Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6231
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6231, 743 aa
1>>>pF1KB6231 743 - 743 aa - 743 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2234+/-0.000966; mu= 7.5274+/- 0.058
mean_var=166.0678+/-34.224, 0's: 0 Z-trim(110.5): 46 B-trim: 7 in 1/51
Lambda= 0.099525
statistics sampled from 11592 (11632) to 11592 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.702), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16
Scan time: 4.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9176.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 743) 4919 718.8 7.5e-207
CCDS9175.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 723) 3254 479.7 6.8e-135
CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17 ( 712) 1083 168.0 4.6e-41
CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 545) 551 91.5 3.7e-18
CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 546) 551 91.5 3.7e-18
CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7 ( 447) 529 88.3 2.8e-17
CCDS9173.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 518) 528 88.2 3.5e-17
CCDS9174.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 468) 526 87.9 3.9e-17
CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 372) 520 87.0 5.9e-17
CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 398) 520 87.0 6.2e-17
CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 495) 520 87.1 7.4e-17
CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11 ( 385) 516 86.4 9e-17
CCDS10670.1 TBX6 gene_id:6911|Hs108|chr16 ( 436) 510 85.6 1.8e-16
CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6 ( 607) 503 84.7 4.8e-16
CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 496) 474 80.5 7.2e-15
CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 602) 474 80.5 8.5e-15
CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX ( 520) 420 72.7 1.6e-12
CCDS59045.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 377) 402 70.0 7.5e-12
CCDS5290.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 435) 402 70.1 8.4e-12
CCDS33310.1 TBR1 gene_id:10716|Hs108|chr2 ( 682) 404 70.5 9.9e-12
CCDS11514.1 TBX21 gene_id:30009|Hs108|chr17 ( 535) 398 69.6 1.5e-11
CCDS55960.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (2856) 405 71.0 2.9e-11
CCDS55959.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (3065) 405 71.0 3.1e-11
>>CCDS9176.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 (743 aa)
initn: 4919 init1: 4919 opt: 4919 Z-score: 3827.1 bits: 718.8 E(32554): 7.5e-207
Smith-Waterman score: 4919; 100.0% identity (100.0% similar) in 743 aa overlap (1-743:1-743)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLSMRDPVIPGTSMAYHPFLPHRAPDFAMSAVLGHQPPFFPALTLPPNGAAALSLPGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 MSLSMRDPVIPGTSMAYHPFLPHRAPDFAMSAVLGHQPPFFPALTLPPNGAAALSLPGAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AKPIMDQLVGAAETGIPFSSLGPQAHLRPLKTMEPEEEVEDDPKVHLEAKELWDQFHKRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 AKPIMDQLVGAAETGIPFSSLGPQAHLRPLKTMEPEEEVEDDPKVHLEAKELWDQFHKRG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TEMVITKSGRRMFPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCRYKFHNSRWMVAGKADPEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 TEMVITKSGRRMFPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCRYKFHNSRWMVAGKADPEM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFHKLKLTNNISDKHGFTLAFPSDHATWQGNYSFGTQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFHKLKLTNNISDKHGFTLAFPSDHATWQGNYSFGTQT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 ILNSMHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVTAYQNDKITQLKIDNNPFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 ILNSMHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVTAYQNDKITQLKIDNNPFA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KGFRDTGNGRREKRKQLTLQSMRVFDERHKKENGTSDESSSEQAAFNCFAQASSPAASTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 KGFRDTGNGRREKRKQLTLQSMRVFDERHKKENGTSDESSSEQAAFNCFAQASSPAASTV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GTSNLKDLCPSEGESDAEAESKEEHGPEACDAAKISTTTSEEPCRDKGSPAVKAHLFAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 GTSNLKDLCPSEGESDAEAESKEEHGPEACDAAKISTTTSEEPCRDKGSPAVKAHLFAAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 RPRDSGRLDKASPDSRHSPATISSSTRGLGAEERRSPVREGTAPAKVEEARALPGKEAFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 RPRDSGRLDKASPDSRHSPATISSSTRGLGAEERRSPVREGTAPAKVEEARALPGKEAFA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PLTVQTDAAAAHLAQGPLPGLGFAPGLAGQQFFNGHPLFLHPSQFAMGGAFSSMAAAGMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PLTVQTDAAAAHLAQGPLPGLGFAPGLAGQQFFNGHPLFLHPSQFAMGGAFSSMAAAGMG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PLLATVSGASTGVSGLDSTAMASAAAAQGLSGASAATLPFHLQQHVLASQGLAMSPFGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PLLATVSGASTGVSGLDSTAMASAAAAQGLSGASAATLPFHLQQHVLASQGLAMSPFGSL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 FPYPYTYMAAAAAASSAAASSSVHRHPFLNLNTMRPRLRYSPYSIPVPVPDGSSLLTTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 FPYPYTYMAAAAAASSAAASSSVHRHPFLNLNTMRPRLRYSPYSIPVPVPDGSSLLTTAL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 PSMAAAAGPLDGKVAALAASPASVAVDSGSELNSRSSTLSSSSMSLSPKLCAEKEAATSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PSMAAAAGPLDGKVAALAASPASVAVDSGSELNSRSSTLSSSSMSLSPKLCAEKEAATSE
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KB6 LQSIQRLVSGLEAKPDRSRSASP
:::::::::::::::::::::::
CCDS91 LQSIQRLVSGLEAKPDRSRSASP
730 740
>>CCDS9175.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 (723 aa)
initn: 3254 init1: 3254 opt: 3254 Z-score: 2535.3 bits: 479.7 E(32554): 6.8e-135
Smith-Waterman score: 4725; 97.3% identity (97.3% similar) in 743 aa overlap (1-743:1-723)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLSMRDPVIPGTSMAYHPFLPHRAPDFAMSAVLGHQPPFFPALTLPPNGAAALSLPGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 MSLSMRDPVIPGTSMAYHPFLPHRAPDFAMSAVLGHQPPFFPALTLPPNGAAALSLPGAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AKPIMDQLVGAAETGIPFSSLGPQAHLRPLKTMEPEEEVEDDPKVHLEAKELWDQFHKRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 AKPIMDQLVGAAETGIPFSSLGPQAHLRPLKTMEPEEEVEDDPKVHLEAKELWDQFHKRG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TEMVITKSGRRMFPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCRYKFHNSRWMVAGKADPEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 TEMVITKSGRRMFPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCRYKFHNSRWMVAGKADPEM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFHKLKLTNNISDKHGFTLAFPSDHATWQGNYSFGTQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFHKLKLTNNISDKHGFT--------------------
190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 ILNSMHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVTAYQNDKITQLKIDNNPFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 ILNSMHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVTAYQNDKITQLKIDNNPFA
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 KGFRDTGNGRREKRKQLTLQSMRVFDERHKKENGTSDESSSEQAAFNCFAQASSPAASTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 KGFRDTGNGRREKRKQLTLQSMRVFDERHKKENGTSDESSSEQAAFNCFAQASSPAASTV
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 GTSNLKDLCPSEGESDAEAESKEEHGPEACDAAKISTTTSEEPCRDKGSPAVKAHLFAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 GTSNLKDLCPSEGESDAEAESKEEHGPEACDAAKISTTTSEEPCRDKGSPAVKAHLFAAE
