Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5757
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5757, 814 aa
1>>>pF1KB5757 814 - 814 aa - 814 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3933+/-0.000825; mu= 11.3372+/- 0.050
mean_var=116.3001+/-23.372, 0's: 0 Z-trim(111.7): 191 B-trim: 411 in 1/50
Lambda= 0.118928
statistics sampled from 12424 (12617) to 12424 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.388), width: 16
Scan time: 4.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs108|chr16 ( 814) 5490 953.0 0
CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 ( 842) 2082 368.3 3e-101
CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 ( 916) 2082 368.3 3.2e-101
CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 ( 875) 2061 364.7 3.7e-100
CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 ( 906) 2061 364.7 3.9e-100
CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 796) 1381 248.0 4.6e-65
CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 785) 1342 241.3 4.6e-63
CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16 ( 799) 1312 236.2 1.7e-61
CCDS3890.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5 ( 794) 1295 233.3 1.3e-60
CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs108|chr18 ( 801) 1286 231.7 3.7e-60
CCDS3894.1 CDH6 gene_id:1004|Hs108|chr5 ( 790) 1285 231.6 4.1e-60
CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 ( 882) 1283 231.2 5.7e-60
CCDS81992.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 670) 1273 229.5 1.5e-59
CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 781) 1273 229.5 1.7e-59
CCDS3889.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 790) 1261 227.4 7.1e-59
CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 ( 784) 1249 225.4 3e-58
CCDS10868.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 ( 829) 1249 225.4 3.1e-58
CCDS3893.1 CDH9 gene_id:1007|Hs108|chr5 ( 789) 1243 224.4 6.1e-58
CCDS11893.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 ( 847) 1230 222.1 3e-57
CCDS11892.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 ( 901) 1230 222.1 3.2e-57
CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs108|chr18 ( 896) 1205 217.9 6.2e-56
CCDS10804.1 CDH5 gene_id:1003|Hs108|chr16 ( 784) 1168 211.5 4.5e-54
CCDS11895.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 840) 1055 192.1 3.3e-48
CCDS11894.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 894) 1055 192.1 3.5e-48
CCDS82991.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5 ( 754) 1052 191.6 4.3e-48
CCDS13485.1 CDH26 gene_id:60437|Hs108|chr20 ( 832) 988 180.6 9.4e-45
CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs108|chr18 ( 999) 983 179.8 2e-44
CCDS82259.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 630) 922 169.2 1.9e-41
CCDS81993.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 693) 900 165.5 2.8e-40
CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 674) 886 163.1 1.4e-39
CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 713) 886 163.1 1.5e-39
CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 760) 886 163.1 1.6e-39
CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs108|chr18 (1118) 790 146.7 2.1e-34
CCDS11897.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1040) 775 144.1 1.1e-33
CCDS45845.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1059) 775 144.1 1.2e-33
CCDS75229.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 575) 768 142.8 1.6e-33
CCDS54835.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 574) 767 142.6 1.8e-33
CCDS11896.1 DSG1 gene_id:1828|Hs108|chr18 (1049) 746 139.1 3.6e-32
CCDS58472.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 732) 713 133.4 1.3e-30
CCDS3892.1 CDH10 gene_id:1008|Hs108|chr5 ( 788) 700 131.2 6.7e-30
CCDS82005.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 ( 821) 690 129.5 2.3e-29
CCDS9585.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 819) 624 118.2 5.9e-26
CCDS59325.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18 ( 490) 614 116.4 1.2e-25
CCDS11994.1 CDH19 gene_id:28513|Hs108|chr18 ( 772) 525 101.2 7.2e-21
CCDS796.1 CELSR2 gene_id:1952|Hs108|chr1 (2923) 526 101.6 2.1e-20
CCDS2775.1 CELSR3 gene_id:1951|Hs108|chr3 (3312) 522 100.9 3.7e-20
CCDS14076.1 CELSR1 gene_id:9620|Hs108|chr22 (3014) 474 92.6 1e-17
CCDS4251.1 PCDHB16 gene_id:57717|Hs108|chr5 ( 776) 461 90.2 1.5e-17
CCDS4255.1 PCDHB13 gene_id:56123|Hs108|chr5 ( 798) 444 87.3 1.1e-16
CCDS4247.1 PCDHB5 gene_id:26167|Hs108|chr5 ( 795) 439 86.4 2.1e-16
>>CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs108|chr16 (814 aa)
initn: 5490 init1: 5490 opt: 5490 Z-score: 5091.7 bits: 953.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5490; 100.0% identity (100.0% similar) in 814 aa overlap (1-814:1-814)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MDAAFLLVLGLLAQSLCLSLGVPGWRRPTTLYPWRRAPALSRVRRAWVIPPISVSENHKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MDAAFLLVLGLLAQSLCLSLGVPGWRRPTTLYPWRRAPALSRVRRAWVIPPISVSENHKR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LPYPLVQIKSDKQQLGSVIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAMLDREKTDRFRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPYPLVQIKSDKQQLGSVIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAMLDREKTDRFRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 RAFALDLGGSTLEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPGTYVTRAEATDAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RAFALDLGGSTLEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPGTYVTRAEATDAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DPETDNAALRFSILQQGSPELFSIDELTGEIRTVQVGLDREVVAVYNLTLQVADMSGDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DPETDNAALRFSILQQGSPELFSIDELTGEIRTVQVGLDREVVAVYNLTLQVADMSGDGL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TATASAIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIEAVSGVDVGRLEVEDRDLPGSPNWVARFTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TATASAIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIEAVSGVDVGRLEVEDRDLPGSPNWVARFTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LEGDPDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQNEAPLQAAALRAERGQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LEGDPDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQNEAPLQAAALRAERGQA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 KVRVHVQDTNEPPVFQENPLRTSLAEGAPPGTLVATFSARDPDTEQLQRLSYSKDYDPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KVRVHVQDTNEPPVFQENPLRTSLAEGAPPGTLVATFSARDPDTEQLQRLSYSKDYDPED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 WLQVDAATGRIQTQHVLSPASPFLKGGWYRAIVLAQDDASQPRTATGTLSIEILEVNDHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WLQVDAATGRIQTQHVLSPASPFLKGGWYRAIVLAQDDASQPRTATGTLSIEILEVNDHA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 PVLAPPPPGSLCSEPHQGPGLLLGATDEDLPPHGAPFHFQLSPRLPELGRNWSLSQVNVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PVLAPPPPGSLCSEPHQGPGLLLGATDEDLPPHGAPFHFQLSPRLPELGRNWSLSQVNVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 HARLRPRHQVPEGLHRLSLLLRDSGQPPQQREQPLNVTVCRCGKDGVCLPGAAALLAGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HARLRPRHQVPEGLHRLSLLLRDSGQPPQQREQPLNVTVCRCGKDGVCLPGAAALLAGGT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 GLSLGALVIVLASALLLLVLVLLVALRARFWKQSRGKGLLHGPQDDLRDNVLNYDEQGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GLSLGALVIVLASALLLLVLVLLVALRARFWKQSRGKGLLHGPQDDLRDNVLNYDEQGGG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 EEDQDAYDISQLRHPTALSLPLGPPPLRRDAPQGRLHPQPPRVLPTSPLDIADFINDGLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EEDQDAYDISQLRHPTALSLPLGPPPLRRDAPQGRLHPQPPRVLPTSPLDIADFINDGLE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB5 AADSDPSVPPYDTALIYDYEGDGSVAGTLSSILSSQGDEDQDYDYLRDWGPRFARLADMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AADSDPSVPPYDTALIYDYEGDGSVAGTLSSILSSQGDEDQDYDYLRDWGPRFARLADMY
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KB5 GHPCGLEYGARWDHQAREGLSPGALLPRHRGRTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GHPCGLEYGARWDHQAREGLSPGALLPRHRGRTA
790 800 810
>>CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 (842 aa)
initn: 1668 init1: 712 opt: 2082 Z-score: 1931.3 bits: 368.3 E(32554): 3e-101
Smith-Waterman score: 2105; 45.2% identity (71.0% similar) in 772 aa overlap (30-781:77-837)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDAAFLLVLGLLAQSLCLSLGVPGWRRPTTLYPW---RRAPALSRVRRAWVIPPISVSE
:: :: . : .: : .: ::::::.: :
CCDS58 VAQTSSPHSGHKPQKGKKVVALDPSPPPKDTLLPWPQHQNANGLRRRKRDWVIPPINVPE
50 60 70 80 90 100
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 NHKRLPYP--LVQIKSDKQQLGSVIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAMLDREK
: .: :.: ::.:.:::.. . ::: : :.:. : :::::...:..... .:::.
