Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8536
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8536, 895 aa
1>>>pF1KB8536 895 - 895 aa - 895 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4564+/-0.00119; mu= 15.6184+/- 0.071
mean_var=92.1297+/-17.954, 0's: 0 Z-trim(103.1): 36 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.133621
statistics sampled from 7228 (7249) to 7228 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 4.170
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7269.1 CTNNA3 gene_id:29119|Hs108|chr10 ( 895) 5681 1106.3 0
CCDS42703.2 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 905) 3592 703.6 4.2e-202
CCDS34243.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 ( 906) 3492 684.3 2.7e-196
CCDS62944.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 953) 3214 630.7 3.8e-180
CCDS78064.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 ( 841) 3145 617.4 3.4e-176
CCDS54371.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 860) 2976 584.8 2.2e-166
CCDS62945.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 584) 2374 468.7 1.4e-131
CCDS74531.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 537) 2315 457.3 3.4e-128
CCDS75315.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 ( 536) 2311 456.5 5.8e-128
CCDS7340.1 VCL gene_id:7414|Hs108|chr10 (1066) 621 130.9 1.2e-29
CCDS69638.1 CTNNAL1 gene_id:8727|Hs108|chr9 ( 718) 520 111.3 6.4e-24
CCDS6775.1 CTNNAL1 gene_id:8727|Hs108|chr9 ( 734) 520 111.3 6.5e-24
CCDS7341.1 VCL gene_id:7414|Hs108|chr10 (1134) 385 85.4 6.4e-16
>>CCDS7269.1 CTNNA3 gene_id:29119|Hs108|chr10 (895 aa)
initn: 5681 init1: 5681 opt: 5681 Z-score: 5918.4 bits: 1106.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5681; 100.0% identity (100.0% similar) in 895 aa overlap (1-895:1-895)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPLIIQVTTLVNCPQNPSSRKKGRSKRASVLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPLIIQVTTLVNCPQNPSSRKKGRSKRASVLLA
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 SVEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEALKVSAERFTDDPCFLPKREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SVEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEALKVSAERFTDDPCFLPKREA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VVQAARALLAAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQRTFESLKNVANKSDLQKTYQKLGKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 LENLDYLAFKRQQDLKSPNQRDEIAGARASLKENSPLLHSICSACLEHSDVASLKASKDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LENLDYLAFKRQQDLKSPNQRDEIAGARASLKENSPLLHSICSACLEHSDVASLKASKDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VCEEIQNALNVISNASQGIQNMTTPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTVTEEEIRPSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 EKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAGKKERSNTLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAGKKERSNTLN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 IALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEIKEYAAIFHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEIKEYAAIFHE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 HTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPKSQAVKNTME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPKSQAVKNTME
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 MYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDADNLDRAAGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDADNLDRAAGAI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 RGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEALSKSSLNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEALSKSSLNV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 LDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLEEEHEVRSHTSIQTEGKTDRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLEEEHEVRSHTSIQTEGKTDRA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 KMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMIMMEMTDFTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMIMMEMTDFTR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 GKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAYLEQIKFYSHQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAYLEQIKFYSHQLK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 ICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIASTKIIRIQSPAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIASTKIIRIQSPAG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB8 PRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRGRQIY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRGRQIY
850 860 870 880 890
>>CCDS42703.2 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (905 aa)
initn: 3414 init1: 1646 opt: 3592 Z-score: 3741.9 bits: 703.6 E(32554): 4.2e-202
Smith-Waterman score: 3592; 61.0% identity (87.5% similar) in 902 aa overlap (2-890:3-900)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPLIIQVTTLVNCP-QNPSSRKKGRSKRASVL
:: .:: :. ::..:...:.:::.:::::. ::::::: ..::..::::::.: ::
CCDS42 MTSATSPIILKWDPKSLEIRTLTVERLLEPLVTQVTTLVNTSNKGPSGKKKGRSKKAHVL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LASVEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEALKVSAERFTDDPCFLPKR
::::.:: :.:.:::.::.:. ::.::.:..:.:::..:...... .:.:::: ::
CCDS42 AASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSSVKR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 EAVVQAARALLAAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQRTFESLKNVANKSDLQKTYQKLG
..:.::::::.::::::::::: ::: ::.:.. ....:..::..:..:: . ....:
CCDS42 GTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFKEFG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KELENLDYLAFKRQQDLKSPNQRDEIAGARASLKENSPLLHSICSACLEHSDVASLKASK
::. .:.:.: .:::.::.:. :::.:.::..::.:. .:.. .: :.: :::. .:..
