Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5846
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5846, 485 aa
1>>>pF1KB5846 485 - 485 aa - 485 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9247+/-0.00113; mu= 10.6555+/- 0.066
mean_var=198.0170+/-40.124, 0's: 0 Z-trim(108.5): 939 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.091143
statistics sampled from 9240 (10268) to 9240 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16
Scan time: 3.320
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4643.1 ZNF165 gene_id:7718|Hs108|chr6 ( 485) 3323 450.3 2.2e-126
CCDS5681.1 ZSCAN21 gene_id:7589|Hs108|chr7 ( 473) 1090 156.6 5.3e-38
CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6 ( 545) 1003 145.3 1.6e-34
CCDS14649.1 ZNF449 gene_id:203523|Hs108|chrX ( 518) 904 132.2 1.3e-30
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 799 118.4 1.9e-26
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 800 118.7 2e-26
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 785 116.5 6.1e-26
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 785 116.5 6.5e-26
CCDS43429.1 ZNF391 gene_id:346157|Hs108|chr6 ( 358) 781 115.8 7.6e-26
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 779 115.7 1.1e-25
CCDS6398.1 GLI4 gene_id:2738|Hs108|chr8 ( 376) 774 114.9 1.5e-25
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 774 115.2 1.9e-25
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 774 115.2 2e-25
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 774 115.2 2.1e-25
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 774 115.3 2.1e-25
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 774 115.3 2.2e-25
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 766 114.1 3.7e-25
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 768 114.5 3.7e-25
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 766 114.1 3.9e-25
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 766 114.1 4e-25
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 767 114.3 4e-25
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 766 114.1 4e-25
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 767 114.3 4e-25
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 767 114.4 4.1e-25
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 766 114.2 4.2e-25
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 766 114.2 4.3e-25
CCDS34357.1 ZNF311 gene_id:282890|Hs108|chr6 ( 666) 766 114.2 4.4e-25
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 764 113.8 4.6e-25
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 764 113.8 4.7e-25
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 763 113.7 5.3e-25
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 763 113.8 5.7e-25
CCDS77368.1 ZNF773 gene_id:374928|Hs108|chr19 ( 441) 758 112.9 7e-25
CCDS33134.1 ZNF773 gene_id:374928|Hs108|chr19 ( 442) 758 112.9 7.1e-25
CCDS12414.2 ZNF681 gene_id:148213|Hs108|chr19 ( 645) 760 113.4 7.5e-25
CCDS12440.2 ZNF792 gene_id:126375|Hs108|chr19 ( 632) 759 113.3 8.1e-25
CCDS12959.2 ZNF551 gene_id:90233|Hs108|chr19 ( 670) 759 113.3 8.4e-25
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 754 112.3 9e-25
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 757 113.0 9.5e-25
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 755 112.6 9.6e-25
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 754 112.4 1.1e-24
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 755 112.7 1.1e-24
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 755 112.7 1.1e-24
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 754 112.5 1.1e-24
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 756 112.9 1.1e-24
CCDS33130.1 ZNF543 gene_id:125919|Hs108|chr19 ( 600) 755 112.7 1.1e-24
CCDS2718.2 ZNF35 gene_id:7584|Hs108|chr3 ( 527) 752 112.2 1.4e-24
