Result of FASTA (omim) for
pFN21AB7054
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7054, 574 aa
1>>>pF1KB7054 574 - 574 aa - 574 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.6300+/-0.000476; mu= -18.0378+/- 0.029
mean_var=757.6193+/-184.638, 0's: 0 Z-trim(123.1): 73 B-trim: 2507 in 1/55
Lambda= 0.046596
statistics sampled from 42339 (42415) to 42339 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.791), E-opt: 0.2 (0.497), width: 16
Scan time: 12.080
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_991331 (OMIM: 608433,612337) zinc finger and BT ( 531) 702 62.7 3.4e-09
XP_016855549 (OMIM: 608433,612337) PREDICTED: zinc ( 522) 700 62.6 3.7e-09
NP_001265125 (OMIM: 608433,612337) zinc finger and ( 522) 700 62.6 3.7e-09
XP_005273063 (OMIM: 608433,612337) PREDICTED: zinc ( 522) 700 62.6 3.7e-09
NP_006343 (OMIM: 608433,612337) zinc finger and BT ( 522) 700 62.6 3.7e-09
NP_001131073 (OMIM: 613915,616248) zinc finger and ( 422) 538 51.6 6.2e-06
XP_016876400 (OMIM: 613915,616248) PREDICTED: zinc ( 422) 538 51.6 6.2e-06
NP_056982 (OMIM: 605878) zinc finger and BTB domai ( 584) 437 44.9 0.00084
NP_001304919 (OMIM: 605878) zinc finger and BTB do ( 584) 437 44.9 0.00084
XP_005259628 (OMIM: 605878) PREDICTED: zinc finger ( 584) 437 44.9 0.00084
XP_005259627 (OMIM: 605878) PREDICTED: zinc finger ( 634) 437 45.0 0.00089
NP_003434 (OMIM: 604084) zinc finger and BTB domai ( 803) 411 43.4 0.0035
NP_001274532 (OMIM: 604084) zinc finger and BTB do ( 810) 411 43.4 0.0035
NP_055687 (OMIM: 616590) zinc finger and BTB domai ( 677) 404 42.8 0.0043
XP_005251691 (OMIM: 616590) PREDICTED: zinc finger ( 677) 404 42.8 0.0043
>>NP_991331 (OMIM: 608433,612337) zinc finger and BTB do (531 aa)
initn: 1057 init1: 296 opt: 702 Z-score: 286.0 bits: 62.7 E(85289): 3.4e-09
Smith-Waterman score: 917; 39.2% identity (59.8% similar) in 508 aa overlap (50-525:9-500)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 RKRSLLRGAVGRYRGATGGDLFWAPFPSWGTMEFPEHSQQLLQSLREQRSQGFLCDCTVM
.::::.::..::: : ::: :::::::::.
NP_991 MCPKGYEDSMEFPDHSRHLLQCLSEQRHQGFLCDCTVL
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 VGSTQFLAHRAVLASCSPFFQLFYKERELDKRDLVCIHNEIVTAPAFGLLLDFMYAGQLT
::..:: :::::::::: .:.::::. .:::::.: ....:::::::.:::.::: :.:
NP_991 VGDAQFRAHRAVLASCSMYFHLFYKD-QLDKRDIVHLNSDIVTAPAFALLLEFMYEGKLQ
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 LRGDTPVEDVLAAASYLHMNDIVKVCKRRLQARALAEADSTKKEEETNSQLPSLEFLSST
.. : :.:::::::::::: :::::::..:. .: .:::::::::...: ..: ::.
NP_991 FK-DLPIEDVLAAASYLHMYDIVKVCKKKLKEKATTEADSTKKEEDASSCSDKVESLSDG
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 SRGTQPSLASAETSGHWGKGEWKGSAAPSPT--VRPPDEPPM---SSGADTTQPGMEVDA
: .: : : :. . : . :: . : . : :..: : : :..
NP_991 SSHIAGDLPSDEDEGE----DEKLNILPSKRDLAAEPGNMWMRLPSDSAGIPQAGGEAE-
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300
pF1KB7 PHLRAPHPPVADVSLASPSSSTETIPTNYFSSGISAVSLEPLPSLDV-----GPESLR--
:: .: ..::: ::::.. .: ...... . .:.: : :.:
NP_991 -----PHATAAGKTVASPCSSTESLSQRSVTSVRDSADVDCVLDLSVKSSLSGVENLNSS
220 230 240 250 260
310 320 330 340 350
pF1KB7 VVEPKDP--GGPLQ-GFYPPASAPTS---------APAPVSAPVPSQAPAPAE-AELVQV
.: .. .: :: : . :. : .. . : :.:. .
NP_991 YFSSQDVLRSNLVQVKVEKEASCDESDVGTNDYDMEHSTVKESVSTNNRVQYEPAHLAPL
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400
pF1KB7 KVEAIVIS-DEETDVSDEQPQGPE--RAFPSGGAVYGAQPSQPEAFEDPGAAGL----EE
. .... :.: .::.. . :: :. :: . : . . : . ..
