Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8826
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8826, 415 aa
1>>>pF1KB8826 415 - 415 aa - 415 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0546+/-0.00123; mu= 18.6267+/- 0.073
mean_var=120.5794+/-35.882, 0's: 0 Z-trim(102.2): 317 B-trim: 851 in 2/47
Lambda= 0.116799
statistics sampled from 6274 (6847) to 6274 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 2.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8652.1 GPR19 gene_id:2842|Hs108|chr12 ( 415) 2769 478.8 4.1e-135
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 431 84.7 1.5e-16
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 417 82.4 7.8e-16
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 409 81.1 2e-15
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 402 79.9 4.5e-15
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 394 78.6 1.2e-14
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 390 77.9 2e-14
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4 ( 465) 381 76.5 6e-14
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 375 75.4 1.1e-13
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 375 75.4 1.1e-13
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 375 75.4 1.1e-13
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 375 75.4 1.1e-13
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 375 75.4 1.1e-13
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 375 75.4 1.1e-13
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 375 75.4 1.1e-13
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 375 75.4 1.2e-13
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 375 75.5 1.3e-13
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 373 75.0 1.3e-13
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 373 75.0 1.4e-13
CCDS34541.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 351) 372 74.8 1.5e-13
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 371 74.7 1.7e-13
CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 306) 366 73.7 2.7e-13
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 357 72.3 8.6e-13
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 352 71.5 1.6e-12
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 350 71.2 2.1e-12
CCDS5044.1 MCHR2 gene_id:84539|Hs108|chr6 ( 340) 339 69.2 6.7e-12
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 336 68.7 9.8e-12
CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 334 68.5 1.3e-11
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 330 67.7 1.9e-11
CCDS3848.1 MTNR1A gene_id:4543|Hs108|chr4 ( 350) 328 67.4 2.5e-11
CCDS5444.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 371) 327 67.2 2.9e-11
CCDS5443.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 377) 327 67.2 2.9e-11
CCDS75579.1 NPSR1 gene_id:387129|Hs108|chr7 ( 390) 327 67.3 3e-11
CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 326 67.1 3.3e-11
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 324 66.6 3.6e-11
CCDS7606.1 PRLHR gene_id:2834|Hs108|chr10 ( 370) 325 66.9 3.6e-11
CCDS44012.1 GPR50 gene_id:9248|Hs108|chrX ( 617) 327 67.5 3.9e-11
CCDS46345.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 311) 321 66.1 5.2e-11
CCDS3791.1 NPY2R gene_id:4887|Hs108|chr4 ( 381) 322 66.4 5.2e-11
CCDS8297.1 GPR83 gene_id:10888|Hs108|chr11 ( 423) 320 66.1 7e-11
>>CCDS8652.1 GPR19 gene_id:2842|Hs108|chr12 (415 aa)
initn: 2769 init1: 2769 opt: 2769 Z-score: 2539.1 bits: 478.8 E(32554): 4.1e-135
Smith-Waterman score: 2769; 99.8% identity (100.0% similar) in 415 aa overlap (1-415:1-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MVFAHRMDNSKPHLIIPTLLVPLQNRSCTETATPLPSQYLMELSEEHSWMSNQTDLHYVL
