::: ::::::.::.:::. . :..:::::::.: .:.
CCDS55 GSTVEEQLHFIFRILGTPTEETWPGILSNEEFKTYNYPKYRAEALLSHAPRLDSDGADLL
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 TKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPE
::.::.:...:.:::.:::: .: ::: ::: ::...:::.::::::::. ..:.::.:.
CCDS55 TKLLQFEGRNRISAEDAMKHPFFLSLGERIHKLPDTTSIFALKEIQLQKEASLRSSSMPD
500 510 520 530 540 550
520
pF1KB9 TGHGKNRRQSMLF
.:
CCDS55 SGRPAFRVVDTEF
560 570
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10 20 30 40 50
pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGRPPTSHSMH
::.::::.::.. ..::.:::.:..::.. .: ..: . :: :
CCDS44 MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPP-----
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 SFLHQYTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASGT
: ..: : .: . :
CCDS44 ----QECSTF---------------------------------------SPTDSGEEPGQ
60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 SSDEVQSPTGVCLRNRIHRRISMEDLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQPMSRR
: :: : . .::.::::..:::::: :::.:. .:.:::..:: . .:.::
CCDS44 LSPGVQFQ-----RRQNQRRFSMEDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDLPKPLSRM
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pF1KB9 SRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTA
:::::::.:::::.:::.::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SRRASLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEGAPCTA
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 IREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNVKLFLY
::::::::.:::::::::::..:::.::::::::::.:::::.: :::.:::::::.:..
CCDS44 IREVSLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMHNVKIFMF
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 QILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYR
:.::::::::.::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVVTLWYR
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 PPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQETWPG
::::::::.:::: ::::::::: .:::.::::::::::..::::::::::::..:::::
CCDS44 PPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTEETWPG
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 ISSNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKHVYFRS
... ::..:.:: : ::::::::::::..::.:....: ::::.:.::: :..: ::::
CCDS44 VTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAALSHSYFRS
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520
pF1KB9 LGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
:: :.: : ...:::::::::::::::.:. .. . :.:::::::..
CCDS44 LGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
430 440 450 460 470
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10 20 30 40 50
pF1KB9 MKKFKRRLSLTLRGSQTIDESLSELAEQMTIEENSSKDNEPIVKNGR-PPTSHSM
::.::::.::.. ..::.:::.:..::.. .: ..: . :: :: :
CCDS14 MIMNKMKNFKRRFSLSVPRTETIEESLAEFTEQFNQLHNRRNENLQLGPLGRDPPQECST
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB9 HSFLHQYTGSFKKPPLRRPHSVIGGSLGSFMAMPRNGSRLDIVHENLKMGSDGESDQASG
: : : ..: :.:. . . : : . . .... .:::
CCDS14 FS----PTDSGEEP----------GQLSPGVQFQR---RQNQRRFSMEV-------RASG
70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB9 TSSDEVQSPTGVCLRNRIHRRISME----DLNKRLSLPADIRIPDGYLEKLQINSPPFDQ
. .: . : .. .::: . :..:::::: :::.:. .:.:::..:: . .
CCDS14 ALPRQVAG----CTHKGVHRRAAALQPDFDVSKRLSLPMDIRLPQEFLQKLQMESPDLPK
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB9 PMSRRSRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEG
:.:: :::::::.:::::.:::.::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS14 PLSRMSRRASLSDIGFGKLETYVKLDKLGEGTYATVFKGRSKLTENLVALKEIRLEHEEG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB9 APCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYMDDCGNIMSMHNV
:::::::::::::.:::::::::::..:::.::::::::::.:::::.: :::.::::::
CCDS14 APCTAIREVSLLKNLKHANIVTLHDLIHTDRSLTLVFEYLDSDLKQYLDHCGNLMSMHNV
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB9 KLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVV
:.:..:.::::::::.::.::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KIFMFQLLRGLAYCHHRKILHRDLKPQNLLINERGELKLADFGLARAKSVPTKTYSNEVV
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB9 TLWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPGSTVEDELHLIFRLLGTPSQ
:::::::::::::.:::: ::::::::: .:::.::::::::::..::::::::::::..
