Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7764
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7764, 501 aa
1>>>pF1KB7764 501 - 501 aa - 501 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1263+/-0.00101; mu= -2.7284+/- 0.062
mean_var=477.0633+/-97.058, 0's: 0 Z-trim(117.8): 12 B-trim: 182 in 1/54
Lambda= 0.058720
statistics sampled from 18662 (18674) to 18662 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.826), E-opt: 0.2 (0.574), width: 16
Scan time: 3.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10750.1 IRX3 gene_id:79191|Hs108|chr16 ( 501) 3370 299.4 5.9e-81
CCDS34132.1 IRX1 gene_id:79192|Hs108|chr5 ( 480) 941 93.6 5.1e-19
CCDS10751.1 IRX5 gene_id:10265|Hs108|chr16 ( 483) 797 81.4 2.4e-15
CCDS58462.1 IRX5 gene_id:10265|Hs108|chr16 ( 482) 795 81.3 2.7e-15
CCDS3868.1 IRX2 gene_id:153572|Hs108|chr5 ( 471) 727 75.5 1.4e-13
CCDS3867.1 IRX4 gene_id:50805|Hs108|chr5 ( 519) 703 73.5 6.3e-13
CCDS32449.1 IRX6 gene_id:79190|Hs108|chr16 ( 446) 626 66.9 5.2e-11
>>CCDS10750.1 IRX3 gene_id:79191|Hs108|chr16 (501 aa)
initn: 3370 init1: 3370 opt: 3370 Z-score: 1566.8 bits: 299.4 E(32554): 5.9e-81
Smith-Waterman score: 3370; 99.8% identity (99.8% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSFPQLGYQYIRPLYPSERPGAAGGSGGSAGARGGLGAGASELNASGSLSNVLSSVYGAP
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CCDS10 MSFPQLGYQYIRPLYPSERPGAAGGSGGSAGARGGLGAGASELNASGSLSNVLSSVYGAP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YAAAAAAAAAQGYGAFLPYAAELPIFPQLGAQYELKDSPGVQHPAAAAAFPHPHPAFYPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YAAAAAAAAAQGYGAFLPYAAELPIFPQLGAQYELKDSPGVQHPAAAAAFPHPHPAFYPY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GQYQFGDPSRPKNATRESTSTLKAWLNEHRKNPYPTKGEKIMLAIITKMTLTQVSTWFAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GQYQFGDPSRPKNATRESTSTLKAWLNEHRKNPYPTKGEKIMLAIITKMTLTQVSTWFAN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ARRRLKKENKMTWAPRSRTDEEGNAYGSEREEEDEEEDEEDGKRELELEEEELGGEEEDT
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CCDS10 ARRRLKKENKMTWAPRSRTDEEGNAYGSEREEEDEEEDEEDGKRELELEEEELGGEEEDT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GGEGLADDDEDEEIDLENLDGAATEPELSLAGAARRDGDLGLGPISDSKNSDSEDSSEGL
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CCDS10 GGEGLADDDEDEEIDLENLDGAATEPELSLAGAARRDGDLGLGPISDSKNSDSEDSSEGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 EDRPLPVLSLAPAPPPVAVASPSLPSPPVSLDPCAPAPAPASALQKPKIWSLAETATSPD
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CCDS10 EDRPLPVLSLAPAPPPVAVASPSLPSPPVSLDPCAPAPAPASALQKPKIWSLAETATSPD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 NPRRSPPGAGGSPPGAAVAPSALQLSPAAAAAAAHRLVSAPLGKFPAWTNRPFPGPPPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NPRRSPPGAGGSPPGAAVAPSALQLSPAAAAAAAHRLVSAPLGKFPAWTNRPFPGPPPGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 RPHPLSLLGSAPPHLLGLPGAAGHPAAAAAFARPAEPEGGTDRCSALEVEKKLLKTAFQP
