Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8543
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8543, 980 aa
1>>>pF1KB8543 980 - 980 aa - 980 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0844+/-0.000764; mu= 14.3206+/- 0.046
mean_var=133.8595+/-26.930, 0's: 0 Z-trim(112.9): 57 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.110854
statistics sampled from 13525 (13582) to 13525 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.417), width: 16
Scan time: 4.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 ( 980) 6513 1053.5 0
CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 ( 806) 1045 178.9 3.5e-44
CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 ( 893) 930 160.6 1.3e-38
CCDS5627.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1283) 849 147.7 1.4e-34
CCDS58062.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 667) 798 139.4 2.4e-32
CCDS1542.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 750) 798 139.4 2.6e-32
CCDS58063.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 765) 798 139.4 2.6e-32
CCDS1541.1 NVL gene_id:4931|Hs108|chr1 ( 856) 798 139.5 2.9e-32
CCDS64710.1 PEX1 gene_id:5189|Hs108|chr7 (1226) 784 137.3 1.8e-31
CCDS56043.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 398) 627 111.9 2.7e-24
CCDS11645.1 PSMC5 gene_id:5705|Hs108|chr17 ( 406) 627 111.9 2.7e-24
CCDS11859.1 AFG3L2 gene_id:10939|Hs108|chr18 ( 797) 590 106.2 2.8e-22
CCDS81837.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 367) 576 103.7 7.2e-22
CCDS32139.1 PSMC1 gene_id:5700|Hs108|chr14 ( 440) 576 103.7 8.3e-22
CCDS7935.1 PSMC3 gene_id:5702|Hs108|chr11 ( 439) 573 103.3 1.2e-21
CCDS5217.1 KATNA1 gene_id:11104|Hs108|chr6 ( 491) 550 99.6 1.6e-20
CCDS5731.1 PSMC2 gene_id:5701|Hs108|chr7 ( 433) 549 99.4 1.6e-20
CCDS46076.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 387) 542 98.3 3.2e-20
CCDS12547.1 PSMC4 gene_id:5704|Hs108|chr19 ( 418) 542 98.3 3.4e-20
CCDS10977.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 795) 543 98.6 5.1e-20
CCDS31956.1 KATNAL1 gene_id:84056|Hs108|chr13 ( 490) 539 97.9 5.4e-20
CCDS6343.1 ATAD2 gene_id:29028|Hs108|chr8 (1390) 545 99.1 6.3e-20
CCDS9710.2 PSMC6 gene_id:5706|Hs108|chr14 ( 403) 536 97.3 6.5e-20
CCDS46227.1 ATAD2B gene_id:54454|Hs108|chr2 (1458) 529 96.6 3.9e-19
CCDS32828.1 KATNAL2 gene_id:83473|Hs108|chr18 ( 466) 506 92.6 2e-18
CCDS58072.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 683) 502 92.0 4.3e-18
CCDS7151.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 716) 502 92.1 4.4e-18
CCDS7152.1 YME1L1 gene_id:10730|Hs108|chr10 ( 773) 502 92.1 4.7e-18
CCDS1779.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 584) 473 87.4 9.4e-17
CCDS1778.1 SPAST gene_id:6683|Hs108|chr2 ( 616) 473 87.4 9.8e-17
CCDS5510.1 FIGNL1 gene_id:63979|Hs108|chr7 ( 674) 465 86.1 2.6e-16
CCDS45517.1 VPS4A gene_id:27183|Hs108|chr16 ( 437) 438 81.7 3.6e-15
CCDS10123.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 753) 438 81.8 5.5e-15
CCDS11983.1 VPS4B gene_id:9525|Hs108|chr18 ( 444) 433 80.9 6.4e-15
CCDS81877.1 SPATA5L1 gene_id:79029|Hs108|chr15 ( 620) 429 80.3 1.3e-14
CCDS7386.1 ATAD1 gene_id:84896|Hs108|chr10 ( 361) 402 75.9 1.7e-13
CCDS10978.1 SPG7 gene_id:6687|Hs108|chr16 ( 489) 376 71.8 3.8e-12
CCDS42354.1 NSF gene_id:4905|Hs108|chr17 ( 744) 378 72.2 4.3e-12
CCDS2221.2 FIGN gene_id:55137|Hs108|chr2 ( 759) 360 69.4 3.2e-11
>>CCDS4877.1 PEX6 gene_id:5190|Hs108|chr6 (980 aa)
initn: 6513 init1: 6513 opt: 6513 Z-score: 5631.6 bits: 1053.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6513; 100.0% identity (100.0% similar) in 980 aa overlap (1-980:1-980)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MALAVLRVLEPFPTETPPLAVLLPPGGPWPAAELGLVLALRPAGESPAGPALLVAALEGP
