Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8287
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8287, 422 aa
1>>>pF1KB8287 422 - 422 aa - 422 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2937+/-0.00187; mu= 13.8680+/- 0.111
mean_var=265.3927+/-50.439, 0's: 0 Z-trim(106.2): 952 B-trim: 37 in 1/49
Lambda= 0.078728
statistics sampled from 7754 (8824) to 7754 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.616), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16
Scan time: 2.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35500.2 ZNF550 gene_id:162972|Hs108|chr19 ( 422) 2951 349.4 3.7e-96
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CCDS32991.1 ZNF599 gene_id:148103|Hs108|chr19 ( 588) 1717 209.5 6.8e-54
CCDS33127.1 ZNF264 gene_id:9422|Hs108|chr19 ( 627) 1684 205.8 9.5e-53
CCDS46208.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 ( 494) 1278 159.5 6.4e-39
CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19 ( 600) 1234 154.7 2.3e-37
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1160 146.3 7.8e-35
CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX ( 506) 1158 145.9 8.2e-35
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 1153 145.2 1.1e-34
CCDS30686.1 ZFP69 gene_id:339559|Hs108|chr1 ( 526) 1148 144.8 1.8e-34
CCDS46211.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 464) 1146 144.5 2e-34
CCDS33931.1 ZNF141 gene_id:7700|Hs108|chr4 ( 474) 1145 144.4 2.2e-34
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 1146 144.6 2.2e-34
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 419) 1141 143.9 2.9e-34
CCDS42637.1 ZNF419 gene_id:79744|Hs108|chr19 ( 478) 1129 142.6 7.9e-34
CCDS9282.1 ZNF140 gene_id:7699|Hs108|chr12 ( 457) 1128 142.4 8.3e-34
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 1121 141.7 1.5e-33
CCDS31939.1 ZNF26 gene_id:7574|Hs108|chr12 ( 533) 1120 141.6 1.7e-33
CCDS12505.1 ZNF571 gene_id:51276|Hs108|chr19 ( 609) 1114 141.1 2.9e-33
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4 ( 648) 1114 141.1 3e-33
CCDS46210.1 ZNF772 gene_id:400720|Hs108|chr19 ( 448) 1104 139.7 5.4e-33
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 1104 139.8 6e-33
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 1104 139.9 6.1e-33
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1098 139.3 1.1e-32
CCDS34644.1 ZNF680 gene_id:340252|Hs108|chr7 ( 530) 1095 138.8 1.2e-32
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 1091 138.3 1.6e-32
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1091 138.3 1.6e-32
CCDS82404.1 ZNF460 gene_id:10794|Hs108|chr19 ( 521) 1087 137.9 2.2e-32
CCDS12949.1 ZNF460 gene_id:10794|Hs108|chr19 ( 562) 1087 137.9 2.3e-32
CCDS81756.1 ZNF26 gene_id:7574|Hs108|chr12 ( 513) 1085 137.6 2.6e-32
CCDS42531.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 ( 444) 1079 136.9 3.9e-32
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 1079 137.0 4.2e-32
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1078 136.9 4.7e-32
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1078 137.0 4.9e-32
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1078 137.0 5e-32
CCDS55114.1 ZNF736 gene_id:728927|Hs108|chr7 ( 427) 1071 135.9 7.1e-32
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1069 135.9 9.4e-32
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1070 136.1 9.7e-32
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 1069 136.0 1.1e-31