CCDS82335.1 ZNF529 gene_id:57711|Hs108|chr19 ( 458) 751 112.0 1.4e-24
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 751 112.1 1.4e-24
CCDS54256.1 ZNF529 gene_id:57711|Hs108|chr19 ( 563) 751 112.1 1.6e-24
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 750 112.1 1.8e-24
>>CCDS4643.1 ZNF165 gene_id:7718|Hs108|chr6 (485 aa)
initn: 3323 init1: 3323 opt: 3323 Z-score: 2382.4 bits: 450.3 E(32554): 2.2e-126
Smith-Waterman score: 3323; 99.4% identity (99.6% similar) in 485 aa overlap (1-485:1-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MATEPKKAAAQNSPEDEGLLIVKIGEEEFIHGQDTCLQRSELLKQELCRQLFRQFCYQDS
:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MATEPKKAAAQNSPEDEGLLIVKIEEEEFIHGQDTCLQRSELLKQELCRQLFRQFCYQDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 PGPREALSRLRELCCQWLKPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPGDLQAWVHEHYPESGEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PGPREALSRLRELCCQWLKPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPGDLQAWVHEHYPESGEEA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 VTILEDLERGTDEAVLQVQAHEHGQEIFQKKVSPPGPALNVKLQPVETKAHFDSSEPQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VTILEDLERGTDEAVLQVQAHEHGQEIFQKKVSPPGPALNVKLQPVETKAHFDSSEPQLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 WDCDNESENSRSMPKLEIFEKIESQRIISGRISGYISEASGESQDICKSAGRVKRQWEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 WDCDNESENSRSMPKLEIFEKIESQRIISGRISGYISEASGESQDICKSAGRVKRQWEKE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 SGESQRLSSAQDEGFGKILTHKNTVRGEIISHDGCERRLNLNSNEFTHQKSCKHGTCDQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SGESQRLSSAQDEGFGKILTHKNTVRGEIISHDGCERRLNLNSNEFTHQKSCKHGTCDQS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SKWNSDFINHQIIYAGEKNHQYGKSFKSPKLAKHAAVFSGDKTHQCNECGKAFRHSSKLA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FKWNSDFINHQIIYAGEKNHQYGKSFKSPKLAKHAAVFSGDKTHQCNECGKAFRHSSKLA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 RHQRIQTGERCYECNECGKSFAESSDLTRHRRIHTGERPFGCKECGRAFNLNSHLIRHQR
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RHQRIHTGERCYECNECGKSFAESSDLTRHRRIHTGERPFGCKECGRAFNLNSHLIRHQR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 IHTREKPYECSECGKTFRVSSHLIRHFRIHTGEKPYECSECGRAFSQSSNLSQHQRIHMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IHTREKPYECSECGKTFRVSSHLIRHFRIHTGEKPYECSECGRAFSQSSNLSQHQRIHMR
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ENLLM
:::::
CCDS46 ENLLM
>>CCDS5681.1 ZSCAN21 gene_id:7589|Hs108|chr7 (473 aa)
initn: 2407 init1: 578 opt: 1090 Z-score: 795.7 bits: 156.6 E(32554): 5.3e-38
Smith-Waterman score: 1140; 41.2% identity (67.8% similar) in 478 aa overlap (14-481:17-469)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MATEPKKAAAQNSPEDE-GLLIVKIGEEEFIHGQDTCLQRSELLKQ-ELCRQLFRQF
:... : :.::. :.: .... : . :. :: ::::
CCDS56 MMTKVLGMAPVLGPRPPQEQVGPLMVKVEEKE---------EKGKYLPSLEMFRQRFRQF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 CYQDSPGPREALSRLRELCCQWLKPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPGDLQAWVHEHYPE
:.:.::::::::.:: :::.::.::::::::::::::::::::::: .:::::.:: ::
CCDS56 GYHDTPGPREALSQLRVLCCEWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPQELQAWVQEHCPE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SGEEAVTILEDLERGTDEAVLQVQAHEHGQEIFQKKVSPPGPAL----NVKLQPVETKAH
:.:::::.:::::: :: ::.. . :. .:.: : : ... ::.::. .
CCDS56 SAEEAVTLLEDLERELDEPGHQVSTPPNEQKPVWEKISSSGTAKESPSSMQPQPLETSHK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 FDSSEPQLLWDCDNESENSRSMPKLEIFEKIESQRIISGRISGYISEASGESQDICKSAG
..: : . . .:.: ... :.. . ... . . .: ::: : . :: .
CCDS56 YESWGPLYIQESGEEQEFAQDPRKVRDCRLSTQHEESADEQKG--SEAEGLKGDIISV--
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 RVKRQWEKESGESQRLSSAQDEGFGKILTHKNTVRGEIISHDGCERRLNLNSNEFTHQKS
. . . : : : .. ...: : . .. .: : .. .. ..
