Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5742
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5742, 741 aa
1>>>pF1KB5742 741 - 741 aa - 741 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9699+/-0.00065; mu= 2.3147+/- 0.039
mean_var=345.5543+/-75.935, 0's: 0 Z-trim(113.3): 393 B-trim: 1136 in 2/49
Lambda= 0.068995
statistics sampled from 22125 (22595) to 22125 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 8.610
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_066956 (OMIM: 180435,601518) 2-5A-dependent rib ( 741) 4947 508.1 5.2e-143
XP_011542148 (OMIM: 603303) PREDICTED: tankyrase-1 (1301) 345 50.3 5.8e-05
XP_006716326 (OMIM: 603303) PREDICTED: tankyrase-1 (1316) 345 50.3 5.8e-05
XP_011542147 (OMIM: 603303) PREDICTED: tankyrase-1 (1316) 345 50.3 5.8e-05
NP_003738 (OMIM: 603303) tankyrase-1 [Homo sapiens (1327) 345 50.3 5.9e-05
XP_011538517 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 ( 695) 329 48.4 0.00012
XP_016872188 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 (1059) 329 48.6 0.00015
NP_079511 (OMIM: 607128) tankyrase-2 [Homo sapiens (1166) 329 48.7 0.00016
XP_011538515 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 (1187) 329 48.7 0.00016
XP_016872189 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 ( 977) 306 46.3 0.00071
XP_016872186 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 (1062) 306 46.3 0.00075
XP_016872187 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 (1062) 306 46.3 0.00075
XP_016872185 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 (1169) 306 46.4 0.0008
XP_005270242 (OMIM: 607128) PREDICTED: tankyrase-2 (1190) 306 46.4 0.00081
XP_011542149 (OMIM: 603303) PREDICTED: tankyrase-1 (1223) 304 46.2 0.00094
NP_001188894 (OMIM: 605760) ankyrin repeat and SOC ( 445) 267 42.0 0.0065
NP_665862 (OMIM: 605760) ankyrin repeat and SOCS b ( 445) 267 42.0 0.0065
NP_057199 (OMIM: 605760) ankyrin repeat and SOCS b ( 518) 267 42.1 0.0071
XP_011541040 (OMIM: 608774) PREDICTED: ankyrin rep ( 702) 269 42.4 0.0075
NP_848605 (OMIM: 608774) ankyrin repeat and protei ( 765) 269 42.5 0.0079
XP_011541039 (OMIM: 608774) PREDICTED: ankyrin rep ( 766) 269 42.5 0.0079
XP_016872964 (OMIM: 608774) PREDICTED: ankyrin rep ( 775) 269 42.5 0.008
XP_011541038 (OMIM: 608774) PREDICTED: ankyrin rep ( 776) 269 42.5 0.008
>>NP_066956 (OMIM: 180435,601518) 2-5A-dependent ribonuc (741 aa)
initn: 4947 init1: 4947 opt: 4947 Z-score: 2688.5 bits: 508.1 E(85289): 5.2e-143
Smith-Waterman score: 4947; 100.0% identity (100.0% similar) in 741 aa overlap (1-741:1-741)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MESRDHNNPQEGPTSSSGRRAAVEDNHLLIKAVQNEDVDLVQQLLEGGANVNFQEEEGGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 MESRDHNNPQEGPTSSSGRRAAVEDNHLLIKAVQNEDVDLVQQLLEGGANVNFQEEEGGW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 TPLHNAVQMSREDIVELLLRHGADPVLRKKNGATPFILAAIAGSVKLLKLFLSKGADVNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 TPLHNAVQMSREDIVELLLRHGADPVLRKKNGATPFILAAIAGSVKLLKLFLSKGADVNE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 