Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7862
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7862, 630 aa
1>>>pF1KB7862 630 - 630 aa - 630 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5408+/-0.00192; mu= 11.1118+/- 0.116
mean_var=298.6086+/-54.333, 0's: 0 Z-trim(106.3): 969 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.074220
statistics sampled from 7878 (8915) to 7878 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.274), width: 16
Scan time: 3.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 4389 484.9 1.4e-136
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 4377 483.6 3.5e-136
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 4132 457.4 2.8e-128
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1878 216.1 1.3e-55
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1798 207.4 4.6e-53
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1798 207.4 4.6e-53
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1780 205.4 1.6e-52
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1780 205.6 1.9e-52
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 1776 205.2 2.7e-52
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1773 204.7 2.9e-52
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1773 204.8 3.1e-52
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1773 204.8 3.1e-52
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1773 204.8 3.1e-52
CCDS35237.2 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 657) 1747 202.0 2.1e-51
CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 697) 1747 202.0 2.2e-51
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1744 201.8 2.9e-51
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1731 200.2 6.7e-51
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1713 198.3 2.4e-50
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1707 197.8 4.2e-50
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 1707 197.8 4.6e-50
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 1707 197.8 4.6e-50
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 1707 197.9 4.6e-50
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 1707 197.9 4.7e-50
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1692 196.1 1.3e-49
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1693 196.4 1.3e-49
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 1680 194.8 3.1e-49
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 1680 194.9 3.1e-49
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 1677 194.5 3.8e-49
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1673 194.0 4.9e-49
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1657 192.1 1.4e-48
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1660 192.8 1.4e-48
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1648 191.3 2.9e-48
CCDS12966.1 ZNF256 gene_id:10172|Hs108|chr19 ( 627) 1649 191.5 3e-48
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1646 191.3 4.1e-48
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1644 191.0 4.5e-48
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1645 191.2 4.5e-48
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1645 191.2 4.6e-48
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 1642 190.8 5.3e-48
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1643 191.1 5.8e-48
CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 1642 190.9 5.9e-48
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1623 188.7 2.1e-47
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1620 188.4 2.5e-47
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1620 188.4 2.5e-47
CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 659) 1617 188.1 3.3e-47
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1616 187.9 3.3e-47
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1616 188.0 3.5e-47
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1614 188.0 5e-47
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1607 187.0 6.6e-47
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1607 187.0 6.8e-47
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1604 186.5 7.2e-47
>>CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 (630 aa)
initn: 4389 init1: 4389 opt: 4389 Z-score: 2565.4 bits: 484.9 E(32554): 1.4e-136
Smith-Waterman score: 4389; 99.8% identity (99.8% similar) in 630 aa overlap (1-630:1-630)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSVSSGDQILTKPETVDRRRSAETTKEAGRPLEMAVSEPEASAAEWKQLDPAQSNLYNDV