CCDS56 -IIANKPEASLERQCVNLENEKGTKPPLQEAGSKKG----------RESVPTKPTPGERR
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KB5 CKHGTCDQSSKWNSDFINHQIIYAGEKNH---QYGKSFK-SPKLAKHAAVFSGDKTHQCN
. : .. . .:.. .:. ..::: . . ::.:. : .:. : . :. ..:
CCDS56 YICAECGKAFSNSSNLTKHRRTHTGEKPYVCTKCGKAFSHSSNLTLHYRTHLVDRPYDC-
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 ECGKAFRHSSKLARHQRIQTGERCYECNECGKSFAESSDLTRHRRIHTGERPFGCKECGR
.::::: .:: : .:::..: : :.:..:::.:. ...: :: ::::::.:. :.:::.
CCDS56 KCGKAFGQSSDLLKHQRMHTEEAPYQCKDCGKAFSGKGSLIRHYRIHTGEKPYQCNECGK
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 AFNLNSHLIRHQRIHTREKPYECSECGKTFRVSSHLIRHFRIHTGEKPYECSECGRAFSQ
.:. .. : :::.:: ::::.:.::::.: ::.. .: ::::::::: : .::..: .
CCDS56 SFSQHAGLSSHQRLHTGEKPYKCKECGKAFNHSSNFNKHHRIHTGEKPYWCHHCGKTFCS
400 410 420 430 440 450
470 480
pF1KB5 SSNLSQHQRIHMRENLLM
.::::.:::.: :
CCDS56 KSNLSKHQRVHTGEGEAP
460 470
>>CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6 (545 aa)
initn: 1188 init1: 809 opt: 1003 Z-score: 733.2 bits: 145.3 E(32554): 1.6e-34
Smith-Waterman score: 1099; 41.9% identity (64.6% similar) in 497 aa overlap (1-483:1-459)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MATEPKKAAAQN--SPEDE-GLLIVKIGEEE----FIHGQDTCLQRSELLKQELCRQLFR
:: ::.: :: . : ::. ::: ::. .:: . . : : : :: ::
CCDS46 MAREPRKNAALDAQSAEDQTGLLTVKVEKEEASALTAEVRAPC---SPARGPERSRQRFR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 QFCYQDSPGPREALSRLRELCCQWLKPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPGDLQAWVHEHY
: : .. ::::::::::::: :::.::.:.:::::::::::::::::::.::.::.:..
CCDS46 GFRYPEAAGPREALSRLRELCGQWLQPEMHSKEQILELLVLEQFLTILPGNLQSWVREQH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 PESGEEAVTILEDLERGTDEAVLQVQAHEHGQEIFQKKV---SPPGPALNVKLQPVETKA
::::::.:..:: ::: :: . :: . ..:::.. :. . . . . ::...
CCDS46 PESGEEVVVLLEYLERQLDEPAPQVPVGDQGQELLCCKMALLTQTQGSQSSQCQPMKALF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 HFDSSEPQLLWDCDNESENSRSMPKLEIFEKIESQRIISGRISGYISEASGESQDICKSA
. .: : : : ..: : . . ....:.. :.. . .:. :
CCDS46 KHESLGSQPLHD------RVLQVPGLAQGGCCREDAMVASRLTPG-SQGLLKMEDV---A
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB5 GRVKRQWEKESGESQRLSSAQDEGFGKILTHKNTVR--GEIISHDGCERRLNLNSN--EF
. : . .:.... .:: : .:.. : ::: ... : : .. :
CCDS46 LTLTPGWTQL--DSSQVNLYRDE---KQENHSSLVSLGGEIQTKS---RDLPPVKKLPEK
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 THQKSCKHGTCDQSSKWNSDFINHQIIYAGEKNHQYGKSFKSPKLAKHAAVFSGDKTHQC
: : : : : . :: .: ..: :. .. : : :.. : :
CCDS46 EHGKIC-HLREDIA----------QIPTHAEAGEQEGRLQRKQKNAI------GSRRHYC
280 290 300 310 320
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 NECGKAFRHSSKLARHQRIQTGERCYECNECGKSFAESSDLTRHRRIHTGERPFGCKECG
.::::.: .:: :..:.::.:::. :::..:::.: :: :. :.:.::::.:. :.:::
CCDS46 HECGKSFAQSSGLTKHRRIHTGEKPYECEDCGKTFIGSSALVIHQRVHTGEKPYECEECG
330 340 350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 RAFNLNSHLIRHQRIHTREKPYECSECGKTFRVSSHLIRHFRIHTGEKPYECSECGRAFS
..:. .:.::.::: :: ::::::..::::: : :..: .::::::::.:. ::.::
CCDS46 KVFSHSSNLIKHQRTHTGEKPYECDDCGKTFSQSCSLLEHHKIHTGEKPYQCNMCGKAFR
390 400 410 420 430 440
470 480
pF1KB5 QSSNLSQHQRIHMRENLLM
..:.: .::::: .:.