CDFYGFTAFMEAAVYGKVKALKFLYKRGANVNLRRKTKEDQERLRKGGATALMDAAEKGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 CDFYGFTAFMEAAVYGKVKALKFLYKRGANVNLRRKTKEDQERLRKGGATALMDAAEKGH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 VEVLKILLDEMGADVNACDNMGRNALIHALLSSDDSDVEAITHLLLDHGADVNVRGERGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 VEVLKILLDEMGADVNACDNMGRNALIHALLSSDDSDVEAITHLLLDHGADVNVRGERGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 TPLILAVEKKHLGLVQRLLEQEHIEINDTDSDGKTALLLAVELKLKKIAELLCKRGASTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 TPLILAVEKKHLGLVQRLLEQEHIEINDTDSDGKTALLLAVELKLKKIAELLCKRGASTD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 CGDLVMTARRNYDHSLVKVLLSHGAKEDFHPPAEDWKPQSSHWGAALKDLHRIYRPMIGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 CGDLVMTARRNYDHSLVKVLLSHGAKEDFHPPAEDWKPQSSHWGAALKDLHRIYRPMIGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LKFFIDEKYKIADTSEGGIYLGFYEKQEVAVKTFCEGSPRAQREVSCLQSSRENSHLVTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 LKFFIDEKYKIADTSEGGIYLGFYEKQEVAVKTFCEGSPRAQREVSCLQSSRENSHLVTF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 YGSESHRGHLFVCVTLCEQTLEACLDVHRGEDVENEEDEFARNVLSSIFKAVQELHLSCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 YGSESHRGHLFVCVTLCEQTLEACLDVHRGEDVENEEDEFARNVLSSIFKAVQELHLSCG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 YTHQDLQPQNILIDSKKAAHLADFDKSIKWAGDPQEVKRDLEDLGRLVLYVVKKGSISFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 YTHQDLQPQNILIDSKKAAHLADFDKSIKWAGDPQEVKRDLEDLGRLVLYVVKKGSISFE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 DLKAQSNEEVVQLSPDEETKDLIHRLFHPGEHVRDCLSDLLGHPFFWTWESRYRTLRNVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 DLKAQSNEEVVQLSPDEETKDLIHRLFHPGEHVRDCLSDLLGHPFFWTWESRYRTLRNVG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 NESDIKTRKSESEILRLLQPGPSEHSKSFDKWTTKINECVMKKMNKFYEKRGNFYQNTVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 NESDIKTRKSESEILRLLQPGPSEHSKSFDKWTTKINECVMKKMNKFYEKRGNFYQNTVG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 DLLKFIRNLGEHIDEEKHKKMKLKIGDPSLYFQKTFPDLVIYVYTKLQNTEYRKHFPQTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 DLLKFIRNLGEHIDEEKHKKMKLKIGDPSLYFQKTFPDLVIYVYTKLQNTEYRKHFPQTH
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KB5 SPNKPQCDGAGGASGLASPGC
:::::::::::::::::::::
NP_066 SPNKPQCDGAGGASGLASPGC
730 740
>>XP_011542148 (OMIM: 603303) PREDICTED: tankyrase-1 iso (1301 aa)
initn: 538 init1: 208 opt: 345 Z-score: 210.1 bits: 50.3 E(85289): 5.8e-05
Smith-Waterman score: 387; 33.6% identity (61.2% similar) in 286 aa overlap (26-297:651-927)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MESRDHNNPQEGPTSSSGRRAAVEDNHLLIKAVQNEDVDLVQQLLEGGANVNFQE
.. :..: . :.. :.:: .. ::: ..
XP_011 SLQGFTAAQMGNEAVQQILSESTPIRTSDVDYRLLEASKAGDLETVKQLC-SSQNVNCRD
630 640 650 660 670
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 EEGGW-TPLHNAVQMSREDIVELLLRHGADPVLRKKNGATPFILAAIAGSVKLLKLFLSK
:: :::: :. ..: ..:: ::.:::: . :.: .:. : : .. .:.. .
