Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8502
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8502, 864 aa
1>>>pF1KB8502 864 - 864 aa - 864 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9108+/-0.00104; mu= 1.2236+/- 0.061
mean_var=415.7430+/-95.658, 0's: 0 Z-trim(114.5): 303 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.062902
statistics sampled from 14744 (15094) to 14744 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.77), E-opt: 0.2 (0.464), width: 16
Scan time: 4.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 864) 6041 563.5 5.8e-160
CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 803) 3779 358.2 3.5e-98
CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620) 2626 253.9 1.7e-66
CCDS45237.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 ( 734) 2276 221.7 3.7e-57
CCDS5116.1 ROS1 gene_id:6098|Hs108|chr6 (2347) 974 104.2 2.9e-21
CCDS1160.1 INSRR gene_id:3645|Hs108|chr1 (1297) 931 100.0 2.9e-20
CCDS73785.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1366) 889 96.2 4.3e-19
CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367) 889 96.2 4.3e-19
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 885 95.8 5.5e-19
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 885 95.8 5.5e-19
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 781 86.1 2.6e-16
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 781 86.1 2.7e-16
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 781 86.1 2.7e-16
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 761 84.3 9.8e-16
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 761 84.3 9.9e-16
CCDS62677.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 626) 757 83.8 1.1e-15
CCDS12574.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 885) 757 84.0 1.3e-15
CCDS12575.1 AXL gene_id:558|Hs108|chr19 ( 894) 757 84.0 1.3e-15
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 718 80.4 1.5e-14
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 718 80.4 1.5e-14
CCDS4887.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1014) 715 80.2 2e-14
CCDS4886.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 ( 940) 713 80.0 2.2e-14
CCDS4885.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1030) 713 80.1 2.3e-14
CCDS4884.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1070) 713 80.1 2.4e-14
CCDS59021.1 PTK7 gene_id:5754|Hs108|chr6 (1078) 713 80.1 2.4e-14
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 706 79.4 3.4e-14
CCDS2094.1 MERTK gene_id:10461|Hs108|chr2 ( 999) 694 78.3 7.5e-14
CCDS81866.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 845) 686 77.5 1.1e-13
CCDS10080.1 TYRO3 gene_id:7301|Hs108|chr15 ( 890) 686 77.5 1.1e-13
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390) 657 75.1 9.4e-13
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1408) 657 75.1 9.5e-13
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 649 74.0 1e-12
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 649 74.1 1.1e-12
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 649 74.1 1.1e-12
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 731) 632 72.5 3e-12
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 733) 632 72.5 3e-12
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 812) 632 72.6 3.2e-12
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 632 72.6 3.3e-12
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 820) 632 72.6 3.3e-12
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 822) 632 72.6 3.3e-12
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8 ( 853) 632 72.6 3.3e-12
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 633 72.8 3.4e-12
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 625 71.8 4.1e-12
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 625 71.9 4.6e-12
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 625 71.9 4.6e-12
CCDS82777.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1294) 631 72.7 4.6e-12
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 625 71.9 4.6e-12
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 625 71.9 4.7e-12
CCDS58833.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1351) 631 72.8 4.7e-12
CCDS2807.1 MST1R gene_id:4486|Hs108|chr3 (1400) 631 72.8 4.8e-12
