Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7061
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7061, 655 aa
1>>>pF1KB7061 655 - 655 aa - 655 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9802+/-0.000371; mu= -4.4908+/- 0.023
mean_var=338.6115+/-68.562, 0's: 0 Z-trim(123.9): 138 B-trim: 33 in 1/58
Lambda= 0.069698
statistics sampled from 44339 (44485) to 44339 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.788), E-opt: 0.2 (0.522), width: 16
Scan time: 13.850
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002006 (OMIM: 136533,268220) forkhead box prote ( 655) 4467 462.9 1.6e-129
XP_011533310 (OMIM: 136533,268220) PREDICTED: fork ( 474) 3036 318.9 2.6e-86
XP_011533312 (OMIM: 136533,268220) PREDICTED: fork ( 418) 2842 299.4 1.7e-80
NP_963853 (OMIM: 602681) forkhead box protein O3 [ ( 673) 1106 125.0 8.9e-28
NP_001446 (OMIM: 602681) forkhead box protein O3 [ ( 673) 1106 125.0 8.9e-28
NP_005929 (OMIM: 300033) forkhead box protein O4 i ( 505) 944 108.6 5.7e-23
NP_001278210 (OMIM: 611457) forkhead box protein O ( 559) 936 107.8 1.1e-22
NP_001164402 (OMIM: 300033) forkhead box protein O ( 450) 838 97.9 8.4e-20
XP_005266924 (OMIM: 602681) PREDICTED: forkhead bo ( 484) 689 83.0 2.9e-15
XP_016866074 (OMIM: 602681) PREDICTED: forkhead bo ( 484) 689 83.0 2.9e-15
XP_011533928 (OMIM: 602681) PREDICTED: forkhead bo ( 506) 686 82.7 3.7e-15
XP_011533930 (OMIM: 602681) PREDICTED: forkhead bo ( 453) 602 74.2 1.2e-12
XP_011533931 (OMIM: 602681) PREDICTED: forkhead bo ( 453) 602 74.2 1.2e-12
XP_016866075 (OMIM: 602681) PREDICTED: forkhead bo ( 453) 602 74.2 1.2e-12
XP_005266925 (OMIM: 602681) PREDICTED: forkhead bo ( 453) 602 74.2 1.2e-12
XP_011529259 (OMIM: 300033) PREDICTED: forkhead bo ( 327) 416 55.4 3.9e-07
NP_001129121 (OMIM: 612351) forkhead box protein I ( 420) 373 51.1 9.5e-06
NP_005240 (OMIM: 164874,613454) forkhead box prote ( 489) 365 50.4 1.9e-05
XP_006710521 (OMIM: 616035) PREDICTED: forkhead bo ( 607) 318 45.7 0.00058
NP_001185780 (OMIM: 616035) forkhead box protein J ( 622) 318 45.7 0.00059
XP_011539328 (OMIM: 616035) PREDICTED: forkhead bo ( 622) 318 45.7 0.00059
NP_001185779 (OMIM: 616035) forkhead box protein J ( 622) 318 45.7 0.00059
NP_055762 (OMIM: 616035) forkhead box protein J3 i ( 622) 318 45.7 0.00059
XP_005270689 (OMIM: 616035) PREDICTED: forkhead bo ( 630) 318 45.7 0.0006
XP_016856182 (OMIM: 616035) PREDICTED: forkhead bo ( 573) 302 44.1 0.0017
NP_001185781 (OMIM: 616035) forkhead box protein J ( 588) 302 44.1 0.0017
XP_006710522 (OMIM: 616035) PREDICTED: forkhead bo ( 596) 302 44.1 0.0018
NP_004465 (OMIM: 602211) forkhead box protein D2 [ ( 495) 289 42.7 0.0038
NP_001443 (OMIM: 603250) forkhead box protein F2 [ ( 444) 286 42.4 0.0043
NP_710141 (OMIM: 600288) hepatocyte nuclear factor ( 457) 281 41.9 0.0062
NP_068556 (OMIM: 600288) hepatocyte nuclear factor ( 463) 281 41.9 0.0062
>>NP_002006 (OMIM: 136533,268220) forkhead box protein O (655 aa)
initn: 4467 init1: 4467 opt: 4467 Z-score: 2446.4 bits: 462.9 E(85289): 1.6e-129
Smith-Waterman score: 4467; 100.0% identity (100.0% similar) in 655 aa overlap (1-655:1-655)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAEAPQVVEIDPDFEPLPRPRSCTWPLPRPEFSQSNSATSSPAPSGSAAANPDAAAGLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MAEAPQVVEIDPDFEPLPRPRSCTWPLPRPEFSQSNSATSSPAPSGSAAANPDAAAGLPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ASAAAVSADFMSNLSLLEESEDFPQAPGSVAAAVAAAAAAAATGGLCGDFQGPEAGCLHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ASAAAVSADFMSNLSLLEESEDFPQAPGSVAAAVAAAAAAAATGGLCGDFQGPEAGCLHP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 APPQPPPPGPLSQHPPVPPAAAGPLAGQPRKSSSSRRNAWGNLSYADLITKAIESSAEKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 APPQPPPPGPLSQHPPVPPAAAGPLAGQPRKSSSSRRNAWGNLSYADLITKAIESSAEKR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKASLQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKASLQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMTEQDDLGEGDVHSMVYPPSAAKMASTLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMTEQDDLGEGDVHSMVYPPSAAKMASTLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 