Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8559
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8559, 1006 aa
1>>>pF1KB8559 1006 - 1006 aa - 1006 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5619+/-0.00152; mu= 11.5017+/- 0.090
mean_var=244.6231+/-53.228, 0's: 0 Z-trim(106.1): 242 B-trim: 4 in 1/49
Lambda= 0.082002
statistics sampled from 8509 (8766) to 8509 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.269), width: 16
Scan time: 4.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11871.1 MIB1 gene_id:57534|Hs108|chr18 (1006) 6891 830.4 0
CCDS53263.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1056) 1679 213.8 1.5e-54
CCDS41224.2 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1070) 1679 213.8 1.5e-54
CCDS53261.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1066) 1309 170.0 2.3e-41
CCDS53262.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1005) 560 81.4 1e-14
CCDS53264.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 ( 753) 555 80.6 1.3e-14
CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 496 74.1 2.9e-12
CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957) 496 74.6 4.7e-12
CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863) 487 73.1 6.1e-12
CCDS6121.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1880) 478 72.0 1.3e-11
CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881) 478 72.0 1.3e-11
CCDS47849.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1897) 478 72.0 1.3e-11
CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430) 469 70.8 2.3e-11
CCDS46769.1 ANKRD28 gene_id:23243|Hs108|chr3 (1053) 466 70.3 2.4e-11
>>CCDS11871.1 MIB1 gene_id:57534|Hs108|chr18 (1006 aa)
initn: 6891 init1: 6891 opt: 6891 Z-score: 4425.3 bits: 830.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6891; 100.0% identity (100.0% similar) in 1006 aa overlap (1-1006:1-1006)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSNSRNNRVMVEGVGARVVRGPDWKWGKQDGGEGHVGTVRSFESPEEVVVVWDNGTAANY
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CCDS11 MSNSRNNRVMVEGVGARVVRGPDWKWGKQDGGEGHVGTVRSFESPEEVVVVWDNGTAANY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 RCSGAYDLRILDSAPTGIKHDGTMCDTCRQQPIIGIRWKCAECTNYDLCTVCYHGDKHHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RCSGAYDLRILDSAPTGIKHDGTMCDTCRQQPIIGIRWKCAECTNYDLCTVCYHGDKHHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 RHRFYRITTPGSERVLLESRRKSKKITARGIFAGARVVRGVDWQWEDQDGGNGRRGKVTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RHRFYRITTPGSERVLLESRRKSKKITARGIFAGARVVRGVDWQWEDQDGGNGRRGKVTE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 IQDWSASSPHSAAYVLWDNGAKNLYRVGFEGMSDLKCVQDAKGGSFYRDHCPVLGEQNGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IQDWSASSPHSAAYVLWDNGAKNLYRVGFEGMSDLKCVQDAKGGSFYRDHCPVLGEQNGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RNPGGLQIGDLVNIDLDLEIVQSLQHGHGGWTDGMFETLTTTGTVCGIDEDHDIVVQYPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RNPGGLQIGDLVNIDLDLEIVQSLQHGHGGWTDGMFETLTTTGTVCGIDEDHDIVVQYPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 