XP_011 LEGRHSTPLHFAAGYNRVSVVEYLLHHGADVHAKDKGGLVPLHNACSYGHYEVAELLVRH
680 690 700 710 720 730
120 130 140 150 160
pF1KB5 GADVNECDFYGFTAFMEAAVYGKVKALKFLYKRGAN-----------VNLRRKTKEDQER
::.:: :.. :: . :::. :: . :.: :.::. ..: .. : .
XP_011 GASVNVADLWKFTPLHEAAAKGKYEICKLLLKHGADPTKKNRDGNTPLDLVKEGDTDIQD
740 750 760 770 780 790
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 LRKGGATALMDAAEKGHV-EVLKILLDEMGADVNACDNMGRNAL-IHALLSSDDSDVEAI
: .: : ::.:::.:: . .: :. : ..: :..:::. .: :.. ...: .
XP_011 LLRGDA-ALLDAAKKGCLARVQKLCTPE---NINCRDTQGRNSTPLH--LAAGYNNLE-V
800 810 820 830 840 850
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 THLLLDHGADVNVRGERGKTPLILAVEKKHLGLVQRLLEQEHIEINDTDSDGKTALLLAV
.. ::.::::::.. . : :: :. :. . :: . . .: ::. . : : :.
XP_011 AEYLLEHGADVNAQDKGGLIPLHNAASYGHVD-IAALLIKYNTCVNATDKWAFTPLHEAA
860 870 880 890 900 910
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 ELKLKKIAELLCKRGASTDCGDLVMTARRNYDHSLVKVLLSHGAKEDFHPPAEDWKPQSS
. .. :: .::
XP_011 QKGRTQLCALLLAHGADPTMKNQEGQTPLDLATADDIRALLIDAMPPEALPTCFKPQATV
920 930 940 950 960 970
>--
initn: 458 init1: 200 opt: 344 Z-score: 209.6 bits: 50.2 E(85289): 6.2e-05
Smith-Waterman score: 344; 32.4% identity (59.8% similar) in 281 aa overlap (29-297:186-459)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MESRDHNNPQEGPTSSSGRRAAVEDNHLLIKAVQNEDVDLVQQLLEGGANVNFQEEEG
:..: .: ::. :..:... :::: .. :
XP_011 AAGVSSTAPLGPGAAGPGTGVPAVSGALRELLEACRNGDVSRVKRLVDA-ANVNAKDMAG
160 170 180 190 200 210
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GWT-PLHNAVQMSREDIVELLLRHGADPVLRKKNGATPFILAAIAGSVKLLKLFLSKGAD
. ::: :. ..:.:.:: ::. ::. : .: :. : : .....:.: .:::
XP_011 RKSSPLHFAAGFGRKDVVEHLLQMGANVHARDDGGLIPLHNACSFGHAEVVSLLLCQGAD
220 230 240 250 260 270
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 VNECDFYGFTAFMEAAVYGKVKALKFLYKRGANVNLRRKTKEDQERLRKGGATA------
: : ...: . :::. ::. . : ..::. :.: .. : .: :
XP_011 PNARDNWNYTPLHEAAIKGKIDVCIVLLQHGADPNIRNTDGKSALDLADPSAKAVLTGEY
280 290 300 310 320 330
180 190 200 210 220
pF1KB5 ----LMDAAEKGHVEVLKILLDEMGADVNACDNMGRNAL-IHALLSSDDSDVEAITHLLL
:..::..:. : : :: .... .: : ::.. .: :.. . :. :..:::
XP_011 KKDELLEAARSGNEEKLMALLTPLNVNCHASD--GRKSTPLH--LAAGYNRVR-IVQLLL
340 350 360 370 380
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 DHGADVNVRGERGKTPLILAVEKKHLGLVQRLLEQEHIEINDTDSDGKTALLLAVELKLK
.:::::... . : .:: : : : .:: .. .: : : : :. .
