Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7131
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7131, 317 aa
1>>>pF1KB7131 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9267+/-0.00121; mu= 11.7220+/- 0.070
mean_var=152.2692+/-51.363, 0's: 0 Z-trim(102.4): 382 B-trim: 779 in 2/46
Lambda= 0.103937
statistics sampled from 6398 (6917) to 6398 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.212), width: 16
Scan time: 1.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 ( 318) 2071 323.4 1.5e-88
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 ( 320) 1277 204.3 1e-52
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 ( 324) 1227 196.8 1.9e-50
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 ( 314) 1159 186.6 2.2e-47
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 ( 312) 1140 183.7 1.6e-46
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 ( 315) 1089 176.1 3.2e-44
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11 ( 317) 1085 175.5 4.8e-44
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11 ( 313) 1071 173.4 2e-43
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11 ( 314) 1069 173.1 2.5e-43
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11 ( 314) 1067 172.8 3.1e-43
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11 ( 314) 1063 172.2 4.7e-43
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11 ( 321) 1058 171.5 8e-43
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11 ( 318) 1057 171.3 8.9e-43
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11 ( 312) 1055 171.0 1.1e-42
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11 ( 342) 1050 170.3 1.9e-42
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11 ( 312) 1045 169.5 3.1e-42
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11 ( 324) 1045 169.5 3.1e-42
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11 ( 313) 1030 167.2 1.5e-41
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11 ( 329) 1023 166.2 3.1e-41
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11 ( 320) 1020 165.8 4.2e-41
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11 ( 326) 1020 165.8 4.2e-41
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11 ( 311) 1017 165.3 5.6e-41
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11 ( 316) 1001 162.9 3e-40
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11 ( 321) 1001 162.9 3e-40
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11 ( 323) 1001 162.9 3e-40
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11 ( 321) 995 162.0 5.6e-40
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11 ( 312) 993 161.7 6.8e-40
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11 ( 317) 979 159.6 2.9e-39
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11 ( 312) 976 159.1 4e-39
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11 ( 325) 972 158.6 6.2e-39
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11 ( 312) 960 156.8 2.1e-38
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11 ( 354) 956 156.2 3.4e-38
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11 ( 320) 953 155.7 4.4e-38
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11 ( 317) 952 155.6 4.9e-38
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11 ( 313) 925 151.5 8e-37
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11 ( 335) 910 149.3 4e-36
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11 ( 323) 859 141.6 7.8e-34
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11 ( 350) 847 139.9 2.8e-33
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11 ( 310) 838 138.5 6.7e-33
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11 ( 320) 827 136.8 2.1e-32
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11 ( 324) 822 136.1 3.6e-32
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11 ( 313) 820 135.8 4.4e-32
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11 ( 365) 817 135.4 6.6e-32
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11 ( 324) 813 134.7 9.3e-32
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11 ( 318) 812 134.6 1e-31
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11 ( 315) 754 125.9 4.2e-29
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11 ( 319) 753 125.7 4.7e-29
CCDS30905.1 OR6N1 gene_id:128372|Hs108|chr1 ( 312) 647 109.8 2.8e-24
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11 ( 320) 642 109.1 4.8e-24
CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1 ( 315) 634 107.9 1.1e-23
>>CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11 (318 aa)
initn: 2071 init1: 2071 opt: 2071 Z-score: 1703.2 bits: 323.4 E(32554): 1.5e-88
Smith-Waterman score: 2071; 100.0% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:2-318)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVDPNGNESSATYFILIGLPGLEEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIYIVRTEHSLHE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MMVDPNGNESSATYFILIGLPGLEEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIYIVRTEHSLHE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 PMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSLSGMESTVLLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSLSGMESTVLLA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 MAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLPFCRSNILSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLPFCRSNILSHS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 YCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLGLTREAQAKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLGLTREAQAKAF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 GTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPLPVILANIYLLVPPVLNPIVYGVKTKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPLPVILANIYLLVPPVLNPIVYGVKTKE
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 IRQRILRLFHVATHASEP
::::::::::::::::::
CCDS31 IRQRILRLFHVATHASEP
310
>>CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11 (320 aa)
initn: 1258 init1: 954 opt: 1277 Z-score: 1059.7 bits: 204.3 E(32554): 1e-52
Smith-Waterman score: 1277; 59.8% identity (86.9% similar) in 306 aa overlap (7-311:5-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVDPNGNESSATYFILIGLPGLEEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIYIVRTEHSLHEP
: . :: :.:::.::::.:.::..::: :.:..:..:: ...:::::.::: :
CCDS77 MSSCNFTHAT-FVLIGIPGLEKAHFWVGFPLLSMYVVAMFGNCIVVFIVRTERSLHAP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSLSGMESTVLLAM
::.:::::..::. .:::.:::.::.:::.: :.:.::: ::: ::.::..:::.::::
CCDS77 MYLFLCMLAAIDLALSTSTMPKILALFWFDSREISFEACLTQMFFIHALSAIESTILLAM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLPFCRSNILSHSY
:::::::::::::::.::. ...::..:::::. .. :::..::.: ::.::.:::::
CCDS77 AFDRYVAICHPLRHAAVLNNTVTAQIGIVAVVRGSLFFFPLPLLIKRLAFCHSNVLSHSY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB7 CLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLGL-TREAQAKAF
:.:::::::: : :::::: .:. ..:.: ..::.::.::..::: : .. .::::
CCDS77 CVHQDVMKLAYADTLPNVVYGLTAILLVMGVDVMFISLSYFLIIRTVLQLPSKSERAKAF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 GTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPLPVILANIYLLVPPVLNPIVYGVKTKE
::::::. .:. ::::.::::.::::.. . :....::::.:::.:::.::.:::.
CCDS77 GTCVSHIGVVLAFYVPLIGLSVVHRFGNSLHPIVRVVMGDIYLLLPPVINPIIYGAKTKQ
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 IRQRILRLFHVATHASEP
:: :.: .:...
CCDS77 IRTRVLAMFKISCDKDLQAVGGK
300 310 320
>>CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11 (324 aa)
initn: 1193 init1: 965 opt: 1227 Z-score: 1019.2 bits: 196.8 E(32554): 1.9e-50
Smith-Waterman score: 1227; 58.8% identity (84.6% similar) in 306 aa overlap (5-308:15-319)
10 20 30 40
pF1KB7 MVDPNGNESSATYFILIGLPGL-EEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIY
::: :.::.:.:.::: .:::::::: .: .:.::::::.
CCDS31 MQKPQLLVPIIATSNGNLVHAAYFLLVGIPGLGPTIHFWLAFPLCFMYALATLGNLTIVL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 IVRTEHSLHEPMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSL
:.:.:. ::::::.:: ::: ::...:. .:::: ..: .. :.:. :: ::: ::.:
CCDS31 IIRVERRLHEPMYLFLAMLSTIDLVLSSITMPKMASLFLMGIQEIEFNICLAQMFLIHAL
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110 120 130 140 150 160
pF1KB7 SGMESTVLLAMAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLP
:..::.:::::::::.::::::::::.::: :.:::..:..:: ... ::: ..: :
CCDS31 SAVESAVLLAMAFDRFVAICHPLRHASVLTGCTVAKIGLSALTRGFVFFFPLPFILKWLS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 FCRSNILSHSYCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLG
.:... ..::.:::::.:::.: : ::::::::..:.:..:.:::.:.:::.::: .::
CCDS31 YCQTHTVTHSFCLHQDIMKLSCTDTRVNVVYGLFIILSVMGVDSLFIGFSYILILWAVLE
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 LT-REAQAKAFGTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPLPVILANIYLLVPPVL
:. :.: :::.::.::.:::..::::.::::.:::.. : : :..:: :::.:::.