NP_991 REDSVLRELDREDKASDDEMMTPESERVQVEGGMESSLLPYVSNILSPAGQIFMCPLCNK
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 VGPSDHFLPTDPHLPYHLLPGAGQYHRGLVTSPLPAPASLHEPLYLSSEYEAAPGSFGVF
: :: :.: :: :. : . . .:. :: . : :
NP_991 VFPSPHILQI--HLSTHFREQDGIRSKPAADVNVPT-CSLCGKTF-SCMYTLKRHERTHS
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 TEDVPTCKTCGKTFSCSYTLRRHATVHTRERPYECRYCLRSYTQSGDLYRHIRKAHNEDL
: :: :::.:. :..: :::.:::::.:. :..: : .:::::::::::: : :
NP_991 GEKPYTCTQCGKSFQYSHNLSRHAVVHTREKPHACKWCERRFTQSGDLYRHIRKFHCELV
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570
pF1KB7 AKRSKPDPEVGPLLGVQPLPGSPTADRQSSSGGGPPKDFVLAPKTNI
NP_991 NSLSVKSEALSLPTVRDWTLEDSSQELWK
510 520 530
>>XP_016855549 (OMIM: 608433,612337) PREDICTED: zinc fin (522 aa)
initn: 1055 init1: 294 opt: 700 Z-score: 285.3 bits: 62.6 E(85289): 3.7e-09
Smith-Waterman score: 915; 39.3% identity (59.8% similar) in 507 aa overlap (51-525:1-491)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KRSLLRGAVGRYRGATGGDLFWAPFPSWGTMEFPEHSQQLLQSLREQRSQGFLCDCTVMV
::::.::..::: : ::: :::::::::.:
XP_016 MEFPDHSRHLLQCLSEQRHQGFLCDCTVLV
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 GSTQFLAHRAVLASCSPFFQLFYKERELDKRDLVCIHNEIVTAPAFGLLLDFMYAGQLTL
:..:: :::::::::: .:.::::. .:::::.: ....:::::::.:::.::: :.: .
XP_016 GDAQFRAHRAVLASCSMYFHLFYKD-QLDKRDIVHLNSDIVTAPAFALLLEFMYEGKLQF
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 RGDTPVEDVLAAASYLHMNDIVKVCKRRLQARALAEADSTKKEEETNSQLPSLEFLSSTS
. : :.:::::::::::: :::::::..:. .: .:::::::::...: ..: ::. :
XP_016 K-DLPIEDVLAAASYLHMYDIVKVCKKKLKEKATTEADSTKKEEDASSCSDKVESLSDGS
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250
pF1KB7 RGTQPSLASAETSGHWGKGEWKGSAAPSPT--VRPPDEPPM---SSGADTTQPGMEVDAP
.: : : :. . : . :: . : . : :..: : : :..
XP_016 SHIAGDLPSDEDEGE----DEKLNILPSKRDLAAEPGNMWMRLPSDSAGIPQAGGEAE--
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300
pF1KB7 HLRAPHPPVADVSLASPSSSTETIPTNYFSSGISAVSLEPLPSLDV-----GPESLR--V
:: .: ..::: ::::.. .: ...... . .:.: : :.:
XP_016 ----PHATAAGKTVASPCSSTESLSQRSVTSVRDSADVDCVLDLSVKSSLSGVENLNSSY
210 220 230 240 250
310 320 330 340 350
pF1KB7 VEPKDP--GGPLQ-GFYPPASAPTS---------APAPVSAPVPSQAPAPAE-AELVQVK
.: .. .: :: : . :. : .. . : :.:. ..
XP_016 FSSQDVLRSNLVQVKVEKEASCDESDVGTNDYDMEHSTVKESVSTNNRVQYEPAHLAPLR
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400
pF1KB7 VEAIVIS-DEETDVSDEQPQGPE--RAFPSGGAVYGAQPSQPEAFEDPGAAGL----EEV
.... :.: .::.. . :: :. :: . : . . : . ..:
XP_016 EDSVLRELDREDKASDDEMMTPESERVQVEGGMESSLLPYVSNILSPAGQIFMCPLCNKV
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 GPSDHFLPTDPHLPYHLLPGAGQYHRGLVTSPLPAPASLHEPLYLSSEYEAAPGSFGVFT
:: :.: :: :. : . . .:. :: . : :
XP_016 FPSPHILQI--HLSTHFREQDGIRSKPAADVNVPT-CSLCGKTF-SCMYTLKRHERTHSG
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 EDVPTCKTCGKTFSCSYTLRRHATVHTRERPYECRYCLRSYTQSGDLYRHIRKAHNEDLA
: :: :::.:. :..: :::.:::::.:. :..: : .:::::::::::: : :
XP_016 EKPYTCTQCGKSFQYSHNLSRHAVVHTREKPHACKWCERRFTQSGDLYRHIRKFHCELVN
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570
pF1KB7 KRSKPDPEVGPLLGVQPLPGSPTADRQSSSGGGPPKDFVLAPKTNI
XP_016 SLSVKSEALSLPTVRDWTLEDSSQELWK
500 510 520
>>NP_001265125 (OMIM: 608433,612337) zinc finger and BTB (522 aa)
initn: 1055 init1: 294 opt: 700 Z-score: 285.3 bits: 62.6 E(85289): 3.7e-09
Smith-Waterman score: 915; 39.3% identity (59.8% similar) in 507 aa overlap (51-525:1-491)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KRSLLRGAVGRYRGATGGDLFWAPFPSWGTMEFPEHSQQLLQSLREQRSQGFLCDCTVMV
::::.::..::: : ::: :::::::::.:
NP_001 MEFPDHSRHLLQCLSEQRHQGFLCDCTVLV
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 GSTQFLAHRAVLASCSPFFQLFYKERELDKRDLVCIHNEIVTAPAFGLLLDFMYAGQLTL
:..:: :::::::::: .:.::::. .:::::.: ....:::::::.:::.::: :.: .
