Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5934
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5934, 538 aa
1>>>pF1KB5934 538 - 538 aa - 538 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5815+/-0.00125; mu= 14.1676+/- 0.074
mean_var=208.3345+/-41.250, 0's: 0 Z-trim(110.2): 939 B-trim: 135 in 1/50
Lambda= 0.088857
statistics sampled from 10398 (11422) to 10398 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.692), E-opt: 0.2 (0.351), width: 16
Scan time: 2.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 ( 538) 3687 486.0 4.7e-137
CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6 ( 545) 3104 411.3 1.5e-114
CCDS56408.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 ( 390) 2706 360.1 2.8e-99
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 1609 219.7 7.5e-57
CCDS5667.1 ZKSCAN5 gene_id:23660|Hs108|chr7 ( 839) 1121 157.3 6.4e-38
CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19 ( 491) 1045 147.3 4e-35
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1007 142.5 1.3e-33
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1007 142.6 1.4e-33
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1007 142.6 1.4e-33
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1007 142.6 1.4e-33
CCDS32383.1 ZNF500 gene_id:26048|Hs108|chr16 ( 480) 999 141.4 2.3e-33
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 983 139.1 8.3e-33
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 983 139.3 9.6e-33
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 983 139.3 9.9e-33
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 972 137.9 2.7e-32
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 972 138.0 2.8e-32
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 972 138.0 2.8e-32
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 972 138.0 2.9e-32
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 972 138.1 3e-32
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 972 138.1 3e-32
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 965 137.2 6e-32
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 964 137.1 6.4e-32
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 964 137.1 6.4e-32
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 964 137.1 6.5e-32
CCDS10495.1 ZNF213 gene_id:7760|Hs108|chr16 ( 459) 960 136.3 7.3e-32
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 959 136.2 8.1e-32
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 962 136.9 8.2e-32
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 960 136.5 8.3e-32
CCDS83401.1 ZNF883 gene_id:169834|Hs108|chr9 ( 379) 957 135.8 8.5e-32
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 960 136.5 8.6e-32
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 960 136.5 8.7e-32
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 961 136.8 8.9e-32
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 960 136.6 9.2e-32
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 956 135.9 1.1e-31
CCDS35106.1 ZNF483 gene_id:158399|Hs108|chr9 ( 744) 955 136.0 1.5e-31
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 950 135.1 1.8e-31
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 950 135.1 1.9e-31
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 950 135.2 2e-31
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 950 135.2 2.1e-31
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 950 135.2 2.1e-31
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 949 135.1 2.3e-31
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 949 135.1 2.4e-31
CCDS82409.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 591) 945 134.6 3.2e-31
CCDS42642.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 676) 945 134.6 3.5e-31
CCDS82410.1 ZNF418 gene_id:147686|Hs108|chr19 ( 697) 945 134.7 3.5e-31
CCDS46801.1 ZNF619 gene_id:285267|Hs108|chr3 ( 532) 943 134.2 3.6e-31
CCDS46803.1 ZNF619 gene_id:285267|Hs108|chr3 ( 576) 943 134.3 3.8e-31
CCDS46802.1 ZNF619 gene_id:285267|Hs108|chr3 ( 616) 943 134.3 3.9e-31
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 ( 541) 941 134.0 4.4e-31
