Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8596
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8596, 898 aa
1>>>pF1KB8596 898 - 898 aa - 898 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1266+/-0.00125; mu= 7.7968+/- 0.074
mean_var=156.5338+/-32.553, 0's: 0 Z-trim(105.7): 95 B-trim: 158 in 1/50
Lambda= 0.102511
statistics sampled from 8472 (8560) to 8472 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 2.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7867.1 KIF18A gene_id:81930|Hs108|chr11 ( 898) 5887 883.7 0
CCDS58555.1 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 833) 1535 240.1 1.3e-62
CCDS45709.2 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 852) 1535 240.1 1.4e-62
CCDS32718.2 KIF19 gene_id:124602|Hs108|chr17 ( 998) 1010 162.5 3.6e-39
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 699) 821 134.4 7e-31
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 726) 821 134.4 7.3e-31
CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8 (1826) 825 135.2 1e-30
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 702) 807 132.3 3e-30
CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234) 811 133.1 3.2e-30
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 ( 747) 798 131.0 7.9e-30
CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX (1232) 801 131.6 8.8e-30
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028) 762 125.8 4.1e-28
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029) 762 125.8 4.1e-28
CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2 ( 957) 761 125.6 4.3e-28
CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749) 760 125.6 7.9e-28
CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757) 760 125.6 7.9e-28
CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770) 760 125.6 7.9e-28
CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805) 760 125.6 8.1e-28
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 761 125.9 9.8e-28
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701) 758 125.4 1.4e-27
CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12 (1032) 740 122.5 3.9e-27
CCDS10653.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 665) 735 121.7 4.6e-27
CCDS58444.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 597) 733 121.4 5.1e-27
CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10 ( 963) 713 118.5 5.9e-26
CCDS2751.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 725) 691 115.2 4.5e-25
CCDS2752.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 790) 691 115.2 4.8e-25
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153) 679 113.5 2.2e-24
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770) 679 113.6 3.2e-24
CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103) 651 109.4 3.8e-23
CCDS45494.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 687) 640 107.6 7.9e-23
CCDS81988.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 724) 640 107.7 8.3e-23
CCDS45493.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 826) 640 107.7 9.3e-23
CCDS10789.2 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 833) 640 107.7 9.3e-23
CCDS81989.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 848) 640 107.7 9.5e-23
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 ( 929) 638 107.4 1.3e-22
CCDS32325.2 KIF7 gene_id:374654|Hs108|chr15 (1343) 626 105.7 5.8e-22
CCDS81987.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 684) 619 104.5 6.8e-22
CCDS7422.1 KIF11 gene_id:3832|Hs108|chr10 (1056) 622 105.1 7.2e-22
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3 (1388) 576 98.3 1e-19
CCDS65072.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1304) 555 95.2 8.2e-19
CCDS65071.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1335) 555 95.2 8.4e-19
