Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8516
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8516, 871 aa
1>>>pF1KB8516 871 - 871 aa - 871 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5674+/-0.000885; mu= 10.8413+/- 0.053
mean_var=122.4059+/-24.406, 0's: 0 Z-trim(109.5): 29 B-trim: 109 in 1/53
Lambda= 0.115924
statistics sampled from 10891 (10918) to 10891 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.335), width: 16
Scan time: 4.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9134.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 871) 5847 989.4 0
CCDS53829.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 837) 5460 924.7 0
CCDS53828.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 824) 3914 666.1 6.9e-191
CCDS53827.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 764) 2875 492.4 1.3e-138
CCDS9135.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 811) 2871 491.7 2.2e-138
CCDS45576.1 TRPV1 gene_id:7442|Hs108|chr17 ( 839) 2313 398.4 2.8e-110
CCDS32576.1 TRPV2 gene_id:51393|Hs108|chr17 ( 764) 1891 327.8 4.6e-89
CCDS5874.2 TRPV6 gene_id:55503|Hs108|chr7 ( 765) 561 105.4 4.2e-22
CCDS5875.1 TRPV5 gene_id:56302|Hs108|chr7 ( 729) 536 101.2 7.2e-21
CCDS11029.1 TRPV3 gene_id:162514|Hs108|chr17 ( 790) 520 98.5 5e-20
CCDS58500.1 TRPV3 gene_id:162514|Hs108|chr17 ( 791) 520 98.5 5e-20
>>CCDS9134.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 (871 aa)
initn: 5847 init1: 5847 opt: 5847 Z-score: 5287.3 bits: 989.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5847; 100.0% identity (100.0% similar) in 871 aa overlap (1-871:1-871)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MADSSEGPRAGPGEVAELPGDESGTPGGEAFPLSSLANLFEGEDGSLSPSPADASRPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 MADSSEGPRAGPGEVAELPGDESGTPGGEAFPLSSLANLFEGEDGSLSPSPADASRPAGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GDGRPNLRMKFQGAFRKGVPNPIDLLESTLYESSVVPGPKKAPMDSLFDYGTYRHHSSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 GDGRPNLRMKFQGAFRKGVPNPIDLLESTLYESSVVPGPKKAPMDSLFDYGTYRHHSSDN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 KRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 TDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRGQT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQPKDEGGYFYFGELPLSLAACTNQPHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 ALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQPKDEGGYFYFGELPLSLAACTNQPHI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 VNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 NLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 NLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LSSLDTCGEEASVLEILVYNSKIENRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 LSSLDTCGEEASVLEILVYNSKIENRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 AMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGEVITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKCPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 AMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGEVITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKCPGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 NSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFALVLGWMNALYFTRGLKLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 NSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFALVLGWMNALYFTRGLKLTG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 TYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCTVPTYPSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 TYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCTVPTYPSC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 RDSETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIALMGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 RDSETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIALMGE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 TVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 TVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 DEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVELNKNSNPDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 DEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVELNKNSNPDE
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KB8 VVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAPL
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 VVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAPL
850 860 870
>>CCDS53829.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 (837 aa)
initn: 5449 init1: 5449 opt: 5460 Z-score: 4937.7 bits: 924.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5540; 96.1% identity (96.1% similar) in 871 aa overlap (1-871:1-837)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MADSSEGPRAGPGEVAELPGDESGTPGGEAFPLSSLANLFEGEDGSLSPSPADASRPAGP
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MADSSEGPRAGPGEVAELPGDESGTPG---------------------------------
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GDGRPNLRMKFQGAFRKGVPNPIDLLESTLYESSVVPGPKKAPMDSLFDYGTYRHHSSDN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 -DGRPNLRMKFQGAFRKGVPNPIDLLESTLYESSVVPGPKKAPMDSLFDYGTYRHHSSDN
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRL
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRGQT
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQPKDEGGYFYFGELPLSLAACTNQPHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQPKDEGGYFYFGELPLSLAACTNQPHI
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDS
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 NLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYD
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LSSLDTCGEEASVLEILVYNSKIENRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LSSLDTCGEEASVLEILVYNSKIENRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLC
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 AMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGEVITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKCPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGEVITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKCPGV
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 NSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFALVLGWMNALYFTRGLKLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFALVLGWMNALYFTRGLKLTG
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 TYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCTVPTYPSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCTVPTYPSC
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 RDSETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIALMGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RDSETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIALMGE
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 TVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRV
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 DEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVELNKNSNPDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVELNKNSNPDE
750 760 770 780 790 800
850 860 870
pF1KB8 VVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAPL
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAPL
810 820 830
>>CCDS53828.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 (824 aa)
initn: 3914 init1: 3914 opt: 3914 Z-score: 3540.5 bits: 666.1 E(32554): 6.9e-191
Smith-Waterman score: 5417; 94.6% identity (94.6% similar) in 871 aa overlap (1-871:1-824)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MADSSEGPRAGPGEVAELPGDESGTPGGEAFPLSSLANLFEGEDGSLSPSPADASRPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MADSSEGPRAGPGEVAELPGDESGTPGGEAFPLSSLANLFEGEDGSLSPSPADASRPAGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GDGRPNLRMKFQGAFRKGVPNPIDLLESTLYESSVVPGPKKAPMDSLFDYGTYRHHSSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GDGRPNLRMKFQGAFRKGVPNPIDLLESTLYESSVVPGPKKAPMDSLFDYGTYRHHSSDN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRG--
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQPKDEGGYFYFGELPLSLAACTNQPHI
:::::::::::::::
CCDS53 ---------------------------------------------ELPLSLAACTNQPHI
240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDS
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 NLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYD
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LSSLDTCGEEASVLEILVYNSKIENRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LSSLDTCGEEASVLEILVYNSKIENRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLC
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 AMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGEVITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKCPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AMVIFTLTAYYQPLEGTPPYPYRTTVDYLRLAGEVITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKCPGV
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 NSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFALVLGWMNALYFTRGLKLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFALVLGWMNALYFTRGLKLTG
500 510 520 530 540 550
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 TYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCTVPTYPSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCTVPTYPSC
560 570 580 590 600 610
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 RDSETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIALMGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RDSETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIALMGE
620 630 640 650 660 670
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 TVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRV
680 690 700 710 720 730
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 DEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVELNKNSNPDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVELNKNSNPDE
740 750 760 770 780 790
850 860 870
pF1KB8 VVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAPL
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAPL
800 810 820
>>CCDS53827.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 (764 aa)
initn: 4500 init1: 2871 opt: 2875 Z-score: 2601.9 bits: 492.4 E(32554): 1.3e-138
Smith-Waterman score: 4894; 87.7% identity (87.7% similar) in 871 aa overlap (1-871:1-764)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MADSSEGPRAGPGEVAELPGDESGTPGGEAFPLSSLANLFEGEDGSLSPSPADASRPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MADSSEGPRAGPGEVAELPGDESGTPGGEAFPLSSLANLFEGEDGSLSPSPADASRPAGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 GDGRPNLRMKFQGAFRKGVPNPIDLLESTLYESSVVPGPKKAPMDSLFDYGTYRHHSSDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GDGRPNLRMKFQGAFRKGVPNPIDLLESTLYESSVVPGPKKAPMDSLFDYGTYRHHSSDN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 KRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRG--
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ALHIAIERRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQPKDEGGYFYFGELPLSLAACTNQPHI
:::::::::::::::
CCDS53 ---------------------------------------------ELPLSLAACTNQPHI
240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 VNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 VNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDS
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 NLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYD
::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIG------------------------------------
320 330
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NSLFIDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFALVLGWMNALYFTRGLKLTG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCTVPTYPSC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRV
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CCDS53 VVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAPL
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CCDS91 KRWRKKIIEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRL
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CCDS91 TDEEFREPSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRGQT
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CCDS91 VVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAPL
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::..:: :: ::.:::.::..: :::::: ::.::: .:.: :::.::.::..: ..
