Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7733
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7733, 433 aa
1>>>pF1KB7733 433 - 433 aa - 433 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3215+/-0.0012; mu= 8.5122+/- 0.070
mean_var=228.5327+/-47.639, 0's: 0 Z-trim(108.8): 887 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.084840
statistics sampled from 9430 (10420) to 9430 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.32), width: 16
Scan time: 3.100
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19 ( 491) 493 73.9 3.9e-13
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CCDS12963.1 ZNF552 gene_id:79818|Hs108|chr19 ( 407) 454 69.0 9.4e-12
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CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 455 69.4 1.1e-11
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 455 69.4 1.1e-11
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 450 68.8 1.7e-11
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 450 68.8 1.8e-11
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 450 68.8 1.8e-11
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 450 68.9 2e-11
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 450 68.9 2.1e-11
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 445 68.3 2.9e-11
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CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 437 67.1 4.5e-11
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 437 67.1 4.8e-11
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CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 437 67.2 5.2e-11
CCDS12638.1 ZNF285 gene_id:26974|Hs108|chr19 ( 590) 436 67.0 5.5e-11
CCDS74389.1 ZNF285 gene_id:26974|Hs108|chr19 ( 597) 436 67.1 5.5e-11
CCDS42535.1 ZNF626 gene_id:199777|Hs108|chr19 ( 528) 435 66.9 5.5e-11
CCDS2708.1 ZNF662 gene_id:389114|Hs108|chr3 ( 426) 433 66.5 5.8e-11
CCDS46807.1 ZNF662 gene_id:389114|Hs108|chr3 ( 452) 433 66.5 6e-11
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 434 66.8 6.3e-11
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 437 67.4 6.4e-11
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 434 66.8 6.6e-11
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 435 67.0 6.6e-11
CCDS75971.1 ZNF630 gene_id:57232|Hs108|chrX ( 533) 433 66.6 6.6e-11
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 434 66.8 6.7e-11
CCDS74924.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 373) 430 66.1 6.8e-11
CCDS43677.1 REPIN1 gene_id:29803|Hs108|chr7 ( 567) 433 66.7 6.9e-11
CCDS6354.1 ZNF572 gene_id:137209|Hs108|chr8 ( 529) 432 66.5 7.2e-11
CCDS33116.3 ZNF628 gene_id:89887|Hs108|chr19 (1059) 437 67.5 7.2e-11
CCDS46163.1 ZNF766 gene_id:90321|Hs108|chr19 ( 468) 431 66.3 7.2e-11
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 435 67.1 7.2e-11
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 435 67.1 7.2e-11
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 435 67.1 7.3e-11
CCDS47745.1 REPIN1 gene_id:29803|Hs108|chr7 ( 624) 433 66.7 7.3e-11
>>CCDS12958.1 ZSCAN4 gene_id:201516|Hs108|chr19 (433 aa)
initn: 2946 init1: 2946 opt: 2946 Z-score: 1972.6 bits: 374.1 E(32554): 1.5e-103
Smith-Waterman score: 2946; 100.0% identity (100.0% similar) in 433 aa overlap (1-433:1-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MALDLRTIFQCEPSENNLGSENSAFQQSQGPAVQREEGISEFSRMVLNSFQDSNNSYARQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MALDLRTIFQCEPSENNLGSENSAFQQSQGPAVQREEGISEFSRMVLNSFQDSNNSYARQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ELQRLYRIFHSWLQPEKHSKDEIISLLVLEQFMIGGHCNDKASVKEKWKSSGKNLERFIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELQRLYRIFHSWLQPEKHSKDEIISLLVLEQFMIGGHCNDKASVKEKWKSSGKNLERFIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DLTDDSINPPALVHVHMQGQEALFSEDMPLRDVIVHLTKQVNAQTTREANMGTPSQTSQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DLTDDSINPPALVHVHMQGQEALFSEDMPLRDVIVHLTKQVNAQTTREANMGTPSQTSQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TSLETGQGYEDEQDGWNSSSKTTRVNENITNQGNQIVSLIIIQEENGPRPEEGGVSSDNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TSLETGQGYEDEQDGWNSSSKTTRVNENITNQGNQIVSLIIIQEENGPRPEEGGVSSDNP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 YNSKRAELVTARSQEGSINGITFQGVPMVMGAGCISQPEQSSPESALTHQSNEGNSTCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YNSKRAELVTARSQEGSINGITFQGVPMVMGAGCISQPEQSSPESALTHQSNEGNSTCEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 HQKGSHGVQKSYKCEECPKVFKYLCHLLAHQRRHRNERPFVCPECQKGFFQISDLRVHQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HQKGSHGVQKSYKCEECPKVFKYLCHLLAHQRRHRNERPFVCPECQKGFFQISDLRVHQI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 IHTGKKPFTCSMCKKSFSHKTNLRSHERIHTGEKPYTCPFCKTSYRQSSTYHRHMRTHEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IHTGKKPFTCSMCKKSFSHKTNLRSHERIHTGEKPYTCPFCKTSYRQSSTYHRHMRTHEK
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB7 ITLPSVPSTPEAS
:::::::::::::
CCDS12 ITLPSVPSTPEAS
430
>>CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6 (545 aa)
initn: 1032 init1: 363 opt: 531 Z-score: 374.0 bits: 78.6 E(32554): 1.6e-14
Smith-Waterman score: 535; 29.9% identity (55.8% similar) in 405 aa overlap (41-418:50-454)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 CEPSENNLGSENSAFQQSQGPAVQREEGISEFSRMVLNSFQDSNNSYARQELQRLYRIFH
: ::. . .:. . . :. :.:: ..