CCDS12843.1 ZNF649 gene_id:65251|Hs108|chr19 ( 505) 1067 135.6 1.1e-31
CCDS12845.1 ZNF350 gene_id:59348|Hs108|chr19 ( 532) 1066 135.5 1.2e-31
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1065 135.3 1.2e-31
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1065 135.3 1.2e-31
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1067 135.9 1.3e-31
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1065 135.5 1.4e-31
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1068 136.2 1.4e-31
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1065 135.5 1.4e-31
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1065 135.6 1.4e-31
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1068 136.3 1.4e-31
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1065 135.6 1.4e-31
>>CCDS35500.2 ZNF550 gene_id:162972|Hs108|chr19 (422 aa)
initn: 2951 init1: 2951 opt: 2951 Z-score: 1839.8 bits: 349.4 E(32554): 3.7e-96
Smith-Waterman score: 2951; 100.0% identity (100.0% similar) in 422 aa overlap (1-422:1-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAETKDAAQMLVTFKDVAVTFTREEWRQLDLAQRTLYREVMLETCGLLVSLGHRVPKPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MAETKDAAQMLVTFKDVAVTFTREEWRQLDLAQRTLYREVMLETCGLLVSLGHRVPKPEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VHLLEHGQELWIVKRGLSHATCAGDRAQVHTREPTTYPPVLSERAFLRGSLTLESSTSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VHLLEHGQELWIVKRGLSHATCAGDRAQVHTREPTTYPPVLSERAFLRGSLTLESSTSSD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 SRLGRARDEEGLLEMQKGKVTPETDLHKETHLGKVSLEGEGLGTDDGLHSRALQEWLSAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SRLGRARDEEGLLEMQKGKVTPETDLHKETHLGKVSLEGEGLGTDDGLHSRALQEWLSAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 VLHECDSQQPGKDALIHAGTNPYKCKQCGKGFNRKWYLVRHQRVHTGMKPYECNACGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VLHECDSQQPGKDALIHAGTNPYKCKQCGKGFNRKWYLVRHQRVHTGMKPYECNACGKAF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 SQSSTLIRHYLIHTGEKPYKCLECGKAFKRRSYLMQHHPIHTGEKPYECSQCRKAFTHRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SQSSTLIRHYLIHTGEKPYKCLECGKAFKRRSYLMQHHPIHTGEKPYECSQCRKAFTHRS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 TFIRHNRTHTGEKPFECKECEKAFSNRAHLIQHYIIHTGEKPYDCMACGKAFRCSSELIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TFIRHNRTHTGEKPFECKECEKAFSNRAHLIQHYIIHTGEKPYDCMACGKAFRCSSELIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 HQRIHTGEKPYECTQCGKAFHRSTYLIQHSVIHTGEMPYKCIECGKAFKRRSHLLQHQRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HQRIHTGEKPYECTQCGKAFHRSTYLIQHSVIHTGEMPYKCIECGKAFKRRSHLLQHQRV
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 HT
::
CCDS35 HT
>>CCDS46207.1 ZNF805 gene_id:390980|Hs108|chr19 (627 aa)
initn: 1190 init1: 1190 opt: 1751 Z-score: 1101.6 bits: 213.4 E(32554): 4.9e-55
Smith-Waterman score: 1751; 58.6% identity (81.8% similar) in 423 aa overlap (1-422:3-422)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MAETKDAAQMLVTFKDVAVTFTREEWRQLDLAQRTLYREVMLETCGLLVSLGHRVPKP
:: : : ::. ::: :::::::.::: ::::::::::.:::::.:::::::: ::.:
CCDS46 MAMALT-DPAQVSVTFDDVAVTFTQEEWGQLDLAQRTLYQEVMLENCGLLVSLGCPVPRP
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pF1KB8 ELVHLLEHGQELWIVKRGLSHATCAGDRAQVHTREPTTYPPVLSERAFLRGSLTLESSTS
::.. :::::: : :. ::..:: ::... .. :::: .::: . :.:: ...:
CCDS46 ELIYHLEHGQEPWTRKEDLSQGTCPGDKGKPKSTEPTTCELALSEGISFWGQLT--QGAS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 SDSRLGRARDEEGLLEMQKGKVTPETDLHKETHLGKVSLEGEGLGTDDGLHSRALQEWLS
