FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7277, 1288 aa
1>>>pF1KB7277 1288 - 1288 aa - 1288 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9023+/-0.00113; mu= -2.2486+/- 0.067
mean_var=349.7050+/-73.845, 0's: 0 Z-trim(113.4): 633 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.068584
statistics sampled from 13369 (14057) to 13369 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.74), E-opt: 0.2 (0.432), width: 16
Scan time: 5.140
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS33293.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 ( 510) 646 78.8 4.1e-14
CCDS63020.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 (1215) 646 79.1 7.9e-14
CCDS2176.2 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 (1328) 646 79.1 8.4e-14
CCDS63021.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 ( 460) 601 74.3 8.3e-13
CCDS63022.1 MAP3K19 gene_id:80122|Hs108|chr2 ( 462) 594 73.6 1.3e-12
CCDS82186.1 MAP3K3 gene_id:4215|Hs108|chr17 ( 622) 582 72.5 3.8e-12
CCDS32702.1 MAP3K3 gene_id:4215|Hs108|chr17 ( 626) 582 72.5 3.9e-12
CCDS32701.1 MAP3K3 gene_id:4215|Hs108|chr17 ( 657) 582 72.5 4e-12
CCDS46404.1 MAP3K2 gene_id:10746|Hs108|chr2 ( 619) 564 70.7 1.3e-11
CCDS34566.1 MAP3K4 gene_id:4216|Hs108|chr6 (1558) 560 70.7 3.4e-11
CCDS75544.1 MAP3K4 gene_id:4216|Hs108|chr6 (1604) 560 70.7 3.5e-11
CCDS34565.1 MAP3K4 gene_id:4216|Hs108|chr6 (1608) 560 70.7 3.5e-11
CCDS43318.1 MAP3K1 gene_id:4214|Hs108|chr5 (1512) 547 69.4 8.2e-11
>>CCDS299.1 MAP3K6 gene_id:9064|Hs108|chr1 (1288 aa)
initn: 8697 init1: 8697 opt: 8697 Z-score: 4666.7 bits: 875.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8697; 99.9% identity (100.0% similar) in 1288 aa overlap (1-1288:1-1288)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 MAGPCPRSGAERAGSCWQDPLAVALSRGRQLAAPPGRGCARSRPLSVVYVLTREPQPGLE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 PREGTEAEPLPLRCLREACAQVPRPRPPPQLRSLPFGTLELGDTAALDAFYNADVVVLEV
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 VTATGRVLCGDAGLLRGLADGLVQAGVGTEALLTPLVGRLARLLEATPTDSCGYFRETIR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 RDIRQARERFSGPQLRQELARLQRRLDSVELLSPDIIMNLLLSYRDVQDYSAIIELVETL
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310 320 330 340 350 360
pF1KB7 QALPTCDVAEQHNVCFHYTFALNRRNRPGDRAKALSVLLPLVQLEGSVAPDLYCMCGRIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 QALPTCDVAEQHNVCFHYTFALNRRNRPGDRAKALSVLLPLVQLEGSVAPDLYCMCGRIY
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pF1KB7 KDMFFSSGFQDAGHREQAYHWYRKAFDVEPSLHSGINAAVLLIAAGQHFEDSKELRLIGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 KDMFFSSGFQDAGHREQAYHWYRKAFDVEPSLHSGINAAVLLIAAGQHFEDSKELRLIGM
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 KLGCLLARKGCVEKMQYYWDVGFYLGAQILANDPTQVVLAAEQLYKLNAPIWYLVSVMET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 KLGCLLARKGCVEKMQYYWDVGFYLGAQILANDPTQVVLAAEQLYKLNAPIWYLVSVMET
430 440 450 460 470 480
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pF1KB7 FLLYQHFRPTPEPPGGPPRRAHFWLHFLLQSCQPFKTACAQGDQCLVLVLEMNKVLLPAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 FLLYQHFRPTPEPPGGPPRRAHFWLHFLLQSCQPFKTACAQGDQCLVLVLEMNKVLLPAK
