Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7036
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7036, 397 aa
1>>>pF1KB7036 397 - 397 aa - 397 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7083+/-0.00112; mu= 14.8048+/- 0.067
mean_var=126.5991+/-42.083, 0's: 0 Z-trim(104.2): 340 B-trim: 970 in 2/47
Lambda= 0.113988
statistics sampled from 7131 (7760) to 7131 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 2.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 2642 446.6 1.9e-125
CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 2352 398.9 4e-111
CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 ( 337) 538 100.5 2.4e-21
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 522 98.0 1.8e-20
CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 360) 520 97.6 2e-20
CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 378) 520 97.6 2e-20
CCDS34270.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 387) 520 97.6 2.1e-20
CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 388) 520 97.6 2.1e-20
CCDS75353.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 411) 520 97.6 2.1e-20
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CCDS34272.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 ( 428) 520 97.7 2.2e-20
CCDS5157.1 TAAR2 gene_id:9287|Hs108|chr6 ( 306) 512 96.2 4.4e-20
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 511 96.1 5.3e-20
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 511 96.2 6.1e-20
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 511 96.2 6.4e-20
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 511 96.2 6.5e-20
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 511 96.2 6.6e-20
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 510 96.1 7.8e-20
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 509 95.9 8.3e-20
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 509 96.0 9.3e-20
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 494 93.4 4.2e-19
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 483 91.6 1.5e-18
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 477 90.6 2.9e-18
CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 453 86.7 4.6e-17
CCDS5158.1 TAAR1 gene_id:134864|Hs108|chr6 ( 339) 450 86.0 5.5e-17
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 444 85.2 1.3e-16
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 444 85.2 1.3e-16
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 444 85.2 1.4e-16
CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 441 84.7 1.9e-16
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 440 84.5 1.9e-16
CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 432 83.1 4.6e-16
CCDS5155.1 TAAR6 gene_id:319100|Hs108|chr6 ( 345) 429 82.6 6.1e-16
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 430 82.9 6.6e-16
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 428 82.5 7.3e-16
CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 427 82.3 8.3e-16
CCDS7293.1 TACR2 gene_id:6865|Hs108|chr10 ( 398) 427 82.3 8.4e-16
CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 422 81.5 1.4e-15
CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 416 80.5 2.8e-15
CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 416 80.6 3.3e-15
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 414 80.2 3.5e-15
CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 412 79.9 5e-15
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 412 80.0 5.2e-15
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 410 79.6 6.4e-15
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 408 79.2 7.2e-15
CCDS75520.1 TAAR9 gene_id:134860|Hs108|chr6 ( 348) 405 78.7 9.5e-15
CCDS839.1 ADORA3 gene_id:140|Hs108|chr1 ( 318) 404 78.4 1e-14
CCDS2604.1 HRH1 gene_id:3269|Hs108|chr3 ( 487) 405 78.8 1.2e-14
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 399 77.7 1.9e-14
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 399 77.7 2e-14
CCDS1958.1 TACR1 gene_id:6869|Hs108|chr2 ( 407) 399 77.7 2.1e-14
>>CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 (397 aa)
initn: 2642 init1: 2642 opt: 2642 Z-score: 2365.8 bits: 446.6 E(32554): 1.9e-125
Smith-Waterman score: 2642; 100.0% identity (100.0% similar) in 397 aa overlap (1-397:1-397)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAVGLNRRLRNLTNCFIVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAVGLNRRLRNLTNCFIVSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISLDRYCAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISLDRYCAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 MDPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGWNSRNETSKGNHTTSKCKVQVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MDPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGWNSRNETSKGNHTTSKCKVQVNE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VYGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHISSWKAATIREHKATVTLAAVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VYGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHISSWKAATIREHKATVTLAAVM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GAFIICWFPYFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSALNPILYAALNRDFRTGYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GAFIICWFPYFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSALNPILYAALNRDFRTGYQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 QLFCCRLANRNSHKTSLRSNASQLSRTQSREPRQQEEKPLKLQVWSGTEVTAPQGATDRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QLFCCRLANRNSHKTSLRSNASQLSRTQSREPRQQEEKPLKLQVWSGTEVTAPQGATDRP
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB7 WLCLPECWSVELTHSFIHLFIHSFANIHPIPTTCQEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WLCLPECWSVELTHSFIHLFIHSFANIHPIPTTCQEL
370 380 390
>>CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 (359 aa)
initn: 2352 init1: 2352 opt: 2352 Z-score: 2108.5 bits: 398.9 E(32554): 4e-111
Smith-Waterman score: 2352; 100.0% identity (100.0% similar) in 359 aa overlap (1-359:1-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAVGLNRRLRNLTNCFIVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAVGLNRRLRNLTNCFIVSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 AITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISLDRYCAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISLDRYCAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 MDPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGWNSRNETSKGNHTTSKCKVQVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGWNSRNETSKGNHTTSKCKVQVNE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VYGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHISSWKAATIREHKATVTLAAVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VYGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHISSWKAATIREHKATVTLAAVM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GAFIICWFPYFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSALNPILYAALNRDFRTGYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GAFIICWFPYFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSALNPILYAALNRDFRTGYQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 QLFCCRLANRNSHKTSLRSNASQLSRTQSREPRQQEEKPLKLQVWSGTEVTAPQGATDRP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLFCCRLANRNSHKTSLRSNASQLSRTQSREPRQQEEKPLKLQVWSGTEVTAPQGATDR
310 320 330 340 350
370 380 390
pF1KB7 WLCLPECWSVELTHSFIHLFIHSFANIHPIPTTCQEL
>>CCDS5156.1 TAAR5 gene_id:9038|Hs108|chr6 (337 aa)
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Smith-Waterman score: 538; 35.3% identity (66.4% similar) in 283 aa overlap (18-296:34-313)
10 20 30 40
pF1KB7 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAVGLNR
...: .. :. .:: : ::: : .::. .