NP_001 GDAQFRAHRAVLASCSMYFHLFYKD-QLDKRDIVHLNSDIVTAPAFALLLEFMYEGKLQF
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 RGDTPVEDVLAAASYLHMNDIVKVCKRRLQARALAEADSTKKEEETNSQLPSLEFLSSTS
. : :.:::::::::::: :::::::..:. .: .:::::::::...: ..: ::. :
NP_001 K-DLPIEDVLAAASYLHMYDIVKVCKKKLKEKATTEADSTKKEEDASSCSDKVESLSDGS
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250
pF1KB7 RGTQPSLASAETSGHWGKGEWKGSAAPSPT--VRPPDEPPM---SSGADTTQPGMEVDAP
.: : : :. . : . :: . : . : :..: : : :..
NP_001 SHIAGDLPSDEDEGE----DEKLNILPSKRDLAAEPGNMWMRLPSDSAGIPQAGGEAE--
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300
pF1KB7 HLRAPHPPVADVSLASPSSSTETIPTNYFSSGISAVSLEPLPSLDV-----GPESLR--V
:: .: ..::: ::::.. .: ...... . .:.: : :.:
NP_001 ----PHATAAGKTVASPCSSTESLSQRSVTSVRDSADVDCVLDLSVKSSLSGVENLNSSY
210 220 230 240 250
310 320 330 340 350
pF1KB7 VEPKDP--GGPLQ-GFYPPASAPTS---------APAPVSAPVPSQAPAPAE-AELVQVK
.: .. .: :: : . :. : .. . : :.:. ..
NP_001 FSSQDVLRSNLVQVKVEKEASCDESDVGTNDYDMEHSTVKESVSTNNRVQYEPAHLAPLR
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400
pF1KB7 VEAIVIS-DEETDVSDEQPQGPE--RAFPSGGAVYGAQPSQPEAFEDPGAAGL----EEV
.... :.: .::.. . :: :. :: . : . . : . ..:
NP_001 EDSVLRELDREDKASDDEMMTPESERVQVEGGMESSLLPYVSNILSPAGQIFMCPLCNKV
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 GPSDHFLPTDPHLPYHLLPGAGQYHRGLVTSPLPAPASLHEPLYLSSEYEAAPGSFGVFT
:: :.: :: :. : . . .:. :: . : :
NP_001 FPSPHILQI--HLSTHFREQDGIRSKPAADVNVPT-CSLCGKTF-SCMYTLKRHERTHSG
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 EDVPTCKTCGKTFSCSYTLRRHATVHTRERPYECRYCLRSYTQSGDLYRHIRKAHNEDLA
: :: :::.:. :..: :::.:::::.:. :..: : .:::::::::::: : :
NP_001 EKPYTCTQCGKSFQYSHNLSRHAVVHTREKPHACKWCERRFTQSGDLYRHIRKFHCELVN
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570
pF1KB7 KRSKPDPEVGPLLGVQPLPGSPTADRQSSSGGGPPKDFVLAPKTNI
NP_001 SLSVKSEALSLPTVRDWTLEDSSQELWK
500 510 520
>>XP_005273063 (OMIM: 608433,612337) PREDICTED: zinc fin (522 aa)
initn: 1055 init1: 294 opt: 700 Z-score: 285.3 bits: 62.6 E(85289): 3.7e-09
Smith-Waterman score: 915; 39.3% identity (59.8% similar) in 507 aa overlap (51-525:1-491)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KRSLLRGAVGRYRGATGGDLFWAPFPSWGTMEFPEHSQQLLQSLREQRSQGFLCDCTVMV
::::.::..::: : ::: :::::::::.:
XP_005 MEFPDHSRHLLQCLSEQRHQGFLCDCTVLV
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 GSTQFLAHRAVLASCSPFFQLFYKERELDKRDLVCIHNEIVTAPAFGLLLDFMYAGQLTL
:..:: :::::::::: .:.::::. .:::::.: ....:::::::.:::.::: :.: .
XP_005 GDAQFRAHRAVLASCSMYFHLFYKD-QLDKRDIVHLNSDIVTAPAFALLLEFMYEGKLQF
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 RGDTPVEDVLAAASYLHMNDIVKVCKRRLQARALAEADSTKKEEETNSQLPSLEFLSSTS
. : :.:::::::::::: :::::::..:. .: .:::::::::...: ..: ::. :
XP_005 K-DLPIEDVLAAASYLHMYDIVKVCKKKLKEKATTEADSTKKEEDASSCSDKVESLSDGS
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250
pF1KB7 RGTQPSLASAETSGHWGKGEWKGSAAPSPT--VRPPDEPPM---SSGADTTQPGMEVDAP
.: : : :. . : . :: . : . : :..: : : :..