CCDS46 TGLLTVKVEKEEASALTAEVRAPCSPARGPERSRQRFRGFRYPEAAGPREALSRLRELCG
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pF1KB7 SWLQPEKHSKDEIISLLVLEQFMIGGHCNDKASVKEKWKSSGKNLERFIEDLTDDSINPP
.::::: :::..:. :::::::. : .. :.:. ::... ..: : . .:
CCDS46 QWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGNLQSWVREQHPESGEEVVVLLEYLERQLDEPA
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180
pF1KB7 ALVHVHMQGQEALFSEDMPLRDVIVHLTKQVNAQTTREANMGTPSQTSQDTSLET---GQ
: : :::: : . : .. ..: . . . . . :: .: :.. .:
CCDS46 PQVPVGDQGQELLCCKMALLTQTQGSQSSQCQPMKALFKHESLGSQPLHDRVLQVPGLAQ
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230
pF1KB7 GYEDEQDGWNSSS---------KTTRVNENITNQGNQI-VSLIIIQEENGPRPEEGGVSS
: ..:. .: : : ..: .:. : . . ... . . . ::
CCDS46 GGCCREDAMVASRLTPGSQGLLKMEDVALTLTPGWTQLDSSQVNLYRDEKQENHSSLVSL
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280
pF1KB7 DNPYNSKRAELVTARS----QEGSINGIT--FQGVPMVMGAGCISQPEQSSPESAL---T
. ..: .: ... ..:.: . . .: :: : . ..:.
CCDS46 GGEIQTKSRDLPPVKKLPEKEHGKICHLREDIAQIPTHAEAGEQEGRLQRKQKNAIGSRR
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 HQSNE-GNSTCE----VHQKGSHGVQKSYKCEECPKVFKYLCHLLAHQRRHRNERPFVCP
: .: :.: . .... : .: :.::.: :.: :. ::: : .:.:. :
CCDS46 HYCHECGKSFAQSSGLTKHRRIHTGEKPYECEDCGKTFIGSSALVIHQRVHTGEKPYECE
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pF1KB7 ECQKGFFQISDLRVHQIIHTGKKPFTCSMCKKSFSHKTNLRSHERIHTGEKPYTCPFCKT
:: : : . :.: :: :::.::. :. : :.::.. .: :..:::::::: : .:
CCDS46 ECGKVFSHSSNLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHKIHTGEKPYQCNMCGK
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410 420 430
pF1KB7 SYRQSSTYHRHMRTHEKITLPSVPSTPEAS
..:..: ::.: :
CCDS46 AFRRNSHLLRHQRIHGDKNVQNPEHGESWESQGRTESQWENTEAPVSYKCNECERSFTRN
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>>CCDS76814.1 ZNF500 gene_id:26048|Hs108|chr16 (441 aa)
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Smith-Waterman score: 539; 30.4% identity (53.4% similar) in 425 aa overlap (25-418:31-431)
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pF1KB7 MALDLRTIFQCEPSENNLGSENSAFQQSQGPAVQREEGISEFSRMVLNSFQDSN
: . :.:. :. : :... : ..
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pF1KB7 NSYARQELQRLYRIFHSWLQPEKHSKDEIISLLVLEQFMIGGHCNDKASVKEKWKSSGKN
. :. :.::... ::.:: ..:..:. :::::::. . .: :.:. ::..
CCDS76 VAGPREALSRLWELCCRWLRPELRTKEQILELLVLEQFLTVLPGEIQARVREQQPESGEE
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pF1KB7 LERFIEDLTDDSINPPALVHVHMQ-GQEALFSEDMPLRDVIVHLTKQVNAQT--------
..: : : . : : :.: : ....:: : .:..::
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pF1KB7 TREANMGTPSQTS---QDTSL---ETGQGYEDEQDGWNSS---SKTTRVNENITN-----
.: ... :.: : : : : : .:. ..: : ..: :. .
CCDS76 ARFSSQQPPAQLSHRPQRGPLLWPERGPPAPRHQEMASASPFLSAWSQVPVNLEDVAVYL
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pF1KB7 QGNQIVSLIIIQ-----EENGP--RPEEGGVSS-DNPYNSKRAELVTARSQEGSINGITF
.:.. . : :..:: . :.:: . : : . ....:: : : . .