CCDS42 KEMVKLNYVAARRQQELKDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAATRANR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 DTVCEEIQNALNVISNASQGIQNMTTPP-EPQAAT----LGSALDELENLIVLNPLTVTE
: : ...:.:. ::::.:. :.: : .. : :..::.:..: :.:.:.: .:
CCDS42 DYVFKQVQEAIAGISNAAQA----TSPTDEAKGHTGIGELAAALNEFDNKIILDPMTFSE
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 EEIRPSLEKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAGKK
..:::::.:::.:::::::.:::::::: .::::.:::::.::::::::::::::.:.:
CCDS42 ARFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMNNTGRK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 ERSNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEIKE
:... ::::.:.: :::::::::::::..::.:::::.:.:::::::::::.: :::.::
CCDS42 EKGDPLNIAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGNEKEVKE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 YAAIFHEHTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPKSQ
:: .:.::...::::::::::.:.::.:.:.:..::.....::::.:::::.:::::.:.
CCDS42 YAQVFREHANKLVEVANLACSISNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSK
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 AVKNTMEMYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDADNL
.....:...: ::....:::::::::::.::::.:::.:::::::::.:::.. :.:.:
CCDS42 VAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIALQEGDVDTL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 DRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEAL
::.::::::::::: ::...::..:: :.::: :.. ...:. ::.:.:. ::.::.:::
CCDS42 DRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEAL
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 SKSSLNVLDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLEEE-HEVRSHTSIQ
: . . ...:.:.: :. .:: ..::: .:.:::::::::: ::.:.: ..:::.::.:
CCDS42 SANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQ
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700
pF1KB8 TE------GKTDRAKMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAK
:: :.. :: :.:::. :: :::::: :.. :::::::. :::..::::::::
CCDS42 TEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAK
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB8 NMCMIMMEMTDFTRGKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLL
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CCDS42 QMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKLARAVADQCPDSACKQDLL
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KB8 AYLEQIKFYSHQLKICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSY
:::..: .: :::.:::.::::.::::::::.:.:::.::::::::::::::: ::: ::
CCDS42 AYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGLDSATSLIQAAKNLMNAVVLTVKASY
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830 840 850 860 870 880
pF1KB8 IASTKIIRIQSPAGPRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVM
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CCDS42 VASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQAL
840 850 860 870 880 890
890
pF1KB8 SEFRGRQIY
:::.
CCDS42 SEFKAMDSF
900
>>CCDS34243.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 (906 aa)
initn: 3379 init1: 1696 opt: 3492 Z-score: 3637.7 bits: 684.3 E(32554): 2.7e-196
Smith-Waterman score: 3492; 59.7% identity (87.5% similar) in 894 aa overlap (7-890:9-901)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPLIIQVTTLVNC-PQNPSSRKKGRSKRASV
:... ::..:...:..::.:::::. ::::::: ..::..:.::::.: :
CCDS34 MTAVHAGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGPSNKKRGRSKKAHV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LLASVEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEALKVSAERFTDDPCFLPK
: ::::.:: :.:.::.:::.:. ::.::.:..:.:::... .:..: .:.:::: :
CCDS34 LAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQGDLMKAAAGEFADDPCSSVK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 REAVVQAARALLAAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQRTFESLKNVANKSDLQKTYQKL
: .:.::::::.::::::::::: ::. :: .... . . .:.:..:..:: :. :
CCDS34 RGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVEDGILKLRNAGNEQDLGIQYKAL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 GKELENLDYLAFKRQQDLKSPNQRDEIAGARASLKENSPLLHSICSACLEHSDVASLKAS
:...:. .: ::::.::. ..::..:.::. :..: :.:.. .:::.: :::. ::.
