Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7891
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7891, 588 aa
1>>>pF1KB7891 588 - 588 aa - 588 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1536+/-0.000938; mu= 1.3024+/- 0.057
mean_var=374.2413+/-76.195, 0's: 0 Z-trim(116.5): 46 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.066298
statistics sampled from 17037 (17077) to 17037 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.801), E-opt: 0.2 (0.525), width: 16
Scan time: 4.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1971.1 TCF7L1 gene_id:83439|Hs108|chr2 ( 588) 4010 397.4 2.7e-110
CCDS73197.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 579) 2082 213.0 8.6e-55
CCDS73196.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 476) 2068 211.5 1.9e-54
CCDS55729.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 459) 2031 208.0 2.2e-53
CCDS7576.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 596) 2031 208.1 2.6e-53
CCDS53577.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 602) 1601 167.0 6.2e-41
CCDS81504.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 455) 1522 159.3 9.7e-39
CCDS73198.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 408) 1411 148.6 1.4e-35
CCDS53578.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 ( 489) 1385 146.2 8.9e-35
CCDS3679.1 LEF1 gene_id:51176|Hs108|chr4 ( 399) 813 91.4 2.3e-18
CCDS47123.1 LEF1 gene_id:51176|Hs108|chr4 ( 371) 734 83.8 4.1e-16
CCDS47122.1 LEF1 gene_id:51176|Hs108|chr4 ( 386) 734 83.9 4.2e-16
CCDS54791.1 LEF1 gene_id:51176|Hs108|chr4 ( 303) 731 83.5 4.4e-16
CCDS4170.1 TCF7 gene_id:6932|Hs108|chr5 ( 269) 670 77.6 2.3e-14
CCDS4169.1 TCF7 gene_id:6932|Hs108|chr5 ( 384) 670 77.7 2.9e-14
CCDS47263.2 TCF7 gene_id:6932|Hs108|chr5 ( 269) 661 76.7 4.2e-14
CCDS43362.1 TCF7 gene_id:6932|Hs108|chr5 ( 268) 656 76.2 5.8e-14
>>CCDS1971.1 TCF7L1 gene_id:83439|Hs108|chr2 (588 aa)
initn: 4010 init1: 4010 opt: 4010 Z-score: 2093.7 bits: 397.4 E(32554): 2.7e-110
Smith-Waterman score: 4010; 100.0% identity (100.0% similar) in 588 aa overlap (1-588:1-588)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPQLGGGGGGGGGGSGGGGGSSAGAAGGGDDLGANDELIPFQDEGGEEQEPSSDSASAQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 MPQLGGGGGGGGGGSGGGGGSSAGAAGGGDDLGANDELIPFQDEGGEEQEPSSDSASAQR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DLDEVKSSLVNESENQSSSSDSEAERRPQPVRDTFQKPRDYFAEVRRPQDSAFFKGPPYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 DLDEVKSSLVNESENQSSSSDSEAERRPQPVRDTFQKPRDYFAEVRRPQDSAFFKGPPYP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GYPFLMIPDLSSPYLSNGPLSPGGARTYLQMKWPLLDVPSSATVKDTRSPSPAHLSNKVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 GYPFLMIPDLSSPYLSNGPLSPGGARTYLQMKWPLLDVPSSATVKDTRSPSPAHLSNKVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VVQHPHHMHPLTPLITYSNDHFSPGSPPTHLSPEIDPKTGIPRPPHPSELSPYYPLSPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 VVQHPHHMHPLTPLITYSNDHFSPGSPPTHLSPEIDPKTGIPRPPHPSELSPYYPLSPGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VGQIPHPLGWLVPQQGQPMYSLPPGGFRHPYPALAMNASMSSLVSSRFSPHMVAPAHPGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 VGQIPHPLGWLVPQQGQPMYSLPPGGFRHPYPALAMNASMSSLVSSRFSPHMVAPAHPGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 PTSGIPHPAIVSPIVKQEPAPPSLSPAVSVKSPVTVKKEEEKKPHVKKPLNAFMLYMKEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 