Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6244
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6244, 680 aa
1>>>pF1KB6244 680 - 680 aa - 680 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9383+/-0.000964; mu= 3.6141+/- 0.058
mean_var=185.9554+/-36.788, 0's: 0 Z-trim(111.7): 38 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.094052
statistics sampled from 12585 (12621) to 12585 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.718), E-opt: 0.2 (0.388), width: 16
Scan time: 3.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3293.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 680) 4662 645.2 9e-185
CCDS82887.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 676) 4608 637.9 1.4e-182
CCDS46978.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 586) 3894 541.0 1.9e-153
CCDS46976.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 555) 3787 526.4 4.2e-149
CCDS46977.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 487) 3079 430.3 3.1e-120
CCDS46979.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 461) 3019 422.2 8.4e-118
CCDS46980.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 ( 393) 2311 326.1 6.1e-89
CCDS49.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 636) 2297 324.3 3.4e-88
CCDS44049.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 587) 2275 321.3 2.5e-87
CCDS55569.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 565) 2264 319.8 6.8e-87
CCDS55566.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 499) 1865 265.6 1.2e-70
CCDS44050.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 450) 1843 262.6 8.9e-70
CCDS55567.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 555) 1661 238.0 2.9e-62
CCDS59965.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 403) 1642 235.3 1.3e-61
CCDS55568.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 540) 1640 235.1 2e-61
CCDS44051.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 ( 426) 1632 234.0 3.5e-61
CCDS11118.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 393) 932 139.0 1.3e-32
CCDS73969.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 354) 927 138.3 1.9e-32
CCDS45606.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 341) 861 129.3 9.1e-30
CCDS45605.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 346) 861 129.3 9.2e-30
CCDS73971.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 302) 856 128.6 1.3e-29
CCDS73970.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 307) 856 128.6 1.3e-29
CCDS73966.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 261) 802 121.2 1.9e-27
CCDS73968.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 209) 731 111.5 1.2e-24
CCDS73967.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 214) 731 111.5 1.3e-24
CCDS73963.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 234) 682 104.9 1.4e-22
CCDS73965.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 182) 611 95.2 8.7e-20
CCDS73964.1 TP53 gene_id:7157|Hs108|chr17 ( 187) 611 95.2 8.9e-20
>>CCDS3293.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 (680 aa)
initn: 4662 init1: 4662 opt: 4662 Z-score: 3430.7 bits: 645.2 E(32554): 9e-185
Smith-Waterman score: 4662; 100.0% identity (100.0% similar) in 680 aa overlap (1-680:1-680)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNFETSRCATLQYCPDPYIQRFVETPAHFSWKESYYRSTMSQSTQTNEFLSPEVFQHIWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MNFETSRCATLQYCPDPYIQRFVETPAHFSWKESYYRSTMSQSTQTNEFLSPEVFQHIWD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 FLEQPICSVQPIDLNFVDEPSEDGATNKIEISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLEQPICSVQPIDLNFVDEPSEDGATNKIEISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 FQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 KQQVSDSTKNGDGTKRPFRQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KQQVSDSTKNGDGTKRPFRQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKES
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LINPQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LINPQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PPYPTDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPYPTDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 ILDHRQLHEFSSPSHLLRTPSSASTVSVGSSETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPRDEWND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ILDHRQLHEFSSPSHLLRTPSSASTVSVGSSETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPRDEWND
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KB6 FNFDMDARRNKQQRIKEEGE
::::::::::::::::::::
CCDS32 FNFDMDARRNKQQRIKEEGE
670 680
>>CCDS82887.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 (676 aa)
initn: 2600 init1: 2567 opt: 4608 Z-score: 3391.2 bits: 637.9 E(32554): 1.4e-182
Smith-Waterman score: 4608; 99.3% identity (99.4% similar) in 680 aa overlap (1-680:1-676)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNFETSRCATLQYCPDPYIQRFVETPAHFSWKESYYRSTMSQSTQTNEFLSPEVFQHIWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MNFETSRCATLQYCPDPYIQRFVETPAHFSWKESYYRSTMSQSTQTNEFLSPEVFQHIWD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 FLEQPICSVQPIDLNFVDEPSEDGATNKIEISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FLEQPICSVQPIDLNFVDEPSEDGATNKIEISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 FQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 KQQVSDSTKNGDGTKRPFRQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKES
::::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KQQVSDSTKNGDA----FRQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKES
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQ
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LINPQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LINPQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPP
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PPYPTDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PPYPTDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKG
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 ILDHRQLHEFSSPSHLLRTPSSASTVSVGSSETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPRDEWND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ILDHRQLHEFSSPSHLLRTPSSASTVSVGSSETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPRDEWND
600 610 620 630 640 650
670 680
pF1KB6 FNFDMDARRNKQQRIKEEGE
::::::::::::::::::::
CCDS82 FNFDMDARRNKQQRIKEEGE
660 670
>>CCDS46978.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 (586 aa)
initn: 3894 init1: 3894 opt: 3894 Z-score: 2868.5 bits: 541.0 E(32554): 1.9e-153