CCDS58 N-SRGPFPQQLVRIRSDKDNDIPIRYSITGVGADQPPMEVFSIDSMSGRMYVTRPMDREE
110 120 130 140 150 160
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 TDRFRLRAFALDLGGSTLEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPGTYVTRA
..::: :.:..:. .:.: :: : :.:.::::: :......: : ::. ::::: .
CCDS58 HASYHLRAHAVDMNGNKVENPIDLYIYVIDMNDNRPEFINQVYNGSVDEGSKPGTYVMTV
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EATDADDPETDNAALRFSILQQG--SP--ELFSIDELTGEIRTVQVGLDREVVAVYNLTL
:.:::: : :. .:. :. : :: ..:.:. ::.: :: .::::: : :.. .
CCDS58 TANDADDSTTANGMVRYRIVTQTPQSPSQNMFTINSETGDIVTVAAGLDREKVQQYTVIV
230 240 250 260 270 280
240 250 260 270 280
pF1KB5 QVADMSGD---GLTATASAIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIEAVSGVDVGRLEVEDRD
:..:: :. ::. ::.::::. :.::: :::: . : :. : . :. : : :::
CCDS58 QATDMEGNLNYGLSNTATAIITVTDVNDNPPEFTASTFAGEVPENRVETVVANLTVMDRD
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LPGSPNWVARFTILEGDPDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQNEAP
: :::: : . :. :::.:.:..:::: ::::....:::.::: . . : : :.:.::
CCDS58 QPHSPNWNAVYRIISGDPSGHFSVRTDPVTNEGMVTVVKAVDYELNRAFMLTVMVSNQAP
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 LQAAALRAERGQAKVRVHVQDTNEPPVFQENPLRTSLAEGAPPGTLVATFSARDPDTEQL
: .. . .. : : . ..: :: : : : : ::.::::...:::: ::: .
CCDS58 LASGIQMSFQSTAGVTISIMDINEAPYFPSNHKLIRLEEGVPPGTVLTTFSAVDPDRFMQ
410 420 430 440 450 460
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 QRLSYSKDYDPEDWLQVDAATGRIQTQHVLSPASPFLKGGWYRAIVLAQDDASQPRTATG
: . ::: :: .::...:..:.: : ::. : . :.. :.: :: :.. : ..::
CCDS58 QAVRYSKLSDPASWLHINATNGQITTAAVLDRESLYTKNNVYEATFLAADNGIPPASGTG
470 480 490 500 510 520
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 TLSIEILEVNDHAPVLAPPPPGSLCSEPHQGPGLLLGATDEDLPPHGAPFHFQLSPRLPE
::.: ....::.:: : : ...: .:. . .. . :.: :. :. .:. :.: : .:
CCDS58 TLQIYLIDINDNAPELLPKE-AQICEKPNLN-AINITAADADVDPNIGPYVFEL-PFVPA
530 540 550 560 570 580
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 LGR-NWSLSQVNVSHARLRPRHQVPE-GLHRLSLLLRDSGQPPQQREQPLNVTVCRCGKD
: ::.....: ..:.: : : :.. . ... :::.:: . . ..: :: : .
CCDS58 AVRKNWTITRLNGDYAQLSLRILYLEAGMYDVPIIVTDSGNPPLSNTSIIKVKVCPCDDN
590 600 610 620 630 640
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 GVCLP-GAAALLAGGTGLSLGALVIVLASALLLLVLVLLVAL-RARFWKQSRGKGLLHGP
: : ::.: ..::. ::.: .: :.::..::: .. : :. . : :: :
CCDS58 GDCTTIGAVA----AAGLGTGAIVAILICILILLTMVLLFVMWMKRREKERHTKQLLIDP
650 660 670 680 690
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 QDDLRDNVLNYDEQGGGEEDQDAYDISQLRHPTALS-LPLGPPPLRR--DAPQGRLHPQP
.::.:::.:.:::.:::::::: ::.:::..: :.. .: : .:: . : : .::
CCDS58 EDDVRDNILKYDEEGGGEEDQD-YDLSQLQQPEAMGHVPSKAPGVRRVDERPVGA-EPQY
700 710 720 730 740 750
710 720 730 740 750
pF1KB5 P-RVLPTSPLDIADFINDGLEAADSDPSVPPYDTALIYDYEGDGSVAGTLSSILSSQGDE
: : . : ::.::::.::.:::.::..::::. :..::::.::.::..:: :.:...
CCDS58 PIRPMVPHPGDIGDFINEGLRAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSVSS-LNSSSSG
760 770 780 790 800 810
760 770 780 790 800 810
pF1KB5 DQDYDYLRDWGPRFARLADMYGHPCGLEYGARWDHQAREGLSPGALLPRHRGRTA
::::::: :::::: .::::::
CCDS58 DQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGEED
820 830 840
>>CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 (916 aa)
initn: 1668 init1: 712 opt: 2082 Z-score: 1930.7 bits: 368.3 E(32554): 3.2e-101
Smith-Waterman score: 2105; 45.2% identity (71.0% similar) in 772 aa overlap (30-781:151-911)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDAAFLLVLGLLAQSLCLSLGVPGWRRPTTLYPW---RRAPALSRVRRAWVIPPISVSE
:: :: . : .: : .: ::::::.: :
CCDS13 VAQTSSPHSGHKPQKGKKVVALDPSPPPKDTLLPWPQHQNANGLRRRKRDWVIPPINVPE
130 140 150 160 170 180
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 NHKRLPYP--LVQIKSDKQQLGSVIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAMLDREK
: .: :.: ::.:.:::.. . ::: : :.:. : :::::...:..... .:::.
