Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB8028
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8028, 1104 aa
1>>>pF1KB8028 1104 - 1104 aa - 1104 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1333+/-0.0012; mu= -3.1461+/- 0.072
mean_var=354.5340+/-72.567, 0's: 0 Z-trim(113.5): 50 B-trim: 164 in 1/50
Lambda= 0.068115
statistics sampled from 14125 (14162) to 14125 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.435), width: 16
Scan time: 4.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42804.1 PARD3B gene_id:117583|Hs108|chr2 (1104) 7441 746.1 9.9e-215
CCDS77511.1 PARD3B gene_id:117583|Hs108|chr2 (1205) 6086 613.0 1.3e-174
CCDS42805.1 PARD3B gene_id:117583|Hs108|chr2 (1136) 4842 490.7 7.7e-138
CCDS42806.1 PARD3B gene_id:117583|Hs108|chr2 (1143) 3147 324.2 1.1e-87
CCDS53509.1 PARD3 gene_id:56288|Hs108|chr10 (1244) 1045 117.6 1.7e-25
CCDS53513.1 PARD3 gene_id:56288|Hs108|chr10 ( 988) 1021 115.2 7.5e-25
CCDS53510.1 PARD3 gene_id:56288|Hs108|chr10 (1266) 1021 115.3 9.1e-25
CCDS53512.1 PARD3 gene_id:56288|Hs108|chr10 (1310) 1021 115.3 9.3e-25
CCDS53511.1 PARD3 gene_id:56288|Hs108|chr10 (1340) 1021 115.3 9.5e-25
>>CCDS42804.1 PARD3B gene_id:117583|Hs108|chr2 (1104 aa)
initn: 7441 init1: 7441 opt: 7441 Z-score: 3968.6 bits: 746.1 E(32554): 9.9e-215
Smith-Waterman score: 7441; 100.0% identity (100.0% similar) in 1104 aa overlap (1-1104:1-1104)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKVTVCFGRTGIVVPCKEGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MKVTVCFGRTGIVVPCKEGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PDDVLADVVEDKDKLIAVFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQLAAFKPIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PDDVLADVVEDKDKLIAVFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQLAAFKPIGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 EIEVTPSALKLGTPLLVRRSSDPVPGPPADTQPSASHPGGQSLKLVVPDSTQNLEDREVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EIEVTPSALKLGTPLLVRRSSDPVPGPPADTQPSASHPGGQSLKLVVPDSTQNLEDREVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NGVQTELLTSPRTKDTLSDMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NGVQTELLTSPRTKDTLSDMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RSKREGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEKSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RSKREGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEKSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IGSLNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTANLTGTDSPETDASASLQQNKSPRVPRLGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IGSLNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTANLTGTDSPETDASASLQQNKSPRVPRLGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 KPSSPSLSPLMGFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFVKNILPKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KPSSPSLSPLMGFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFVKNILPKGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 AIKDGRLQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGHFLPRELKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AIKDGRLQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGHFLPRELKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 EPDCCALSLETSEQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKSIIHGGAAFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EPDCCALSLETSEQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKSIIHGGAAFK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 DGRLRMNDQLIAVNGESLLGKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRRPERPMEDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DGRLRMNDQLIAVNGESLLGKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRRPERPMEDPA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 ECGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGTCSPQDKQKGLLLPNDGWAESEVPPSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ECGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGTCSPQDKQKGLLLPNDGWAESEVPPSPT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 PHSALGLGLEDYSHSSGVDSAVYFPDQHINFRSVTPARQPESINLKASKSMDLVPDESKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PHSALGLGLEDYSHSSGVDSAVYFPDQHINFRSVTPARQPESINLKASKSMDLVPDESKV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 HSLAGQKSESPSKDFGPTLGLKKSSSLESLQTAVAEVRKNDLPFHRPRPHMVRGRGCNES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HSLAGQKSESPSKDFGPTLGLKKSSSLESLQTAVAEVRKNDLPFHRPRPHMVRGRGCNES
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 FRAAIDKSYDGPEEIEADGLSDKSSHSGQGALNCESAPQGNSELEDMENKARKVKKTKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FRAAIDKSYDGPEEIEADGLSDKSSHSGQGALNCESAPQGNSELEDMENKARKVKKTKEK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 EKKKEKGKLKVKEKKRKEENEDPERKIKKKGFGAMLRFGKKKEDKGGKAEQKGTLKHGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EKKKEKGKLKVKEKKRKEENEDPERKIKKKGFGAMLRFGKKKEDKGGKAEQKGTLKHGGL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB8 REEELEKMKEERESGRPTGGSTDRIQKLRKEYYQARREGFPLYEDDEGRARPSEYDLLWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 REEELEKMKEERESGRPTGGSTDRIQKLRKEYYQARREGFPLYEDDEGRARPSEYDLLWV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB8 PGRGPDGNAHNLRFEGMERQYASLPRGGPADPVDYLPAAPRGLYKERELPYYPGAHPMHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PGRGPDGNAHNLRFEGMERQYASLPRGGPADPVDYLPAAPRGLYKERELPYYPGAHPMHP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB8 PKGSYPRPTELRVADLRYPQHYPPPPAPQHKGPFRQDVPPSPPQHQRMPAYQETGRPGPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PKGSYPRPTELRVADLRYPQHYPPPPAPQHKGPFRQDVPPSPPQHQRMPAYQETGRPGPR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KB8 GGSPDQYPYRTQDSRQKNPMTAAV