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CCDS86 MVFAHRMDNSKPHLIIPTLLVPLQNRSCTETATPLPSQYLMELSEEHSWMSNQTDLHYVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KPGEVATASIFFGILWLFSIFGNSLVCLVIHRSRRTQSTTNYFVVSMACADLLISVASTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KPGEVATASIFFGILWLFSIFGNSLVCLVIHRSRRTQSTTNYFVVSMACADLLISVASTP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 FVLLQFTTGRWTLGSATCKVVRYFQYLTPGVQIYVLLSICIDRFYTIVYPLSFKVSREKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 FVLLQFTTGRWTLGSATCKVVRYFQYLTPGVQIYVLLSICIDRFYTIVYPLSFKVSREKA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 KKMIAASWIFDAGFVTPVLFFYGSNWDSHCNYFLPSSWEGTAYTVIHFLVGFVIPSVLII
::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KKMIAASWVFDAGFVTPVLFFYGSNWDSHCNYFLPSSWEGTAYTVIHFLVGFVIPSVLII
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 LFYQKVIKYIWRIGTDGRTVRRTMNIVPRTKVKTIKMFLILNLLFLLSWLPFHVAQLWHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 LFYQKVIKYIWRIGTDGRTVRRTMNIVPRTKVKTIKMFLILNLLFLLSWLPFHVAQLWHP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 HEQDYKKSSLVFTAITWISFSSSASKPTLYSIYNANFRRGMKETFCMSSMKCYRSNAYTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 HEQDYKKSSLVFTAITWISFSSSASKPTLYSIYNANFRRGMKETFCMSSMKCYRSNAYTI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB8 TTSSRMAKKNYVGISEIPSMAKTITKDSIYDSFDREAKEKKLAWPINSNPPNTFV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 TTSSRMAKKNYVGISEIPSMAKTITKDSIYDSFDREAKEKKLAWPINSNPPNTFV
370 380 390 400 410
>>CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 (349 aa)
initn: 305 init1: 163 opt: 431 Z-score: 410.7 bits: 84.7 E(32554): 1.5e-16
Smith-Waterman score: 431; 27.2% identity (60.4% similar) in 313 aa overlap (70-366:38-338)
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 LMELSEEHSWMSNQTDLHYVLKPGEVATASIFFGILWLFSIFGNSLVCLVIHRSR--RTQ
. ::... ....::::: :. ::. . .
CCDS12 LSEGNASWPEPPAPEPGPLFGIGVENFVTLVVFGLIFALGVLGNSLVITVLARSKPGKPR
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 STTNYFVVSMACADLLISVASTPFVLLQFTTGRWTLGSATCKVVRYFQYLTPGVQIYVLL
:::: :..... ::: . :: .. :.::. :: ..:: .. :.:..:
CCDS12 STTNLFILNLSIADLAYLLFCIPFQATVYALPTWVLGAFICKFIHYFFTVSMLVSIFTLA
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200
pF1KB8 SICIDRFYTIVYPL---SFKVSREKAKKMIAASWIFDAGFVTPVLFFYG-----SNWDSH
.. .::. .::. :..:::. : .. : .. ....:: . : .. ..
CCDS12 AMSVDRYVAIVHSRRSSSLRVSRN-ALLGVGCIWALSIAMASPVAYHQGLFHPRASNQTF
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 CNYFLPSSWEGTAYTVIHFLVGFVIPSVLIILFYQKVIKYIWRIGTDGRTVRRTMNIVPR
: :. . ::.: :. :...: .:: . : ::.... . .. .
CCDS12 CWEQWPDPRHKKAYVVCTFVFGYLLPLLLICFCYAKVLNHL------HKKLKNMSKKSEA
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 TKVKTIKMFLILNLLFLLSWLPFHVAQLWHPHEQ-DYKKSSLVFTAITW-ISFSSSASKP
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CCDS12 SKKKTAQTVLVVVVVFGISWLPHHIIHLWAEFGVFPLTPASFLFRITAHCLAYSNSSVNP
250 260 270 280 290 300
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 TLYSIYNANFRRGMKETFCMSSMKCY-RSNAY---TITTSSRMAKKNYVGISEIPSMAKT
.:.. . :::...:..: ::. :.... : ..::.
CCDS12 IIYAFLSENFRKAYKQVF-----KCHIRKDSHLSDTKESKSRIDTPPSTNCTHV
310 320 330 340
390 400 410
pF1KB8 ITKDSIYDSFDREAKEKKLAWPINSNPPNTFV
>>CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 (369 aa)
initn: 219 init1: 120 opt: 417 Z-score: 397.7 bits: 82.4 E(32554): 7.8e-16
Smith-Waterman score: 421; 27.3% identity (61.4% similar) in 308 aa overlap (51-347:31-329)
30 40 50 60 70 80
pF1KB8 VPLQNRSCTETATPLPSQYLMELSEEHSWMSNQTDLHYVLKPGEVATASIFFGILWLFSI
::::. .: : . : : :.: .. ....