SLSEISNPENMENLLDNLNLLSSPTSLTVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 SLSEISNPENMENLLDNLNLLSSPTSLTVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 YQKYTYGQSSMSPLPQMPIQTLQDNKSSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIMTPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 YQKYTYGQSSMSPLPQMPIQTLQDNKSSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIMTPV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 DPGVAQPNSRVLGQNVMMGPNSVMSTYGSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGRPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DPGVAQPNSRVLGQNVMMGPNSVMSTYGSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGRPLP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 HTVSTMPHTSGMNRLTQVKTPVQVPLPHPMQMSALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEKLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HTVSTMPHTSGMNRLTQVKTPVQVPLPHPMQMSALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEKLPS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KB7 DLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDNVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDNVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG
610 620 630 640 650
>>XP_011533310 (OMIM: 136533,268220) PREDICTED: forkhead (474 aa)
initn: 3033 init1: 3033 opt: 3036 Z-score: 1670.6 bits: 318.9 E(85289): 2.6e-86
Smith-Waterman score: 3036; 99.6% identity (99.8% similar) in 448 aa overlap (209-655:27-474)
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGW-KNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWW
: .:::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MRSKHTANCLAFRCILAWPGGLAQNCWCQNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWW
10 20 30 40 50
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 MLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKASLQSGQEGAGDSPGSQFSKWPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKASLQSGQEGAGDSPGSQFSKWPA
60 70 80 90 100 110
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMTEQDDLGEGDVHSMVYPPSAAKMAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMTEQDDLGEGDVHSMVYPPSAAKMAS
120 130 140 150 160 170
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 TLPSLSEISNPENMENLLDNLNLLSSPTSLTVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLPSLSEISNPENMENLLDNLNLLSSPTSLTVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSP
180 190 200 210 220 230
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 SPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPIQTLQDNKSSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPIQTLQDNKSSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIM
240 250 260 270 280 290
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 TPVDPGVAQPNSRVLGQNVMMGPNSVMSTYGSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TPVDPGVAQPNSRVLGQNVMMGPNSVMSTYGSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGR
300 310 320 330 340 350
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 PLPHTVSTMPHTSGMNRLTQVKTPVQVPLPHPMQMSALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLPHTVSTMPHTSGMNRLTQVKTPVQVPLPHPMQMSALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEK
360 370 380 390 400 410
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 LPSDLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDNVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPSDLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDNVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG
420 430 440 450 460 470
>>XP_011533312 (OMIM: 136533,268220) PREDICTED: forkhead (418 aa)
initn: 2842 init1: 2842 opt: 2842 Z-score: 1565.9 bits: 299.4 E(85289): 1.7e-80
Smith-Waterman score: 2842; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (238-655:1-418)
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 GWKNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSR
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSR
10 20 30
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 SRAAKKKASLQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRAAKKKASLQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGR
40 50 60 70 80 90
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 LSPIMTEQDDLGEGDVHSMVYPPSAAKMASTLPSLSEISNPENMENLLDNLNLLSSPTSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LSPIMTEQDDLGEGDVHSMVYPPSAAKMASTLPSLSEISNPENMENLLDNLNLLSSPTSL
100 110 120 130 140 150
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 TVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPIQTLQDNKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPIQTLQDNKS
160 170 180 190 200 210
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 SYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIMTPVDPGVAQPNSRVLGQNVMMGPNSVMSTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIMTPVDPGVAQPNSRVLGQNVMMGPNSVMSTY
220 230 240 250 260 270
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 GSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGRPLPHTVSTMPHTSGMNRLTQVKTPVQVPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGRPLPHTVSTMPHTSGMNRLTQVKTPVQVPLP
280 290 300 310 320 330
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 HPMQMSALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEKLPSDLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HPMQMSALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEKLPSDLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDT
340 350 360 370 380 390
630 640 650
pF1KB7 LDFNFDNVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG
::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LDFNFDNVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG
400 410
>>NP_963853 (OMIM: 602681) forkhead box protein O3 [Homo (673 aa)
initn: 1474 init1: 790 opt: 1106 Z-score: 619.7 bits: 125.0 E(85289): 8.9e-28
Smith-Waterman score: 1767; 47.0% identity (69.4% similar) in 702 aa overlap (4-655:12-673)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAEAPQVVEIDPDFEPLPRPRSCTWPLPRPEFSQSNSATSSPA-PSGSAAAN
.: ::.::.::: ::::::::: :::.. .::: ::: .::.
NP_963 MAEAPASPAPLSPLEVELDPEFEPQSRPRSCTWPLQRPELQ------ASPAKPSGETAAD
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB7 ---P-------DAAAGLPSASAAAV-----SADFMSNLSLLEESEDFPQAPGSVAAAVAA
: : .: ..:: :. :. . :.: :::.: :::. . .
NP_963 SMIPEEEDDEDDEDGGGRAGSAMAIGGGGGSGTLGSGL-LLEDSARV-LAPGGQDPGSGP
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 AAAAAATGGLCGDFQGPEAGCLHPAPPQPPPPGPLSQHPPVPPAAAGPLAGQPRKSSSSR
:.:: ::: : : .: :.: : ::: :.::: .::::: :: :
NP_963 ATAA---GGLSG---GTQA-LLQPQQPLPPPQ----------PGAAGG-SGQPRKCSS-R
120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 RNAWGNLSYADLITKAIESSAEKRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHN
::::::::::::::.::::: .:::::::::::::. :::::::::::::::::::::::
NP_963 RNAWGNLSYADLITRAIESSPDKRLTLSQIYEWMVRCVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHN
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKAS
:::::.:.:::::::::::::..::.::::::.:::::.::::..:..:::.:::::::.
NP_963 LSLHSRFMRVQNEGTGKSSWWIINPDGGKSGKAPRRRAVSMDNSNKYTKSRGRAAKKKAA
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 LQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIM--TE
::.. :.: ::: ::.::::.:: :.:.:..: :. :: ::.:::::.:::::::: ::
NP_963 LQTAPESADDSP-SQLSKWPGSPTSRSSDELDAWTDFRSRTNSNASTVSGRLSPIMASTE
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370
pF1KB7 QDDLGEGD--VHSMVYP------PSAAKMAST-LPSLSEISNPENM-----ENLLDNL-N
:.. . : . :.: ::..: .. :: :..... :. :::.:.: .
NP_963 LDEVQDDDAPLSPMLYSSSASLSPSVSKPCTVELPRLTDMAGTMNLNDGLTENLMDDLLD
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 LLSSPTSLTVSTQSSP-GTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMP
.. : : : :: : .::.. . .. ...:.::. .... ..: ::.. : : :
NP_963 NITLPPS-----QPSPTGGLMQRSSSFPYTTKGSGLGSPTSSFNSTVFGPSSLNSLRQSP
400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 IQTLQDNK-SSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIM-TPVDPGVAQPNSRVLGQNV
.::.:.:: .....::.:. :..:::::: :.:.: : :: ..: .. : .::
NP_963 MQTIQENKPATFSSMSHYGNQT--LQDLLTSDSLSHSDVMMTQSDPLMSQASTAVSAQNS
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 ---MMGPNSVMSTYGSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGRPLPHTVSTMPHTSGMN
.: :. : ....: ......: .. : : : . ..: : ..::.: : .
