Result of FASTA (omim) for
pFN21AB5724
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5724, 729 aa
1>>>pF1KB5724 729 - 729 aa - 729 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5701+/-0.000769; mu= -3.7818+/- 0.045
mean_var=941.8829+/-217.600, 0's: 0 Z-trim(111.0): 615 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.041790
statistics sampled from 18965 (19499) to 18965 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.554), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 10.910
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005268866 (OMIM: 604834,616439) PREDICTED: seri ( 729) 4799 307.3 1.4e-82
XP_005268867 (OMIM: 604834,616439) PREDICTED: seri ( 729) 4799 307.3 1.4e-82
NP_037386 (OMIM: 604834,616439) serine/threonine-p ( 729) 4799 307.3 1.4e-82
XP_005273413 (OMIM: 605048) PREDICTED: inhibitor o ( 716) 1981 137.4 1.9e-31
NP_054721 (OMIM: 605048) inhibitor of nuclear fact ( 716) 1981 137.4 1.9e-31
NP_001180251 (OMIM: 605048) inhibitor of nuclear f ( 657) 1951 135.6 6.4e-31
NP_001180250 (OMIM: 605048) inhibitor of nuclear f ( 631) 1600 114.4 1.5e-24
XP_016858357 (OMIM: 605048) PREDICTED: inhibitor o ( 594) 1430 104.1 1.7e-21
>>XP_005268866 (OMIM: 604834,616439) PREDICTED: serine/t (729 aa)
initn: 4799 init1: 4799 opt: 4799 Z-score: 1603.7 bits: 307.3 E(85289): 1.4e-82
Smith-Waterman score: 4799; 100.0% identity (100.0% similar) in 729 aa overlap (1-729:1-729)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 VYEKLMKINLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAHQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VYEKLMKINLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAHQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAMTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAMTH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 FTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETLPQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 KMFTASSGIKHTMTPIYPSSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLTMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KMFTASSGIKHTMTPIYPSSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLTMD
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 GGLRNVDCL
:::::::::
XP_005 GGLRNVDCL
>>XP_005268867 (OMIM: 604834,616439) PREDICTED: serine/t (729 aa)
initn: 4799 init1: 4799 opt: 4799 Z-score: 1603.7 bits: 307.3 E(85289): 1.4e-82
Smith-Waterman score: 4799; 100.0% identity (100.0% similar) in 729 aa overlap (1-729:1-729)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 VYEKLMKINLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAHQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VYEKLMKINLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAHQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAMTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAMTH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 FTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETLPQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 KMFTASSGIKHTMTPIYPSSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLTMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KMFTASSGIKHTMTPIYPSSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLTMD
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 GGLRNVDCL
:::::::::
XP_005 GGLRNVDCL
>>NP_037386 (OMIM: 604834,616439) serine/threonine-prote (729 aa)
initn: 4799 init1: 4799 opt: 4799 Z-score: 1603.7 bits: 307.3 E(85289): 1.4e-82
Smith-Waterman score: 4799; 100.0% identity (100.0% similar) in 729 aa overlap (1-729:1-729)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB5 VYEKLMKINLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAHQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 VYEKLMKINLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAHQE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB5 GTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAMTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 GTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAMTH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB5 FTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETLPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 FTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETLPQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 KMFTASSGIKHTMTPIYPSSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLTMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_037 KMFTASSGIKHTMTPIYPSSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLTMD
670 680 690 700 710 720
pF1KB5 GGLRNVDCL
:::::::::
NP_037 GGLRNVDCL
>>XP_005273413 (OMIM: 605048) PREDICTED: inhibitor of nu (716 aa)
initn: 2148 init1: 1951 opt: 1981 Z-score: 685.6 bits: 137.4 E(85289): 1.9e-31
Smith-Waterman score: 2222; 49.3% identity (74.9% similar) in 718 aa overlap (1-714:1-707)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK
::::.:.:: .:.:::::::.:...:.::.:.: :.::::. :.::: .::.::::::.