PTSGIPHPAIVSPIVKQEPAPPSLSPAVSVKSPVTVKKEEEKKPHVKKPLNAFMLYMKEM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 RAKVVAECTLKESAAINQILGRKWHNLSREEQAKYYELARKERQLHSQLYPTWSARDNYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 RAKVVAECTLKESAAINQILGRKWHNLSREEQAKYYELARKERQLHSQLYPTWSARDNYG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 KKKKRKREKQLSQTQSQQQVQEAEGALASKSKKPCVQYLPPEKPCDSPASSHGSMLDSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 KKKKRKREKQLSQTQSQQQVQEAEGALASKSKKPCVQYLPPEKPCDSPASSHGSMLDSPA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 TPSAALASPAAPAATHSEQAQPLSLTTKPETRAQLALHSAAFLSAKAAASSSGQMGSQPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 TPSAALASPAAPAATHSEQAQPLSLTTKPETRAQLALHSAAFLSAKAAASSSGQMGSQPP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KB7 LLSRPLPLGSMPTALLASPPSFPATLHAHQALPVLQAQPLSLVTKSAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS19 LLSRPLPLGSMPTALLASPPSFPATLHAHQALPVLQAQPLSLVTKSAH
550 560 570 580
>>CCDS73197.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 (579 aa)
initn: 1211 init1: 866 opt: 2082 Z-score: 1097.2 bits: 213.0 E(32554): 8.6e-55
Smith-Waterman score: 2294; 61.9% identity (77.6% similar) in 585 aa overlap (27-586:7-577)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPQLGGGGGGGGGGSGGGGGSSAGAAGGGDDLGANDELIPFQDEGGEEQEPSSDSASAQR
::::::::::::: :.::: :..: ::...::.:
CCDS73 MPQLNGGGGDDLGANDELISFKDEG-EQEEKSSENSSAER
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB7 DLDEVKSSLVNESE-NQSSSSDSEAERRPQPVRDTFQ-KPRDYFAEVRRPQDSAFFKGPP
:: .:::::::::: ::.::::::::::: : ..:. : :. . :. . ::...:::::
CCDS73 DLADVKSSLVNESETNQNSSSDSEAERRPPPRSESFRDKSRESLEEAAKRQDGGLFKGPP
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YPGYPFLMIPDLSSPYLSNGPLSPGGARTYLQMKWPLLDVP-----SSATVKDTRSPSPA
::::::.:::::.:::: :: ::: :::::::::::::: : ..::.::::::
CCDS73 YPGYPFIMIPDLTSPYLPNGSLSPT-ARTYLQMKWPLLDVQAGSLQSRQALKDARSPSPA
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HL-SNKVPVVQHPHHMHPLTPLITYSNDHFSPGSPPTHLSPEIDPKTGIPRPPHPSELSP
:. ::::::::::::.:::::::::::.::.::.:: :: ..:::::::::::: ..::
CCDS73 HIVSNKVPVVQHPHHVHPLTPLITYSNEHFTPGNPPPHLPADVDPKTGIPRPPHPPDISP
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YYPLSPGAVGQIPHPLGWLVPQQGQPMYSLPPGGFRHPYP-ALAMNASMSSLVSSRFSPH
:::::::.::::::::::::::::::.: . :::::::: ::..::::: :: ::
CCDS73 YYPLSPGTVGQIPHPLGWLVPQQGQPVYPITTGGFRHPYPTALTVNASMS-----RFPPH
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 MVAPAHPGLPTSGIPHPAIVSPIVKQEPAPPSLSPAVSVKSPVTVKKEEEKKPHVKKPLN
:: : : : :.::::::::.: :::: . ... : : . :.::.::::.:::::
CCDS73 MVPPHHT-LHTTGIPHPAIVTPTVKQESSQSDVGSLHSSKHQDSKKEEEKKKPHIKKPLN
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 AFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRKWHNLSREEQAKYYELARKERQLHSQLYP
:::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::::::::::::::::::: ::::
CCDS73 AFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYP
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460
pF1KB7 TWSARDNYGKKKKRKREKQLSQTQSQQQVQEAEGALA----------SKSKKPCVQYLPP
:::::::::::::::.:: ..:.. . .. .. .. . :: ::.:.
CCDS73 GWSARDNYGKKKKRKRDKQPGETNDLSAPKKCRARFGLDQQNNWCGPCRRKKKCVRYIQG
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 EKPCDSPASSHGSMLDSPATPSAALASPAAPAATHSEQAQPLSLTTKPETRAQLALHSA-
: : :: :: ::.:::: :.:: : ...::.:::::. ::. :.:..