NP_963 RRNVMLRNDPMMSFAAQPNQGSLVN-QNLLHHQHQTQGALGGSRALSNSVSNMG-LSESS
510 520 530 540 550 560
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 RLTQVKTPVQVPLPHPMQM--SALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEKLPSDLD-GMFIERL
: ..: : :. . :: ..:.: : :. . :: .::.::::: :: :
NP_963 SLGSAKHQQQSPVSQSMQTLSDSLSGSSLYSTSANLPVMG---HEKFPSDLDLDMFNGSL
570 580 590 600 610 620
620 630 640 650
pF1KB7 DCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDNVLPNQS--------FPHSVKTTTHSWVSG
.::::::::..:::.: ::::::... .:. : . .....::: :
NP_963 ECDMESIIRSELMDADGLDFNFDSLISTQNVVGLNVGNFTGAKQASSQSWVPG
630 640 650 660 670
>>NP_001446 (OMIM: 602681) forkhead box protein O3 [Homo (673 aa)
initn: 1474 init1: 790 opt: 1106 Z-score: 619.7 bits: 125.0 E(85289): 8.9e-28
Smith-Waterman score: 1767; 47.0% identity (69.4% similar) in 702 aa overlap (4-655:12-673)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAEAPQVVEIDPDFEPLPRPRSCTWPLPRPEFSQSNSATSSPA-PSGSAAAN
.: ::.::.::: ::::::::: :::.. .::: ::: .::.
NP_001 MAEAPASPAPLSPLEVELDPEFEPQSRPRSCTWPLQRPELQ------ASPAKPSGETAAD
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB7 ---P-------DAAAGLPSASAAAV-----SADFMSNLSLLEESEDFPQAPGSVAAAVAA
: : .: ..:: :. :. . :.: :::.: :::. . .
NP_001 SMIPEEEDDEDDEDGGGRAGSAMAIGGGGGSGTLGSGL-LLEDSARV-LAPGGQDPGSGP
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 AAAAAATGGLCGDFQGPEAGCLHPAPPQPPPPGPLSQHPPVPPAAAGPLAGQPRKSSSSR
:.:: ::: : : .: :.: : ::: :.::: .::::: :: :
NP_001 ATAA---GGLSG---GTQA-LLQPQQPLPPPQ----------PGAAGG-SGQPRKCSS-R
120 130 140 150
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 RNAWGNLSYADLITKAIESSAEKRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHN
::::::::::::::.::::: .:::::::::::::. :::::::::::::::::::::::
NP_001 RNAWGNLSYADLITRAIESSPDKRLTLSQIYEWMVRCVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHN
160 170 180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKAS
:::::.:.:::::::::::::..::.::::::.:::::.::::..:..:::.:::::::.
NP_001 LSLHSRFMRVQNEGTGKSSWWIINPDGGKSGKAPRRRAVSMDNSNKYTKSRGRAAKKKAA
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 LQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIM--TE
::.. :.: ::: ::.::::.:: :.:.:..: :. :: ::.:::::.:::::::: ::
NP_001 LQTAPESADDSP-SQLSKWPGSPTSRSSDELDAWTDFRSRTNSNASTVSGRLSPIMASTE
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370
pF1KB7 QDDLGEGD--VHSMVYP------PSAAKMAST-LPSLSEISNPENM-----ENLLDNL-N
:.. . : . :.: ::..: .. :: :..... :. :::.:.: .
NP_001 LDEVQDDDAPLSPMLYSSSASLSPSVSKPCTVELPRLTDMAGTMNLNDGLTENLMDDLLD
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 LLSSPTSLTVSTQSSP-GTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMP
.. : : : :: : .::.. . .. ...:.::. .... ..: ::.. : : :
NP_001 NITLPPS-----QPSPTGGLMQRSSSFPYTTKGSGLGSPTSSFNSTVFGPSSLNSLRQSP
400 410 420 430 440
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 IQTLQDNK-SSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIM-TPVDPGVAQPNSRVLGQNV
.::.:.:: .....::.:. :..:::::: :.:.: : :: ..: .. : .::
NP_001 MQTIQENKPATFSSMSHYGNQT--LQDLLTSDSLSHSDVMMTQSDPLMSQASTAVSAQNS
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 ---MMGPNSVMSTYGSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGRPLPHTVSTMPHTSGMN
.: :. : ....: ......: .. : : : . ..: : ..::.: : .
