FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5896, 524 aa
1>>>pF1KB5896 524 - 524 aa - 524 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1060+/-0.00099; mu= 5.2530+/- 0.058
mean_var=235.8330+/-52.579, 0's: 0 Z-trim(111.2): 705 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.083516
statistics sampled from 11364 (12178) to 11364 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.374), width: 16
Scan time: 3.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3 ( 524) 3441 428.2 1.1e-119
CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 559) 1882 240.4 4.2e-63
CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 545) 1879 240.0 5.3e-63
CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 544) 1873 239.3 8.8e-63
CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 565) 1873 239.3 9e-63
CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX ( 580) 1873 239.3 9.1e-63
CCDS44687.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 ( 553) 1744 223.7 4.2e-58
CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 438) 1088 144.6 2.2e-34
CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 ( 591) 1074 143.0 8.9e-34
CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20 ( 719) 1031 137.9 3.7e-32
CCDS10054.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 ( 681) 1006 134.9 2.9e-31
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 818 112.1 1.6e-24
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 804 110.4 4.8e-24
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 786 108.2 2.2e-23
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 416) 775 106.8 4.9e-23
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 769 106.1 8.3e-23
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 769 106.1 8.4e-23
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 426) 757 104.7 2.2e-22
CCDS61590.1 PAK6 gene_id:56924|Hs108|chr15 ( 636) 708 99.0 1.8e-20
CCDS81582.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 812) 709 99.2 1.9e-20
CCDS8082.1 MAP4K2 gene_id:5871|Hs108|chr11 ( 820) 709 99.2 1.9e-20
CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 873) 700 98.1 4.2e-20
CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 894) 700 98.2 4.3e-20
CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1204) 691 97.2 1.1e-19
CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1235) 691 97.2 1.1e-19
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 671 94.7 5.1e-19
CCDS56024.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 ( 853) 663 93.7 9.2e-19
CCDS32601.1 TAOK1 gene_id:57551|Hs108|chr17 (1001) 663 93.8 1e-18
CCDS42564.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 821) 657 92.9 1.5e-18
CCDS59385.1 MAP4K1 gene_id:11184|Hs108|chr19 ( 833) 657 92.9 1.5e-18
CCDS9188.1 TAOK3 gene_id:51347|Hs108|chr12 ( 898) 653 92.5 2.2e-18
CCDS48168.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 339) 629 89.2 8.4e-18
CCDS10662.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1049) 636 90.5 1e-17
CCDS58448.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1122) 636 90.6 1.1e-17
CCDS10663.1 TAOK2 gene_id:9344|Hs108|chr16 (1235) 636 90.6 1.1e-17
CCDS63200.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 349) 618 87.8 2.1e-17
CCDS63199.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 332) 603 86.0 7.3e-17
CCDS54673.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1268) 603 86.6 1.8e-16
CCDS54674.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1276) 603 86.6 1.8e-16
CCDS54677.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1297) 603 86.6 1.8e-16
CCDS54678.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1305) 603 86.6 1.8e-16
CCDS54675.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1323) 603 86.7 1.9e-16
CCDS54676.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1331) 603 86.7 1.9e-16
CCDS54679.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1352) 603 86.7 1.9e-16
CCDS46956.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1360) 603 86.7 1.9e-16
CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 588 84.9 7.4e-16
CCDS45589.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1303) 580 83.9 1.3e-15
CCDS45590.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1312) 580 83.9 1.3e-15
CCDS45588.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1332) 580 83.9 1.3e-15
CCDS66573.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 412) 561 81.1 2.8e-15
>>CCDS3321.1 PAK2 gene_id:5062|Hs108|chr3 (524 aa)
initn: 3441 init1: 3441 opt: 3441 Z-score: 2261.9 bits: 428.2 E(32554): 1.1e-119