XP_005 MQSTANYLWHTDDLLGQGATASVYKARNKKSGELVAVKVFNTTSYLRPREVQVREFEVLR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV
::::.:::::::.:: .:.:::.::.: ::: .::: : ::.::::.:::.::: ::
XP_005 KLNHQNIVKLFAVEETGGSRQKVLVMEYCSSGSLLSVLESPENAFGLPEDEFLVVLRCVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL
.::::::::::::::::::::::..::.:::.::::::::::::.:::.:::.:::::::
XP_005 AGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRLVGEEGQSIYKLTDFGAARELDDDEKFVSVYGTEEYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG
:::::::::::: .:: .:.::::::::::.:::::::::: :: :::::::.::.: :
XP_005 HPDMYERAVLRKPQQKAFGVTVDLWSIGVTLYHAATGSLPFIPFGGPRRNKEIMYRITTE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA
::.:::.:.:. ::::..:: .:..:.:: ::: :.:.::::::..: ::::::::::
XP_005 KPAGAIAGAQRRENGPLEWSYTLPITCQLSLGLQSQLVPILANILEVEQAKCWGFDQFFA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV
::::::.:.:.:::::.: . :.::::..:: .::.: :.:::.. .:: ..::. :
XP_005 ETSDILQRVVVHVFSLSQAVLHHIYIHAHNTIAIFQEAVHKQTSVAPRHQEYLFEGHLCV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG
:::. :::. .:: .:. . : . ... ...:: :. ::..: . ::.. :
XP_005 LEPSVSAQHIAHTTASSPLTLFSTAIPKGLAFRDPALDVPKFVPKVDLQADYNTAKGVLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK
. : :.: .:: :::: .:..:..:... : .. ::. : . . . :
XP_005 AGYQALRLARALLDGQELMFRGLHWVMEVLQ----ATCRRTLEVARTSLLYLSSSLGT--
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KB5 VYEKLMKI--NLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAH
:.. .. . : :: ......: :. . .. . . :: :: ..
XP_005 --ERFSSVAGTPEIQELKAAAELRSRLRTLAEVLSRCSQNITETQESLS---SLNRELVK
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 QEGTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAM
.. .::.....: :. :. :: ::::.. . :.::::::::.:: .. . : . .
XP_005 SRDQVHEDRSIQQIQCCLDKMNFIYKQFKKSRMRPGLGYNEEQIHKLDKVNFSHLAKRLL
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 THFTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETL
: .:::.::.: : . .: . . :..: . . . :.. :: ..: : :
XP_005 QVFQEECVQKYQASLVTHGKRMRVVHETRNHLRLVGCSVAACNTEAQGVQESLSKLLEEL
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 PQKMFTA-SSGIKHTMTPIYP-SSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGS
.... ..: . . :: : : : .. : :..: : :. ....: .::.:.::.
XP_005 SHQLLQDRAKGAQASPPPIAPYPSPTRKDLLLHMQELCEGMKLLASDLLDNNRIIERLNR
650 660 670 680 690 700
720
pF1KB5 LTMDGGLRNVDCL
XP_005 VPAPPDV
710
>>NP_054721 (OMIM: 605048) inhibitor of nuclear factor k (716 aa)
initn: 2148 init1: 1951 opt: 1981 Z-score: 685.6 bits: 137.4 E(85289): 1.9e-31
Smith-Waterman score: 2222; 49.3% identity (74.9% similar) in 718 aa overlap (1-714:1-707)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK
::::.:.:: .:.:::::::.:...:.::.:.: :.::::. :.::: .::.::::::.
NP_054 MQSTANYLWHTDDLLGQGATASVYKARNKKSGELVAVKVFNTTSYLRPREVQVREFEVLR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV
::::.:::::::.:: .:.:::.::.: ::: .::: : ::.::::.:::.::: ::
NP_054 KLNHQNIVKLFAVEETGGSRQKVLVMEYCSSGSLLSVLESPENAFGLPEDEFLVVLRCVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL
.::::::::::::::::::::::..::.:::.::::::::::::.:::.:::.:::::::
NP_054 AGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRLVGEEGQSIYKLTDFGAARELDDDEKFVSVYGTEEYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG
:::::::::::: .:: .:.::::::::::.:::::::::: :: :::::::.::.: :
NP_054 HPDMYERAVLRKPQQKAFGVTVDLWSIGVTLYHAATGSLPFIPFGGPRRNKEIMYRITTE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA
::.:::.:.:. ::::..:: .:..:.:: ::: :.:.::::::..: ::::::::::
NP_054 KPAGAIAGAQRRENGPLEWSYTLPITCQLSLGLQSQLVPILANILEVEQAKCWGFDQFFA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV
::::::.:.:.:::::.: . :.::::..:: .::.: :.:::.. .:: ..::. :
NP_054 ETSDILQRVVVHVFSLSQAVLHHIYIHAHNTIAIFQEAVHKQTSVAPRHQEYLFEGHLCV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG
:::. :::. .:: .:. . : . ... ...:: :. ::..: . ::.. :
NP_054 LEPSVSAQHIAHTTASSPLTLFSTAIPKGLAFRDPALDVPKFVPKVDLQADYNTAKGVLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK
. : :.: .:: :::: .:..:..:... : .. ::. : . . . :
NP_054 AGYQALRLARALLDGQELMFRGLHWVMEVLQ----ATCRRTLEVARTSLLYLSSSLGT--
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KB5 VYEKLMKI--NLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAH
:.. .. . : :: ......: :. . .. . . :: :: ..
