FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7309, 911 aa
1>>>pF1KB7309 911 - 911 aa - 911 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4546+/-0.000966; mu= 5.9832+/- 0.058
mean_var=154.6373+/-30.996, 0's: 0 Z-trim(110.1): 83 B-trim: 91 in 2/49
Lambda= 0.103138
statistics sampled from 11277 (11359) to 11277 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.349), width: 16
Scan time: 4.550
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 6079 917.1 0
CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 3148 481.0 4.2e-135
CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 1304 206.5 1e-52
CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 1223 194.4 4.4e-49
CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 1113 178.0 3.5e-44
CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 1040 167.2 6e-41
CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 943 152.8 1.9e-36
CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 912 148.1 3.7e-35
CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 902 146.7 1.3e-34
CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 864 141.0 5.1e-33
CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 820 134.5 5.1e-31
CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 808 132.7 1.7e-30
CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 777 128.1 4.7e-29
CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 770 127.1 1.1e-28
CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 762 125.8 2e-28
CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 753 124.5 4.6e-28
CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 742 122.9 1.6e-27
CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 741 122.7 2.2e-27
CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 737 122.1 2.6e-27
CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 721 119.8 1.7e-26
CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 694 115.7 2.6e-25
CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 682 113.9 8.1e-25
CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 643 108.1 3.7e-23
CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 566 96.7 1.2e-19
CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 548 94.0 8.3e-19
CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 547 93.8 8.6e-19
CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 548 94.0 8.7e-19
CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 548 94.0 9.1e-19
CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 548 94.0 9.1e-19
CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 548 94.0 9.3e-19
CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 548 94.0 9.4e-19
CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 547 93.9 9.6e-19
CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 544 93.5 1.6e-18
CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 530 91.3 5.9e-18
CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 530 91.3 6e-18
CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 443 78.4 4e-14
>>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 (911 aa)
initn: 6079 init1: 6079 opt: 6079 Z-score: 4895.6 bits: 917.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6079; 100.0% identity (100.0% similar) in 911 aa overlap (1-911:1-911)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 LGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRKKLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRKKLW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEAVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 DLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEAVC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 IAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 IAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 DATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 DATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANTKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANTKD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 SADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 EMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIEMEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 EMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIEMEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 SSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPTDLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPTDLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 AARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDNATDSPKSSLKGSNPLKSRSLKVNFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 AARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDNATDSPKSSLKGSNPLKSRSLKVNFK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 ENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADFSLTTPQHISTILLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 ENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADFSLTTPQHISTILLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 SKGLSPRFPKQKLFPFSSRERRSFTEIDTGDDEDFLELPGAREEKQVDSSPNCFADKPSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 SKGLSPRFPKQKLFPFSSRERRSFTEIDTGDDEDFLELPGAREEKQVDSSPNCFADKPSD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 GRDPLREEGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYHAVSEVKKDSSQEGCKMENHLFAPEIHSNPGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS62 GRDPLREEGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYHAVSEVKKDSSQEGCKMENHLFAPEIHSNPGD
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB7 TGYCPTRETSM
:::::::::::
CCDS62 TGYCPTRETSM
910
>>CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 (858 aa)
initn: 3453 init1: 3024 opt: 3148 Z-score: 2539.0 bits: 481.0 E(32554): 4.2e-135
Smith-Waterman score: 3444; 63.3% identity (77.3% similar) in 912 aa overlap (6-911:2-858)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR
: :.... :::: ::::::..:.:::.:::::..::::: :::::::::::::::
CCDS13 MPAGMTKHGSRSTSSLPPEPMEIVRSKACSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTR
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFG
::::::::::.:::::::::.:..::::::::::::::::::::::.::::::::::::.