Smith-Waterman score: 3441; 100.0% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MSDNGELEDKPPAPPVRMSSTIFSTGGKDPLSANHSLKPLPSVPEEKKPRHKIISIFSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MSDNGELEDKPPAPPVRMSSTIFSTGGKDPLSANHSLKPLPSVPEEKKPRHKIISIFSGT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 EKGSKKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKLEQKKNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EKGSKKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKLEQKKNP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 QAVLDVLKFYDSNTVKQKYLSFTPPEKDGFPSGTPALNAKGTEAPAVVTEEEDDDEETAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QAVLDVLKFYDSNTVKQKYLSFTPPEKDGFPSGTPALNAKGTEAPAVVTEEEDDDEETAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAPVGDSHVDGAAKSLDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAPVGDSHVDGAAKSLDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALGQEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALGQEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB5 LEMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIMAAKEAMKSNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIMAAKEAMKSNR
490 500 510 520
>>CCDS48153.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX (559 aa)
initn: 2525 init1: 1828 opt: 1882 Z-score: 1246.4 bits: 240.4 E(32554): 4.2e-63
Smith-Waterman score: 2579; 73.0% identity (85.9% similar) in 560 aa overlap (3-523:3-557)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSDNGELEDKPPAPPVRMSSTIFSTGGKDPLSANHSLKPLPSVPEEKKPRHKIISIF-SG
:. . :.::::::.::.:. ..: . ::: :::: .::::. . .. ::: .:
CCDS48 MSDGLDNEEKPPAPPLRMNSN-----NRDSSALNHSSKPLPMAPEEKNKKARLRSIFPGG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB5 TEKGSKKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFT---------------GMPEQWAR
.: .::::::::::: :::::::::::::::::::: :.::::::
CCDS48 GDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTPDLYGSQMCPGKLPEGIPEQWAR
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 LLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSN-TVK-QKYLSFTPPEKD--GFPSGTPALNAK
::::::::::::::::::::::::::::. ::. :::.::: .:. :. .. :. .
CCDS48 LLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB5 GTEAPAV--VTEEEDDDEETA------PPVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAP-VGDSHV
..: : . :.::::..:: ::::::::.::::::::::.. . .: : ...:
CCDS48 ASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEV
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260
pF1KB5 DGAA----------KSLDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKIGQGASG
. .. :.:.::.:::::::.::::.:::.:::::::::.:::::::::
CCDS48 TPPSAENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASG
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 TVFTATDVALGQEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLVGDELFV
::.:: :.: ::::::::.:::.::::::::::::::.: :::::::.::::::::::.:
CCDS48 TVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWV
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 VMEYLAGGSLTDVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVLLGMEGS
:::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::.::::::::::::.::::.::
CCDS48 VMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGS
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 VKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEP
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 PYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHPFLK
::::::::::::::::::::::::::.:: .:::::::::::::..::::::::::::::
CCDS48 PYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLK
480 490 500 510 520 530
510 520
pF1KB5 LAKPLSSLTPLIMAAKEAMKSNR
::::::::::::.:::::.:..
CCDS48 LAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
540 550
>>CCDS8250.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 (545 aa)
initn: 2691 init1: 1842 opt: 1879 Z-score: 1244.5 bits: 240.0 E(32554): 5.3e-63
Smith-Waterman score: 2672; 76.6% identity (89.2% similar) in 546 aa overlap (1-523:1-544)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSDNG-ELEDKPPAPPVRMSSTIFSTGGKDPLSANHSLKPLPSVPEEKKPRHKII-SIFS
::.:: ...:::::::.: .::....:.:: . ::. :::: ::::: . .. ::.
CCDS82 MSNNGLDIQDKPPAPPMRNTSTMIGAGSKDAGTLNHGSKPLPPNPEEKKKKDRFYRSILP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GTEKGSKKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKLEQKK
: .: .::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS82 G-DKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKSEQKK
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 NPQAVLDVLKFYDSNTVK--QKYLSFTPPEKDGFPSGTPALNAKG-TEAPAV--VTEEED
:::::::::.::.:. .. :::.::: . . :.. :::.:. .:.::: :.:.::
CCDS82 NPQAVLDVLEFYNSKKTSNSQKYMSFTDKSAEDYNSSN-ALNVKAVSETPAVPPVSEDED
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KB5 DDEETA--PPVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVP---------APVGDSHV-----DGAAKS
::.. : ::::::::.::::.::::::.:.: .:.. .. :. ...
