Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8114
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8114, 324 aa
1>>>pF1KB8114 324 - 324 aa - 324 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1794+/-0.00073; mu= 13.4604+/- 0.044
mean_var=105.8885+/-21.326, 0's: 0 Z-trim(112.8): 50 B-trim: 238 in 1/51
Lambda= 0.124638
statistics sampled from 13435 (13485) to 13435 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.414), width: 16
Scan time: 2.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2439.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 324) 2163 398.9 2.9e-111
CCDS46519.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 ( 277) 1816 336.4 1.5e-92
CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 241) 573 112.9 2.7e-25
CCDS5946.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 ( 326) 573 113.0 3.4e-25
CCDS3048.1 DNAJB8 gene_id:165721|Hs108|chr3 ( 232) 494 98.7 4.9e-21
CCDS14008.1 DNAJB7 gene_id:150353|Hs108|chr22 ( 309) 476 95.5 5.8e-20
CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 ( 340) 395 81.0 1.5e-15
CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1 ( 337) 376 77.6 1.6e-14
CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 348) 362 75.1 9.3e-14
CCDS47959.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 420) 362 75.1 1.1e-13
CCDS47960.2 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 ( 462) 362 75.2 1.2e-13
CCDS8227.1 DNAJB13 gene_id:374407|Hs108|chr11 ( 316) 339 70.9 1.5e-12
>>CCDS2439.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 (324 aa)
initn: 2163 init1: 2163 opt: 2163 Z-score: 2111.1 bits: 398.9 E(32554): 2.9e-111
Smith-Waterman score: 2163; 100.0% identity (100.0% similar) in 324 aa overlap (1-324:1-324)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH
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CCDS24 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH
10 20 30 40 50 60
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pF1KB8 KREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFAELFDDL
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CCDS24 KREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFAELFDDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFPGHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRIT
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CCDS24 GPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFPGHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTP
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CCDS24 TRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAAGKKPAGGREAQHRRQGRPKAQHQDPGLGGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 ASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAAGKKPAGGREAQHRRQGRPKAQHQDPGLGGTQ
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KB8 EGARGEATKRSPSPEEKASRCLIL
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CCDS24 EGARGEATKRSPSPEEKASRCLIL
310 320
>>CCDS46519.1 DNAJB2 gene_id:3300|Hs108|chr2 (277 aa)
initn: 1816 init1: 1816 opt: 1816 Z-score: 1774.8 bits: 336.4 E(32554): 1.5e-92
Smith-Waterman score: 1816; 100.0% identity (100.0% similar) in 274 aa overlap (1-274:1-274)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH
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CCDS46 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFAELFDDL
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CCDS46 KREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFAELFDDL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 GPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFPGHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRIT
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CCDS46 GPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFPGHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 ASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAAGKKPAGGREAQHRRQGRPKAQHQDPGLGGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAAGKKPADVF
250 260 270
310 320
pF1KB8 EGARGEATKRSPSPEEKASRCLIL
>>CCDS47755.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 (241 aa)
initn: 666 init1: 392 opt: 573 Z-score: 567.7 bits: 112.9 E(32554): 2.7e-25
Smith-Waterman score: 760; 55.9% identity (73.9% similar) in 238 aa overlap (1-207:1-231)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH
:..:::.: : : :: .:::::::. ::.:::::::.::: ::.:::.:::::::::: .
CCDS47 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB8 KREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGP-GFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFA-ELFD
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CCDS47 KRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDS----PFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFE
70 80 90 100 110
120 130 140
pF1KB8 DLGPFSEL--QNRG-----SRHSGPFFTFSSSFP-------------------GH---SD
: :: .. . :: :: .: ::. :.:: :: ..
CCDS47 D--PFEDFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTS
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 FSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRITTRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVP
:::.::. : : : :.:.:::: .:.::.:::.::.:::::::::::::::::.::::
CCDS47 FSSTSFGGS-GMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGKE
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 DDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTPASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAA
CCDS47 QLLRLDNK
240
>>CCDS5946.1 DNAJB6 gene_id:10049|Hs108|chr7 (326 aa)
initn: 782 init1: 392 opt: 573 Z-score: 565.9 bits: 113.0 E(32554): 3.4e-25
Smith-Waterman score: 829; 48.8% identity (67.1% similar) in 328 aa overlap (1-290:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH
:..:::.: : : :: .:::::::. ::.:::::::.::: ::.:::.:::::::::: .
CCDS59 MVDYYEVLGVQRHASPEDIKKAYRKLALKWHPDKNPENKEEAERKFKQVAEAYEVLSDAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB8 KREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGP-GFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFA-ELFD
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CCDS59 KRDIYDKYGKEGLNGGGGGGSHFDS----PFEFGFTFRNPDDVFREFFGGRDPFSFDFFE
70 80 90 100 110
120 130 140
pF1KB8 DLGPFSEL--QNRG-----SRHSGPFFTFSSSFP-------------------GH---SD
: :: .. . :: :: .: ::. :.:: :: ..