CCDS46 RNSHLLRHQRIHGDKNVQNPEHGESWESQGRTESQWENTEAPVSYKCNECERSFTRNRSL
450 460 470 480 490 500
>>CCDS14649.1 ZNF449 gene_id:203523|Hs108|chrX (518 aa)
initn: 2821 init1: 537 opt: 904 Z-score: 663.1 bits: 132.2 E(32554): 1.3e-30
Smith-Waterman score: 936; 37.1% identity (64.7% similar) in 456 aa overlap (46-481:27-460)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 DEGLLIVKIGEEEFIHGQDTCLQRSELLKQELCRQLFRQFCYQDSPGPREALSRLRELCC
:. :: :::: :... ::.::...: ::::
CCDS14 MAVALGCAIQASLNQGSVFQEYDTDCEVFRQRFRQFQYREAAGPHEAFNKLWELCC
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120 130
pF1KB5 QWLKPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPGDLQAWVHEHYPESGEEAVTILEDLERGTDEAV
:::::....:::::::::::::::::: ....::.:: ::. :..:...:::.: .
CCDS14 QWLKPKMRSKEQILELLVLEQFLTILPTEIETWVREHCPENRERVVSLIEDLQRELEIPE
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180
pF1KB5 LQVQAHEHGQEIFQKKVS---PP-----GPALNV----KLQPVETKAHFDSSEPQLLW--
::. :. : . . :: .:::.: . :: ... :.: .
CCDS14 QQVDMHDMLLEELAPVGTAHIPPTMHLESPALQVMGPAQEAPVAEAWIPQAGPPELNYGA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB5 --DCDNESENSRSMPKLEIFEKIESQRIISGRISGYISEA--SGESQDICKSAGRVKRQW
.:.: . . .:::.. ..:. : ...: : : ... : .. .
CCDS14 TGECQNFLDPGYPLPKLDMNFSLEN------REEPWVKELQDSKEMKQLLDS--KIGFEI
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 EKESGESQRLSSAQDEGFGKILTHK-NTVRGEIISHDGCERRLNLNSNEFTHQKSCKHGT
:. :. .. .. . :.: . :...: :...: ..:... : .. .
CCDS14 GIENEEDTSKQKKMETMYPFIVTLEGNALQGPILQKD----YVQLENQWETPPEDLQ---
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 CDQSSKWNSDFINHQIIYAGEKNHQYGKSFKSPKLAK-HAAVFSGDKTHQCNECGKAFRH
: .. ....: :: .. .... : : : :.: :.: .::: : .