CCDS82 DDDDDATPPPVIAPRPEHTKSVYTRSVIEPLPVTPTRDVATSPISPTENNTTPPDALTRN
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 LDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALGQEVAI
.::::: ::.::::.::::.:::.:::::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::
CCDS82 TEKQKKKPKMSDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTAMDVATGQEVAI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 KQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLTDVVTE
::.:::.::::::::::::::.: :::::::.::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS82 KQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 TCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFCAQITPEQ
:::::.:::::::::::::::::.::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
CCDS82 TCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQ
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 SKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS82 SKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIAT
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 NGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIMAAK
::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::: :::.::::::::::: :::
CCDS82 NGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHQFLKIAKPLSSLTPLIAAAK
480 490 500 510 520 530
520
pF1KB5 EAMKSNR
:: :.:
CCDS82 EATKNNH
540
>>CCDS14554.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX (544 aa)
initn: 2539 init1: 1828 opt: 1873 Z-score: 1240.6 bits: 239.3 E(32554): 8.8e-63
Smith-Waterman score: 2631; 75.1% identity (88.3% similar) in 547 aa overlap (1-523:1-542)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSDNGELEDKPPAPPVRMSSTIFSTGGKDPLSANHSLKPLPSVPEEKKPRHKIISIF-SG
:::. . :.::::::.::.:. ..: . ::: :::: .::::. . .. ::: .:
CCDS14 MSDGLDNEEKPPAPPLRMNSN-----NRDSSALNHSSKPLPMAPEEKNKKARLRSIFPGG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 TEKGSKKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKLEQKKN
.: .::::::::::: :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS14 GDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGIPEQWARLLQTSNITKLEQKKN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 PQAVLDVLKFYDSN-TVK-QKYLSFTPPEKD--GFPSGTPALNAKGTEAPAV--VTEEED
:::::::::::::. ::. :::.::: .:. :. .. :. . ..: : . :.::::
CCDS14 PQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPPLAPPVSEEED
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KB5 DDEETA------PPVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAP-VGDSHVDGAA----------K
..:: ::::::::.::::::::::.. . .: : ...: . .
CCDS14 EEEEEEEDENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPAVPNKEVTPPSAENANSSTLYR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 SLDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALGQEVA
. :.:.::.:::::::.::::.:::.:::::::::.:::::::::::.:: :.: :::::
CCDS14 NTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTALDIATGQEVA
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 IKQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLTDVVT
:::.:::.::::::::::::::.: :::::::.::::::::::.::::::::::::::::
CCDS14 IKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVT
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 ETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFCAQITPE
::::::.:::::::::::::.:::.::::::::::::.::::.:::::::::::::::::
CCDS14 ETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPE
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 QSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIA
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 TNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIMAA
:::::::::::.:: .:::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS14 TNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIIAA
480 490 500 510 520 530
520
pF1KB5 KEAMKSNR
:::.:..
CCDS14 KEAIKNSSR
540
>>CCDS48152.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX (565 aa)
initn: 2420 init1: 1828 opt: 1873 Z-score: 1240.4 bits: 239.3 E(32554): 9e-63
Smith-Waterman score: 2559; 73.0% identity (85.5% similar) in 560 aa overlap (9-523:9-563)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSDNGELEDKPPAPPVRMSSTIFSTGGKDPLSANHSLKPLPSVPEEKKPRHKIISIF-SG
.::::::.::.:. ..: . ::: :::: .::::. . .. ::: .:
CCDS48 MSDGLDNEEKPPAPPLRMNSN-----NRDSSALNHSSKPLPMAPEEKNKKARLRSIFPGG
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB5 TEKGSKKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFT---------------------GM
.: .::::::::::: :::::::::::::::::::: :.
CCDS48 GDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTNSPFQTSRPVTVASSQSEGKMGI
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 PEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSN-TVK-QKYLSFTPPEKD--GFPSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::. :::.::: .:. :. ..