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CCDS48 MALAVLRVLEPFPTETPPLAVLLPPGGPWPAAELGLVLALRPAGESPAGPALLVAALEGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 DAGTEEQGPGPPQLLVSRALLRLLALGSGAWVRARAVRRPPALGWALLGTSLGPGLGPRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DAGTEEQGPGPPQLLVSRALLRLLALGSGAWVRARAVRRPPALGWALLGTSLGPGLGPRV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GPLLVRRGETLPVPGPRVLETRPALQGLLGPGTRLAVTELRGRARLCPESGDSSRPPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GPLLVRRGETLPVPGPRVLETRPALQGLLGPGTRLAVTELRGRARLCPESGDSSRPPPPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VVSSFAVSGTVRRLQGVLGGTGDSLGVSRSCLRGLGLFQGEWVWVAQARESSNTSQPHLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VVSSFAVSGTVRRLQGVLGGTGDSLGVSRSCLRGLGLFQGEWVWVAQARESSNTSQPHLA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RVQVLEPRWDLSDRLGPGSGPLGEPLADGLALVPATLAFNLGCDPLEMGELRIQRYLEGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RVQVLEPRWDLSDRLGPGSGPLGEPLADGLALVPATLAFNLGCDPLEMGELRIQRYLEGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IAPEDKGSCSLLPGPPFARELHIEIVSSPHYSTNGNYDGVLYRHFQIPRVVQEGDVLCVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IAPEDKGSCSLLPGPPFARELHIEIVSSPHYSTNGNYDGVLYRHFQIPRVVQEGDVLCVP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 TIGQVEILEGSPEKLPRWREMFFKVKKTVGEAPDGPASAYLADTTHTSLYMVGSTLSPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TIGQVEILEGSPEKLPRWREMFFKVKKTVGEAPDGPASAYLADTTHTSLYMVGSTLSPVP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 WLPSEESTLWSSLSPPGLEALVSELCAVLKPRLQPGGALLTGTSSVLLRGPPGCGKTTVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 WLPSEESTLWSSLSPPGLEALVSELCAVLKPRLQPGGALLTGTSSVLLRGPPGCGKTTVV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 AAACSHLGLHLLKVPCSSLCAESSGAVETKLQAIFSRARRCRPAVLLLTAVDLLGRDRDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AAACSHLGLHLLKVPCSSLCAESSGAVETKLQAIFSRARRCRPAVLLLTAVDLLGRDRDG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LGEDARVMAVLRHLLLNEDPLNSCPPLMVVATTSRAQDLPADVQTAFPHELEVPALSEGQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RLSILRALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLYALLTHSSRAACTRIKNSGLAGGLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RLSILRALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLYALLTHSSRAACTRIKNSGLAGGLT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 EEDEGELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEILET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EEDEGELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEILET
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 IQLPLEHPELLSLGLRRSGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IQLPLEHPELLSLGLRRSGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVGQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 SEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 DVFVIGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVGANEDRASQLRVLSAITRKFKLEPSVSLVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 DVFVIGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVGANEDRASQLRVLSAITRKFKLEPSVSLVN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB8 VLDCCPPQLTGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMEDLLQAAARLQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VLDCCPPQLTGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMEDLLQAAARLQP
910 920 930 940 950 960
970 980
pF1KB8 SVSEQELLRYKRIQRKFAAC
::::::::::::::::::::
CCDS48 SVSEQELLRYKRIQRKFAAC
970 980
>>CCDS6573.1 VCP gene_id:7415|Hs108|chr9 (806 aa)
initn: 374 init1: 374 opt: 1045 Z-score: 906.7 bits: 178.9 E(32554): 3.5e-44
Smith-Waterman score: 1046; 31.7% identity (61.1% similar) in 704 aa overlap (290-972:81-744)
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 GPLGEPLADGLALVPATLAFNLGCDPLEMGELRIQRYLEGSIAPEDKGSCSLLPGPP--F
..:..: ..... . :. : : .