CCDS34 KPEVDKLNIMAAKRQQELKDVGHRDQMAAARGILQKNVPILYTASQACLQHPDVAAYKAN
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KDTVCEEIQNALNVISNASQGI--QNMTTPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTVTEEE
.: . ...:.:.. ::::.:. .. . .. :. ::..... :...::. .::.
CCDS34 RDLIYKQLQQAVTGISNAAQATASDDASQHQGGGGGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEER
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 IRPSLEKRLEAIISGAALLADSSCTRDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAGKKER
.:::::.:::.:::::::.:::::::: .::::.:::::.::::::::::::.:::.:::
CCDS34 FRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKER
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB8 SNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEIKEYA
:..:: :.:.: :::::::::::::..::::::::.:.::::::::::::: :::.::::
CCDS34 SDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAKNGNEKEVKEYA
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 AIFHEHTSRLVEVANLACSMSTNEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPKSQAV
.:.::...:.::::::::.:.::.:.:.:...:..::.::::.:::::::::.:.:. .
CCDS34 QVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAALALAAKPQSKLA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 KNTMEMYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDADNLDR
...:...:. ::....:::.::::::::::::::::.:::::::::.:::...:.:.:::
CCDS34 QENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLDR
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 AAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEALSK
.::::::::::: :.::.:::.::::.::: :.. ...:..::.:.:. ::..:.::::.
CCDS34 TAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEALSS
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB8 SSLNVLDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLE-EEHEVRSHTSIQTE
. . .:.:.:.: :. .:: :.::: .:.::::::::.: ::.: :. .:::.::.:::
CCDS34 DPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEELDD-SDFETEDFDVRSRTSVQTE
610 620 630 640 650
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pF1KB8 ------GKTDRAKMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNM
:.. :: :.:::. .: :::::::.:.. :::::::. :::..::::::::.:
CCDS34 DDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQM
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB8 CMIMMEMTDFTRGKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAY
::::::::::::::::::.:.::: ::: :.:.::::: :.: ::..::: .::::::::
CCDS34 CMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLAY
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KB8 LEQIKFYSHQLKICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIA
:..: .: :::.:::.::::.:::::::..:..::. :::::::::::::::::: ::.:
CCDS34 LQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLIQAAKNLMNAVVQTVKASYVA
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KB8 STKIIRIQSPAGPRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSE
::: . :. :. :.: :.:::: ::::.:::: .:: . ..:.: ::...:.:..::
CCDS34 STKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQTKIKRASQKKHVNPVQALSE
840 850 860 870 880 890
890
pF1KB8 FRGRQIY
:.