CCDS14 TLWYRPPDVLLGSTEYSTPIDMWGVGCIHYEMATGRPLFPGSTVKEELHLIFRLLGTPTE
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB9 ETWPGISSNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLDSEGIELITKFLQYESKKRVSAEEAMKH
:::::... ::..:.:: : ::::::::::::..::.:....: ::::.:.::: :..:
CCDS14 ETWPGVTAFSEFRTYSFPCYLPQPLINHAPRLDTDGIHLLSSLLLYESKSRMSAEAALSH
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KB9 VYFRSLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETGHGKNRRQSMLF
:::::: :.: : ...:::::::::::::::.:. .. . :.:::::::..
CCDS14 SYFRSLGERVHQLEDTASIFSLKEIQLQKDPGYRGLAFQQPGRGKNRRQSIF
460 470 480 490 500
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110 120 130 140 150
pF1KB9 LKMGSDGESDQASGTSSDEVQSPTGVCLRNRIHRRISMED-LNKRLSLPADIRIPDGYLE
:..: : : ..: . .. ..
CCDS75 MSTRNCQGMDSVIKPLDTIPEDKKVRVQRTQSTFDPFEKPANQVKRVHSENNACI
10 20 30 40 50
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KLQINSPPFDQPMSRR-SRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLV
... .: ..: :: : .: . ::: ..: ::::::::.:::::::.::.. .::
CCDS75 NFKTSSTGKESPKVRRHSSPSSPTSPKFGKADSYEKLEKLGEGSYATVYKGKSKVNGKLV
60 70 80 90 100 110
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pF1KB9 ALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYM
::: :::..:::.: :::::.:::: ::::::: ::::.:: ..:::::::. :: :::
CCDS75 ALKVIRLQEEEGTPFTAIREASLLKGLKHANIVLLHDIIHTKETLTLVFEYVHTDLCQYM
120 130 140 150 160 170
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 DDCGNIMSMHNVKLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAK
: . . ::::::.:.::::.: :.: .::::::::::::.. ::::::::::::::
CCDS75 DKHPGGLHPDNVKLFLFQLLRGLSYIHQRYILHRDLKPQNLLISDTGELKLADFGLARAK
180 190 200 210 220 230
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 SVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPG-STVEDE
:::..::::::::::::::::::::.:::: .::::::::: :: .: ::: . ..:.
CCDS75 SVPSHTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTCLDMWGVGCIFVEMIQGVAAFPGMKDIQDQ
240 250 260 270 280 290
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pF1KB9 LHLIFRLLGTPSQETWPGISSNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLD--SEGIELITKFLQ
:. :: .::::...::::. : .:: : :. . : . .:. ... .: .:.::
CCDS75 LERIFLVLGTPNEDTWPGVHSLPHFKPERFTLYSSKNLRQAWNKLSYVNHAEDLASKLLQ
300 310 320 330 340 350
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 YESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETG-HG
:.:.::. :..: :: .: ::. : . :::.. ...:: . : .. ... .:
CCDS75 CSPKNRLSAQAALSHEYFSDLPPRLWELTDMSSIFTVPNVRLQPEAGESMRAFGKNNSYG
360 370 380 390 400 410
520
pF1KB9 KNRRQSMLF
:. .:
CCDS75 KSLSNSKH
420
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110 120 130 140 150
pF1KB9 LKMGSDGESDQASGTSSDEVQSPTGVCLRNRIHRRISMED-LNKRLSLPADIRIPDGYLE
:..: : : ..: . .. ..
CCDS56 ICVTKMSTRNCQGMDSVIKPLDTIPEDKKVRVQRTQSTFDPFEKPANQVKRVHSENNACI
30 40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KLQINSPPFDQPMSRR-SRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLV
... .: ..: :: : .: . ::: ..: ::::::::.:::::::.::.. .::
CCDS56 NFKTSSTGKESPKVRRHSSPSSPTSPKFGKADSYEKLEKLGEGSYATVYKGKSKVNGKLV
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 ALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYM
::: :::..:::.: :::::.:::: ::::::: ::::.:: ..:::::::. :: :::
CCDS56 ALKVIRLQEEEGTPFTAIREASLLKGLKHANIVLLHDIIHTKETLTLVFEYVHTDLCQYM
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KB9 DDCGNIMSMHNVKLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAK
: . . ::::::.:.::::.: :.: .::::::::::::.. ::::::::::::::
CCDS56 DKHPGGLHPDNVKLFLFQLLRGLSYIHQRYILHRDLKPQNLLISDTGELKLADFGLARAK
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KB9 SVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPG-STVEDE
:::..::::::::::::::::::::.:::: .::::::::: :: .: ::: . ..:.