CCDS73 EGSCLSPPSSDGSLLDSPPPSPNLLGSPPRDAKSQTEQTQPLSLSLKPDPLAHLSMMPPP
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570
pF1KB7 -AFLSAKAA--ASSSGQMGSQ--PPLLSRPLPLGSMPTALLASPPSFPATLHAHQALPVL
:.: :.:. ::. :. :: .: . :.. .:.: . ..::.:..:
CCDS73 PALLLAEATHKASALCPNGALDLPPAALQP----AAPSSSIAQPST--SSLHSHSSLAGT
520 530 540 550 560
580
pF1KB7 QAQPLSLVTKSAH
: :::::::::
CCDS73 QPQPLSLVTKSLE
570
>>CCDS73196.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 (476 aa)
initn: 1771 init1: 1328 opt: 2068 Z-score: 1091.0 bits: 211.5 E(32554): 1.9e-54
Smith-Waterman score: 2073; 69.6% identity (83.6% similar) in 451 aa overlap (27-468:7-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPQLGGGGGGGGGGSGGGGGSSAGAAGGGDDLGANDELIPFQDEGGEEQEPSSDSASAQR
::::::::::::: :.::: :..: ::...::.:
CCDS73 MPQLNGGGGDDLGANDELISFKDEG-EQEEKSSENSSAER
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB7 DLDEVKSSLVNESE-NQSSSSDSEAERRPQPVRDTFQ-KPRDYFAEVRRPQDSAFFKGPP
:: .:::::::::: ::.::::::::::: : ..:. : :. . :. . ::...:::::
CCDS73 DLADVKSSLVNESETNQNSSSDSEAERRPPPRSESFRDKSRESLEEAAKRQDGGLFKGPP
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YPGYPFLMIPDLSSPYLSNGPLSPGGARTYLQMKWPLLDVP-----SSATVKDTRSPSPA
::::::.:::::.:::: :: ::: :::::::::::::: : ..::.::::::
CCDS73 YPGYPFIMIPDLTSPYLPNGSLSPT-ARTYLQMKWPLLDVQAGSLQSRQALKDARSPSPA
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HL-SNKVPVVQHPHHMHPLTPLITYSNDHFSPGSPPTHLSPEIDPKTGIPRPPHPSELSP
:. ::::::::::::.:::::::::::.::.::.:: :: ..:::::::::::: ..::
CCDS73 HIVSNKVPVVQHPHHVHPLTPLITYSNEHFTPGNPPPHLPADVDPKTGIPRPPHPPDISP
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YYPLSPGAVGQIPHPLGWLVPQQGQPMYSLPPGGFRHPYP-ALAMNASMSSLVSSRFSPH
:::::::.::::::::::::::::::.: . :::::::: ::..::::::..:::: ::
CCDS73 YYPLSPGTVGQIPHPLGWLVPQQGQPVYPITTGGFRHPYPTALTVNASMSSFLSSRFPPH
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 MVAPAHPGLPTSGIPHPAIVSPIVKQEPAPPSLSPAVSVKSPVTVKKEEEKKPHVKKPLN
:: : : : :.::::::::.: :::: . ... : : . :.::.::::.:::::
CCDS73 MVPPHHT-LHTTGIPHPAIVTPTVKQESSQSDVGSLHSSKHQDSKKEEEKKKPHIKKPLN
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 AFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRKWHNLSREEQAKYYELARKERQLHSQLYP
:::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::::::::::::::::::: ::::
CCDS73 AFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYP
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 TWSARDNYGKKKKRKREKQLSQTQSQQQVQEAEGALASKSKKPCVQYLPPEKPCDSPASS
:::::::::::::::.:: ..:. ...: : .::.. ::: ..:
CCDS73 GWSARDNYGKKKKRKRDKQPGETN-----EHSECFL-----NPCLS-LPPITDLSAPKKC
400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 HGSMLDSPATPSAALASPAAPAATHSEQAQPLSLTTKPETRAQLALHSAAFLSAKAAASS
CCDS73 RARFGLDQQNNWCGPCRCKYSKEVSGTVRA
450 460 470
>>CCDS55729.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 (459 aa)
initn: 1794 init1: 842 opt: 2031 Z-score: 1072.1 bits: 208.0 E(32554): 2.2e-53
Smith-Waterman score: 2036; 69.0% identity (82.5% similar) in 451 aa overlap (27-468:7-438)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPQLGGGGGGGGGGSGGGGGSSAGAAGGGDDLGANDELIPFQDEGGEEQEPSSDSASAQR
::::::::::::: :.::: :..: ::...::.:
CCDS55 MPQLNGGGGDDLGANDELISFKDEG-EQEEKSSENSSAER
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB7 DLDEVKSSLVNESE-NQSSSSDSEAERRPQPVRDTFQ-KPRDYFAEVRRPQDSAFFKGPP
:: .:::::::::: ::.::::::::::: : ..:. : :. . :. . ::...:::::
CCDS55 DLADVKSSLVNESETNQNSSSDSEAERRPPPRSESFRDKSRESLEEAAKRQDGGLFKGPP
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YPGYPFLMIPDLSSPYLSNGPLSPGGARTYLQMKWPLLDVP-----SSATVKDTRSPSPA