CCDS34 FKAMDSI
900
>>CCDS62944.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (953 aa)
initn: 3549 init1: 1640 opt: 3214 Z-score: 3347.8 bits: 630.7 E(32554): 3.8e-180
Smith-Waterman score: 3408; 57.8% identity (82.9% similar) in 932 aa overlap (2-872:3-930)
10 20 30 40 50
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:: .:: :. ::..:...:.:::.:::::. ::::::: ..::..::::::.: ::
CCDS62 MTSATSPIILKWDPKSLEIRTLTVERLLEPLVTQVTTLVNTSNKGPSGKKKGRSKKAHVL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
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::::.:: :.:.:::.::.:. ::.::.:..:.:::..:...... .:.:::: ::
CCDS62 AASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSSVKR
70 80 90 100 110 120
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..:.::::::.::::::::::: ::: ::.:.. ....:..::..:..:: . ....:
CCDS62 GTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFKEFG
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180 190 200 210 220 230
pF1KB8 KELENLDYLAFKRQQDLKSPNQRDEIAGARASLKENSPLLHSICSACLEHSDVASLKASK
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CCDS62 KEMVKLNYVAARRQQELKDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAATRANR
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: : ...:.:. ::::.:. :.: : .. : :..::.:..: :.:.:.: .:
CCDS62 DYVFKQVQEAIAGISNAAQA----TSPTDEAKGHTGIGELAAALNEFDNKIILDPMTFSE
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..:::::.:::.:::::::.:::::::: .::::.:::::.::::::::::::::.:.:
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:... ::::.:.: :::::::::::::..::.:::::.:.:::::::::::.: :::.::
CCDS62 EKGDPLNIAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGNEKEVKE
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:: .:.::...::::::::::.:.::.:.:.:..::.....::::.:::::.:::::.:.
CCDS62 YAQVFREHANKLVEVANLACSISNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSK
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.....:...: ::....:::::::::::.::::.:::.:::::::::.:::.. :.:.:
CCDS62 VAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIALQEGDVDTL
480 490 500 510 520 530
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::.::::::::::: ::...::..:: :.::: :.. ...:. ::.:.:. ::.::.:::
CCDS62 DRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEAL
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: . . ...:.:.: :. .:: ..::: .:.:::::::::: ::.:.: ..:::.::.:
CCDS62 SANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQ
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pF1KB8 TE------GKTDRAKMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAK
:: :.. :: :.:::. :: :::::: :.. :::::::. :::..::::::::
CCDS62 TEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAK
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pF1KB8 NMCMIMMEMTDFTRGKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLL
.:::::::::::::::::::.:.::: ::: :.:.::::: ::: .:.:::: .::::::
CCDS62 QMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKLARAVADQCPDSACKQDLL
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770 780 790 800
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:::..: .: :::.:::.::::.::::::::.:.
CCDS62 AYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGTGVQSTFTTFYEVDCDVIDGGRASQL
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810 820 830
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CCDS62 STHLPTCAEGAPIGSGSSDSSMLDSATSLIQAAKNLMNAVVLTVKASYVASTKYQKVYGT
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840 850 860 870 880 890
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CCDS62 AAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF
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10 20 30 40 50
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...:...:. ::....:::.::::::::::::::::.:::::::::.:::...:.:.:::
CCDS78 QENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLDR
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pF1KB8 AAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEALSK
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CCDS78 TAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEALSS
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pF1KB8 SSLNVLDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELEDVSDLE-EEHEVRSHTSIQTE
. . .:.:.:.: :. .:: :.::: .:.::::::::.: ::.: :. .:::.::.:::
CCDS78 DPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEELDD-SDFETEDFDVRSRTSVQTE
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CCDS78 DDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQM
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::::::::::::::::::.:.::: ::: :.:.::::: :.: ::..::: .::::::::
CCDS78 CMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLAY
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pF1KB8 LEQIKFYSHQLKICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIA
:..: .: :::.:::.::::.:::::::..:. .. . .:. :
CCDS78 LQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGNCDTCGALQGLKGWPPPLCWPLTGWTAP
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CCDS78 CP
840
>>CCDS54371.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (860 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB8 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPLIIQVTTLVNCP-QNPSSRKKGRSKRASVL
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CCDS54 MTSATSPIILKWDPKSLEIRTLTVERLLEPLVTQVTTLVNTSNKGPSGKKKGRSKKAHVL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 LASVEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEALKVSAERFTDDPCFLPKR
::::.:: :.:.:::.::.:. ::.::.:..:.:::..:...... .:.:::: ::
CCDS54 AASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSSVKR
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CCDS54 GTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFKEFG
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pF1KB8 KELENLDYLAFKRQQDLKSPNQRDEIAGARASLKENSPLLHSICSACLEHSDVASLKASK
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CCDS54 KEMVKLNYVAARRQQELKDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAATRANR
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pF1KB8 DTVCEEIQNALNVISNASQGIQNMTTPP-EPQAAT----LGSALDELENLIVLNPLTVTE
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CCDS54 DYVFKQVQEAIAGISNAAQA----TSPTDEAKGHTGIGELAAALNEFDNKIILDPMTFSE
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CCDS54 ARFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMNNTGRK
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CCDS54 EKGDPLNIAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGNEKEVKE
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CCDS54 DRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEAL
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CCDS54 SANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQ
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pF1KB8 TE------GKTDRAKMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAK
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CCDS54 TEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAK
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pF1KB8 NMCMIMMEMTDFTRGKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLL
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CCDS54 QMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKLARAVADQ-----------
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pF1KB8 AYLEQIKFYSHQLKICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSY
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CCDS54 ----------------------------------LDSATSLIQAAKNLMNAVVLTVKASY
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pF1KB8 IASTKIIRIQSPAGPRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVM
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CCDS54 VASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQAL
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pF1KB8 SEFRGRQIY
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CCDS54 SEFKAMDSF
860
>>CCDS62945.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (584 aa)
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pF1KB8 RDLHRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAGKKERSNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKA
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CCDS62 GWRRPLQSVGKVCEKNMKTSEMHTMSGAQTGRKEKGDPLNIAIDKMTKKTRDLRRQLRKA
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 IIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKNGREKEIKEYAAIFHEHTSRLVEVANLACSMSTNED
..::.:::::.:.:::::::::::.: :::.:::: .:.::...::::::::::.:.::.
CCDS62 VMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSGNEKEVKEYAQVFREHANKLVEVANLACSISNNEE
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pF1KB8 GIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPKSQAVKNTMEMYKRTWENHIHVLTEAVDDI
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CCDS62 GVKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDI
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pF1KB8 TSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDADNLDRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEP
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CCDS62 TSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEA
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pF1KB8 GAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEALSKSSLNVLDDNQFVDISKKIYDTIHDI
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CCDS62 GVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDI
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CCDS62 RKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKI
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CCDS62 AEQVEIFHQEKSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVIN
370 380 390 400 410 420
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::: :.:.::::: ::: .:.:::: .:::::::::..: .: :::.:::.::::.::::
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::::.:.:::.::::::::::::::: ::: ::.:::: .. . :. ::: :.::::
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860 870 880 890
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::::.::::::: . ::::: ::.: :.:..:::.
CCDS62 EKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF
550 560 570 580
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CCDS74 LLVLIEAAKSGNEKEVKEYAQVFREHANKLVEVANLACSISNNEEGVKLVRMAATQIDSL
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:::.:::::.:::::.:......:...: ::....:::::::::::.::::.:::.:::
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::::::.:::.. :.:.:::.::::::::::: ::...::..:: :.::: :.. ...:.
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::.:.:. ::.::.:::: . . ...:.:.: :. .:: ..::: .:.::::::::::
CCDS74 ETVMPRFAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELED
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::. :::..::::::::.:::::::::::::::::::.:.::: ::: :.:.::::: :
CCDS74 AEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKL
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:: .:.:::: .:::::::::..: .: :::.:::.::::.::::::::.:.:::.::::
CCDS74 ARAVADQCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGLDSATSLI
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::::::::::: ::: ::.:::: .. . :. ::: :.:::: ::::.:::::::
CCDS74 QAAKNLMNAVVLTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQ
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pF1KB8 AAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRGRQIY
. ::::: ::.: :.:..:::.