CCDS59 D--PFEDFFGNRRGPRGSRSRGTGSFFSAFSGFPSFGSGFSSFDTGFTSFGSLGHGGLTS
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB8 FSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRITTRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVP
:::.::. : : : :.:.:::: .:.::.:::.::.:::::::::::::::::.:::::
CCDS59 FSSTSFGGS-GMGNFKSISTSTKMVNGRKITTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSLTINGVA
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB8 DDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTPASCPLDSD----LSEDE---DLQLAMAYS
:: ::. : :: :. .. .. .: . . : : :::.: : : .
CCDS59 DDDALAEERMRRGQN-ALPAQPAGLRPPKPPRPASLLRHAPHCLSEEEGEQDRPRAPGPW
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB8 LSEMEAAGKKPAGGREAQHRRQGRPKAQHQDPGLGGTQEGARGEATKRSPSPEEKASRCL
::: : .: :. :..:. : .
CCDS59 DPLASAAGLKEGGKRKKQKQREESKKKKSTKGNH
300 310 320
>>CCDS3048.1 DNAJB8 gene_id:165721|Hs108|chr3 (232 aa)
initn: 725 init1: 338 opt: 494 Z-score: 491.2 bits: 98.7 E(32554): 4.9e-21
Smith-Waterman score: 678; 53.5% identity (72.4% similar) in 228 aa overlap (1-207:1-222)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH
::.:::.: : ::: .:::::::. ::.::::::::::: :::::: :.::::::::..
CCDS30 MANYYEVLGVQASASPEDIKKAYRKLALRWHPDKNPDNKEEAEKKFKLVSEAYEVLSDSK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 KREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFAELFDDL
:: .::: : .. . : : : . :.:: :.::..::::::. :::. : :
CCDS30 KRSLYDRAGCDSWRAGG-GASTPYHSPFDTGYTF--RNPEDIFREFFGGLDPFSFEFWD-
70 80 90 100 110
130 140 150
pF1KB8 GPFSELQNRGSRHSG------------PFF--TFSS------SFPGHSDFSSSSFS-FSP
.::. ..::.: : : : .::: : .:. :::.::. :
CCDS30 SPFN--SDRGGRGHGLRGAFSAGFGEFPAFMEAFSSFNMLGCSGGSHTTFSSTSFGGSSS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 GAGAFRSVSTSTTFVQGRRITTRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDDLALGLELS
:...:.:: .:: ...:...::.::.:::::::::::::::::::.::
CCDS30 GSSGFKSVMSSTEMINGHKVTTKRIVENGQERVEVEEDGQLKSVTVNGKEQLKWMDSK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 RREQQPSVTSRSGGTQVQQTPASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAAGKKPAGGREA
>>CCDS14008.1 DNAJB7 gene_id:150353|Hs108|chr22 (309 aa)
initn: 522 init1: 367 opt: 476 Z-score: 471.9 bits: 95.5 E(32554): 5.8e-20
Smith-Waterman score: 590; 37.3% identity (64.6% similar) in 322 aa overlap (1-293:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDKH
:..:::.: . : :: .::::::.. ::.:::::::.::: ::.:::::::::::::. .
CCDS14 MVDYYEVLGLQRYASPEDIKKAYHKVALKWHPDKNPENKEEAERKFKEVAEAYEVLSNDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB8 KREIYDRYGREGLTGTGTG-PSRAEAGSGGPGFTFTFRSPEEVFREFFGSGDPFA-ELFD
::.:::.:: :::.: :. .. : : :::..:..::.:.: :::. ..:.
CCDS14 KRDIYDKYGTEGLNGGGSHFDDECEYG-------FTFHKPDDVFKEIFHERDPFSFHFFE
70 80 90 100 110
120 130 140 150
pF1KB8 DLGPFSELQNR-GS------RHSGPFFTFSSSFP------------------GHSDFSS-
: . .: :: :: : .: ::. .: .: :: ..:
CCDS14 D--SLEDLLNRPGSSYGNRNRDAGYFFSTASEYPIFEKFSSYDTGYTSQGSLGHEGLTSF
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB8 SSFSF-SPGAGAFRSVSTSTTFVQGRRITTRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDD
::..: . : . ::.:: .:.:: :.:..:.:. ::: :.:..:.: .:.: ..
CCDS14 SSLAFDNSGMDNYISVTTSDKIVNGRNINTKKIIESDQER-EAEDNGELTFFLVNSVANE
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 LALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQVQQTPASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAAGK
... : : : :. . : .. .. ... .:.: . .. . . . .::
CCDS14 EGFAKECSWRTQSFNNYSPNSHSS-KHVSQYTFVDND---EGGISWVTSNRDPPIFSAGV
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KB8 KPAGGREAQHRRQGRPKAQHQDPGLGGTQEGARGEATKRSPSPEEKASRCLIL
: .: :. ..:.. . :. ...