GNRWTFNPAVLTKANIVRSGDAAQGAEGGTSQFQVGDLVQVCYDLERIKLLQRGHGEWAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GNRWTFNPAVLTKANIVRSGDAAQGAEGGTSQFQVGDLVQVCYDLERIKLLQRGHGEWAE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 AMLPTLGKVGRVQQIYSDSDLKVEVCGTSWTYNPAAVSKVASAGSAISNASGERLSQLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AMLPTLGKVGRVQQIYSDSDLKVEVCGTSWTYNPAAVSKVASAGSAISNASGERLSQLLK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 KLFETQESGDLNEELVKAAANGDVAKVEDLLKRPDVDVNGQCAGHTAMQAASQNGHVDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KLFETQESGDLNEELVKAAANGDVAKVEDLLKRPDVDVNGQCAGHTAMQAASQNGHVDIL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 KLLLKQNVDVEAEDKDGDRAVHHAAFGDEGAVIEVLHRGSADLNARNKRRQTPLHIAVNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KLLLKQNVDVEAEDKDGDRAVHHAAFGDEGAVIEVLHRGSADLNARNKRRQTPLHIAVNK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 GHLQVVKTLLDFGCHPSLQDSEGDTPLHDAISKKRDDILAVLLEAGADVTITNNNGFNAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GHLQVVKTLLDFGCHPSLQDSEGDTPLHDAISKKRDDILAVLLEAGADVTITNNNGFNAL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 HHAALRGNPSAMRVLLSKLPRPWIVDEKKDDGYTALHLAALNNHVEVAELLVHQGNANLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HHAALRGNPSAMRVLLSKLPRPWIVDEKKDDGYTALHLAALNNHVEVAELLVHQGNANLD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 IQNVNQQTALHLAVERQHTQIVRLLVRAGAKLDIQDKDGDTPLHEALRHHTLSQLRQLQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IQNVNQQTALHLAVERQHTQIVRLLVRAGAKLDIQDKDGDTPLHEALRHHTLSQLRQLQD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 MQDVGKVDAAWEPSKNTLIMGLGTQGAEKKSAASIACFLAANGADLSIRNKKGQSPLDLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MQDVGKVDAAWEPSKNTLIMGLGTQGAEKKSAASIACFLAANGADLSIRNKKGQSPLDLC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 PDPNLCKALAKCHKEKVSGQVGSRSPSMISNDSETLEECMVCSDMKRDTLFGPCGHIATC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PDPNLCKALAKCHKEKVSGQVGSRSPSMISNDSETLEECMVCSDMKRDTLFGPCGHIATC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 SLCSPRVKKCLICKEQVQSRTKIEECVVCSDKKAAVLFQPCGHMCACENCANLMKKCVQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLCSPRVKKCLICKEQVQSRTKIEECVVCSDKKAAVLFQPCGHMCACENCANLMKKCVQC
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB8 RAVVERRVPFIMCCGGKSSEDATDDISSGNIPVLQKDKDNTNVNADVQKLQQQLQDIKEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RAVVERRVPFIMCCGGKSSEDATDDISSGNIPVLQKDKDNTNVNADVQKLQQQLQDIKEQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KB8 TMCPVCLDRLKNMIFLCGHGTCQLCGDRMSECPICRKAIERRILLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TMCPVCLDRLKNMIFLCGHGTCQLCGDRMSECPICRKAIERRILLY
970 980 990 1000
>>CCDS53263.1 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1056 aa)
initn: 2320 init1: 627 opt: 1679 Z-score: 1092.7 bits: 213.8 E(32554): 1.5e-54
Smith-Waterman score: 2308; 38.5% identity (64.0% similar) in 1025 aa overlap (14-1006:112-1055)
10 20 30 40
pF1KB8 MSNSRNNRVMVEGVGARVVRGPDWKWGKQDGGEGHVGTVR---
:: ::::: :::::.:::::: ::::
CCDS53 LKAARRATGRPDRSRAAPPNMDPDPQAGVQVGMRVVRGVDWKWGQQDGGEGGVGTVVELG
90 100 110 120 130 140
50 60 70 80 90
pF1KB8 ---SFESPEEVVVV-WDNGTAANYRCS--GAYDLRILDSAPTGIKHDGTMCDTCRQQPII
: .:...::: ::.:: .::: . ::.:: . :.: :..: . .:: :... .