>>CCDS10077.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 (864 aa)
initn: 6041 init1: 6041 opt: 6041 Z-score: 2985.3 bits: 563.5 E(32554): 5.8e-160
Smith-Waterman score: 6041; 100.0% identity (100.0% similar) in 864 aa overlap (1-864:1-864)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGCWGQLLVWFGAAGAILCSSPGSQETFLRSSPLPLASPSPRDPKVSAPPSILEPASPLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGCWGQLLVWFGAAGAILCSSPGSQETFLRSSPLPLASPSPRDPKVSAPPSILEPASPLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SPGTEGSWLFSTCGASGRHGPTQTQCDGAYAGTSVVVTVGAAGQLRGVQLWRVPGPGQYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SPGTEGSWLFSTCGASGRHGPTQTQCDGAYAGTSVVVTVGAAGQLRGVQLWRVPGPGQYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ISAYGAAGGKGAKNHLSRAHGVFVSAIFSLGLGESLYILVGQQGEDACPGGSPESQLVCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ISAYGAAGGKGAKNHLSRAHGVFVSAIFSLGLGESLYILVGQQGEDACPGGSPESQLVCL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GESRAVEEHAAMDGSEGVPGSRRWAGGGGGGGGATYVFRVRAGELEPLLVAAGGGGRAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GESRAVEEHAAMDGSEGVPGSRRWAGGGGGGGGATYVFRVRAGELEPLLVAAGGGGRAYL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RPRDRGRTQASPEKLENRSEAPGSGGRGGAAGGGGGWTSRAPSPQAGRSLQEGAEGGQGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RPRDRGRTQASPEKLENRSEAPGSGGRGGAAGGGGGWTSRAPSPQAGRSLQEGAEGGQGC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 SEAWATLGWAAAGGFGGGGGACTAGGGGGGYRGGDASETDNLWADGEDGVSFIHPSSELF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SEAWATLGWAAAGGFGGGGGACTAGGGGGGYRGGDASETDNLWADGEDGVSFIHPSSELF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LQPLAVTENHGEVEIRRHLNCSHCPLRDCQWQAELQLAECLCPEGMELAVDNVTCMDLHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LQPLAVTENHGEVEIRRHLNCSHCPLRDCQWQAELQLAECLCPEGMELAVDNVTCMDLHK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 PPGPLVLMVAVVATSTLSLLMVCGVLILVKQKKWQGLQEMRLPSPELELSKLRTSAIRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PPGPLVLMVAVVATSTLSLLMVCGVLILVKQKKWQGLQEMRLPSPELELSKLRTSAIRTA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 PNPYYCQVGLGPAQSWPLPPGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPGDSSPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PNPYYCQVGLGPAQSWPLPPGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPGDSSPLQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 VAIKTLPELCSPQDELDFLMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VAIKTLPELCSPQDELDFLMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 FLRHSRPHLGQPSPLVMRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FLRHSRPHLGQPSPLVMRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 KIGDFGMARDIYRASYYRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KIGDFGMARDIYRASYYRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 YMPYPGRTNQEVLDFVVGGGRMDPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILERLQYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YMPYPGRTNQEVLDFVVGGGRMDPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILERLQYC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 TQDPDVLNSLLPMELGPTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQPQELSPEKLKSWGGSPLGPWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TQDPDVLNSLLPMELGPTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQPQELSPEKLKSWGGSPLGPWL
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KB8 SSGLKPLKSRGLQPQNLWNPTYRS
::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSGLKPLKSRGLQPQNLWNPTYRS
850 860
>>CCDS10078.1 LTK gene_id:4058|Hs108|chr15 (803 aa)
initn: 3749 init1: 3749 opt: 3779 Z-score: 1876.3 bits: 358.2 E(32554): 3.5e-98
Smith-Waterman score: 5455; 92.9% identity (92.9% similar) in 864 aa overlap (1-864:1-803)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MGCWGQLLVWFGAAGAILCSSPGSQETFLRSSPLPLASPSPRDPKVSAPPSILEPASPLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGCWGQLLVWFGAAGAILCSSPGSQETFLRSSPLPLASPSPRDPKVSAPPSILEPASPLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 SPGTEGSWLFSTCGASGRHGPTQTQCDGAYAGTSVVVTVGAAGQLRGVQLWRVPGPGQYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SPGTEGSWLFSTCGASGRHGPTQTQCDGAYAGTSVVVTVGAAGQLRGVQLWRVPGPGQYL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 ISAYGAAGGKGAKNHLSRAHGVFVSAIFSLGLGESLYILVGQQGEDACPGGSPESQLVCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ISAYGAAGGKGAKNHLSRAHGVFVSAIFSLGLGESLYILVGQQGEDACPGGSPESQLVCL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 GESRAVEEHAAMDGSEGVPGSRRWAGGGGGGGGATYVFRVRAGELEPLLVAAGGGGRAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GESRAVEEHAAMDGSEGVPGSRRWAGGGGGGGGATYVFRVRAGELEPLLVAAGGGGRAYL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RPRDRGRTQASPEKLENRSEAPGSGGRGGAAGGGGGWTSRAPSPQAGRSLQEGAEGGQGC