CCDS6665.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1401) 555 95.2 8.7e-19
CCDS4844.1 KIF6 gene_id:221458|Hs108|chr6 ( 814) 534 92.0 4.8e-18
CCDS6427.1 KIFC2 gene_id:90990|Hs108|chr8 ( 838) 523 90.4 1.5e-17
CCDS6801.1 KIF12 gene_id:113220|Hs108|chr9 ( 513) 514 88.9 2.5e-17
CCDS30963.1 KIF14 gene_id:9928|Hs108|chr1 (1648) 504 87.7 1.9e-16
CCDS58949.1 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 686) 481 84.1 9.5e-16
CCDS3980.2 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 706) 481 84.1 9.7e-16
CCDS47216.1 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 744) 475 83.3 1.9e-15
CCDS72774.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 671) 474 83.1 1.9e-15
>>CCDS7867.1 KIF18A gene_id:81930|Hs108|chr11 (898 aa)
initn: 5887 init1: 5887 opt: 5887 Z-score: 4715.3 bits: 883.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5887; 100.0% identity (100.0% similar) in 898 aa overlap (1-898:1-898)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSVTEEDLCHHMKVVVRVRPENTKEKAAGFHKVVHVVDKHILVFDPKQEEVSFFHGKKTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MSVTEEDLCHHMKVVVRVRPENTKEKAAGFHKVVHVVDKHILVFDPKQEEVSFFHGKKTT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NQNVIKKQNKDLKFVFDAVFDETSTQSEVFEHTTKPILRSFLNGYNCTVLAYGATGAGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NQNVIKKQNKDLKFVFDAVFDETSTQSEVFEHTTKPILRSFLNGYNCTVLAYGATGAGKT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HTMLGSADEPGVMYLTMLHLYKCMDEIKEEKICSTAVSYLEVYNEQIRDLLVNSGPLAVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 HTMLGSADEPGVMYLTMLHLYKCMDEIKEEKICSTAVSYLEVYNEQIRDLLVNSGPLAVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 EDTQKGVVVHGLTLHQPKSSEEILHLLDNGNKNRTQHPTDMNATSSRSHAVFQIYLRQQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EDTQKGVVVHGLTLHQPKSSEEILHLLDNGNKNRTQHPTDMNATSSRSHAVFQIYLRQQD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 KTASINQNVRIAKMSLIDLAGSERASTSGAKGTRFVEGTNINRSLLALGNVINALADSKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 KTASINQNVRIAKMSLIDLAGSERASTSGAKGTRFVEGTNINRSLLALGNVINALADSKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KNQHIPYRNSKLTRLLKDSLGGNCQTIMIAAVSPSSVFYDDTYNTLKYANRAKDIKSSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 KNQHIPYRNSKLTRLLKDSLGGNCQTIMIAAVSPSSVFYDDTYNTLKYANRAKDIKSSLK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SNVLNVNNHITQYVKICNEQKAEILLLKEKLKAYEEQKAFTNENDQAKLMISNPQEKEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SNVLNVNNHITQYVKICNEQKAEILLLKEKLKAYEEQKAFTNENDQAKLMISNPQEKEIE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 RFQEILNCLFQNREEIRQEYLKLEMLLKENELKSFYQQQCHKQIEMMCSEDKVEKATGKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RFQEILNCLFQNREEIRQEYLKLEMLLKENELKSFYQQQCHKQIEMMCSEDKVEKATGKR
430 440 450 460 470 480
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pF1KB8 DHRLAMLKTRRSYLEKRREEELKQFDENTNWLHRVEKEMGLLSQNGHIPKELKKDLHCHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DHRLAMLKTRRSYLEKRREEELKQFDENTNWLHRVEKEMGLLSQNGHIPKELKKDLHCHH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 LHLQNKDLKAQIRHMMDLACLQEQQHRQTEAVLNALLPTLRKQYCTLKEAGLSNAAFESD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LHLQNKDLKAQIRHMMDLACLQEQQHRQTEAVLNALLPTLRKQYCTLKEAGLSNAAFESD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 FKEIEHLVERKKVVVWADQTAEQPKQNDLPGISVLMTFPQLGPVQPIPCCSSSGGTNLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FKEIEHLVERKKVVVWADQTAEQPKQNDLPGISVLMTFPQLGPVQPIPCCSSSGGTNLVK
610 620 630 640 650 660