CCDS53 RHGSPSTPDRTVVVQWDQGTRTNYRAGYQGAHDLLLYDNAQIGVRHPNIICDCCKKHGLR
150 160 170 180 190 200
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 GIRWKCAECTNYDLCTVCYHGDKHHLRHRFYRITTPGSERVLLESRRKSKKITARGIFAG
:.:::: : .::::: :: .::.: : : : : :. : : :. .: :::: :
CCDS53 GMRWKCRVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLPRIPLRGIFQG
210 220 230 240 250 260
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 ARVVRGVDWQWEDQDGGNGRRGKVTEIQDWSASSPHSAAYVLWDNGAKNLYRVGFEGMSD
:.:::: ::.: .::::.:. :.:..:. :.. . .:.: : : .:. :.:::: .: :
CCDS53 AKVVRGPDWEWGSQDGGEGKPGRVVDIRGWDVETGRSVASVTWADGTTNVYRVGHKGKVD
270 280 290 300 310 320
220 230 240 250 260
pF1KB8 LKCVQDAKGGSFYRDHCPVLGEQ-------NGNRNPGGLQIGDLVNIDLDLEIVQSLQHG
:::: .: :: .:.:: : ::. ... .: .: :: :. :: .... .:.:
CCDS53 LKCVGEAAGGFYYKDHLPRLGKPAELQRRVSADSQP--FQHGDKVKCLLDTDVLREMQEG
330 340 350 360 370
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 HGGWTDGMFETLTTTGTVCGIDEDHDIVVQYPSGNRWTFNPAVLTKANIVRSGDAAQGAE
::::. : : . :::: : . :. ::. .::::.:..::: .
CCDS53 HGGWNPRMAEFIGQTGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHH------------
380 390 400 410 420
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 GGTSQFQVGDLVQVCYDLERIKLLQRGHGEWAEAMLPTLGKVGRVQQIYSDSDLKVEVCG
.: :::.:.: ::. .: :: :::::.. : :.::.::.: ....:..:.: : :
CCDS53 ----SFWVGDVVRVIGDLDTVKRLQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAG
430 440 450 460 470 480
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 TSWTYNPA---AVSKVASAGSAISNASGERLSQL---LKKLFETQESGDLNEELVKAAAN
::..:. : .:. ... . : :.: : :: . . . .:: .:
CCDS53 QRWTFSPSCLVAYRPEEDANLDVAERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVAL
490 500 510 520 530 540
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 GDVAKVEDLLKRPDVDVNGQCAGHTAMQAASQNGHVDILKLLLKQNVDVEAEDKDGDRAV
:..:.. :::.: .:. . :.::.:.:. :.:....:::. . :. : .:. :.
CCDS53 GNAARALDLLRRRPEQVDTKNQGRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTAL
550 560 570 580 590 600
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 HHAAFGDEGAVIEVLHRGSADLNARNKRRQTPLHIAVNKGHLQVVKTLLDFGCHPSLQDS
:.::.:.. . .:: .. .: :. ..: ::.::..: :.::..: . :: .: :.
CCDS53 HYAALGNQPEATRVLLSAGCRADAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDA
610 620 630 640 650 660
570 580 590 600 610
pF1KB8 EGDTPLHDAISKKR--DDILAVLLEA-GADVTITNNNGFNALHHAALRGNPSAMRVLLSK
..:::::.::: . :. :: :. . ::: ::..::. ::::.:.:. :.: .:..
