Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5903
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5903, 501 aa
1>>>pF1KB5903 501 - 501 aa - 501 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1895+/-0.000885; mu= 13.5453+/- 0.053
mean_var=73.3056+/-14.659, 0's: 0 Z-trim(106.4): 21 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.149798
statistics sampled from 8940 (8961) to 8940 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.275), width: 16
Scan time: 2.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 501) 3326 728.2 5.1e-210
CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 235) 1586 352.1 4e-97
CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 ( 419) 1501 333.8 2.3e-91
CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 ( 423) 1501 333.8 2.3e-91
CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 ( 393) 1478 328.8 6.8e-90
CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 ( 427) 1266 283.0 4.6e-76
CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 ( 433) 1235 276.3 4.8e-74
CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 ( 433) 1217 272.4 7.1e-73
CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 ( 436) 1152 258.3 1.2e-68
CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 390) 1134 254.4 1.6e-67
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12 ( 424) 1114 250.1 3.5e-66
CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 372) 1048 235.8 6.1e-62
CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 391) 1048 235.8 6.4e-62
CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22 ( 445) 951 214.9 1.5e-55
CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 303) 919 207.9 1.2e-53
CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1 ( 379) 914 206.9 3.3e-53
CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 418) 912 206.5 4.8e-53
CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 453) 912 206.5 5.2e-53
CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21 ( 375) 846 192.2 8.5e-49
CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2 ( 360) 630 145.5 9.3e-35
>>CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 (501 aa)
initn: 3326 init1: 3326 opt: 3326 Z-score: 3884.0 bits: 728.2 E(32554): 5.1e-210
Smith-Waterman score: 3326; 100.0% identity (100.0% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQDPQQQLVPKKKRQRFVDKNGRCNVQHGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 MSALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQDPQQQLVPKKKRQRFVDKNGRCNVQHGNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GSETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRGDLNKAHVGNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GSETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRGDLNKAHVGNY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TPCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLFQSILGSIVDAFLIGCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 TPCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLFQSILGSIVDAFLIGCM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 FIKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMVSAQIRCKLLKSRQTPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 FIKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMVSAQIRCKLLKSRQTPE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GEFLPLDQLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLSQRSMQTEQFEIVVILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GEFLPLDQLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLSQRSMQTEQFEIVVILE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 GIVETTGMTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEEGFFKVDYSQFHATFEVPTPPYSVKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 GIVETTGMTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEEGFFKVDYSQFHATFEVPTPPYSVKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 QEEMLLMSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKLQKITGREDFPKKLLRMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 QEEMLLMSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKLQKITGREDFPKKLLRMS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 STTSEKAYSLGDLPMKLQRISSVPGNSEEKLVSKTTKMLSDPMSQSVADLPPKLQKMAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS22 STTSEKAYSLGDLPMKLQRISSVPGNSEEKLVSKTTKMLSDPMSQSVADLPPKLQKMAGG
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KB5 AARMEGNLPAKLRKMNSDRFT
:::::::::::::::::::::
CCDS22 AARMEGNLPAKLRKMNSDRFT
490 500
>>CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 (235 aa)
initn: 1586 init1: 1586 opt: 1586 Z-score: 1857.2 bits: 352.1 E(32554): 4e-97
Smith-Waterman score: 1586; 100.0% identity (100.0% similar) in 234 aa overlap (1-234:1-234)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQDPQQQLVPKKKRQRFVDKNGRCNVQHGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQDPQQQLVPKKKRQRFVDKNGRCNVQHGNL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 GSETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRGDLNKAHVGNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRGDLNKAHVGNY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 TPCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLFQSILGSIVDAFLIGCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TPCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLFQSILGSIVDAFLIGCM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 FIKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMVSAQIRCKLLKSRQTPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FIKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMVSAQIRCKLLKG
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 GEFLPLDQLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLSQRSMQTEQFEIVVILE
>>CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 (419 aa)
initn: 1399 init1: 1399 opt: 1501 Z-score: 1753.7 bits: 333.8 E(32554): 2.3e-91
Smith-Waterman score: 1508; 62.8% identity (83.0% similar) in 358 aa overlap (23-364:16-370)
10 20 30 40
pF1KB5 MSALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQDPQQ--QLVP------------KKKRQRF
:. : : . :.: . :: :: :::.
CCDS84 MAGDSRNAMNQDMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRY
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 VDKNGRCNVQHGNLGSETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIA
..:.:.:::.:::. .:: ::::::::::::::::.::..: ..:::.:::.. .::.::
CCDS84 MEKSGKCNVHHGNV-QETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 YTRGDLNKAHVGN--YTPCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLF
: ::::. :::. . ::: :. .: ::::: ::::.:::::.: ::.::::::::.:
CCDS84 YIRGDLD--HVGDQEWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 QSILGSIVDAFLIGCMFIKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMV
:.::::::.::..::::.:.:::::::::::::..::::::: :: ::::::.:::::.:
CCDS84 QAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 SAQIRCKLLKSRQTPEGEFLPLDQLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLS
:.:: ::.::::: ::::.::.: ...:::.:: :.::::::: : : :. ::::...:
CCDS84 EASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINQKSPFWEMS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 QRSMQTEQFEIVVILEGIVETTGMTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEEGFFKVDYSQ
: ... :.::.::::::.::.::::::::.:: . :::::::: ::..::.::..:::.