NP_001 RRNVMLRNDPMMSFAAQPNQGSLVN-QNLLHHQHQTQGALGGSRALSNSVSNMG-LSESS
510 520 530 540 550 560
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 RLTQVKTPVQVPLPHPMQM--SALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEKLPSDLD-GMFIERL
: ..: : :. . :: ..:.: : :. . :: .::.::::: :: :
NP_001 SLGSAKHQQQSPVSQSMQTLSDSLSGSSLYSTSANLPVMG---HEKFPSDLDLDMFNGSL
570 580 590 600 610 620
620 630 640 650
pF1KB7 DCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDNVLPNQS--------FPHSVKTTTHSWVSG
.::::::::..:::.: ::::::... .:. : . .....::: :
NP_001 ECDMESIIRSELMDADGLDFNFDSLISTQNVVGLNVGNFTGAKQASSQSWVPG
630 640 650 660 670
>>NP_005929 (OMIM: 300033) forkhead box protein O4 isofo (505 aa)
initn: 1247 init1: 699 opt: 944 Z-score: 533.4 bits: 108.6 E(85289): 5.7e-23
Smith-Waterman score: 1165; 40.4% identity (59.6% similar) in 638 aa overlap (3-633:11-502)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAEAPQVVEIDPDFEPLPRPRSCTWPLPRPEFSQSNSATSSPAPSGSAAANP
:: ....:::::: :::::::::::::.... :: ..:
NP_005 MDPGNENSATEAAAIIDLDPDFEPQSRPRSCTWPLPRPEIANQ--------PSEPPEVEP
10 20 30 40 50
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pF1KB7 DAAAGLPSASAAAVSADFMSNLSLLEESEDFPQAPGSVAAAVAAAAAAAATGGLCGDFQG
: . : .. :. :: :. .
NP_005 DLGE--------KVHTEGRSEPILL---------PSRL----------------------
60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 PEAGCLHPAPPQPPPPGPLSQHPPVPPAAAGPLAGQPRKSSSSRRNAWGNLSYADLITKA
: : : :: : : ..: :::..: ::::::: :::.::..:
NP_005 -------PEPAGGPQPGIL-----------GAVTG-PRKGGS-RRNAWGNQSYAELISQA
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pF1KB7 IESSAEKRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTG
:::. ::::::.:::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.:.::.::
NP_005 IESAPEKRLTLAQIYEWMVRTVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIKVHNEATG
120 130 140 150 160 170
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 KSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKAS-LQSGQEGAGD-SPGS
::::::::::::::::.:::::::::..::. ..::.: ::: : : . ::: :: .
NP_005 KSSWWMLNPEGGKSGKAPRRRAASMDSSSKLLRGRSKAPKKKPSVLPAPPEGATPTSPVG
180 190 200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 QFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMTEQDDLGEGDVHSMVYPP
.:.:: .:: :.. .. : :.:::::.:::::..: ::::. :.. :.: :
NP_005 HFAKWSGSPCSRNREEADMWTTFRPRSSSNASSVSTRLSPLRPESEVLAE------EIPA
240 250 260 270 280
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pF1KB7 SAAKMASTLPSLSEISNPENMENLLDNLNLLSSPTSLTVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPP
:....:. .: . :..: :::.::: :: . :. : :. :
NP_005 SVSSYAGGVPP----TLNEGLE-LLDGLNLTSSHSLLSRSGLSG------------F---
290 300 310 320
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pF1KB7 NTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPIQTLQDNKSSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDS
::. :. . .::..: .:: . :... . :: :: :. :::::.
