Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6269
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6269, 694 aa
1>>>pF1KB6269 694 - 694 aa - 694 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7402+/-0.000939; mu= 9.6228+/- 0.057
mean_var=155.7536+/-31.606, 0's: 0 Z-trim(111.4): 20 B-trim: 542 in 1/50
Lambda= 0.102767
statistics sampled from 12330 (12345) to 12330 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.723), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16
Scan time: 3.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5396.1 NFE2L3 gene_id:9603|Hs108|chr7 ( 694) 4671 704.7 1.1e-202
CCDS11524.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 772) 846 137.6 6.4e-32
CCDS82150.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 742) 844 137.3 7.7e-32
CCDS82151.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 ( 761) 844 137.3 7.8e-32
CCDS46458.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 582) 604 101.7 3.3e-21
CCDS46457.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 589) 604 101.7 3.3e-21
CCDS42782.1 NFE2L2 gene_id:4780|Hs108|chr2 ( 605) 604 101.7 3.4e-21
CCDS8876.1 NFE2 gene_id:4778|Hs108|chr12 ( 373) 532 90.9 3.7e-18
>>CCDS5396.1 NFE2L3 gene_id:9603|Hs108|chr7 (694 aa)
initn: 4671 init1: 4671 opt: 4671 Z-score: 3752.0 bits: 704.7 E(32554): 1.1e-202
Smith-Waterman score: 4671; 100.0% identity (100.0% similar) in 694 aa overlap (1-694:1-694)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MKHLKRWWSAGGGLLHLTLLLSLAGLRVDLDLYLLLPPPTLLQDELLFLGGPASSAYALS
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CCDS53 MKHLKRWWSAGGGLLHLTLLLSLAGLRVDLDLYLLLPPPTLLQDELLFLGGPASSAYALS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PFSASGGWGRAGHLHPKGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVHSVAAGS
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CCDS53 PFSASGGWGRAGHLHPKGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVHSVAAGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 ADEAHGLLGAAAASSTGGAGASVDGGSQAVQGGGGDPRAARSGPLDAGEEEKAPAEPTAQ
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CCDS53 ADEAHGLLGAAAASSTGGAGASVDGGSQAVQGGGGDPRAARSGPLDAGEEEKAPAEPTAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VPDAGGCASEENGVLREKHEAVDHSSQHEENEERVSAQKENSLQQNDDDENKIAEKPDWE
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CCDS53 VPDAGGCASEENGVLREKHEAVDHSSQHEENEERVSAQKENSLQQNDDDENKIAEKPDWE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 AEKTTESRNERHLNGTDTSFSLEDLFQLLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAH
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CCDS53 AEKTTESRNERHLNGTDTSFSLEDLFQLLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 YHVNFSQAISQDVNLHEAILLCPNNTFRRDPTARTSQSQEPFLQLNSHTTNPEQTLPGTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YHVNFSQAISQDVNLHEAILLCPNNTFRRDPTARTSQSQEPFLQLNSHTTNPEQTLPGTN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 LTGFLSPVDNHMRNLTSQDLLYDLDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSG
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CCDS53 LTGFLSPVDNHMRNLTSQDLLYDLDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LSLDSSHNNTSVIKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPEPSKLCHLDQ
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CCDS53 LSLDSSHNNTSVIKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPEPSKLCHLDQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 SDSDFHGDLTFQHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLEDTDRNLSRDEQ
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CCDS53 SDSDFHGDLTFQHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLEDTDRNLSRDEQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 RAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRKRKL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 DIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLRDDQGRPVNPN
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CCDS53 DIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLRDDQGRPVNPN
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KB6 HYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 HYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK
670 680 690
>>CCDS11524.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 (772 aa)
initn: 1077 init1: 626 opt: 846 Z-score: 686.5 bits: 137.6 E(32554): 6.4e-32
Smith-Waterman score: 1107; 34.7% identity (60.2% similar) in 734 aa overlap (51-694:45-770)
30 40 50 60 70
pF1KB6 LSLAGLRVDLDLYLLLPPPTLLQDELLFLGGPASSAYALSPF----SASGGWGRAGHLHP
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CCDS11 FTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPPLREIILGP-SSAYTQTQFHNLRNTLDGYG----IHP
20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 KGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVHSVAAGSADEAHGLLGAAAASST
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CCDS11 KSIDLDNYFTAR-RLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSVSGSQPNSGLALESSS
70 80 90 100 110 120
140 150 160
pF1KB6 GGAGAS-VDGG---SQAVQGGGGDPR--AARSGP----------------------LDAG
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CCDS11 GLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDIDLIDILWRQDIDLGAG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KB6 EE------EKAPAEPTAQVPDAG--------GCASEENGVLREKHEAVDHSSQHEENEER
.: .. . .. :.: : . ..: . . . . .: .:..