CCDS13 N-SRGPFPQQLVRIRSDKDNDIPIRYSITGVGADQPPMEVFSIDSMSGRMYVTRPMDREE
190 200 210 220 230
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 TDRFRLRAFALDLGGSTLEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPGTYVTRA
..::: :.:..:. .:.: :: : :.:.::::: :......: : ::. ::::: .
CCDS13 HASYHLRAHAVDMNGNKVENPIDLYIYVIDMNDNRPEFINQVYNGSVDEGSKPGTYVMTV
240 250 260 270 280 290
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EATDADDPETDNAALRFSILQQG--SP--ELFSIDELTGEIRTVQVGLDREVVAVYNLTL
:.:::: : :. .:. :. : :: ..:.:. ::.: :: .::::: : :.. .
CCDS13 TANDADDSTTANGMVRYRIVTQTPQSPSQNMFTINSETGDIVTVAAGLDREKVQQYTVIV
300 310 320 330 340 350
240 250 260 270 280
pF1KB5 QVADMSGD---GLTATASAIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIEAVSGVDVGRLEVEDRD
:..:: :. ::. ::.::::. :.::: :::: . : :. : . :. : : :::
CCDS13 QATDMEGNLNYGLSNTATAIITVTDVNDNPPEFTASTFAGEVPENRVETVVANLTVMDRD
360 370 380 390 400 410
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 LPGSPNWVARFTILEGDPDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQNEAP
: :::: : . :. :::.:.:..:::: ::::....:::.::: . . : : :.:.::
CCDS13 QPHSPNWNAVYRIISGDPSGHFSVRTDPVTNEGMVTVVKAVDYELNRAFMLTVMVSNQAP
420 430 440 450 460 470
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 LQAAALRAERGQAKVRVHVQDTNEPPVFQENPLRTSLAEGAPPGTLVATFSARDPDTEQL
: .. . .. : : . ..: :: : : : : ::.::::...:::: ::: .
CCDS13 LASGIQMSFQSTAGVTISIMDINEAPYFPSNHKLIRLEEGVPPGTVLTTFSAVDPDRFMQ
480 490 500 510 520 530
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 QRLSYSKDYDPEDWLQVDAATGRIQTQHVLSPASPFLKGGWYRAIVLAQDDASQPRTATG
: . ::: :: .::...:..:.: : ::. : . :.. :.: :: :.. : ..::
CCDS13 QAVRYSKLSDPASWLHINATNGQITTAAVLDRESLYTKNNVYEATFLAADNGIPPASGTG
540 550 560 570 580 590
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 TLSIEILEVNDHAPVLAPPPPGSLCSEPHQGPGLLLGATDEDLPPHGAPFHFQLSPRLPE
::.: ....::.:: : : ...: .:. . .. . :.: :. :. .:. :.: : .:
CCDS13 TLQIYLIDINDNAPELLPKE-AQICEKPNLN-AINITAADADVDPNIGPYVFEL-PFVPA
600 610 620 630 640 650
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 LGR-NWSLSQVNVSHARLRPRHQVPE-GLHRLSLLLRDSGQPPQQREQPLNVTVCRCGKD
: ::.....: ..:.: : : :.. . ... :::.:: . . ..: :: : .
CCDS13 AVRKNWTITRLNGDYAQLSLRILYLEAGMYDVPIIVTDSGNPPLSNTSIIKVKVCPCDDN
660 670 680 690 700 710
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 GVCLP-GAAALLAGGTGLSLGALVIVLASALLLLVLVLLVAL-RARFWKQSRGKGLLHGP
: : ::.: ..::. ::.: .: :.::..::: .. : :. . : :: :
CCDS13 GDCTTIGAVA----AAGLGTGAIVAILICILILLTMVLLFVMWMKRREKERHTKQLLIDP
720 730 740 750 760 770
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 QDDLRDNVLNYDEQGGGEEDQDAYDISQLRHPTALS-LPLGPPPLRR--DAPQGRLHPQP
.::.:::.:.:::.:::::::: ::.:::..: :.. .: : .:: . : : .::
CCDS13 EDDVRDNILKYDEEGGGEEDQD-YDLSQLQQPEAMGHVPSKAPGVRRVDERPVGA-EPQY
780 790 800 810 820 830
710 720 730 740 750
pF1KB5 P-RVLPTSPLDIADFINDGLEAADSDPSVPPYDTALIYDYEGDGSVAGTLSSILSSQGDE
: : . : ::.::::.::.:::.::..::::. :..::::.::.::..:: :.:...
CCDS13 PIRPMVPHPGDIGDFINEGLRAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSVSS-LNSSSSG
840 850 860 870 880
760 770 780 790 800 810
pF1KB5 DQDYDYLRDWGPRFARLADMYGHPCGLEYGARWDHQAREGLSPGALLPRHRGRTA
::::::: :::::: .::::::
CCDS13 DQDYDYLNDWGPRFKKLADMYGGGEED
890 900 910
>>CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 (875 aa)
initn: 1680 init1: 668 opt: 2061 Z-score: 1911.6 bits: 364.7 E(32554): 3.7e-100
Smith-Waterman score: 2066; 43.7% identity (70.7% similar) in 757 aa overlap (40-781:123-871)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 GLLAQSLCLSLGVPGWRRPTTLYPWRRAPALSRVRRAWVIPPISVSENHKRLPYP--LVQ
:.: .: ::::::.. :: .: :.: ::.
CCDS77 KPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPEN-SRGPFPQELVR
100 110 120 130 140 150
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IKSDKQQLGSVIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAMLDREKTDRFRLRAFALDL
:.::... :. ::. :::.:. : :.: :. ..:.. .. ::::. ::.::: :.:.
CCDS77 IRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVDI
160 170 180 190 200 210
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GGSTLEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPGTYVTRAEATDADDPETDNA
.:. .:.: :. : :.:.::::: ::.....: : ::. ::::: . : :::::.. :.
CCDS77 NGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNALNG
220 230 240 250 260 270
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 ALRFSILQQG----SPELFSIDELTGEIRTVQVGLDREVVAVYNLTLQVADMSGD---GL
::. :..:. ::..:.:.. ::.: :: .::::: : :.: .:..:: :. ::
CCDS77 MLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTYGL
280 290 300 310 320 330
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TATASAIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIEAVSGVDVGRLEVEDRDLPGSPNWVARFTI
. ::.:.::. :.::: :::: :. :. : . :. : : :.: : .: : : . :
CCDS77 SNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRI
340 350 360 370 380 390
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LEGDPDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQNEAPLQAAALRAERGQA
::: :.:.:.:::..:.:....:: .:.:. . . : :...:..:: . . .. :
CCDS77 SGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQSTA
400 410 420 430 440 450
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 KVRVHVQDTNEPPVFQENPLRTSLAEGAPPGTLVATFSARDPDTEQLQRLSYSKDYDPED
: : : :.:: : : :: :: ::...::.:.::: . : . :.: :: .