CCDS56 SVPSHTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTCLDMWGVGCIFVEMIQGVAAFPGMKDIQDQ
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pF1KB9 LHLIFRLLGTPSQETWPGISSNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLD--SEGIELITKFLQ
:. :: .::::...::::. : .:: : :. . : . .:. ... .: .:.::
CCDS56 LERIFLVLGTPNEDTWPGVHSLPHFKPERFTLYSSKNLRQAWNKLSYVNHAEDLASKLLQ
330 340 350 360 370 380
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pF1KB9 YESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETG-HG
:.:.::. :..: :: .: ::. : . :::.. ...:: . : .. ... .:
CCDS56 CSPKNRLSAQAALSHEYFSDLPPRLWELTDMSSIFTVPNVRLQPEAGESMRAFGKNNSYG
390 400 410 420 430 440
520
pF1KB9 KNRRQSMLF
:. .:
CCDS56 KSLSNSKH
450
>>CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 (469 aa)
initn: 1227 init1: 986 opt: 1237 Z-score: 794.0 bits: 156.4 E(32554): 6.7e-38
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110 120 130 140 150
pF1KB9 LKMGSDGESDQASGTSSDEVQSPTGVCLRNRIHRRISMED-LNKRLSLPADIRIPDGYLE
:..: : : ..: . .. ..
CCDS75 ICVTKMSTRNCQGMDSVIKPLDTIPEDKKVRVQRTQSTFDPFEKPANQVKRVHSENNACI
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB9 KLQINSPPFDQPMSRR-SRRASLSEIGFGKMETYIKLEKLGEGTYATVYKGRSKLTENLV
... .: ..: :: : .: . ::: ..: ::::::::.:::::::.::.. .::
CCDS75 NFKTSSTGKESPKVRRHSSPSSPTSPKFGKADSYEKLEKLGEGSYATVYKGKSKVNGKLV
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB9 ALKEIRLEHEEGAPCTAIREVSLLKDLKHANIVTLHDIVHTDKSLTLVFEYLDKDLKQYM
::: :::..:::.: :::::.:::: ::::::: ::::.:: ..:::::::. :: :::
CCDS75 ALKVIRLQEEEGTPFTAIREASLLKGLKHANIVLLHDIIHTKETLTLVFEYVHTDLCQYM
170 180 190 200 210 220
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pF1KB9 DDCGNIMSMHNVKLFLYQILRGLAYCHRRKVLHRDLKPQNLLINEKGELKLADFGLARAK
: . . ::::::.:.::::.: :.: .::::::::::::.. ::::::::::::::
CCDS75 DKHPGGLHPDNVKLFLFQLLRGLSYIHQRYILHRDLKPQNLLISDTGELKLADFGLARAK
230 240 250 260 270 280
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pF1KB9 SVPTKTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSSEYSTQIDMWGVGCIFFEMASGRPLFPG-STVEDE
:::..::::::::::::::::::::.:::: .::::::::: :: .: ::: . ..:.
CCDS75 SVPSHTYSNEVVTLWYRPPDVLLGSTEYSTCLDMWGVGCIFVEMIQGVAAFPGMKDIQDQ
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KB9 LHLIFRLLGTPSQETWPGISSNEEFKNYNFPKYKPQPLINHAPRLD--SEGIELITKFLQ
:. :: .::::...::::. : .:: : :. . : . .:. ... .: .:.::
CCDS75 LERIFLVLGTPNEDTWPGVHSLPHFKPERFTLYSSKNLRQAWNKLSYVNHAEDLASKLLQ
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KB9 YESKKRVSAEEAMKHVYFRSLGPRIHALPESVSIFSLKEIQLQKDPGFRNSSYPETG-HG
:.:.::. :..: :: .: ::. : . :::.. ...:: . : .. ... .:
CCDS75 CSPKNRLSAQAALSHEYFSDLPPRLWELTDMSSIFTVPNVRLQPEAGESMRAFGKNNSYG
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520
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