XP_005 SHIAGDLPSDEDEGE----DEKLNILPSKRDLAAEPGNMWMRLPSDSAGIPQAGGEAE--
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300
pF1KB7 HLRAPHPPVADVSLASPSSSTETIPTNYFSSGISAVSLEPLPSLDV-----GPESLR--V
:: .: ..::: ::::.. .: ...... . .:.: : :.:
XP_005 ----PHATAAGKTVASPCSSTESLSQRSVTSVRDSADVDCVLDLSVKSSLSGVENLNSSY
210 220 230 240 250
310 320 330 340 350
pF1KB7 VEPKDP--GGPLQ-GFYPPASAPTS---------APAPVSAPVPSQAPAPAE-AELVQVK
.: .. .: :: : . :. : .. . : :.:. ..
XP_005 FSSQDVLRSNLVQVKVEKEASCDESDVGTNDYDMEHSTVKESVSTNNRVQYEPAHLAPLR
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400
pF1KB7 VEAIVIS-DEETDVSDEQPQGPE--RAFPSGGAVYGAQPSQPEAFEDPGAAGL----EEV
.... :.: .::.. . :: :. :: . : . . : . ..:
XP_005 EDSVLRELDREDKASDDEMMTPESERVQVEGGMESSLLPYVSNILSPAGQIFMCPLCNKV
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 GPSDHFLPTDPHLPYHLLPGAGQYHRGLVTSPLPAPASLHEPLYLSSEYEAAPGSFGVFT
:: :.: :: :. : . . .:. :: . : :
XP_005 FPSPHILQI--HLSTHFREQDGIRSKPAADVNVPT-CSLCGKTF-SCMYTLKRHERTHSG
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 EDVPTCKTCGKTFSCSYTLRRHATVHTRERPYECRYCLRSYTQSGDLYRHIRKAHNEDLA
: :: :::.:. :..: :::.:::::.:. :..: : .:::::::::::: : :
XP_005 EKPYTCTQCGKSFQYSHNLSRHAVVHTREKPHACKWCERRFTQSGDLYRHIRKFHCELVN
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570
pF1KB7 KRSKPDPEVGPLLGVQPLPGSPTADRQSSSGGGPPKDFVLAPKTNI
XP_005 SLSVKSEALSLPTVRDWTLEDSSQELWK
500 510 520
>>NP_006343 (OMIM: 608433,612337) zinc finger and BTB do (522 aa)
initn: 1055 init1: 294 opt: 700 Z-score: 285.3 bits: 62.6 E(85289): 3.7e-09
Smith-Waterman score: 915; 39.3% identity (59.8% similar) in 507 aa overlap (51-525:1-491)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KRSLLRGAVGRYRGATGGDLFWAPFPSWGTMEFPEHSQQLLQSLREQRSQGFLCDCTVMV
::::.::..::: : ::: :::::::::.:
NP_006 MEFPDHSRHLLQCLSEQRHQGFLCDCTVLV
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 GSTQFLAHRAVLASCSPFFQLFYKERELDKRDLVCIHNEIVTAPAFGLLLDFMYAGQLTL
:..:: :::::::::: .:.::::. .:::::.: ....:::::::.:::.::: :.: .
NP_006 GDAQFRAHRAVLASCSMYFHLFYKD-QLDKRDIVHLNSDIVTAPAFALLLEFMYEGKLQF
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 RGDTPVEDVLAAASYLHMNDIVKVCKRRLQARALAEADSTKKEEETNSQLPSLEFLSSTS
. : :.:::::::::::: :::::::..:. .: .:::::::::...: ..: ::. :
NP_006 K-DLPIEDVLAAASYLHMYDIVKVCKKKLKEKATTEADSTKKEEDASSCSDKVESLSDGS
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250
pF1KB7 RGTQPSLASAETSGHWGKGEWKGSAAPSPT--VRPPDEPPM---SSGADTTQPGMEVDAP
.: : : :. . : . :: . : . : :..: : : :..
NP_006 SHIAGDLPSDEDEGE----DEKLNILPSKRDLAAEPGNMWMRLPSDSAGIPQAGGEAE--
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300
pF1KB7 HLRAPHPPVADVSLASPSSSTETIPTNYFSSGISAVSLEPLPSLDV-----GPESLR--V
:: .: ..::: ::::.. .: ...... . .:.: : :.:
NP_006 ----PHATAAGKTVASPCSSTESLSQRSVTSVRDSADVDCVLDLSVKSSLSGVENLNSSY
210 220 230 240 250
310 320 330 340 350
pF1KB7 VEPKDP--GGPLQ-GFYPPASAPTS---------APAPVSAPVPSQAPAPAE-AELVQVK
.: .. .: :: : . :. : .. . : :.:. ..
