Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5744
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5744, 746 aa
1>>>pF1KB5744 746 - 746 aa - 746 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5988+/-0.00117; mu= 13.4532+/- 0.069
mean_var=101.4704+/-19.896, 0's: 0 Z-trim(103.3): 81 B-trim: 85 in 1/51
Lambda= 0.127322
statistics sampled from 7291 (7356) to 7291 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.579), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4918.1 MEP1A gene_id:4224|Hs108|chr6 ( 746) 5111 950.4 0
CCDS77173.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 ( 700) 1786 339.6 9.8e-93
CCDS45846.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 ( 701) 1786 339.6 9.8e-93
CCDS33249.1 ASTL gene_id:431705|Hs108|chr2 ( 431) 423 89.1 1.5e-17
CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 730) 375 80.5 1.1e-14
CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 986) 375 80.5 1.4e-14
CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015) 369 79.4 3e-14
CCDS56342.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 ( 392) 362 77.9 3.3e-14
CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013) 362 78.1 7.4e-14
>>CCDS4918.1 MEP1A gene_id:4224|Hs108|chr6 (746 aa)
initn: 5111 init1: 5111 opt: 5111 Z-score: 5078.7 bits: 950.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5111; 99.7% identity (99.9% similar) in 746 aa overlap (1-746:1-746)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDIL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 LQKSRNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGESSYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LQKSRNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGESSYI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 IFQQFDGCWSEVGDQHVGQNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYVNIWW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 IFQQFDGCWSEVGDQHVGQNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYVNIWW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 DQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFNSIIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 DQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFNSIIG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 QRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQAGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 QRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQAGEV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 DHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPSDRLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 DHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPSDRLVV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 WVRRDDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDPQNSTGGIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 WVRRDDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDPQNSTGGIY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 LDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGLTLYPNSGESSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: ::::
CCDS49 LDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGVTLYPNSRESSG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 YLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKSHTSPAIND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 YLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKSHTSPAIND
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 TVIWDRPSRVGTYHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLIIFVDFEDITHLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 TVIWDRPSRVGTYHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLIIFVDFEDITHLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 QTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPSRQKRSVENTGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 QTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPSRQKRSVENTGP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 LEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERCQAVQVHGSVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 LEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERCQAVQVHGSVLG
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KB5 MVIGGTAGVIFLTFSIIAILSQRPRK
::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MVIGGTAGVIFLTFSIIAILSQRPRK
730 740
>>CCDS77173.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 (700 aa)
initn: 1630 init1: 599 opt: 1786 Z-score: 1778.3 bits: 339.6 E(32554): 9.8e-93
Smith-Waterman score: 1847; 40.4% identity (66.0% similar) in 755 aa overlap (3-745:4-681)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDI
: : ... .:: :.: :: :.: : ..:: .:: . :::::.:::
CCDS77 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATP------ENF-DVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LLQKS--RNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES
:... ::.. . :: :::.: :.: .::::.:: ::: .:::.:.::::. ::.
CCDS77 RLDRAQIRNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGET
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SYIIFQQFDGCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYV
.:: . .:::: ::...:: :..::: .: : ..::.::::::.:::::.::::::
CCDS77 NYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFN
: ::.:::: .:::.::.:.. .::.:::: :.:::. .: .:.. :::...: .:.
CCDS77 RIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAF-QNGTEPTIVTRISDFE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQ
..::::.::: :: .::..:::... ...: :.:: :.:::::.. :..:: . ...
CCDS77 DVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 AG-EVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPS
: : ::. .::: :.:.::.:..:: .. .:.:::: ::::: :::::. .:: :
CCDS77 RGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSES
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 DRLVVWVRR---DDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDP
:.: ...:. :. :: :. :. .. .:.. ::.:: .::: .:.: ::.
CCDS77 DQLNIYIREYSADNVDGN---LTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSG
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 QNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGLTLY
: ::. .:::.:.:: :: .: .:::.: . : . : :: ::.:.::.: . :
CCDS77 A-SLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFI--GSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLN
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 PNSGESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKS
..: . ::. :: :: :.:: .:. .:.:::.::.:.:::.. .::.