::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GGSPDQYPYRTQDSRQKNPMTAAV
1090 1100
>>CCDS77511.1 PARD3B gene_id:117583|Hs108|chr2 (1205 aa)
initn: 6066 init1: 6033 opt: 6086 Z-score: 3248.4 bits: 613.0 E(32554): 1.3e-174
Smith-Waterman score: 6701; 91.1% identity (91.1% similar) in 1136 aa overlap (1-1035:1-1136)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKVTVCFGRTGIVVPCKEGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MKVTVCFGRTGIVVPCKEGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PDDVLADVVEDKDKLIAVFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQLAAFKPIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PDDVLADVVEDKDKLIAVFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQLAAFKPIGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 EIEVTPSALKLGTPLLVRRSSDPVPGPPADTQPSASHPGGQSLKLVVPDSTQNLEDREVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EIEVTPSALKLGTPLLVRRSSDPVPGPPADTQPSASHPGGQSLKLVVPDSTQNLEDREVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NGVQTELLTSPRTKDTLSDMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NGVQTELLTSPRTKDTLSDMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RSKREGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEKSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RSKREGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEKSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IGSLNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTANLTGTDSPETDASASLQQNKSPRVPRLGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 IGSLNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTANLTGTDSPETDASASLQQNKSPRVPRLGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 KPSSPSLSPLMGFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFVKNILPKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KPSSPSLSPLMGFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFVKNILPKGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 AIKDGRLQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGHFLPRELKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AIKDGRLQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGHFLPRELKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 EPDCCALSLETSEQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKSIIHGGAAFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EPDCCALSLETSEQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKSIIHGGAAFK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 DGRLRMNDQLIAVNGESLLGKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRRPERPMEDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DGRLRMNDQLIAVNGESLLGKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRRPERPMEDPA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 ECGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGTCSPQDKQKGLLLPNDGWAESEVPPSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ECGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGTCSPQDKQKGLLLPNDGWAESEVPPSPT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 PHSALGLGLEDYSHSSGVDSAVYFPDQHINFRSVTPARQPESINLKASKSMDLVPDESKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PHSALGLGLEDYSHSSGVDSAVYFPDQHINFRSVTPARQPESINLKASKSMDLVPDESKV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 HSLAGQKSESPSKDFGPTLGLKKSSSLESLQTAVAEVRKNDLPFHRPRPHMVRGRGCNES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HSLAGQKSESPSKDFGPTLGLKKSSSLESLQTAVAEVRKNDLPFHRPRPHMVRGRGCNES
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 FRAAIDKSYDGPEEIEADGLSDKSSHSGQGALNCESAPQGNSELEDMENKARKVKKTKEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FRAAIDKSYDGPEEIEADGLSDKSSHSGQGALNCESAPQGNSELEDMENKARKVKKTKEK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 EKKKEKGKLKVKEKKRKEENEDPERKIKKKGFGAMLRFGKKKEDKGGKAEQKGTLKHGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EKKKEKGKLKVKEKKRKEENEDPERKIKKKGFGAMLRFGKKKEDKGGKAEQKGTLKHGGL
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB8 REEELEKMKEERE-----------------------------------------------
:::::::::::::
CCDS77 REEELEKMKEERERIGAKHQELREKQARGLLDYATGAIGSVYDMDDDEMDPNYARVNHFR
910 920 930 940 950 960
pF1KB8 ------------------------------------------------------SGRPTG
::::::
CCDS77 EPCTSANVFRSPSPPRAGPFGYPRDGHPLSPERDHLEGLYAKVNKPYHPLVPADSGRPTG
970 980 990 1000 1010 1020
920 930 940 950 960 970
pF1KB8 GSTDRIQKLRKEYYQARREGFPLYEDDEGRARPSEYDLLWVPGRGPDGNAHNLRFEGMER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GSTDRIQKLRKEYYQARREGFPLYEDDEGRARPSEYDLLWVPGRGPDGNAHNLRFEGMER
1030 1040 1050 1060 1070 1080
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KB8 QYASLPRGGPADPVDYLPAAPRGLYKERELPYYPGAHPMHPPKGSYPRPTELRVADLRYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QYASLPRGGPADPVDYLPAAPRGLYKERELPYYPGAHPMHPPKGSYPRPTELRVADLRYP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KB8 QHYPPPPAPQHKGPFRQDVPPSPPQHQRMPAYQETGRPGPRGGSPDQYPYRTQDSRQKNP