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pF1KB7 LEVRGTDPVSTVTLSLLEPETQDIPSSWTFPVASICGVSASKRDERCCFLYALPPAQDVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 LEVRGTDPVSTVTLSLLEPETQDIPSSWTFPVASICGVSASKRDERCCFLYALPPAQDVQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 LCFPSVGHCQWFCGLIQAWVTKPDSTAPAEEAEGAGEMLEFDYEYTETGERLVLGKGTYG
:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 VVYAGRDRHTRVRIAIKEIPERDSRFSQPLHEEIALHRRLRHKNIVRYLGSASQGGYLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 VVYAGRDRHTRVRIAIKEIPERDSRFSQPLHEEIALHRRLRHKNIVRYLGSASQGGYLKI
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pF1KB7 FMEEVPGGSLSSLLRSVWGPLKDNESTISFYTRQILQGLGYLHDNHIVHRDIKGDNVLIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 FMEEVPGGSLSSLLRSVWGPLKDNESTISFYTRQILQGLGYLHDNHIVHRDIKGDNVLIN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 TFSGLLKISDFGTSKRLAGITPCTETFTGTLQYMAPEIIDQGPRGYGKAADIWSLGCTVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 TFSGLLKISDFGTSKRLAGITPCTETFTGTLQYMAPEIIDQGPRGYGKAADIWSLGCTVI
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pF1KB7 EMATGRPPFHELGSPQAAMFQVGMYKVHPPMPSSLSAEAQAFLLRTFEPDPRLRASAQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 EMATGRPPFHELGSPQAAMFQVGMYKVHPPMPSSLSAEAQAFLLRTFEPDPRLRASAQTL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 RCLSYGGTSQLRVPEEPAAEEPASPEESSGLSLLHQESKRRAMLAAVLEQELPALAENLH
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pF1KB7 QEQKQEQGARLGRNHVEELLRCLGAHIHTPNRRQLAQELRALQGRLRAQGLGPALLHRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 FAFPDAVKQILRKRQIRPHWMFVLDSLLSRAVRAALGVLGPEVEKEAVSPRSEELSNEGD
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pF1KB7 SQQSPGQQSPLPVEPEQGPAPLMVQLSLLRAETDRLREILAGKEREYQALVQRALQRLNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 SQQSPGQQSPLPVEPEQGPAPLMVQLSLLRAETDRLREILAGKEREYQALVQRALQRLNE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB7 EARTYVLAPEPPTALSTDQGLVQWLQELNVDSGTIQMLLNHSFTLHTLLTYATRDDLIYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 EARTYVLAPEPPTALSTDQGLVQWLQELNVDSGTIQMLLNHSFTLHTLLTYATRDDLIYT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280
pF1KB7 RIRGGMVCRIWRAILAQRAGSTPVTSGP
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS29 RIRGGMVCRIWRAILAQRAGSTPVTSGP
1270 1280
>>CCDS72738.1 MAP3K6 gene_id:9064|Hs108|chr1 (1280 aa)
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Smith-Waterman score: 8619; 99.3% identity (99.4% similar) in 1288 aa overlap (1-1288:1-1280)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAGPCPRSGAERAGSCWQDPLAVALSRGRQLAAPPGRGCARSRPLSVVYVLTREPQPGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 PREGTEAEPLPLRCLREACAQVPRPRPPPQLRSLPFGTLELGDTAALDAFYNADVVVLEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PREGTEAEPLPLRCLREACAQVPRPRPPPQLRSLPFGTLELGDTAALDAFYNADVVVLEV
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 SSSLVQPSLFYHLGVRESFSMTNNVLLCSQADLPDLQALREDVFQKNSDCVGSYTLIPYV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS72 SSSLVQPSLFYHLGVRESFSMTNNVLLCSQADLPDLQALR--------DCVGSYTLIPYV
130 140 150 160 170
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VTATGRVLCGDAGLLRGLADGLVQAGVGTEALLTPLVGRLARLLEATPTDSCGYFRETIR
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RDIRQARERFSGPQLRQELARLQRRLDSVELLSPDIIMNLLLSYRDVQDYSAIIELVETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RDIRQARERFSGPQLRQELARLQRRLDSVELLSPDIIMNLLLSYRDVQDYSAIIELVETL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KLGCLLARKGCVEKMQYYWDVGFYLGAQILANDPTQVVLAAEQLYKLNAPIWYLVSVMET
