FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7881, 578 aa
1>>>pF1KB7881 578 - 578 aa - 578 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3796+/-0.00126; mu= 16.4886+/- 0.076
mean_var=232.6693+/-44.421, 0's: 0 Z-trim(110.0): 940 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.084082
statistics sampled from 10230 (11259) to 10230 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.346), width: 16
Scan time: 2.310
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 1300 171.4 2.5e-42
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CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1260 166.8 8.6e-41
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CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1257 166.4 1e-40
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CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1248 165.1 2e-40
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1246 165.1 2.9e-40
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1246 165.2 2.9e-40
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CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 1235 163.7 6.7e-40
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 1235 163.7 6.9e-40
CCDS12850.2 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 535) 1233 163.3 6.9e-40
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 1232 163.1 7.1e-40
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CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 1224 162.2 1.4e-39
CCDS42639.1 ZNF154 gene_id:7710|Hs108|chr19 ( 437) 1223 162.0 1.4e-39
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 1225 162.5 1.6e-39
CCDS74437.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 458) 1222 161.9 1.6e-39
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 1222 161.9 1.6e-39
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1223 162.1 1.7e-39
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 1224 162.4 1.7e-39
>>CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 (578 aa)
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Smith-Waterman score: 3978; 100.0% identity (100.0% similar) in 578 aa overlap (1-578:1-578)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAEESRKPSAPSPPDQTPEEDLVIVKVEEDHGWDQESSLHESNPLGQEVFRLRFRQLRYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAEESRKPSAPSPPDQTPEEDLVIVKVEEDHGWDQESSLHESNPLGQEVFRLRFRQLRYQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ETLGPREALIQLRALCHQWLRPDLNTKEQILELLVLEQFLTILPEELQTLVKEHQLENGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ETLGPREALIQLRALCHQWLRPDLNTKEQILELLVLEQFLTILPEELQTLVKEHQLENGE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 EVVTLLEDLERQIDILGRPVSARVHGHRVLWEEVVHSASAPEPPNTQLQSEATQHKSPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EVVTLLEDLERQIDILGRPVSARVHGHRVLWEEVVHSASAPEPPNTQLQSEATQHKSPVP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QESQERAMSTSQSPTRSQKGSSGDQEMTATLLTAGFQTLEKIEDMAVSLIREEWLLDPSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QESQERAMSTSQSPTRSQKGSSGDQEMTATLLTAGFQTLEKIEDMAVSLIREEWLLDPSQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 KDLCRDNRPENFRNMFSLGGETRSENRELASKQVISTGIQPHGETAAKCNGDVIRGLEHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KDLCRDNRPENFRNMFSLGGETRSENRELASKQVISTGIQPHGETAAKCNGDVIRGLEHE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 EARDLLGRLERQRGNPTQERRHKCDECGKSFAQSSGLVRHWRIHTGEKPYQCNVCGKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EARDLLGRLERQRGNPTQERRHKCDECGKSFAQSSGLVRHWRIHTGEKPYQCNVCGKAFS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 YRSALLSHQDIHNKVKRYHCKECGKAFSQNTGLILHQRIHTGEKPYQCNQCGKAFSQSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YRSALLSHQDIHNKVKRYHCKECGKAFSQNTGLILHQRIHTGEKPYQCNQCGKAFSQSAG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LILHQRIHSGERPYECNECGKAFSHSSHLIGHQRIHTGEKPYECDECGKTFRRSSHLIGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LILHQRIHSGERPYECNECGKAFSHSSHLIGHQRIHTGEKPYECDECGKTFRRSSHLIGH
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pF1KB7 QRSHTGEKPYKCNECGRAFSQKSGLIEHQRIHTGERPYKCKECGKAFNGNTGLIQHLRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QRSHTGEKPYKCNECGRAFSQKSGLIEHQRIHTGERPYKCKECGKAFNGNTGLIQHLRIH
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550 560 570
pF1KB7 TGEKPYQCNECGKAFIQRSSLIRHQRIHSGEKSESISV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TGEKPYQCNECGKAFIQRSSLIRHQRIHSGEKSESISV
550 560 570
>>CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 (538 aa)
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Smith-Waterman score: 1611; 46.9% identity (71.8% similar) in 546 aa overlap (1-543:1-533)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAEESRKPSAPSPPDQTPEEDLVIVKVEEDHGWDQESSLHESNPLGQEVFRLRFRQLRYQ
::.: . .: . . . .:...::::. :... : ::.: : ::: .::
CCDS46 MARELSESTALDAQSTEDQMELLVIKVEEE-----EAGFPSSPDLGSEGSRERFRGFRYP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ETLGPREALIQLRALCHQWLRPDLNTKEQILELLVLEQFLTILPEELQTLVKEHQLENGE
:. :::::: .:: ::.:::.:....:::::::::::::::::: .::. :.:.. :.::
CCDS46 EAAGPREALSRLRELCRQWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGNLQSWVREQHPESGE
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130 140 150 160 170
pF1KB7 EVVTLLEDLERQIDILGRPVSARVHGHRVLWEEVVHSASAPEPPNTQLQ--SEATQHKSP
:::.::: ::::.: . ::. .:...: ... . :: ..:.: . .:.:
CCDS46 EVVVLLEYLERQLDEPAPQVSGVDQGQELLCCKMALLTPAPGSQSSQFQLMKALLKHESV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VPQESQERAMSTSQSPTRSQKGSSGDQEMTATLLTAGFQTLEKIEDMAVSLIREEWLL-D
: :.:.. : :. .. : .....:. :: : : :.::.:..: :: :
CCDS46 GSQPLQDRVL---QVPVLAHGGCCREDKVVASRLTPESQGLLKVEDVALTLT-PEWTQQD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PSQKDLCRDNRPENFRNMFSLGGETRSENRELASKQVISTGIQPHGETAAKCNGDVIRGL
:: .::::.. :: .. ::: : ....:.: . . . ::. . . :. .