CCDS11 REVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPSGEDQ
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KB6 VSAQKENSLQ---------QNDD---DENKIAEKPDWEAEKTTESRNERH--LNGTDTSF
.. . :. :. .: . : ..:.: :.: . . : :.::.. :
CCDS11 TALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGTESPF
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 SLEDLFQLLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAHYHVNFSQAISQDVNLHEAIL
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CCDS11 DLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASL
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370
pF1KB6 L-CPNNTFRRDPTART--SQSQEPFLQLN-SHTTNPEQTLPGTNLTG-FLSPVDNHMRNL
: .. . .: ... :. .: : :..:. ..:. .::::: :. : : :
CCDS11 GGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTAND
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 TSQDLLYD-----LDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSSHNNT
:. : : :: ..:::.::.:: :..:.:...::: .: ::::::::::::. .
CCDS11 TAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPS
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470
pF1KB6 SV-------------------IKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPE
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CCDS11 SLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVG-YQPE
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 PSKLCHLDQSDSDFHGDLTF-QHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLED
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CCDS11 YSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGS-KEKQADF
550 560 570 580 590 600
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 TDRNLSRDEQRAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKV
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CCDS11 LDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKM
610 620 630 640 650 660
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 AAQNCRKRKLDIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLR
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CCDS11 AAQNCRKRKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLR
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690
pF1KB6 DDQGRPVNPNHYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK
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CCDS11 DENGRPYSPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
730 740 750 760 770
>>CCDS82150.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 (742 aa)
initn: 1077 init1: 626 opt: 844 Z-score: 685.1 bits: 137.3 E(32554): 7.7e-32
Smith-Waterman score: 1215; 36.8% identity (61.7% similar) in 741 aa overlap (17-694:15-740)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MKHLKRWWSAGGGLLHLTLLLSLAGLRVDLDLYLL--LPPPTLLQDELLFLGGPASSAYA
.:.:::: :.:::.: :: ::: :.. .: :: ::::.
CCDS82 MLSLKKYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPP---LREIIL---GP-SSAYT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LSPF----SASGGWGRAGHLHPKGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVH
. : .. :.: .:::. .:: . .:: .:::: :: : :.:::::
CCDS82 QTQFHNLRNTLDGYG----IHPKSIDLDNYFTAR-RLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVH
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160
pF1KB6 SVAAGSADEAHGLLGAAAASSTGGAGAS-VDGG---SQAVQGGGGDPR--AARSGPLDAG
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CCDS82 RDPEGSVSGSQPNSGLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPV-SG
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KB6 EEEKAPAEPTA----QVPDAGGCASEENGVLREKHEAV-----DHSSQHEENEERVSAQK
. : . : : :. . :.:.. : : . : : . :
CCDS82 DLTKEDIDLIDILWRQDIDLGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALA
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260
pF1KB6 ENSLQQNDDDEN----------KIAEKPDWEAEKTTESRNERH--LNGTDTSFSLEDLFQ
.: : ... :. .:.: :.: . . : :.::.. :.::. .:
CCDS82 RNLLVDGETGESFPAQFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGTESPFDLEQQWQ
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 LLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAHYHVNFSQAISQDVNLHEAILL-CPNNT
: : : . .. . . : : :..: . . :.:.:.::.: : : ..
CCDS82 DLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLHQASLGGCSQDF
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 FRRDPTART--SQSQEPFLQLN-SHTTNPEQTLPGTNLTG-FLSPVDNHMRNLTSQDLLY
. .: ... :. .: : :..:. ..:. .::::: :. : : : :. :
CCDS82 LLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNGTANDTAGPELP
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KB6 D-----LDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSSHNNTSV-----
: :: ..:::.::.:: :..:.:...::: .: ::::::::::::. .:.
CCDS82 DPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSSHSPSSLSSSEG
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470
pF1KB6 --------------IKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGGYYPEPSKLCHL
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CCDS82 SSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVG-YQPEYSKFCRM
470 480 490 500 510 520
480 490 500 510 520 530
pF1KB6 DQSDSDFHGDLTF-QHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSRYLEDTDRNLSR
. .: . : . .:: :::::.. :.: .:.. : : :. . . . . :...::
CCDS82 SYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGS-KEKQADFLDKQMSR
530 540 550 560 570 580
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 DEQRAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRGKNKVAAQNCRK
::.::.:..:::. :.:...::. :: .::.: :.. :.:::::::::::::.:::::::
CCDS82 DEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRGKNKMAAQNCRK
590 600 610 620 630 640
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 RKLDIILNLEDDVCNLQAKKETLKREQAQCNKAINIMKQKLHDLYHDIFSRLRDDQGRPV
:::: ::::: :: .:: : : ::... ... ::::...::...:.::::..:::
CCDS82 RKLDTILNLERDVEDLQRDKARLLREKVEFLRSLRQMKQKVQSLYQEVFGRLRDENGRPY
650 660 670 680 690 700
660 670 680 690
pF1KB6 NPNHYALQCTHDGSILIVPKELVASGHKKETQKGKRK
.:..:::: . :::.:..:. .. . ... .: : .