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CCDS10 RLHPLSLLGSAPPHLLGLPGAAGHPAAAAAFARPAEPEGGTDRCSALEVEKKLLKTAFQP
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KB7 VPRRPQNHLDAALVLSALSSS
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CCDS10 VPRRPQNHLDAALVLSALSSS
490 500
>>CCDS34132.1 IRX1 gene_id:79192|Hs108|chr5 (480 aa)
initn: 759 init1: 592 opt: 941 Z-score: 455.0 bits: 93.6 E(32554): 5.1e-19
Smith-Waterman score: 1118; 44.8% identity (61.7% similar) in 525 aa overlap (1-501:1-480)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MSFPQLGY-QYIRPLYPS----ERPGAAGGSGGSAGARGGLGAGASELNASGSLSNVLSS
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CCDS34 MSFPQLGYPQYLSAAGPGAYGGERPGVLAAAAAAAAAASSGRPGAAELGG-GAGAAAVTS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 VYGAPYAAAAAAAAAQGYGAFLPYAAELPIFPQLGAQYELKDSPGVQHPAAAAAFPHPHP
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CCDS34 VLGM-YAAAGPYAGAPNYSAFLPYAADLSLFSQMGSQYELKDNPGV-HPATFAA--HTAP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 AFYPYGQYQFGDPSRPKNATRESTSTLKAWLNEHRKNPYPTKGEKIMLAIITKMTLTQVS
:.:::::.:.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AYYPYGQFQYGDPGRPKNATRESTSTLKAWLNEHRKNPYPTKGEKIMLAIITKMTLTQVS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 TWFANARRRLKKENKMTWAPRSRTDEEGNAYGSEREEEDEEEDEEDGKRELELEEEELGG
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CCDS34 TWFANARRRLKKENKVTWGARSKDQEDGALFGSDTEG-DPEKAEDD--EEIDLESIDIDK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 EEEDTGGEGLADDDEDEEIDLENLDGAATEPELSLAGAARRDGDLGLGPISDSKNSDSED
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CCDS34 IDEHDGDQS-NEDDEDK----------AEAPHAPAAPSALAR-DQG-SPLAAADVLKPQD
240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SSEGLEDRPLPVLSLAPAPPPVAVASPSLPSPPVSLDPCAPAPAPASALQKPKIWSLAET
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CCDS34 S-------PLGLAKEAPEP-----GSTRLLSPGAAAGGLQGAPHG-----KPKIWSLAET
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 ATSPDN-PRRSPPGAGGSPPGAAVAPSALQLSPAAAAAAAHRLVSAPLGKFPAWTN----
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CCDS34 ATSPDGAPKASPPPPAGHP--GAHGPSAGAPLQHPAFLPSHGLYTCHIGKFSNWTNSAFL
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450
pF1KB7 --------RPFPG-PPPGPRPHPLSLLGSAPPH--LLGLPGAAGHPAAAAAFARPAEPEG
: : : : :: : . ::. . ::: . :.. . :. ::
CCDS34 AQGSLLNMRSFLGVGAPHAAPHGPHLPAPPPPQPPVAIAPGALNGDKASVR-SSPTLPE-
390 400 410 420 430
460 470 480 490 500
pF1KB7 GTDRCSALEVEKKLLKTAFQPVPRR---PQNHLDAALVLSALSSS
: . . ::. :::: ::. . .:.:: :.