NP_005 --SLQHPGVTGPLHTYSSSLFSP-AEGPLSAGEGCFSS----SQA------LEALLTSDT
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pF1KB7 PPH-NDI-MTPVDPGVAQ-PNSRVLGQNVMMGPNSVMSTYGSQASHNKMMNPSSHTHPGH
:: :. :: ::: ..: :. .:: :.: :. . . . :. ::
NP_005 PPPPADVLMTQVDPILSQAPTLLLLGG----LPSS------SKLATGVGLCPKPLEAPGP
380 390 400 410 420
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pF1KB7 AQQTSAVNGRPLPHTVSTMPHTSGMNRLTQVKTPVQVPLPHPMQMSALGGYSSVSSCNGY
.. . ... : .... : .... ::: .: : . ..
NP_005 SSLVPTLSMIAPPPVMASAPIPKALG------TPVLTP---PTEAAS-------------
430 440 450 460
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 GRMGLLHQEKLPSDLD-GMFIERLDCDMESIIRNDLMD-GDTLDFNFDNVLPNQSFPHSV
:...:.::: :..: :.:::..:: .:::: :. :::::.
NP_005 -------QDRMPQDLDLDMYMENLECDMDNII-SDLMDEGEGLDFNFEPDP
470 480 490 500
650
pF1KB7 KTTTHSWVSG
>>NP_001278210 (OMIM: 611457) forkhead box protein O6 [H (559 aa)
initn: 1085 init1: 725 opt: 936 Z-score: 528.4 bits: 107.8 E(85289): 1.1e-22
Smith-Waterman score: 1133; 37.2% identity (57.1% similar) in 666 aa overlap (8-655:10-559)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAEAPQVVEIDPDFEPLPRPRSCTWPLPRPEFSQSNSATSSPAPSGSAAANPDAAAGL
:..:::: : ::::::::::.:.. :.. :.: :
NP_001 MAAKLRAHQVDVDPDFAPQSRPRSCTWPLPQPDL----------------AGDEDGALG-
10 20 30 40
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pF1KB7 PSASAAAVSADFMSNLSLLEESEDFPQAPGSVAAAVAAAAAAAATGGLCGDFQGPEAGCL
:.:. : .:: :: ::
NP_001 -----AGVA----------EGAED------------------------CG----PERRAT
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pF1KB7 HPAPPQPPPPGPLSQHPPVPPAAAGPLAGQPRKSSSSRRNAWGNLSYADLITKAIESSAE
:: :: : : .::: ::..::::::::::::::::::::::. .
NP_001 APAMAPAPPLG----------AEVGPL----RKAKSSRRNAWGNLSYADLITKAIESAPD
70 80 90 100
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pF1KB7 KRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWM
:::::::::.:::. :::::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::::
NP_001 KRLTLSQIYDWMVRYVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHTRFIRVQNEGTGKSSWWM
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKASLQSGQEGAGDS------PGS--
:::::::.::.:::::.::::..:: . ...:.::: .::. ... :: ::
NP_001 LNPEGGKTGKTPRRRAVSMDNGAKFLRIKGKASKKK-QLQAPERSPDDSSPSAPAPGPVP
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340
pF1KB7 QFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFR----PRTSSNASTISGRLSPIMTEQDDLGEGDVHSM
.:: :::.::..::.. :. :: : . : . . .. .. : . :
NP_001 AAAKWAASPASHASDDYEAWADFRGGGRPLLGEAAELEDDEALEALAPSSPLMYPSPASA
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 VYPPSAAKMASTLPSLSEISNPENMENLLDNLNLLSSPTSLTVSTQSSPGTMMQQ-TPCY
. : ... . :: :.:...: .... . .: : .: ..:.. : . :: :
NP_001 LSPALGSRCPGELPRLAELGGPLGLHGG-GGAGL---PEGLLDGAQDAYGPRARAGTPAY
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 SFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPIQTLQDNKSSYGGMSQYNCAPGLLKEL
:. . . . . .. : .:. : ..:.::.:.::.. . :: : :
NP_001 -FGGCKGGAYGGGGGF-----GPPAMGALRRLPMQTIQENKQASFVPAAAPFRPGALPAL
350 360 370 380 390
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 LTSDSPPHNDIMTPVDPGVAQPNSRVLGQNVMMGPNSVMSTYGSQA-SHNKMMNPSS-HT
: :: : : .. :. .:. . :.. . :. : :.. . .: : :
NP_001 L----PPPPPAPRP-GPVLGAPGELALAGAAAAYPGKGAAPYAPPAPSRSALAHPISLMT
400 410 420 430 440 450
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 HPGHAQQTSAVNGRPLPHTVSTMPHTSGMNRLTQVKTPVQVPLPHPMQMSALGGYSSVSS
::.: .:.. : :... .:. . :: :. .: : ...