CCDS77 TVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDPAN
460 470 480 490 500 510
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 WLQVDAATGRIQTQHVLSPASPFLKGGWYRAIVLAQDDASQPRTATGTLSIEILEVNDHA
::..: ..:.: : ::. :: .:.. : : ::.:.. : ..::::.: .:..::.:
CCDS77 WLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDINDNA
520 530 540 550 560 570
490 500 510 520 530
pF1KB5 PVLAPPPPGSLCSEPHQGPGLLLGATDEDLPPHGAPFHFQLSPRLP-ELGRNWSLSQVNV
: . : . : : . .. . : : :. :...:: :.: : : . :::.....:
CCDS77 PQVLPQEAET-CETPDPN-SINITALDYDIDPNAGPFAFDL-PLSPVTIKRNWTITRLNG
580 590 600 610 620
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 SHARLRPRHQVPE-GLHRLSLLLRDSGQPPQQREQPLNVTVCRCGKDGVCLPGAAALLAG
. :.: . . : :.... ... :::.::.. . : : ::.: ..: : .
CCDS77 DFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRIV---
630 640 650 660 670 680
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 GTGLSLGALVIVLASALLLLVLVLL-VALRARFWKQSRGKGLLHGPQDDLRDNVLNYDEQ
:.::. ::.. .: ..::.:::. :. : :. ..: :: :.::.:::.:.:::.
CCDS77 GAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEE
690 700 710 720 730 740
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 GGGEEDQDAYDISQLRHP-TALSLPLGPPPLRR-DAPQGRLHPQPP-RVLPTSPLDIADF
:::::::: ::.:::..: :. . : .:: : . .:: : : : ::.::
CCDS77 GGGEEDQD-YDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDF
750 760 770 780 790 800
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 INDGLEAADSDPSVPPYDTALIYDYEGDGSVAGTLSSILSSQGDEDQDYDYLRDWGPRFA
::.::.:::.::..::::. :..::::.::.::.:::. ::.. .:::::: ::::::
CCDS77 INEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLNDWGPRFK
810 820 830 840 850 860
780 790 800 810
pF1KB5 RLADMYGHPCGLEYGARWDHQAREGLSPGALLPRHRGRTA
.::::::
CCDS77 KLADMYGGGDD
870
>>CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 (906 aa)
initn: 1680 init1: 668 opt: 2061 Z-score: 1911.3 bits: 364.7 E(32554): 3.9e-100
Smith-Waterman score: 2066; 43.7% identity (70.7% similar) in 757 aa overlap (40-781:154-902)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 GLLAQSLCLSLGVPGWRRPTTLYPWRRAPALSRVRRAWVIPPISVSENHKRLPYP--LVQ
:.: .: ::::::.. :: .: :.: ::.
CCDS11 KPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPEN-SRGPFPQELVR
130 140 150 160 170 180
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IKSDKQQLGSVIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAMLDREKTDRFRLRAFALDL
:.::... :. ::. :::.:. : :.: :. ..:.. .. ::::. ::.::: :.:.
CCDS11 IRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVDI
190 200 210 220 230 240
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GGSTLEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPGTYVTRAEATDADDPETDNA
.:. .:.: :. : :.:.::::: ::.....: : ::. ::::: . : :::::.. :.
CCDS11 NGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNALNG
250 260 270 280 290 300
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 ALRFSILQQG----SPELFSIDELTGEIRTVQVGLDREVVAVYNLTLQVADMSGD---GL
::. :..:. ::..:.:.. ::.: :: .::::: : :.: .:..:: :. ::
CCDS11 MLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVAAGLDREKVQQYTLIIQATDMEGNPTYGL
310 320 330 340 350 360
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TATASAIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIEAVSGVDVGRLEVEDRDLPGSPNWVARFTI
. ::.:.::. :.::: :::: :. :. : . :. : : :.: : .: : : . :
CCDS11 SNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRI
370 380 390 400 410 420
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 LEGDPDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQNEAPLQAAALRAERGQA
::: :.:.:.:::..:.:....:: .:.:. . . : :...:..:: . . .. :
CCDS11 SGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQSTA
430 440 450 460 470 480
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 KVRVHVQDTNEPPVFQENPLRTSLAEGAPPGTLVATFSARDPDTEQLQRLSYSKDYDPED
: : : :.:: : : :: :: ::...::.:.::: . : . :.: :: .
CCDS11 TVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDPAN
490 500 510 520 530 540
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 WLQVDAATGRIQTQHVLSPASPFLKGGWYRAIVLAQDDASQPRTATGTLSIEILEVNDHA
::..: ..:.: : ::. :: .:.. : : ::.:.. : ..::::.: .:..::.:
CCDS11 WLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDINDNA
550 560 570 580 590 600
490 500 510 520 530
pF1KB5 PVLAPPPPGSLCSEPHQGPGLLLGATDEDLPPHGAPFHFQLSPRLP-ELGRNWSLSQVNV
: . : . : : . .. . : : :. :...:: :.: : : . :::.....:
CCDS11 PQVLPQEAET-CETPDPN-SINITALDYDIDPNAGPFAFDL-PLSPVTIKRNWTITRLNG
610 620 630 640 650
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 SHARLRPRHQVPE-GLHRLSLLLRDSGQPPQQREQPLNVTVCRCGKDGVCLPGAAALLAG
. :.: . . : :.... ... :::.::.. . : : ::.: ..: : .
CCDS11 DFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQCDSNGDCTDVDRIV---
660 670 680 690 700 710
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 GTGLSLGALVIVLASALLLLVLVLL-VALRARFWKQSRGKGLLHGPQDDLRDNVLNYDEQ
:.::. ::.. .: ..::.:::. :. : :. ..: :: :.::.:::.:.:::.