NP_006 FSSQDVLRSNLVQVKVEKEASCDESDVGTNDYDMEHSTVKESVSTNNRVQYEPAHLAPLR
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400
pF1KB7 VEAIVIS-DEETDVSDEQPQGPE--RAFPSGGAVYGAQPSQPEAFEDPGAAGL----EEV
.... :.: .::.. . :: :. :: . : . . : . ..:
NP_006 EDSVLRELDREDKASDDEMMTPESERVQVEGGMESSLLPYVSNILSPAGQIFMCPLCNKV
320 330 340 350 360 370
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 GPSDHFLPTDPHLPYHLLPGAGQYHRGLVTSPLPAPASLHEPLYLSSEYEAAPGSFGVFT
:: :.: :: :. : . . .:. :: . : :
NP_006 FPSPHILQI--HLSTHFREQDGIRSKPAADVNVPT-CSLCGKTF-SCMYTLKRHERTHSG
380 390 400 410 420 430
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 EDVPTCKTCGKTFSCSYTLRRHATVHTRERPYECRYCLRSYTQSGDLYRHIRKAHNEDLA
: :: :::.:. :..: :::.:::::.:. :..: : .:::::::::::: : :
NP_006 EKPYTCTQCGKSFQYSHNLSRHAVVHTREKPHACKWCERRFTQSGDLYRHIRKFHCELVN
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570
pF1KB7 KRSKPDPEVGPLLGVQPLPGSPTADRQSSSGGGPPKDFVLAPKTNI
NP_006 SLSVKSEALSLPTVRDWTLEDSSQELWK
500 510 520
>>NP_001131073 (OMIM: 613915,616248) zinc finger and BTB (422 aa)
initn: 1023 init1: 397 opt: 538 Z-score: 227.5 bits: 51.6 E(85289): 6.2e-06
Smith-Waterman score: 759; 37.4% identity (54.3% similar) in 506 aa overlap (51-523:1-413)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KRSLLRGAVGRYRGATGGDLFWAPFPSWGTMEFPEHSQQLLQSLREQRSQGFLCDCTVMV
::::::. .:: ::.:: ::::::::.:
NP_001 MEFPEHGGRLLGRLRQQRELGFLCDCTVLV
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 GSTQFLAHRAVLASCSPFFQLFYKERELDKRDLVCIHNEIVTAPAFGLLLDFMYAGQLTL
:...: :::::::.:: .:.:::..: .:: : ....:::::::: :::::: :.: :
NP_001 GDARFPAHRAVLAACSVYFHLFYRDRPAGSRDTVRLNGDIVTAPAFGRLLDFMYEGRLDL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 RGDTPVEDVLAAASYLHMNDIVKVCKRRLQARALAEADSTKKEEETNSQLPSLEFLSSTS
:. :::::::::::::: ::::::: ::: :. : : .. .
NP_001 RS-LPVEDVLAAASYLHMYDIVKVCKGRLQ-------------EKDRSLDP-----GNPA
100 110 120 130
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 RGTQPSLASAETSGHWGKGEWKGSAAPSPTVRPPDEPPMSSGADTTQPGMEVDAPHLRAP
:..: :. : : .: :..: ::. :. .. : : ::
NP_001 PGAEP----AQPPCPWPV--W--TADLCPAARKAKLPPF--GVKAALP------P--RAS
140 150 160 170
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 HPPVADVSLASPSSSTETIPTNYFSSGISAVSLEPLPSLDVGPESLRVVEPKDPGGPLQG
:: .: : : . :..: :: ::.. ::
NP_001 GPPPCQV----PEESDQ------------ALDL----SLKSGPRQERV------------
180 190 200
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 FYPPASAPTSAPAPVSAPVPSQAPAPAEAELVQVKVEAIVISDEETDVSDEQPQGPERAF
.:: : :. :: :. : :: : .:..: . :...:..: .
NP_001 -HPPCVLQT--------PLCSQRQ-PGAQPL--VKDERDSLSEQEESSSSRSPHSPPKPP
210 220 230 240
390 400 410 420 430
pF1KB7 P---SGGAVYGAQPSQPEAFEDPGAAGLEEVGPSDHFLPTDPHLPYHLLPGAGQYHRGLV
: . : : : :: : . : :. :: .: . : .. .: ::. :
NP_001 PVPAAKGLVVGLQP-LPLSGE--GSRELE-LGAGR--LASEDELG----PGGPLCICPLC
250 260 270 280 290
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 TSPLPAPASLHEPLYLSSEYEAAPGSFGVFTED--VPTCKTCGKTFSCSYTLRRH-----
.. .:. :. :.::.... .. . .. : .::: :::::::.:::.::
NP_001 SKLFPSSHVLQ--LHLSAHFRERDSTRARLSPDGVAPTCPLCGKTFSCTYTLKRHERTHS
300 310 320 330 340 350
500 510 520
pF1KB7 -----------------------ATVHTRERPYECRYCLRSYTQSGDLYRHIRKAHNEDL
..:::::.:. ::.: : .:::::::::.:: :
NP_001 GEKPYTCVQCGKSFQYSHNLSRHTVVHTREKPHACRWCERRFTQSGDLYRHVRKFHCGLV
360 370 380 390 400 410
530 540 550 560 570
pF1KB7 AKRSKPDPEVGPLLGVQPLPGSPTADRQSSSGGGPPKDFVLAPKTNI
NP_001 KSLLV
420
>>XP_016876400 (OMIM: 613915,616248) PREDICTED: zinc fin (422 aa)
initn: 1023 init1: 397 opt: 538 Z-score: 227.5 bits: 51.6 E(85289): 6.2e-06
Smith-Waterman score: 759; 37.4% identity (54.3% similar) in 506 aa overlap (51-523:1-413)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KRSLLRGAVGRYRGATGGDLFWAPFPSWGTMEFPEHSQQLLQSLREQRSQGFLCDCTVMV
::::::. .:: ::.:: ::::::::.:
XP_016 MEFPEHGGRLLGRLRQQRELGFLCDCTVLV
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 GSTQFLAHRAVLASCSPFFQLFYKERELDKRDLVCIHNEIVTAPAFGLLLDFMYAGQLTL
:...: :::::::.:: .:.:::..: .:: : ....:::::::: :::::: :.: :
XP_016 GDARFPAHRAVLAACSVYFHLFYRDRPAGSRDTVRLNGDIVTAPAFGRLLDFMYEGRLDL
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 RGDTPVEDVLAAASYLHMNDIVKVCKRRLQARALAEADSTKKEEETNSQLPSLEFLSSTS
:. :::::::::::::: ::::::: ::: :. : : .. .