CCDS65 LFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKY
60 70 80 90 100 110
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 ARELHIEIVSSPHYSTNGN-YDGVLYRHF-QIPRVVQEGDVLCVPTIGQVEILEGSPEKL
....:. ... . .:: .. : .: . : ...::.. : .:.
CCDS65 GKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLV---------RGG----
120 130 140 150
380 390 400 410 420 430
pF1KB8 PRWREMFFKVKKTVGEAPDGPASAYLADTTHTSLYMVGSTLSPVPWLPSEESTLWSSLSP
: . ::: .: : : : . : .. : :. ::: . .
CCDS65 --MRAVEFKVVET------DP-SPYCIVAPDTVIHCEGE---PIKREDEEESLNEVGYDD
160 170 180 190 200
440 450 460 470 480
pF1KB8 PG----LEALVSELCAVLKPRLQPGGALLTGTS---SVLLRGPPGCGKTTVVAAACSHLG
: : ..:. . : .:. :.. ..:: :::: ::: .. :. .. :
CCDS65 IGGCRKQLAQIKEMVEL--PLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETG
210 220 230 240 250 260
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 LHLLKVPCSSLCAESSGAVETKLQAIFSRARRCRPAVLLLTAVDLLGRDRDGL-GEDARV
.. . . .. .: :..:. : .:.. ::.... .: .. :. :: :
CCDS65 AFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVER-
270 280 290 300 310 320
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 MAVLRHLLLNEDPLNSCPPLMVVATTSRAQDL-PADVQTA-FPHELEVPALSEGQRLSIL
.. .:: : :.. ..:.:.:.: ... :: . . : .:... . :: ::
CCDS65 -RIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEIL
330 340 350 360 370 380
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 RALTAHLPLGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLYALLTHSSRAACTRIKNSGLAGGLTEEDEG
. : .. :...:.: :.: . : : .:: :: :.:: :... : .:
CCDS65 QIHTKNMKLADDVDLEQVANETHGHVGADLAAL---CSEAALQAIRKKMDLIDLEDETID
390 400 410 420 430
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 ELCAAGFPLLAEDFGQALEQLQ-TAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEILETIQLP
.. . .:: :: : . .: ..: ..:.:.:.:.:::..::.:. : .: :
CCDS65 AEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETV--VEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYP
440 450 460 470 480 490
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 LEHPE-LLSLGLRRS-GLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVGQSE
.:::. .:..:. : :.:..:::: ::::::::.:.::. .:.:.:::::..:. :.::
CCDS65 VEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESE
500 510 520 530 540 550
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 ENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRS-GDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQD
::::.: .:: ::::..:::::::.: .:: . ::.::. :::..:.:.:.::. . ..
CCDS65 ANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKN
560 570 580 590 600 610
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 VFVIGATNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVGANEDRASQLRVLSAITRKFKLEPSVSLVNV
::.::::::::..:::.:::::.:.:... :. :.. .:.: :: . .:.: .
CCDS65 VFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPL-PDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDL-EF
620 630 640 650 660 670
910 920 930 940 950
pF1KB8 LDCCPPQLTGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDL---EEGLEPGSSALMLTMEDLLQAAARL
: ..:::: .:. : :... ... :. . . ::. . .: . :
CCDS65 LAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAMEVEEDDPVPEIRRD
680 690 700 710 720 730
960 970 980
pF1KB8 QPSVSEQELLRYKRIQRKFAAC
. .: .:. :
CCDS65 H----FEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGG
740 750 760 770 780 790
>>CCDS3730.1 SPATA5 gene_id:166378|Hs108|chr4 (893 aa)
initn: 884 init1: 536 opt: 930 Z-score: 806.7 bits: 160.6 E(32554): 1.3e-38
Smith-Waterman score: 936; 34.5% identity (65.9% similar) in 519 aa overlap (466-976:390-887)
440 450 460 470 480 490
pF1KB8 PGLEALVSELCAVLKPRLQPGGALLTGTSSVLLRGPPGCGKTTVVAAACSHLGLHLLKVP
::: :::: ::: .. :. ...: .. .