CCDS48 PEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMSFTSGDKSAHGYIAAH
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KB5 PALNAKGTEAPAV--VTEEEDDDEETA------PPVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAP-
:. . ..: : . :.::::..:: ::::::::.::::::::::.. . .:
CCDS48 PSSTKTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPPVIAPRPEHTKSIYTRSVVESIASPA
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KB5 VGDSHV-----DGAAKSL-----DKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKI
: ...: ..: .: :.:.::.:::::::.::::.:::.:::::::::.:::
CCDS48 VPNKEVTPPSAENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKI
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB5 GQGASGTVFTATDVALGQEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLV
::::::::.:: :.: ::::::::.:::.::::::::::::::.: :::::::.::::::
CCDS48 GQGASGTVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLV
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB5 GDELFVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVL
::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::.::::::::::::.:
CCDS48 GDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLHSNQVIHRDIKSDNIL
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KB5 LGMEGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIE
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIE
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KB5 MVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELL
::::::::::::::::::::::::::::::::.:: .:::::::::::::..::::::::
CCDS48 MVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRCLEMDVDRRGSAKELL
480 490 500 510 520 530
500 510 520
pF1KB5 QHPFLKLAKPLSSLTPLIMAAKEAMKSNR
::::::::::::::::::.:::::.:..
CCDS48 QHPFLKLAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
540 550 560
>>CCDS48151.1 PAK3 gene_id:5063|Hs108|chrX (580 aa)
initn: 2626 init1: 1828 opt: 1873 Z-score: 1240.3 bits: 239.3 E(32554): 9.1e-63
Smith-Waterman score: 2472; 71.7% identity (83.2% similar) in 555 aa overlap (29-523:24-578)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSDNGELEDKPPAPPVRMSSTIFSTGGKDPLSANHSLKPLPSVPEEKKPRHKIISIF-SG
: . ::: :::: .::::. . .. ::: .:
CCDS48 MSDGLDNEEKPPAPPLRMNSNNRDSSALNHSSKPLPMAPEEKNKKARLRSIFPGG
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB5 TEKGSKKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFT-----------------------
.: .::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS48 GDKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTNSPFQTSRPVTVASSQSEGKMPD
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KB5 -------------GMPEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSN-TVK-QKYLS
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::. ::. :::.:
CCDS48 LYGSQMCPGKLPEGIPEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLDVLKFYDSKETVNNQKYMS
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190
pF1KB5 FTPPEKD--GFPSGTPALNAKGTEAPAV--VTEEEDDDEETA------PPVIAPRPDHTK
:: .:. :. .. :. . ..: : . :.::::..:: ::::::::.:::
CCDS48 FTSGDKSAHGYIAAHPSSTKTASEPPLAPPVSEEEDEEEEEEEDENEPPPVIAPRPEHTK
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240
pF1KB5 SIYTRSVIDPVPAP-VGDSHVDGAA----------KSLDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIV
:::::::.. . .: : ...: . .. :.:.::.:::::::.::::.::
CCDS48 SIYTRSVVESIASPAVPNKEVTPPSAENANSSTLYRNTDRQRKKSKMTDEEILEKLRSIV
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALGQEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKE
:.:::::::::.:::::::::::.:: :.: ::::::::.:::.::::::::::::::.:
CCDS48 SVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTALDIATGQEVAIKQMNLQQQPKKELIINEILVMRE
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLH
:::::::.::::::::::.::::::::::::::::::::::.:::::::::::::.:::
CCDS48 NKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEGQIAAVCRECLQALDFLH
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 ANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAY
.::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAY
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 GPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: .::::::::
CCDS48 GPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPERLSAVFRDFLNRC
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520
pF1KB5 LEMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIMAAKEAMKSNR
:::::..::::::::::::::::::::::::::.:::::.:..
CCDS48 LEMDVDRRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIIAAKEAIKNSSR
540 550 560 570 580
>>CCDS44687.1 PAK1 gene_id:5058|Hs108|chr11 (553 aa)
initn: 2567 init1: 1718 opt: 1744 Z-score: 1156.6 bits: 223.7 E(32554): 4.2e-58
Smith-Waterman score: 2537; 76.3% identity (89.0% similar) in 519 aa overlap (1-496:1-517)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MSDNG-ELEDKPPAPPVRMSSTIFSTGGKDPLSANHSLKPLPSVPEEKKPRHKII-SIFS
::.:: ...:::::::.: .::....:.:: . ::. :::: ::::: . .. ::.