CCDS46 SSQGNLCRDEKQENHGSLVSLGDEKQTKSRDLPPAEELPE--KEHGKISCHLREDIAQIP
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300 310 320 330 340 350
pF1KB7 EHEEARDLLGRLERQRGNPTQERRHKCDECGKSFAQSSGLVRHWRIHTGEKPYQCNVCGK
:: . :::.:.. : : ::: : :::::::::::: .: :::::::::.:. :::
CCDS46 TCAEAGEQEGRLQRKQKNATGGRRHICHECGKSFAQSSGLSKHRRIHTGEKPYECEECGK
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pF1KB7 AFSYRSALLSHQDIHNKVKRYHCKECGKAFSQNTGLILHQRIHTGEKPYQCNQCGKAFSQ
:: :::. :: .:. : :.:.:::::::... :: ::: :::::::.:..:::.:::
CCDS46 AFIGSSALVIHQRVHTGEKPYECEECGKAFSHSSDLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQ
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pF1KB7 SAGLILHQRIHSGERPYECNECGKAFSHSSHLIGHQRIHTGEKPYECDECGKTFRRSSHL
: .:. :.:::.::.::.:. ::::: .::::. :::::::.: . : :.... :..
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pF1KB7 IGHQRSHTGEKPYKCNECGRAFSQKSGLIEHQRIHTGERPYKCKECGKAFNGNTGLIQHL
.. .. :::::: :.:.:..::::::.:::::.::.:. :::.:. . :.::
CCDS46 ESQLENVETPMSYKCNECERSFTQNTGLIEHQKIHTGEKPYQCNACGKGFTRISYLVQHQ
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pF1KB7 RIHTGEKPYQCNECGKAFIQRSSLIRHQRIHSGEKSESISV
: :.:.
CCDS46 RSHVGKNILSQ
530
>>CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6 (545 aa)
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Smith-Waterman score: 1543; 45.6% identity (70.1% similar) in 551 aa overlap (1-544:1-541)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAEESRKPSAPSPPDQTPEEDLVIVKVEEDHG--WDQESSLHESNPLGQEVFRLRFRQLR
::.: :: .: . . . :. ::::.... : : : : : ::: .:
CCDS46 MAREPRKNAALDAQSAEDQTGLLTVKVEKEEASALTAEVRAPCSPARGPERSRQRFRGFR
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 YQETLGPREALIQLRALCHQWLRPDLNTKEQILELLVLEQFLTILPEELQTLVKEHQLEN
: :. :::::: .:: :: :::.:....:::::::::::::::::: .::. :.:.. :.
CCDS46 YPEAAGPREALSRLRELCGQWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGNLQSWVREQHPES
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 GEEVVTLLEDLERQIDILGRPVSARVHGHRVLWEEVVHSASAPEPPNTQLQSEAT--QHK
:::::.::: ::::.: . : . .:...: ... ... ..: : . .:.
CCDS46 GEEVVVLLEYLERQLDEPAPQVPVGDQGQELLCCKMALLTQTQGSQSSQCQPMKALFKHE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 SPVPQESQERAMSTSQSPTRSQKGSSGDQEMTATLLTAGFQTLEKIEDMAVSLIREEWL-
: : ..:.. : : .: : .. :.:. :: : : : :.::.:..: :
CCDS46 SLGSQPLHDRVL---QVPGLAQGGCCREDAMVASRLTPGSQGLLKMEDVALTLT-PGWTQ
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LDPSQKDLCRDNRPENFRNMFSLGGETRSENRELASKQVISTGIQPHGETAAKCN--GDV
:: :: .: ::.. :: .. ::::: ....:.: . . :. : . :. :.