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 944 134.7 4.4e-31
>>CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 (538 aa)
initn: 3687 init1: 3687 opt: 3687 Z-score: 2574.1 bits: 486.0 E(32554): 4.7e-137
Smith-Waterman score: 3687; 99.8% identity (99.8% similar) in 538 aa overlap (1-538:1-538)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MARELSESTALDAQSTEDQMELLVIKVEEEEAGFPSSPDLGSEGSRERFRGFRYPEAAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MARELSESTALDAQSTEDQMELLVIKVEEEEAGFPSSPDLGSEGSRERFRGFRYPEAAGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 REALSRLRELCRQWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGNLQSWVREQHPESGEEVVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 REALSRLRELCRQWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGNLQSWVREQHPESGEEVVVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 LEYLERQLDEPAPQVSGVDQGQELLCCKMALLTPAPGSQSSQFQLMKALLKHESVGSQPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LEYLERQLDEPAPQVSGVDQGQELLCCKMALLTPAPGSQSSQFQLMKALLKHESVGSQPL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 QDRVLQVPVLAHGGCCREDAVVASRLTPESQGLLKVEDVALTLTPEWTQQDSSQGNLCRD
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QDRVLQVPVLAHGGCCREDKVVASRLTPESQGLLKVEDVALTLTPEWTQQDSSQGNLCRD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EKQENHGSLVSLGDEKQTKSRDLPPAEELPEKEHGKISCHLREDIAQIPTCAEAGEQEGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EKQENHGSLVSLGDEKQTKSRDLPPAEELPEKEHGKISCHLREDIAQIPTCAEAGEQEGR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LQRKQKNATGGRRHICHECGKSFAQSSGLSKHRRIHTGEKPYECEECGKAFIGSSALVIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LQRKQKNATGGRRHICHECGKSFAQSSGLSKHRRIHTGEKPYECEECGKAFIGSSALVIH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QRVHTGEKPYECEECGKAFSHSSDLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QRVHTGEKPYECEECGKAFSHSSDLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHRIH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 TGEKPYQCSMCGKAFRRSSHLLRHQRIHTGDKNVQEPEQGEAWKSRMESQLENVETPMSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TGEKPYQCSMCGKAFRRSSHLLRHQRIHTGDKNVQEPEQGEAWKSRMESQLENVETPMSY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB5 KCNECERSFTQNTGLIEHQKIHTGEKPYQCNACGKGFTRISYLVQHQRSHVGKNILSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KCNECERSFTQNTGLIEHQKIHTGEKPYQCNACGKGFTRISYLVQHQRSHVGKNILSQ
490 500 510 520 530
>>CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6 (545 aa)
initn: 1619 init1: 1619 opt: 3104 Z-score: 2170.1 bits: 411.3 E(32554): 1.5e-114
Smith-Waterman score: 3104; 84.3% identity (91.8% similar) in 547 aa overlap (1-538:1-545)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MARELSESTALDAQSTEDQMELLVIKVEEEEAGF-------PSSPDLGSEGSRERFRGFR
:::: ...::::::.::: ::..:::.:::. : :: : : ::.::::::
CCDS46 MAREPRKNAALDAQSAEDQTGLLTVKVEKEEASALTAEVRAPCSPARGPERSRQRFRGFR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 YPEAAGPREALSRLRELCRQWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGNLQSWVREQHPES
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 YPEAAGPREALSRLRELCGQWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGNLQSWVREQHPES
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 GEEVVVLLEYLERQLDEPAPQVSGVDQGQELLCCKMALLTPAPGSQSSQFQLMKALLKHE
:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::: . :::::: : ::::.:::
CCDS46 GEEVVVLLEYLERQLDEPAPQVPVGDQGQELLCCKMALLTQTQGSQSSQCQPMKALFKHE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 SVGSQPLQDRVLQVPVLAHGGCCREDAVVASRLTPESQGLLKVEDVALTLTPEWTQQDSS
:.:::::.::::::: ::.::::::::.::::::: ::::::.::::::::: ::: :::
CCDS46 SLGSQPLHDRVLQVPGLAQGGCCREDAMVASRLTPGSQGLLKMEDVALTLTPGWTQLDSS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 QGNLCRDEKQENHGSLVSLGDEKQTKSRDLPPAEELPEKEHGKISCHLREDIAQIPTCAE
: :: ::::::::.:::::: : :::::::::...::::::::: :::::::::::: ::
CCDS46 QVNLYRDEKQENHSSLVSLGGEIQTKSRDLPPVKKLPEKEHGKI-CHLREDIAQIPTHAE
250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 AGEQEGRLQRKQKNATGGRRHICHECGKSFAQSSGLSKHRRIHTGEKPYECEECGKAFIG
::::::::::::::: :.::: ::::::::::::::.:::::::::::::::.:::.:::