CCDS53 HSDTPLHSAISAGTGASGIVEVLTEVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILAR
670 680 690 700 710 720
620 630 640 650 660 670
pF1KB8 LPRPWIVDEKKDDGYTALHLAALNNHVEVAELLVHQGNANLDIQNVNQQTALHLAVERQH
. .:: ::.::.::::::::::: :::..:...: .....: . :. :::::.. :
CCDS53 ARQ--LVDAKKEDGFTALHLAALNNHREVAQILIREGRCDVNVRNRKLQSPLHLAVQQAH
730 740 750 760 770 780
680 690 700 710 720 730
pF1KB8 TQIVRLLVRAGAKLDIQDKDGDTPLHEALRHHTLSQLRQLQDMQDVGKVDAAWEPSKNTL
. .: ::: :: ... .:..::: :: ::..: : : . : :. .:. :
CCDS53 VGLVPLLVDAGCSVNAEDEEGDTALHVALQRHQLLPL--VAD-------GAGGDPGPLQL
790 800 810 820 830
740 750 760 770 780 790
pF1KB8 IMGLGTQG----AEKKSAASIACFLAANGADLSIRNKKGQSPLDLCPDPNLCKALAKC--
. : ..: :: .:..::::: .:::.: :..:.::::: . . ::: :
CCDS53 LSRLQASGLPGSAELTVGAAVACFLALEGADVSYTNHRGRSPLDLAAEGRVLKALQGCAQ
840 850 860 870 880 890
800 810 820 830 840 850
pF1KB8 -HKEKVSGQVGSRSPSMISNDSETLEECMVCSDMKRDTLFGPCGHIATCSLCSPRVKKCL
.:. .: :. .:. .:: . .... . ::
CCDS53 RFRERQAG--GGAAPG----PRQTLGTPNTVTNLHVGAAPGP------------------
900 910 920
860 870 880 890 900 910
pF1KB8 ICKEQVQSRTKIEECVVCSDKKAAVLFQPCGHMCACENCANLMKKCVQCRAVVERRVPFI
. ::.:::. :::.:: : .::.:: ::::..:..:: ...
CCDS53 ----------EAAECLVCSELALLVLFSPCQHRTVCEECARRMKKCIRCQVVVSKKL---
930 940 950 960 970
920 930 940 950 960 970
pF1KB8 MCCGGKSSEDATDDISSGNIPVLQKDKDNTNVNADVQKLQQQLQDIKEQTMCPVCLDRLK
:... :.. : .. :..::.. ....:. ::.:.:
CCDS53 -------RPDGSEVASAAPAPGPPRQL--------VEELQSRYRQMEERITCPICIDSHI
980 990 1000 1010 1020
980 990 1000
pF1KB8 NMIFLCGHGTCQLCGDRMSECPICRKAIERRILLY
..: ::::.: ::. .: :::::. :. :: ..
CCDS53 RLVFQCGHGACAPCGSALSACPICRQPIRDRIQIFV
1030 1040 1050
>>CCDS41224.2 MIB2 gene_id:142678|Hs108|chr1 (1070 aa)
initn: 2320 init1: 627 opt: 1679 Z-score: 1092.7 bits: 213.8 E(32554): 1.5e-54
Smith-Waterman score: 2308; 38.5% identity (64.0% similar) in 1025 aa overlap (14-1006:126-1069)
10 20 30 40
pF1KB8 MSNSRNNRVMVEGVGARVVRGPDWKWGKQDGGEGHVGTVR---
:: ::::: :::::.:::::: ::::
CCDS41 RAARPTMDPSAHRSRAAPPNMDPDPQAGVQVGMRVVRGVDWKWGQQDGGEGGVGTVVELG
100 110 120 130 140 150
50 60 70 80 90
pF1KB8 ---SFESPEEVVVV-WDNGTAANYRCS--GAYDLRILDSAPTGIKHDGTMCDTCRQQPII
: .:...::: ::.:: .::: . ::.:: . :.: :..: . .:: :... .