CCDS37 SQLKAIREIIELPLKQPELFKSYGIPAPRGVLLYGPPGTGKTMIARAVANEVGAYVSVIN
360 370 380 390 400 410
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 CSSLCAESSGAVETKLQAIFSRARRCRPAVLLLTAVDLLGRDRDGLGEDA--RVMAVLRH
. .. : .:.::. ::..: .:..... .: : :.: ... ::.: :
CCDS37 GPEIISKFYGETEAKLRQIFAEATLRHPSIIFIDELDALCPKREGAQNEVEKRVVASLLT
420 430 440 450 460 470
560 570 580 590 600 610
pF1KB8 LLLNEDPLNSCPPLMVVATTSRAQDLPADVQTA--FPHELEVPALSEGQRLSILRALTAH
:. . : ..:...:.: . : : .. : .:.:. . . .::.::. : .
CCDS37 LMDGIGSEVSEGQVLVLGATNRPHALDAALRRPGRFDKEIEIGVPNAQDRLDILQKLLRR
480 490 500 510 520 530
620 630 640 650 660 670
pF1KB8 LP-LGQEVNLAQLARRCAGFVVGDLYALLTHSSRAACTRIKNSGLAGGLTEEDEGELCAA
.: : :..: ::: :.: .:: .: .... : :: .. . . .. .:
CCDS37 VPHLLTEAELLQLANSAHGYVGADLKVLCNEAGLCALRRILKK-------QPNLPDVKVA
540 550 560 570 580 590
680 690 700 710 720
pF1KB8 GF-PLLAEDFGQALEQLQTAHSQAVGAPKIPSVSWHDVGGLQEVKKEILETIQLPLEHPE
:. . .:: ::..... . . . : .:.::: :.:::. .: .. .... ::.:::
CCDS37 GLVKITLKDFLQAMNDIRPSAMREI-AIDVPNVSWSDIGGLESIKLKLEQAVEWPLKHPE
600 610 620 630 640 650
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 -LLSLGLRR-SGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVGQSEENVRE
.. .:.. .:.::.:::: .::..:::.:.: .:.::..:::::.: :::.::. :::
CCDS37 SFIRMGIQPPKGVLLYGPPGCSKTMIAKALANESGLNFLAIKGPELMNKYVGESERAVRE
660 670 680 690 700 710
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 VFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGLHSTQDVFVIGA
.: .:::.:: ::::::::.:: :: : .:.: :::..:::.:.::... .:: ...:
CCDS37 TFRKARAVAPSIIFFDELDALAVERGSSLGAGNVADRVLAQLLTEMDGIEQLKDVTILAA
720 730 740 750 760 770
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 TNRPDLLDPALLRPGRFDKLVFVGANEDRASQLRVLSAITRKFKLEPSVSLVNVLDCCPP
::::: .: ::.::::.:....: : :.. .... ... . :.: . :
CCDS37 TNRPDRIDKALMRPGRIDRIIYVPL-PDAATRREIFKLQFHSMPVSNEVDL-DELILQTD
780 790 800 810 820
910 920 930 940 950 960
pF1KB8 QLTGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMEDLLQAAARLQPSVSEQEL
.::.. ..: .: :: :: .. : .. . . :: . . : . :.
CCDS37 AYSGAEIVAVCREAALLAL-------EEDIQ----ANLIMKRHFTQALSTVTPRIPESLR
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970 980
pF1KB8 LRYKRIQRKFAAC
:. :.:
CCDS37 RFYEDYQEKSGLHTL
880 890
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.: ....:: : : ::.:.. : :.. : :. .: :..: .. .. :..
CCDS56 AGLRNGALLLTGGKGSGKSTLAKAICKEAFDKLDAHVERVDCKALRGKRLENIQKTLEVA
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520 530 540 550 560
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::.: .:.:.:: .::.. . . :: : : : . .. .. .
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570 580 590 600 610
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..::.. :.: : :.. : .. . .. :: :: : . ..
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.: ..:.. .:::. :. .:. .:: .:.. .... :.: . : . :
CCDS56 DLQHVAKETGGFVARDFTVLV---DRAIHSRLSRQSIS---TREK--------LVLTTLD
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: .::. . : ..:. : ...: .:::.::.. ...::::: ..:::.. : .:
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:.:.::.::::::::::: ..: : ..:.:::::::.. :.: ::. ::..: ::.::
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:::.::::..:.:: ::. :. :: ::::.:::..:::... : :.:..::.::::.::
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860 870 880 890 900 910
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:::::::.:: :. :..:.:..:.... .. : .:.: .: . ..::::: .
CCDS56 ALLRPGRLDKCVYCPP-PDQVSRLEILNVLSDSLPLADDVDLQHVASVTD-SFTGADLKA
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: .:. ::. . : ::. :::.