CCDS82 SPSQYALQYAGDGSVLLIPRTMADQQARRQERKPKDRRK
710 720 730 740
>>CCDS82151.1 NFE2L1 gene_id:4779|Hs108|chr17 (761 aa)
initn: 1073 init1: 626 opt: 844 Z-score: 685.0 bits: 137.3 E(32554): 7.8e-32
Smith-Waterman score: 1133; 35.2% identity (61.0% similar) in 738 aa overlap (36-694:36-759)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 RWWSAGGGLLHLTLLLSLAGLRVDLDLYLLLPPPTLLQDELLFLGGPASSAYALSPF---
::: :.. .: :: ::::. . :
CCDS82 KYLTEGLLQFTILLSLIGVRVDVDTYLTSQLPP---LREIIL---GP-SSAYTQTQFHNL
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 -SASGGWGRAGHLHPKGRELDPAAPPEGQLLREVRALGVPFVPRTSVDAWLVHSVAAGSA
.. :.: .:::. .:: . .:: .:::: :: : :.::::: ::.
CCDS82 RNTLDGYG----IHPKSIDLDNYFTAR-RLLSQVRALDRFQVPTTEVNAWLVHRDPEGSV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KB6 DEAHGLLGAAAASSTGGAGAS-VDGG---SQAVQGGGGDPR--AARSGP-----------
. .. : : ::.: .. :.: :.. :: : : . .: . :
CCDS82 SGSQPNSGLALESSSGLQDVTGPDNGVRESETEQGFGEDLEDLGAVAPPVSGDLTKEDID
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB6 LDAGEE------EKAPAEPTAQVPDAG--------GCASEENGVLREKHEAVDHSSQHEE
: ::.: .. . .. :.: : . ..: . . . . .:
CCDS82 LGAGREVFDYSHRQKEQDVEKELRDGGEQDTWAGEGAEALARNLLVDGETGESFPAQVPS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250
pF1KB6 NEERVSAQKENSLQ---------QNDD---DENKIAEKPDWEAEKTTESRNERH--LNGT
.:.... . :. :. .: . : ..:.: :.: . . : :.::
CCDS82 GEDQTALSLEECLRLLEATCPFGENAEFPADISSITEAVPSESEPPALQNNLLSPLLTGT
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 DTSFSLEDLFQLLSSQPENSLEGISLGDIPLPGSISDGMNSSAHYHVNFSQAISQDVNLH
.. :.::. .: : : : . .. . . : : :..: . . :.:.:.::
CCDS82 ESPFDLEQQWQDLMSIMEMQAMEVNTSASEILYSAPPGDPLSTNYSLAPNTPINQNVSLH
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 EAILL-CPNNTFRRDPTART--SQSQEPFLQLN-SHTTNPEQTLPGTNLTG-FLSPVDNH
.: : : .. . .: ... :. .: : :..:. ..:. .::::: :. : :
CCDS82 QASLGGCSQDFLLFSPEVESLPVASSSTLLPLAPSNSTSLNSTFGSTNLTGLFFPPQLNG
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420
pF1KB6 MRNLTSQDLLYD-----LDINIFDEINLMSLATEDNFDPIDVSQLFDEPDSDSGLSLDSS
: :. : : :: ..:::.::.:: :..:.:...::: .: :::::::::::
CCDS82 TANDTAGPELPDPLGGLLDEAMLDEISLMDLAIEEGFNPVQASQLEEEFDSDSGLSLDSS
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460
pF1KB6 HNNTSV-------------------IKSNSSHSVCDEGAIGYCTDHESSSHHDLEGAVGG
:. .:. .:..: : .:::.:: .: :. . .. :::::
CCDS82 HSPSSLSSSEGSSSSSSSSSSSSSSASSSASSSFSEEGAVGYSSDSETLDLEEAEGAVG-
480 490 500 510 520 530
470 480 490 500 510 520
pF1KB6 YYPEPSKLCHLDQSDSDFHGDLTF-QHVFHNHTYHLQPTAPESTSEPFPWPGKSQKIRSR
: :: ::.:... .: . : . .:: :::::.. :.: .:.. : : :. . . .
CCDS82 YQPEYSKFCRMSYQDPAQLSCLPYLEHVGHNHTYNMAPSALDSADLPPPSALKKGS-KEK
540 550 560 570 580 590
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 YLEDTDRNLSRDEQRAKALHIPFSVDEIVGMPVDSFNSMLSRYYLTDLQVSLIRDIRRRG
. :...::::.::.:..:::. :.:...::. :: .::.: :.. :.::::::::::
CCDS82 QADFLDKQMSRDEHRARAMKIPFTNDKIINLPVEEFNELLSKYQLSEAQLSLIRDIRRRG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]