Smith-Waterman score: 3894; 100.0% identity (100.0% similar) in 572 aa overlap (109-680:15-586)
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 EPSEDGATNKIEISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDH
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 AQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTEL
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 KKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQI
110 120 130 140 150 160
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 APPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNR
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 RPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPF
230 240 250 260 270 280
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 RQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQ
290 300 310 320 330 340
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 QQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDG
350 360 370 380 390 400
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 MGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGC
410 420 430 440 450 460
560 570 580 590 600 610
pF1KB6 SSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLR
470 480 490 500 510 520
620 630 640 650 660 670
pF1KB6 TPSSASTVSVGSSETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPRDEWNDFNFDMDARRNKQQRIKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TPSSASTVSVGSSETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPRDEWNDFNFDMDARRNKQQRIKEE
530 540 550 560 570 580
680
pF1KB6 GE
::
CCDS46 GE
>>CCDS46976.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 (555 aa)
initn: 3787 init1: 3787 opt: 3787 Z-score: 2790.4 bits: 526.4 E(32554): 4.2e-149
Smith-Waterman score: 3787; 100.0% identity (100.0% similar) in 550 aa overlap (1-550:1-550)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MNFETSRCATLQYCPDPYIQRFVETPAHFSWKESYYRSTMSQSTQTNEFLSPEVFQHIWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MNFETSRCATLQYCPDPYIQRFVETPAHFSWKESYYRSTMSQSTQTNEFLSPEVFQHIWD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 FLEQPICSVQPIDLNFVDEPSEDGATNKIEISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FLEQPICSVQPIDLNFVDEPSEDGATNKIEISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 DQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 FQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 TVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 KQQVSDSTKNGDGTKRPFRQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KQQVSDSTKNGDGTKRPFRQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKES
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 LELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 LINPQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LINPQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PPYPTDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKG
::::::::::
CCDS46 PPYPTDCSIVRIWQV
550
>>CCDS46977.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 (487 aa)
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MNFETSRCATLQYCPDPYIQRFVETPAHFSWKESYYRSTMSQSTQTNEFLSPEVFQHIWD
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FLEQPICSVQPIDLNFVDEPSEDGATNKIEISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSM
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEV
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFT
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KQQVSDSTKNGDGTKRPFRQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKES
370 380 390 400 410 420
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:::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS46 LELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKHLLSACFRNELVEPRRETPKQSDVFFRHSKP
430 440 450 460 470 480
>>CCDS46979.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 (461 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTEL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQI
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260 270 280 290 300 310
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNR
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320 330 340 350 360 370
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQ
290 300 310 320 330 340
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVRIWQV
410 420 430 440 450 460
560 570 580 590 600 610
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>>CCDS46980.1 TP63 gene_id:8626|Hs108|chr3 (393 aa)
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::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLYLENNAQTQFSEPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDH
10 20 30 40
140 150 160 170 180 190
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTEL
50 60 70 80 90 100
200 210 220 230 240 250
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQI
110 120 130 140 150 160
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNR
170 180 190 200 210 220
320 330 340 350 360 370
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPF
230 240 250 260 270 280
380 390 400 410 420 430
pF1KB6 RQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RQNTHGIQMTSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQ
290 300 310 320 330 340
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 QQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDG
:::::::::::.
CCDS46 QQQQHQHLLQKHLLSACFRNELVEPRRETPKQSDVFFRHSKPPNRSVYP
350 360 370 380 390
>>CCDS49.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 (636 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB6 TLQYCPDPYIQRFVETPAHFSWKESYYRSTMSQSTQTNEFLSPE---VFQHIWDFLEQPI
:.::: : ::. .:.:.:.
CCDS49 MAQSTAT----SPDGGTTFEHLWS------
10 20
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 CSVQPIDLNFVDEPSEDGATNKI----EISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSMDQ
:..: : .. : :. . ..:.. . ::: .... .. . :. :: : ..:::
CCDS49 -SLEP-DSTYFDLPQSSRGNNEVVGGTDSSMDVFHLEG--MTTSVMAQF-NL-LSSTMDQ
30 40 50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 QIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQ
... ..:.:::. .:: :: . :::::::::::..::.:.::::::::::: :.:.::
CCDS49 -MSSRAASASPYTPEHAA-SVPTHSPYAQPSSTFDTMSPAPVIPSNTDYPGPHHFEVTFQ
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 QSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVK
::::::::::::: :::::::::::::::::: :::: :..::::::::::::::.:::
CCDS49 QSSTAKSATWTYSPLLKKLYCQIAKTCPIQIKVSTPPPPGTAIRAMPVYKKAEHVTDVVK
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 RCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTV
:::::::.:.::::: :: :::::::::. .:::.::.::::::.::::::::::::::.