CCDS77 QHYPPPPAPQHKGPFRQDVPPSPPQHQRMPAYQETGRPGPRGGSPDQYPYRTQDSRQKNP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
>>CCDS42805.1 PARD3B gene_id:117583|Hs108|chr2 (1136 aa)
initn: 6217 init1: 4821 opt: 4842 Z-score: 2588.1 bits: 490.7 E(32554): 7.7e-138
Smith-Waterman score: 6617; 85.9% identity (85.9% similar) in 1205 aa overlap (1-1104:1-1136)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKVTVCFGRTGIVVPCKEGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MKVTVCFGRTGIVVPCKEGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB8 PDDVLADVVEDKDKLIAVFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQLAAFKPIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PDDVLADVVEDKDKLIAVFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQLAAFKPIGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB8 EIEVTPSALKLGTPLLVRRSSDPVPGPPADTQPSASHPGGQSLKLVVPDSTQNLEDREVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EIEVTPSALKLGTPLLVRRSSDPVPGPPADTQPSASHPGGQSLKLVVPDSTQNLEDREVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 NGVQTELLTSPRTKDTLSDMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NGVQTELLTSPRTKDTLSDMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 RSKREGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEKSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RSKREGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEKSV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 IGSLNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTANLTGTDSPETDASASLQQNKSPRVPRLGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IGSLNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTANLTGTDSPETDASASLQQNKSPRVPRLGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB8 KPSSPSLSPLMGFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFVKNILPKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KPSSPSLSPLMGFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFVKNILPKGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 AIKDGRLQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGHFLPRELKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AIKDGRLQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGHFLPRELKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB8 EPDCCALSLETSEQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKSIIHGGAAFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EPDCCALSLETSEQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKSIIHGGAAFK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB8 DGRLRMNDQLIAVNGESLLGKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRRPERPMEDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DGRLRMNDQLIAVNGESLLGKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRRPERPMEDPA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB8 ECGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGTCSPQDKQKGLLLPNDGWAESEVPPSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ECGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGTCSPQDKQKGLLLPNDGWAESEVPPSPT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB8 PHSALGLGLEDYSHSSGVDSAVYFPDQHINFRSVTPARQPESINLKASKSMDLVPDESKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PHSALGLGLEDYSHSSGVDSAVYFPDQHINFRSVTPARQPESINLKASKSMDLVPDESKV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB8 HSLAGQKSESPSKDFGPTLGLKKSSSLESLQTAVAEVRKNDLPFHRPRPHMVRGRGCNES
::::::::
CCDS42 HSLAGQKS----------------------------------------------------
790 800 810 820 830 840
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EKKKEKGKLKVKEKKRKEENEDPERKIKKKGFGAMLRFGKKKEDKGGKAEQKGTLKHGGL
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910
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:::::::::::::
CCDS42 REEELEKMKEERERIGAKHQELREKQARGLLDYATGAIGSVYDMDDDEMDPNYARVNHFR
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CCDS42 GSTDRIQKLRKEYYQARREGFPLYEDDEGRARPSEYDLLWVPGRGPDGNAHNLRFEGMER
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QYASLPRGGPADPVDYLPAAPRGLYKERELPYYPGAHPMHPPKGSYPRPTELRVADLRYP
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CCDS42 MTAAV
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CCDS42 MKVTVCFGRTGIVVPCKEGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILD
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CCDS42 PDDVLADVVEDKDKLIAVFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQLAAFKPIGG
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CCDS42 RSKREGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEKSV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS42 MTAAV
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::.: ::..:::.:.:::.::.: : .. :.. . :::. : .:.... ..::.:
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: . : .. ::. .:.. . . : . :: :.::.. ::. ..:::
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:::::::: :. .:: :::... .: ......:.::.::.:::.::. :: .. : :::
CCDS53 LGIHVVPF-SARGGRTLGLLVKRLEKGGKAEHENLFRENDCIVRINDGDLRNRRFEQAQH
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pF1KB8 VFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEK-SVIGSLNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTA
.:::::..: . .::.: :.::::. : . : ... . . . ...::.:.
