Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7790
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7790, 517 aa
1>>>pF1KB7790 517 - 517 aa - 517 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2359+/-0.00199; mu= 4.7966+/- 0.117
mean_var=371.6253+/-72.962, 0's: 0 Z-trim(106.1): 840 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.066531
statistics sampled from 7780 (8779) to 7780 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 3.140
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS10499.1 ZNF263 gene_id:10127|Hs108|chr16 ( 683) 662 79.1 1.8e-14
CCDS35105.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 256) 651 77.4 2.2e-14
CCDS10495.1 ZNF213 gene_id:7760|Hs108|chr16 ( 459) 653 78.0 2.6e-14
CCDS33740.1 ZNF620 gene_id:253639|Hs108|chr3 ( 422) 651 77.7 2.9e-14
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CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 618 74.6 2.8e-13
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 617 74.5 2.9e-13
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 620 75.0 2.9e-13
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CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 574) 610 74.0 5.2e-13
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CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 610 74.1 5.6e-13
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 611 74.2 5.7e-13
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 610 74.1 5.8e-13
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 610 74.1 5.9e-13
CCDS31087.1 ZNF670 gene_id:93474|Hs108|chr1 ( 389) 602 72.9 7.2e-13
CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19 ( 600) 605 73.5 7.5e-13
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 606 73.8 8.4e-13
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 605 73.7 9e-13
CCDS42531.1 ZNF506 gene_id:440515|Hs108|chr19 ( 444) 599 72.7 9.4e-13
CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 602 73.3 9.5e-13
CCDS12269.2 ZNF625 gene_id:90589|Hs108|chr19 ( 372) 597 72.4 9.8e-13
CCDS46164.1 ZNF880 gene_id:400713|Hs108|chr19 ( 577) 600 73.0 1e-12
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 603 73.6 1.1e-12
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 599 73.0 1.1e-12
CCDS12980.1 ZNF132 gene_id:7691|Hs108|chr19 ( 706) 600 73.1 1.1e-12
CCDS10494.2 ZNF205 gene_id:7755|Hs108|chr16 ( 554) 598 72.8 1.1e-12
CCDS7195.1 ZNF25 gene_id:219749|Hs108|chr10 ( 456) 595 72.4 1.2e-12
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 593 72.0 1.2e-12
>>CCDS7775.1 ZNF215 gene_id:7762|Hs108|chr11 (517 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MQPLSKLMAISKPRNLSLREQREVLRADMSWQQETNPVVETHDSEASRQKFRHFQYLKVS
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CCDS77 MQPLSKLMAISKPRNLSLREQREVLRADMSWQQETNPVVETHDSEASRQKFRHFQYLKVS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GPHEALSQLWELCLQWLRPEIHTKKQIIELLVLEQFLAILPEEVRTWVNLQHPNNSKDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS77 GPHEALSQLWELCLQWLRPEIHTKKQIIELLVLEQFLAILPEEVRTWVNLQHPNNSKDMV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TLIEDVIEMLEDEDMPCKDSALQMGSIKEKMKAGSRTGKPQEPVTFKDVVVEFSKEEWGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TLIEDVIEMLEDEDMPCKDSALQMGSIKEKMKAGSRTGKPQEPVTFKDVVVEFSKEEWGQ