CCDS84 QAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 FHATFEVPTPPYSVKEQEEMLLMSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKLQ
:: :.:. :: .:: ::
CCDS84 FHDTYETNTPSCCAKELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLG
360 370 380 390 400 410
>>CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 (423 aa)
initn: 1505 init1: 1403 opt: 1501 Z-score: 1753.6 bits: 333.8 E(32554): 2.3e-91
Smith-Waterman score: 1501; 59.1% identity (83.5% similar) in 369 aa overlap (25-387:29-396)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQ--DPQQQLVP----KKKRQRFVDKN
::. : : : . . :.: ::.: :.
CCDS42 MAKLTESMTNVLEGDSMDQDVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQRYVRKD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GRCNVQHGNLGSETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRG
:.:::.:::. :: :::.:.::::::::::.::.::...:::.:::.. .::.::: ::
CCDS42 GKCNVHHGNV-RETYRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 DLNKAHVGNYTPCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLFQSILGS
:... . ..::::.:. .: ::::: ::::.::::::: :::::::::::.:.::.:::
CCDS42 DMDHIEDPSWTPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 IVDAFLIGCMFIKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMVSAQIRC
::.::..::::.:.::::::::::.:: ::::::::::: ::::::.:::::.: :.::
CCDS42 IVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 KLLKSRQTPEGEFLPLDQLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLSQRSMQT
::.::.:: ::::.::.: ...::. :: :.::::::: : : :. .:::...:. ..
CCDS42 KLIKSKQTSEGEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 EQFEIVVILEGIVETTGMTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEEGFFKVDYSQFHATFE
:..::::::::.::.::::::::.:: .:.:::.:: ::..::.::..:::..:: :.:
CCDS42 EELEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 VPTPPYSVKEQEEMLLMSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKLQKITGRE
. :: :.:: :. . .. ..... ..: .:
CCDS42 TSTPSLSAKELAELASRAELPLSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLEEQTERNGDVANLEN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 DFPKKLLRMSSTTSEKAYSLGDLPMKLQRISSVPGNSEEKLVSKTTKMLSDPMSQSVADL
CCDS42 ESKV
420
>>CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 (393 aa)
initn: 1509 init1: 1369 opt: 1478 Z-score: 1727.3 bits: 328.8 E(32554): 6.8e-90
Smith-Waterman score: 1478; 63.3% identity (87.7% similar) in 332 aa overlap (33-363:10-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 ALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQDPQQQLVPKKK-RQRFVDKNGRCNVQHGNLG
: :. :... :::.:.:.::::::.::.
CCDS11 MAQENAAFSPGQEEPPRRRGRQRYVEKDGRCNVQQGNV-
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 SETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRGDLNKAHVGNYT
:: :::.:::::::::.:: .:..:.:.:...:::....::.::: ::::.. . .:
CCDS11 RETYRYLTDLFTTLVDLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTAWT
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 PCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLFQSILGSIVDAFLIGCMF
::: :. .: .:::: ::::.:::::.: :::.:::::.:.:.:.::::.:.::..::::
CCDS11 PCVNNLNGFVAAFLFSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMF
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 IKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMVSAQIRCKLLKSRQTPEG
.:.:::.::: ::.:: :::.:.:::.: ::::::.::.::.: :.:: ::..:::: ::
CCDS11 VKISQPNKRAATLVFSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEG
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 EFLPLDQLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLSQRSMQTEQFEIVVILEG
::.:: : .:.:::.:: :.:::::::.: : ::: :::.. :.:... ..:::::::::
CCDS11 EFIPLHQTDLSVGFDTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEG
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 IVETTGMTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEEGFFKVDYSQFHATFEVPTPPYSVKEQ
.::.::::::::.:: ::::::::: :..::.::..:::..:: ::::::: :..:
CCDS11 MVEATGMTCQARSSYLVDEVLWGHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVPTPSCSAREL
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 EEMLLMSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKLQKITGREDFPKKLLRMSS
:
CCDS11 AEAAARLDAHLYWSIPSRLDEKVEEEGAGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
340 350 360 370 380 390
>>CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 (427 aa)
initn: 1261 init1: 979 opt: 1266 Z-score: 1479.1 bits: 283.0 E(32554): 4.6e-76
Smith-Waterman score: 1266; 52.3% identity (81.3% similar) in 348 aa overlap (12-355:9-354)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQ----GPGQDPQQQLVPKKKRQRFVDKNGRCNVQ
:..:.. .: : . : :. .. . .. :.::: :.:.::::
CCDS11 MGSVRTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 HGNLGSETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRGDLNKAH
:.: . .:::.:.::: ::..::: : :: :.....:::.. ..:.:: .:::. ..
CCDS11 FINVGEKGQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 VGNYTPCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLFQSILGSIVDAFL
:. ::..: .: .:::: :::..:::::.: .::.:: .... .::::.: :.:::.
CCDS11 EGK--ACVSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 IGCMFIKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMVSAQIRCKLLKSR
:: .. ::..:::: :::.::..:::.:::::: ::.::::::.::.: :..: .:::::
CCDS11 IGAVMAKMAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 QTPEGEFLPLDQLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLSQRSMQTEQFEIV
: :::..::::....:::..: :..:::::.:: : :: ::.::::...... .::::
CCDS11 ITSEGEYIPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 VILEGIVETTGMTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEEGFFKVDYSQFHATFEVPTPPY
:::::.::.:.:: : :.:: .:.:::::. ::. :. ..:::::.:: :.:::. :
CCDS11 VILEGMVEATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPL
300 310 320 330 340 350
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