XP_011 QHGADVHAKDKGGLVPLHNACSYGHYE-VTELLLKHGACVNAMDLWQFTPLHEAASKNRV
390 400 410 420 430 440
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 KIAELLCKRGASTDCGDLVMTARRNYDHSLVKVLLSHGAKEDFHPPAEDWKPQSSHWGAA
.. :: ..::
XP_011 EVCSLLLSHGADPTLVNCHGKSAVDMAPTPELRERLTYEFKGHSLLQAAREADLAKVKKT
450 460 470 480 490 500
>>XP_006716326 (OMIM: 603303) PREDICTED: tankyrase-1 iso (1316 aa)
initn: 538 init1: 208 opt: 345 Z-score: 210.0 bits: 50.3 E(85289): 5.8e-05
Smith-Waterman score: 387; 33.6% identity (61.2% similar) in 286 aa overlap (26-297:651-927)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MESRDHNNPQEGPTSSSGRRAAVEDNHLLIKAVQNEDVDLVQQLLEGGANVNFQE
.. :..: . :.. :.:: .. ::: ..
XP_006 SLQGFTAAQMGNEAVQQILSESTPIRTSDVDYRLLEASKAGDLETVKQLC-SSQNVNCRD
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pF1KB5 EEGGW-TPLHNAVQMSREDIVELLLRHGADPVLRKKNGATPFILAAIAGSVKLLKLFLSK
:: :::: :. ..: ..:: ::.:::: . :.: .:. : : .. .:.. .
XP_006 LEGRHSTPLHFAAGYNRVSVVEYLLHHGADVHAKDKGGLVPLHNACSYGHYEVAELLVRH
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120 130 140 150 160
pF1KB5 GADVNECDFYGFTAFMEAAVYGKVKALKFLYKRGAN-----------VNLRRKTKEDQER
::.:: :.. :: . :::. :: . :.: :.::. ..: .. : .
XP_006 GASVNVADLWKFTPLHEAAAKGKYEICKLLLKHGADPTKKNRDGNTPLDLVKEGDTDIQD
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pF1KB5 LRKGGATALMDAAEKGHV-EVLKILLDEMGADVNACDNMGRNAL-IHALLSSDDSDVEAI
: .: : ::.:::.:: . .: :. : ..: :..:::. .: :.. ...: .
XP_006 LLRGDA-ALLDAAKKGCLARVQKLCTPE---NINCRDTQGRNSTPLH--LAAGYNNLE-V
800 810 820 830 840 850
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 THLLLDHGADVNVRGERGKTPLILAVEKKHLGLVQRLLEQEHIEINDTDSDGKTALLLAV
.. ::.::::::.. . : :: :. :. . :: . . .: ::. . : : :.
XP_006 AEYLLEHGADVNAQDKGGLIPLHNAASYGHVD-IAALLIKYNTCVNATDKWAFTPLHEAA
860 870 880 890 900 910
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 ELKLKKIAELLCKRGASTDCGDLVMTARRNYDHSLVKVLLSHGAKEDFHPPAEDWKPQSS
. .. :: .::
XP_006 QKGRTQLCALLLAHGADPTMKNQEGQTPLDLATADDIRALLIDAMPPEALPTCFKPQATV
920 930 940 950 960 970
>--
initn: 458 init1: 200 opt: 344 Z-score: 209.5 bits: 50.2 E(85289): 6.2e-05
Smith-Waterman score: 344; 32.4% identity (59.8% similar) in 281 aa overlap (29-297:186-459)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MESRDHNNPQEGPTSSSGRRAAVEDNHLLIKAVQNEDVDLVQQLLEGGANVNFQEEEG
:..: .: ::. :..:... :::: .. :