CCDS13 LGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRKKLW
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::: .::::::
CCDS13 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELKREAETLREREGEEFDNTCCAEKRKKLW
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 DLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEAVC
:::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::: ::::: .:: :::::::::
CCDS13 DLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLSTIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAHVEAVC
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 IAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
::::::::::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFFKGPLNAIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 DATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
: ::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DDTKFKSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNF
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 SEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANTKD
:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:..:..::: ::. . ::
CCDS13 SEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKD
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 SADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSAQKL
...::::::..:::....::::::.::::.: : .: ::::::::..:.:
CCDS13 KVQDNHLSPNKWKWTKRTLSETSSSKSFETKEQGSPEK-------ARSSSSPQHLNVQQL
480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 EMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIEMEEVVCPQEQLAVAQTEVIVDMKST
: .::...::: :.: . .:. . : .::.::: . : : . .:: ..::.:
CCDS13 EDMYNKMAKTQ--SQPILNTKESAAQ-SKPKEELEMESIPSPVAPLPT-RTEGVIDMRSM
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 SSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPTDLPGTEEHQRARGPPFLTLSREKGP
:::::: :::::: :. : :: . :.::. . : : . :
CCDS13 SSIDSFISCATDFPEATRF-------SHSPL---TSLPSKTGGSTA---PEVGWRGALG-
590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 AARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDNATDSPKSSLKGSNPLKSRSLKVNFK
: : . . .: . ..:: :: . .:::::.: .:::: :.:::::
CCDS13 -ASGGRF------VEANPSPDASQ---HSSF----FIESPKSSMKTNNPLKLRALKVNFM
640 650 660 670
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 ENRGSAPQTPPSTARPLPVTTADFSLTTPQHISTILLEETPSQGDRPLLGTEVSAPCQGP
:. :: :. : . . ... : . :. .:. : : .
CCDS13 EG-------DPSPLLPVLGMYHDPLRNRGSAAAAVAGLECATLLDKAVLSPESSIYTTAS
680 690 700 710 720 730
790 800 810 820 830
pF1KB7 SKGLSPRFPKQKL---FPFSSRERRSFTEIDTGDDEDFLELPGAREEKQVDSSPNCFADK
.: :: :... : : . .. . . :: :. ..: . : : :. . :
CCDS13 AK-TPPRSPEKHTAIAFNFEAGVHQ-YIDADTDDEGQLLYSVDSSPPK---SLPGSTSPK
740 750 760 770 780
840 850 860 870 880 890
pF1KB7 PSDGRDPLRE--EGSVGSSSPQDTGHNCRQDIYHAVSEVKKD-SSQEGCKMENHLFAPEI
: : .. :.: .::. .:: :: . . . : :.:: ::.:::. .:..
CCDS13 FSTGTRSEKNHFESSPLPTSPKFLRQNC---IYSTEALTGKGPSGQEKCKLENHI-SPDV
790 800 810 820 830 840
900 910
pF1KB7 HSNPGDTGYCPTRETSM
. :: .. ::. :.
CCDS13 RVLPGGGAHGSTRDQSI
850
>>CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 (500 aa)
initn: 1258 init1: 561 opt: 1304 Z-score: 1059.8 bits: 206.5 E(32554): 1e-52
Smith-Waterman score: 1304; 46.3% identity (73.3% similar) in 469 aa overlap (39-485:43-497)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 LNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCN
.:::: . ..:. .:.::::::
CCDS63 LDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLALGDCFTVNVGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVV
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110
pF1KB7 TH----------ESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALS
. : ::.::: : .::::::: :: .:..::::.::.::..::::
CCDS63 ASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFDRSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALS
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 FGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL-----RREAETMREREGEEFDNTCCP
: ::..::::::. ..:::. :: ..:: ..: : .. :...: : ..:.. ::
CCDS63 FLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKE-LSETLDFKKDTEDQESQHESE-QDFSQGPCP
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQL
:.:::..::::.::.::.:....::.:.:.: : ..: . ::. : :: :
CCDS63 TVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGVISIIFVVVSIINMALMS-AELSWLDL--QL-----L
200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 AHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTES---NKSV
.: :::.::: :..:::: .. .:.. :.::::::::.:.:. :.:: ....
CCDS63 EILEYVCISWFTGEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITL-LVESLSGSQTT
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS
...:: :.::..:..: ::.:::.::::::.:::.:. . :.:.:::.:::..:: :::
CCDS63 QELENVGRIVQVLRLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 SLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA
.. .:::.. : :::.: ..:::: .::::::::: : : ::::. .: ..:.::.:
CCDS63 TVEYFAEQSIPDTTFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLA
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460
pF1KB7 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRN---GSIVSMNLKDAFARS-MELID
::: :: . :: : : .: :...::::.. .: : .:.::.:..::: ::..
CCDS63 LPIAIINDRFSACYFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLR
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 VAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNN
. :. : :.:..:. :.
CCDS63 L---KGRERASTRSSGGDDFWF
490 500
>>CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 (494 aa)
initn: 1196 init1: 873 opt: 1223 Z-score: 994.7 bits: 194.4 E(32554): 4.4e-49
Smith-Waterman score: 1223; 40.6% identity (73.9% similar) in 463 aa overlap (22-481:10-466)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR
::: . . . . .. .::::. . . :.. :.::
CCDS16 MDGSGERSLPEPGSQSSAASDDIEIVVNVGGVRQVLYGDLLSQYPETR
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB7 LGKLRDC--NTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALS
:..: .: . ..... .::::. .. :..::: : :: ... : :..:: . .: .
CCDS16 LAELINCLAGGYDTIFSLCDDYDPGKREFYFDRDPDAFKCVIEVYYFGEVHMKKGICPIC
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 FGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKRKK
: .:.:.: .: .:..::... .:.:.. ::. :... . . : . . .:
CCDS16 FKNEMDFWKVDLKFLDDCCKSHLSEKREEL-EEIARRVQLILDDLGVDAAEGRWRRCQKC
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEA
.: .::::.:: :...:..:.:.:..:.... ..:.:::: : :. .. : .::.
CCDS16 VWKFLEKPESSCPARVVAVLSFLLILVSSVVMCMGTIPELQVLDAEGNRVEHPTLENVET
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRR
.::.:::.:::::..::::: .: . .:..:.:::::.::.. ::. . .... ::..
CCDS16 ACIGWFTLEYLLRLFSSPNKLHFALSFMNIVDVLAILPFYVSLTLTHLGARMMELTNVQQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 VVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEK
.:: .::::: ::.::::::.:::.: ..:.::..:::::...::.::..::.: . :.
CCDS16 AVQALRIMRIARIFKLARHSSGLQTLTYALKRSFKELGLLLMYLAVGIFVFSALGYTMEQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 DEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVN
.. : : ::: ::::: ::::::::::::::: :::. ... . ::..::::: :.:
CCDS16 SHPETLFKSIPQSFWWAIITMTTVGYGDIYPKTTLGKLNAAISFLCGVIAIALPIHPIIN
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 NFSEFYKEQKRQEKAIKRR-EALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESAN
:: ..:..:. : : :.. : .: . .:. . : . .:: .: .. : ::. :
CCDS16 NFVRYYNKQRVLETAAKHELELMELNSSSGG----EGKTGGSRS-DLDNLPPEPAGKEAP
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 TKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQHLSA
. .:
CCDS16 SCSSRLKLSHSDTFIPLLTEEKHHRTRLQSCK
470 480 490
>>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 (466 aa)
initn: 941 init1: 398 opt: 1113 Z-score: 906.7 bits: 178.0 E(32554): 3.5e-44
Smith-Waterman score: 1113; 40.6% identity (74.2% similar) in 419 aa overlap (32-441:14-430)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 AEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRL
: .:.: ::::: .. : .: : : .::
CCDS12 MEPWPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRLAWAALARCPLARL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFGQ
.:: : :..::.:::::.....:.:::: : :: .:. . :.:::.... :::.: .
CCDS12 ERLRACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKLRLLRGPCALAFRD
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB7 ELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDK----RK
:: :::::: :: :: : ....:. : : . : : .: . :.
CCDS12 ELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEA--RAGPTERGAQGSPARALGPRGRLQRGRR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDN-RQLAHV
.: :....:.:..:.:..: ::. :.......: :.:.:... .: :. . . :.: .
CCDS12 RLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEEERGECSPKCRSLFVL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 EAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFL--TESNKSVLQFQ
:.::.:::..:.::: :.. .: :...:::.::.::.::.::...: . . .. ..