XP_016 RS-LPVEDVLAAASYLHMYDIVKVCKGRLQ-------------EKDRSLDP-----GNPA
100 110 120 130
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 RGTQPSLASAETSGHWGKGEWKGSAAPSPTVRPPDEPPMSSGADTTQPGMEVDAPHLRAP
:..: :. : : .: :..: ::. :. .. : : ::
XP_016 PGAEP----AQPPCPWPV--W--TADLCPAARKAKLPPF--GVKAALP------P--RAS
140 150 160 170
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 HPPVADVSLASPSSSTETIPTNYFSSGISAVSLEPLPSLDVGPESLRVVEPKDPGGPLQG
:: .: : : . :..: :: ::.. ::
XP_016 GPPPCQV----PEESDQ------------ALDL----SLKSGPRQERV------------
180 190 200
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 FYPPASAPTSAPAPVSAPVPSQAPAPAEAELVQVKVEAIVISDEETDVSDEQPQGPERAF
.:: : :. :: :. : :: : .:..: . :...:..: .
XP_016 -HPPCVLQT--------PLCSQRQ-PGAQPL--VKDERDSLSEQEESSSSRSPHSPPKPP
210 220 230 240
390 400 410 420 430
pF1KB7 P---SGGAVYGAQPSQPEAFEDPGAAGLEEVGPSDHFLPTDPHLPYHLLPGAGQYHRGLV
: . : : : :: : . : :. :: .: . : .. .: ::. :
XP_016 PVPAAKGLVVGLQP-LPLSGE--GSRELE-LGAGR--LASEDELG----PGGPLCICPLC
250 260 270 280 290
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 TSPLPAPASLHEPLYLSSEYEAAPGSFGVFTED--VPTCKTCGKTFSCSYTLRRH-----
.. .:. :. :.::.... .. . .. : .::: :::::::.:::.::
XP_016 SKLFPSSHVLQ--LHLSAHFRERDSTRARLSPDGVAPTCPLCGKTFSCTYTLKRHERTHS
300 310 320 330 340 350
500 510 520
pF1KB7 -----------------------ATVHTRERPYECRYCLRSYTQSGDLYRHIRKAHNEDL
..:::::.:. ::.: : .:::::::::.:: :
XP_016 GEKPYTCVQCGKSFQYSHNLSRHTVVHTREKPHACRWCERRFTQSGDLYRHVRKFHCGLV
360 370 380 390 400 410
530 540 550 560 570
pF1KB7 AKRSKPDPEVGPLLGVQPLPGSPTADRQSSSGGGPPKDFVLAPKTNI
XP_016 KSLLV
420
>>NP_056982 (OMIM: 605878) zinc finger and BTB domain-co (584 aa)
initn: 387 init1: 191 opt: 437 Z-score: 189.2 bits: 44.9 E(85289): 0.00084
Smith-Waterman score: 454; 24.7% identity (50.3% similar) in 547 aa overlap (51-566:11-538)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KRSLLRGAVGRYRGATGGDLFWAPFPSWGTMEFPEHSQQLLQSLREQRSQGFLCDCTVMV
. ::.::...:..: :::.::.::: ...:
NP_056 MAGGVDGPIGIPFPDHSSDILSGLNEQRTQGLLCDVVILV
10 20 30 40
90 100 110 120 130
pF1KB7 GSTQFLAHRAVLASCSPFFQ-LFYKERELDKRDLVCIHNEIVTAPAFGLLLDFMYAGQLT
. .: .::.:::.:: .:. :: . .:.... : ..:.: :. :.:: :.. ::
NP_056 EGREFPTHRSVLAACSQYFKKLFTSGAVVDQQNVYEI--DFVSAEALTALMDFAYTATLT
50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 LRGDTPVEDVLAAASYLHMNDIVKVCKRRLQARALA-EADSTKKEEETNSQLPS------
. . . : :.:.:: :.. . .:: :. . :: .: . . . .:. .
NP_056 V-STANVGDILSAARLLEIPAVSHVCADLLDRQILAADAGADAGQLDLVDQIDQRNLLRA
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240
pF1KB7 ---LEFLSSTSRGTQPSLASAETSGHWGKGEWKGSAAPSPTVRPPDEPPMSSGADTTQP-
:::..:. .. : :.: ... :.. .: . . : .. : ..
NP_056 KEYLEFFQSNPMNSLPPAAAAAAASF----PWSAFGASDDDLDATKEAVAAAVAAVAAGD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 --GMEVDAPHLRAPHPPVADVSL--ASPS---SSTETIPTN-YFSSGISAVSLEPLPSLD
:.. .: : .::..: . ..:. : ::. : .. .