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RPRDRGRTQASPEKLENRSEAPGSGGRGGAAGG---------------------------
250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 SEAWATLGWAAAGGFGGGGGACTAGGGGGGYRGGDASETDNLWADGEDGVSFIHPSSELF
::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ----------------------------------DASETDNLWADGEDGVSFIHPSSELF
280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 LQPLAVTENHGEVEIRRHLNCSHCPLRDCQWQAELQLAECLCPEGMELAVDNVTCMDLHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LQPLAVTENHGEVEIRRHLNCSHCPLRDCQWQAELQLAECLCPEGMELAVDNVTCMDLHK
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 PPGPLVLMVAVVATSTLSLLMVCGVLILVKQKKWQGLQEMRLPSPELELSKLRTSAIRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PPGPLVLMVAVVATSTLSLLMVCGVLILVKQKKWQGLQEMRLPSPELELSKLRTSAIRTA
360 370 380 390 400 410
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 PNPYYCQVGLGPAQSWPLPPGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPGDSSPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PNPYYCQVGLGPAQSWPLPPGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPGDSSPLQ
420 430 440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 VAIKTLPELCSPQDELDFLMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VAIKTLPELCSPQDELDFLMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKS
480 490 500 510 520 530
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 FLRHSRPHLGQPSPLVMRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FLRHSRPHLGQPSPLVMRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVA
540 550 560 570 580 590
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 KIGDFGMARDIYRASYYRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KIGDFGMARDIYRASYYRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLG
600 610 620 630 640 650
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 YMPYPGRTNQEVLDFVVGGGRMDPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILERLQYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YMPYPGRTNQEVLDFVVGGGRMDPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILERLQYC
660 670 680 690 700 710
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 TQDPDVLNSLLPMELGPTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQPQELSPEKLKSWGGSPLGPWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TQDPDVLNSLLPMELGPTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQPQELSPEKLKSWGGSPLGPWL
720 730 740 750 760 770
850 860
pF1KB8 SSGLKPLKSRGLQPQNLWNPTYRS
::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSGLKPLKSRGLQPQNLWNPTYRS
780 790 800
>>CCDS33172.1 ALK gene_id:238|Hs108|chr2 (1620 aa)
initn: 2767 init1: 2275 opt: 2626 Z-score: 1307.4 bits: 253.9 E(32554): 1.7e-66
Smith-Waterman score: 3136; 55.6% identity (75.9% similar) in 859 aa overlap (4-843:608-1450)
10 20 30
pF1KB8 MGCWGQLLVWFGAAGAILCSSPG---SQETFLR
: :...:.: .. . . . : . .:
CCDS33 GRMVWHVAAYEGLSLWQWMVLPLLDVSDRFWLQMVAWWGQGSRAIVAFDNISISLDCYLT
580 590 600 610 620 630
40 50 60 70 80
pF1KB8 SSP----LPLASPSPRDPKVSAPPSILEPA--SPLNSPGTEGS--WLFSTCGASGRHGPT
: : ..:. :. : . :.:. :: ..: . . :::.:::::: ::::
CCDS33 ISGEDKILQNTAPKSRNLFERNPNKELKPGENSPRQTPIFDPTVHWLFTTCGASGPHGPT
640 650 660 670 680 690
90 100 110 120 130 140
pF1KB8 QTQCDGAYAGTSVVVTVGAAGQLRGVQLWRVPGPGQYLISAYGAAGGKGAKNHLSRAHGV
:.::..:: .... : ::. : :.:.:.:.::. : ::.::::::::.:: . :.:::
CCDS33 QAQCNNAYQNSNLSVEVGSEGPLKGIQIWKVPATDTYSISGYGAAGGKGGKNTMMRSHGV
700 710 720 730 740 750
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 FVSAIFSLGLGESLYILVGQQGEDACPGGSPESQLVCLGESRAVEEHAAMDGSEGVPGSR
: .::.: . ::::::::::::::. . : ::.::. ..::. .. : .
CCDS33 SVLGIFNLEKDDMLYILVGQQGEDACPSTNQLIQKVCIGENNVIEEEIRVNRS-----VH
760 770 780 790 800 810
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 RWAGGGGGGGGATYVFRVRAGELEPLLVAAGGGGRAYLRPRDRGRTQASPEKLENRSEAP
.:::::::::::::::... : ::..::::::::: : . ::.::: : .