CCDS12 ETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSLLLGLAAGPGGTKLLE
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 NVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVF
. :....: .:.: ...::::: ::.:::.:.:: :.:::.::: ... .:. ::
CCDS12 RAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCAREFGLLLLFLCVAMALFAPLVH
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 FAEKDEDATK-FTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPI
.::.. : . :.:.:::.:::.:.::::::::. :..: :..:. ..:.:..:.:.
CCDS12 LAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLPGQVVALSSILSGILLMAFPV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 PIIVNNFSEFYKEQK-RQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKA
: ..::. :.: : .:..: . . ::.
CCDS12 TSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATEDSSQGPDSAGLADDSADALW
410 420 430 440 450 460
>>CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (425 aa)
initn: 1026 init1: 381 opt: 1040 Z-score: 848.6 bits: 167.2 E(32554): 6e-41
Smith-Waterman score: 1040; 40.2% identity (70.7% similar) in 413 aa overlap (37-441:11-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 PGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRD
: .:::: . . . : .: :...:.
CCDS42 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 CNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRT-GKLHMMEEMCALSFGQELDY
: .....:::::::. ..:::::::: :: :: . : :::.. .:: ::: .:. :
CCDS42 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 WGIDEIYLESCCQARYHQK-KEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPDKR--KKLWDL
::.. .:: ::: : .. .. .. : .. . :.. :..: ...
CCDS42 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSDTYTFYSADEPGVLGRDEARPGGAEAAPSRRWLERMRRT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLAHVEAVCIA
.:.:.::.::.::: ::..:...: ..: .:::. ... .. :.:. .::.::.
CCDS42 FEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRI-IEAICIG
170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 WFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQI
::: : ..::. : :: .: : :::.:::::: :::.....: . :.: . ....
CCDS42 WFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENSQLQRAGVTLRV
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 FRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKDED-
.:.:::. ..::::: :::.::.::.: : :. .:..:. ... :::.: . :. :
CCDS42 LRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDL
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410
pF1KB7 --ATK-FTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVN
..: ::::::. ::. :.::::::::.:: :. :.:.::.: ..:....:::: .: .
CCDS42 ETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYH
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 NFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANT
.: . :.: : . .: . :
CCDS42 SFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN
400 410 420
>>CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 (630 aa)
initn: 778 init1: 492 opt: 943 Z-score: 767.9 bits: 152.8 E(32554): 1.9e-36
Smith-Waterman score: 981; 31.4% identity (64.1% similar) in 615 aa overlap (22-627:28-606)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLD
: : :..: . . .::.: .. ::.
CCDS57 MAAGVAAWLPFARAAAIGWMPVASGPMPAPPRQERKRTQDALIVLNVSGTRFQTWQDTLE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 RLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEM
: : : :: ....... :. . ..::::: : : :::::::::::. ..
CCDS57 RYPDTLLG-----SSERDFF-----YHPETQQYFFDRDPDIFRHILNFYRTGKLHYPRHE
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 CALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCCPD
: .. .:: ..:. . .:: .:...... :.:. .:.: . :: :
CCDS57 CISAYDEELAFFGLIPEIIGDCCYEEYKDRRRENAERLQDDADT--DTAGESALPTMT--
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLA
:...: .:.:..:. : .. :. .::..:.:: ..:.: . .. .: ... :
CCDS57 ARQRVWRAFENPHTSTMALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETVPCGSSPGHIKELPCGERYA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 ----HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSV
....:. ::.:::::. ..:....: .. ...::..::::::. . .:..
CCDS57 VAFFCLDTACVMIFTVEYLLRLAAAPSRYRFVRSVMSIIDVVAILPYYIGLVMTDN----
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFS
..: . .:..:..::.:..::: ::. ::.::. .:::.:.. :.:.:.::.
CCDS57 ---EDVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAIIIFA
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 SLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIA
...:.::: .:.:::::::.::.. .::::.::::. :::. ::: :..: ..::::::
CCDS57 TVMFYAEKGSSASKFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPKTIAGKIFGSICSLSGVLVIA
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460
pF1KB7 LPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEK--AIKR-REALERAKRNGSIVS-MNLKDAFARSMELID
::.:.::.:::..:....: .: : :. : : :: ..:: . :. : : .: .
