Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6670
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6670, 454 aa
1>>>pF1KB6670 454 - 454 aa - 454 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6222+/-0.00144; mu= -3.6331+/- 0.082
mean_var=282.1657+/-64.543, 0's: 0 Z-trim(106.8): 666 B-trim: 111 in 1/52
Lambda= 0.076352
statistics sampled from 8452 (9223) to 8452 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.627), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 2.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12116.1 DAPK3 gene_id:1613|Hs108|chr19 ( 454) 2919 335.8 5.7e-92
CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430) 1543 184.6 5.6e-46
CCDS10188.1 DAPK2 gene_id:23604|Hs108|chr15 ( 370) 1486 177.8 1.6e-44
CCDS2315.1 STK17B gene_id:9262|Hs108|chr2 ( 372) 860 108.9 9.2e-24
CCDS5470.1 STK17A gene_id:9263|Hs108|chr7 ( 414) 856 108.5 1.4e-23
CCDS43141.1 MYLK gene_id:4638|Hs108|chr3 (1845) 845 107.8 9.4e-23
CCDS46896.1 MYLK gene_id:4638|Hs108|chr3 (1914) 845 107.9 9.7e-23
CCDS76861.1 MYLK3 gene_id:91807|Hs108|chr16 ( 478) 809 103.4 5.4e-22
CCDS10723.2 MYLK3 gene_id:91807|Hs108|chr16 ( 819) 809 103.6 8.1e-22
CCDS34330.1 MYLK4 gene_id:340156|Hs108|chr6 ( 388) 790 101.2 2e-21
CCDS13191.1 MYLK2 gene_id:85366|Hs108|chr20 ( 596) 756 97.6 3.7e-20
CCDS3028.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1289) 762 98.6 4.1e-20
CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 360) 729 94.4 2e-19
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 426) 729 94.5 2.3e-19
CCDS3883.1 TRIO gene_id:7204|Hs108|chr5 (3097) 748 97.4 2.3e-19
CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs108|chr5 ( 473) 718 93.3 5.6e-19
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 710 92.3 8.4e-19
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 710 92.4 8.9e-19
CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3 ( 648) 699 91.4 3e-18
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 688 89.9 4.6e-18
CCDS43263.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 676 88.7 1.4e-17
CCDS3704.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 676 88.7 1.4e-17
CCDS54797.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 489) 676 88.7 1.4e-17
CCDS47127.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 492) 676 88.7 1.4e-17
CCDS82950.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 498) 676 88.7 1.4e-17
CCDS3703.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 499) 676 88.7 1.4e-17
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 674 88.4 1.5e-17
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs108|chr1 ( 476) 675 88.6 1.5e-17
CCDS82948.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 512) 672 88.3 2e-17
CCDS82949.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 533) 672 88.3 2.1e-17
CCDS43386.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 478) 670 88.0 2.2e-17
CCDS43387.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 489) 670 88.1 2.3e-17
CCDS7337.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 527) 665 87.5 3.5e-17
CCDS73153.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 539) 665 87.5 3.5e-17
CCDS7336.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 495) 664 87.4 3.6e-17
CCDS7338.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 556) 664 87.4 3.9e-17
CCDS54421.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (26926) 701 93.0 4e-17
CCDS54423.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (27051) 701 93.0 4e-17
CCDS54422.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (27118) 701 93.0 4e-17
CCDS54424.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (33423) 701 93.1 4.7e-17
CCDS74610.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (34350) 701 93.1 4.8e-17
CCDS59435.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (35991) 701 93.1 5e-17
CCDS48094.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 897) 655 86.6 1.1e-16
CCDS73561.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 422) 646 85.4 1.3e-16
CCDS55895.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 433) 646 85.4 1.3e-16
CCDS9354.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 729) 646 85.6 1.9e-16