CCDS77 LAHVTNAG---IYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPF
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KB5 HTSPAINDTVIWDRPSRVGT---YHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLII
:. : . .:::::.::: . . . :. : :.::.:. :: :.:.:.::. :
CCDS77 MTTD--NGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYI
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 FVDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPS
.. :::.::..:.. .:.: ::
CCDS77 LLTVEDISHLNSTQI-----QLTPA---------------------------------PS
590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 RQKRSVENTGPLEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERC
: : :. . :.:::.:. : : ::: ::. ..: ::::
CCDS77 VQ--------------------DLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERC
610 620 630 640
710 720 730 740
pF1KB5 QAVQVHGSVLGMVIGGTAGV--IFLTFSIIAILSQRPRK
. ... .....:..: ..: ...... : .
CCDS77 EKRGSTRDTIVIAVSSTVAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNHAF
650 660 670 680 690 700
>>CCDS45846.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 (701 aa)
initn: 1630 init1: 599 opt: 1786 Z-score: 1778.3 bits: 339.6 E(32554): 9.8e-93
Smith-Waterman score: 1847; 40.4% identity (66.0% similar) in 755 aa overlap (3-745:4-681)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MAWIRSTCILFFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDI
: : ... .:: :.: :: :.: : ..:: .:: . :::::.:::
CCDS45 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATP------ENF-DVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEGDI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 LLQKS--RNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES
:... ::.. . :: :::.: :.: .::::.:: ::: .:::.:.::::. ::.
CCDS45 RLDRAQIRNSIIGEKYRWPHTIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCIDFKPWAGET
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SYIIFQQFDGCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYV
.:: . .:::: ::...:: :..::: .: : ..::.::::::.:::::.::::::
CCDS45 NYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 NIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFN
: ::.:::: .:::.::.:.. .::.:::: :.:::. .: .:.. :::...: .:.
CCDS45 RIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAF-QNGTEPTIVTRISDFE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 SIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQ
..::::.::: :: .::..:::... ...: :.:: :.:::::.. :..:: . ...
CCDS45 DVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 AG-EVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPS
: : ::. .::: :.:.::.:..:: .. .:.:::: ::::: :::::. .:: :
CCDS45 RGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSES
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 DRLVVWVRR---DDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDP
:.: ...:. :. :: :. :. .. .:.. ::.:: .::: .:.: ::.
CCDS45 DQLNIYIREYSADNVDGN---LTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSG
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 QNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGLTLY
: ::. .:::.:.:: :: .: .:::.: . : . : :: ::.:.::.: . :
CCDS45 A-SLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFI--GSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLN
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 PNSGESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKS
..: . ::. :: :: :.:: .:. .:.:::.::.:.:::.. .::.
CCDS45 LAHVTNAG---IYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPF
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580
pF1KB5 HTSPAINDTVIWDRPSRVGT---YHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLII
:. : . .:::::.::: . . . :. : :.::.:. :: :.:.:.::. :
CCDS45 MTTD--NGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYI
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KB5 FVDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPS
.. :::.::..:.. .:.: ::
CCDS45 LLTVEDISHLNSTQI-----QLTPA---------------------------------PS
590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KB5 RQKRSVENTGPLEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERC
: : :. . :.:::.:. : : ::: ::. ..: ::::
CCDS45 VQ--------------------DLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERC
610 620 630 640
710 720 730 740
pF1KB5 QAVQVHGSVLGMVIGGTAGV--IFLTFSIIAILSQRPRK
. ... .....:..: ..: ...... : .
CCDS45 EKRGSTRDTIVIAVSSTVAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNQHAF
650 660 670 680 690 700
>>CCDS33249.1 ASTL gene_id:431705|Hs108|chr2 (431 aa)
initn: 351 init1: 174 opt: 423 Z-score: 428.4 bits: 89.1 E(32554): 1.5e-17
Smith-Waterman score: 427; 32.4% identity (62.2% similar) in 238 aa overlap (41-262:53-284)
20 30 40 50 60
pF1KB5 FFTLLFAHIAAVPIKYLPEENVHDADFGEQKDISEINLAAGLD-------LFQGDILLQK
::: :: . :. :..:::. .