CCDS46 AGEQEGRLQRKQKNAIGSRRHYCHECGKSFAQSSGLTKHRRIHTGEKPYECEDCGKTFIG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 SSALVIHQRVHTGEKPYECEECGKAFSHSSDLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSL
::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SSALVIHQRVHTGEKPYECEECGKVFSHSSNLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 LEHHRIHTGEKPYQCSMCGKAFRRSSHLLRHQRIHTGDKNVQEPEQGEAWKS--RMESQL
::::.::::::::::.::::::::.:::::::::: ::::::.::.::.:.: : :::
CCDS46 LEHHKIHTGEKPYQCNMCGKAFRRNSHLLRHQRIH-GDKNVQNPEHGESWESQGRTESQW
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 ENVETPMSYKCNECERSFTQNTGLIEHQKIHTGEKPYQCNACGKGFTRISYLVQHQRSHV
::.:.:.::::::::::::.: .::::::::::::::::..::::::: :::::::::::
CCDS46 ENTEAPVSYKCNECERSFTRNRSLIEHQKIHTGEKPYQCDTCGKGFTRTSYLVQHQRSHV
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 GKNILSQ
::. :::
CCDS46 GKKTLSQ
540
>>CCDS56408.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 (390 aa)
initn: 2706 init1: 2706 opt: 2706 Z-score: 1895.9 bits: 360.1 E(32554): 2.8e-99
Smith-Waterman score: 2706; 99.7% identity (99.7% similar) in 390 aa overlap (149-538:1-390)
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 VLLEYLERQLDEPAPQVSGVDQGQELLCCKMALLTPAPGSQSSQFQLMKALLKHESVGSQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MALLTPAPGSQSSQFQLMKALLKHESVGSQ
10 20 30
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 PLQDRVLQVPVLAHGGCCREDAVVASRLTPESQGLLKVEDVALTLTPEWTQQDSSQGNLC
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PLQDRVLQVPVLAHGGCCREDKVVASRLTPESQGLLKVEDVALTLTPEWTQQDSSQGNLC
40 50 60 70 80 90
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 RDEKQENHGSLVSLGDEKQTKSRDLPPAEELPEKEHGKISCHLREDIAQIPTCAEAGEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RDEKQENHGSLVSLGDEKQTKSRDLPPAEELPEKEHGKISCHLREDIAQIPTCAEAGEQE
100 110 120 130 140 150
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 GRLQRKQKNATGGRRHICHECGKSFAQSSGLSKHRRIHTGEKPYECEECGKAFIGSSALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GRLQRKQKNATGGRRHICHECGKSFAQSSGLSKHRRIHTGEKPYECEECGKAFIGSSALV
160 170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 IHQRVHTGEKPYECEECGKAFSHSSDLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IHQRVHTGEKPYECEECGKAFSHSSDLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHR
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 IHTGEKPYQCSMCGKAFRRSSHLLRHQRIHTGDKNVQEPEQGEAWKSRMESQLENVETPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IHTGEKPYQCSMCGKAFRRSSHLLRHQRIHTGDKNVQEPEQGEAWKSRMESQLENVETPM
280 290 300 310 320 330
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 SYKCNECERSFTQNTGLIEHQKIHTGEKPYQCNACGKGFTRISYLVQHQRSHVGKNILSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SYKCNECERSFTQNTGLIEHQKIHTGEKPYQCNACGKGFTRISYLVQHQRSHVGKNILSQ
340 350 360 370 380 390
>>CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 (578 aa)
initn: 4705 init1: 762 opt: 1609 Z-score: 1134.1 bits: 219.7 E(32554): 7.5e-57
Smith-Waterman score: 1609; 46.8% identity (71.6% similar) in 545 aa overlap (1-533:1-543)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MARELSESTALDAQSTEDQMELLVIKVEEE-----EAGFPSSPDLGSEGSRERFRGFRYP
::.: . .: . . . .:...::::. :... : ::.: : ::: .::
CCDS46 MAEESRKPSAPSPPDQTPEEDLVIVKVEEDHGWDQESSLHESNPLGQEVFRLRFRQLRYQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 EAAGPREALSRLRELCRQWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGNLQSWVREQHPESGE
:. :::::: .:: ::.:::.:....:::::::::::::::::: .::. :.:.. :.::
CCDS46 ETLGPREALIQLRALCHQWLRPDLNTKEQILELLVLEQFLTILPEELQTLVKEHQLENGE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 EVVVLLEYLERQLDEPAPQVSGVDQGQELLCCKMALLTPAPGSQSSQFQLMKALLKHESV
:::.::: ::::.: . ::. .:...: ... . :: ..:.: . .:.:
CCDS46 EVVTLLEDLERQIDILGRPVSARVHGHRVLWEEVVHSASAPEPPNTQLQ--SEATQHKSP
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 GSQPLQDRVL---QVPVLAHGGCCREDAVVASRLTPESQGLLKVEDVALTLTPEWTQQDS
: :.:.. : :. .. : .. ..:. :: : : :.::.:..: : :
CCDS46 VPQESQERAMSTSQSPTRSQKGSSGDQEMTATLLTAGFQTLEKIEDMAVSLIREEWLLDP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SQGNLCRDEKQENHGSLVSLGDEKQTKSRDLPPAEELPE--KEHGKISCHLREDIAQIPT
:: .::::.. :: .. ::: : ....:.: . . . ::. . . :. .