CCDS41 RHGSPSTPDRTVVVQWDQGTRTNYRAGYQGAHDLLLYDNAQIGVRHPNIICDCCKKHGLR
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KB8 GIRWKCAECTNYDLCTVCYHGDKHHLRHRFYRITTPGSERVLLESRRKSKKITARGIFAG
:.:::: : .::::: :: .::.: : : : : :. : : :. .: :::: :
CCDS41 GMRWKCRVCLDYDLCTQCYMHNKHELAHAFDRYETAHSRPVTLSPRQGLPRIPLRGIFQG
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 ARVVRGVDWQWEDQDGGNGRRGKVTEIQDWSASSPHSAAYVLWDNGAKNLYRVGFEGMSD
:.:::: ::.: .::::.:. :.:..:. :.. . .:.: : : .:. :.:::: .: :
CCDS41 AKVVRGPDWEWGSQDGGEGKPGRVVDIRGWDVETGRSVASVTWADGTTNVYRVGHKGKVD
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260
pF1KB8 LKCVQDAKGGSFYRDHCPVLGEQ-------NGNRNPGGLQIGDLVNIDLDLEIVQSLQHG
:::: .: :: .:.:: : ::. ... .: .: :: :. :: .... .:.:
CCDS41 LKCVGEAAGGFYYKDHLPRLGKPAELQRRVSADSQP--FQHGDKVKCLLDTDVLREMQEG
340 350 360 370 380 390
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 HGGWTDGMFETLTTTGTVCGIDEDHDIVVQYPSGNRWTFNPAVLTKANIVRSGDAAQGAE
::::. : : . :::: : . :. ::. .::::.:..::: .
CCDS41 HGGWNPRMAEFIGQTGTVHRITDRGDVRVQFNHETRWTFHPGALTKHH------------
400 410 420 430 440
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 GGTSQFQVGDLVQVCYDLERIKLLQRGHGEWAEAMLPTLGKVGRVQQIYSDSDLKVEVCG
.: :::.:.: ::. .: :: :::::.. : :.::.::.: ....:..:.: : :
CCDS41 ----SFWVGDVVRVIGDLDTVKRLQAGHGEWTDDMAPALGRVGKVVKVFGDGNLRVAVAG
450 460 470 480 490
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 TSWTYNPA---AVSKVASAGSAISNASGERLSQL---LKKLFETQESGDLNEELVKAAAN
::..:. : .:. ... . : :.: : :: . . . .:: .:
CCDS41 QRWTFSPSCLVAYRPEEDANLDVAERARENKSSLSVALDKLRAQKSDPEHPGRLVVEVAL
500 510 520 530 540 550
450 460 470 480 490 500
pF1KB8 GDVAKVEDLLKRPDVDVNGQCAGHTAMQAASQNGHVDILKLLLKQNVDVEAEDKDGDRAV
:..:.. :::.: .:. . :.::.:.:. :.:....:::. . :. : .:. :.
CCDS41 GNAARALDLLRRRPEQVDTKNQGRTALQVAAYLGQVELIRLLLQARAGVDLPDDEGNTAL
560 570 580 590 600 610
510 520 530 540 550 560
pF1KB8 HHAAFGDEGAVIEVLHRGSADLNARNKRRQTPLHIAVNKGHLQVVKTLLDFGCHPSLQDS
:.::.:.. . .:: .. .: :. ..: ::.::..: :.::..: . :: .: :.
CCDS41 HYAALGNQPEATRVLLSAGCRADAINSTQSTALHVAVQRGFLEVVRALCERGCDVNLPDA
620 630 640 650 660 670
570 580 590 600 610
pF1KB8 EGDTPLHDAISKKR--DDILAVLLEA-GADVTITNNNGFNALHHAALRGNPSAMRVLLSK
..:::::.::: . :. :: :. . ::: ::..::. ::::.:.:. :.: .:..
CCDS41 HSDTPLHSAISAGTGASGIVEVLTEVPNIDVTATNSQGFTLLHHASLKGHALAVRKILAR
680 690 700 710 720 730
620 630 640 650 660 670
pF1KB8 LPRPWIVDEKKDDGYTALHLAALNNHVEVAELLVHQGNANLDIQNVNQQTALHLAVERQH
. .:: ::.::.::::::::::: :::..:...: .....: . :. :::::.. :
CCDS41 ARQ--LVDAKKEDGFTALHLAALNNHREVAQILIREGRCDVNVRNRKLQSPLHLAVQQAH
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 05:44:16 2016 done: Sun Nov 6 05:44:16 2016
Total Scan time: 4.430 Total Display time: 0.340
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]