CCDS44 MSNNGLDIQDKPPAPPMRNTSTMIGAGSKDAGTLNHGSKPLPPNPEEKKKKDRFYRSILP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GTEKGSKKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKLEQKK
: .: .::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS44 G-DKTNKKKEKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWARLLQTSNITKSEQKK
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 NPQAVLDVLKFYDSNTVK--QKYLSFTPPEKDGFPSGTPALNAKG-TEAPAV--VTEEED
:::::::::.::.:. .. :::.::: . . : . :::.:. .:.::: :.:.::
CCDS44 NPQAVLDVLEFYNSKKTSNSQKYMSFTDKSAEDYNS-SNALNVKAVSETPAVPPVSEDED
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KB5 DDEETA--PPVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVP---------APVGDSHV-----DGAAKS
::.. : ::::::::.::::.::::::.:.: .:.. .. :. ...
CCDS44 DDDDDATPPPVIAPRPEHTKSVYTRSVIEPLPVTPTRDVATSPISPTENNTTPPDALTRN
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 LDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALGQEVAI
.::::: ::.::::.::::.:::.:::::::::.:::::::::::.:: ::: ::::::
CCDS44 TEKQKKKPKMSDEEILEKLRSIVSVGDPKKKYTRFEKIGQGASGTVYTAMDVATGQEVAI
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 KQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLTDVVTE
::.:::.::::::::::::::.: :::::::.::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS44 KQMNLQQQPKKELIINEILVMRENKNPNIVNYLDSYLVGDELWVVMEYLAGGSLTDVVTE
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 TCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFCAQITPEQ
:::::.:::::::::::::::::.::::::::::::.::::.::::::::::::::::::
CCDS44 TCMDEGQIAAVCRECLQALEFLHSNQVIHRDIKSDNILLGMDGSVKLTDFGFCAQITPEQ
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 SKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS44 SKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMIEGEPPYLNENPLRALYLIAT
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 NGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIMAAK
::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NGTPELQNPEKLSAIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQVRKLRFQVFSNFSMIAASIPE
480 490 500 510 520 530
520
pF1KB5 EAMKSNR
CCDS44 DCQAPLQPHSTDCCS
540 550
>>CCDS33019.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 (438 aa)
initn: 1240 init1: 1035 opt: 1088 Z-score: 730.6 bits: 144.6 E(32554): 2.2e-34
Smith-Waterman score: 1222; 43.0% identity (68.8% similar) in 458 aa overlap (67-513:4-432)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 LKPLPSVPEEKKPRHKIISIFSGTEKGSKKKEKERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFT
:.:.: ::: ::.::: .:.::: .::
CCDS33 MFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFT
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 GMPEQWARLLQTSNITKLEQKKNPQAVLD--VLKFYDSNTVKQKYLSFTP--PEKDGF--
:.:.:: :.. :. . :. ..: . . .. : . . .: : :.
CCDS33 GLPRQWQSLIE-------ESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKGEPHDVAPNGPSAGGLAI
40 50 60 70 80
160 170 180 190 200
pF1KB5 P-----SGTPALNAKGTEAPAVVTEEEDDDEETAPPVIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAP
: :. : :.:. .:.:. . .. . :::. .: . ::.:
CCDS33 PQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQ-LAPPACTP------------AAPAVPGP
90 100 110 120 130
210 220 230 240 250 260
pF1KB5 VGDSHVDGAAKSLDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFT
: . :.. ... :.. :. .:. :::.. . :::.:..: :
CCDS33 PGPR---------SPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCI
140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 ATDVALGQEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEY
:: . :. ::.:...:.:: ..::..::...:.. .. :.:.. .::::::::.::::.
CCDS33 ATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEF
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KB5 LAGGSLTDVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLT
: ::.:::.::.: :.: :::::: :::: :::. :::::::::..:: .: :::.
CCDS33 LEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLS
250 260 270 280 290 300
390 400 410 420 430 440
pF1KB5 DFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLN
:::::::.. : .:...::::::::::...: :::.:::::::::.::::.:::::.:
CCDS33 DFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFN
310 320 330 340 350 360
450 460 470 480 490 500
pF1KB5 ENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRCLEMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKP
: ::.:. .: : :.:.: .:.:: .. ::.: : : .:..: :::.:::: : :
CCDS33 EPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGP
370 380 390 400 410 420
510 520
pF1KB5 LSSLTPLIMAAKEAMKSNR
.:..::.