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LDSAVKNLYRNVMLENFRNLNSLRKAHLLSKPFESLKLESKKKRWIMEKEIPRKTIFDMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LDSAVKNLYRNVMLENFRNLNSLRKAHLLSKPFESLKLESKKKRWIMEKEIPRKTIFDMK
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 SISGEESSHGVIMTRLTESGHPSSDAWKGENWLYRNQKKWDINLPQEAFIPETIYTEEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SISGEESSHGVIMTRLTESGHPSSDAWKGENWLYRNQKKWDINLPQEAFIPETIYTEEED
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 FECSENKKSFDINSVSSICAIQVGIPSRKGSPKCDKFKTYFKFNLDSVGKQHSEYEYGND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FECSENKKSFDINSVSSICAIQVGIPSRKGSPKCDKFKTYFKFNLDSVGKQHSEYEYGND
310 320 330 340 350 360
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pF1KB7 LSLSTDIRHQKSHTTMNSYECYQCGKAFCRSSSLIRHQIIHTGEKPYKCSECGRFFNRRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LSLSTDIRHQKSHTTMNSYECYQCGKAFCRSSSLIRHQIIHTGEKPYKCSECGRFFNRRT
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pF1KB7 NLTKHQKLHAEAKACTSNKCGKAFSKSEDSNNPTLHFGNNFYQCVNCGKSFNRSSSLIRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NLTKHQKLHAEAKACTSNKCGKAFSKSEDSNNPTLHFGNNFYQCVNCGKSFNRSSSLIRH
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pF1KB7 QMIHTGEKPFKCKECSKAFNRSSNLVKHQKLHTRDKS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QMIHTGEKPFKCKECSKAFNRSSNLVKHQKLHTRDKS
490 500 510
>>CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 (744 aa)
initn: 1279 init1: 476 opt: 981 Z-score: 538.4 bits: 109.7 E(32554): 1.1e-23
Smith-Waterman score: 1060; 38.1% identity (63.6% similar) in 557 aa overlap (3-516:6-549)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MQPLSKLMAIS-KPRNLSLREQREVLRADMSWQQETNPVVETHDSEASRQKFRHFQY
::.:. ::: .:..:. :: :: :. : .::. .. :.:. ::.:: : :
CCDS35 MQAVVPLNKMTAISPEPQTLASTEQNEVPRVVTSGEQEAILRGNAADAESFRQRFRWFCY
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pF1KB7 LKVSGPHEALSQLWELCLQWLRPEIHTKKQIIELLVLEQFLAILPEEVRTWVNLQHPNNS
.:.::..::::::::: :::::.::::.::.::::.::::.::: :.: ::. :::..:
CCDS35 SEVAGPRKALSQLWELCNQWLRPDIHTKEQILELLVFEQFLTILPGEIRIWVKSQHPESS
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 KDVVTLIEDVIEMLEDEDMPCKDSALQM--GSIKEKMKAGSRTGKPQEPVTFKDVVVEFS
..:::::::. .:::..: .::.... .: ..:: . . . : .:.:::.:.::
CCDS35 EEVVTLIEDLTQMLEEKDPVSQDSTVSQEENSKEDKMVTVCPNTESCESITLKDVAVNFS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KEEWGQLDSAVKNLYRNVMLENFRNLNSLRKAHLLSKPFESLKLESKKKRWIMEKEIPRK
. :: .:. :.::..:.:::.:::. .:. : .:.: :. : :. :.:
CCDS35 RGEWKKLEPFQKELYKEVLLENLRNLE------FLDFPVSKLELISQLK-WV---ELPWL
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pF1KB7 TIFDMKSISGEESSHGVIMTR-LTESGH---PSSDAWKGENWL-YRNQKKWDINLPQEAF
:: .::. :. : : .. : :. . : . . :: . . :.