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 RPRDSGRLDKASPDSRHSPATISSSTRGLGAEERRSPVREGTAPAKVEEARALPGKEAFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 RPRDSGRLDKASPDSRHSPATISSSTRGLGAEERRSPVREGTAPAKVEEARALPGKEAFA
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 PLTVQTDAAAAHLAQGPLPGLGFAPGLAGQQFFNGHPLFLHPSQFAMGGAFSSMAAAGMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PLTVQTDAAAAHLAQGPLPGLGFAPGLAGQQFFNGHPLFLHPSQFAMGGAFSSMAAAGMG
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PLLATVSGASTGVSGLDSTAMASAAAAQGLSGASAATLPFHLQQHVLASQGLAMSPFGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PLLATVSGASTGVSGLDSTAMASAAAAQGLSGASAATLPFHLQQHVLASQGLAMSPFGSL
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 FPYPYTYMAAAAAASSAAASSSVHRHPFLNLNTMRPRLRYSPYSIPVPVPDGSSLLTTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 FPYPYTYMAAAAAASSAAASSSVHRHPFLNLNTMRPRLRYSPYSIPVPVPDGSSLLTTAL
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KB6 PSMAAAAGPLDGKVAALAASPASVAVDSGSELNSRSSTLSSSSMSLSPKLCAEKEAATSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS91 PSMAAAAGPLDGKVAALAASPASVAVDSGSELNSRSSTLSSSSMSLSPKLCAEKEAATSE
650 660 670 680 690 700
730 740
pF1KB6 LQSIQRLVSGLEAKPDRSRSASP
:::::::::::::::::::::::
CCDS91 LQSIQRLVSGLEAKPDRSRSASP
710 720
>>CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17 (712 aa)
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Smith-Waterman score: 2309; 56.0% identity (70.5% similar) in 770 aa overlap (5-743:1-706)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSLSMRDPVIPGTSMAYHPFLPHRAPDFAMSAVLGH-QPPFFPALTLPPNGAAALSLPG-
::.:.. ...:::::: : :: ::: :. :: :::::.::: :: : ::
CCDS11 MREPALAASAMAYHPFHAPRPADFPMSAFLAAAQPSFFPALALPP-GALAKPLPDP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 --ALAKPIMDQLVGAAETGIPFSSLGPQ---AHLRPLKTMEPEEEVEDDPKVHLEAKELW
: : ..:::.:. :.:::. :::: ::..:::.:::::::: :::::::
CCDS11 GLAGAAAAAAAAAAAAEAGLHVSALGPHPPAAHLRSLKSLEPEDEVEDDPKVTLEAKELW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 DQFHKRGTEMVITKSGRRMFPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCRYKFHNSRWMVA
::::: :::::::::::::::::::: :::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS11 DQFHKLGTEMVITKSGRRMFPPFKVRVSGLDKKAKYILLMDIVAADDCRYKFHNSRWMVA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFHKLKLTNNISDKHGFTLAFPSDHATWQGN
:::::::::::::::::::::::::.: :.:::::::::::::::::
CCDS11 GKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMAKPVAFHKLKLTNNISDKHGFT-------------
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 YSFGTQTILNSMHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVTAYQNDKITQLK
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::
CCDS11 -------ILNSMHKYQPRFHIVRANDILKLPYSTFRTYVFPETDFIAVTAYQNDKITQLK
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 IDNNPFAKGFRDTGNGRREKRKQLTLQSMRVFDERHKKE-NGT-SDESSSEQAAFNCFAQ
:::::::::::::::::::::::::: :.:...:. : : .:. :: :: .
CCDS11 IDNNPFAKGFRDTGNGRREKRKQLTLPSLRLYEEHCKPERDGAESDASSCDPPPAR--EP
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 ASSPAASTVGTSNLKDLCPSEGESDAEAESKEEHGPEACDAAKISTTTSEEPCRDKGSPA
.::.:. : :. :.. :.: : :: . . .. .. : :..::
CCDS11 PTSPGAA---PSPLRLHRARAEEKSCAADSDPE--PERLSEERAGAPLGRSPAPDSASP-
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB6 VKAHLFAAERPRDSGRLDKASPDSRHSPATISSSTRGLGAEERRSPVREGTAPAKVEEAR
..: :: :. . ::. . :: . : : :: .: . . .:.:
CCDS11 --TRLTEPERARE-----RRSPERGKEPAE----SGGDGPFGLRSLEKERAEARRKDEGR
390 400 410 420 430
480 490 500 510 520
pF1KB6 --ALPGKE-AFAPLTVQTDAAAAHLAQGPLPGLGFAPGLAGQQFFN----GHPLFLHPSQ
: ::: ..:::.::::.:. :. : ::::.:. : :::::. :.::::::.:
CCDS11 KEAAEGKEQGLAPLVVQTDSASP-LGAGHLPGLAFSSHLHGQQFFGPLGAGQPLFLHPGQ
440 450 460 470 480 490
530 540 550 560 570 580
pF1KB6 FAMG-GAFSSMAAAGMGPLLATVSGASTGVSGLDSTAMASAAAAQG--LSGAS-AATLPF