NP_001 LPGEA---GAAGLAPSGHAAAFGGPPGGL---------LLDALPGPYAAAAAGPLGAA--
460 470 480 490
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 CNGYGRMGLLHQEKLPSDLD-GMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDNVLPNQSFP
...:.::: :: :.::.:::: ::.::.: .:::::..:: :
NP_001 -----------PDRFPADLDLDMFSGSLECDVESIILNDFMDSDEMDFNFDSALPPPP-P
500 510 520 530 540
650
pF1KB7 H--SVKTTTHSWVSG
.. ..::: :
NP_001 GLAGAPPPNQSWVPG
550
>>NP_001164402 (OMIM: 300033) forkhead box protein O4 is (450 aa)
initn: 1163 init1: 617 opt: 838 Z-score: 476.5 bits: 97.9 E(85289): 8.4e-20
Smith-Waterman score: 990; 41.6% identity (62.0% similar) in 519 aa overlap (122-633:20-447)
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 AAVAAAAAAAATGGLCGDFQGPEAGCLHPAPPQPPPPGPLSQHPPVPPAAAGPLAGQPRK
: : : : :.: .:.:: .
NP_001 MDPGNENSATEAAAIIDLDPDFEPQSRPRSCTWPLPRPE---IANQPSE
10 20 30 40
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 SSSSRRNAWGNLSYADLITKAIESSAEKRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKN
. :: :::::. ::::::.:::::::..::::::::::::::::::
NP_001 PPEVE---------PDLGEKAIESAPEKRLTLAQIYEWMVRTVPYFKDKGDSNSSAGWKN
50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 SIRHNLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAA
:::::::::::::.:.::.::::::::::::::::::.:::::::::..::. ..::.:
NP_001 SIRHNLSLHSKFIKVHNEATGKSSWWMLNPEGGKSGKAPRRRAASMDSSSKLLRGRSKAP
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320
pF1KB7 KKKAS-LQSGQEGAGD-SPGSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLS
::: : : . ::: :: ..:.:: .:: :.. .. : :.:::::.:::::..: :::
NP_001 KKKPSVLPAPPEGATPTSPVGHFAKWSGSPCSRNREEADMWTTFRPRSSSNASSVSTRLS
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 PIMTEQDDLGEGDVHSMVYPPSAAKMASTLPSLSEISNPENMENLLDNLNLLSSPTSLTV
:. :.. :.: .. : :....:. .: . :..: :::.::: :: . :.
NP_001 PLRPESEVLAE-EI-----PASVSSYAGGVPP----TLNEGLE-LLDGLNLTSSHSLLSR
220 230 240 250 260
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 STQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPIQTLQDNKSSY
: :. : ::. :. . .::..: .:: . :... . ::
NP_001 SGLSG------------F-----SLQHPGVTGPLHTYSSSLFSP-AEGPLSAGEGCFSS-
270 280 290 300
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 GGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPH-NDI-MTPVDPGVAQ-PNSRVLGQNVMMGPNSVMST
:: :. :::::.:: :. :: ::: ..: :. .:: :.:
NP_001 ---SQA------LEALLTSDTPPPPADVLMTQVDPILSQAPTLLLLGGL----PSS----
310 320 330 340 350
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 YGSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGRPLPHTVSTMPHTSGMNRLTQVKTPVQVPL
:. . . . :. :: .. . ... : .... : .... ::: .:
NP_001 --SKLATGVGLCPKPLEAPGPSSLVPTLSMIAPPPVMASAPIPKALG------TPVLTP-
360 370 380 390 400
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 PHPMQMSALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEKLPSDLD-GMFIERLDCDMESIIRNDLMD-
: . .. :...:.::: :..: :.:::..:: .::::
NP_001 --PTEAAS--------------------QDRMPQDLDLDMYMENLECDMDNII-SDLMDE
410 420 430
630 640 650
pF1KB7 GDTLDFNFDNVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG
:. :::::.