CCDS57 LPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQKKARLARIRAAKSGSANAYMQSKRNGLLSNQLQS
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 VAVEKAGESANTKD-SADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLN
:.: : . .. .. .:: : . . : ... ::.. .::. .:
CCDS57 SEDEQAFVSKSGSSFETQHHHLLHCLEKTTNH---EFVDEQVFEESCMEVA------TVN
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 NTSSSSPQHLSAQKLEMLYNEITKTQPHSHPNPDCQEKPERPSAYEEEIEMEEVVCPQEQ
:: ::. ::.:. . . .. . .. :. . . . .. .: . .. : :.
CCDS57 RPSSHSPS-LSSQQ-GVTSTCCSRRHKKTFRIPNANVSGSHQGSIQE-LSTIQIRCV-ER
520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 LAVAQTEVIVDMKSTSSIDSFTSCATDFTETERSPLPPPSASHLQMKFPTDLPGTEEHQR
..... .. : . .: .. : .: : ..
CCDS57 TPLSNSRSSLNAKMEECVK--LNCEQPYVTTAIISIPTPPVTTPEGDDRPESPEYSGGNI
570 580 590 600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 ARGPPFLTLSREKGPAARDGTLEYAPVDITVNLDASGSQCGLHSPLQSDNATDSPKSSLK
CCDS57 VRVSAL
630
>>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 (491 aa)
initn: 1200 init1: 737 opt: 912 Z-score: 744.7 bits: 148.1 E(32554): 3.7e-35
Smith-Waterman score: 1339; 44.0% identity (75.8% similar) in 459 aa overlap (37-483:17-469)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 PGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRD
:..::::... : :: :.:.::::::
CCDS16 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRLGKLLT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 CNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFGQELDYW
:...:..::.::::.. ..::.:::.:. : .:::: :::::.:::.:..:: ::..::
CCDS16 CHSEEAILELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQEIEYW
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB7 GIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNE------------ELRREAETMREREGEEFDNTCCPD
::.:....:::. ::...::. .: . : .. :.: :.::. .
CCDS16 GINELFIDSCCSNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEKFDTLRFGQ
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLNDNRQLA
:::.: .:.: ..::..:: :. .. : .:. .... :.:. : :...: :
CCDS16 LRKKIWIRMENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNED--GEVDDPV-LE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 HVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNKSVLQFQ
:: .:::::: : .:. ..: . ::.:.:::.::...:.:.:.:. . ... ...
CCDS16 GVEIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVDTKEEESEDIE
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 NVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVF
:. .::::.:.:::.:::::::::.::.::: :::.::.:.:::.:::..:: ::: :..
CCDS16 NMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLLLLFLSVGISIFSVLIY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 FAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIP
.:::. ....:::: .:::::.:::::::: .: :: ::.... : : :.::.::::
CCDS16 SVEKDDHTSSLTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLIASTCIICGILVVALPIT
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 IIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGE
:: :.::..:..:: . ..: :. .. . .:..: .:. :. . ... ..:
CCDS16 IIFNKFSKYYQKQKDIDVDQCSEDAPEKCHE---LPYFNIRDIYAQRMHTFITSLSSVGI
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 SANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTSSSSPQH
.. ::.:
CCDS16 VVSDPDSTDASSIEDNEDICNTTSLENCTAK
470 480 490
>>CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX (647 aa)
initn: 834 init1: 503 opt: 902 Z-score: 734.7 bits: 146.7 E(32554): 1.3e-34
Smith-Waterman score: 948; 35.8% identity (69.6% similar) in 438 aa overlap (20-448:27-442)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWR-T
::: : .... .. . .::.: :. :. :
CCDS14 MAAGLATWLPFARAAAVGWLPLAQQPLPPAPG--VKASRGDEVLVVNVSGRRFET-WKNT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LDRLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMME
::: : : :: .... .. :. . .:::::: : : .:::::::.:: .
CCDS14 LDRYPDTLLG-----SSEKEFF-----YDADSGEYFFDRDPDMFRHVLNFYRTGRLHCPR
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 EMCALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAETMREREGEEFDNTCC
. : .: .:: ..:. . .:: .:...:.. :.: .. :. . .: .