CCDS35 LEEVSKSSRLDESALDKIIERCLRDDDHGLMEESQQYCGSSEEDHGNQGNSKGRVAQNKT
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pF1KB7 IPETIYTEEEDFECSENKKSFDINSVSSICAIQVGIPSRKGSPKCDKFKTYFKFNLDSV-
. .. : . : ..: .: . : ..: . :: : . .. : :.:. : :
CCDS35 LGSGSRGKKFDPDKSPFGHNFKETS-DLIKHLRVYL--RKKSRRYNESKKPFSFHSDLVL
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pF1KB7 -------G-KQHSEYEYGNDLSLSTDI----RHQKSHTTMNSYECYQCGKAFCRSSSLIR
: :... . :. :: :. . ..:: : : .: .:: : : :.: :
CCDS35 NRKEKTAGEKSRKSNDGGKVLSHSSALTEHQKRQKIHLGDRSQKCSKCGIIFIRRSTLSR
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400 410 420 430
pF1KB7 HQII---------------------HTGEKPYKCSECGRFFNRRTNLTKHQKLHAEAKAC
.. ..::: .:::.::. :. ..::::...:. :
CCDS35 RKTPMCEKCRKDSCQEAALNKDEGNESGEKTHKCSKCGKAFGYSASLTKHRRIHTGEKPY
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440 450 460 470 480 490
pF1KB7 TSNKCGKAFSKSED-SNNPTLHFGNNFYQCVNCGKSFNRSSSLIRHQMIHTGEKPFKCKE
:.:::::: : . . . : :.. ..: .:::.:. :. ::.:: :::::::.:::.
CCDS35 MCNECGKAFSDSSSLTPHHRTHSGEKPFKCDDCGKGFTLSAHLIKHQRIHTGEKPYKCKD
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500 510
pF1KB7 CSKAFNRSSNLVKHQKLHTRDKS
:.. :. ::.:..::..:: .:
CCDS35 CGRPFSDSSSLIQHQRIHTGEKPYTCSNCGKSFSHSSSLSKHQRIHTGEKPYKCGECGKA
530 540 550 560 570 580
>>CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029 aa)
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Smith-Waterman score: 796; 32.1% identity (57.2% similar) in 558 aa overlap (17-495:10-543)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MQPLSKLMAISKPRNLSLREQREVLRADMSWQQETNPVVETHDS-EASRQKFRHFQYLKV
.::.. : : .:. :. . . :.:. .::...: ..
CCDS27 MTRENVAHNALRQEGLVKGKDDTWKWGTSFQGSSSSVWETSHLHFRQLRYHET
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pF1KB7 SGPHEALSQLWELCLQWLRPEIHTKKQIIELLVLEQFLAILPEEVRTWVNLQHPNNSKDV
:::.::::.: ::: .::::: .:: ::.:::::::::.::: :.::::.:.::......
CCDS27 SGPQEALSRLRELCRRWLRPEARTKAQILELLVLEQFLSILPGEIRTWVQLHHPGSGEEA
60 70 80 90 100 110
120 130
pF1KB7 VTLIEDVIE-----------MLEDEDM---------------------------------
:.:.:.. . ...:.:
CCDS27 VALVEELQKDLDGPAIQVPVLVKDQDTLQKVVSAPGTTLPPVLPGSHIAAEICPHPPTDL
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180
pF1KB7 -------PCKDS-ALQMGSIKEKMKAGSR-------TGKPQEPVTFKDVVVEFSKEEWGQ
: .:: : . ...... . .. :..::: : :..: : :..:::.
CCDS27 VAFNLQDPQHDSPAPEASALSQEENPRNQLMALMLLTAQPQELVMFEEVSVCFTSEEWAC
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230
pF1KB7 LDSAVKNLYRNVMLENFRNLNSLR------KAHLLSKPFESLKLESKK---KRWIMEKEI
: . :: .:::::. :..::. . .. ::: : . .:.: :: .. .