::::::.:::::.:::: :: ::: :::::::::::::: : ..::.::::::
CCDS55 YPGYPFIMIPDLTSPYLPNGSLSPT-ARTYLQMKWPLLDVQAGSLQSRQALKDARSPSPA
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HL-SNKVPVVQHPHHMHPLTPLITYSNDHFSPGSPPTHLSPEIDPKTGIPRPPHPSELSP
:. ::::::::::::.:::::::::::.::.::.:: :: ..:::::::::::: ..::
CCDS55 HIVSNKVPVVQHPHHVHPLTPLITYSNEHFTPGNPPPHLPADVDPKTGIPRPPHPPDISP
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YYPLSPGAVGQIPHPLGWLVPQQGQPMYSLPPGGFRHPYP-ALAMNASMSSLVSSRFSPH
:::::::.::::::::::::::::::.: . :::::::: ::..::::: :: ::
CCDS55 YYPLSPGTVGQIPHPLGWLVPQQGQPVYPITTGGFRHPYPTALTVNASMS-----RFPPH
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 MVAPAHPGLPTSGIPHPAIVSPIVKQEPAPPSLSPAVSVKSPVTVKKEEEKKPHVKKPLN
:: : : : :.::::::::.: :::: . ... : : . :.::.::::.:::::
CCDS55 MVPPHHT-LHTTGIPHPAIVTPTVKQESSQSDVGSLHSSKHQDSKKEEEKKKPHIKKPLN
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 AFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRKWHNLSREEQAKYYELARKERQLHSQLYP
:::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::::::::::::::::::: ::::
CCDS55 AFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYP
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 TWSARDNYGKKKKRKREKQLSQTQSQQQVQEAEGALASKSKKPCVQYLPPEKPCDSPASS
:::::::::::::::.:: ..:. ...: : .::.. ::: ..:
CCDS55 GWSARDNYGKKKKRKRDKQPGETN-----EHSECFL-----NPCLS-LPPITDLSAPKKC
400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 HGSMLDSPATPSAALASPAAPAATHSEQAQPLSLTTKPETRAQLALHSAAFLSAKAAASS
CCDS55 RARFGLDQQNNWCGPCSL
450
>>CCDS7576.1 TCF7L2 gene_id:6934|Hs108|chr10 (596 aa)
initn: 1211 init1: 842 opt: 2031 Z-score: 1070.7 bits: 208.1 E(32554): 2.6e-53
Smith-Waterman score: 2265; 60.3% identity (75.1% similar) in 602 aa overlap (27-586:7-594)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPQLGGGGGGGGGGSGGGGGSSAGAAGGGDDLGANDELIPFQDEGGEEQEPSSDSASAQR
::::::::::::: :.::: :..: ::...::.:
CCDS75 MPQLNGGGGDDLGANDELISFKDEG-EQEEKSSENSSAER
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB7 DLDEVKSSLVNESE-NQSSSSDSEAERRPQPVRDTFQ-KPRDYFAEVRRPQDSAFFKGPP
:: .:::::::::: ::.::::::::::: : ..:. : :. . :. . ::...:::::
CCDS75 DLADVKSSLVNESETNQNSSSDSEAERRPPPRSESFRDKSRESLEEAAKRQDGGLFKGPP
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YPGYPFLMIPDLSSPYLSNGPLSPGGARTYLQMKWPLLDVP-----SSATVKDTRSPSPA
::::::.:::::.:::: :: ::: :::::::::::::: : ..::.::::::
CCDS75 YPGYPFIMIPDLTSPYLPNGSLSPT-ARTYLQMKWPLLDVQAGSLQSRQALKDARSPSPA
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HL-SNKVPVVQHPHHMHPLTPLITYSNDHFSPGSPPTHLSPEIDPKTGIPRPPHPSELSP
:. ::::::::::::.:::::::::::.::.::.:: :: ..:::::::::::: ..::
CCDS75 HIVSNKVPVVQHPHHVHPLTPLITYSNEHFTPGNPPPHLPADVDPKTGIPRPPHPPDISP
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YYPLSPGAVGQIPHPLGWLVPQQGQPMYSLPPGGFRHPYP-ALAMNASMSSLVSSRFSPH
:::::::.::::::::::::::::::.: . :::::::: ::..::::: :: ::
CCDS75 YYPLSPGTVGQIPHPLGWLVPQQGQPVYPITTGGFRHPYPTALTVNASMS-----RFPPH
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 MVAPAHPGLPTSGIPHPAIVSPIVKQEPAPPSLSPAVSVKSPVTVKKEEEKKPHVKKPLN
:: : : : :.::::::::.: :::: . ... : : . :.::.::::.:::::
CCDS75 MVPPHHT-LHTTGIPHPAIVTPTVKQESSQSDVGSLHSSKHQDSKKEEEKKKPHIKKPLN
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 AFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRKWHNLSREEQAKYYELARKERQLHSQLYP
:::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::::::::::::::::::: ::::
CCDS75 AFMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYP
340 350 360 370 380 390
420 430 440
pF1KB7 TWSARDNYGKKKKRKREKQLSQTQSQQQV---------------------------QEAE
:::::::::::::::.:: ..:. ... :. .