CCDS33 PASIVPLMRQNRTR
430
>>CCDS12528.1 PAK4 gene_id:10298|Hs108|chr19 (591 aa)
initn: 1223 init1: 1035 opt: 1074 Z-score: 719.9 bits: 143.0 E(32554): 8.9e-34
Smith-Waterman score: 1088; 46.1% identity (72.4% similar) in 362 aa overlap (152-513:246-585)
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 AVLDVLKFYDSNTVKQKYLSFTPPEKDGFPSGTPALNAKGTEAPAVVTEEEDDDEETAPP
:. : :.:. .:.:. . .. . :::
CCDS12 PSRGAQGEPHDVAPNGPSAGGLAIPQSSSSSSRPPTRARGAPSPGVLGPHASEPQ-LAPP
220 230 240 250 260 270
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VIAPRPDHTKSIYTRSVIDPVPAPVGDSHVDGAAKSLDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVS
. .: . ::.: : . :.. ... :.. :. .:.
CCDS12 ACTP------------AAPAVPGPPGPR---------SPQREPQRVSHEQFRAALQLVVD
280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 IGDPKKKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALGQEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKEL
:::.. . :::.:..: : :: . :. ::.:...:.:: ..::..::...:..
CCDS12 PGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDY
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 KNPNIVNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHA
.. :.:.. .::::::::.::::.: ::.:::.::.: :.: :::::: :::: :::
CCDS12 QHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHA
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 NQVIHRDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYG
. :::::::::..:: .: :::.:::::::.. : .:...::::::::::...: ::
CCDS12 QGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYG
440 450 460 470 480 490
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 PKVDIWSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRCL
:.:::::::::.::::.:::::.:: ::.:. .: : :.:.: .:.:: .. ::.: :
CCDS12 PEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLL
500 510 520 530 540 550
490 500 510 520
pF1KB5 EMDVEKRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIMAAKEAMKSNR
: .:..: :::.:::: : : .:..::.
CCDS12 VRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR
560 570 580 590
>>CCDS13107.1 PAK5 gene_id:57144|Hs108|chr20 (719 aa)
initn: 1187 init1: 1007 opt: 1031 Z-score: 690.9 bits: 137.9 E(32554): 3.7e-32
Smith-Waterman score: 1031; 50.2% identity (79.1% similar) in 297 aa overlap (217-513:419-713)
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 PDHTKSIYTRSVIDPVPAPVGDSHVDGAAKSLDKQKKKTKMTDEEIMEKLRTIVSIGDPK
: :.: .... :.. :. .:: :::.
CCDS13 QSSSQYISTASYLSSLSLSSSTYPPPSWGSSSDQQP--SRVSHEQFRAALQLVVSPGDPR
390 400 410 420 430 440
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KKYTRYEKIGQGASGTVFTATDVALGQEVAIKQINLQKQPKKELIINEILVMKELKNPNI
. . . :::.:..: : ::. :..::.:...:.:: ..::..::...:.. .. :.
CCDS13 EYLANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYHHDNV
450 460 470 480 490 500
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 VNFLDSYLVGDELFVVMEYLAGGSLTDVVTETCMDEAQIAAVCRECLQALEFLHANQVIH
:.. .::::::::.::::.: ::.:::.::.: :.: :::.:: :.:: .:: . :::
CCDS13 VDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIH
510 520 530 540 550 560
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 RDIKSDNVLLGMEGSVKLTDFGFCAQITPEQSKRSTMVGTPYWMAPEVVTRKAYGPKVDI
::::::..:: .: .::.:::::::.. : ::...:::::::::::..: :: .:::
CCDS13 RDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQVSKEVPKRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDI
570 580 590 600 610 620
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 WSLGIMAIEMVEGEPPYLNENPLRALYLIATNGTPELQNPEKLSPIFRDFLNRCLEMDVE
::::::.:::..:::::.:: ::.:. : . :.... .:.: ..: ::. : .
CCDS13 WSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRIRDSLPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPS
630 640 650 660 670 680
490 500 510 520
pF1KB5 KRGSAKELLQHPFLKLAKPLSSLTPLIMAAKEAMKSNR
.:..:.::: ::::::: : : ..::.
CCDS13 QRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLMRQYRHH
690 700 710
524 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 20:26:52 2016 done: Mon Nov 7 20:26:52 2016
Total Scan time: 3.080 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]