CCDS14 TDLAK-----LVDQQNPTLGETPEN--SNLEEPLNPKPHKKKSPGEKPHRCPQCGKCFAR
290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
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.:.:. ::::..::. ..: :::: : .:::: ::.:.::::::. : : . :. :::
CCDS14 KSQLTGHQRIHSGEEPHKCPECGKRFLRSSDLYRHQRLHTGERPYECTVCKKRFTRRSHL
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: ::: :..:. :.: ::::.: .: : ::.. ::::::..: .::..::. . :. ::
CCDS14 IGHQRTHSEEETYKCLECGKSFCHGSSLKRHLKTHTGEKPHRCHNCGKSFSRLTALTLHQ
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480
pF1KB5 RIHMRENLLM
: : .:
CCDS14 RTHTEERPFKCNYCGKSFRQRPSLVIHLRIHTGEKPYKCTHCSKSFRQRAGLIMHQVTHF
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CCDS45 QETPGPREALSRLQELCYQWLMPELHTKEQILELLVLEQFLSILPEELQIWVQQHNPESG
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:::::.:::::: :. :: : .: . : .. . ...:::..:. . :
CCDS45 EEAVTLLEDLEREFDDPGQQVPASPQGPAVPWKDLTCLRASQESTDIHLQPLKTQ--LKS
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.: : : :::.. : : :. .:: . . ::: ::. .
CCDS45 WKPCLSPKSD--CENSETATKEGISEE-KSQGLPQEPSFRGISE--HESNLV--------
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:.. :. ...: : .. : :.... :.:. . .. .: :: : :... . ::
CCDS45 --WKQGSATGEKLRSPSQGGSFSQVIFTNKSLGKRDL--YDEAERCLILTTDSIMCQKVP
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CCDS45 PEERPYRCDVCGHSFKQHSSLTQHQRIHTGEKPYKCNQCGKAFSLRSYLIIHQRIHSGEK
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...:.:::::: .:: : ::..:.:::. .::::::.:..:: : :.::::::.:. :
CCDS45 AYECSECGKAFNQSSALIRHRKIHTGEKACKCNECGKAFSQSSYLIIHQRIHTGEKPYEC
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CCDS45 NECGKTFSQSSKLIRHQRIHTGERPYECNECGKAFRQSSELITHQRIHSGEKPYECSECG
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.::: :::: .::::: :
CCDS45 KAFSLSSNLIRHQRIHSGEEPYQCNECGKTFKRSSALVQHQRIHSGDEAYICNECGKAFR
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CCDS47 ECSAFDRNLNLDQNVVRLQRNKTGERVFKCDICSKTFKYNSDLSRHQRSHTGEKPYECGR
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CCDS47 CGRAFTHSSNLVLHHHIHTGNKPFKCDECGKTFGLNSHLRLHRRIHTGEKPFGCGECGKA
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CCDS47 FSRSSTLIQHRIIHTGEKPYKCNECGRGFSQSPQLTQHQRIHTGEKPHECSHCGKAFSRS
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CCDS47 SSLIQHERIHTGEKPHKCNQCGKAFSQSSSLFLHHRVHTGEKPYVCNECGRAFGFNSHLT
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CCDS47 EHVRIHTGEKPYVCNECGKAFRRSSTLVQHRRVHTGEKPYQCVECGKAFSQSSQLTLHQR
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.: :
CCDS47 VHTGEKPYDCGDCGKAFSRRSTLIQHQKVHSGETRKCRKHGPAFVHGSSLTADGQIPTGE
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CCDS43 EWKRLEPAQRDLYRDVMLENYGNVFSLDRETRTENDQEISEDTRSHGVLLGRFQKDISQG
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CCDS43 SFTVNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNRTSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQ
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CCDS43 SSHLIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSALILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTL
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CCDS43 THHQRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQ
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CCDS43 RIHTGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHT
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CCDS43 GEKPLNGIGMSKSSLRVTTELNIREST
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pF1KB5 PGPALNVKLQPVETKAHFD-------SSEPQLLWDCDNESENSRSMPK-----LEIFEKI
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CCDS11 PSGLMIFKKSPSSEKDRENNESERGCSPSPNLVTHQGDTTEGVSAFATSGQNFLEILESN
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pF1KB5 ESQRIISGRISGYISEASGESQDICKSAGRVKRQWEKESGESQRLSSAQD----EGFGKI
..:: . ::. :: :.. : ... . .:. :.. . ::
CCDS11 KTQR-----------SSVGEKPHTCKECGKAFNQ-NSHLIQHMRVHSGEKPFECKECGKT
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pF1KB5 LTHKNTVRGEIISHDG-----CER--RLNLNSNEFTHQKSCKHGT----CDQSSK---WN
. ....: .. : : :.. . ..:... :.. . : :.. .: :
CCDS11 FGTNSSLRRHLRIHAGEKPFACNECGKAFIQSSHLIHHHRIHTGERPYKCEECGKAFSQN
180 190 200 210 220 230
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pF1KB5 SDFINHQIIYAGEKNHQY---GKSFK-SPKLAKHAAVFSGDKTHQCNECGKAFRHSSKLA
: .: :: :..::: .. ::.:. : .: .: . . .. :.::::::::.::: :
CCDS11 SALILHQRIHTGEKPYECNECGKTFRVSSQLIQHQRIHTEERYHECNECGKAFKHSSGLI
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:::.:.:::. : ::::::.:..::.: ::.:::::..:. :.:::..:. ::..::: :
CCDS11 RHQKIHTGEKPYLCNECGKGFGQSSELIRHQRIHTGDKPYECNECGKTFGQNSEIIRHIR
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pF1KB5 IHTREKPYECSECGKTFRVSSHLIRHFRIHTGEKPYECSECGRAFSQSSNLSQHQRIHMR
::: :::: :.::::.:: .:.:.:: ::::::::::: :::.:: ..:.: :::::
CCDS11 IHTGEKPYVCKECGKAFRGNSELLRHERIHTGEKPYECFECGKAFRRTSHLIVHQRIHTG
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pF1KB5 ENLLM
:
CCDS11 EKPHQCNECARTFWDNSELLLHQKIHIGEKPYECSECEKTFSQHSQLIIHQRIHTGEKPY
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CCDS43 PAQKKSSFENTVVRKVSVTLKEIFTGEEGPESSEFSLSPNLDAQQKIPKGHGSPISRKNS
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pF1KB5 V-RGEIISHDGCERRLNLNSNEFTHQKSCKHGTCDQSSKWNSDFINHQIIYAGEKN---H
...:.: .:: :...: :: . :... ...::.. :. :..::: .
CCDS43 KDNSDLIKH----QRL------FSQRKPCKCNECEKAFSYQSDLLVHSRIHGGEKPFECN
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. :::: .: .: .: . .:.: ..:::::::: .:..:. ::::.:::. :::.::::
CCDS43 KCGKSFSRSTHLIEHQRTHTGEKPYECNECGKAFSRSTHLSLHQRIHTGEKPYECSECGK
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CCDS43 AFSRSTNLSQHQRTHTQERPYKCNECGKAFGDRSTIIQHQRIHTGENPYECSKCGKAFSW
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CCDS43 ISSLTEHQRTHTGENPYECSECGKVFSRSSSLTEHQRIHSGEKPHECRVCGKGFSRSSSL
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CCDS43 IIHQRTHTGEKPYKCNDCGKAFCQSSTLIRHQHLHTKE
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pF1KB5 EIFEKIESQRIISGRISGYISEASGESQDICKSAGRVKRQWEKESGESQRL----SSAQD
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CCDS12 IFTPEYMPTFIQQTFLTLHQIINNEDRPYECKKCGKAFSQ-NSQFIQHQRIHIGEKSYEC
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CCDS12 KECGKFFSCGSHVTRHLKIHTGEKPFECKECGKAFSCSSYLSQHQRIHTGKKPYECKE--
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CCDS12 CGKAFSYCSNLIDHQRIHTGEKPYECKVCGKAFTKSSQLFQHARIHTGEKPYECKECGKA
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CCDS12 FTQSSKLVQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSALTNHQRIHTGEKPYDCKECGKAFTQS
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CCDS12 SQLRQHQRIHAGEKPFECLECGKAFTQNSQLFQHQRIHTDEKPYECNECGKAFNKCSNLT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]