CCDS53 MFRQAMRTPIIWFHVVPAANKEQYEQLSQSEKNNYYSSRFSPDSQYIDNRSVNSAGLHTV
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. . . :: :. . : .. : : ::.:. .: :....: .:
CCDS53 QRAPRLNHPPEQIDSHSRLPHSAHPS----GKPPSAPASAPQNVFSTTVSSGYNTKKIGK
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...:.:::: :::::....:: .: : .::.::::::.::::.::::..:::..:::: :
CCDS53 RLNIQLKKGTEGLGFSITSRDVTIGGSAPIYVKNILPRGAAIQDGRLKAGDRLIEVNGVD
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450 460 470 480 490
pF1KB8 VTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGHFLPRELKGEPDCCALSLE-TSEQLTFEI
..:..:::.:..:::::. :.::.. ::: : :::::.: . .:. . : : ::::.
CCDS53 LVGKSQEEVVSLLRSTKMEGTVSLLVFRQEDAFHPRELKAEDEDIVLTPDGTREFLTFEV
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pF1KB8 PLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKSIIHGGAAFKDGRLRMNDQLIAVNGESLL
:::::::::::::.:::.:.:. .:::::.::::.:::: ::::::.:::::::::::::
CCDS53 PLNDSGSAGLGVSVKGNRSKENHADLGIFVKSIINGGAASKDGRLRVNDQLIAVNGESLL
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pF1KB8 GKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRR---------------PERPME---DPAE
::.:..:::::::::: ::: ::::::.. :: :: :.: : :
CCDS53 GKTNQDAMETLRRSMSTEGNKRGMIQLIVARRISKCNELKSPGSPPGPELPIETALDDRE
600 610 620 630 640 650
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pF1KB8 CGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGTCS-------PQDKQKGLLLPNDGWAESE
.:. . . .. . :: .. . .: . ::: ... .:
CCDS53 -RRISHSLYSGIEGLDESPSRN-AALSRIMGKYQLSPTVNMPQDDT--VIIEDDRLPV--
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660 670 680 690 700
pF1KB8 VPP------SPTPHSALGLGLED---YSHSSGVDSA--VYFPDQH--INFRSVTPARQPE
.:: : . :. .:. : ..... ::: :: . :. .::
CCDS53 LPPHLSDQSSSSSHDDVGFVTADAGTWAKAAISDSADCSLSPDVDPVLAFQREGFGRQ--
710 720 730 740 750 760
710 720 730 740 750
pF1KB8 SINLKASKSMDLVPDESKVHSLAGQKSES------PSKDFGPTLGLKKSSSLESLQTAVA
:.. : .:... : :.. . .::.: ::.: ::.:::::::::::::::::
CCDS53 SMSEKRTKQFS---DASQLDFVKTRKSKSMDLGSSPSRDVGPSLGLKKSSSLESLQTAVA
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pF1KB8 EVRKN-DLPFHRPRPHMVRGRGCNESFRAAIDKSYDGP---------EEIEADGLSDKSS
:: : :.:::::::...:::::::::::::::::: : : .: : ...::
CCDS53 EVTLNGDIPFHRPRPRIIRGRGCNESFRAAIDKSYDKPAVDDDDEGMETLEED--TEESS
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pF1KB8 HSGQGALNCES-APQ--------GNSELEDMENKAR-KVKKTKEKEKKKEKGKLKVKE--
.::. ... : :. ::.: : .. . :. : :.:.. ::: :.:.:.
CCDS53 RSGRESVSTASDQPSHSLERQMNGNQEKGDKTDRKKDKTGKEKKKDRDKEKDKMKAKKGM
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pF1KB8 --------KKRKEENEDPERKIKKKGFGAMLRFGKK--KEDK---GGKAEQKGTL-----
. . . : ::. ... .. . : . .:. :: . .:..