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pF1KB8 IPTEKRTRRKLMPSPLKGQHTLKSPPSQSVQLNDSLSKELQPIVYTPEDCRKAFQNPSTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IPTEKRTRRKLMPSPLKGQHTLKSPPSQSVQLNDSLSKELQPIVYTPEDCRKAFQNPSTV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 TLMKPSSFTTSFQAISSNINSDNCLKMLCEVAIPHNRRKECGQEDLDSTFTICEDIKSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TLMKPSSFTTSFQAISSNINSDNCLKMLCEVAIPHNRRKECGQEDLDSTFTICEDIKSSK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 CKLPEQESLPNDNKDILQRLDPSSFSTKHSMPVPSMVPSYMAMTTAAKRKRKLTSSTSNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 CKLPEQESLPNDNKDILQRLDPSSFSTKHSMPVPSMVPSYMAMTTAAKRKRKLTSSTSNS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB8 SLTADVNSGFAKRVRQDNSSEKHLQENKPTMEHKRNICKINPSMVRKFGRNISKGNLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SLTADVNSGFAKRVRQDNSSEKHLQENKPTMEHKRNICKINPSMVRKFGRNISKGNLR
850 860 870 880 890
>>CCDS58555.1 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 (833 aa)
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Smith-Waterman score: 1569; 37.0% identity (62.5% similar) in 881 aa overlap (12-853:8-821)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSVTEEDLCHHMKVVVRVRPENTKEKAAGFHKVVHVVDKHILVFDPKQEEVSFFHGKKTT
..::::::: . .: . . ::.:::...:::.:.. . .: :
CCDS58 MAVEDSTLQVVVRVRPPTPRELDSQRRPVVQVVDERVLVFNPEEPDGGFPGLKWGG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NQNVIKKQNKDLKFVFDAVFDETSTQSEVFEHTTKPILRSFLNGYNCTVLAYGATGAGKT
... ::..::: :::: :: :..::..::.:::. .: :::.::::.:.::::::::::
CCDS58 THDGPKKKGKDLTFVFDRVFGEAATQQDVFQHTTHSVLDSFLQGYNCSVFAYGATGAGKT
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130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HTMLGSADEPGVMYLTMLHLYKCMDEIKEEKICSTAVSYLEVYNEQIRDLLVNSGPLAVR
::::: .::.:::: ..::. .. ..:: . .:: :::::::.::: .::::.:
CCDS58 HTMLGREGDPGIMYLTTVELYRRLEARQQEKHFEVLISYQEVYNEQIHDLLEPKGPLAIR
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pF1KB8 EDTQKGVVVHGLTLHQPKSSEEILHLLDNGNKNRTQHPTDMNATSSRSHAVFQIYLRQQD
:: .:::::.::..::: :.:..:..: ::.:::::::: :::::::::.:::...:::
CCDS58 EDPDKGVVVQGLSFHQPASAEQLLEILTRGNRNRTQHPTDANATSSRSHAIFQIFVKQQD
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pF1KB8 KTASINQNVRIAKMSLIDLAGSERASTSGAKGTRFVEGTNINRSLLALGNVINALADSKR
.. ...: :..:::::::::::::::.. ::: :. ::.::::::::: ::.:::::.:
CCDS58 RVPGLTQAVQVAKMSLIDLAGSERASSTHAKGERLREGANINRSLLALINVLNALADAKG
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 KNQHIPYRNSKLTRLLKDSLGGNCQTIMIAAVSPSSVFYDDTYNTLKYANRAKDIKSSLK
.. :.:::.:::::::::::::::.:.::::.::::. :.:::::::::.:::.:. :::
CCDS58 RKTHVPYRDSKLTRLLKDSLGGNCRTVMIAAISPSSLTYEDTYNTLKYADRAKEIRLSLK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 SNVLNVNNHITQYVKICNEQKAEILLLKEKLKAYEEQKAFTNENDQAKLMISNPQEKEIE
::: ... ::.::. ::.. .::. :..::..:: .. .. . : :.
CCDS58 SNVTSLDCHISQYATICQQLQAEVAALRKKLQVYEGGGQPPPQDLPGSPKSGPPPEH---
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 RFQEILNCLFQNREEIRQEYLKLEMLLKENELKSFYQQQCHKQIEMMCSEDKVEKATGKR
: . : .: :. . . .
CCDS58 --------------------------LPSSPLPPHPPSQ-------PCTPELPAGPRALQ
420 430 440
490 500 510 520 530
pF1KB8 DHRLAM-LKTRRSYLEKRREEELKQFDENTNWLHRVEKEMGLLSQNGHIPKELKKDLHCH
.. :.: ...:.. . ..: . ::. . ..: .: . . .:. . :. .
CCDS58 EESLGMEAQVERAMEGNSSDQEQSPEDEDEGPAEEVPTQMPEQNPTHALPESPRLTLQPK
450 460 470 480 490 500
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pF1KB8 HL--HLQNKDLKAQIRHMMDLA--CLQEQQHRQTEAVLNALLPTLRKQYCTLK-------
. :.. ..: .. ... : :. ..:. .:. : : : . .. ::.
CCDS58 PVVGHFSARELDGDRSKQLALKVLCVAQRQYSLLQAA-NLLTPDMITEFETLQQLVQEEK
510 520 530 540 550
590 600 610 620 630 640
pF1KB8 -EAGLSNAAFESDFKEIEHLVER---KKVVVWADQTAEQPKQNDLPGISVLMTFPQLGP-
: : ..: : . . :... ... : . : : . : .. :. ::
CCDS58 IEPG-AEALRTSGLARGAPLAQELCSESIPVPSPLCPEPPGYTG-P-VTRTMARRLSGPL
560 570 580 590 600 610
650 660 670 680 690
pF1KB8 ----VQPIPCCSSSGGTNLVKIPTEKRTRRKLMPSPLKGQHTLKSPPSQSVQLNDSLSKE
. : : :. . :. . : ::. :: :: :... . :..... ..
CCDS58 HTLGIPPGPNCTPAQGS---RWPMEKKRRR---PSALEADSPM--APKRGTK------RQ
620 630 640 650 660
700 710 720 730 740 750
pF1KB8 LQPIVYTPEDCRKAFQNPSTVTLMKPSSFTTSFQAISSNINSDN-CLKMLCEVAIP--HN
: . : : . . :.: . :: : . . :: .: : . . .: .