CCDS46 SQKDLCRDNRPENFRNMFSLGGETRSENRELASKQVISTGIQPHGETAAKCNGDVIRGLE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 CAEAGEQEGRLQRKQKNATGGRRHICHECGKSFAQSSGLSKHRRIHTGEKPYECEECGKA
:: . :::.:.. : : ::: : :::::::::::: .: :::::::::.:. ::::
CCDS46 HEEARDLLGRLERQRGNPTQERRHKCDECGKSFAQSSGLVRHWRIHTGEKPYQCNVCGKA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 FIGSSALVIHQRVHTGEKPYECEECGKAFSHSSDLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQS
: :::. :: .:. : :.:.:::::::... :: ::: :::::::.:..:::.::::
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360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KB5 CSLLEHHRIHTGEKPYQCSMCGKAFRRSSHLLRHQRIHTGDKNVQEPEQGEAWK--SRME
.:. :.:::.::.::.:. ::::: .::::. :::::::.: . : :.... :..
CCDS46 AGLILHQRIHSGERPYECNECGKAFSHSSHLIGHQRIHTGEKPYECDECGKTFRRSSHLI
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pF1KB5 SQLENVETPMSYKCNECERSFTQNTGLIEHQKIHTGEKPYQCNACGKGFTRISYLVQHQR
.. .. :::::: :.:.:..::::::.:::::.::.:. :::.:. . :.:: :
CCDS46 GHQRSHTGEKPYKCNECGRAFSQKSGLIEHQRIHTGERPYKCKECGKAFNGNTGLIQHLR
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530
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:.:.
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.:...: ..:.:.: :. . ..: ::: ::. ..: . . . . . :..
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CCDS56 QKPRLLEENALPVLQVPSLPLKDS---QELTASLLSTGSQKLVKIEEVADVAVSFILEEW
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. :.:: .: ::...::.::..:.: :.. . . . . : : .... :
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: ::... .: .:: : : : :. . ... . .: .. : ::. ..: .:
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CCDS56 GKFFLQASNFIQHRRIHTGEKPFKCGECGKSYNQRVHLTQHQRVHTGEKPYKCQVCGKAF
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: :..:: .:.::.:: :. ::: : : :::..: . : .:. :. . .. ....
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CCDS56 SVKKKISEYSEADMELSGKTQRNVSQVQDFGEGCEFQGKLDRKQGIPMKEILGQPSSKRM
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500 510 520 530
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: . . :.: :::.:..:: :::.: . ..:.:::: :.:.
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CCDS56 HLTQHQRVHTGEKPYTCPLCGKAFRVRSHLVQHQSVHSGERPFKCNECGKGFGRRSHLAG
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CCDS12 GPYKDVPTDQRGRESGASRNSSSAWPNLTSQEKPPSEDKFDLVDAYGTEPPYTYSGKRSS
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CCDS12 SSALMVHLRIHITVLQ
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CCDS74 TPVLEQWQRNGFGE-NISLNPDLPHQPMTPE----------RQSPHTWGTR------GKR
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: : :::: :::::::.: .::.::.: :..:.: :::::::.:: :::.: :::
CCDS74 SALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFS
260 270 280 290 300 310
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 LRHQRIHTGDKNVQEPEQGEAWKSRMESQLENVETPMSYKCNECERSFTQNTGLIEHQKI
CCDS74 QHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQR
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340 350 360 370 380 390
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: :::: :.::::.:::::.: .:.:::::
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:::::: ::::.: :: : .:.::::::::: : ::::: .:: : .::: :::
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: : : .. : :.: :. : .: .