CCDS11 MDMADEPLNGSHTWLSIPFDLNGSVVSTNTSNQTEPYYDLTSNAVLTF-IYF-VVCIIGL
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 FGNSLVCLVIHRSRRTQSTTNYFVVSMACADLLISVASTPFVLLQFTTGRWTLGSATCKV
::.:: :: : . .. :: .....: :: :. .. ::. .: . .: .:.: :.:
CCDS11 CGNTLVIYVILRYAKMKTITNIYILNLAIADELFMLG-LPFLAMQVALVHWPFGKAICRV
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190
pF1KB8 VRYFQYLTPGVQIYVLLSICIDRFYTIVYPL-SFKVSREKAKKMIA-ASWIFDAGFVTPV
: . .. ..:. : . :::. ..:.:. : : : .. :::. : : . . :.
CCDS11 VMTVDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLVILPI
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 LFFYG--SN-WD-SHCNYFLPS---SWEGTAYTVIHFLVGFVIPSVLIILFYQKVIKYIW
... : :: : : :. :. .: :.. . :..::..: ..: : : .:
CCDS11 MIYAGLRSNQWGRSSCTINWPGESGAWY-TGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFIII---
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 RIGTDGRTVRRTMNIVPRTKVKTIKMFLILNLLFLLSWLPFHVAQLWHPHEQDYKKSSL-
.. ..: .: . ... :. .: :. .:.. ::::.. .. .:
CCDS11 KVKSSG--IRVGSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALK
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360
pF1KB8 -VFTAITWISFSSSASKPTLYSIYNANFRRGMKETFCMSSMKCYRSNAYTITTSSRMAKK
.: .. .....: ..: ::.. . ::........:.
CCDS11 GMFDFVVVLTYANSCANPILYAFLSDNFKKSFQNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQDKSRLN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KB8 NYVGISEIPSMAKTITKDSIYDSFDREAKEKKLAWPINSNPPNTFV
CCDS11 ETTETQRTLLNGDLQTSI
360
>>CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 (387 aa)
initn: 232 init1: 232 opt: 409 Z-score: 390.2 bits: 81.1 E(32554): 2e-15
Smith-Waterman score: 409; 26.2% identity (60.0% similar) in 290 aa overlap (64-346:24-307)
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 PLPSQYLMELSEEHSWMSNQTDLHYVLKPGEVATASIFFGILWLFSIFGNSLVCLVIHRS
:.. . ..:....: . ::.:: :. :.
CCDS11 MNVSGCPGAGNASQAGGGGGWHPEAVIVPLLFALIFLVGTVGNTLVLAVLLRG
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 RRTQSTTNYFVVSMACADLLISVASTPFVLLQFTTGRWTLGSATCKVVRYFQYLTPGVQI
.. :::: :..... ::: . . .:: .: :..:: ::.:... .:: ..
CCDS11 GQAVSTTNLFILNLGVADLCFILCCVPFQATIYTLDGWVFGSLLCKAVHFLIFLTMHASS
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 YVLLSICIDRFYTIVYPLSFKVSREKAKKMIAAS--WIFDAGFVTPVLFFYGSNWDSHCN
..: .. .::. .: ::: . : . . : . : .. : : : .: .. .. .
CCDS11 FTLAAVSLDRYLAIRYPLHSRELRTPRNALAAIGLIWGLSLLFSGPYLSYYRQSQLANLT
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260
pF1KB8 YFLPSSWEGT---AYTVIHFLVGFVIPSVLIILFYQKVIKYIWRIGTDGRTVRRTMNIVP
:. : . :. . :. ....: ... : : ....:.:: ..: ..
CCDS11 VCHPA-WSAPRRRAMDICTFVFSYLLPVLVLGLTYARTLRYLWR-AVDPVAAGSGAR---
180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 RTKVKTIKMFLILNLLFLLSWLPFHVAQL--WHPHEQDYKKSSLVFTAITWISFSSSASK
:.: :. .:.::. :: : :.: :. : : . . . . .:...: .