CCDS53 LKGLGDMFRIQAKTREFRERQARERDYAEIQDFHRTFGCDDELMYGGVSSYEGSMALNAR
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pF1KB8 ----KHGGLREEELEKMKEER-------ESGRPTGGSTDRIQKLRKEYYQARREGFPLYE
..: . . ..:. : .:.: : .. ::::.::.:. ::... :
CCDS53 PQSPREGHMMDALYAQVKKPRNSKPSPVDSNRSTPSNHDRIQRLRQEFQQAKQD-----E
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pF1KB8 DDEGRARPSEYDLLWVPGRGP--DGNAHNLRFE-GMERQYASLPRGGPADPVDYLPAAPR
: : : : .. : :. : ... :.. : :.::
CCDS53 DVEDRRRTYSFEQPW-PNARPATQSGRHSVSVEVQMQRQRQEERESSQQAQRQYSSLPRQ
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pF1KB8 GLYKERELPYYPGAHPMHPPKGSYPRPTELRVADLRYPQHYPPPPAPQHKGPFRQDVPPS
CCDS53 SRKNASSVSQDSWEQNYSPGEGFQSAKENPRYSSYQGSRNGYLGGHGFNARVMLETQELL
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pF1KB8 EGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILDPDDVLADVVEDKDKLIA
.:.::. :::::: ::.: ::..:::.:.:
CCDS53 DGHMKVFSLIQQAVTRYRKAIAKDPNYWIQVHRLEHGDGGILDLDDILCDVADDKDRLVA
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pF1KB8 VFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQ-LAAFKPIGG--EIEVTPSALKLGTP
::.::.: : .. :.. . :::. : .:.... ..::.: . :::::::.:. . :
CCDS53 VFDEQDPHHGGDGTSASSTGTQSPEIFGSELGTNNVSAFQPYQATSEIEVTPSVLRANMP
80 90 100 110 120 130
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pF1KB8 LLVRRSSDPV-----------------PG---P---------------------------
: :::::::. :. :
CCDS53 LHVRRSSDPALIGLSTSVSDSNFSSEEPSRKNPTRWSTTAGFLKQNTAGSPKTCDRKKDE
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180
pF1KB8 -----PADTQP--------------SASHPG-GQSLKLVVPDSTQNLEDR---EVLNGVQ
: ::. ::::: :. :. : . :: : .. ..
CCDS53 NYRSLPRDTSNWSNQFQRDNARSSLSASHPMVGKWLEKQEQDEDGTEEDNSRVEPVGHAD
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TELLTSPRTKDTLSDMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNSRSKR
: : : .:.::.. ::. ..::::::::::: :. .:: :::... .: ......
CCDS53 TGLEHIPNF--SLDDMVKLVEVPNDGGPLGIHVVPF-SARGGRTLGLLVKRLEKGGKAEH
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEK-SVIGS
:.::.::.:::.::. :: .. : ::: .:::::..: . .::.: :.::::. : .
CCDS53 ENLFRENDCIVRINDGDLRNRRFEQAQHMFRQAMRTPIIWFHVVPAANKEQYEQLSQSEK
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTANLTG--TDSPET-DASASLQQNKSPRVPRLGG
: ... . . . ...::.:.. . . :: :. . : .. : :
CCDS53 NNYYSSRFSPDSQYIDNRSVNSAGLHTVQRAPRLNHPPEQIDSHSRLPHSAHPS----GK
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410
pF1KB8 KPSSPSLSPLM--------GFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFV
::.:. .: :....: .:...:.:::: :::::....:: .: : .::.:
CCDS53 PPSAPASAPQNVFSTTVSSGYNTKKIGKRLNIQLKKGTEGLGFSITSRDVTIGGSAPIYV
440 450 460 470 480 490
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pF1KB8 KNILPKGAAIKDGRLQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGH
:::::.::::.::::..:::..:::: :..:..:::.:..:::::. :.::.. :::
CCDS53 KNILPRGAAIQDGRLKAGDRLIEVNGVDLVGKSQEEVVSLLRSTKMEGTVSLLVFRQEDA
500 510 520 530 540 550
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pF1KB8 FLPRELKGEPDCCALSLE-TSEQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKS
: :::::.: . .:. . : : ::::.:::::::::::::.:::.:.:. .:::::.::
CCDS53 FHPRELKAEDEDIVLTPDGTREFLTFEVPLNDSGSAGLGVSVKGNRSKENHADLGIFVKS
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540 550 560 570 580 590
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::.:::: ::::::.:::::::::::::::.:..:::::::::: ::: ::::::.. ::
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:: :.: : : .:. . . .. . :: .. . .:
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:: . .:.: . :.. : :: : : : ::. :.. . .
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.. :..: .: . .. . ::.:.... ::. :::.: ::.:
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:::::::::::::::::: : :.:::::::...:::::::::::::::::: :
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: .: : ...::.::. ... : ..: ..:... .: :: ..::.:
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::::. ...: . : :: ::.: :. ..: : .:
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pF1KB8 NFR----------SVTPARQPESINLKASKSMDLVPDESKVHSLAGQKSESPSKDFGPTL
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CCDS53 NNYYSSRFSPDSQYIDNRSVNSAGLHTVQRAPRLNHPPEQIDSHSRLPHSAHPS----GK
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