.::.::. .:..:. ::: .. : : .:: ::.: . .:::: :.. :: .:. .:
CCDS46 GDSQLGQPKDQDGFSEMQGERLRPGLDSQKEKLPGKMSPKHDGLGTADSVCSRIIQDRVS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 -ADVLHECDSQQPGKDALIHAGTNPYKCKQCGKGFNRKWYLVRHQRVHTGMKPYECNACG
.: .:.:::. ::. .:. : .::..: : ::.: :.::.:.:.:.:::::. ::
CCDS46 LGDDVHDCDSHGSGKNPVIQEEENIFKCNECEKVFNKKRLLARHERIHSGVKPYECTECG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 KAFSQSSTLIRHYLIHTGEKPYKCLECGKAFKRRSYLMQHHPIHTGEKPYECSQCRKAFT
:.::.:. :..:...:::::::::.::::::.:.:.: ::. ::.:::::.::.: ::::
CCDS46 KTFSKSTYLLQHHMVHTGEKPYKCMECGKAFNRKSHLTQHQRIHSGEKPYKCSECGKAFT
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pF1KB8 HRSTFIRHNRTHTGEKPFECKECEKAFSNRAHLIQHYIIHTGEKPYDCMACGKAFRCSSE
:::::. :::.::::::: :::: ::: .: .:.:::::.::.::.:. :::.:. :
CCDS46 HRSTFVLHNRSHTGEKPFVCKECGKAFRDRPGFIRHYIIHSGENPYECFECGKVFKHRSY
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pF1KB8 LIQHQRIHTGEKPYECTQCGKAFHRSTYLIQHSVIHTGEMPYKCIECGKAFKRRSHLLQH
:. ::. :::::::::..::::: .:. ::.: :::::: :..:.::::::..::.: .:
CCDS46 LMWHQQTHTGEKPYECSECGKAFCESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRH
360 370 380 390 400 410
420
pF1KB8 QRVHT
::.::
CCDS46 QRIHTGEKPYVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGEKPFECKECGKAFSNRADLIRHFSIH
420 430 440 450 460 470
>--
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Smith-Waterman score: 744; 73.6% identity (84.3% similar) in 140 aa overlap (283-422:423-562)
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pF1KB8 HTGEKPYKCLECGKAFKRRSYLMQHHPIHTGEKPYECSQCRKAFTHRSTFIRHNRTHTGE
::::: ::.: ::::: :::: :.:.::::
CCDS46 HTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPYVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHTGE
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pF1KB8 KPFECKECEKAFSNRAHLIQHYIIHTGEKPYDCMACGKAFRCSSELIQHQRIHTGEKPYE
:::::::: ::::::: ::.:. ::::::::.:: ::::: : : .:::::.::::::
CCDS46 KPFECKECGKAFSNRADLIRHFSIHTGEKPYECMECGKAFNRRSGLTRHQRIHSGEKPYE
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380 390 400 410 420
pF1KB8 CTQCGKAFHRSTYLIQHSVIHTGEMPYKCIECGKAFKRRSHLLQHQRVHT
: .:::.: :: ::.::.::::: ::.: ::::::.: : : ::::.::
CCDS46 CIECGKTFCWSTNLIRHSIIHTGEKPYECSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGRNPISVTDV
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CCDS46 GRPFTSGQTSVNIQELLLGKNFLNVTTEENLLQEEASYMASDRTYQRETPQVSSL
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>>CCDS32991.1 ZNF599 gene_id:148103|Hs108|chr19 (588 aa)
initn: 1137 init1: 1137 opt: 1717 Z-score: 1081.0 bits: 209.5 E(32554): 6.8e-54
Smith-Waterman score: 1717; 59.6% identity (78.8% similar) in 416 aa overlap (8-422:5-418)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MAETKDAAQMLVTFKDVAVTFTREEWRQLDLAQRTLYREVMLETCGLLVSLGHRVPKPEL
: ::.:.::.:::: ::: .:::::::::.::::::: ::::::: ::::::
CCDS32 MAAPALALVSFEDVVVTFTGEEWGHLDLAQRTLYQEVMLETCRLLVSLGHPVPKPEL
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70 80 90 100 110 120
pF1KB8 VHLLEHGQELWIVKRGLSHATCAGDRAQVHTREPTTYPPVLSERAFLRGSLTLESSTSSD
..::::::::: ::::::..::::..:. . :::. ..::.. .. :. .:: :
CCDS32 IYLLEHGQELWTVKRGLSQSTCAGEKAKPKITEPTASQLAFSEESSFQELLAQRSSR--D
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB8 SRLGRARDEEGLLEMQKGKVTPETDLHKETHLGKVSLEGEGLGTDDGLHSRALQEWLSA-
::::.::::: :...:.:.. : :. ::: :.: . . : ::.: :.::: ..