CCDS11 GAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYDEE
720 730 740 750 760 770
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 GGGEEDQDAYDISQLRHP-TALSLPLGPPPLRR-DAPQGRLHPQPP-RVLPTSPLDIADF
:::::::: ::.:::..: :. . : .:: : . .:: : : : ::.::
CCDS11 GGGEEDQD-YDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIRRMDERPIHAEPQYPVRSAAPHPGDIGDF
780 790 800 810 820 830
720 730 740 750 760 770
pF1KB5 INDGLEAADSDPSVPPYDTALIYDYEGDGSVAGTLSSILSSQGDEDQDYDYLRDWGPRFA
::.::.:::.::..::::. :..::::.::.::.:::. ::.. .:::::: ::::::
CCDS11 INEGLKAADNDPTAPPYDSLLVFDYEGSGSTAGSLSSLNSSSSGGEQDYDYLNDWGPRFK
840 850 860 870 880 890
780 790 800 810
pF1KB5 RLADMYGHPCGLEYGARWDHQAREGLSPGALLPRHRGRTA
.::::::
CCDS11 KLADMYGGGDD
900
>>CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 (796 aa)
initn: 835 init1: 329 opt: 1381 Z-score: 1281.7 bits: 248.0 E(32554): 4.6e-65
Smith-Waterman score: 1381; 34.4% identity (62.8% similar) in 802 aa overlap (4-781:9-787)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDAAFLLVLGLLAQSLCLSLGVPGWRRPTTL---YPWRRAPALSRVRRAWVIPPI
: :. ::.: .: .. : ::. ... .:.: .:.:: .
CCDS10 MKENYCLQAALVCLGMLCHSHAFAPERRGHLRPSFHGHHEKGKEGQVLQRSKRGWVWNQF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB5 SVSENHKRLPYPLV--QIKSDKQQL-GSVIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAM
: :.. : :.. ...:: .. :.. : ..: :. .: :: .:.. .
CCDS10 FVIEEYTG-PDPVLVGRLHSDIDSGDGNIKYILSGEGAGT----IFVIDDKSGNIHATKT
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 LDREKTDRFRLRAFALDLGGST-LEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPG
::::. .. : : :.: . :: :... . : : ::: : ::.:.. . : : . :
CCDS10 LDREERAQYTLMAQAVDRDTNRPLEPPSEFIVKVQDINDNPPEFLHETYHANVPERSNVG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 TYVTRAEATDADDPETDNAA-LRFSILQQGSPELFSIDELTGEIRTVQVGLDREVVAVYN
: : .. :.::::: :.: : .:::. :.: ::.. :: :::. ..:::. :.
CCDS10 TSVIQVTASDADDPTYGNSAKLVYSILE-GQP-YFSVEAQTGIIRTALPNMDREAKEEYH
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 LTLQVADMSGD--GLTATASAIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIEA-VSGVDVGRLEVE
...:. ::.: ::..:... ::: :.::: :.: .. . : . :: : : .:::....
CCDS10 VVIQAKDMGGHMGGLSGTTKVTITLTDVNDNPPKFPQSVYQMSVSEAAVPGEEVGRVKAK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 DRDLPGSPNWVARFTILEGDPDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQN
: :. . : .. ..:..:: .: : :: .:.:::... : .:.:. . : ::: . :
CCDS10 DPDI--GENGLVTYNIVDGDGMESFEITTDYETQEGVIKLKKPVDFETKRAYSLKVEAAN
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 -EAPLQAAALRAERGQAKVRVHVQDTNEPPVFQENPLRTSLAEGAPPGTLVATFSARDPD
. . . . . :.. :.:..:::.: . :.: ::.:. :.:::
CCDS10 VHIDPKFISNGPFKDTVTVKISVEDADEPPMFLAPSYIHEVQENAAAGTVVGRVHAKDPD
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 TEQLQ-RLSYSKDYDPEDWLQVDAATGRIQTQHVLSPASPFLKGGWYRAIVLAQDDASQP
. . : : .. : . .. .. : :.: . :. . .: :.: . ..
CCDS10 AANSPIRYSIDRHTDLDRFFTINPEDGFIKTTKPLDRE----ETAWLNITVFAAEIHNRH
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510
pF1KB5 RTATGTLSIEILEVNDHAPVLAPPPPGSLC----SEPHQG-PGLLLGATDEDLPPHGAPF
. : ..:..:.:::.:: .: : : .: ..: .. : . ..: :.: .: :
CCDS10 QEAKVPVAIRVLDVNDNAPKFAAPYEGFICESDQTKPLSNQPIVTISADDKDDTANGPRF
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 HFQLSPRL---PELGRNWSLSQVNVSHARLRPRHQVPEGLHRLSLLLRDSGQPPQQREQP
:.: :.. :.. . ... .:: . . :. : ... :.: ::.. .
CCDS10 IFSLPPEIIHNPNFTVRDNRDNTAGVYARRGGFSRQKQDLYLLPIVISDGGIPPMSSTNT
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 LNVTVCRCGKDGVCLPGAAALLAGGTGLSLGALVIVLASALLLLVLVLL-VALRARFWKQ
:.. :: : .:. : : ..::: :::. .:: ..:::.:.: :.:: .:
CCDS10 LTIKVCGCDVNGALLSCNAEAYILNAGLSTGALIAILACIVILLVIVVLFVTLR----RQ
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KB5 SRGKGLLHGPQDDLRDNVLNYDEQGGGEEDQDAYDISQLRHPTALSLPLGPPPLRRDA-P
.. . :. ..:.:.:...::..:::::: .:.::. :..: ... : : :.: :
CCDS10 KK-EPLIVFEEEDVRENIITYDDEGGGEEDTEAFDIATLQNPDGIN---GFIP-RKDIKP
650 660 670 680 690
700 710 720 730 740 750
pF1KB5 QGRLHPQPP-RVLPTSPLDIADFINDGLEAADSDPSVPPYDTALIYDYEGDGSVAGTLSS
. . :.: : :.: .:. :::: .. ::.::..::::. :: ::: :::::.:::
CCDS10 EYQYMPRPGLRPAPNS-VDVDDFINTRIQEADNDPTAPPYDSIQIYGYEGRGSVAGSLSS
700 710 720 730 740 750
760 770 780 790 800 810
pF1KB5 ILSSQGDEDQDYDYLRDWGPRFARLADMYGHPCGLEYGARWDHQAREGLSPGALLPRHRG
. :. : : :::::..::::: .:::.::
CCDS10 LESATTDSDLDYDYLQNWGPRFKKLADLYGSKDTFDDDS
760 770 780 790
>>CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 (785 aa)
initn: 894 init1: 289 opt: 1342 Z-score: 1245.6 bits: 241.3 E(32554): 4.6e-63
Smith-Waterman score: 1342; 34.3% identity (63.5% similar) in 795 aa overlap (5-781:8-777)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MDAAFLLVLGLLAQSLCLSLGVPGWRRPTTLYPWRRAPALSRVRRAWVIPPISVSEN
: : :.: ::.: . . :. .. . ::..:.:: . : :.
CCDS11 MKLGKVEFCHFLQLIALFLCFSGMSQAELSRSRSKPYFQS-GRSRTKRSWVWNQFFVLEE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 HK-RLPYPLVQIKSDKQQL-GSVIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAMLDREKT
. : . ...:: .. ::. : ..: :.. ..: ::. :: . . ::::.
CCDS11 YMGSDPLYVGKLHSDVDKGDGSIKYILSGEGAS----SIFIIDENTGDIHATKRLDREEQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 DRFRLRAFALD-LGGSTLEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPGTYVTRA
. ::: ::: : .. .: ... : . : :::.: ::. .:. : : . :: :...