CCDS75 GWSARDNYGKKKKRKRDKQPGETNEHSECFLNPCLSLPPITDLSAPKKCRARFGLDQQNN
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. :: ::.:. : : :: :: ::.:::: :.:: : ...::.::::
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:. ::. :.:.. :.: :.:. ::. :. :: .: . :.. .:.
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:::::::::::::::::: :::: :::::::::::::::.:: ..:.. . .. .. ..
CCDS53 REEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKKRKRDKQPGETNDANTPKKCRALFG
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pF1KB7 ----------SKSKKPCVQYLPPEKPCDSPASSHGSMLDSPATPSAALASPAAPAATHSE
. :: ::.:. : : :: :: ::.:::: :.:: : ...:
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::::::::::.:: ..:..... : . :. : .:
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CCDS53 VAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPGWSARDNYGKKKK
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pF1KB7 RKREKQLSQTQSQQQVQEAEGAL-ASKSKKPCVQYLPPEKPCDSPASSHGSMLDSPATPS
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CCDS53 RKRDKQPGETNGEKKSAFATYKVKAAASAHPLQMEAY
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CCDS36 MPQLSGGGGGGG---------------GDPELCATDEMIPFKDEGDPQKEKIFAEISHPE
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pF1KB7 AQRDLDEVKSSLVNESENQSSSSDSEAERRPQPVRDTFQ-KPRDYFAEVRRPQDSAFFKG
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CCDS36 EEGDLADIKSSLVNESEIIPASNGHEVARQAQTSQEPYHDKAREHPDDGKHPDGGLYNKG
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pF1KB7 PPYPGYP-FLMIPDLSS-PYLSNGPLSPGGARTYLQMKWPLLDVPSSATVKDTRSPSPAH
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CCDS36 PSYSSYSGYIMMPNMNNDPYMSNGSLSP---------------------------PIP-R
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pF1KB7 LSNKVPVVQHPHHMHPLTPLITYSNDHFSPGSPPTHLSPEIDPKTGIPRPPHPSELSPYY
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CCDS36 TSNKVPVVQPSHAVHPLTPLITYSDEHFSPGSHPSHIPSDVNSKQGMSRHPPAPDIPTFY
140 150 160 170 180 190
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pF1KB7 PLSPGAVGQIPHPLGWLVPQQGQPMYSLPPGGFRHPYPA-LAMNASMSSLVSSRFSPHMV
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CCDS36 PLSPGGVGQITPPLGW----QGQPVYPIT-GGFRQPYPSSLSVDTSM-----SRFSHHMI
200 210 220 230 240
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pF1KB7 APAHPGLPTSGIPHPAIVSPIVKQEPAPPSLSPAVSVKSPVTVKKEEE-KKPHVKKPLNA
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CCDS36 -PGPPGPHTTGIPHPAIVTPQVKQEH-PHTDSDLMHVKPQHEQRKEQEPKRPHIKKPLNA
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pF1KB7 FMLYMKEMRAKVVAECTLKESAAINQILGRKWHNLSREEQAKYYELARKERQLHSQLYPT
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CCDS36 FMLYMKEMRANVVAECTLKESAAINQILGRRWHALSREEQAKYYELARKERQLHMQLYPG
310 320 330 340 350 360
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pF1KB7 WSARDNYGKKKKRKREKQLSQTQSQQQVQEAEGALASKSKKPCVQYLPPEKPCDSPASSH
::::::::::::::::: :... :
CCDS36 WSARDNYGKKKKRKREK-LQESASGTGPRMTAAYI
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588 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 18:24:35 2016 done: Sun Nov 6 18:24:36 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]