Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB6221
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6221, 670 aa
1>>>pF1KB6221 670 - 670 aa - 670 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7080+/-0.00103; mu= 4.1247+/- 0.062
mean_var=193.8912+/-39.818, 0's: 0 Z-trim(110.5): 49 B-trim: 4 in 1/51
Lambda= 0.092108
statistics sampled from 11607 (11653) to 11607 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.358), width: 16
Scan time: 4.280
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1235.1 ATF6 gene_id:22926|Hs108|chr1 ( 670) 4367 593.3 3.6e-169
CCDS47408.1 ATF6B gene_id:1388|Hs108|chr6 ( 700) 755 113.4 1.2e-24
CCDS4737.1 ATF6B gene_id:1388|Hs108|chr6 ( 703) 755 113.4 1.2e-24
>>CCDS1235.1 ATF6 gene_id:22926|Hs108|chr1 (670 aa)
initn: 4367 init1: 4367 opt: 4367 Z-score: 3150.6 bits: 593.3 E(32554): 3.6e-169
Smith-Waterman score: 4367; 99.9% identity (100.0% similar) in 670 aa overlap (1-670:1-670)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNFDNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNFDNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 DFDLDLVPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSPASSSYSVSSPRSVDSYSSTQHVPEE
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DFDLDLMPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSPASSSYSVSSPRSVDSYSSTQHVPEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 LDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDKPVTGPRNKTENGLTPKKKIQVNSKPSIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDKPVTGPRNKTENGLTPKKKIQVNSKPSIQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 PKPLLLPAAPKTQTNSSVPAKTIIIQTVPTLMPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PKPLLLPAAPKTQTNSSVPAKTIIIQTVPTLMPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQPTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQLPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQLPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 GSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKKENGTLKRQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKKENGTLKRQLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 EVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQDSRRMNPSVSPANQRRHLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQDSRRMNPSVSPANQRRHLLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB6 FSAKEAQDTSDGIIQKNSYRYDHSVSNDKALMVLTEEPLLYIPPPPCQPLINTTESLRLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FSAKEAQDTSDGIIQKNSYRYDHSVSNDKALMVLTEEPLLYIPPPPCQPLINTTESLRLN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 HELRGWVHRHEVERTKSRRMTNNQQKTRILQGALEQGSNSQLMAVQYTETTSSISRNSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HELRGWVHRHEVERTKSRRMTNNQQKTRILQGALEQGSNSQLMAVQYTETTSSISRNSGS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 ELQVYYASPRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPATTHNKTTRPKMSIVLPAINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELQVYYASPRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPATTHNKTTRPKMSIVLPAINI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 NENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQRNQTNTFFGSPPAATEATH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQRNQTNTFFGSPPAATEATH
610 620 630 640 650 660
670
pF1KB6 VVSTIPESLQ
::::::::::
CCDS12 VVSTIPESLQ
670
>>CCDS47408.1 ATF6B gene_id:1388|Hs108|chr6 (700 aa)
initn: 1079 init1: 416 opt: 755 Z-score: 556.3 bits: 113.4 E(32554): 1.2e-24
Smith-Waterman score: 1121; 36.4% identity (60.6% similar) in 698 aa overlap (25-666:25-694)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNFD--
:::::.:.. : .. .. :: : . ::
CCDS47 MAELMLLSEIADPTRFFTDNLLSPEDWDSTLYSGLDEVAE-EQTQLFRCPEQ-DVPFDGS
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 NLDFDLDLVPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSP-ASSSYSVSSPR-SVDSYSSTQH
.:: .:. : : :.. . :.... .: :: .::: : : : :.. : .