CCDS81762.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 740) 646 85.6 1.9e-16
CCDS48095.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 898) 646 85.6 2.2e-16
CCDS14257.1 CASK gene_id:8573|Hs108|chrX ( 921) 646 85.7 2.2e-16
CCDS42824.1 SPEG gene_id:10290|Hs108|chr2 (3267) 653 86.9 3.3e-16
>>CCDS12116.1 DAPK3 gene_id:1613|Hs108|chr19 (454 aa)
initn: 2919 init1: 2919 opt: 2919 Z-score: 1764.7 bits: 335.8 E(32554): 5.7e-92
Smith-Waterman score: 2919; 100.0% identity (100.0% similar) in 454 aa overlap (1-454:1-454)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSTFRQEDVEDHYEMGEELGSGQFAIVRKCRQKGTGKEYAAKFIKKRRLSSSRRGVSREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MSTFRQEDVEDHYEMGEELGSGQFAIVRKCRQKGTGKEYAAKFIKKRRLSSSRRGVSREE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IEREVNILREIRHPNIITLHDIFENKTDVVLILELVSGGELFDFLAEKESLTEDEATQFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IEREVNILREIRHPNIITLHDIFENKTDVVLILELVSGGELFDFLAEKESLTEDEATQFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 KQILDGVHYLHSKRIAHFDLKPENIMLLDKNVPNPRIKLIDFGIAHKIEAGNEFKNIFGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KQILDGVHYLHSKRIAHFDLKPENIMLLDKNVPNPRIKLIDFGIAHKIEAGNEFKNIFGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGETKQETLTNISAVNYDFDEEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGETKQETLTNISAVNYDFDEEY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FSNTSELAKDFIRRLLVKDPKRRMTIAQSLEHSWIKAIRRRNVRGEDSGRKPERRRLKTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FSNTSELAKDFIRRLLVKDPKRRMTIAQSLEHSWIKAIRRRNVRGEDSGRKPERRRLKTT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 RLKEYTIKSHSSLPPNNSYADFERFSKVLEEAAAAEEGLRELQRSRRLCHEDVEALAAIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RLKEYTIKSHSSLPPNNSYADFERFSKVLEEAAAAEEGLRELQRSRRLCHEDVEALAAIY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 EEKEAWYREESDSLGQDLRRLRQELLKTEALKRQAQEEAKGALLGTSGLKRRFSRLENRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EEKEAWYREESDSLGQDLRRLRQELLKTEALKRQAQEEAKGALLGTSGLKRRFSRLENRY
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB6 EALAKQVASEMRFVQDLVRALEQEKLQGVECGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EALAKQVASEMRFVQDLVRALEQEKLQGVECGLR
430 440 450
>>CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430 aa)
initn: 1606 init1: 1543 opt: 1543 Z-score: 939.0 bits: 184.6 E(32554): 5.6e-46
Smith-Waterman score: 1543; 82.2% identity (97.1% similar) in 276 aa overlap (1-276:1-276)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSTFRQEDVEDHYEMGEELGSGQFAIVRKCRQKGTGKEYAAKFIKKRRLSSSRRGVSREE
:..::::.:.:.:. ::::::::::.:.:::.:.:: .:::::::::: .:::::::::.
CCDS43 MTVFRQENVDDYYDTGEELGSGQFAVVKKCREKSTGLQYAAKFIKKRRTKSSRRGVSRED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 IEREVNILREIRHPNIITLHDIFENKTDVVLILELVSGGELFDFLAEKESLTEDEATQFL
:::::.::.::.:::.::::...::::::.::::::.::::::::::::::::.:::.::
CCDS43 IEREVSILKEIQHPNVITLHEVYENKTDVILILELVAGGELFDFLAEKESLTEEEATEFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 KQILDGVHYLHSKRIAHFDLKPENIMLLDKNVPNPRIKLIDFGIAHKIEAGNEFKNIFGT
::::.::.:::: .:::::::::::::::.:::.::::.::::.::::. ::::::::::
CCDS43 KQILNGVYYLHSLQIAHFDLKPENIMLLDRNVPKPRIKIIDFGLAHKIDFGNEFKNIFGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGETKQETLTNISAVNYDFDEEY
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:.:::::.:..::
CCDS43 PEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGDTKQETLANVSAVNYEFEDEY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 FSNTSELAKDFIRRLLVKDPKRRMTIAQSLEHSWIKAIRRRNVRGEDSGRKPERRRLKTT
::::: :::::::::::::::.:::: .::.: :::
CCDS43 FSNTSALAKDFIRRLLVKDPKKRMTIQDSLQHPWIKPKDTQQALSRKASAVNMEKFKKFA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 RLKEYTIKSHSSLPPNNSYADFERFSKVLEEAAAAEEGLRELQRSRRLCHEDVEALAAIY
CCDS43 ARKKWKQSVRLISLCQRLSRSFLSRSNMSVARSDDTLDEEDSFVMKAIIHAINDDNVPGL
310 320 330 340 350 360
>>CCDS10188.1 DAPK2 gene_id:23604|Hs108|chr15 (370 aa)
initn: 1473 init1: 1449 opt: 1486 Z-score: 912.8 bits: 177.8 E(32554): 1.6e-44
Smith-Waterman score: 1486; 73.7% identity (89.6% similar) in 308 aa overlap (1-300:11-318)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSTFRQEDVEDHYEMGEELGSGQFAIVRKCRQKGTGKEYAAKFIKKRRLS
: :.:. ::: :..::::::::::::.:::.:.:: ::::::::::.