CCDS33 GAPLASSCAGACGTSFPDGLTPEGTQASGDKDIPAINQGLILEETPESSFLIEGDIIRPS
30 40 50 60 70 80
70 80 90 100 110
pF1KB5 SRNGLRDPNTRWTF------PIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES
: ...: . .:..:... .. .:: :. :. ..:. : :. .
CCDS33 PFRLLSATSNKWPMGGSGVVEVPFLLSSKYDEPSRQVILEALAEFERSTCIRFVTYQDQR
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 SYIIFQQFDGCWSEVGDQHVGQNISIGQGCAYKA--IIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDY
..: . . ::.: :: . : .:.. : :. :. ::..:.:::.::..:.::: :
CCDS33 DFISIIPMYGCFSSVGRSGGMQVVSLAPTCLQKGRGIVLHELMHVLGFWHEHTRADRDRY
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 VNIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAK-IPE
. . :..:: :.. :: ..: .. ::::: :.::: ..:.. . .:::: :
CCDS33 IRVNWNEILPGFEINFIKSQSS---NMLTPYDYSSVMHYGRLAFSRRG-LPTITPLWAPS
210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 FNSIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDS
. :::: ..:: :. :. ..:.:. .
CCDS33 VH--IGQRWNLSASDITRVLKLYGCSPSGPRPRGRGSHAHSTGRSPAPASLSLQRLLEAL
260 270 280 290 300 310
>>CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 (730 aa)
initn: 301 init1: 232 opt: 375 Z-score: 377.3 bits: 80.5 E(32554): 1.1e-14
Smith-Waterman score: 375; 32.9% identity (62.4% similar) in 210 aa overlap (65-267:120-328)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 ADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDILLQKSRNGLRDPNTRWTFP-IPYILADNLGLNAKG
: . :. : ::.... :. . ..
CCDS34 GNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRRAATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRA
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 AILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGESSYIIFQQFD-GCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKA
.. :.. .. ..:: : :.:::.: :: : :: . : : ::::..: .
CCDS34 VFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTYRPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFG
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 IIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYVNIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESL
:. ::. :..::.::..: ::: .:.: ..: : ..:: .. . . .:. ::..:.
CCDS34 IVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVRENIQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSI
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260
pF1KB5 MHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFNSI---IGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTT-HTLLD
::: .:... . ::. : : :.. :::: .: :. . ..:.: . .:: :
CCDS34 MHYARNTFSRGIFLDTIVPKY-EVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQD
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 HCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQAGEVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEA
CCDS34 STGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWR
330 340 350 360 370 380
>>CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 (986 aa)
initn: 347 init1: 232 opt: 375 Z-score: 375.4 bits: 80.5 E(32554): 1.4e-14
Smith-Waterman score: 375; 32.9% identity (62.4% similar) in 210 aa overlap (65-267:120-328)
40 50 60 70 80 90
pF1KB5 ADFGEQKDISEINLAAGLDLFQGDILLQKSRNGLRDPNTRWTFP-IPYILADNLGLNAKG
: . :. : ::.... :. . ..
CCDS60 GNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRRAATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRA
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 AILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGESSYIIFQQFD-GCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKA
.. :.. .. ..:: : :.:::.: :: : :: . : : ::::..: .
CCDS60 VFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTYRPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFG
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 IIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYVNIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESL
:. ::. :..::.::..: ::: .:.: ..: : ..:: .. . . .:. ::..:.
CCDS60 IVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVRENIQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSI
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260
pF1KB5 MHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFNSI---IGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTT-HTLLD
::: .:... . ::. : : :.. :::: .: :. . ..:.: . .:: :
CCDS60 MHYARNTFSRGIFLDTIVPKY-EVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQD
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KB5 HCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQAGEVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEA
CCDS60 STGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWR
330 340 350 360 370 380
>>CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015 aa)
initn: 282 init1: 234 opt: 369 Z-score: 369.2 bits: 79.4 E(32554): 3e-14
Smith-Waterman score: 369; 32.8% identity (65.6% similar) in 195 aa overlap (79-267:164-357)
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 AAGLDLFQGDILLQKSRNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCV
:::... :. . .. . :.. .. ..::
CCDS74 GTLHAAAKTFSPRVRRATTSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAIFKQAMRHWEKHTCV
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 DFKPYEGESSYIIFQQFD-GCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHE
: : :.:.:. :: : :: . : : ::::..: .:. ::. :..::.::
CCDS74 TFIERTDEESFIVFSYRTCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVAHELGHVVGFWHE
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 QSRTDRDDYVNIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVP
..: :::..:.: ..: : ..:: .. . ...:. ::..:.::: .:.... .