CCDS51 VFIQGAEEHPAAFCYQVNGSCPRTVHTLGIQLVIYLACAAGMLIIVLGNVFVAFAVSYFK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 RLRNLTNCFIVSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASIL
:.. :: ...:::..:..:::::::.:.: .. : :: .: ..: ::...: .::.
CCDS51 ALHTPTNFLLLSLALADMFLGLLVLPLSTIRSVESCWFFGDFLCRLHTYLDTLFCLTSIF
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110 120 130 140 150 160
pF1KB7 NLFMISLDRYCAVMDPLRYPVLVTPVRVAISLVLI-WVISITLS--FLSIHLGWNSRNET
.: .::.::.::. ::: :: : ::::. .: : . . . :: . . ..
CCDS51 HLCFISIDRHCAICDPLLYPSKFT-VRVALRYILAGWGVPAAYTSLFLYTDVVETRLSQW
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 SKGNHTTSKCKVQVNEVYGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHIS-SWK
. ...:.. .:. .: .. . :..: ::: : .:: :: ::..:. .: :
CCDS51 LEEMPCVGSCQLLLNKFWGWLN-FPLFFVPCLIMISLYVKIFVVATRQAQQITTLSKSLA
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 AATIREHKATVTLAAVMGAFIICWFPYFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSAL
.:. .:.::. ::. ..: ...::.:. . .: . :.. : .:..: :::
CCDS51 GAAKHERKAAKTLGIAVGIYLLCWLPFTIDTMVDSLLHFITPPLVFD-IFIWFAYFNSAC
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 NPILYAALNRDFRTGYQQLFCCRLANRNSHKTSLRSNASQLSRTQSREPRQQEEKPLKLQ
:::.:. . ::
CCDS51 NPIIYVFSYQWFRKALKLTLSQKVFSPQTRTVDLYQE
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>>CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 (446 aa)
initn: 448 init1: 270 opt: 522 Z-score: 481.0 bits: 98.0 E(32554): 1.8e-20
Smith-Waterman score: 689; 35.1% identity (64.7% similar) in 368 aa overlap (18-342:23-387)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAVGLNRRLRN-LTN
.: . :..::: :. ::..:: :: :.::. .::
CCDS43 MRTLNTSAMDGTGLVVERDFSVRILTACFLSLLILSTLLGNTLVCAAVIRFRHLRSKVTN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 CFIVSLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISL
:..:::..:::...::.:..:. ... : ::. ::::....:.: ::::::: .::.
CCDS43 FFVISLAVSDLLVAVLVMPWKAVAEIAGFWPFGS-FCNIWVAFDIMCSTASILNLCVISV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRYCAVMDPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGWNSRNETSK--GNHTT-
::: :. .:.:: .:: . : . . :..:. .::. ..:.:.. . :: :: :.
CCDS43 DRYWAISSPFRYERKMTPKAAFILISVAWTLSVLISFIPVQLSWHKAKPTSPSDGNATSL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KB7 ----SKCKVQVNEVYGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHI--------
..: .....:.. .....::.:. :: .:: ::...:. : .:: .
CCDS43 AETIDNCDSSLSRTYAISSSVISFYIPVAIMIVTYTRIYRIAQKQIRRIAALERAAVHAK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250
pF1KB7 ------------------SSWKAATIREHKATVTLAAVMGAFIICWFPYFT-----AFVY
::.: . :: :. ::...::.:. ::.:.: :
CCDS43 NCQTTTGNGKPVECSQPESSFKMSFKRETKVLKTLSVIMGVFVCCWLPFFILNCILPFCG
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 RGLRGDDAINEVLEAIVLWLGYANSALNPILYAALNRDFRTGYQQLFCC-RL--ANRNSH
: :. . .:.:.:::.::::.:: .: ::: ... :. : :: :. :.