CCDS46 LDSSQVNLYRDEKQENHSSLVSLGGEIQTKSRDLPPVKKL-----PEKEHGKICHLREDI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 IRGLEHEEARDLLGRLERQRGNPTQERRHKCDECGKSFAQSSGLVRHWRIHTGEKPYQCN
. : :: . :::.:.. : ::: : ::::::::::::..: :::::::::.:.
CCDS46 AQIPTHAEAGEQEGRLQRKQKNAIGSRRHYCHECGKSFAQSSGLTKHRRIHTGEKPYECE
300 310 320 330 340 350
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pF1KB7 VCGKAFSYRSALLSHQDIHNKVKRYHCKECGKAFSQNTGLILHQRIHTGEKPYQCNQCGK
:::.: :::. :: .:. : :.:.::::.::....:: ::: :::::::.:..:::
CCDS46 DCGKTFIGSSALVIHQRVHTGEKPYECEECGKVFSHSSNLIKHQRTHTGEKPYECDDCGK
360 370 380 390 400 410
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pF1KB7 AFSQSAGLILHQRIHSGERPYECNECGKAFSHSSHLIGHQRIHTGEKPYECDECGKTFRR
.:::: .:. :..::.::.::.:: ::::: ..:::. ::::: :.: . : :....
CCDS46 TFSQSCSLLEHHKIHTGEKPYQCNMCGKAFRRNSHLLRHQRIH-GDKNVQNPEHGESWES
420 430 440 450 460 470
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pF1KB7 SSHLIGHQRSHTGEKPYKCNECGRAFSQKSGLIEHQRIHTGERPYKCKECGKAFNGNTGL
... .. .. . :::::: :.:... .:::::.:::::.::.: :::.:. .. :
CCDS46 QGRTESQWENTEAPVSYKCNECERSFTRNRSLIEHQKIHTGEKPYQCDTCGKGFTRTSYL
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540 550 560 570
pF1KB7 IQHLRIHTGEKPYQCNECGKAFIQRSSLIRHQRIHSGEKSESISV
.:: : :.:.:
CCDS46 VQHQRSHVGKKTLSQ
540
>>CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 (534 aa)
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Smith-Waterman score: 1790; 50.5% identity (71.9% similar) in 572 aa overlap (1-569:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAEESRKPSAPSPPDQTPEEDLVIVKVEEDHGWDQESSLHESNPLGQEVFRLRFRQLRYQ
:: :: :. : : ::..:..::::.. .::.. . . :. ::.:: .::.. ::
CCDS45 MAVESGVISTLIPQDP-PEQELILVKVEDNFSWDEKFKQNGSTQSCQELFRQQFRKFCYQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ETLGPREALIQLRALCHQWLRPDLNTKEQILELLVLEQFLTILPEELQTLVKEHQLENGE
:: :::::: .:. ::.::: :.:.:::::::::::::::.::::::: :..:. :.::
CCDS45 ETPGPREALSRLQELCYQWLMPELHTKEQILELLVLEQFLSILPEELQIWVQQHNPESGE
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:.:::::::::..: :. : : .: : :.... .. : . .:: :: :: :
CCDS45 EAVTLLEDLEREFDDPGQQVPASPQGPAVPWKDLTCLRASQESTDIHLQPLKTQLKSWKP
120 130 140 150 160 170
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:: ..: : . : :.. :. . .: .: ::
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. . . . ... . : . :: .. . .::: :. : : : : :
CCDS45 RGISEHESNLVWKQGSATGEKLRSPSQGGSFSQVIFTN---------KSLGK--RDLYDE
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CCDS74 RIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHT
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CCDS12 ISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGH---WEWSCESLESLAVPVAFTPVKTPVLE
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CCDS12 TKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEK
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CCDS54 DTFRLLVSVGHWLPKPNVISLLEQEAELWAVESRLPQGVYPEIKGHFQFLLLSDLETRPK
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CCDS54 VKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGH---WEWSCESLESLAVPVAF
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CCDS54 TPVKTPVLEQWQRNGFGENISLNPDLPHQPMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCV
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pF1KB7 FQTLEKIEDMAVSLIREEWLLDPSQKDLCRDNRPENFRNMFSLGGETRSENRELASKQVI
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CCDS54 KEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTH--TGERP--YECHECLKGFRNSSA--LTKHQRI
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