CCDS74 HTRPDRDQHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEAGEVSSLGETYDFDSIMHYARNTFSRGVFLD
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 TITAKIPEFNSI---IGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTT-HTLLDHCTFEKANICGMIQG
:: . . :.. ::::. .: :. . ..:.: . .:: :
CCDS74 TILPRQDD-NGVRPTIGQRVRLSQGDIAQARKLYKCPACGETLQDTTGNFSAPGFPNGYP
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 TRDDTDWAHQDSAQAGEVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQ
CCDS74 SYSHCVWRISVTPGEKIVLNFTSMDLFKSRLCWYDYVEVRDGYWRKAPLLGRFCGDKIPE
380 390 400 410 420 430
>>CCDS56342.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (392 aa)
initn: 307 init1: 236 opt: 362 Z-score: 368.5 bits: 77.9 E(32554): 3.3e-14
Smith-Waterman score: 362; 33.9% identity (64.0% similar) in 186 aa overlap (79-259:162-346)
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 AAGLDLFQGDILLQKSRNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCV
:::... :. . .. . :.. .. ..::
CCDS56 VPLQFSGQNEKNRVPRAATSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAMFKQAMRHWEKHTCV
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 DFKPYEGESSYIIFQQFD-GCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHE
: : :::.: :: : :: . : : ::::..: .:. ::. :..::.::
CCDS56 TFIERSDEESYIVFTYRPCGCCSYVGRRGNGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVIGFWHE
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 QSRTDRDDYVNIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVP
..: :::..:.: ..: : ..:: .. . ...:. ::..:.::: .:... .
CCDS56 HTRPDRDNHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEPGEVNSLGERYDFDSIMHYARNTFSRGMFLD
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 TITAKIPEFNSI---IGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGT
:: . . :.: :::: .: :. . ..: :
CCDS56 TILPSRDD-NGIRPAIGQRTRLSKGDIAQARKLYRCPACGETLQESNGNLSSPGFPNGYP
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 RDDTDWAHQDSAQAGEVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQC
CCDS56 SYTHCIWRVSVTPGEKVVFSLC
380 390
>>CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013 aa)
initn: 336 init1: 236 opt: 362 Z-score: 362.3 bits: 78.1 E(32554): 7.4e-14
Smith-Waterman score: 362; 33.9% identity (64.0% similar) in 186 aa overlap (79-259:162-346)
50 60 70 80 90 100
pF1KB5 AAGLDLFQGDILLQKSRNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCV
:::... :. . .. . :.. .. ..::
CCDS38 VPLQFSGQNEKNRVPRAATSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAMFKQAMRHWEKHTCV
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KB5 DFKPYEGESSYIIFQQFD-GCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHE
: : :::.: :: : :: . : : ::::..: .:. ::. :..::.::
CCDS38 TFIERSDEESYIVFTYRPCGCCSYVGRRGNGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVIGFWHE
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 QSRTDRDDYVNIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVP
..: :::..:.: ..: : ..:: .. . ...:. ::..:.::: .:... .
CCDS38 HTRPDRDNHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEPGEVNSLGERYDFDSIMHYARNTFSRGMFLD
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 TITAKIPEFNSI---IGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGT
:: . . :.: :::: .: :. . ..: :
CCDS38 TILPSRDD-NGIRPAIGQRTRLSKGDIAQARKLYRCPACGETLQESNGNLSSPGFPNGYP
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 RDDTDWAHQDSAQAGEVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQC
CCDS38 SYTHCIWRVSVTPGEKIVLNFTTMDLYKSSLCWYDYIEVRDGYWRKSPLLGRFCGDKLPE
380 390 400 410 420 430
746 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 03:22:18 2016 done: Tue Nov 8 03:22:19 2016
Total Scan time: 3.120 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]