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MSVSSGVQILTKPETVDRRRSAETTKEAGRPLEMAVSEPEASAAEWKQLDPAQSNLYNDV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MLENYCNQASMGCQAPKPDMISKLEKGEAPWLGKGKRPSQGCPSKIARPKQKETDGKVQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MLENYCNQASMGCQAPKPDMISKLEKGEAPWLGKGKRPSQGCPSKIARPKQKETDGKVQK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DDDQLENIQKSQNKLLREVAVKKKTQAKKNGSDCGSLGKKNNLHKKHVPSKKRLLKFESC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DDDQLENIQKSQNKLLREVAVKKKTQAKKNGSDCGSLGKKNNLHKKHVPSKKRLLKFESC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GKILKQNLDLPDHSRNCVKRKSDAAKEHKKSFNHSLSDTRKGKKQTGKKHEKLSSHSSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 GKILKQNLDLPDHSRNCVKRKSDAAKEHKKSFNHSLSDTRKGKKQTGKKHEKLSSHSSSD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 KCNKTGKKHDKLCCHSSSHIKQDKIQTGEKHEKSPSLSSSTKHEKPQACVKPYECNQCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 KCNKTGKKHDKLCCHSSSHIKQDKIQTGEKHEKSPSLSSSTKHEKPQACVKPYECNQCGK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VLSHKQGLIDHQRVHTGEKPYECNECGIAFSQKSHLVVHQRTHTGEKPYECIQCGKAHGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VLSHKQGLIDHQRVHTGEKPYECNECGIAFSQKSHLVVHQRTHTGEKPYECIQCGKAHGH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KHALTDHLRIHTGEKPYECAECGKTFRHSSNLIQHVRSHTGEKPYECKECGKSFRYNSSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 KHALTDHLRIHTGEKPYECAECGKTFRHSSNLIQHVRSHTGEKPYECKECGKSFRYNSSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 TEHVRTHTGEIPYECNECGKAFKYSSSLTKHMRIHTGEKPFECNECGKAFSKKSHLIIHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 TEHVRTHTGEIPYECNECGKAFKYSSSLTKHMRIHTGEKPFECNECGKAFSKKSHLIIHQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 RTHTKEKPYKCNECGKAFGHSSSLTYHMRTHTGESPFECNQCGKGFKQIEGLTQHQRVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 RTHTKEKPYKCNECGKAFGHSSSLTYHMRTHTGESPFECNQCGKGFKQIEGLTQHQRVHT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 GEKPYECNECGKAFSQKSHLIVHQRTHTGEKPYECNECEKAFNAKSQLVIHQRSHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 GEKPYECNECGKAFSQKSHLIVHQRTHTGEKPYECNECEKAFNAKSQLVIHQRSHTGEKP
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KB7 YECNECGKTFKQNASLTKHVKTHSEDKSHE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 YECNECGKTFKQNASLTKHVKTHSEDKSHE
610 620 630
>>CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 (631 aa)
initn: 4138 init1: 4138 opt: 4377 Z-score: 2558.5 bits: 483.6 E(32554): 3.5e-136
Smith-Waterman score: 4377; 99.7% identity (99.7% similar) in 631 aa overlap (1-630:1-631)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MSVSSGDQILTKPETVDRRRSAETTKEAGRPLEMAVSEPEASAA-EWKQLDPAQSNLYND
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS65 MSVSSGVQILTKPETVDRRRSAETTKEAGRPLEMAVSEPEASAAKEWKQLDPAQSNLYND
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VMLENYCNQASMGCQAPKPDMISKLEKGEAPWLGKGKRPSQGCPSKIARPKQKETDGKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VMLENYCNQASMGCQAPKPDMISKLEKGEAPWLGKGKRPSQGCPSKIARPKQKETDGKVQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 KDDDQLENIQKSQNKLLREVAVKKKTQAKKNGSDCGSLGKKNNLHKKHVPSKKRLLKFES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KDDDQLENIQKSQNKLLREVAVKKKTQAKKNGSDCGSLGKKNNLHKKHVPSKKRLLKFES
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 CGKILKQNLDLPDHSRNCVKRKSDAAKEHKKSFNHSLSDTRKGKKQTGKKHEKLSSHSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 CGKILKQNLDLPDHSRNCVKRKSDAAKEHKKSFNHSLSDTRKGKKQTGKKHEKLSSHSSS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 DKCNKTGKKHDKLCCHSSSHIKQDKIQTGEKHEKSPSLSSSTKHEKPQACVKPYECNQCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 DKCNKTGKKHDKLCCHSSSHIKQDKIQTGEKHEKSPSLSSSTKHEKPQACVKPYECNQCG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 KVLSHKQGLIDHQRVHTGEKPYECNECGIAFSQKSHLVVHQRTHTGEKPYECIQCGKAHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KVLSHKQGLIDHQRVHTGEKPYECNECGIAFSQKSHLVVHQRTHTGEKPYECIQCGKAHG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 HKHALTDHLRIHTGEKPYECAECGKTFRHSSNLIQHVRSHTGEKPYECKECGKSFRYNSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 HKHALTDHLRIHTGEKPYECAECGKTFRHSSNLIQHVRSHTGEKPYECKECGKSFRYNSS
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 LTEHVRTHTGEIPYECNECGKAFKYSSSLTKHMRIHTGEKPFECNECGKAFSKKSHLIIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 LTEHVRTHTGEIPYECNECGKAFKYSSSLTKHMRIHTGEKPFECNECGKAFSKKSHLIIH
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 QRTHTKEKPYKCNECGKAFGHSSSLTYHMRTHTGESPFECNQCGKGFKQIEGLTQHQRVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 QRTHTKEKPYKCNECGKAFGHSSSLTYHMRTHTGESPFECNQCGKGFKQIEGLTQHQRVH
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 TGEKPYECNECGKAFSQKSHLIVHQRTHTGEKPYECNECEKAFNAKSQLVIHQRSHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TGEKPYECNECGKAFSQKSHLIVHQRTHTGEKPYECNECEKAFNAKSQLVIHQRSHTGEK
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630
pF1KB7 PYECNECGKTFKQNASLTKHVKTHSEDKSHE