CCDS14 KEGGKRKKKKRKEVQKKSTKRNC
290 300
>>CCDS12312.1 DNAJB1 gene_id:3337|Hs108|chr19 (340 aa)
initn: 382 init1: 236 opt: 395 Z-score: 392.6 bits: 81.0 E(32554): 1.5e-15
Smith-Waterman score: 404; 38.7% identity (68.6% similar) in 194 aa overlap (4-194:5-185)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDK
::. : . :.:: ..::.::::.::..::::: . ::.::::.::::.::::
CCDS12 MGKDYYQTLGLARGASDEEIKRAYRRQALRYHPDKNKEPG--AEEKFKEIAEAYDVLSDP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 HKREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAG-SGGPGFTFTFRS-PEEVFREFFGSGDPFAELF
.::::.::::.::: :.: :: . .: ..: .:..::.. :. .: ::::. .:: .:
CCDS12 RKREIFDRYGEEGLKGSG--PSGGSGGGANGTSFSYTFHGDPHAMFAEFFGGRNPFDTFF
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 DDLGPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFP-GHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQG
. . ..: . :: :.:: : . :.. .:. : .: . . ..
CCDS12 GQRNG-----EEGMDIDDPF----SGFPMGMGGFTNVNFGRSRSAQEPARKKQDPPVTHD
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 RRITTRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDDLALGLELSRREQQPSVTSRSGGTQV
:.. ..:. . .....
CCDS12 LRVSLEEIYSGCTKKMKISHKRLNPDGKSIRNEDKILTIEVKKGWKEGTKITFPKEGDQT
170 180 190 200 210 220
>>CCDS684.1 DNAJB4 gene_id:11080|Hs108|chr1 (337 aa)
initn: 354 init1: 178 opt: 376 Z-score: 374.2 bits: 77.6 E(32554): 1.6e-14
Smith-Waterman score: 385; 34.6% identity (62.6% similar) in 246 aa overlap (4-246:5-230)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDK
:: :: . ..:: .:::::::..::..::::: . . ::.::::::::::::::
CCDS68 MGKDYYCILGIEKGASDEDIKKAYRKQALKFHPDKNKSPQ--AEEKFKEVAEAYEVLSDP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 HKREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFTFTFRS-PEEVFREFFGSGDPFAELFD
.::::::..:.::: : :.: . :.:: : .::.. :. .: :::...:: .:
CCDS68 KKREIYDQFGEEGLKG-GAGGTD---GQGGT-FRYTFHGDPHATFAAFFGGSNPFEIFFG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 DLGPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFPGHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQGRR
.. ... . :: .:. :. : . . : .:. .. . .. :
CCDS68 RRMGGGRDSEEMEIDGDPFSAFGFSMNG---YPRDRNSVGPS-----RLKQDPPVIHELR
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB8 ITTRRIMENGQERVEVEEDGQLKSVTINGVPDDLALGLELSR--REQQPSVTSRSGGTQV
.. ..:. . .:... . .:.. . .: : .:... .: . : :
CCDS68 VSLEEIYSGCTKRMKISRK-RLNADGRSYRSEDKILTIEIKKGWKEGTKITFPREG----
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB8 QQTPASCPLDSDLSEDEDLQLAMAYSLSEMEAAGKKPAGGREAQHRRQGRPKAQHQDPGL
..:: : : :
CCDS68 DETPNSIPADIVFIIKDKDHPKFKRDGSNIIYTAKISLREALCGCSINVPTLDGRNIPMS
230 240 250 260 270 280
>>CCDS35007.1 DNAJB5 gene_id:25822|Hs108|chr9 (348 aa)
initn: 340 init1: 157 opt: 362 Z-score: 360.4 bits: 75.1 E(32554): 9.3e-14
Smith-Waterman score: 362; 51.2% identity (75.2% similar) in 125 aa overlap (4-124:5-122)
10 20 30 40 50
pF1KB8 MASYYEILDVPRSASADDIKKAYRRKALQWHPDKNPDNKEFAEKKFKEVAEAYEVLSDK
::.:: .: .:. :.::::::. ::..::::: . . ::.::::.::::.::::
CCDS35 MGKDYYKILGIPSGANEDEIKKAYRKMALKYHPDKNKEPN--AEEKFKEIAEAYDVLSDP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB8 HKREIYDRYGREGLTGTGTGPSRAEAGSGGPGFTFTFRS-PEEVFREFFGSGDPFAELFD
.:: .::.::.::: :: : : .::.: .: .::.. :. .: :::...:: .:
CCDS35 KKRGLYDQYGEEGLK-TGGGTS---GGSSG-SFHYTFHGDPHATFASFFGGSNPFDIFFA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB8 D---LGPFSELQNRGSRHSGPFFTFSSSFPGHSDFSSSSFSFSPGAGAFRSVSTSTTFVQ
. :::
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