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310 320 330 340 350 360
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. . :: . . : ::::.:..::.:.::.:::::::::::.:::::: . :. :::.
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CCDS12 HTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGE
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430 440 450 460 470 480
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490 500 510 520 530
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::.: :.:.: . ::.::.::::::::.:: ::..:.. : :..::: :
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.. :. .. . ::::.:.:::::: ::::. :.:.::::.::::.:: :.: .:
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390 400 410 420 430 440
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: : :::: :::::::.: .::.::.: :..:.: :::::::.:: :::.: :::
CCDS12 SALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFS
270 280 290 300 310 320
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 LRHQRIHTGDKNVQEPEQGEAWKSRMESQLENVETPMSYKCNECERSFTQNTGLIEHQKI
CCDS12 QHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQR
330 340 350 360 370 380
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340 350 360 370 380 390
pF1KB5 IHTGEKPYECEECGKAFIGSSALVIHQRVHTGEKPYECEECGKAFSHSSDLIKHQRTHTG
: :::: :.::::.:::::.: .:.:::::
CCDS12 IHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTG
560 570 580 590 600 610
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 EKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHRIHTGEKPYQCSMCGKAFRRSSHLLRHQRIHTGDKNV
:::::: ::::.: :: : .:.::::::::: : ::::: .:: : .::: :::
CCDS12 EKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
620 630 640 650 660 670
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 QEPEQGEAWKSRMESQLENVETPMSYKCNECERSFTQNTGLIEHQKIHTGEKPYQCNACG
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250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SLVSLGDEKQTKSRDLPPAEELPEKEHGKISCHLREDIAQIP-TCAEAGE---QEGRLQR
: : : .. : :.: :. : .: .
CCDS54 PLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQ
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KQKNATGGRRHICHECGKSFAQSSGLSKHRRIHTGEKPYECEECGKAFIGSSALVIHQRV
. . :: . . : ::::.:..::.:.::.:::::::::::.:::::: . :. :::.
CCDS54 HLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQITPLIQHQRT
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370 380 390 400 410 420
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::::::::: :::::::.:. : .:.: ::::::: :..::::::.: :: .:.: ::::
CCDS54 HTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSSLSQHERTHTGE
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430 440 450 460 470 480
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490 500 510 520 530
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CCDS54 KLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAFTPVK
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pF1KB5 LPPAEELPEKEHGKISCHLREDIAQIPTCAEAGEQEGRLQRKQKNATGGRRHICHECGKS
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CCDS54 TPVLEQWQRNGFGE-NISLNPDLPHQPMTPE----------RQSPHTWGTR------GKR
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330 340 350 360 370 380
pF1KB5 FAQSSGLSKHRRIHTGEKPYECEECGKAFIGSSALVIHQRVHTGEKPYECEECGKAFSHS
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CCDS54 --EKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTHTGERPYECHECLKGFRNS
230 240 250 260 270
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pF1KB5 SDLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHRIHTGEKPYQCSMCGKAFR-RSSHL
: : :::: :::::::.: .::.::.: :..:.: :::::::.:: :::.: :::
CCDS54 SALTKHQRIHTGEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSFSFRSSFS
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 LRHQRIHTGDKNVQEPEQGEAWKSRMESQLENVETPMSYKCNECERSFTQNTGLIEHQKI
CCDS54 QHERTHTGEKPYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQR
340 350 360 370 380 390
>--
initn: 452 init1: 452 opt: 452 Z-score: 331.8 bits: 71.5 E(32554): 3.7e-12
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340 350 360 370 380 390
pF1KB5 IHTGEKPYECEECGKAFIGSSALVIHQRVHTGEKPYECEECGKAFSHSSDLIKHQRTHTG
: :::: :.::::.:::::.: .:.:::::
CCDS54 IHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTG
570 580 590 600 610 620
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 EKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHRIHTGEKPYQCSMCGKAFRRSSHLLRHQRIHTGDKNV
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CCDS54 EKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
630 640 650 660 670 680
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