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PYECNECGKTFKQNASLTKHVKTHSEDKSHE
610 620 630
>>CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 (645 aa)
initn: 4132 init1: 4132 opt: 4132 Z-score: 2416.6 bits: 457.4 E(32554): 2.8e-128
Smith-Waterman score: 4349; 97.5% identity (97.5% similar) in 645 aa overlap (1-630:1-645)
10 20 30 40
pF1KB7 MSVSSGDQILTKPETVDRRRSAETTKEAGRPLEMAVSEPEASAA---------------E
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS65 MSVSSGVQILTKPETVDRRRSAETTKEAGRPLEMAVSEPEASAAVSVTFKHVTMAFTQKE
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 WKQLDPAQSNLYNDVMLENYCNQASMGCQAPKPDMISKLEKGEAPWLGKGKRPSQGCPSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 WKQLDPAQSNLYNDVMLENYCNQASMGCQAPKPDMISKLEKGEAPWLGKGKRPSQGCPSK
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 IARPKQKETDGKVQKDDDQLENIQKSQNKLLREVAVKKKTQAKKNGSDCGSLGKKNNLHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 IARPKQKETDGKVQKDDDQLENIQKSQNKLLREVAVKKKTQAKKNGSDCGSLGKKNNLHK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 KHVPSKKRLLKFESCGKILKQNLDLPDHSRNCVKRKSDAAKEHKKSFNHSLSDTRKGKKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 KHVPSKKRLLKFESCGKILKQNLDLPDHSRNCVKRKSDAAKEHKKSFNHSLSDTRKGKKQ
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 TGKKHEKLSSHSSSDKCNKTGKKHDKLCCHSSSHIKQDKIQTGEKHEKSPSLSSSTKHEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 TGKKHEKLSSHSSSDKCNKTGKKHDKLCCHSSSHIKQDKIQTGEKHEKSPSLSSSTKHEK
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 PQACVKPYECNQCGKVLSHKQGLIDHQRVHTGEKPYECNECGIAFSQKSHLVVHQRTHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 PQACVKPYECNQCGKVLSHKQGLIDHQRVHTGEKPYECNECGIAFSQKSHLVVHQRTHTG
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 EKPYECIQCGKAHGHKHALTDHLRIHTGEKPYECAECGKTFRHSSNLIQHVRSHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 EKPYECIQCGKAHGHKHALTDHLRIHTGEKPYECAECGKTFRHSSNLIQHVRSHTGEKPY
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 ECKECGKSFRYNSSLTEHVRTHTGEIPYECNECGKAFKYSSSLTKHMRIHTGEKPFECNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 ECKECGKSFRYNSSLTEHVRTHTGEIPYECNECGKAFKYSSSLTKHMRIHTGEKPFECNE
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 CGKAFSKKSHLIIHQRTHTKEKPYKCNECGKAFGHSSSLTYHMRTHTGESPFECNQCGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 CGKAFSKKSHLIIHQRTHTKEKPYKCNECGKAFGHSSSLTYHMRTHTGESPFECNQCGKG
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 FKQIEGLTQHQRVHTGEKPYECNECGKAFSQKSHLIVHQRTHTGEKPYECNECEKAFNAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 FKQIEGLTQHQRVHTGEKPYECNECGKAFSQKSHLIVHQRTHTGEKPYECNECEKAFNAK
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630
pF1KB7 SQLVIHQRSHTGEKPYECNECGKTFKQNASLTKHVKTHSEDKSHE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 SQLVIHQRSHTGEKPYECNECGKTFKQNASLTKHVKTHSEDKSHE
610 620 630 640
>>CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 (738 aa)
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CCDS54 ------GGK-----SSSQSEPNSNLEKIHNGV-------IPFDDNQCGNVFRNTQSLIQY
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CCDS82 ECNECGKAFSQSSALTVHMRSHTGEKPYECKECRKAFSHKKNFITHQKIHTREKPYECNE
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CCDS82 FSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNECGKAFSQIASLTLHLRSHTGEKPYECDKCGKAFSQC
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CCDS82 SLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQRTSLIVHMRGHTGEKPYECNKCGKAFSQSSSLT
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pF1KB7 KHVKTHSEDKSHE
:.. :. .:
CCDS82 IHIRGHTGEKPFDCSKCGKAFSQISSLTLHMRKHTGEKPYHCIECGKAFSQKSHLVRHQR
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CCDS12 LLRQVEVKFQKTLTEEKGNECQKKFANVFPLNSDFFPSRHNLYEYDLFGKCLEHNFDCHN
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. . :. :: .. .: . :.::..:. :. . .::.:
CCDS12 NVK-CLMRKEHCEYNEPVKSYGNSSSHFVITPFKCNHCGKGFNQTLDLIRHLRIHTGEKP
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CCDS12 YACKECEKSFSQKSNLIDHEKIHTGEKPYECNECGKAFSQKQSLIAHQKVHTGEKPYACN
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330 340 350 360 370 380
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.: .:: : :.:::::::::::::: :.: ..... : . :: : :::::::::::
CCDS12 AFSQSSALTVHMRSHTGEKPYECKECRKAFSHKKNFITHQKIHTREKPYECNECGKAFIQ
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:...::::.:..::.:::.:.:: .:: : : :::::::::..::::::: : : .:.
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630
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.:
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CCDS11 QRTCLIQHQRIHTGEKPYACRICGKTFTQSTNLIQHQRVHTGAKHRN
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CCDS74 RGK--REKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGER--PYECH---
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]