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LEVRGTDPVSTVTLSLLEPETQDIPSSWTFPVASICGVSASKRDERCCFLYALPPAQDVQ
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:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 VVYAGRDRHTRVRIAIKEIPERDSRFSQPLHEEIALHRRLRHKNIVRYLGSASQGGYLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VVYAGRDRHTRVRIAIKEIPERDSRFSQPLHEEIALHRRLRHKNIVRYLGSASQGGYLKI
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730 740 750 760 770 780
pF1KB7 FMEEVPGGSLSSLLRSVWGPLKDNESTISFYTRQILQGLGYLHDNHIVHRDIKGDNVLIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FMEEVPGGSLSSLLRSVWGPLKDNESTISFYTRQILQGLGYLHDNHIVHRDIKGDNVLIN
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pF1KB7 TFSGLLKISDFGTSKRLAGITPCTETFTGTLQYMAPEIIDQGPRGYGKAADIWSLGCTVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TFSGLLKISDFGTSKRLAGITPCTETFTGTLQYMAPEIIDQGPRGYGKAADIWSLGCTVI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EMATGRPPFHELGSPQAAMFQVGMYKVHPPMPSSLSAEAQAFLLRTFEPDPRLRASAQTL
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910 920 930 940 950 960
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LGDPFLQPGKRSRSPSSPRHAPRPSDAPSASPTPSANSTTQSQTFPCPQAPSQHPPSPPK
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 RCLSYGGTSQLRVPEEPAAEEPASPEESSGLSLLHQESKRRAMLAAVLEQELPALAENLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RCLSYGGTSQLRVPEEPAAEEPASPEESSGLSLLHQESKRRAMLAAVLEQELPALAENLH
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB7 QEQKQEQGARLGRNHVEELLRCLGAHIHTPNRRQLAQELRALQGRLRAQGLGPALLHRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 QEQKQEQGARLGRNHVEELLRCLGAHIHTPNRRQLAQELRALQGRLRAQGLGPALLHRPL
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1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB7 FAFPDAVKQILRKRQIRPHWMFVLDSLLSRAVRAALGVLGPEVEKEAVSPRSEELSNEGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FAFPDAVKQILRKRQIRPHWMFVLDSLLSRAVRAALGVLGPEVEKEAVSPRSEELSNEGD
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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pF1KB7 SQQSPGQQSPLPVEPEQGPAPLMVQLSLLRAETDRLREILAGKEREYQALVQRALQRLNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SQQSPGQQSPLPVEPEQGPAPLMVQLSLLRAETDRLREILAGKEREYQALVQRALQRLNE
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB7 EARTYVLAPEPPTALSTDQGLVQWLQELNVDSGTIQMLLNHSFTLHTLLTYATRDDLIYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EARTYVLAPEPPTALSTDQGLVQWLQELNVDSGTIQMLLNHSFTLHTLLTYATRDDLIYT
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1270 1280
pF1KB7 RIRGGMVCRIWRAILAQRAGSTPVTSGP
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RIRGGMVCRIWRAILAQRAGSTPVTSGP
1260 1270 1280
>>CCDS35212.2 MAP3K15 gene_id:389840|Hs108|chrX (1313 aa)
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Smith-Waterman score: 3594; 46.0% identity (71.4% similar) in 1312 aa overlap (5-1278:22-1301)
10 20 30 40
pF1KB7 MAGPCPRS-GAERAGSCWQDPLAVALSRGRQLAAPPGRGCARS
:: :.: :.. . :. . : . . : :
CCDS35 MESGGGNAPAGALGAASESPQCPPPPGVEGAAGPAEPDGAAEGAAGGSGEGESGGG--PR
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 RPLSVVYVLTREPQPGLE--PREGTEAEPLPLRCLREACAQVPRPRPPPQLRSLPFGTLE
: : .::: .. : : :. :.. .:: .:: .: :.::: :.