:.:: ::::.: ::: :::.:.:...: .: .:: . :.. : :.:: :: .::
CCDS11 FTMGPGAFSAM---GMGHLLASVAGGGNGGGGGPGTAAGLDAGGLGPAASAASTAAPFPF
500 510 520 530 540 550
590 600 610 620
pF1KB6 HLQQHVLASQGLAMSPFGSLFPYPYTYMAAAAAASSA-----------AASSSVHRHPFL
::.::.:::::. : ::.:::::::::::::::.:: ::..:. : :::
CCDS11 HLSQHMLASQGIPMPTFGGLFPYPYTYMAAAAAAASALPATSAAAAAAAAAGSLSRSPFL
560 570 580 590 600 610
630 640 650 660 670 680
pF1KB6 NLNTMRPRLRYSPYSIPVPVPDGSSLLTTALPSMAAAAGPLDGKVAALAASPASVAVDSG
. . :::::.:::.::: .: ..:::::.: : .. :. ... ::
CCDS11 G--SARPRLRFSPYQIPVTIPPSTSLLTTGLASEGSKAAGGNSR----EPSPLP------
620 630 640 650 660
690 700 710 720 730 740
pF1KB6 SELNSRSSTLSSSSMSLSPKLCAEKEAATSELQSIQRLVSGLEAKPDRSRSASP
:: :. . : .:::. : :::: .:::::::::::::.. :. ::
CCDS11 -ELALRKVG-APSRGALSPSGSA-KEAA-NELQSIQRLVSGLESQ----RALSPGRESPK
670 680 690 700 710
>>CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 (545 aa)
initn: 853 init1: 543 opt: 551 Z-score: 439.5 bits: 91.5 E(32554): 3.7e-18
Smith-Waterman score: 809; 48.8% identity (67.2% similar) in 293 aa overlap (42-328:17-278)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 GTSMAYHPFLPHRAPDFAMSAVLGHQPPFFPALTLPPNGAAALSLPGALAKPIMDQLVGA
:. .: .:: : ::: : : ::
CCDS11 MLQDKGLSESEEAFRAPGPALGEASAANAPEP-ALAAP---GLSGA
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 AETGIPFSSLGPQAHLRPLKTMEPEEEVEDDPKVHLEAKELWDQFHKRGTEMVITKSGRR
: . : :: : . . . :. .:. :: :. :::: .::. ::::.:::.:::
CCDS11 ALGSPP----GPGADV--VAAAAAEQTIEN-IKVGLHEKELWKKFHEAGTEMIITKAGRR
50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 MFPPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCRYKFHNSRWMVAGKADPEMPKRMYIHPDSP
::: .::. .:.. :.:::::.::. ::: :::: ...:::::::.: :: :.:.:::::
CCDS11 MFPSYKVKVTGMNPKTKYILLIDIVPADDHRYKFCDNKWMVAGKAEPAMPGRLYVHPDSP
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 ATGEQWMSKVVTFHKLKLTNNISDKHGFTLAFPSDHATWQGNYSFGTQTILNSMHKYQPR
::: .:: ..:.:.::::::: : : . :::::::::::
CCDS11 ATGAHWMRQLVSFQKLKLTNNHLDPFG--------------------HIILNSMHKYQPR
160 170 180 190
260 270 280 290 300
pF1KB6 FHIVRA--NDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVTAYQNDKITQLKIDNNPFAKGFR--DTG
.:::.: :. . ..: :..:::: ::.::.::: :::::::.::::::::: : .
CCDS11 LHIVKADENNAFGSKNTAFCTHVFPETSFISVTSYQNHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDS
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 NGR--REKRKQLTLQSMRVFDERHKKENGTSDESSSEQAAFNCFAQASSPAASTVGTSNL
. : : . :. . : .. .:
CCDS11 DLRVARLQSKEYPVISKSIMRQRLISPQLSATPDVGPLLGTHQALQHYQHENGAHSQLAE
260 270 280 290 300 310
>>CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 (546 aa)
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20 30 40 50 60 70
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:. .: .:: : ::: : : ::
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: . : :: : . . . :. .:. :: :. :::: .::. ::::.:::.:::
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50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
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::: .::. .:.. :.:::::.::. ::: :::: ...:::::::.: :: :.:.:::::
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100 110 120 130 140 150
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::: .:: ..:.:.::::::: : : . :::::::::::
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260 270 280 290 300
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.:::.: :. . ..: :..:::: ::.::.::: :::::::.::::::::: : .
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200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
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. : : . :. . : .. .:
CCDS82 DLRVARLQSKEYPVISKSIMRQRLISPQLSATPDVGPLLGTHQALQHYQHENGAHSQLAE
260 270 280 290 300 310
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: : :: :...:.. : . :. : .