CCDS47 SLDVGMDVSPSEPP-WEL---LPIFPDLQVKSEPSSPCSSSSLSSESSRLSTEPSSEALG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VPEELDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDK-PVTGPRNKTENGLTPKKKIQ-VN
: : : ... : :: : :.. .: : : .. . :.. . ... . : . . ::
CCDS47 VGEVLHVKTESLAPPLCLLGDDPTS--SFETVQINVIPTSDDSSDVQTKIEPVSPCSSVN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KB6 SKPSI-----QPKPLLLPAAPKTQTNS---------SVPAKT---IIIQTVPTL-----M
:. :. . . .. . ...:.: .::: . . :. :.:
CCDS47 SEASLLSADSSSQAFIGEEVLEVKTESLSPSGCLLWDVPAPSLGAVQISMGPSLDGSSGK
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KB6 PLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQ---P--TVVQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQLPN
: ..: ::: :. :: . . : :.: ::. : ..::. . :.. :.
CCDS47 ALPTRKP--PLQPKPVVLTTVPMPSRAVPPSTTVLLQSLVQPPPVSPVVLIQGAIRVQPE
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 HVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNVGSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKK
:::: : . :.. . .. : .:.::::::::::::::::.::
CCDS47 G-----PAPSLPRPE--RKSIVPAPMPGNSCPPEVDAKLLKRQQRMIKNRESACQSRRKK
300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 KEYMLGLEARLKAALSENEQLKKENGTLKRQLDEVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAF
:::. ::::::.:.:..:.::..::..:.:.:. ...::..::. : .:.:::.:. : :
CCDS47 KEYLQGLEARLQAVLADNQQLRRENAALRRRLEALLAENSELKLGSGNRKVVCIMVFLLF
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KB6 IILNYGPMSMLEQDSRRMNPSVSPANQ--RRHLLGFSAKEA-------QDTSDGIIQKNS
: .:.::.:. : : ..: .. .. :::::::: .: : .:.: . .
CCDS47 IAFNFGPVSISEPPSAPISPRMNKGEPQPRRHLLGFSEQEPVQGVEPLQGSSQGPKEPQP
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KB6 YRYDH-SVSNDKAL------MVLTEEPLLYIPPPPCQPLINTTESLRLNHELRGWVHRHE
:. : :: :. ..: . :.. :. . : :::::: :: :::.::.
CCDS47 SPTDQPSFSNLTAFPGGAKELLLRDLDQLFLSSD-CRHF-NRTESLRLADELSGWVQRHQ
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KB6 VERTKSRRMTNNQQKTRILQGALEQGSNSQLMAVQYTETTSSISRNSGSELQVYYASPRS
: : . ....::.. . .. . :: . . :.: ..::.: ::
CCDS47 RGRRKIPQRAQERQKSQ------PRKKSPPVKAVPI-QPPGPPERDSVGQLQLYRHPDRS
530 540 550 560 570
560 570 580 590 600
pF1KB6 YQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPATTHNKTTRPKMSIVLPAININENVINGQ---
:..:: :: ::::::::::::::::: .::::.:::::.:.::. ::. ..:.
CCDS47 QPAFLDAIDRREDTFYVVSFRRDHLLLPAISHNKTSRPKMSLVMPAMAPNET-LSGRGAP
580 590 600 610 620 630
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 -DYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQRNQTNTFFGSP-P--AATEATHVVST
::: ::::.:.:::::..:::.:.::: :: : .. :.: : ::..: : .:
CCDS47 GDYEEMMQIECEVMDTRVIHIKTSTVPPSLRKQPSPTPGNATGGPLPVSAASQA-HQASH
640 650 660 670 680 690
670
pF1KB6 IPESLQ
:
CCDS47 QPLYLNHP
700
>>CCDS4737.1 ATF6B gene_id:1388|Hs108|chr6 (703 aa)
initn: 1021 init1: 416 opt: 755 Z-score: 556.3 bits: 113.4 E(32554): 1.2e-24
Smith-Waterman score: 1099; 36.1% identity (60.3% similar) in 701 aa overlap (25-666:25-697)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDW---DSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNF
::: .:.:.. : .. .. :: : . :
CCDS47 MAELMLLSEIADPTRFFTDNLLSPEDWGLQNSTLYSGLDEVAE-EQTQLFRCPEQ-DVPF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 D--NLDFDLDLVPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSP-ASSSYSVSSPR-SVDSYSS
: .:: .:. : : :.. . :.... .: :: .::: : : : :.. :
CCDS47 DGSSLDVGMDVSPSEPP-WEL---LPIFPDLQVKSEPSSPCSSSSLSSESSRLSTEPSSE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 TQHVPEELDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDK-PVTGPRNKTENGLTPKKKIQ
. : : : ... : :: : :.. .: : : .. . :.. . ... . : . .