CCDS33 EWAGGGGGGGGATYVFKMKDGVPVPLIIAAGGGGRAYGAKTDTFH----PERLENNSSVL
820 830 840 850 860
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 GSGGRGGAAGGGGGWTSRAPSPQAGRSLQEGAEGGQGCSEAWATLGWAAAGGFGGGGGAC
: .: .:::::::::.. . ::.:::::: ::..: .: :: . ::::::::.:
CCDS33 GLNGNSGAAGGGGGWNDNTSLLWAGKSLQEGATGGHSCPQAMKKWGWETRGGFGGGGGGC
870 880 890 900 910 920
330 340 350 360 370 380
pF1KB8 TAGGGGGGYRGGDASETDNLWADGEDGVSFIHPSSELFLQPLAVTENHGEVEIRRHLNCS
..::::::: ::.:. ... ::::::::: : . :. : : :.::::.:...::::
CCDS33 SSGGGGGGYIGGNAASNNDPEMDGEDGVSFISPLGILYTPALKVMEGHGEVNIKHYLNCS
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pF1KB8 HCPLRDCQWQAELQLAECLCPEGMELAVDNVTCM--DLHKPPGPLVLMVAVVATSTLSLL
:: . .:. . : . . :.: .: :: :.:.:. .: :: :...::... .. :
CCDS33 HCEVDECHMDPESHKVICFCDHGTVLAEDGVSCIVSPTPEPHLPLSLILSVVTSALVAAL
990 1000 1010 1020 1030 1040
450 460 470 480 490
pF1KB8 MVC--GVLILVKQKKWQGLQ--EMRLPSPELELSKLRTSAIRTAPNPYYCQVGLGPAQSW
.. :..: : ..: : :: .:.: ::: .:::::::.: : :: :: .: . :
CCDS33 VLAFSGIMI-VYRRKHQELQAMQMELQSPEYKLSKLRTSTIMTDYNPNYCFAGKTSSIS-
1050 1060 1070 1080 1090 1100
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 PLPPGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPGDSSPLQVAIKTLPELCSPQDEL
. :: :.::.:.:::::::::::: : :.:.: ::::::.:::::.:: ::::
CCDS33 ----DLKEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPNDPSPLQVAVKTLPEVCSEQDEL
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pF1KB8 DFLMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKSFLRHSRPHLGQPSPLV
:::::::::::: :::::::.:.::.. ::.::::::.:::.:::::..::. .::: :.
CCDS33 DFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLA
1170 1180 1190 1200 1210 1220
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pF1KB8 MRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVAKIGDFGMARDIYRASY
: :::..:.::: ::.:::::::::::::::::::.: ::.:::::::::::::::::::
CCDS33 MLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMARDIYRASY
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680 690 700 710 720 730
pF1KB8 YRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLGYMPYPGRTNQEVLDFV
::.: :.:::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::...:::::.::
CCDS33 YRKGGCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFV
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pF1KB8 VGGGRMDPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILERLQYCTQDPDVLNSLLPMELG
..:::::::..:::::::::::::::.:: ::.:: ::::..::::::::.:. ::.: :
CCDS33 TSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEYG
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pF1KB8 PTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQ--PQELSPEKLKSWGGSPLGPWLSSGLKPLKSRGLQP
: ::: . .. : . :: :. . :. .: .. : : :::
CCDS33 PLVEEEEKVPVRPKDPEGV-PPLLVSQQAKREEERSPAAPPPLPTTSSGKAAKKPTAAEI
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860
pF1KB8 QNLWNPTYRS
CCDS33 SVRVPRGPAVEGGHVNMAFSQSNPPSELHKVHGSRNKPTSLWNPTYGSWFTEKPTKKNNP
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CCDS45 MGCWGQLLVWFGAAGAILCSSPGSQETFLRSSPLPLASPSPRDPKVSAPPSILEPASPLN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SPGTEGSWLFSTCGASGRHGPTQTQCDGAYAGTSVVVTVGAAGQLRGVQLWRVPGPGQYL
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ISAYGAAGGKGAKNHLSRAHGVFVSAIFSLGLGESLYILVGQQGEDACPGGSPESQLVCL
130 140 150 160 170 180
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pF1KB8 GESRAVEEHAAMDGSEGVPGSRRWAGGGGGGGGATYVFRVRAGELEPLLVAAGGGGRAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GESRAVEEHAAMDGSEGVPGSRRWAGGGGGGGGATYVFRVRAGELEPLLVAAGGGGRAYL
190 200 210 220 230 240