CCDS49 RCPNHELGRDFNEGQSAPASHLIRVEGNNLSQYVDDPVTGRQSVVVPYEPPQVGTEFTTI
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 LYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQ
::::::::::::::::::::::.::: ::::::::: ::.::::::::::::::: :.:
CCDS49 LYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIITLEMRDGQVLGRRSFEGRICACPGRDRKADEDHYREQ
260 270 280 290 300 310
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pF1KB6 QVSD--STKNGDGTKRPFRQNTHGIQM--TSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIK
:. . :.::: ..:: :.:. .. ...:::: :.. :: :::::..:.:.:.:
CCDS49 QALNESSAKNGAASKRAFKQSPPAVPALGAGVKKRRHGDEDTYYLQVRGRENFEILMKLK
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 ESLELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNS-MNKLPS
::::::. .:: ...:::::: :::. . .: : ::: :.::... ::::::
CCDS49 ESLELMELVPQPLVDSYRQQQQ-----LLQRPSHLQ-PPSYGPVLSPMNKVHGGMNKLPS
380 390 400 410 420
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pF1KB6 VSQLIN--PQQRNALTPTTIPDGMGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTS
:.::.. : . .: ::. : : : . : .: :.:.. .: :: : :
CCDS49 VNQLVGQPPPHSSAATPNLGPVGPGM-LNNHGHAVPANGEMSSSHSAQ------SMVSGS
430 440 450 460 470
540 550 560 570 580 590
pF1KB6 HCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRH
:::::::: .: :.::::. ::: .:..:::.::: .::.... ...::..::::::.:
CCDS49 HCTPPPPYHADPSLVSFLTGLGCPNCIEYFTSQGLQSIYHLQNLTIEDLGALKIPEQYRM
480 490 500 510 520 530
600 610 620 630 640 650
pF1KB6 AIWKGILDHRQLHEFSSPSHLLRTPSSASTVSVGSS-ETRGERVIDAVRFTLRQTISFPP
.::.:. : .: :..:. ..:::. :.:.:.:.:.: : . .::..::.: .:.::..:
CCDS49 TIWRGLQDLKQGHDYSTAQQLLRS-SNAATISIGGSGELQRQRVMEAVHFRVRHTITIPN
540 550 560 570 580 590
660 670 680
pF1KB6 R-------DEWNDFNFDMDARRNKQQRIKEEGE
: ::: ::.::. . ..: ::::
CCDS49 RGGPGGGPDEWADFGFDLPDCKARKQPIKEEFTEAEIH
600 610 620 630
>>CCDS44049.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 (587 aa)
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Smith-Waterman score: 2275; 58.8% identity (80.1% similar) in 592 aa overlap (103-678:4-580)
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 DLNFVDEPSEDGATNKIEISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYT-NLGLLNSMDQQIQNGSSST
..:: : ...::.: .:... ..:.
CCDS44 MLYVGDPARHLATAQFNLLSSTMDQMSSRAASA
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 SPYNTDHAQNSVTAPSPYAQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSAT
:::. .:: :: . :::::::::::..::.:.::::::::::: :.:.:::::::::::
CCDS44 SPYTPEHAA-SVPTHSPYAQPSSTFDTMSPAPVIPSNTDYPGPHHFEVTFQQSSTAKSAT
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 WTYSTELKKLYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSR
:::: :::::::::::::::::: :::: :..::::::::::::::.::::::::::.:
CCDS44 WTYSPLLKKLYCQIAKTCPIQIKVSTPPPPGTAIRAMPVYKKAEHVTDVVKRCPNHELGR
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 EFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSS
.::::: :: :::::::::. .:::.::.::::::.::::::::::::::.:::::::::
CCDS44 DFNEGQSAPASHLIRVEGNNLSQYVDDPVTGRQSVVVPYEPPQVGTEFTTILYNFMCNSS
160 170 180 190 200 210
320 330 340 350 360
pF1KB6 CVGGMNRRPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSD--STK
:::::::::::::.::: ::::::::: ::.::::::::::::::: :.::. . :.:
CCDS44 CVGGMNRRPILIIITLEMRDGQVLGRRSFEGRICACPGRDRKADEDHYREQQALNESSAK
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 NGDGTKRPFRQNTHGIQM--TSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYL
:: ..:: :.:. .. ...:::: :.. :: :::::..:.:.:.:::::::. .