CCDS47 ALGVGEVLHVKTESLAPPLCLLGDDPTS--SFETVQINVIPTSDDSSDVQTKIEPVSPCS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KB6 -VNSKPSI-----QPKPLLLPAAPKTQTNS---------SVPAKT---IIIQTVPTL---
:::. :. . . .. . ...:.: .::: . . :. :.:
CCDS47 SVNSEASLLSADSSSQAFIGEEVLEVKTESLSPSGCLLWDVPAPSLGAVQISMGPSLDGS
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KB6 --MPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQ---P--TVVQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQ
: ..: ::: :. :: . . : :.: ::. : ..::. . :..
CCDS47 SGKALPTRKP--PLQPKPVVLTTVPMPSRAVPPSTTVLLQSLVQPPPVSPVVLIQGAIRV
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 LPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNVGSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSR
:. :::: : . :.. . .. : .:.::::::::::::::::
CCDS47 QPEG-----PAPSLPRPE--RKSIVPAPMPGNSCPPEVDAKLLKRQQRMIKNRESACQSR
300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 KKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKKENGTLKRQLDEVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIV
.:::::. ::::::.:.:..:.::..::..:.:.:. ...::..::. : .:.:::.:.
CCDS47 RKKKEYLQGLEARLQAVLADNQQLRRENAALRRRLEALLAENSELKLGSGNRKVVCIMVF
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KB6 LAFIILNYGPMSMLEQDSRRMNPSVSPANQ--RRHLLGFSAKEA-------QDTSDGIIQ
: :: .:.::.:. : : ..: .. .. :::::::: .: : .:.: .
CCDS47 LLFIAFNFGPVSISEPPSAPISPRMNKGEPQPRRHLLGFSEQEPVQGVEPLQGSSQGPKE
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480
pF1KB6 KNSYRYDH-SVSNDKAL------MVLTEEPLLYIPPPPCQPLINTTESLRLNHELRGWVH
. :. : :: :. ..: . :.. :. . : :::::: :: :::.
CCDS47 PQPSPTDQPSFSNLTAFPGGAKELLLRDLDQLFLSSD-CRHF-NRTESLRLADELSGWVQ
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KB6 RHEVERTKSRRMTNNQQKTRILQGALEQGSNSQLMAVQYTETTSSISRNSGSELQVYYAS
::. : : . ....::.. . .. . :: . . :.: ..::.:
CCDS47 RHQRGRRKIPQRAQERQKSQ------PRKKSPPVKAVPI-QPPGPPERDSVGQLQLYRHP
530 540 550 560 570
550 560 570 580 590 600
pF1KB6 PRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPATTHNKTTRPKMSIVLPAININENVINGQ
:: :..:: :: ::::::::::::::::: .::::.:::::.:.::. ::. ..:.
CCDS47 DRSQPAFLDAIDRREDTFYVVSFRRDHLLLPAISHNKTSRPKMSLVMPAMAPNET-LSGR
580 590 600 610 620 630
610 620 630 640 650 660
pF1KB6 ----DYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQRNQTNTFFGSP-P--AATEATHV
::: ::::.:.:::::..:::.:.::: :: : .. :.: : ::..: :
CCDS47 GAPGDYEEMMQIECEVMDTRVIHIKTSTVPPSLRKQPSPTPGNATGGPLPVSAASQA-HQ
640 650 660 670 680 690
670
pF1KB6 VSTIPESLQ
.: :
CCDS47 ASHQPLYLNHP
700
670 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 18:50:53 2016 done: Sun Nov 6 18:50:54 2016
Total Scan time: 4.280 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]