CCDS11 RAKRKVTRMILIVAALFCLCWMPHHALILCVWFGQFPLTRATYALRILSHLVSYANSCVN
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 PTLYSIYNANFRRGMKETFCMSSMKCYRSNAYTITTSSRMAKKNYVGISEIPSMAKTITK
: .:.. . .::.:.. :.:
CCDS11 PIVYALVSKHFRKGFR-TICAGLLGRAPGRASGRVCAAARGTHSGSVLERESSDLLHMSE
290 300 310 320 330 340
>>CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 (364 aa)
initn: 244 init1: 85 opt: 402 Z-score: 384.1 bits: 79.9 E(32554): 4.5e-15
Smith-Waterman score: 402; 25.5% identity (60.3% similar) in 310 aa overlap (51-347:21-321)
30 40 50 60 70
pF1KB8 VPLQNRSCTETATPLPSQYLMELSEEHSWMSNQTDLHYVLKPGEVATA-SIFFGILWLF-
:. : . .. :. : : ... .:.:.
CCDS10 MEPLFPASTPSWNASSPGAASGGGDNRTLVGPAPSAGARAVLVPVLYLLV
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 ---SIFGNSLVCLVIHRSRRTQSTTNYFVVSMACADLLISVASTPFVLLQFTTGRWTLGS
.. ::.:: :. : . ...:: .....: ::.: .. ::. : ... : .:
CCDS10 CAAGLGGNTLVIYVVLRFAKMKTVTNIYILNLAVADVLYMLG-LPFLATQNAASFWPFGP
60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB8 ATCKVVRYFQYLTPGVQIYVLLSICIDRFYTIVYPLSF-KVSREKAKKMI-AASWIFDAG
. :..: .. .. .... : . .::. ..:.::: . : .. :. ::.:...
CCDS10 VLCRLVMTLDGVNQFTSVFCLTVMSVDRYLAVVHPLSSARWRRPRVAKLASAAAWVLSLC
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 FVTPVLFFYGSNWDSHCNYFLPSS---WEGTAYTVIHFLVGFVIPSVLIILFYQKVIKYI
. :.: : . . :: : : :... . ..:: : ..: : : .. .
CCDS10 MSLPLLVFADVQEGGTCNASWPEPVGLW-GAVFIIYTAVLGFFAPLLVICLCYLLIVVKV
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300
pF1KB8 WRIGTDGRTVRRTMNIVPRTKVKTIKMFLILNLLFLLSWLPF---HVAQLWHPHEQDYKK
:. ::: :.. :. .: :.. :.: :::: ....: :. .
CCDS10 RAAGVRVGCVRR------RSERKVTRMVLVVVLVFAGCWLPFFTVNIVNLAVALPQEPAS
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 SSLVFTAITWISFSSSASKPTLYSIYNANFRRGMKETFCMSSMKCYRSNAYTITTSSRMA
..: : .. .:...: ..:.::.. . :::.......:.
CCDS10 AGLYFFVVI-LSYANSCANPVLYGFLSDNFRQSFQKVLCLRKGSGAKDADATEPRPDRIR
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410
pF1KB8 KKNYVGISEIPSMAKTITKDSIYDSFDREAKEKKLAWPINSNPPNTFV
CCDS10 QQQEATPPAHRAAANGLMQTSKL
350 360
>>CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 (391 aa)
initn: 289 init1: 101 opt: 394 Z-score: 376.5 bits: 78.6 E(32554): 1.2e-14
Smith-Waterman score: 397; 25.2% identity (61.1% similar) in 298 aa overlap (63-350:56-343)
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 TPLPSQYLMELSEEHSWMSNQTDLHYVLKPGEVATASIFFGILWLFSIFGNSLVCLVIHR
: . :...... : .. :::.: :: :
CCDS96 GSRGPGAGAADGMEEPGRNASQNGTLSEGQGSAILISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILR
30 40 50 60 70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 SRRTQSTTNYFVVSMACADLLISVASTPFVLLQFTTGRWTLGSATCKVVRYFQYLTPGVQ
. ...:: .....: :: :. . :.::.. . .: .:. :..: . .. ..
CCDS96 YAKMKTATNIYILNLAIADELLML-SVPFLVTSTLLRHWPFGALLCRLVLSVDAVNMFTS
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200
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::...: . : ..... ::.::..: : : : .: . .. . .:
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pF1KB8 PTLYSIYNANFRRGMKETFCM-SSMKCYRSNAYTITTSSRMAKKNYVGISEIPSMAKTIT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]