CCDS35 RALRAVYVRSESSQGGAAGGPEAGAR------QCLLRACEA-----EGAHLTSVPFGELD
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 LGDTAALDAFYNADVVVLEVSSSLVQPSLFYHLGVRESFSMTNNVLLCSQADLPDLQALR
.:.::.:::::.:::.:...:. ::::::::::::::.:.:::.: ..: .:.
CCDS35 FGETAVLDAFYDADVAVVDMSDVSRQPSLFYHLGVRESFDMANNVILYHDTDADTALSLK
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KB7 EDVFQKNSDCVGSYTLIPYVVTATGRVLCGDAGLLRGLADGLVQAGVGT--EALLTPLVG
. : :::. :.: .:::.:: . .: .. : :. .: . . : :::
CCDS35 DMVTQKNTASSGNYYFIPYIVTPCADYFCCESDAQRR-ASEYMQPNWDNILGPLCMPLVD
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CCDS63 H
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CCDS21 TSNKLAAEKEYRKLQEEVDLLKALKHVNIVAYLGTCLQENTVSIFMEFVPGGSISSII-N
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CCDS21 SMDR-MAAMFYIGAHRGLMPPLPDHFSENAADFVRMCLTRDQHERPSALQLLKHSFLERS
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CCDS21 H
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pF1KB7 LGSASQGGYLKIFMEEVPGGSLSSLLRSVWGPLKDNESTISFYTRQILQGLGYLHDNHIV
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CCDS63 HRDIKGNNVMLMP-TGIIKLIDFGCARRLAWAGLNGTHSDMLKSMHGTPYWMAPEVINES
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pF1KB7 PRGYGKAADIWSLGCTVIEMATGRPPFHELGSPQAAMFQVGMYK-VHPPMPSSLSAEAQA
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CCDS63 --GYGRKSDIWSIGCTVFEMATGKPPLASMDR-MAAMFYIGAHRGLMPPLPDHFSENAAD
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CCDS63 FVRMCLTRDQHERPSALQLLKHSFLERSH
440 450 460
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CCDS63 QKEESSRELCNVNLGFLLPRSCLELNISKSVTREDAPHFLKEQQRKSE--EFSTSHMKYS
150 160 170 180 190 200
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 ERLVLGKGTYGVVYAGRDRHTRVRIAIKEIPERDSRFSQP-LHEEIALHRRLRHKNIVRY
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CCDS63 GRSI-KRHSSGLRIYDREEKFLISNEKKIFSENSLKSEEPILWTKVDLLKALKHVNIVAY
210 220 230 240 250 260
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CCDS63 LGTCLQENTVSIFMEFVPGGSISSIINR-FGPLP--EMVFCKYTKQILQGVAYLHENCVV
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CCDS63 HRDIKGNNVMLMP-TGIIKLIDFGCARRLAWAGLNGTHSDMLKSMHGTPYWMAPEVINES
320 330 340 350 360 370
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CCDS63 FVRMCLTRDQHERPSALQLLKHSFLERSH
440 450 460
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CCDS82 PDSPETSKEVSA-LECEIQLLKNLQHERIVQYYGCLRDRAEKTLTIFMEYMPGGSVKDQL
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CCDS82 AEY-EAMAAIFKIATQPTNPQLPSHISEHGRDFLRRIFV-EARQRPSAEELLTHHFAQLM
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CCDS82 Y
1288 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]