CCDS34 -RDLVPRPDSPAQQLKSPFQPVRDNSLAPQE--GTPRILAALPSA
440 450 460 470 480
>>CCDS10751.1 IRX5 gene_id:10265|Hs108|chr16 (483 aa)
initn: 758 init1: 522 opt: 797 Z-score: 389.0 bits: 81.4 E(32554): 2.4e-15
Smith-Waterman score: 806; 38.3% identity (57.0% similar) in 491 aa overlap (1-479:1-465)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSFPQLGYQYIRPLYPSERPGAAGGSGGSAGARGGLGAGASELNASGSLSNVLSSVYGAP
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CCDS10 MSYPQ-GYLY----QPSASLALYSCPAYSTSVIS--GPRTDELGRSSSGSAF------SP
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB7 YAAAAA-AAAAQGYGAFLPYAAELPIFPQLGAQYELKDSPGVQHPAAAAAFPHPHPAFYP
::...: .: . ::.. : :.:. : .: :: . :. :... . :: :
CCDS10 YAGSTAFTAPSPGYNSHLQYGAD-PAAAAAAAFSSYVGSPYDHTPGMAGSLGY-HPYAAP
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YGQYQFGDPSRPKNATRESTSTLKAWLNEHRKNPYPTKGEKIMLAIITKMTLTQVSTWFA
:.: .:::. :::::..:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LGSYPYGDPAYRKNATRDATATLKAWLNEHRKNPYPTKGEKIMLAIITKMTLTQVSTWFA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 NARRRLKKENKMTWAPRSRTD--EEGNAYGSEREEEDEEEDEEDGKRELELEEEELGGEE
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CCDS10 NARRRLKKENKMTWTPRNRSEDEEEEENIDLEKNDEDEPQKPED---KGDPEGPEAGGAE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 ED--TGGEGLADDDEDEEIDLENLDGAATEPELSLAGAARRDGDLGLGPISDSKNSDSED
. .: : : . : :. .. ... . : : :: . : .
CCDS10 QKAASGCERLQGPPTPAGKETE---GSLSDSDFKEPPSEGRLDALQ-GPPRTGGPSPAGP
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SSEGLEDRP---LPVLSLAPAPPPVAVASPSLPSPPVSLDPCAPAPAPASALQKPKIWSL
.. : . : :. . ::.: :.: : :. : :. : : : ..: :::.:::
CCDS10 AAARLAEDPAPHYPAGAPAPGPHPAAGEVPPGPGGP-SVIHSPPPPPPPAVLAKPKLWSL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KB7 AETATSPDNPRRSPPGAGGSP----PGAAVAPSALQLSPAAAAAAAHRLVSAPLGKFPAW
:: ::: :. . . : ::: :: .: .:: : :. : : : :: ::.
CCDS10 AEIATSSDKVKDGGGGNEGSPCPPCPGP-IAGQALGGSRASPAPAPSRSPSAQC-PFPGG
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 TNRPFPGPPPGPRPHPLSLLGSAPPHLLGLPGAAGHPAAAAAFARPAEPEGGTDRCSALE
: : .: . :: :: : :: . :... . . . .: .::
CCDS10 TVLSRPLYYTAPFYPGYTNYGSFG-HLHGHPGPGPGPTTGPGSHFNGLNQTVLNRADALA
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500
pF1KB7 VEKKLLKTAFQPVPRRPQNHLDAALVLSALSSS
. :.:.. :
CCDS10 KDPKMLRSQSQLDLCKDSPYELKKGMSDI
460 470 480
>>CCDS58462.1 IRX5 gene_id:10265|Hs108|chr16 (482 aa)
initn: 751 init1: 515 opt: 795 Z-score: 388.1 bits: 81.3 E(32554): 2.7e-15
Smith-Waterman score: 804; 38.1% identity (56.6% similar) in 491 aa overlap (1-479:1-464)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSFPQLGYQYIRPLYPSERPGAAGGSGGSAGARGGLGAGASELNASGSLSNVLSSVYGAP
::.:: :: : :: . . . :... . : ..::. :.: : .:
CCDS58 MSYPQ-GYLY----QPSASLALYSCPAYSTSVIS--GPRTDELGRSSSGSAF------SP
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB7 YAAAAA-AAAAQGYGAFLPYAAELPIFPQLGAQYELKDSPGVQHPAAAAAFPHPHPAFYP
::...: .: . ::.. : :.:. : .: :: . :. :... . :: :
CCDS58 YAGSTAFTAPSPGYNSHLQYGAD-PAAAAAAAFSSYVGSPYDHTPGMAGSLGY-HPYAAP
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 YGQYQFGDPSRPKNATRESTSTLKAWLNEHRKNPYPTKGEKIMLAIITKMTLTQVSTWFA
:.: .:::. :::::..:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LGSYPYGDPAYRKNATRDATATLKAWLNEHRKNPYPTKGEKIMLAIITKMTLTQVSTWFA
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 NARRRLKKENKMTWAPRSRTD--EEGNAYGSEREEEDEEEDEEDGKR----ELELEEEEL
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CCDS58 NARRRLKKENKMTWTPRNRSEDEEEEENIDLEKNDEDEPQKPEDKGDPEGPEAGAEQKAA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 GGEEEDTGGEGLADDDEDEEIDLENLDGAATEPEL-SLAGAARRDGDLGLGPISDSKNSD
.: :. : : . . .. .. .: .: .: : : : :: .