NP_001 GEGLDFNFEPDP
440 450
>>XP_005266924 (OMIM: 602681) PREDICTED: forkhead box pr (484 aa)
initn: 965 init1: 430 opt: 689 Z-score: 395.1 bits: 83.0 E(85289): 2.9e-15
Smith-Waterman score: 1172; 43.6% identity (70.7% similar) in 491 aa overlap (200-655:7-484)
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 TKAIESSAEKRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWK-NSIRHNLSLHSKFIRVQN
:: :... : :::::::::::.:.::::
XP_005 MTVALQKGASGGGPCLKQNSIRHNLSLHSRFMRVQN
10 20 30
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 EGTGKSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKASLQSGQEGAGDSP
:::::::::..::.::::::.:::::.::::..:..:::.:::::::.::.. :.: :::
XP_005 EGTGKSSWWIINPDGGKSGKAPRRRAVSMDNSNKYTKSRGRAAKKKAALQTAPESADDSP
40 50 60 70 80 90
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 GSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIM--TEQDDLGEGD--VH
::.::::.:: :.:.:..: :. :: ::.:::::.:::::::: :: :.. . : .
XP_005 -SQLSKWPGSPTSRSSDELDAWTDFRSRTNSNASTVSGRLSPIMASTELDEVQDDDAPLS
100 110 120 130 140 150
350 360 370 380 390
pF1KB7 SMVYP------PSAAKMAST-LPSLSEISNPENM-----ENLLDNL-NLLSSPTSLTVST
:.: ::..: .. :: :..... :. :::.:.: . .. : :
XP_005 PMLYSSSASLSPSVSKPCTVELPRLTDMAGTMNLNDGLTENLMDDLLDNITLPPS-----
160 170 180 190 200 210
400 410 420 430 440
pF1KB7 QSSP-GTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMPIQTLQDNK-SSY
: :: : .::.. . .. ...:.::. .... ..: ::.. : : :.::.:.:: ...
XP_005 QPSPTGGLMQRSSSFPYTTKGSGLGSPTSSFNSTVFGPSSLNSLRQSPMQTIQENKPATF
220 230 240 250 260 270
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 GGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIM-TPVDPGVAQPNSRVLGQNV---MMGPNSVMS
..::.:. :..:::::: :.:.: : :: ..: .. : .:: .: :. :
XP_005 SSMSHYGNQ--TLQDLLTSDSLSHSDVMMTQSDPLMSQASTAVSAQNSRRNVMLRNDPMM
280 290 300 310 320
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pF1KB7 TYGSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGRPLPHTVSTMPHTSGMNRLTQVKTPVQVP
....: ......: .. : : : . ..: : ..::.: : . : ..: : :
XP_005 SFAAQPNQGSLVN-QNLLHHQHQTQGALGGSRALSNSVSNMG-LSESSSLGSAKHQQQSP
330 340 350 360 370 380
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 LPHPMQM--SALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEKLPSDLD-GMFIERLDCDMESIIRNDL
. . :: ..:.: : :. . :: .::.::::: :: :.::::::::..:
XP_005 VSQSMQTLSDSLSGSSLYSTSANLPVMG---HEKFPSDLDLDMFNGSLECDMESIIRSEL
390 400 410 420 430 440
630 640 650
pF1KB7 MDGDTLDFNFDNVLPNQS--------FPHSVKTTTHSWVSG
::.: ::::::... .:. : . .....::: :
XP_005 MDADGLDFNFDSLISTQNVVGLNVGNFTGAKQASSQSWVPG
450 460 470 480
>>XP_016866074 (OMIM: 602681) PREDICTED: forkhead box pr (484 aa)
initn: 965 init1: 430 opt: 689 Z-score: 395.1 bits: 83.0 E(85289): 2.9e-15
Smith-Waterman score: 1172; 43.6% identity (70.7% similar) in 491 aa overlap (200-655:7-484)
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 TKAIESSAEKRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWK-NSIRHNLSLHSKFIRVQN
:: :... : :::::::::::.:.::::
XP_016 MTVALQKGASGGGPCLKQNSIRHNLSLHSRFMRVQN
10 20 30
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 EGTGKSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKASLQSGQEGAGDSP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]