CCDS27 LGPIQRALYWDVMLENYGNVTSLEWETMTENEEVTSKPSSSQRADSHKGTSKR--LQGSV
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 PRKTIFDMKSISGEESSHGVIMTRLTESGHPSSDAWKGENWLYRNQKKWDINLPQEAFIP
:. ..:.. :: :. .. . .:. : . :..:: : :
CCDS27 PQ--VLDFE----EECEWQVLASQWGNETDERADTVKKVSLCERDKKK---RTP-----P
300 310 320 330
300 310 320 330 340
pF1KB7 ETIYTEEEDFECSENKKSFDINSVSSICAIQVGIPSRKGSPKCDKFKTYFK-----FNLD
: . . .. .. .: :.: .: ..: ::: .:. .:
CCDS27 EK---QGQKWKELGDSLTFG----SAISESLIGTEGKK-FYKCDMCCKHFNKISHLINHR
340 350 360 370 380
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 SVG---KQHSEYEYGND-LSLSTDIRHQKSHTTMNSYECYQCGKAFCRSSSLIRHQIIHT
. : :. : :. .. :. . : ..:. . :.: .::::: .:. :. :: :::
CCDS27 RIHTGEKPHKCKECGKGFIQRSSLLMHLRNHSGEKPYKCNECGKAFSQSAYLLNHQRIHT
390 400 410 420 430 440
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 GEKPYKCSECGRFFNRRTNLTKHQKLHAEAKACTSNKCGKAFSKSEDS-NNPTLHFGNNF
:::::::.:::. : :...: : . :. . :.:::.::.. .. :: :..
CCDS27 GEKPYKCKECGKGFYRHSGLIIHLRRHSGERPYKCNECGKVFSQNAYLIDHQRLHKGEEP
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500 510
pF1KB7 YQCVNCGKSFNRSSSLIRHQMIHTGEKPFKCKECSKAFNRSSNLVKHQKLHTRDKS
:.: .: :.: ..::: :: ::.::::.:: ::
CCDS27 YKCNKCQKAFILKKSLILHQRIHSGEKPYKCDECGKTFAQTTYLIDHQRLHSAENPYKCK
510 520 530 540 550 560
CCDS27 ECGKVFIRSKSLLLHQRVHTEKKTFGCKKCGKIFSSKSNFIDHKRMHSREKPYKCTECGK
570 580 590 600 610 620
>>CCDS59381.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 (665 aa)
initn: 1570 init1: 295 opt: 730 Z-score: 408.6 bits: 85.6 E(32554): 1.9e-16
Smith-Waterman score: 730; 35.0% identity (66.9% similar) in 366 aa overlap (161-516:25-384)
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 EDEDMPCKDSALQMGSIKEKMKAGSRTGKPQEPVTFKDVVVEFSKEEWGQLDSAVKNLYR
:: :::.::...::..:: :: ..:::
CCDS59 MFPVLEPHQVGLIRSYNSKTMTCFQELVTFRDVAIDFSRQEWEYLDPNQRDLYR
10 20 30 40 50
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 NVMLENFRNLNSLRKAHLLSKPFESLKLESKKKRWIMEKEIPRKTIFDMKSISGEESSHG
.:::::.::: :: .: .::: :: :. :.. .: . : .:.. : :.
CCDS59 DVMLENYRNLVSL-GGHSISKPVVVDLLERGKEPWMILREETQFTDLDLQC---EIISYI
60 70 80 90 100 110
260 270 280 290 300
pF1KB7 VIMTRLTE-SGHPSSDAWKGENWLYRNQK-KWDINLPQEAFIPETIYTEEEDFECSENKK
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CCDS59 EVPTYETDISSTQLQSIYKREK-LYECKKCQKKFSSGYQLILHHRFHVIERPYECKECGK
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. .... .. :: :. . : .: .: ::. . .. . : ..
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CCDS46 RHRRIHTGERPFGCKECGRAFNLNSHLIRHQRIHTREKPYECSECGKTFRVSSHLIRHFR
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CCDS46 IHTGEKPYECSECGRAFSQSSNLSQHQRIHMRENLLM
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CCDS35 MAETKDAAQMLVTFKDVAVTFTREEWRQLDLAQRTLYR
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CCDS35 EVMLETCGLLVSL--GHRVPKPELVHLLEHGQELWIVKRGLSHATCAGDRAQVHTREPTT
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CCDS35 YPPVLSERAFLRGSLTLESSTSSDSRLGRA---RDEEGL-LEMQKGKVTPETDLHKETHL
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