CCDS44 NGAASKRAFKQSPPAVPALGAGVKKRRHGDEDTYYLQVRGRENFEILMKLKESLELMELV
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 PQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNS-MNKLPSVSQLIN--P
:: ...:::::: :::. . .: :: :: :.::... :::::::.::.. :
CCDS44 PQPLVDSYRQQQQ-----LLQRPSHLQPPS-YGPVLSPMNKVHGGMNKLPSVNQLVGQPP
340 350 360 370 380
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pF1KB6 QQRNALTPTTIPDGMGANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYP
. .: ::. : : : . : .: :.:.. .: :: : :::::::::
CCDS44 PHSSAATPNLGPVGPGM-LNNHGHAVPANGEMSSSHSAQ------SMVSGSHCTPPPPYH
390 400 410 420 430
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 TDCSIVSFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKGILDH
.: :.::::. ::: .:..:::.::: .::.... ...::..::::::.: .::.:. :
CCDS44 ADPSLVSFLTGLGCPNCIEYFTSQGLQSIYHLQNLTIEDLGALKIPEQYRMTIWRGLQDL
440 450 460 470 480 490
610 620 630 640 650
pF1KB6 RQLHEFSSPSHLLRTPSSASTVSVGSS-ETRGERVIDAVRFTLRQTISFPPR-------D
.: :..:. ..:::. :.:.:.:.:.: : . .::..::.: .:.::..: : :
CCDS44 KQGHDYSTAQQLLRS-SNAATISIGGSGELQRQRVMEAVHFRVRHTITIPNRGGPGGGPD
500 510 520 530 540 550
660 670 680
pF1KB6 EWNDFNFDMDARRNKQQRIKEEGE
:: ::.::. . ..: ::::
CCDS44 EWADFGFDLPDCKARKQPIKEEFTEAEIH
560 570 580
>>CCDS55569.1 TP73 gene_id:7161|Hs108|chr1 (565 aa)
initn: 2094 init1: 1325 opt: 2264 Z-score: 1673.4 bits: 319.8 E(32554): 6.8e-87
Smith-Waterman score: 2264; 59.9% identity (80.7% similar) in 574 aa overlap (120-678:1-558)
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 EISMDCIRMQDSDLSDPMWPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPY
::: ... ..:.:::. .:: :: . :::
CCDS55 MDQ-MSSRAASASPYTPEHAA-SVPTHSPY
10 20
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 AQPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTELKKLYCQIAKTC
::::::::..::.:.::::::::::: :.:.::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS55 AQPSSTFDTMSPAPVIPSNTDYPGPHHFEVTFQQSSTAKSATWTYSPLLKKLYCQIAKTC
30 40 50 60 70 80
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 PIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELSREFNEGQIAPPSHLIRVEG
:::::: :::: :..::::::::::::::.::::::::::.:.::::: :: ::::::::
CCDS55 PIQIKVSTPPPPGTAIRAMPVYKKAEHVTDVVKRCPNHELGRDFNEGQSAPASHLIRVEG
90 100 110 120 130 140
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 NSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFTTVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLET
:. .:::.::.::::::.::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::
CCDS55 NNLSQYVDDPVTGRQSVVVPYEPPQVGTEFTTILYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIITLEM
150 160 170 180 190 200
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 RDGQVLGRRCFEARICACPGRDRKADEDSIRKQQVSD--STKNGDGTKRPFRQNTHGIQM
::::::::: ::.::::::::::::::: :.::. . :.::: ..:: :.:. ..
CCDS55 RDGQVLGRRSFEGRICACPGRDRKADEDHYREQQALNESSAKNGAASKRAFKQSPPAVPA
210 220 230 240 250 260
390 400 410 420 430 440
pF1KB6 --TSIKKRRSPDDELLYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQH
...:::: :.. :: :::::..:.:.:.:::::::. .:: ...::::::
CCDS55 LGAGVKKRRHGDEDTYYLQVRGRENFEILMKLKESLELMELVPQPLVDSYRQQQQ-----
270 280 290 300 310 320
450 460 470 480 490 500
pF1KB6 LLQKQTSIQSPSSYGNSSPPLNKMNS-MNKLPSVSQLIN--PQQRNALTPTTIPDGMGAN
:::. . .: :: :: :.::... :::::::.::.. : . .: ::. : : :
CCDS55 LLQRPSHLQPPS-YGPVLSPMNKVHGGMNKLPSVNQLVGQPPPHSSAATPNLGPVGPGM-
330 340 350 360 370 380
510 520 530 540 550 560
pF1KB6 IPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIVSFLARLGCSSCL
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CCDS55 LNNHGHAVPANGEMSSSHSAQ------SMVSGSHCTPPPPYHADPSLVSFLTGLGCPNCI
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