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.:..:. . : ::.:::::::::::: : ::: .::::.: :.: ::. ::
CCDS45 KELVNASYTDSYYKGQTALHIAIERRNMALVTLLVENGADVQAAAHGDFFKKTKGRPGFY
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:::::::::::::: ::..: .: . ::. .:: ::::::::: .:::: .::::::
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.::. .:. :.: : .:: . :. :..:: .:: :::::.. .:..::. . . ::::
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::: .::::::.::::::: .::: :. ::::...:.: . :::.:: :::.:.::.::
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: .: ::.: . : :.:::..:::.:..: ::. .. : ::.:..::..... ::
CCDS45 WDRFVKRIFYFNFLVYCLYMIIFTMAAYYRPVDGLPPFKMEKTGDYFRVTGEILSVLGGV
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::: .:. :... :....::.:. ..:.:. :........::.. .. :.: :::.:
CCDS45 YFFFRGIQ-YFLQRRPSMKTLFVDSYSEMLFFLQSLFMLATVVLYFSHLKEYVASMVFSL
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.::: : ::.:::.. : :..::.:....:: ::..::..:..:...:.:.:.. :
CCDS45 ALGWTNMLYYTRGFQQMGIYAVMIEKMILRDLCRFMFVYIVFLFGFSTAVVTLIEDGKND
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.. .:. .. :.:: :: : . :.:::.::::::::. . . .:::::
CCDS45 SLPSESTSHRW--RGPACRPPDSSYNSLYSTCLELFKFTIGMGDLEFTENYDFKAVFIIL
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:..:.:::..::::::::::::::.....:::.::::: : :::: :.:: .::::::
CCDS45 LLAYVILTYILLLNMLIALMGETVNKIAQESKNIWKLQRAITILDTEKSFLKCMRKAFRS
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pF1KB8 GEMVTVGKSSDGTPDRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQY-YGFSHTVGRL
:... :: . :: : :::::::::::. :: :.::::::::. : . .:: .:.
CCDS45 GKLLQVGYTPDGKDDYRWCFRVDEVNWTTWNTNVGIINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSRV
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pF1KB8 RRDRWSS--VVPRVVELN----KNSNPDEVVVPLDSMGNPRCDGHQQGYPRKWRTDDAPL
.:.. .:: . : . ....:.::
CCDS45 SGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQFSGSLKPEDAEVFKSPAASGEK
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pF1KB8 RMKFQGAFRKGVPNPIDLLESTLYESSVVPGPKKAPMDSLFDYGTYRHHSSDNKRWRKKI
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CCDS32 SPSSSPVFRLETLDGGQEDGSEADRGKLDFGSGLPPMESQFQ--------GEDRKFAPQI
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pF1KB8 IEKQPQSPKAPAPQPPPILKVFNRPILFDIVSRGSTADLDGLLPFLLTHKKRLTDEEFRE
. . : :: : . :.: ::. :::: :: :: .: .: ::: :. :
CCDS32 RVNLNYRKGTGASQPDP--NRFDRDRLFNAVSRGVPEDLAGLPEYLSKTSKYLTDSEYTE
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pF1KB8 PSTGKTCLPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRGQTALHIAIE
::::::: ::.:::..: : : ::.: . .:: . ..:. : ::::..:::::::
CCDS32 GSTGKTCLMKAVLNLKDGVNACILPLLQIDRDSGNPQPLVNAQCTDDYYRGHSALHIAIE
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pF1KB8 RRCKHYVELLVAQGADVHAQARGRFFQPKDEGGYFYFGELPLSLAACTNQPHIVNYLTEN
.: . :.::: .::.:::.: ::::: : .: ::::::::::::::.: .:.:: ::
CCDS32 KRSLQCVKLLVENGANVHARACGRFFQ-KGQGTCFYFGELPLSLAACTKQWDVVSYLLEN
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pF1KB8 PHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLN
::. :... ::.::::::::: :.::. :: .::.::: :: ::: : .:: . :
CCDS32 PHQPASLQATDSQGNTVLHALVMISDNSAENIALVTSMYDGLLQAGARLCPTVQLEDIRN
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pF1KB8 NDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTC
. :.:: .::: ::: ::.::..:: . :::::: .: :::: :::::.:.:.:
CCDS32 LQDLTPLKLAAKEGKIEIFRHILQREFSG--LSHLSRKFTEWCYGPVRVSLYDLASVDSC
