Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5762
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5762, 751 aa
1>>>pF1KB5762 751 - 751 aa - 751 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2581+/-0.000858; mu= 21.0062+/- 0.052
mean_var=77.3815+/-15.289, 0's: 0 Z-trim(107.6): 17 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.145799
statistics sampled from 9667 (9679) to 9667 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.665), E-opt: 0.2 (0.297), width: 16
Scan time: 2.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43679.1 AOC1 gene_id:26|Hs108|chr7 ( 751) 5253 1114.9 0
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CCDS74071.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 ( 634) 905 200.3 8.1e-51
CCDS45690.1 AOC2 gene_id:314|Hs108|chr17 ( 729) 872 193.4 1.1e-48
CCDS62198.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 ( 220) 639 143.9 2.5e-34
>>CCDS43679.1 AOC1 gene_id:26|Hs108|chr7 (751 aa)
initn: 5253 init1: 5253 opt: 5253 Z-score: 5967.6 bits: 1114.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5253; 99.7% identity (99.9% similar) in 751 aa overlap (1-751:1-751)
10 20 30 40 50 60
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CCDS43 MPALGWAVAAILMLQTAMAEPSPGTLPRKAGVFSDLSNQELKAVHSFLWSKKELRLQPSS
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TTTMAKNTVFLIEMLLPKKYHVLRFLDKGERHPVREARAVIFFGDQEHPNVTEFAVGPLP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GPCYMRALSPRPGYQSSWASRPISTAEYALLYHTLQEATKPLHQFFLNTTGFSFQDCHDR
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CLAFTDVAPRGVASGQRRSWLIIQRYVEGYFLHPTGLELLVDHGSTDAGHWAVEQVWYNG
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KFYGSPEELARKYADGEVDVVVLEDPLPGGKGHDSTEEPPLFSSHKPRGDFPSPIHVSGP
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RLVQPHGPRFRLEGNAVLYGGWSFAFRLRSSSGLQVLNVHFGGERIAYEVSVQEAVALYG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GHTPAGMQTKYLDVGWGLGSVTHELAPGIDCPETATFLDTFHYYDADDPVHYPRALCLFE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MPTGVPLRRHFNSNFKGGFNFYAGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 ATGYVHATFYTPEGLRHGTRLHTHLIGNIHTHLVHYRVDLDVAGTKNSFQTLQMKLENIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ATGYVHATFYTPEGLRHGTRLHTHLIGNIHTHLVHYRVDLDVAGTKNSFQTLQMKLENIT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 NPWSPRHRVVQPTLEQTQYSWERQAAFRFKRKLPKYLLFTSPQENPWGHKRSYRLQIHSM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS43 NPWSPRHRVVQPTLEQTQYSWERQAAFRFKRKLPKYLLFTSPQENPWGHKRTYRLQIHSM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 ADQVLPPGWQEEQAITWARYPLAVTKYRESELCSSSIYHQNDPWDPPVVFEQFLHNNENI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS43 ADQVLPPGWQEEQAITWARYPLAVTKYRESELCSSSIYHQNDPWHPPVVFEQFLHNNENI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 ENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASRDTVIVWPRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFFPEDPSLASRDTVIVWPRD
670 680 690 700 710 720
730 740 750
pF1KB5 NGPNYVQRWIPEDRDCSMPPPFSYNGTYRPV
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NGPNYVQRWIPEDRDCSMPPPFSYNGTYRPV
730 740 750
>>CCDS64797.1 AOC1 gene_id:26|Hs108|chr7 (770 aa)