CCDS14 QECIQAFDEELAFYGLVPELVGDCCLEEYRDRKKENAERLAEDEEAEQAGDGPALPAG--
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB7 PDKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLP---ELQETDEFGQLND
. :..:: .:.:..:.:: .. :. .::..:.:: ..:.: ..... ..
CCDS14 SSLRQRLWRAFENPHTSTAALVFYYVTGFFIAVSVIANVVETIPCRGSARRSSREQPCGE
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 NRQLAH--VEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESN
: ....:. :: :::::....:.. .:... ...::..::::::. ... ...
CCDS14 RFPQAFFCMDTACVLIFTGEYLLRLFAAPSRCRFLRSVMSLIDVVAILPYYIGLLVPKND
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 KSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIM
.: . .:..:..::.:..::: ::. ::.::. .:::.:.. :.:.:.
CCDS14 -------DVSGAFVTLRVFRVFRIFKFSRHSQGLRILGYTLKSCASELGFLLFSLTMAII
290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 IFSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVL
::....:.::: . :.::::::.::.. .::::.::::. :.:. ::: :..: ..:::
CCDS14 IFATVMFYAEKGTNKTNFTSIPAAFWYTIVTMTTLGYGDMVPSTIAGKIFGSICSLSGVL
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 VIALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEK---AIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMEL
:::::.:.::.:::..:....: .: : : : : ..:.
CCDS14 VIALPVPVIVSNFSRIYHQNQRADKRRAQQKVRLARIRLAKSGTTNAFLQYKQNGGLEDS
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 IDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQL
CCDS14 GSGEEQALCVRNRSAFEQQHHHLLHCLEKTTCHEFTDELTFSEALGAVSPGGRTSRSTSV
460 470 480 490 500 510
>>CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 (477 aa)
initn: 1249 init1: 562 opt: 864 Z-score: 706.3 bits: 141.0 E(32554): 5.1e-33
Smith-Waterman score: 1270; 41.1% identity (75.4% similar) in 472 aa overlap (26-485:8-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPPEPVDIIRSKTCSRRVKINVGGLNHEVLWRTLDRLPRTR
:. .... . ...:::::..... .:: :.:.::
CCDS62 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETR
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNFYRTGKLHMMEEMCALSFG
::.: :...:..::.::::. . :..:::.: : .:.::.:::::.: :.:..::.
CCDS62 LGRLLLCHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160
pF1KB7 QELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKK-----EQMNEELRREAETMRERE-------GEEFD
::..::::.:....:::. :: .: :. .:. .:. : : . .::
CCDS62 QEIEYWGINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFD
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 NTCCPDKRKKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLPELQETDEFGQLN
. . :..:: :..:. :: .....:.::: .. : :.. ::.::..: : :. .
CCDS62 GQPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 DNRQLAHVEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLLAILPYYVTIFLTESNK
.. .. :: :::::.: . :: .:. ::::. ::.:::..:.:.:.:. .. .
CCDS62 EDPRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVE
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 SVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMI
:. . :. ::.:..:.:::.::::::::::::.::: ::. ::.:.:::.:.:..:: :
CCDS62 STPTLANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLYLSVGISI
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 FSSLVFFAEKDEDATKFTSIPASFWWATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLV
:: ... ::.:. ...::: .::::..::::::::. : : ::.... : .::.::
CCDS62 FSVVAYTIEKEENEG-LATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASACILAGILV
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 IALPIPIIVNNFSEFYKEQKRQEKAIKRREALERAKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVA
..::: .: :.::.::..::. :.:.. . . :. . :.::.: .:.... . ..
CCDS62 VVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKE---VPSVNLRDYYAHKVKSLMAS
410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 VEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSETSSNKSFENKYQEVSQKDSHEQLNNTS
. . ..:. .. : .:.
CCDS62 LTNMSRSSPSELSLNDSLR
460 470
911 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 04:19:44 2016 done: Tue Nov 8 04:19:45 2016
Total Scan time: 4.550 Total Display time: 0.200
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]