CCDS11 AYYTLRAQALDRLTNKPVEPESEFVIKIQDINDNEPKFLDGPYTAGVPEMSPVGTSVVQV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 EATDADDPETDNAA-LRFSILQQGSPELFSIDELTGEIRTVQVGLDREVVAVYNLTLQVA
::::::: :.: . .:::: :.: ::.. :: :.:. ..:::. : :..:.
CCDS11 TATDADDPTYGNSARVVYSILQ-GQP-YFSVEPKTGVIKTALPNMDREAKDQYLLVIQAK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB5 DMSGD--GLTATASAIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIEA--VSGVDVGRLEVEDRDLP
:: :. ::..:.:. .:: :.::: :.: : . ... :. :..: :.:... : :.
CCDS11 DMVGQNGGLSGTTSVTVTLTDVNDNPPRFPRRSYQYNVPESLPVASV-VARIKAADADI-
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 GSPNWVARFTILEGDPDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQN-EAPL
:. : .. :..:: : : : .: .:.::...: : ::.:. : :.. . : .:
CCDS11 GA-NAEMEYKIVDGDGLGIFKISVDKETQEGIITIQKELDFEAKTSYTLRIEAANKDADP
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB5 QAAALRAERGQAKVRVHVQDTNEPPVFQENPLRT-SLAEGAPPGTLVATFSARDPDTEQL
. .: . :.. :.:..:::::. .:: ..:.. :....: .:.:::. .
CCDS11 RFLSLGPFSDTTTVKIIVEDVDEPPVFS-SPLYPMEVSEATQVGNIIGTVAAHDPDSSNS
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB5 Q-RLSYSKDYDPEDWLQVDAATGRIQTQHVLSPASPFLKGGWYRAIVLAQDDASQPRTAT
: : ... : : ....:: .: : : . :. . .. . :::... . ...
CCDS11 PVRYSIDRNTDLERYFNIDANSGVITTAKSLDRET----NAIHNITVLAMESQNPSQVGR
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 GTLSIEILEVNDHAPVLAPPPPGSLCSEPHQGPGLL-LGATDEDLPPHGAPFHFQLSPRL
: ..: ::..::.:: .: ..: . . : . ..:.:.: : .: :.:.:.
CCDS11 GYVAITILDINDNAPEFAMDYETTVCENAQPGQVIQKISAVDKDEPSNGHQFYFSLTTDA
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 PELGRNWSLSQVNVSHARLRPRH----QVPEGLHRLSLLLRDSGQPPQQREQPLNVTVCR
. ..:.::.. . . : . :. . .... : ... :::.: . . :.. ::
CCDS11 TN-NHNFSLKDNKDNTASILTRRNGFRRQEQSVYYLPIFIVDSGSPSLSSTNTLTIRVCD
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 CGKDGVCLPGAAALLAGGTGLSLGALVIVLASALLLLVLVLLVALRARFWKQSRGKGLLH
: ::: : . .::: :::. .:: .: ::::.::.. : :. :.
CCDS11 CDADGVAQTCNAEAYVLPAGLSTGALIAILACVLTLLVLILLIVTMRRRKKEP----LIF
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 GPQDDLRDNVLNYDEQGGGEEDQDAYDISQLRHPTALSLPLGPPPLRRDA-PQGRLHPQP
. :.:.:.. ::..:::::: .:.:.. ::. ... :::. :. .. .:
CCDS11 DEERDIRENIVRYDDEGGGEEDTEAFDMAALRNLNVIR----DTKTRRDVTPEIQFLSRP
650 660 670 680 690
710 720 730 740 750
pF1KB5 P-RVLPTSPLDIADFINDGLEAADSDPSVPPYDTALIYDYEGDGSVAGTLSSILSSQGDE
. .: . . . .:: . :. :: ::..::::. : .::.:::: .:::. : ...
CCDS11 AFKSIPDNVI-FREFIWERLKEADVDPGAPPYDSLQTYAFEGNGSVAESLSSLDSISSNS
700 710 720 730 740 750
760 770 780 790 800 810
pF1KB5 DQDYDYLRDWGPRFARLADMYGHPCGLEYGARWDHQAREGLSPGALLPRHRGRTA
::.:::: :::::: :::::::
CCDS11 DQNYDYLSDWGPRFKRLADMYGTGQESLYS
760 770 780
>>CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16 (799 aa)
initn: 923 init1: 299 opt: 1312 Z-score: 1217.6 bits: 236.2 E(32554): 1.7e-61
Smith-Waterman score: 1312; 33.5% identity (63.2% similar) in 761 aa overlap (40-780:56-790)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 GLLAQSLCLSLGVPGWRRPTTLYPWRRAPALSRVRRAWVIPPISVSENHKRLPYPLV--Q
:.: .:.:: . : :. . : :.. .
CCDS10 CIYMAPMNQSQVLMSGSPLELNSLGEEQRILNRSKRGWVWNQMFVLEEFSG-PEPILVGR
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 IKSDKQQLGS--VIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAMLDREKTDRFRLRAFAL
...: . :: . : ..: :. .:.:. :: . ::::. .. : : :.
CCDS10 LHTDLDP-GSKKIKYILSGDGAGT----IFQINDVTGDIHAIKRLDREEKAEYTLTAQAV
90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 DLGGST-LEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPGTYVTRAEATDADDPET
: : :: :... : : : ::: : ::. . . : : .. :: :: . :::::::
CCDS10 DWETSKPLEPPSEFIIKVQDINDNAPEFLNGPYHATVPEMSILGTSVTNVTATDADDPVY
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DNAA-LRFSILQQGSPELFSIDELTGEIRTVQVGLDREVVAVYNLTLQVADMSGD--GLT
:.: : .:::. :.: :::. :. :.:. ..:::. : ...:. ::.: ::.
CCDS10 GNSAKLVYSILE-GQP-YFSIEPETAIIKTALPNMDREAKEEYLVVIQAKDMGGHSGGLS
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 ATASAIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIE-AVSGVDVGRLEVEDRDLPGSPNWVARFTI
.:.. .:: :.::: :.:... . . . : .: :. .::....:.:. . : . . :
CCDS10 GTTTLTVTLTDVNDNPPKFAQSLYHFSVPEDVVLGTAIGRVKANDQDI--GENAQSSYDI
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350
pF1KB5 LEGDPDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQNEAPLQAAALRAE-RGQ
..:: . : : .: ....:.. . : ::.:. . : ::: . : . :. .