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pF1KB8 RPRDRGRTQASPEKLENRSEAPGSGGRGGAAGGGGGWTSRAPSPQAGRSLQEGAEGGQGC
:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RPRDRGRTQASPEKLENRSEAPGSGGRGGAAGG---------------------------
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pF1KB8 SEAWATLGWAAAGGFGGGGGACTAGGGGGGYRGGDASETDNLWADGEDGVSFIHPSSELF
::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ----------------------------------DASETDNLWADGEDGVSFIHPSSELF
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pF1KB8 LQPLAVTENHGEVEIRRHLNCSHCPLRDCQWQAELQLAECLCPEGMELAVDNVTCMDLHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LQPLAVTENHGEVEIRRHLNCSHCPLRDCQWQAELQLAECLCPEGMELAVDNVTCMDLHK
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pF1KB8 PPGPLVLMVAVVATSTLSLLMVCGVLILVKQKKWQGLQEMRLPSPELELSKLRTSAIRTA
:::::::::::::::::::::::::::: : :.: : .:: :
CCDS45 PPGPLVLMVAVVATSTLSLLMVCGVLIL--GGAW--------PGPVL------ASATR--
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pF1KB8 PNPYYCQVGLGPAQSWPLPPGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPGDSSPLQ
:. :. :.: .
CCDS45 -----CHRGF-PSQCY--------------------------------------------
410
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 VAIKTLPELCSPQDELDFLMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKS
. .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 -SAQTLPELCSPQDELDFLMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FLRHSRPHLGQPSPLVMRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KIGDFGMARDIYRASYYRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLG
540 550 560 570 580 590
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YMPYPGRTNQEVLDFVVGGGRMDPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILERLQYC
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pF1KB8 TQDPDVLNSLLPMELGPTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQPQELSPEKLKSWGGSPLGPWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TQDPDVLNSLLPMELGPTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQPQELSPEKLKSWGGSPLGPWL
660 670 680 690 700 710
850 860
pF1KB8 SSGLKPLKSRGLQPQNLWNPTYRS
::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SSGLKPLKSRGLQPQNLWNPTYRS
720 730
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pF1KB8 APNPYYCQVGLGPAQSWPLPPGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPG-DSSP
.:: :: ::::::::: .. . : :.
CCDS51 GVGLANACYAIHTLPTQEEIENLPAFPREKLTLRLLLGSGAFGEVYEGTAVDILGVGSGE
1920 1930 1940 1950 1960 1970
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 LQVAIKTLPELCSPQDELDFLMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDM
..::.::: . . :....:: :: ..::: : ::.. .:. : :. :.:::: :::.
CCDS51 IKVAVKTLKKGSTDQEKIEFLKEAHLMSKFNHPNILKQLGVCLLNEPQYIILELMEGGDL
1980 1990 2000 2010 2020 2030
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pF1KB8 KSFLRHSRPHLGQPSPLVMRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPS-
..::..: :.. ::..: ::..:: :::. ::::::.::::::.: .
CCDS51 LTYLRKARMATFYGPLLTLVDLVDLCVDISKGCVYLERMHFIHRDLAARNCLVSVKDYTS
2040 2050 2060 2070 2080 2090
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pF1KB8 -RVAKIGDFGMARDIYRASYYRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEI
:..::::::.:::::. .:::. ..::::.:: ::....::::...: ::::.:.:::
CCDS51 PRIVKIGDFGLARDIYKNDYYRKRGEGLLPVRWMAPESLMDGIFTTQSDVWSFGILIWEI
2100 2110 2120 2130 2140 2150
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pF1KB8 FSLGYMPYPGRTNQEVLDFVVGGGRMDPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILER
..::..:::...: .::..: :::..:::.:: .. .::::: .::. ::.: : ..