CCDS10 MFQASMRSPNMEPFKQQKVEDFYDIGEELGSGQFAIVKKCREKSTGLEYAAKFIKKRQSR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 SSRRGVSREEIEREVNILREIRHPNIITLHDIFENKTDVVLILELVSGGELFDFLAEKES
.::::::::::::::.:::.. : :.:::::..::.::::::::::::::::::::.:::
CCDS10 ASRRGVSREEIEREVSILRQVLHHNVITLHDVYENRTDVVLILELVSGGELFDFLAQKES
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 LTEDEATQFLKQILDGVHYLHSKRIAHFDLKPENIMLLDKNVPNPRIKLIDFGIAHKIEA
:.:.:::.:.:::::::.:::.:.:::::::::::::::::.: :.:::::::.::.::
CCDS10 LSEEEATSFIKQILDGVNYLHTKKIAHFDLKPENIMLLDKNIPIPHIKLIDFGLAHEIED
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGETKQETLTNIS
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.::.
CCDS10 GVEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGDTKQETLANIT
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280
pF1KB6 AVNYDFDEEYFSNTSELAKDFIRRLLVKDPKRRMTIAQSLEHSWIKAI-------RRRNV
::.::::::.::.::::::::::.::::. ..:.:: ..:.: :: . ::..:
CCDS10 AVSYDFDEEFFSQTSELAKDFIRKLLVKETRKRLTIQEALRHPWITPVDNQQAMVRRESV
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 RGEDSGRKPE-RRRLKTTRLKEYTIKSHSSLPPNNSYADFERFSKVLEEAAAAEEGLREL
. .. :: ::: : .
CCDS10 VNLENFRKQYVRRRWKLSFSIVSLCNHLTRSLMKKVHLRPDEDLRNCESDTEEDIARRKA
310 320 330 340 350 360
>>CCDS2315.1 STK17B gene_id:9262|Hs108|chr2 (372 aa)
initn: 829 init1: 461 opt: 860 Z-score: 540.1 bits: 108.9 E(32554): 9.2e-24
Smith-Waterman score: 860; 42.2% identity (74.2% similar) in 341 aa overlap (5-340:24-355)
10 20 30 40
pF1KB6 MSTFRQEDVEDHYEM-GEELGSGQFAIVRKCRQKGTGKEYA
..:. .. : . ..::: :.::.::.: .:.::.:::
CCDS23 MSRRRFDCRSISGLLTTTPQIPIKMENFNNFYILTSKELGRGKFAVVRQCISKSTGQEYA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB6 AKFIKKRRLSSSRRGVS-REEIEREVNILREIRH-PNIITLHDIFENKTDVVLILELVSG
:::.:::: :: . : :: .:. .:. . : .:.::...:: ....:::: ..:
CCDS23 AKFLKKRR-----RGQDCRAEILHEIAVLELAKSCPRVINLHEVYENTSEIILILEYAAG
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 GELFDF-LAE-KESLTEDEATQFLKQILDGVHYLHSKRIAHFDLKPENIMLLDKNVPNPR
::.:.. : : : ..:... ...::::.::.:::.. :.:.::::.:: ::.. :
CCDS23 GEIFSLCLPELAEMVSENDVIRLIKQILEGVYYLHQNNIVHLDLKPQNI-LLSSIYPLGD
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 IKLIDFGIAHKIEAGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASP
::..:::...:: . :...:.::::..::::.::.:. .:::.::.:.:.::. .::
CCDS23 IKIVDFGMSRKIGHACELREIMGTPEYLAPEILNYDPITTATDMWNIGIIAYMLLTHTSP
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 FLGETKQETLTNISAVNYDFDEEYFSNTSELAKDFIRRLLVKDPKRRMTIAQSLEHSWIK
:.:: .::: ::: :: :..:: ::..:.:: :::. ::::.:..: : : :::..