CCDS76 SGEEPRCMDPAQRDAPLENEGPGIQLEDGGDGREDAPLRMEWYRVLSARCQ-GPGHPLPG
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pF1KB7 QGVPMVMGAGCISQPEQSSPESALTHQSNEGNSTCEVHQKGSHGVQKSYKCEECPKVFKY
: : : .::. . : . ...:::..: : : :: : :.
CCDS76 QRPAPVRGLVRPDQPRGGPPPG----------------RRASHGADKPYTCPECGKGFSK
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330 340 350 360 370 380
pF1KB7 LCHLLAHQRRHRNERPFVCPECQKGFFQISDLRVHQIIHTGKKPFTCSMCKKSFSHKTNL
:: ::: : .:::. : : ::: . :.. .:: .:::.::. : : : ::....:
CCDS76 TSHLTKHQRTHTGERPYKCLVCGKGFSDRSNFSTHQRVHTGEKPYPCPECGKRFSQSSSL
340 350 360 370 380 390
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pF1KB7 RSHERIHTGEKPYTCPFCKTSYRQSSTYHRHMRTHEKITLPSVPSTPEAS
:.: :.::.::.: : . .:: . : :::
CCDS76 VIHRRTHSGERPYACTQCGKRFNNSSHFSAHRRTHTGHILRSGCT
400 410 420 430 440
>>CCDS32383.1 ZNF500 gene_id:26048|Hs108|chr16 (480 aa)
initn: 513 init1: 406 opt: 524 Z-score: 370.0 bits: 77.7 E(32554): 2.7e-14
Smith-Waterman score: 570; 29.5% identity (55.2% similar) in 451 aa overlap (25-430:31-473)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MALDLRTIFQCEPSENNLGSENSAFQQSQGPAVQREEGISEFSRMVLNSFQDSN
: . :.:. :. : :... : ..
CCDS32 MATVPGLQPLPTLEQDLEQEEILIVKVEEDFCLEEEPSVETEDPSPETFRQLFRLFCYQE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NSYARQELQRLYRIFHSWLQPEKHSKDEIISLLVLEQFMIGGHCNDKASVKEKWKSSGKN
. :. :.::... ::.:: ..:..:. :::::::. . .: :.:. ::..
CCDS32 VAGPREALSRLWELCCRWLRPELRTKEQILELLVLEQFLTVLPGEIQARVREQQPESGEE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB7 LERFIEDLTDDSINPPALVHVHMQ-GQEALFSEDMPLRDVIVHLTKQVNAQT--------
..: : .: . : : :.: : ....:: : .:..::
CCDS32 AVVLVEGLQR---KP----RKHRQRGSELLSDDEVPLGIGGQFLKHQAEAQPEDLSLEEE
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB7 TREANMGTPSQTS---QDTSL---ETGQGYEDEQDGWNSS---SKTTRVNENITN-----
.: ... :.: : : : : : .:. ..: : ..: :. .
CCDS32 ARFSSQQPPAQLSHRPQRGPLLWPERGPPAPRHQEMASASPFLSAWSQVPVNLEDVAVYL
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 QGNQIVSLIIIQ-----EENGP--RPEEGGVSS-DNPYNSKRAELVTARSQEGSINGITF
.:.. . : :..:: . :.:: . : : . ....:: : : . .
CCDS32 SGEEPRCMDPAQRDAPLENEGPGIQLEDGGDGREDAPLRMEWYRVLSARCQ-GPGHPLPG
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310
pF1KB7 QGVPMVMGAGCISQPEQSSPESALTHQSNEGNSTCEVHQKG------------SHGVQKS
: : : .::. . : . . .. . :: :: .: ..
CCDS32 QRPAPVRGLVRPDQPRGGPPPGRRASHGADKPYTCPECGKGFSKTSHLTKHQRTHTGERP
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 YKCEECPKVFKYLCHLLAHQRRHRNERPFVCPECQKGFFQISDLRVHQIIHTGKKPFTCS
::: : : :. .. .::: : .:.:. :::: : : : :.: .:. :.:..:..:.
CCDS32 YKCLVCGKGFSDRSNFSTHQRVHTGEKPYPCPECGKRFSQSSSLVIHRRTHSGERPYACT
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420
pF1KB7 MCKKSFSHKTNLRSHERIHTGEKPYTCPFCKTSYRQSSTYHRHMRTHEKI-TLPSV-PST
.: : :...... .:.: :::::::::: : ..:... :.:.::: .::.. : .
CCDS32 QCGKRFNNSSHFSAHRRTHTGEKPYTCPACGRGFRRGTDLHKHQRTHMGAGSLPTLQPVA
420 430 440 450 460 470
430
pF1KB7 PEAS
:
CCDS32 PGGPGAKA
480
>>CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 (538 aa)
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240 250 260 270 280
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CCDS46 CGKAFRRSSHLLRHQRIHTGDKNVQEPEQGEAWKSRMESQLENVETPMSYKCNECERSFT
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. .:...: . . .:: : . : :..: : .. ...: : ::
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CCDS12 ACGRAFSDCSALIRHLRIHSGEKPYQCKVCPKAFAQSSSLIEHQRIHTGEKPYKCSDCGK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]