CCDS51 LTLGHQPYPAHSNLDVLNYVQTGGRLEPPRNCPDDLWNLMTQCWAQEPDQRPTFHRIQDQ
2160 2170 2180 2190 2200 2210
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pF1KB8 LQYCTQDPDVLNSLLPMELGPTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQPQELSPEKLKSWGGSPL
:: . :::. . .: ..::. :.:.:
CCDS51 LQLFRN--FFLNSIYK-----SRDEANNSGVINESFEGEDGDVICLNSDDIMPVALMETK
2220 2230 2240 2250 2260
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pF1KB8 GPWLSSGLKPLKSRGLQPQNLWNPTYRS
CCDS51 NREGLNYMVLATECGQGEEKSEGPLGSQESESCGLRKEEKEPHADKDFCQEKQVAYCPSG
2270 2280 2290 2300 2310 2320
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pF1KB8 MVCGVLILVKQKKWQGLQEMRLPSPELELSKLRTSAIRTAPNP-YYCQVGLGPAQSWPLP
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pF1KB8 PGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPGDSSPLQVAIKTLPELCSPQDELDFL
:: .....: ::.:.:: :::::. :: . ::.::. :: ::.. ..::
CCDS11 ----EVPREQISIIRELGQGSFGMVYEGLARGLEAGEESTPVALKTVNELASPRECIEFL
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pF1KB8 MEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKSFLRHSRPHL----GQPSPL
:: ... :. ...:: .:. .. : :...:::. ::.:: :: ::. : :.:
CCDS11 KEASVMKAFKCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSHLRSLRPEAENNPGLPQP-
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pF1KB8 VMRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVAKIGDFGMARDIYRAS
.. ...:.: .::.: :: :.:.:::.:::::..: . ..:::::::.::.:...
CCDS11 ALGEMIQMAGEIADGMAYLAANKFVHRDLAARNCMVS---QDFTVKIGDFGMTRDVYETD
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pF1KB8 YYRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLGYMPYPGRTNQEVLDF
:::.: ..::::.:: ::.. .::::...: :::::.:::: .:. .:: : .:..:: :
CCDS11 YYRKGGKGLLPVRWMAPESLKDGIFTTHSDVWSFGVVLWEIVTLAEQPYQGLSNEQVLKF
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pF1KB8 VVGGGRMDPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILERLQYCTQDPDVLNSLLPMEL
:. :: .. .::: . ..:..::: .:.:::::. ::. .: .. :. . .
CCDS11 VMDGGVLEELEGCPLQLQELMSRCWQPNPRLRPSFTHILDSIQ-----EELRPSFRLLSF
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pF1KB8 GPTPEEEGTSG-LGNRSLECLRPPQPQELSPEKLKSWGGSPLGPWLSSGLKPLKSRGLQP
.:: .:. : : . . : : :.. ::.
CCDS11 YYSPECRGARGSLPTTDAEPDSSPTPRDCSPQNGGPGH
1260 1270 1280 1290
860
pF1KB8 QNLWNPTYRS
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pF1KB8 LMVCGVLILVKQKKWQGLQEMRLPSPELELSKLRTSAIRTAPNP-YYCQVGLGPAQSWPL
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CCDS73 HLIIALPVAVLLIVGGLVIMLYVFHRKRNNSRLGNGVLYASVNPEYFSAADVYVPDEW--
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pF1KB8 PPGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPGDSSPLQVAIKTLPELCSPQDELDF
::. ..:. : ::.:.:: ::::.. :. : .:::::. : : .....:
CCDS73 -----EVAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKGVVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEF
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pF1KB8 LMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKSFLRHSRPHL-GQP--SPL
: :: ....: ...:: .:. .. : :...:::. ::.::.:: ::.. ..: .:
CCDS73 LNEASVMKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPP
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pF1KB8 VMRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVAKIGDFGMARDIYRAS
. ..:.: .::.: ::. :.:.:::.:::::... . ..:::::::.::::...
CCDS73 SLSKMIQMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARNCMVA---EDFTVKIGDFGMTRDIYETD
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pF1KB8 YYRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLGYMPYPGRTNQEVLDF
:::.: ..::::.:: ::.. .:.::. .: :::::.:::: .:. .:: : .:..:: :
CCDS73 YYRKGGKGLLPVRWMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGVVLWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRF
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:. :: .: : .:: ....: .:::..:..:::: :. : . :.