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pF1KB8 GEEASVLEILVYNSKIENRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLCAMVIFTL
:: :::::.... : .::.:...::.:.::. :: . .:..: . : : :::
CCDS32 -EENSVLEIIAFHCKSPHRHRMVVLEPLNKLLQAKWDLL-IPKFFLNFLCNLIYMFIFTA
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pF1KB8 TAYYQPLEGTPPYPY-RTTV-DYLRLAGEVITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKCPGVNSLFI
.::.:: :. .. : . . :.:... :. :. .. .. : .. . ::
CCDS32 VAYHQPTLKKQAAPHLKAEVGNSMLLTGHILILLGGIYLLVGQLW-YFWRRHVFIWISFI
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pF1KB8 DGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFALVLGWMNALYFTRGLKLTGTYSIM
:. :..:... ..:..:: .: . .:: :: ..: ::::::.: ::.:::.. :: ::.:
CCDS32 DSYFEILFLFQALLTVVSQVLCFLAIEWYLPLLVSALVLGWLNLLYYTRGFQHTGIYSVM
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pF1KB8 IQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCTVPTYPSCRD---
:::....::.::::.::.:..:.: ::::: . .. . ... .: . . .:
CCDS32 IQKVILRDLLRFLLIYLVFLFGFAVALVSLSQEAWRPEAPTGPNATESVQPMEGQEDEGN
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pF1KB8 SETFSTFL---LDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIALMG
. . .: :.:::.:::::.: . . .. . ..::..:..::..::::::::::.
CCDS32 GAQYRGILEASLELFKFTIGMGELAFQEQLHFRGMVLLLLLAYVLLTYILLLNMLIALMS
590 600 610 620 630 640
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pF1KB8 ETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTPDRRWCFR
:::..:. .: ::::: : ..:..: .. . :: :.: :.::: . ::.::.:::::
CCDS32 ETVNSVATDSWSIWKLQKAISVLEMENGY-WWCRKKQRAGVMLTVGTKPDGSPDERWCFR
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pF1KB8 VDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVELNKNSNPD
:.::::. :.:.: . :::
CCDS32 VEEVNWASWEQTLPTLCEDPSGAGVPRTLENPVLASPPKEDEDGASEENYVPVQLLQSN
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pF1KB8 LPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRGQTALHIAIERRCKHYV
:.. :. . :.::::::::. . . :
CCDS58 QRGAMGETALHIAALYDNLEAAMVLMEAAPELVFEPMTSELYEGQTALHIAVVNQNMNLV
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pF1KB8 ELLVAQGADVHAQARGRFFQPKDEGGYFYFGELPLSLAACTNQPHIVNYLTENPHKKADM
. :.:. :.: :.: : :. .. . .:::: :::.:::.:. .:: : :. ::.
CCDS58 RALLARRASVSARATGTAFR-RSPCNLIYFGEHPLSFAACVNSEEIVRLLIEH---GADI
180 190 200 210 220
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pF1KB8 RRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGLSPL
: ::: :::::: :. . : :. .::.::: . . :. : :..::.:.
CCDS58 RAQDSLGNTVLHILI-----LQPNKTFACQMYNLLLSYDRHGDHLQPLDLVPNHQGLTPF
230 240 250 260 270 280
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pF1KB8 MMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTCGEEASVL
.:. :. .:::.... :: .:.:::. :.::::. .:. :.: :.:
CCDS58 KLAGVEGNTVMFQHLMQK-----------RKHTQWTYGPLTSTLYDLTEIDSSGDEQSLL
290 300 310 320 330
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pF1KB8 EILVYNSKIENRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLCAMVIFTLTAYYQPL
:... ..: : : ..: :..::. ::...: : . . :: .. ::. :.::
CCDS58 ELIITTKKREAR-QILDQTPVKELVSLKWKRYGRPYFCMLGAIYLLYIICFTMCCIYRPL
340 350 360 370 380 390
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pF1KB8 EG-----TPPYP------------YRTTVDYLRLAGEVITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKC
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CCDS58 KPRTNNRTSPRDNTLLQQKLLQEAYMTPKDDIRLVGELVTVIGAIIILLVEVPDIFRM--
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]