CCDS56 LLYNAQLEALHGML--LSSGLQDGSSSSDSDLSLSSMVFLNHSSGSDDSAGDGECGLDQS
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: : ::. ..:...:.: ..: .. : : .:. . .:..: ::..:
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:. :: :: .: :. . .:: :: ..: . .
CCDS58 KGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGLLRDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPS-A
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. : .:.:.: :.:.:.....:. .: :...:. . .::: .:.:: :::: :
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pF1KB8 KTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINMYVGQSEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLA
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CCDS58 KTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNMYVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALC
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: : : :. :::.:::.:.:::.. :.::...::::::..:::.:::::.:: .:
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:: :: . :.... : :. .:.: . : : : ::::: .: .:
CCDS58 VGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDADVNLEAIAGDLRCDC---YTGADLSALVREASI
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pF1KB8 AALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMEDLLQAAARLQPSVSEQELLRYKRIQRKFAAC
::.... . : : : : .. . . .: ... :.:... . :.:.:....
CCDS58 CALRQEMARQKSGNEKGE--LKVSHKHFEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR
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CCDS15 CIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVA---QLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPDS
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:: ... : .:. :: . . :. :: ::
CCDS15 ALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGLL
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CCDS15 RDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPS-AKREGFVTVPNVTWADIGALEDIREELT
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pF1KB8 ETIQLPLEHPELL-SLGLRR-SGLLLHGPPGTGKTLLAKAVATECSLTFLSVKGPELINM
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pF1KB8 YVGQSEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGL
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CCDS15 YVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRR--SDRETGASVRVVNQLLTEMDGL
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.. :.::...::::::..:::.:::::.:: .::: :: . :.... : :.
CCDS15 EARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDA
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pF1KB8 SVSLVNV---LDC-CPPQLTGADLYSLCSDAMTAALKRRVHDLEEGLEPGSSALMLTMED
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CCDS15 DVNLEAIAGDLRCDC---YTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGE--LKVSHKH
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pF1KB8 LLQAAARLQPSVSEQELLRYKRIQRKFAAC
. .: ... :.:... . :.:.:....
CCDS15 FEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR
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CCDS58 DGEIEAVLQKKAKARGLEFQISNVKFEDVGGNDMTLKEVCKMLIHMRHPEVYHHLGVVPP
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CCDS58 RGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELFEQAVSNAP
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CCDS58 CIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVA---QLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPDS
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CCDS58 LDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFVGADLM
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:: ... : .:. :: . . :. :: ::
CCDS58 ALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGLL
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CCDS58 RDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPS-AKREGFVTVPNVTWADIGALEDIREELT
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CCDS58 MAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNM
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CCDS58 EARQQVFIMAATNRPDIIDPAILRPGRLDKTLFVGLPPPADRLAILKTITKNGTKPPLDA
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CCDS58 DVNLEAIAGDLRCDC---YTGADLSALVREASICALRQEMARQKSGNEKGE--LKVSHKH
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pF1KB8 LLQAAARLQPSVSEQELLRYKRIQRKFAAC
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CCDS58 FEEAFKKVRSSISKKDQIMYERLQESLSR
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CCDS15 RGVLLHGPPGCGKTLLAHAIAGELDLPILKVAAPEIVSGVSGESEQKLRELFEQAVSNAP
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CCDS15 CIIFIDEIDAITPKREVASKDMERRIVA---QLLTCMDDLNNVAATARVLVIGATNRPDS
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CCDS15 LDPALRRAGRFDREICLGIPDEASRERILQTLCRKLRLPQAFDFCHLAHLTPGFVGADLM
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CCDS15 ALCREAAMCAVNRVLMKLQEQQKKNPEMEDLPSKGVQEERLGTEPTSETQDELQRLLGLL
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CCDS15 RDQDPLSEEQMQGLCIELNDFIVALSSVQPS-AKREGFVTVPNVTWADIGALEDIREELT
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CCDS15 MAILAPVRNPDQFKALGLVTPAGVLLAGPPGCGKTLLAKAVANESGLNFISVKGPELLNM
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pF1KB8 YVGQSEENVREVFARARAAAPCIIFFDELDSLAPSRGRSGDSGGVMDRVVSQLLAELDGL
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CCDS15 YVGESERAVRQVFQRAKNSAPCVIFFDEVDALCPRR--SDRETGASVRVVNQLLTEMDGL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]