XP_006 AAGVSSTAPLGPGAAGPGTGVPAVSGALRELLEACRNGDVSRVKRLVDA-ANVNAKDMAG
160 170 180 190 200 210
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 GWT-PLHNAVQMSREDIVELLLRHGADPVLRKKNGATPFILAAIAGSVKLLKLFLSKGAD
. ::: :. ..:.:.:: ::. ::. : .: :. : : .....:.: .:::
XP_006 RKSSPLHFAAGFGRKDVVEHLLQMGANVHARDDGGLIPLHNACSFGHAEVVSLLLCQGAD
220 230 240 250 260 270
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 VNECDFYGFTAFMEAAVYGKVKALKFLYKRGANVNLRRKTKEDQERLRKGGATA------
: : ...: . :::. ::. . : ..::. :.: .. : .: :
XP_006 PNARDNWNYTPLHEAAIKGKIDVCIVLLQHGADPNIRNTDGKSALDLADPSAKAVLTGEY
280 290 300 310 320 330
180 190 200 210 220
pF1KB5 ----LMDAAEKGHVEVLKILLDEMGADVNACDNMGRNAL-IHALLSSDDSDVEAITHLLL
:..::..:. : : :: .... .: : ::.. .: :.. . :. :..:::
XP_006 KKDELLEAARSGNEEKLMALLTPLNVNCHASD--GRKSTPLH--LAAGYNRVR-IVQLLL
340 350 360 370 380
230 240 250 260 270 280
pF1KB5 DHGADVNVRGERGKTPLILAVEKKHLGLVQRLLEQEHIEINDTDSDGKTALLLAVELKLK
.:::::... . : .:: : : : .:: .. .: : : : :. .
XP_006 QHGADVHAKDKGGLVPLHNACSYGHYE-VTELLLKHGACVNAMDLWQFTPLHEAASKNRV
390 400 410 420 430 440
290 300 310 320 330 340
pF1KB5 KIAELLCKRGASTDCGDLVMTARRNYDHSLVKVLLSHGAKEDFHPPAEDWKPQSSHWGAA
.. :: ..::
XP_006 EVCSLLLSHGADPTLVNCHGKSAVDMAPTPELRERLTYEFKGHSLLQAAREADLAKVKKT
450 460 470 480 490 500
>>XP_011542147 (OMIM: 603303) PREDICTED: tankyrase-1 iso (1316 aa)
initn: 538 init1: 208 opt: 345 Z-score: 210.0 bits: 50.3 E(85289): 5.8e-05
Smith-Waterman score: 387; 33.6% identity (61.2% similar) in 286 aa overlap (26-297:651-927)
10 20 30 40 50
pF1KB5 MESRDHNNPQEGPTSSSGRRAAVEDNHLLIKAVQNEDVDLVQQLLEGGANVNFQE
.. :..: . :.. :.:: .. ::: ..
XP_011 SLQGFTAAQMGNEAVQQILSESTPIRTSDVDYRLLEASKAGDLETVKQLC-SSQNVNCRD
630 640 650 660 670
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 EEGGW-TPLHNAVQMSREDIVELLLRHGADPVLRKKNGATPFILAAIAGSVKLLKLFLSK
:: :::: :. ..: ..:: ::.:::: . :.: .:. : : .. .:.. .
XP_011 LEGRHSTPLHFAAGYNRVSVVEYLLHHGADVHAKDKGGLVPLHNACSYGHYEVAELLVRH
680 690 700 710 720 730
120 130 140 150 160
pF1KB5 GADVNECDFYGFTAFMEAAVYGKVKALKFLYKRGAN-----------VNLRRKTKEDQER
::.:: :.. :: . :::. :: . :.: :.::. ..: .. : .
XP_011 GASVNVADLWKFTPLHEAAAKGKYEICKLLLKHGADPTKKNRDGNTPLDLVKEGDTDIQD
740 750 760 770 780 790
170 180 190 200 210 220
pF1KB5 LRKGGATALMDAAEKGHV-EVLKILLDEMGADVNACDNMGRNAL-IHALLSSDDSDVEAI
: .: : ::.:::.:: . .: :. : ..: :..:::. .: :.. ...: .
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