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.. :.:. . .: . .: : .: .. : .:: : :. :. ::.::
CCDS43 SSCAQPLGELTSLDAHGEFGGGSGSSPSSSSLCTEPLIPTTPIIPSEEMAKIACSLETKE
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:::.::. ::::.:::::::::: ..: ::.: .::::.::::. .:. ::.. : :
CCDS43 LWDKFHELGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFSGVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYHRSS
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:.::::::: .: :.:.::::: :::: ....:.:.:.::::: :.::
CCDS43 WLVAGKADPPLPARLYVHPDSPFTGEQLLKQMVSFEKVKLTNNELDQHG-----------
170 180 190 200 210
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. ::::::::::: ::.. .: .:.: :::..:::: : ::::::
CCDS43 ---------HIILNSMHKYQPRVHIIKKKDHTASLLNLKSEEFRTFIFPETVFTAVTAYQ
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 NDKITQLKIDNNPFAKGFRDTGNGRREKRKQLTLQSMRVFDERHKKENGTSDESSSEQAA
:. ::.::::.:::::::::.. . .. .:.. . ..:. . ..:. .
CCDS43 NQLITKLKIDSNPFAKGFRDSS-----RLTDIERESVESLIQKHSYARSPIRTYGGEEDV
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.. .:.. .:. ::. .: : :.. . .: :.. : ::.. :
CCDS43 LGDESQTTPNRGSAFTTSD--NLSLSSWVSSSSSFPGFQH-PQSLTALGTSTASIATPIP
330 340 350 360 370 380
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CCDS43 HPIQGSLPPYSRLGMPLTPSAIASSMQGSGPTFPSFHMPRYHHYFQQGPYAAIQGLRHSS
390 400 410 420 430 440
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:. .::: .::. ::::.:::.:::::: .::. .::. :.::::::::. ::: ::::
CCDS91 LHERELWLKFHEVGTEMIITKAGRRMFPSYKVKVTGLNPKTKYILLMDIVPADDHRYKFA
60 70 80 90 100 110
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...: :.:::.: :: :.:.:::::::: .:: ..:.:.::::::: : :
CCDS91 DNKWSVTGKAEPAMPGRLYVHPDSPATGAHWMRQLVSFQKLKLTNNHLDPFG--------
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. :::::::::::.:::.: :. . ..: :..:::: :::::.:
CCDS91 ------------HIILNSMHKYQPRLHIVKADENNGFGSKNTAFCTHVFPETAFIAVTSY
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:: :::::::.::::::::: . . . .. ... . . : . ... .:..: :::
CCDS91 QNHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDMELHRMSRMQSKEYPVVPRSTVRQKVASNHSPFSSE
220 230 240 250 260 270
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. :.. .. .: :.:. .:: : . : :. : : : .
CCDS91 SRALSTSSNLGSQYQCENGVSGPSQDLLPPPNPYPLPQEHSQIYH----C------TKRK
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:: : : : .. .. .:: . ..: :... :. :. : .:
CCDS91 EEECSTTDHPYKKPYMETSPSEEDS--FYRSSYPQQQGLGASYRTESAQRQACMYASSAP
330 340 350 360 370 380
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: . . . :. ... :: : . .::...::: : :. .
CCDS91 PSEPVPSLEDISCNTWPSMPSYSSCTVTTVQPMDRLPYQHFSAHFTSGPLVPRLAGMANH
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
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.. :. :. .: : .. :
CCDS91 GSPQL--GEGMFQHQTSVAHQPVVRQCGPQTGLQSPGTLQPPEFLYSHGVPRTLSPHQYH
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pF1KB6 TGIPFSSLGPQAHLRPLKTMEPEEEVEDDPKVHLEAKELWDQFHKRGTEMVITKSGRRMF
:: :. .::: .::. ::::.:::.:::::
CCDS91 MEGIKVFLHERELWLKFHEVGTEMIITKAGRRMF
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 PPFKVRCSGLDKKAKYILLMDIIAADDCRYKFHNSRWMVAGKADPEMPKRMYIHPDSPAT
: .::. .::. :.::::::::. ::: :::: ...: :.:::.: :: :.:.:::::::
CCDS91 PSYKVKVTGLNPKTKYILLMDIVPADDHRYKFADNKWSVTGKAEPAMPGRLYVHPDSPAT
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 GEQWMSKVVTFHKLKLTNNISDKHGFTLAFPSDHATWQGNYSFGTQTILNSMHKYQPRFH
: .:: ..:.:.::::::: : : . :::::::::::.:
CCDS91 GAHWMRQLVSFQKLKLTNNHLDPFG--------------------HIILNSMHKYQPRLH
100 110 120 130
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 IVRA--NDILKLPYSTFRTYLFPETEFIAVTAYQNDKITQLKIDNNPFAKGFRDTGNGRR
::.: :. . ..: :..:::: :::::.::: :::::::.::::::::: . . .