initn: 4303 init1: 4303 opt: 4303 Z-score: 4887.5 bits: 915.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5205; 97.3% identity (97.4% similar) in 770 aa overlap (1-751:1-770)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MPALGWAVAAILMLQTAMAEPSPGTLPRKAGVFSDLSNQELKAVHSFLWSKKELRLQPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MPALGWAVAAILMLQTAMAEPSPGTLPRKAGVFSDLSNQELKAVHSFLWSKKELRLQPSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TTTMAKNTVFLIEMLLPKKYHVLRFLDKGERHPVREARAVIFFGDQEHPNVTEFAVGPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TTTMAKNTVFLIEMLLPKKYHVLRFLDKGERHPVREARAVIFFGDQEHPNVTEFAVGPLP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GPCYMRALSPRPGYQSSWASRPISTAEYALLYHTLQEATKPLHQFFLNTTGFSFQDCHDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GPCYMRALSPRPGYQSSWASRPISTAEYALLYHTLQEATKPLHQFFLNTTGFSFQDCHDR
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CLAFTDVAPRGVASGQRRSWLIIQRYVEGYFLHPTGLELLVDHGSTDAGHWAVEQVWYNG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KFYGSPEELARKYADGEVDVVVLEDPLPGGKGHDSTEEPPLFSSHKPRGDFPSPIHVSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KFYGSPEELARKYADGEVDVVVLEDPLPGGKGHDSTEEPPLFSSHKPRGDFPSPIHVSGP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 RLVQPHGPRFRLEGNAVLYGGWSFAFRLRSSSGLQVLNVHFGGERIAYEVSVQEAVALYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RLVQPHGPRFRLEGNAVLYGGWSFAFRLRSSSGLQVLNVHFGGERIAYEVSVQEAVALYG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 GHTPAGMQTKYLDVGWGLGSVTHELAPGIDCPETATFLDTFHYYDADDPVHYPRALCLFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GHTPAGMQTKYLDVGWGLGSVTHELAPGIDCPETATFLDTFHYYDADDPVHYPRALCLFE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 MPTGVPLRRHFNSNFKGGFNFYAGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MPTGVPLRRHFNSNFKGGFNFYAGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIWDFIFYPNGVMEAKMH
430 440 450 460 470 480
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pF1KB5 ATGYVHATFYTPEGLRHGTRLHTHLIGNIHTHLVHYRVDLDVAGTKNSFQTLQMKLENIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ATGYVHATFYTPEGLRHGTRLHTHLIGNIHTHLVHYRVDLDVAGTKNSFQTLQMKLENIT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 NPWSPRHRVVQPTLEQTQYSWERQAAFRFKRKLPKYLLFTSPQENPWGHKRSYRLQIHSM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS64 NPWSPRHRVVQPTLEQTQYSWERQAAFRFKRKLPKYLLFTSPQENPWGHKRTYRLQIHSM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB5 ADQVLPPGWQEEQAITWAR-------------------YPLAVTKYRESELCSSSIYHQN
::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS64 ADQVLPPGWQEEQAITWARTEGGQPRALSQAASPVPGRYPLAVTKYRESELCSSSIYHQN
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 DPWDPPVVFEQFLHNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNF
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DPWHPPVVFEQFLHNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNF
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750
pF1KB5 FPEDPSLASRDTVIVWPRDNGPNYVQRWIPEDRDCSMPPPFSYNGTYRPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 FPEDPSLASRDTVIVWPRDNGPNYVQRWIPEDRDCSMPPPFSYNGTYRPV
730 740 750 760 770
>>CCDS11443.1 AOC2 gene_id:314|Hs108|chr17 (756 aa)
initn: 1870 init1: 480 opt: 1357 Z-score: 1538.6 bits: 295.4 E(32554): 2.2e-79
Smith-Waterman score: 1915; 42.8% identity (68.9% similar) in 739 aa overlap (19-746:44-755)
10 20 30 40
pF1KB5 MPALGWAVAAILMLQTAMAEPSPGTLPRKAGVFSDLSNQELKAVHSFL
:.: : : .. .:.::: .:: :: ::
CCDS11 LITIFALAYVLLTSPGGSSQPPHCPSVSHRAQPWPH--PGQSQLFADLSREELTAVMRFL
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 WSKKELRLQPSSTTTMAKNTVFLIEMLLPKKYHVLRFLDKGERHPVREARAVIFFGDQEH
.. : .. . . : .: .:. :: : .: ::.: :.::: :...:: : .