CCDS58 RQS--FLP--CLRRGSLPDTQPSQGPS--TPKGERASSPCHSPRVCPATVIKSRVPLGPS
670 680 690 700 710
760 770 780 790 800
pF1KB8 RRKECGQ------EDLDSTFTICEDIKSS----KC----KLPEQESLPNDNKDILQRLDP
..:. .::..:: . :. :. .: :.:.. : .. .. :
CCDS58 AMQNCSTPLALPTRDLNATFDLSEEPPSKPSFHECIGWDKIPQE--LSRLDQPFIPRAPV
720 730 740 750 760 770
810 820 830 840 850 860
pF1KB8 SSFSTKHSMPVPSMVPSYMAMTTAAKRKRKLTSSTSNS-SLTADVNSGFAKRVRQDNSSE
:. : :. :. :. :.: :.:: .::.:.. : : . :. ::
CCDS58 PLFTMKGPKPTSSL-PG----TSACKKKRVASSSVSHGRSRIARLPSSTLKRPAGPLVLP
780 790 800 810 820
870 880 890
pF1KB8 KHLQENKPTMEHKRNICKINPSMVRKFGRNISKGNLR
CCDS58 GDWH
830
>>CCDS45709.2 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 (852 aa)
initn: 1567 init1: 1535 opt: 1535 Z-score: 1237.2 bits: 240.1 E(32554): 1.4e-62
Smith-Waterman score: 1580; 37.3% identity (61.5% similar) in 920 aa overlap (12-896:8-846)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSVTEEDLCHHMKVVVRVRPENTKEKAAGFHKVVHVVDKHILVFDPKQEEVSFFHGKKTT
..::::::: . .: . . ::.:::...:::.:.. . .: :
CCDS45 MAVEDSTLQVVVRVRPPTPRELDSQRRPVVQVVDERVLVFNPEEPDGGFPGLKWGG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 NQNVIKKQNKDLKFVFDAVFDETSTQSEVFEHTTKPILRSFLNGYNCTVLAYGATGAGKT
... ::..::: :::: :: :..::..::.:::. .: :::.::::.:.::::::::::
CCDS45 THDGPKKKGKDLTFVFDRVFGEAATQQDVFQHTTHSVLDSFLQGYNCSVFAYGATGAGKT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 HTMLGSADEPGVMYLTMLHLYKCMDEIKEEKICSTAVSYLEVYNEQIRDLLVNSGPLAVR
::::: .::.:::: ..::. .. ..:: . .:: :::::::.::: .::::.:
CCDS45 HTMLGREGDPGIMYLTTVELYRRLEARQQEKHFEVLISYQEVYNEQIHDLLEPKGPLAIR
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CCDS75 KIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEKKV-IVGG
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CCDS75 VDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRRELEE---KEQERLDIEEKYTSLQEEAQ
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CCDS75 GKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLIIDNFIPRDY
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CCDS55 MGDSKVKVAVRIRPMNRRE--TDLHTKCVVDVDANKVILNPVNTNLS--KGD-A
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CCDS55 --ESEKLIQEMTVTWEEKLRKTEEIAQERQKQLESLGISLQSSGIKVGDDKCFLVNLNAD
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CCDS55 PALNELLVYYLKEHTLIGSANSQDIQLCGMGILPEHCIIDITSEGQVMLTPQKNTRTFVN
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CCDS75 EERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEKKVIVGGVDLLAKAEEQEKLLEESN
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CCDS75 LMAAKSEMADLQQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQMLIIDNFIPRDYQEMIENYVHWNE
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CCDS47 GIIPRVIQLLFKEIDKKSDFEF-TLKVSYLEIYNEEILDLLCPSREKAQINIREDPKEGI
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CCDS47 KIVGLTEKTVLVALDTVSCLEQGNNSRTVASTAMNSQSSRSHAIFTISIEQRKKSDK-NC
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CCDS13 HE--MPK-----TFTFDAVYDWNAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKT
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CCDS13 YTMEGIRGDPEKRGVIPNSFDHIFTHISRSQNQQYLVRA-SYLEIYQEEIRDLLSKDQTK
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CCDS13 RLELKERPDTGVYVKDLSSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVIT
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CCDS13 IECSEVGLDGENHIRVGKLNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNVISAL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]