NP_056 CNGLDFYGPGPPAERPPTGDGDEGDSNPGLWPERDEDAPTGGLFPPPVAPPAATQNGHYG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KB7 VGPE----SLRVVEPKDPGGPLQGFYPPASAPTSAPAPVSAPVPSQAPAPAEAELVQVKV
: : :: . : .:: :: :. .. .: . ... :
NP_056 RGGEEEAASLSEAAP-EPGDS-PGFLSGAAEGEDGDGPDVDGLAASTLLQQMMSSVGRAG
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 EAIVISDEETDVSDEQPQGPERAFPSGGAVYGAQPSQPEAFEDPGAAGLEEVGPSDHFLP
: ::::. ..:. . . ::. . :. . : : . :
NP_056 AAAGDSDEESRADDKGVMDYYLKYFSGAHDGDVYPAWSQKVEKKIRAKAFQKCP------
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 TDPHLPYHLLPGAGQYHRGLVTSPLPAPASLHEPLYLSSEYEAAPGSFGVFTEDVP-TCK
. ... :::. : . : : . .. . . : . : :.
NP_056 ----ICEKVIQGAGKLPRHIRTHTGEKPYECNICKVRFTRQDKLKVHMRKHTGEKPYLCQ
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 TCGKTFSCSYTLRRHATVHTRERPYECRYCLRSYTQSGDLYRHIRKAHNEDLAKRSKPDP
:: .:. .: :. : ::: :::.: : .....: :.::..: . . .: :
NP_056 QCGAAFAHNYDLKNHMRVHTGLRPYQCDSCCKTFVRSDHLHRHLKKDGCNGVPSRRGRKP
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570
pF1KB7 EV-----GPLLGVQPLPGSPTADRQSSSG-GGPPKDFVLAPKTNI
.: : :. ::.:. . .. .: : :
NP_056 RVRGGAPDPSPGATATPGAPAQPSSPDARRNGQEKHFKDEDEDEDVASPDGLGRLNVAGA
510 520 530 540 550 560
NP_056 GGGGDSGGGPGAATDGNFTAGLA
570 580
>>NP_001304919 (OMIM: 605878) zinc finger and BTB domain (584 aa)
initn: 387 init1: 191 opt: 437 Z-score: 189.2 bits: 44.9 E(85289): 0.00084
Smith-Waterman score: 454; 24.7% identity (50.3% similar) in 547 aa overlap (51-566:11-538)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KRSLLRGAVGRYRGATGGDLFWAPFPSWGTMEFPEHSQQLLQSLREQRSQGFLCDCTVMV
. ::.::...:..: :::.::.::: ...:
NP_001 MAGGVDGPIGIPFPDHSSDILSGLNEQRTQGLLCDVVILV
10 20 30 40
90 100 110 120 130
pF1KB7 GSTQFLAHRAVLASCSPFFQ-LFYKERELDKRDLVCIHNEIVTAPAFGLLLDFMYAGQLT
. .: .::.:::.:: .:. :: . .:.... : ..:.: :. :.:: :.. ::
NP_001 EGREFPTHRSVLAACSQYFKKLFTSGAVVDQQNVYEI--DFVSAEALTALMDFAYTATLT
50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 LRGDTPVEDVLAAASYLHMNDIVKVCKRRLQARALA-EADSTKKEEETNSQLPS------
. . . : :.:.:: :.. . .:: :. . :: .: . . . .:. .
NP_001 V-STANVGDILSAARLLEIPAVSHVCADLLDRQILAADAGADAGQLDLVDQIDQRNLLRA
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240
pF1KB7 ---LEFLSSTSRGTQPSLASAETSGHWGKGEWKGSAAPSPTVRPPDEPPMSSGADTTQP-
:::..:. .. : :.: ... :.. .: . . : .. : ..
NP_001 KEYLEFFQSNPMNSLPPAAAAAAASF----PWSAFGASDDDLDATKEAVAAAVAAVAAGD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 --GMEVDAPHLRAPHPPVADVSL--ASPS---SSTETIPTN-YFSSGISAVSLEPLPSLD
:.. .: : .::..: . ..:. : ::. : .. .
NP_001 CNGLDFYGPGPPAERPPTGDGDEGDSNPGLWPERDEDAPTGGLFPPPVAPPAATQNGHYG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KB7 VGPE----SLRVVEPKDPGGPLQGFYPPASAPTSAPAPVSAPVPSQAPAPAEAELVQVKV
: : :: . : .:: :: :. .. .: . ... :
NP_001 RGGEEEAASLSEAAP-EPGDS-PGFLSGAAEGEDGDGPDVDGLAASTLLQQMMSSVGRAG
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 EAIVISDEETDVSDEQPQGPERAFPSGGAVYGAQPSQPEAFEDPGAAGLEEVGPSDHFLP
: ::::. ..:. . . ::. . :. . : : . :
NP_001 AAAGDSDEESRADDKGVMDYYLKYFSGAHDGDVYPAWSQKVEKKIRAKAFQKCP------
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 TDPHLPYHLLPGAGQYHRGLVTSPLPAPASLHEPLYLSSEYEAAPGSFGVFTEDVP-TCK
. ... :::. : . : : . .. . . : . : :.