CCDS43 SGETQPFCIDSNTFDVFVWFGWANSSLNPIIYA-FNADFRKAFSTLLGCYRLCPATNNAI
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 KT-SLRSNASQLSRTQSREPRQQEEKPLKLQVWSGTEVTAPQGATDRPWLCLPECWSVEL
.: :. .:.. . .. .::: . : .:
CCDS43 ETVSINNNGAAMFSSH-HEPRGSISKECNLVYLIPHAVGSSEDLKKEEAAGIARPLEKLS
360 370 380 390 400 410
>>CCDS34273.2 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 (360 aa)
initn: 726 init1: 245 opt: 520 Z-score: 480.3 bits: 97.6 E(32554): 2e-20
Smith-Waterman score: 699; 40.1% identity (69.6% similar) in 312 aa overlap (18-305:19-329)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAVGLNRRLRNL-TNCFIV
:... . :...::... ::..: .:: .:.::.. :: :::
CCDS34 MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAILGNLLVMVAVCWDRQLRKIKTNYFIV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SLAITDLLLGLLVLPFSAIYQLSCKWSFGKVFCNIYTSLDVMLCTASILNLFMISLDRYC
:::..:::...::.::.:: .. : .:.::: . :::::.: ::::..: ::::::
CCDS34 SLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTTASIFHLCCISLDRYY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 AVM-DPLRYPVLVTPVRVAISLVLIWVISITLSFLSIHLGWNSRN-----ETSKGNHTTS
:. .:: : .::.:.:. : ::: .::: : :::. . : : :....
CCDS34 AICCQPLVYRNKMTPLRIALMLGGCWVIPTFISFLPIMQGWNNIGIIDLIEKRKFNQNSN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KB7 K--CKVQVNEVYGLVDGLVTFYLPLLIMCITYYRIFKVARDQAKRINHISSWKAAT----
. : .::. :... ..:.::.:.:.: ..::::. .:...:..:. .. :..
CCDS34 STYCVFMVNKPYAITCSVVAFYIPFLLMVLAYYRIYVTAKEHAHQIQMLQRAGASSESRP
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KB7 ----------IR-EHKATVTLAAVMGAFIICWFPYFTAFVYRGLRGDDAINEVLEAIVLW
.: : ::. :: .:: : .:: :.:.. . . . ..: :. ::
CCDS34 QSADQHSTHRMRTETKAAKTLCIIMGCFCLCWAPFFVTNIVDPFIDYTVPGQVWTAF-LW
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 LGYANSALNPILYAALNRDFRTGYQQLFCCRLANRNSHKTSLRSNASQLSRTQSREPRQQ
::: ::.:::.::: ::..:: .. ..::
CCDS34 LGYINSGLNPFLYAFLNKSFRRAFLIILCCDDERYRRPSILGQTVPCSTTTINGSTHVLR
300 310 320 330 340 350
>>CCDS34271.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 (378 aa)
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>>CCDS4291.1 HTR4 gene_id:3360|Hs108|chr5 (388 aa)
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CCDS42 MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAILGNLLVMVAVCWDRQLRKIKTNYFIV
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pF1KB7 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAVGLNRRLRNL-TNCFIV
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CCDS75 MDKLDANVSSEEGFGSVEKVVLLTFLSTVILMAILGNLLVMVAVCWDRQLRKIKTNYFIV
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CCDS75 SLAFADLLVSVLVMPFGAIELVQDIWIYGEVFCLVRTSLDVLLTTASIFHLCCISLDRYY
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CCDS75 QSADQHSTHRMRTETKAAKTLCIIMGCFCLCWAPFFVTNIVDPFIDYTVPGQVWTAF-LW
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pF1KB7 MAPNGTASSFCLDSTACKITITVVLAVLILITVAGNVVVCLAV
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CCDS34 ELSHFKRTQTKKEKFNCSEYGNRSCPENERSLGVRVAMYSFMAGSIFITIFGNLAMIISI
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CCDS34 SYFKQLHTPTNFLILSMAITDFLLGFTIMPYSMIRSVENCWYFGLTFCKIYYSFDLMLSI
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CCDS34 TSIFHLCSVAIDRFYAICYPLLYSTKITIPV-IKRLLLLCWSVPGAFAFGVVFS--EAYA
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CCDS34 DGIEGYDILVACSSSCPVMFNKLWGTTLFMAGFFTPGSMMVGIYGKIFAVSRKHAHAINN
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CCDS34 LRENQNNQVKKDKKAAKTLGIVIGVFLLCWFPCFFTILLDPFLNFSTPV--VLFDALTWF
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CCDS34 GYFNSTCNPLIYGFFYPWFRRALKYILLGKIFSSCFHNTILCMQKESE
310 320 330 340 350
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]