CCDS58 SGCERLQGPPTPAGKETEGSLSDSDFKEPPSEGRLDALQGPPRTGGPSPAGP---AAARL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SEDSSEGLEDRPLPVLSLAPAPPPVAVASPSLPSPPVSLDPCAPAPAPASALQKPKIWSL
.:: . :. . ::.: :.: : :. : :. : : : ..: :::.:::
CCDS58 AEDPAPHY-----PAGAPAPGPHPAAGEVPPGPGGP-SVIHSPPPPPPPAVLAKPKLWSL
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KB7 AETATSPDNPRRSPPGAGGSP----PGAAVAPSALQLSPAAAAAAAHRLVSAPLGKFPAW
:: ::: :. . . : ::: :: .: .:: : :. : : : :: ::.
CCDS58 AEIATSSDKVKDGGGGNEGSPCPPCPGP-IAGQALGGSRASPAPAPSRSPSAQC-PFPGG
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 TNRPFPGPPPGPRPHPLSLLGSAPPHLLGLPGAAGHPAAAAAFARPAEPEGGTDRCSALE
: : .: . :: :: : :: . :... . . . .: .::
CCDS58 TVLSRPLYYTAPFYPGYTNYGSFG-HLHGHPGPGPGPTTGPGSHFNGLNQTVLNRADALA
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500
pF1KB7 VEKKLLKTAFQPVPRRPQNHLDAALVLSALSSS
. :.:.. :
CCDS58 KDPKMLRSQSQLDLCKDSPYELKKGMSDI
460 470 480
>>CCDS3868.1 IRX2 gene_id:153572|Hs108|chr5 (471 aa)
initn: 650 init1: 513 opt: 727 Z-score: 357.1 bits: 75.5 E(32554): 1.4e-13
Smith-Waterman score: 782; 38.2% identity (58.4% similar) in 497 aa overlap (1-480:1-452)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MSFPQLGYQYIRPLYPSERPGAAGGSGGSAGARGGLGAGASELNASGSLSNVLSSVYGAP
::.:: :: : . ::. . . : . ..:.: :: : .. ....: :
CCDS38 MSYPQ-GYLY-------QAPGSLALYSCPAYGASALAAPRSEELARSASGSAFSPY---P
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB7 YAAAAAAAAAQGYGAFLPYAAELPI----FPQ-LGAQYELKDSPGVQHPAAAAAFPHPH-
.:: .: :: :.:. : :.:. ::. .:: :. . :. ..: .. ::.
CCDS38 GSAAFTAQAATGFGSPLQYSADAAAAAAGFPSYMGAPYD-AHTTGM---TGAISY-HPYG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 PAFYPYGQYQFGDPSRPKNATRESTSTLKAWLNEHRKNPYPTKGEKIMLAIITKMTLTQV
: ::: :..::. :::::..:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 SAAYPY---QLNDPAYRKNATRDATATLKAWLNEHRKNPYPTKGEKIMLAIITKMTLTQV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 STWFANARRRLKKENKMTWAPRSRTDEEGNAYGSEREEEDEEEDEEDGKRELELEEEELG
::::::::::::::::::::::.....: . :. . .:: :. . : :.: ..