CCDS73 VMEGGLLDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLEII--------------SSIKEEM
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pF1KB8 GPTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQPQELS--PEKLKSWGGSPLGPWLSSGLKPLKSR--G
: : .. : . :.:.::. ::...: :: : ::. :: .: :
CCDS73 EP-----GFREVSFYYSEENKLPEPEELDLEPENMES---VPLDPSASSSSLPLPDRHSG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
860
pF1KB8 LQPQNLWNPTYRS
. .: .:
CCDS73 HKAENGPGPGVLVLRASFDERQPYAHMNGGRKNERALPLPQSSTC
1330 1340 1350 1360
>>CCDS10378.1 IGF1R gene_id:3480|Hs108|chr15 (1367 aa)
initn: 764 init1: 724 opt: 889 Z-score: 456.3 bits: 96.2 E(32554): 4.3e-19
Smith-Waterman score: 909; 38.1% identity (66.9% similar) in 399 aa overlap (470-860:965-1331)
440 450 460 470 480 490
pF1KB8 LMVCGVLILVKQKKWQGLQEMRLPSPELELSKLRTSAIRTAPNP-YYCQVGLGPAQSWPL
:.: .... .. :: :. . . . :
CCDS10 HLIIALPVAVLLIVGGLVIMLYVFHRKRNNSRLGNGVLYASVNPEYFSAADVYVPDEW--
940 950 960 970 980 990
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 PPGVTEVSPANVTLLRALGHGAFGEVYEGLVIGLPGDSSPLQVAIKTLPELCSPQDELDF
::. ..:. : ::.:.:: ::::.. :. : .:::::. : : .....:
CCDS10 -----EVAREKITMSRELGQGSFGMVYEGVAKGVVKDEPETRVAIKTVNEAASMRERIEF
1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KB8 LMEALIISKFRHQNIVRCVGLSLRATPRLILLELMSGGDMKSFLRHSRPHL-GQP--SPL
: :: ....: ...:: .:. .. : :...:::. ::.::.:: ::.. ..: .:
CCDS10 LNEASVMKEFNCHHVVRLLGVVSQGQPTLVIMELMTRGDLKSYLRSLRPEMENNPVLAPP
1050 1060 1070 1080 1090 1100
620 630 640 650 660 670
pF1KB8 VMRDLLQLAQDIAQGCHYLEENHFIHRDIAARNCLLSCAGPSRVAKIGDFGMARDIYRAS
. ..:.: .::.: ::. :.:.:::.:::::... . ..:::::::.::::...
CCDS10 SLSKMIQMAGEIADGMAYLNANKFVHRDLAARNCMVA---EDFTVKIGDFGMTRDIYETD
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KB8 YYRRGDRALLPVKWMPPEAFLEGIFTSKTDSWSFGVLLWEIFSLGYMPYPGRTNQEVLDF
:::.: ..::::.:: ::.. .:.::. .: :::::.:::: .:. .:: : .:..:: :
CCDS10 YYRKGGKGLLPVRWMSPESLKDGVFTTYSDVWSFGVVLWEIATLAEQPYQGLSNEQVLRF
1170 1180 1190 1200 1210 1220
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pF1KB8 VVGGGRMDPPRGCPGPVYRIMTQCWQHEPELRPSFASILERLQYCTQDPDVLNSLLPMEL
:. :: .: : .:: ....: .:::..:..:::: :. : . :.
CCDS10 VMEGGLLDKPDNCPDMLFELMRMCWQYNPKMRPSFLEII--------------SSIKEEM
1230 1240 1250 1260 1270
800 810 820 830 840 850
pF1KB8 GPTPEEEGTSGLGNRSLECLRPPQPQELS--PEKLKSWGGSPLGPWLSSGLKPLKSR--G
: : .. : . :.:.::. ::...: :: : ::. :: .: :
CCDS10 EP-----GFREVSFYYSEENKLPEPEELDLEPENMES---VPLDPSASSSSLPLPDRHSG
1280 1290 1300 1310 1320
860
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