CCDS23 FVGEDNQETYLNISQVNVDYSEETFSSVSQLATDFIQSLLVKNPEKRPTAEICLSHSWLQ
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 AIRRRNVRGEDSGRKPERRRLKTTRLKEYTIKSHSSLPPNNSYADFERFSKVLEEAAAAE
.:. . . . . ...: .: :.:: :.. .: : .. :... .
CCDS23 QWDFENLFHPEETSSSSQTQDHSVRSSE-DKTSKSSC--NGTCGDREDKENIPEDSSMVS
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 EGLRELQRSRRLCHEDVEALAAIYEEKEAWYREESDSLGQDLRRLRQELLKTEALKRQAQ
. .:
CCDS23 KRFRFDDSLPNPHELVSDLLC
360 370
>>CCDS5470.1 STK17A gene_id:9263|Hs108|chr7 (414 aa)
initn: 880 init1: 454 opt: 856 Z-score: 537.1 bits: 108.5 E(32554): 1.4e-23
Smith-Waterman score: 863; 42.2% identity (74.2% similar) in 322 aa overlap (5-321:51-357)
10 20 30
pF1KB6 MSTFRQEDVEDHYEM--GEELGSGQFAIVRKCRQ
: : .: : . :.::: :.::.:::: .
CCDS54 GRAGRGLSGPCRPPPPPQARGLLTEIRAVVRTEPFQDGYSLCPGRELGRGKFAVVRKCIK
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 KGTGKEYAAKFIKKRRLSSSRRGVSREEIEREVNILREIR-HPNIITLHDIFENKTDVVL
: .:::.::::..::: ... : :: .:. .:. . .: .:.::...:. ....:
CCDS54 KDSGKEFAAKFMRKRRKGQD----CRMEIIHEIAVLELAQDNPWVINLHEVYETASEMIL
90 100 110 120 130
100 110 120 130 140
pF1KB6 ILELVSGGELFD-FLAEKE-SLTEDEATQFLKQILDGVHYLHSKRIAHFDLKPENIMLLD
.:: ..:::.:: .:..: .. : .. ....:::.:::.::.. ..:.::::.::.: .
CCDS54 VLEYAAGGEIFDQCVADREEAFKEKDVQRLMRQILEGVHFLHTRDVVHLDLKPQNILLTS
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 KNVPNPRIKLIDFGIAHKIEAGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYI
.. : ::..:::... .. ..:...:.::::.:::::..:.:... .:::::::.::.
CCDS54 ES-PLGDIKIVDFGLSRILKNSEELREIMGTPEYVAPEILSYDPISMATDMWSIGVLTYV
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 LLSGASPFLGETKQETLTNISAVNYDFDEEYFSNTSELAKDFIRRLLVKDPKRRMTIAQS
.:.: :::::. ::::. ::: .: ...:: :. :: : :::: :::: :. : : .
CCDS54 MLTGISPFLGNDKQETFLNISQMNLSYSEEEFDVLSESAVDFIRTLLVKKPEDRATAEEC
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 LEHSWIKAIRRRNVRGEDSGRKPERRRLKTTRLKEYTIKSHSSLPPNNSYADFERFSKVL
:.: :. ..: ..: : :. . . ..:: .: :: .:
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CCDS34 EETATGLKLAAKIIKTRGMKD------KEEVKNEISVMNQLDHANLIQLYDAFESKNDIV
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CCDS34 LLSGLSPFLGDNDAETLNNILACRWDLEDEEFQDISEEAKEFISKLLIKEKSWRISASEA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]