FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8536, 895 aa
1>>>pF1KB8536 895 - 895 aa - 895 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3171+/-0.000522; mu= 16.8448+/- 0.032
mean_var=106.3367+/-20.020, 0's: 0 Z-trim(110.1): 89 B-trim: 30 in 1/53
Lambda= 0.124375
statistics sampled from 18324 (18403) to 18324 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.558), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 11.230
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001120856 (OMIM: 607667,615616) catenin alpha-3 ( 895) 5681 1031.3 0
NP_037398 (OMIM: 607667,615616) catenin alpha-3 is ( 895) 5681 1031.3 0
XP_016871642 (OMIM: 607667,615616) PREDICTED: cate ( 907) 5681 1031.3 0
XP_016871640 (OMIM: 607667,615616) PREDICTED: cate ( 918) 4500 819.4 0
XP_016871643 (OMIM: 607667,615616) PREDICTED: cate ( 634) 4045 737.6 4.3e-212
XP_016871644 (OMIM: 607667,615616) PREDICTED: cate ( 634) 4045 737.6 4.3e-212
XP_016871645 (OMIM: 607667,615616) PREDICTED: cate ( 634) 4045 737.6 4.3e-212
NP_004380 (OMIM: 114025) catenin alpha-2 isoform 1 ( 905) 3592 656.5 1.7e-187
XP_016858892 (OMIM: 114025) PREDICTED: catenin alp ( 905) 3592 656.5 1.7e-187
NP_001269527 (OMIM: 114025) catenin alpha-2 isofor ( 939) 3592 656.5 1.7e-187
XP_016871641 (OMIM: 607667,615616) PREDICTED: cate ( 970) 3494 638.9 3.5e-182
NP_001310911 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 906) 3492 638.5 4.2e-182
NP_001894 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 is ( 906) 3492 638.5 4.2e-182
NP_001310913 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 906) 3492 638.5 4.2e-182
NP_001310912 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 906) 3492 638.5 4.2e-182
NP_001310914 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 897) 3429 627.2 1.1e-178
XP_016871646 (OMIM: 607667,615616) PREDICTED: cate ( 530) 3397 621.3 3.8e-177
XP_016858894 (OMIM: 114025) PREDICTED: catenin alp ( 876) 3214 588.6 4.3e-167
XP_016858893 (OMIM: 114025) PREDICTED: catenin alp ( 891) 3214 588.6 4.3e-167
XP_011530858 (OMIM: 114025) PREDICTED: catenin alp ( 953) 3214 588.7 4.6e-167
NP_001269526 (OMIM: 114025) catenin alpha-2 isofor ( 953) 3214 588.7 4.6e-167
XP_011530857 (OMIM: 114025) PREDICTED: catenin alp ( 953) 3214 588.7 4.6e-167
NP_001277238 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 803) 3164 579.6 2e-164
NP_001277236 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 841) 3145 576.2 2.2e-163
NP_001277239 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 783) 3105 569.0 3e-161
NP_001158355 (OMIM: 114025) catenin alpha-2 isofor ( 860) 2976 545.9 3e-154
NP_001269528 (OMIM: 114025) catenin alpha-2 isofor ( 584) 2374 437.8 7.3e-122
NP_001269529 (OMIM: 114025) catenin alpha-2 isofor ( 537) 2315 427.2 1.1e-118
NP_001310917 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001310929 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001310928 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001310926 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001310924 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001310925 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001310923 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001277241 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001310921 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001310922 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001310918 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001310927 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001310920 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001310916 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001310919 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 536) 2311 426.4 1.7e-118
NP_001278062 (OMIM: 607667,615616) catenin alpha-3 ( 388) 2187 404.1 6.7e-112
XP_016871647 (OMIM: 607667,615616) PREDICTED: cate ( 388) 2187 404.1 6.7e-112
NP_001310932 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 471) 1964 364.1 8.7e-100
NP_001310933 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 471) 1964 364.1 8.7e-100
NP_001310934 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 471) 1964 364.1 8.7e-100
NP_001310931 (OMIM: 116805,608970) catenin alpha-1 ( 471) 1964 364.1 8.7e-100
NP_001307739 (OMIM: 114025) catenin alpha-2 isofor ( 585) 1937 359.4 3e-98
>>NP_001120856 (OMIM: 607667,615616) catenin alpha-3 iso (895 aa)
initn: 5681 init1: 5681 opt: 5681 Z-score: 5513.1 bits: 1031.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5681; 100.0% identity (100.0% similar) in 895 aa overlap (1-895:1-895)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPLIIQVTTLVNCPQNPSSRKKGRSKRASVLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPLIIQVTTLVNCPQNPSSRKKGRSKRASVLLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SVEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEALKVSAERFTDDPCFLPKREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEALKVSAERFTDDPCFLPKREA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VVQAARALLAAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQRTFESLKNVANKSDLQKTYQKLGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVQAARALLAAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQRTFESLKNVANKSDLQKTYQKLGKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LENLDYLAFKRQQDLKSPNQRDEIAGARASLKENSPLLHSICSACLEHSDVASLKASKDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LENLDYLAFKRQQDLKSPNQRDEIAGARASLKENSPLLHSICSACLEHSDVASLKASKDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VCEEIQNALNVISNASQGIQNMTTPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTVTEEEIRPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VCEEIQNALNVISNASQGIQNMTTPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTVTEEEIRPSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAGKKERSNTLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAGKKERSNTLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 IALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEIKEYAAIFHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEIKEYAAIFHE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 HTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPKSQAVKNTME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPKSQAVKNTME
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 MYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDADNLDRAAGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDADNLDRAAGAI
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550 560 570 580 590 600
pF1KB8 RGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEALSKSSLNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEALSKSSLNV
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610 620 630 640 650 660
pF1KB8 LDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLEEEHEVRSHTSIQTEGKTDRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLEEEHEVRSHTSIQTEGKTDRA
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670 680 690 700 710 720
pF1KB8 KMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMIMMEMTDFTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMIMMEMTDFTR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 GKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAYLEQIKFYSHQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAYLEQIKFYSHQLK
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pF1KB8 ICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIASTKIIRIQSPAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIASTKIIRIQSPAG
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850 860 870 880 890
pF1KB8 PRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRGRQIY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRGRQIY
850 860 870 880 890
>>NP_037398 (OMIM: 607667,615616) catenin alpha-3 isofor (895 aa)
initn: 5681 init1: 5681 opt: 5681 Z-score: 5513.1 bits: 1031.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5681; 100.0% identity (100.0% similar) in 895 aa overlap (1-895:1-895)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPLIIQVTTLVNCPQNPSSRKKGRSKRASVLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPLIIQVTTLVNCPQNPSSRKKGRSKRASVLLA
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 SVEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEALKVSAERFTDDPCFLPKREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 SVEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEALKVSAERFTDDPCFLPKREA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 VVQAARALLAAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQRTFESLKNVANKSDLQKTYQKLGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 VVQAARALLAAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQRTFESLKNVANKSDLQKTYQKLGKE
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pF1KB8 LENLDYLAFKRQQDLKSPNQRDEIAGARASLKENSPLLHSICSACLEHSDVASLKASKDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 LENLDYLAFKRQQDLKSPNQRDEIAGARASLKENSPLLHSICSACLEHSDVASLKASKDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 VCEEIQNALNVISNASQGIQNMTTPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTVTEEEIRPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 VCEEIQNALNVISNASQGIQNMTTPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTVTEEEIRPSL
250 260 270 280 290 300
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pF1KB8 EKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAGKKERSNTLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 EKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAGKKERSNTLN
310 320 330 340 350 360
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pF1KB8 IALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEIKEYAAIFHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 IALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEIKEYAAIFHE
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pF1KB8 HTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPKSQAVKNTME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 HTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPKSQAVKNTME
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pF1KB8 MYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDADNLDRAAGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 MYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDADNLDRAAGAI
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pF1KB8 RGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEALSKSSLNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 RGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEALSKSSLNV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 LDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLEEEHEVRSHTSIQTEGKTDRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 LDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLEEEHEVRSHTSIQTEGKTDRA
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pF1KB8 KMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMIMMEMTDFTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 KMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMIMMEMTDFTR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 GKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAYLEQIKFYSHQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 GKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAYLEQIKFYSHQLK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 ICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIASTKIIRIQSPAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 ICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIASTKIIRIQSPAG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB8 PRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRGRQIY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 PRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRGRQIY
850 860 870 880 890
>>XP_016871642 (OMIM: 607667,615616) PREDICTED: catenin (907 aa)
initn: 5681 init1: 5681 opt: 5681 Z-score: 5513.0 bits: 1031.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5681; 100.0% identity (100.0% similar) in 895 aa overlap (1-895:13-907)
10 20 30 40
pF1KB8 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPLIIQVTTLVNCPQNPSSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKSTQRREKQGSMSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPLIIQVTTLVNCPQNPSSRK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB8 KGRSKRASVLLASVEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEALKVSAERF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KGRSKRASVLLASVEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEALKVSAERF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB8 TDDPCFLPKREAVVQAARALLAAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQRTFESLKNVANKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TDDPCFLPKREAVVQAARALLAAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQRTFESLKNVANKS
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170 180 190 200 210 220
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLQKTYQKLGKELENLDYLAFKRQQDLKSPNQRDEIAGARASLKENSPLLHSICSACLEH
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDVASLKASKDTVCEEIQNALNVISNASQGIQNMTTPPEPQAATLGSALDELENLIVLNP
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290 300 310 320 330 340
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LTVTEEEIRPSLEKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMN
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350 360 370 380 390 400
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NAGKKERSNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGRE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEIKEYAAIFHEHTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RPKSQAVKNTMEMYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DADNLDRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALEALSKSSLNVLDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLEEEHEVRSH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSIQTEGKTDRAKMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CMIMMEMTDFTRGKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LEQIKFYSHQLKICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIA
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XP_016 STKIIRIQSPAGPRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSE
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:::::::
XP_016 FRGRQIY
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Smith-Waterman score: 5625; 97.5% identity (97.5% similar) in 918 aa overlap (1-895:1-918)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPLIIQVTTLVNCPQNPSSRKKGRSKRASVLLA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SVEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEALKVSAERFTDDPCFLPKREA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VVQAARALLAAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQRTFESLKNVANKSDLQKTYQKLGKE
130 140 150 160 170 180
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XP_016 LENLDYLAFKRQQVNNSGLNTTFAFSRKNLPTPKASDLKSPNQRDEIAGARASLKENSPL
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220 230 240 250 260 270