CCDS31 LSSRRAALKAFNTCISHLCAVLVFYVPLIGLSVVHRLGGPT-SLLHVVMANTYLLLPPVV
250 260 270 280 290
290 300 310
pF1KB7 NPIVYGVKTKEIRQRILRLFHVATHASEP
::.:::.::::: .:.: .:
CCDS31 NPLVYGAKTKEICSRVLCMFSQGGK
300 310 320
>>CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1127 init1: 841 opt: 1159 Z-score: 964.2 bits: 186.6 E(32554): 2.2e-47
Smith-Waterman score: 1159; 52.5% identity (84.3% similar) in 305 aa overlap (5-308:8-312)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVDPNGNESSATYFILIGLPGLEEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIYIVRTEHSL
:.. : .. :.: :.::::. ..:...::: .::... :: ::..:..::.::
CCDS31 MTLGSLGNSSSSVSATFLLSGIPGLERMHIWISIPLCFMYLVSIPGNCTILFIIKTERSL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 HEPMYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSLSGMESTVL
:::::.:: ::. ::. .: ..: .:.::: .. :. :::. :.: :: .: .::.::
CCDS31 HEPMYLFLSMLALIDLGLSLCTLPTVLGIFWVGAREISHDACFAQLFFIHCFSFLESSVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LAMAFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLPFCRSNILS
:.:::::.:::::::.....:: . .::.... :..::. ::: ..:..:.: : .::
CCDS31 LSMAFDRFVAICHPLHYVSILTNTVIGRIGLVSLGRSVALIFPLPFMLKRFPYCGSPVLS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 HSYCLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLGL-TREAQA
:::::::.:::::: :...: .::..::.:..:.::::: ::: :::.:::.. .: .
CCDS31 HSYCLHQEVMKLACADMKANSIYGMFVIVSTVGIDSLLILFSYALILRTVLSIASRAERF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KAFGTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPLPVILANIYLLVPPVLNPIVYGVK
::..:::::.:::..::.:.::::..:::.:. . :... .::: :::.:::::.::
CCDS31 KALNTCVSHICAVLLFYTPMIGLSVIHRFGKQAPHLVQVVMGFMYLLFPPVMNPIVYSVK
250 260 270 280 290 300
300 310
pF1KB7 TKEIRQRILRLFHVATHASEP
::.::.:. . :
CCDS31 TKQIRDRVTHAFCY
310
>>CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11 (312 aa)
initn: 1149 init1: 799 opt: 1140 Z-score: 948.8 bits: 183.7 E(32554): 1.6e-46
Smith-Waterman score: 1140; 53.9% identity (80.6% similar) in 304 aa overlap (7-309:5-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVDPNGNESSATYFILIGLPGLEEAQFWLAFPLCSLYLIAVLGNLTIIYIVRTEHSLHEP
: . ..:.: :.:::: .. ::. ::: .: .:. :: .:. ::.: :::::
CCDS31 MGLFNVTHPAFFLLTGIPGLESSHSWLSGPLCVMYAVALGGNTVILQAVRVEPSLHEP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 MYIFLCMLSGIDILISTSSMPKMLAIFWFNSTTIQFDACLLQMFAIHSLSGMESTVLLAM
:: :: ::: :. :: ...: .: : .:. .: :::::.::: :: .: ::: .::::
CCDS31 MYYFLSMLSFSDVAISMATLPTVLRTFCLNARNITFDACLIQMFLIHFFSMMESGILLAM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 AFDRYVAICHPLRHATVLTLPRVTKIGVAAVVRGAALMAPLPVFIKQLPFCRSNILSHSY
.:::::::: :::.::::: .. .:..:..:. . ::: .::.::.::::.:::::
CCDS31 SFDRYVAICDPLRYATVLTTEVIAAMGLGAAARSFITLFPLPFLIKRLPICRSNVLSHSY
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB7 CLHQDVMKLACDDIRVNVVYGLIVIISAIGLDSLLISFSYLLILKTVLGL-TREAQAKAF
::: :.:.::: :: .: .:::.:..:..:.: ..: .::.:::..:.. .:: . ::.
CCDS31 CLHPDMMRLACADISINSIYGLFVLVSTFGMDLFFIFLSYVLILRSVMATASREERLKAL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 GTCVSHVCAVFIFYVPFIGLSMVHRFSKRRDSPLPVILANIYLLVPPVLNPIVYGVKTKE
.:::::. ::. ::::.::.: ::::.:. . :...:.::.:::::::..:..::::
CCDS31 NTCVSHILAVLAFYVPMIGVSTVHRFGKHVPCYIHVLMSNVYLFVPPVLNPLIYSAKTKE
240 250 260 270 280 290
300 310
pF1KB7 IRQRILRLFHVATHASEP
::. :.:.::
CCDS31 IRRAIFRMFHHIKI
300 310
>>CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11 (315 aa)
initn: 1072 init1: 763 opt: 1089 Z-score: 907.5 bits: 176.1 E(32554): 3.2e-44
Smith-Waterman score: 1089; 49.8% identity (80.6% similar) in 309 aa overlap (1-308:1-309)
10 20 30 40 50 60
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