CCDS11 TQRLGPGLVDAAQAQPSDNCIFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPPAREALAIVLFGGQPQ
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 PNVTEFAVGPLPGPCYMRALS-PRPGYQSSWASRPISTAEYALLYHTLQEATKPLHQFFL
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CCDS11 PNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLRAEFTQMWRHLKEVELPKAPIFL
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 NTTGFSFQDCHDRCLAFTDVAPRGVASGQRRSWLIIQRYVEGY--FLHPTGLELLVDHGS
..: :.. . :: . ..:::. ::.: .:. . . . : ::::.:::::.:: .
CCDS11 SST-FNY---NGSTLAAVHATPRGLRSGDRATWMALYHNISGVGLFLHPVGLELLLDHRA
200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 TDAGHWAVEQVWYNGKFYGSPEELARKYADGEVDVVVLEDPLPGGKGHDSTEEPPLFSSH
: .::.:.::.: :..:.. .: :.. .:...:: . ::: .: .: : : .
CCDS11 LDPAHWTVQQVFYLGHYYADLGQLEREFKSGRLEVVRV--PLPPPNGASS-----LRSRN
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 KPRGDFPSPIHVSGPRLVQPHGPRFRLEGNAVLYGGWSFAFRLRSSSGLQVLNVHFGGER
.: : .: :.. : :.: .. ..:: :. . :::.: :::....:.: :::
CCDS11 SP-GPLP-PLQFS------PQGSQYSVQGNLVVSSLWSFTFGHGVFSGLRIFDVRFQGER
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 IAYEVSVQEAVALYGGHTPAGMQTKYLDVGWGLGSVTHELAPGIDCPETATFLDTFHYYD
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CCDS11 IAYEVSVQECVSIYGADSPKTMLTRYLDSSFGLGRNSRGLVRGVDCPYQATMVD-IHILV
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 ADDPVHY-PRALCLFEMPTGVPLRRHFNSNFKGGFNFYAGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYI
. :. : :.:.:: :.::::: : ... .::.:: ...::.:..:.: :::::
CCDS11 GKGAVQLLPGAVCVFEEAQGLPLRRHHNY-LQN--HFYGGLASSALVVRSVSSVGNYDYI
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 WDFIFYPNGVMEAKMHATGYVHATFYT--PEGLRHGTRLHTHLIGNIHTHLVHYRVDLDV
:::..::::..:...:::::....: ::: :.:. ...:..::: :...::::
CCDS11 WDFVLYPNGALEGRVHATGYINTAFLKGGEEGLLFGNRVGERVLGTVHTHAFHFKLDLDV
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 AGTKNSFQTLQMKLENITNPWSPRHRVVQPTLEQTQYSWERQAAFRFKRKLPKYLLFTSP
:: :: . .. .. .. ::.:.: . .: : . . : .:: . ::.:: ..:
CCDS11 AGLKNWVVAEDVVFKPVAAPWNPEHWLQRPQLTRQVLGKEDLTAFSLGSPLPRYLYLASN
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 QENPWGHKRSYRLQIHSMADQVLPPGWQEEQAITWARYPLAVTKYRESELCSSSIYHQND
: : :::.:.::.:::: .: . :.:..:.:: :.::. .: : :::::::::
CCDS11 QTNAWGHQRGYRIQIHSPLGIHIPLESDMERALSWGRYQLVVTQRKEEESQSSSIYHQND
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 PWDPPVVFEQFLHNNENIENEDLVAWVTVGFLHIPHSEDIPNTATPGNSVGFLLRPFNFF
: : :.: .:. :::.. .::::::::..::::::.::::::.: :: :::::::.:::
CCDS11 IWTPTVTFADFI-NNETLLGEDLVAWVTASFLHIPHAEDIPNTVTLGNRVGFLLRPYNFF
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750
pF1KB5 PEDPSLASRDTVIVWP-RDNGPNYVQRW--IPEDRDCSMP--PPFSYNGTYRPV
::::. : .: .: : .. .:. : .: :::::.:
CCDS11 DEDPSIFSPGSVYFEKGQDAGLCSINPVACLPDLAAC-VPDLPPFSYHGF
710 720 730 740 750
>>CCDS11444.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 (763 aa)
initn: 1438 init1: 633 opt: 1346 Z-score: 1526.0 bits: 293.1 E(32554): 1.1e-78