CCDS74 TRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF
520 530
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340 350 360 370 380 390
pF1KB8 RQALQDLLSEYMNNAGKKERSNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKAIIDHVSDSFLDTTVP
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CCDS75 MTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVP
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::::::::::: :::.:::: .:.::...:.::::::::.:.::.:.:.:...:..::.:
CCDS75 LLVLIEAAKNGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEAL
40 50 60 70 80 90
460 470 480 490 500 510
pF1KB8 CPQIINAALALAARPKSQAVKNTMEMYKRTWENHIHVLTEAVDDITSIDDFLAVSESHIL
:::.:::::::::.:.:. ....:...:. ::....:::.::::::::::::::::.:::
CCDS75 CPQVINAALALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHIL
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pF1KB8 EDVNKCIIALRDQDADNLDRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMDSYEPGAYTEGVMRNVNFLT
::::::.:::...:.:.:::.::::::::::: :.::.:::.::::.::: :.. ...:.
CCDS75 EDVNKCVIALQEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLS
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pF1KB8 STVIPEFVTQVNVALEALSKSSLNVLDDNQFVDISKKIYDTIHDIRCSVMMIRTPEELED
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CCDS75 NTVMPRFTEQVEAAVEALSSDPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEELDD
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pF1KB8 VSDLE-EEHEVRSHTSIQTE------GKTDRAKMTQLPEAEKEKIAEQVADFKKVKSKLD
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CCDS75 -SDFETEDFDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLD
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pF1KB8 AEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMIMMEMTDFTRGKGPLKHTTDVIYAAKMISESGSRMDVL
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CCDS75 AEVSKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKL
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pF1KB8 ARQIANQCPDPSCKQDLLAYLEQIKFYSHQLKICSQVKAEIQNLGGELIMSALDSVTSLI
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CCDS75 GRTIADHCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLI
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pF1KB8 QAAKNLMNAVVQTVKMSYIASTKIIRIQSPAGPRHPVVMWRMKAPAKKPLIKREKPEETC
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CCDS75 QAAKNLMNAVVQTVKASYVASTKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQ
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pF1KB8 AAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRGRQIY
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CCDS75 TKIKRASQKKHVNPVQALSEFKAMDSI
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10 20 30 40
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CCDS73 AWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPS---ASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELC
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pF1KB8 KVSAERFTDDPC-FLPKREAVVQAARALL-----AAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQ
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CCDS73 AGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGSSPVAMQKAQQVSQGLDV--LTAKVENAA
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CCDS73 RKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDI
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pF1KB8 AGARASLKENSPLLHSICSACLEHSDVASLKASKDTVCEEIQNAL-NVISNASQGIQNMT
:: : : : .. : :... .. .. .. ... .:: :. ....... :
CCDS73 L---RSLGEISALTSKL--ADLRRQGKGDSPEAR-ALAKQVATALQNLQTKTNRAVAN--
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pF1KB8 TPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTVTEEEIRPSLEKRLEAIISGAALLADSSCTRDL
. : :. : . ... . : :: :: . : . ...... . ::.
CCDS73 SRPAKAAVHLEGKIEQAQRWID-NP-TVDD---RGVGQAAIRGLVAEGHRLAN--VMMGP
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.:. ..:.:. . : .: . . :.. .. .: :.. : ::. ....:. .
CCDS73 YRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLK---DLKARMQEAMTQ
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.::: : :::.:. .: :: .::. . : :: :..:...: .:. : ...:
CCDS73 EVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTA
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CCDS73 NKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLV
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CCDS73 DEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVEN
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: . :.: . :..:. : .: ..... .: .:. ..:.: . .: ..
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pF1KB8 HDIRCSVMMIRT--PEELEDVSDLEEEHEVRSHTSIQTEGKTDRAKMTQLPEAEKEKIAE
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CCDS73 AKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPP-PEEKDEEFPE
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pF1KB8 QVAD------FKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMIMMEMTDFTRGKGPLKHTT
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CCDS73 QKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA-
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CCDS73 -LIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATM
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: :.:
CCDS73 RWVRKTPWYQ
1060
895 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 15:28:38 2016 done: Sun Nov 6 15:28:38 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]