CCDS32 SRLGQARDEEKLIKIQEGNLRPGTNPHKEICPEKLSYKHDDLEPDDSLGLRVLQERVTPQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 DVLHECDSQQPGKDALIHAGTNPYKCKQCGKGFNRKWYLVRHQRVHTGMKPYECNACGKA
:.::::::: :::: . : .::: : .:::::..:: :::::..:.:.:::::: ::::
CCDS32 DALHECDSQGPGKDPMTDARNNPYTCTECGKGFSKKWALVRHQQIHAGVKPYECNECGKA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 FSQSSTLIRHYLIHTGEKPYKCLECGKAFKRRSYLMQHHPIHTGEKPYECSQCRKAFTHR
. .:::. .:::::::::.::::::::: .: .:. ::::.:::::..: ::::::
CCDS32 CRYMADVIRHMRLHTGEKPYKCIECGKAFKRRFHLTEHQRIHTGDKPYECKECGKAFTHR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB8 STFIRHNRTHTGEKPFECKECEKAFSNRAHLIQHYIIHTGEKPYDCMACGKAFRCSSELI
:.::.:: ::: :::: :::: ::: . . ::. ::::.: :.: ::::: : .:
CCDS32 SSFIQHNMTHTREKPFLCKECGKAFYYSSSFAQHMRIHTGKKLYECGECGKAFTHRSTFI
300 310 320 330 340 350
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pF1KB8 QHQRIHTGEKPYECTQCGKAFHRSTYLIQHSVIHTGEMPYKCIECGKAFKRRSHLLQHQR
::. ::::::. : .:::.: .. . :: ::::: ::.: :::::: .:: ...:.:
CCDS32 QHNVTHTGEKPFLCKECGKTFCLNSSFTQHMRIHTGEKPYECGECGKAFTHRSTFIRHKR
360 370 380 390 400 410
420
pF1KB8 VHT
.::
CCDS32 THTGEKPFECKECGKAFCDSSSLIQHMRIHTGEKPYECSECGKAFTHHSVFIRHNRTHSG
420 430 440 450 460 470
>--
initn: 756 init1: 756 opt: 756 Z-score: 491.1 bits: 100.4 E(32554): 4.9e-21
Smith-Waterman score: 756; 59.5% identity (78.6% similar) in 168 aa overlap (255-422:419-586)
230 240 250 260 270 280
pF1KB8 HTGMKPYECNACGKAFSQSSTLIRHYLIHTGEKPYKCLECGKAFKRRSYLMQHHPIHTGE
::::..: :::::: : :.:: :::::
CCDS32 HTGEKPYECGECGKAFTHRSTFIRHKRTHTGEKPFECKECGKAFCDSSSLIQHMRIHTGE
390 400 410 420 430 440
290 300 310 320 330 340
pF1KB8 KPYECSQCRKAFTHRSTFIRHNRTHTGEKPFECKECEKAFSNRAHLIQHYIIHTGEKPYD
::::::.: :::::.:.::::::::.:.::.::::: ::: . . .:. ::::::::
CCDS32 KPYECSECGKAFTHHSVFIRHNRTHSGQKPLECKECAKAFYYSSSFTRHMRIHTGEKPYV
450 460 470 480 490 500
350 360 370 380 390 400
pF1KB8 CMACGKAFRCSSELIQHQRIHTGEKPYECTQCGKAFHRSTYLIQHSVIHTGEMPYKCIEC
: ::::: .....:.::::::::.:: .: ::: . : :: :::: :..: ::
CCDS32 CRECGKAFTQPANFVRHNRIHTGEKPFECKECEKAFCDNFALTQHMRTHTGEKPFECNEC
510 520 530 540 550 560
410 420
pF1KB8 GKAFKRRSHLLQHQRVHT
::.:.. : . .:...::
CCDS32 GKTFSHSSSFTHHRKIHTRV
570 580
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CCDS33 ELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTCEPALSEGISLQGQVT--QGNS
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CCDS33 LMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHYVIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRH
360 370 380 390 400 410
420