Smith-Waterman score: 1852; 40.1% identity (66.2% similar) in 736 aa overlap (21-746:46-759)
10 20 30 40
pF1KB5 MPALGWAVAAILMLQTAMAEPS--PGTLPRKAGVFSDLSNQELKAVHSFL
:: : : : .. .:.::: .:: :: ::
CCDS11 TIFALVCVLLVGRGGDGGEPSQLPHCPSVSPSAQPWTHPGQSQLFADLSREELTAVMRFL
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 WSKKELRLQPSSTTTMAKNTVFLIEMLLPKKYHVLRFLDKGERHPVREARAVIFFGDQEH
.. : .. . . : :: .:. :: : .: ::.: :.::: :..::: : .
CCDS11 TQRLGPGLVDAAQARPSDNCVFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPPAREALAIVFFGRQPQ
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 PNVTEFAVGPLPGPCYMRALS-PRPGYQSSWASRPISTAEYALLYHTLQEATKPLHQFFL
:::.:..::::: : ::: .. : : . ::. :: . . . . : . .:
CCDS11 PNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDIDQMIFNRELPQASGLL
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 NTTGFSFQDCHDRCLAFTDVAPRGVASGQRRSWLIIQRYVEG--YFLHPTGLELLVDHGS
. : . : :. .::::. ::.: .:. . . : .::: .::::::.: .
CCDS11 HHC--CFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFLHHVGLELLVNHKA
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 TDAGHWAVEQVWYNGKFYGSPEELARKYADGEVDVVVLEDPLPGGKGHDSTEEPPLFSSH
: ..:....:.:.:..: : .: .. : :.::.. : ::. .. ::
CCDS11 LDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSWSLKSPVPP-----
260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 KPRGDFPSPIHVSGPRLVQPHGPRFRLEGNAVLYGGWSFAFRLRSSSGLQVLNVHFGGER
: :.: : :.:::: ..:. : . :.:.: : . :: ....:.: :::
CCDS11 ---G--PAP-----PLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGER
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 IAYEVSVQEAVALYGGHTPAGMQTKYLDVGWGLGSVTHELAPGIDCPETATFLDTFHYYD
..::.:.:::.:.:::..::.: :.:.: :.:.:. : :. :.::: ::..: .
CCDS11 LVYEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLE
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 ADDPVHYPRALCLFEMPTGVPLRRHFNSNFKGGFNFYAGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIW
.. : :.:.::. :.::::: .. .. ....:: :::.:. ::. ::::.:
CCDS11 SQAPKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYS---HYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVW
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 DFIFYPNGVMEAKMHATGYVHATFYTPEGLRHGTRLHTHLIGNIHTHLVHYRVDLDVAGT
: .:.:.:..: ...::::. ..: ..:... : .:..::: .:..:::::::
CCDS11 DTVFHPSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGKYGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGL
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 KNSFQTLQMKLENITNPWSPRHRVVQPTLEQTQYSWERQAAFRFKRKLPKYLLFTSPQEN
.: . .: . .. ::::.:.. . . . :.:::: :.:: ..: . :
CCDS11 ENWVWAEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSN
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 PWGHKRSYRLQIHSMADQVLPPGWQEEQAITWARYPLAVTKYRESELCSSSIYHQNDPWD
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CCDS11 KWGHPRGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLAVTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]