NP_001 ----ICEKVIQGAGKLPRHIRTHTGEKPYECNICKVRFTRQDKLKVHMRKHTGEKPYLCQ
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 TCGKTFSCSYTLRRHATVHTRERPYECRYCLRSYTQSGDLYRHIRKAHNEDLAKRSKPDP
:: .:. .: :. : ::: :::.: : .....: :.::..: . . .: :
NP_001 QCGAAFAHNYDLKNHMRVHTGLRPYQCDSCCKTFVRSDHLHRHLKKDGCNGVPSRRGRKP
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570
pF1KB7 EV-----GPLLGVQPLPGSPTADRQSSSG-GGPPKDFVLAPKTNI
.: : :. ::.:. . .. .: : :
NP_001 RVRGGAPDPSPGATATPGAPAQPSSPDARRNGQEKHFKDEDEDEDVASPDGLGRLNVAGA
510 520 530 540 550 560
NP_001 GGGGDSGGGPGAATDGNFTAGLA
570 580
>>XP_005259628 (OMIM: 605878) PREDICTED: zinc finger and (584 aa)
initn: 387 init1: 191 opt: 437 Z-score: 189.2 bits: 44.9 E(85289): 0.00084
Smith-Waterman score: 454; 24.7% identity (50.3% similar) in 547 aa overlap (51-566:11-538)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 KRSLLRGAVGRYRGATGGDLFWAPFPSWGTMEFPEHSQQLLQSLREQRSQGFLCDCTVMV
. ::.::...:..: :::.::.::: ...:
XP_005 MAGGVDGPIGIPFPDHSSDILSGLNEQRTQGLLCDVVILV
10 20 30 40
90 100 110 120 130
pF1KB7 GSTQFLAHRAVLASCSPFFQ-LFYKERELDKRDLVCIHNEIVTAPAFGLLLDFMYAGQLT
. .: .::.:::.:: .:. :: . .:.... : ..:.: :. :.:: :.. ::
XP_005 EGREFPTHRSVLAACSQYFKKLFTSGAVVDQQNVYEI--DFVSAEALTALMDFAYTATLT
50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 LRGDTPVEDVLAAASYLHMNDIVKVCKRRLQARALA-EADSTKKEEETNSQLPS------
. . . : :.:.:: :.. . .:: :. . :: .: . . . .:. .
XP_005 V-STANVGDILSAARLLEIPAVSHVCADLLDRQILAADAGADAGQLDLVDQIDQRNLLRA
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240
pF1KB7 ---LEFLSSTSRGTQPSLASAETSGHWGKGEWKGSAAPSPTVRPPDEPPMSSGADTTQP-
:::..:. .. : :.: ... :.. .: . . : .. : ..
XP_005 KEYLEFFQSNPMNSLPPAAAAAAASF----PWSAFGASDDDLDATKEAVAAAVAAVAAGD
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 --GMEVDAPHLRAPHPPVADVSL--ASPS---SSTETIPTN-YFSSGISAVSLEPLPSLD
:.. .: : .::..: . ..:. : ::. : .. .
XP_005 CNGLDFYGPGPPAERPPTGDGDEGDSNPGLWPERDEDAPTGGLFPPPVAPPAATQNGHYG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KB7 VGPE----SLRVVEPKDPGGPLQGFYPPASAPTSAPAPVSAPVPSQAPAPAEAELVQVKV
: : :: . : .:: :: :. .. .: . ... :
XP_005 RGGEEEAASLSEAAP-EPGDS-PGFLSGAAEGEDGDGPDVDGLAASTLLQQMMSSVGRAG
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 EAIVISDEETDVSDEQPQGPERAFPSGGAVYGAQPSQPEAFEDPGAAGLEEVGPSDHFLP
: ::::. ..:. . . ::. . :. . : : . :
XP_005 AAAGDSDEESRADDKGVMDYYLKYFSGAHDGDVYPAWSQKVEKKIRAKAFQKCP------
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 TDPHLPYHLLPGAGQYHRGLVTSPLPAPASLHEPLYLSSEYEAAPGSFGVFTEDVP-TCK
. ... :::. : . : : . .. . . : . : :.
XP_005 ----ICEKVIQGAGKLPRHIRTHTGEKPYECNICKVRFTRQDKLKVHMRKHTGEKPYLCQ
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 TCGKTFSCSYTLRRHATVHTRERPYECRYCLRSYTQSGDLYRHIRKAHNEDLAKRSKPDP
:: .:. .: :. : ::: :::.: : .....: :.::..: . . .: :
XP_005 QCGAAFAHNYDLKNHMRVHTGLRPYQCDSCCKTFVRSDHLHRHLKKDGCNGVPSRRGRKP
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570
pF1KB7 EV-----GPLLGVQPLPGSPTADRQSSSG-GGPPKDFVLAPKTNI
.: : :. ::.:. . .. .: : :
XP_005 RVRGGAPDPSPGATATPGAPAQPSSPDARRNGQEKHFKDEDEDEDVASPDGLGRLNVAGA
510 520 530 540 550 560
XP_005 GGGGDSGGGPGAATDGNFTAGLA
570 580
574 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 14:35:59 2016 done: Mon Nov 7 14:36:01 2016
Total Scan time: 12.080 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]