CCDS38 STWFANARRRLKKENKMTWAPRNKSEDEDEDEGDATRSKDESPDKAQEGTETSAEDEGIS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 GEEEDTGGEGLADDDEDEEIDLENLDGAATEPELSLAGAARRDGDLGLGPISDSKNSDSE
..:.: . . : : :.: : .: : .:. .: . :....: :
CCDS38 -----LHVDSLTDHSCSAESDGEKLPCRAGDP-LCESGSECKDK---YDDLEDDEDDD-E
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KB7 DSSEGLEDRPLPVLSL------AP--APPPVAVASPSLPSPPVS-LDPCAPAPAPASALQ
.. .:: : :: : :: .::: :. . .: : .: :: :: .
CCDS38 EGERGLAP-PKPVTSSPLTGLEAPLLSPPPEAAPRGGRKTPQGSRTSPGAPPPA-----S
280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 KPKIWSLAETATSPDNPRRSPPGAGGSPPG--AAVAPSALQLSPAAAAAAAHRLVSAPLG
:::.::::: ::: . :: : ::: ::.::.. :... : : ::
CCDS38 KPKLWSLAEIATSDLKQPSLGPGCG--PPGLPAAAAPASTGAPPGGSPYPASPL----LG
330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 KFPAWTNRPFPGPPPGPRPHPLSLLGSAPPHLLGLPGAAGHPAAAAAFARPAEPEGGTDR
. : . . :: : . .: :.. :: .::. :. : : : ..:
CCDS38 R-PLYYTSPFYGNYTNYGNLNAALQGQG---LLRYNSAAAAPGEALHTAPKAASDAGKAG
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500
pF1KB7 CSALEVEKKLLKTAFQPVPRRPQNHLDAALVLSALSSS
:: . . ...:
CCDS38 AHPLESHYRSPGGGYEPKKDASEGCTVVGGGVQPYL
440 450 460 470
>>CCDS3867.1 IRX4 gene_id:50805|Hs108|chr5 (519 aa)
initn: 654 init1: 473 opt: 703 Z-score: 345.6 bits: 73.5 E(32554): 6.3e-13
Smith-Waterman score: 740; 36.1% identity (56.9% similar) in 534 aa overlap (1-465:1-519)
10 20 30 40
pF1KB7 MSFPQLGYQYIR-P--LYPSERPGAAGGSGGSAGARGGLGAGA----------SELNASG
::.::.:: : : :. .. .. ::: . : .: .:.: :.: :..
CCDS38 MSYPQFGYPYSSAPQFLMATNSLSTCCESGGRTLADSGPAASAQAPVYCPVYESRLLATA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 S--LSNVLS-SVYGAPYAAAAAAAAAQGYGAFLPYAAELPIFPQLGAQYELKDSPGVQH-
:... . .:::.::... :::: .. :..: : .:.. .. ::. : :
CCDS38 RHELNSAAALGVYGGPYGGS------QGYGNYVTYGSEASAFYSLNS-FDSKDGSGSAHG
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB7 ---PAAAAAFPHPHPAF--YPYGQYQFGDP-SRPKNATRESTSTLKAWLNEHRKNPYPTK
::::: .:. .::. ::: .: : .: ::::::.::::::::.::::::::::
CCDS38 GLAPAAAAYYPY-EPALGQYPYDRYGTMDSGTRRKNATRETTSTLKAWLQEHRKNPYPTK
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 GEKIMLAIITKMTLTQVSTWFANARRRLKKENKMTWAPRSRTDEEGNAYGSEREEEDEEE
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CCDS38 GEKIMLAIITKMTLTQVSTWFANARRRLKKENKMTWPPRNKCADEKRPYAEGEEEEGGEE
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 DEEDGKRELELEEEELGGEEEDTGGEGLADDDEDEEIDLENLDGAATEPELSLAGAARRD
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