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::.::
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CCDS33 GRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL
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CCDS33 GIGPQRGKLLEKMSSERDGLGSDDGVCTKITQKQVSTEGDLYECDSHGPVTDALIREEKN
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CCDS33 SYKCEECGKVFKKNALLVQHERIHTQVKPYECTECGKTFSKSTHLLQHLIIHTGEKPYKC
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CCDS33 MECGKAFNRRSHLTRHQRIHSGEKPYKCSECGKAFTHRSTFVLHHRSHTGEKPFVCKECG
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CCDS33 KAFRDRPGFIRHYIIHTGEKPYECIECGKAFNRRSYLTWHQQIHTGVKPFECNECGKAFC
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CCDS46 GEKPYKYEKCGKAFISGSAFVKHGRIHTGEKPLKCKQCGKTISGSYQLTVHKSIHTGKKP
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CCDS46 YECGECGKAFLVYGKLTRHQSTHTGEKPFGCEECGKAFSTFSYLVQHQRIHTSEKPYECK
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CCDS46 ECGKAFSTSSPLAKHQRIHTGEKPYECKECGKSFTVYGQLTRHQSIHTGEKPFECKECGK
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CCDS46 AFRLSSFLHAHQRIHAEIKPYGCKECGRTFSRASYLVQHGRLHTGEKPYECKECGKAFST
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CCDS46 GSYLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFISRHQLTVHQRVHTGEKPYECKECGKAFRVHVHL
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CCDS46 KPYECKECGKAFRVHVHLTQHRKIHTDVKPYECKECGKTFSRASYLVQHSRIHTGKKPYE
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CCDS46 CKECGKAFSSGSYLVQHQRIHTGEKPYECNKCGKAFTVYGQLIGHQSVHTGEKPFECKEC
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CCDS46 GKAFRLNSFLTEHQRVHTGEKPFKCKKCGKTFRYSSALKVHLRKHMSVIP
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CCDS14 MPANGTSPQRFPALIPGEPGRSFEGSVSFEDVAVDFTRQEWHRLDPAQRTMHKDVMLETY
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pF1KB8 GLLVSLGHRVPKPELVHLLEHGQELWIVKRGLSHATCAGDRAQVHTREPTTYPPVLSERA
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CCDS14 SNLASVGLCVAKPEMIFKLERGEELWILEEESSGHGYSGSLSLLCGNGSVGDNALRHDND
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CCDS14 LLHHQKIQTLDQNVEYNGCRKAFHEKTGFV---RRKRTPRGDKNFECHECGKAYCRKSNL
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CCDS14 VEHLRIHT-GERPYECG----ECAKTFSARSYLIAHQKTHTGERPFECNECGKSFGRKSQ
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CCDS14 LILHTRTHTGERPYECTECGKTFSEKATLTIHQRTHTGEKPYECSECGKTFRVKISLTQH
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CCDS14 HRTHTGEKPYECGECGKNFRAKKSLNQHQRIHTGEKPYECGECGKFFRMKMTLNNHQRTH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]