CCDS91 IVKADENNGFGSKNTAFCTHVFPETAFIAVTSYQNHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDMEL
140 150 160 170 180 190
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pF1KB6 EKRKQLTLQSMRVFDERHKKENGTSDES--SSEQAAFNCFAQASSPAASTVGTSN-LKDL
.. ... . . : . ... .:..: :::. :.. .. .: :.:. .::
CCDS91 HRMSRMQSKEYPVVPRSTVRQKVASNHSPFSSESRALSTSSNLGSQYQCENGVSGPSQDL
200 210 220 230 240 250
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: . : :. : : : .:: : : : .. .. .::
CCDS91 LPPPNPYPLPQEHSQIYH----C------TKRKEEECSTTDHPYKKPYMETSPSEEDS-F
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.. :... :. :. : .: : . . . :. ... ::
CCDS91 YRSSYPQQQGLGASYRTESAQRQACMYASSAPPSEPVPSLEDISCNTWPSMPSYSSCTVT
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: . .::...::: : :. . .. :. :. .: : .. :
CCDS91 TVQPMDRLPYQHFSAHFTSGPLVPRLAGMANHGSPQL--GEGMFQHQTSVAHQPVVRQCG
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CCDS91 PQTGLQSPGTLQPPEFLYSHGVPRTLSPHQYHSVHGVGMVPEWSDNS
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: . : : : .::: . :: :
CCDS13 DMEAFTASSLSSLGAAGGFPGAASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCAAAAPGAPGPPPPPH
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.. :: :. :: : ..... .:.:: : :::.:.. ::
CCDS13 AYPFAPAAGAATSAAAEPEGPGASCAAAAKAPVKKNAKVAGVSVQLEMKALWDEFNQLGT
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::..::.:::::: :.:. :.: : :.::::.. .:: ::. ::.: :.:::::::
CCDS13 EMIVTKAGRRMFPTFQVKLFGMDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLVAGKADPA
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: :.. :::::: : :::...:.: :::::::. : .: .
CCDS13 TPGRVHYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNG--------------------H
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::::::.::::::.: .. : : .:.:..: ::.: ::::::: .:::::: .
CCDS13 IILNSMHRYQPRFHVVYVDPRKDSEKYAEENFKTFVFEETRFTAVTAYQNHRITQLKIAS
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::::::::: . :..: .: : .: . .. . .. :..:.
CCDS13 NPFAKGFRDCDPEDWPRNHRPG-ALPLMSAFARSRNPVASPTQPSGTEKGLVTEGSGLQP
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pF1KB6 MRDPVIPGTSMAYHPFLPHRAPDFAMSAVLGHQPPFFPALTLPPNGAAALSLPGALAKPI
: . : : : .::: . :: :
CCDS13 DMEAFTASSLSSLGAAGGFPGAASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCAAAAPGAPGPPPPPH
10 20 30 40 50 60
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pF1KB6 MDQLVGAA--ETGIPFSSLGPQAHLRPLKTMEPEEEVE-DDPKVHLEAKELWDQFHKRGT
.. :: :. :: : ..... .:.:: : :::.:.. ::
CCDS13 AYPFAPAAGAATSAAAEPEGPGASCAAAAKAPVKKNAKVAGVSVQLEMKALWDEFNQLGT
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::..::.:::::: :.:. :.: : :.::::.. .:: ::. ::.: :.:::::::
CCDS13 EMIVTKAGRRMFPTFQVKLFGMDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLVAGKADPA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 MPKRMYIHPDSPATGEQWMSKVVTFHKLKLTNNISDKHGFTLAFPSDHATWQGNYSFGTQ
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CCDS13 TPGRVHYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNG--------------------H
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CCDS13 IILNSMHRYQPRFHVVYVDPRKDSEKYAEENFKTFVFEETRFTAVTAYQNHRITQLKIAS
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::::::::: . :..: .: : .: . .. . .. :..:.
CCDS13 NPFAKGFRDCDPEDWPRNHRPG-ALPLMSAFARSRNPVASPTQPSGTEKGGHVLKDKEVK
290 300 310 320 330 340
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pF1KB6 PAASTVGTSNLKDLCPSEGESDAEAESKEEHGPEACDAAKISTTTSEEPCRDKGSPAVKA
CCDS13 AETSRNTPEREVELLRDAGGCVNLGLPCPAECQPFNTQGLVAGRTAGDRLC
350 360 370 380 390
743 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 06:10:51 2016 done: Sun Nov 6 06:10:52 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]