CCDS10 IDGDGTALFEITSDAQAQDGIIRLRKPLDFETKKSYTLKVEAANVHIDPRFSGRGPFKDT
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 AKVRVHVQDTNEPPVFQENPLRTSLAEGAPPGTLVATFSARDPD-TEQLQRLSYSKDYDP
: :.. :.:..:::::. . :.: ..... .::::: : . :.: .. :
CCDS10 ATVKIVVEDADEPPVFSSPTYLLEVHENAALNSVIGQVTARDPDITSSPIRFSIDRHTDL
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 EDWLQVDAATGRIQTQHVLSPASPFLK--GGWYRAIVLAQDDASQPRTATGTLSIEILEV
: ....: :.: :.:. . . :. ..: . .. . . ..:..:.:
CCDS10 ERQFNINADDGKITL------ATPLDRELSVWHNITIIATEIRNHSQISRVPVAIKVLDV
440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 NDHAPVLAPPPPGSLCSEPHQGPGL-LLGATDEDLPPHGAPFHFQLSPRLPELGRNWSLS
::.:: .: . :: . . : . ..: :.: : .: : ..: :.. . . :....
CCDS10 NDNAPEFASEYEAFLCENGKPGQVIQTVSAMDKDDPKNGHYFLYSLLPEMVN-NPNFTIK
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 QVNVSHARLRPRH----QVPEGLHRLSLLLRDSGQPPQQREQPLNVTVCRCGKDGVCLPG
. . . . .: . . .. : ... :::.:: . . :.. :: :..:::
CCDS10 KNEDNSLSILAKHNGFNRQKQEVYLLPIIISDSGNPPLSSTSTLTIRVCGCSNDGVVQSC
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 AAALLAGGTGLSLGALVIVLASALLLLVLVLL-VALRARFWKQSRGKGLLHGPQDDLRDN
. . :::.:::. .:: .::::.:.: :.:: . ... :. ..:.:.:
CCDS10 NVEAYVLPIGLSMGALIAILACIILLLVIVVLFVTLR-----RHKNEPLIIKDDEDVREN
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700
pF1KB5 VLNYDEQGGGEEDQDAYDISQLRHPTALSLPLGPPPLRRDA-PQGRLHPQPPRVLPTSPL
.. ::..:::::: .:.::. :..: ... : : :.: :. .. :. . . .
CCDS10 IIRYDDEGGGEEDTEAFDIATLQNPDGIN---GFLP-RKDIKPDLQFMPRQGLAPVPNGV
670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 DIADFINDGLEAADSDPSVPPYDTALIYDYEGDGSVAGTLSSILSSQGDEDQDYDYLRDW
:. .::: :. ::.::..::::. :: ::: :::::.:::. :. .: ::..::: ::
CCDS10 DVDEFINVRLHEADNDPTAPPYDSIQIYGYEGRGSVAGSLSSLESTTSDSDQNFDYLSDW
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810
pF1KB5 GPRFARLADMYGHPCGLEYGARWDHQAREGLSPGALLPRHRGRTA
:::: ::...:
CCDS10 GPRFKRLGELYSVGESDKET
780 790
>>CCDS3890.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5 (794 aa)
initn: 834 init1: 303 opt: 1295 Z-score: 1201.9 bits: 233.3 E(32554): 1.3e-60
Smith-Waterman score: 1341; 35.8% identity (63.3% similar) in 771 aa overlap (33-781:43-783)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 AAFLLVLGLLAQSLCLSLGVPGWRRPTTLYPWRRAPALSRVRRAWVIPPISVSENH-KRL
: .:. ..::.:.:: . : :..
CCDS38 VLFDGGLLTPLQPQPQQTLATEPRENVIHLPGQRSH-FQRVKRGWVWNQFFVLEEYVGSE
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 PYPLVQIKSDKQQ-LGSVIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAMLDREKTDRFRL
: . ...:: .. :.: :...: :. ::.::. :: . ::::. . :
CCDS38 PQYVGKLHSDLDKGEGTVKYTLSGDGAGT----VFTIDETTGDIHAIRSLDREEKPFYTL
80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KB5 RAFALDLGG-STLEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPGTYVTRAEATDA
:: :.:. . :: ... : : : :::.: ::. ... : : . :.:: ...::::
CCDS38 RAQAVDIETRKPLEPESEFIIKVQDINDNEPKFLDGPYVATVPEMSPVGAYVLQVKATDA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 DDPETDNAA-LRFSILQQGSPELFSIDELTGEIRTVQVGLDREVVAVYNLTLQVADMSGD
::: :.: . .:::: :.: :::: :: :::. ..:::: :.. .:. ::.:.
CCDS38 DDPTYGNSARVVYSILQ-GQP-YFSIDPKTGVIRTALPNMDREVKEQYQVLIQAKDMGGQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 --GLTATASAIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIEAVS-GVDVGRLEVEDRDLPGSPNWV
::..:. . ::: :.::: :.: .. : ... :. : .::... : :. . :
CCDS38 LGGLAGTTIVNITLTDVNDNPPRFPKSIFHLKVPESSPIGSAIGRIRAVDPDF--GQNAE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 ARFTILEGDPDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQN---EAPLQAAA
...:. :: . : : :: :.:::... : ::.:. . : .:: ..: . ...:.
CCDS38 IEYNIVPGDGGNLFDIVTDEDTQEGVIKLKKPLDFETKKAYTFKVEASNLHLDHRFHSAG
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 LRAERGQAKVRVHVQDTNEPPVFQENPLRT-SLAEGAPPGTLVATFSARDPDTEQLQRLS
. : :.. : :..:::::.. :: : . : .: ::.... .:.: :. . . .
CCDS38 --PFKDTATVKISVLDVDEPPVFSK-PLYTMEVYEDTPVGTIIGAVTAQDLDVGS-SAVR
370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KB5 YSKDY--DPEDWLQVDAATGRIQTQHVLSPASPFLKGGWYRAIVLAQDDASQPRTATGTL
: :. : .... .:. : : :...:. : . : ..:. .. :. ..
CCDS38 YFIDWKSDGDSYFTIDGNEGTIATNELLDREST----AQYNFSIIASKVSNPLLTSKVNI
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB5 SIEILEVNDHAPVLAPPPPGSLCSEPHQGPGL-LLGATDEDLPPHGAPFHFQLSPRLPEL
:..:.::. : .. : ..: . . : . ...:.:.:: : : : :.:::. .
CCDS38 LINVLDVNEFPPEISVPYETAVCENAKPGQIIQIVSAADRDLSPAGQQFSFRLSPE-AAI
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB5 GRNWSLSQVNVSHARLRPRH----QVPEGLHRLSLLLRDSGQPPQQREQPLNVTVCRCGK
:... . . : .. :. . . :. : ....::. : :. . ... :::: .