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LHSICSACLEHSDVASLKASKDTVCEEIQNALNVISNASQGIQNMTTPPEPQAATLGSAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DELENLIVLNPLTVTEEEIRPSLEKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQ
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340 350 360 370 380 390
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALQDLLSEYMNNAGKKERSNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLL
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400 410 420 430 440 450
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLIEAAKNGREKEIKEYAAIFHEHTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCP
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460 470 480 490 500 510
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VNKCIIALRDQDADNLDRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTST
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VIPEFVTQVNVALEALSKSSLNVLDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DLEEEHEVRSHTSIQTEGKTDRAKMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SNDIIVLAKNMCMIMMEMTDFTRGKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DPSCKQDLLAYLEQIKFYSHQLKICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VVQTVKMSYIASTKIIRIQSPAGPRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAK
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880 890
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::::::::::::::::::
XP_016 KKIHPLQVMSEFRGRQIY
910
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::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTTPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEEEIRPSLEKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKERSNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEYAAIFHEHTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQAVKNTMEMYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDAD
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pF1KB8 NLDRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLDRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALSKSSLNVLDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLEEEHEVRSHTSI
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pF1KB8 QTEGKTDRAKMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QTEGKTDRAKMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMI
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pF1KB8 MMEMTDFTRGKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAYLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MMEMTDFTRGKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAYLEQ
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pF1KB8 IKFYSHQLKICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIASTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IKFYSHQLKICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIASTK
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pF1KB8 IIRIQSPAGPRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IIRIQSPAGPRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRG
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pF1KB8 RQIY
::::
XP_016 RQIY
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240 250 260 270 280 290
pF1KB8 ASLKASKDTVCEEIQNALNVISNASQGIQNMTTPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTV
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTTPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTV
10 20 30
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TEEEIRPSLEKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEEEIRPSLEKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAG
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pF1KB8 KKERSNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKERSNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEI
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pF1KB8 KEYAAIFHEHTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEYAAIFHEHTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPK
160 170 180 190 200 210
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 SQAVKNTMEMYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQAVKNTMEMYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDAD
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pF1KB8 NLDRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLDRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALSKSSLNVLDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLEEEHEVRSHTSI
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pF1KB8 QTEGKTDRAKMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QTEGKTDRAKMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMI
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pF1KB8 MMEMTDFTRGKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAYLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MMEMTDFTRGKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAYLEQ
460 470 480 490 500 510
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pF1KB8 IKFYSHQLKICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIASTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IKFYSHQLKICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIASTK
520 530 540 550 560 570
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pF1KB8 IIRIQSPAGPRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IIRIQSPAGPRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRG
580 590 600 610 620 630
pF1KB8 RQIY
::::
XP_016 RQIY
>>XP_016871645 (OMIM: 607667,615616) PREDICTED: catenin (634 aa)
initn: 4045 init1: 4045 opt: 4045 Z-score: 3928.7 bits: 737.6 E(85289): 4.3e-212
Smith-Waterman score: 4045; 100.0% identity (100.0% similar) in 634 aa overlap (262-895:1-634)
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 ASLKASKDTVCEEIQNALNVISNASQGIQNMTTPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTV
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MTTPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTV
10 20 30
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 TEEEIRPSLEKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TEEEIRPSLEKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAG
40 50 60 70 80 90
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 KKERSNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKERSNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEI
100 110 120 130 140 150
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KEYAAIFHEHTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEYAAIFHEHTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPK
160 170 180 190 200 210
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 SQAVKNTMEMYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SQAVKNTMEMYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDAD
220 230 240 250 260 270
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 NLDRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NLDRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALE
280 290 300 310 320 330
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 ALSKSSLNVLDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLEEEHEVRSHTSI
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XP_016 ALSKSSLNVLDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLEEEHEVRSHTSI
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895 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 15:28:39 2016 done: Sun Nov 6 15:28:40 2016
Total Scan time: 11.230 Total Display time: 0.250
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]