CCDS38 KPNFTVRDFRNNTAGIETRRNGYSRRQQELYFLPVVIEDSSYPVQSSTNTMTIRVCRCDS
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 DGVCLPGAAALLAGGTGLSLGALVIVLASALLLL-VLVLLVALRARFWKQSRGKGLLHGP
::. : . . .::: :::. .: ..:: ..:: :::: .:.. : :
CCDS38 DGTILSCNVEAIFLPVGLSTGALIAILLCIVILLAIVVLYVALR----RQKK-KDTLMTS
600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 QDDLRDNVLNYDEQGGGEEDQDAYDISQLRHPTALSLPLGPPPLRRDA-PQGRLHPQ--P
..:.::::..::..:::::: .:.::. ::.: .. .::: :.. :. :
CCDS38 KEDIRDNVIHYDDEGGGEEDTQAFDIGALRNPKVIE----ENKIRRDIKPDSLCLPRQRP
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 PRVLPTSPLDIADFINDGLEAADSDPSVPPYDTALIYDYEGDGSVAGTLSSILSSQGDED
: : :: :::.. :. : ::..::::. : :::.:::: .:::: : . :
CCDS38 PMEDNT---DIRDFIHQRLQENDVDPTAPPYDSLATYAYEGSGSVAESLSSIDSLTTEAD
710 720 730 740 750 760
770 780 790 800 810
pF1KB5 QDYDYLRDWGPRFARLADMYGHPCGLEYGARWDHQAREGLSPGALLPRHRGRTA
:::::: :::::: ::::.:
CCDS38 QDYDYLTDWGPRFKVLADMFGEEESYNPDKVT
770 780 790
>>CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs108|chr18 (801 aa)
initn: 865 init1: 335 opt: 1286 Z-score: 1193.5 bits: 231.7 E(32554): 3.7e-60
Smith-Waterman score: 1286; 34.2% identity (61.4% similar) in 766 aa overlap (42-785:56-796)
20 30 40 50 60 70
pF1KB5 LAQSLCLSLGVPGWRRPTTLYPWRRAPALSRVRRAWVIPPISVSENHKRL-PYPLVQIKS
:..:.:: . : :.. : . ...:
CCDS11 MDLTTTVLSDTPTPQGELEALLSDKPQSHQRTKRSWVWNQFFVLEEYTGTDPLYVGKLHS
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120
pF1KB5 DKQQL-GSVIYSIQGPGVDEEPRGVFSIDKFTGKVFLNAMLDREKTDRFRLRAFALDL-G
: .. ::. : ..: :. ::.:: :: . ::::. .. ::: :::
CCDS11 DMDRGDGSIKYILSGEGAG----IVFTIDDTTGDIHAIQRLDREERAQYTLRAQALDRRT
90 100 110 120 130 140
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GSTLEDPTDLEIVVVDQNDNRPAFLQEAFTGRVLEGAVPGTYVTRAEATDADDPETDNAA
: .: ... : . : :::.: ::. ... : : . :: : .. ::::::: :.:
CCDS11 GRPMEPESEFIIKIQDINDNEPKFLDGPYVATVPEMSPVGTSVIQVTATDADDPTYGNSA
150 160 170 180 190 200
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 -LRFSILQQGSPELFSIDELTGEIRTVQVGLDREVVAVYNLTLQVADMSGD--GLTATAS
. .:::: :.: ::.: :: :::. ...:::. :.. .:. ::.:. ::..:..
CCDS11 RVVYSILQ-GQP-YFSVDSKTGVIRTALMNMDREAKEYYEVIIQAKDMGGQLGGLAGTTT
210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 AIITLDDINDNAPEFTRDEFFMEAIEAVS-GVDVGRLEVEDRDLPGSPNWVARFTILEGD
. :::.:.::: :.: . .. : ..:.. . ::: : .:: . : ..::..::
CCDS11 VNITLSDVNDNPPRFPQKHYQMSVLESAPISSTVGR--VFAKDLDEGINAEMKYTIVDGD
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 PDGQFTIRTDPKTNEGVLSIVKALDYESCEHYELKVSVQN-EAPLQAAALRAERGQAKVR
: : :::. . :.... : :..:: . : ::: : . .. : . . :.
CCDS11 GADAFDISTDPNFQVGIITVKKPLSFESKKSYTLKVEGANPHLEMRFLNLGPFQDTTTVH
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 VHVQDTNEPPVFQENPLRTSLAEGAPPGTLVATFSARDPD-TEQLQRLSYSKDYDPEDWL
. :.:..:::::. . . . : . :: . .::.::: :.. : : ... :: ..
CCDS11 ISVEDVDEPPVFEPGFYFVEVPEDVAIGTTIQIISAKDPDVTNNSIRYSIDRSSDPGRFF
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 QVDAATGRIQTQHVLSPASPFLKGGWYRAIVLAQDDASQPRTATGTLSIEILEVNDHAPV
:: .:: ..: . :. : .:. :::.. . .... ..:..:.:::.::
CCDS11 YVDITTGALMTARPLD-REEF---SWHNITVLAMEMNNPSQVGSVPVTIKVLDVNDNAPE
440 450 460 470 480 490
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 LAPPPPGSLCSEPHQGPGL-LLGATDEDLPPHGAPFHFQLSPRLPELGRNWSLSQVNVSH
. . .: . . : . ..:.:.: : .: :...:.:. . . :... . . .
CCDS11 FPRFYEAFVCENAKAGQLIQTVSAVDQDDPRNGQHFYYSLAPEAAN-NPNFTIRDNQDNT
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590
pF1KB5 ARLRPRH----QVPEGLHRLSLLLRDSGQPPQQREQPLNVTVCRCGKDG---VCLPGAAA
::. :. : ... .: .:. ::::: . :.. :: : :: : : :
CCDS11 ARILTRRSGFRQQEQSVFHLPILIADSGQPVLSSTGTLTIQVCSCDDDGHVMSCSPEAYM
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 LLAGGTGLSLGALVIVLASALLLLVLVLLVALRARFWKQSRGKGLLHGPQDDLRDNVLNY
: ..:: :::. .:: ..:::::::. : :: . ......:.. :
CCDS11 L---PVSLSRGALIAILACIFVLLVLVLLILSMRRHRKQPY----IIDDEENIHENIVRY
620 630 640 650 660
660 670 680 690 700
pF1KB5 DEQGGGEEDQDAYDISQLRHPTALSLPLGPPPLRRDA-PQ----GRLHPQPPRVLPTSPL
:..:::::: .:.::. . .: . . : :.: :. .: :: : :
CCDS11 DDEGGGEEDTEAFDIAAMWNPRE-AQAGAAPKTRQDMLPEIESLSRYVPQTCAVNST---
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB5 DIADFINDGLEAADSDPSVPPYDTALIYDYEGDGSVAGTLSSILSSQGDEDQDYDYLRDW
. ... : :: : .::.:. : .::::::::.:::. :. .: .:..:.: ::
CCDS11 -VHSYVLAKLYEADMDLWAPPFDSLQTYMFEGDGSVAGSLSSLQSATSDSEQSFDFLTDW
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810
pF1KB5 GPRFARLADMYGHPCGLEYGARWDHQAREGLSPGALLPRHRGRTA
:::: .::..:: :
CCDS11 GPRFRKLAELYGASEGPAPLW
790 800
814 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 05:54:56 2016 done: Tue Nov 8 05:54:57 2016
Total Scan time: 4.910 Total Display time: 0.320
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]