NP_054 --ERFSSVAGTPEIQELKAAAELRSRLRTLAEVLSRCSQNITETQESLS---SLNRELVK
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 QEGTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAM
.. .::.....: :. :. :: ::::.. . :.::::::::.:: .. . : . .
NP_054 SRDQVHEDRSIQQIQCCLDKMNFIYKQFKKSRMRPGLGYNEEQIHKLDKVNFSHLAKRLL
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 THFTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETL
: .:::.::.: : . .: . . :..: . . . :.. :: ..: : :
NP_054 QVFQEECVQKYQASLVTHGKRMRVVHETRNHLRLVGCSVAACNTEAQGVQESLSKLLEEL
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 PQKMFTA-SSGIKHTMTPIYP-SSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGS
.... ..: . . :: : : : .. : :..: : :. ....: .::.:.::.
NP_054 SHQLLQDRAKGAQASPPPIAPYPSPTRKDLLLHMQELCEGMKLLASDLLDNNRIIERLNR
650 660 670 680 690 700
720
pF1KB5 LTMDGGLRNVDCL
NP_054 VPAPPDV
710
>>NP_001180251 (OMIM: 605048) inhibitor of nuclear facto (657 aa)
initn: 2148 init1: 1951 opt: 1951 Z-score: 676.1 bits: 135.6 E(85289): 6.4e-31
Smith-Waterman score: 2134; 52.4% identity (77.1% similar) in 632 aa overlap (1-630:1-621)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MQSTSNHLWLLSDILGQGATANVFRGRHKKTGDLFAIKVFNNISFLRPVDVQMREFEVLK
::::.:.:: .:.:::::::.:...:.::.:.: :.::::. :.::: .::.::::::.
NP_001 MQSTANYLWHTDDLLGQGATASVYKARNKKSGELVAVKVFNTTSYLRPREVQVREFEVLR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 KLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVV
::::.:::::::.:: .:.:::.::.: ::: .::: : ::.::::.:::.::: ::
NP_001 KLNHQNIVKLFAVEETGGSRQKVLVMEYCSSGSLLSVLESPENAFGLPEDEFLVVLRCVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 GGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYL
.::::::::::::::::::::::..::.:::.::::::::::::.:::.:::.:::::::
NP_001 AGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRLVGEEGQSIYKLTDFGAARELDDDEKFVSVYGTEEYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 HPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITG
:::::::::::: .:: .:.::::::::::.:::::::::: :: :::::::.::.: :
NP_001 HPDMYERAVLRKPQQKAFGVTVDLWSIGVTLYHAATGSLPFIPFGGPRRNKEIMYRITTE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFA
::.:::.:.:. ::::..:: .:..:.:: ::: :.:.::::::..: ::::::::::
NP_001 KPAGAIAGAQRRENGPLEWSYTLPITCQLSLGLQSQLVPILANILEVEQAKCWGFDQFFA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 ETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLV
::::::.:.:.:::::.: . :.::::..:: .::.: :.:::.. .:: ..::. :
NP_001 ETSDILQRVVVHVFSLSQAVLHHIYIHAHNTIAIFQEAVHKQTSVAPRHQEYLFEGHLCV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 LEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITG
:::. :::. .:: .:. . : . ... ...:: :. ::..: . ::.. :
NP_001 LEPSVSAQHIAHTTASSPLTLFSTAIPKGLAFRDPALDVPKFVPKVDLQADYNTAKGVLG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 VVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVK
. : :.: .:: :::: .:..:..:... : .. ::. : . . . :
NP_001 AGYQALRLARALLDGQELMFRGLHWVMEVLQ----ATCRRTLEVARTSLLYLSSSLGT--
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KB5 VYEKLMKI--NLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAH
:.. .. . : :: ......: :. . .. . . :: :: ..
NP_001 --ERFSSVAGTPEIQELKAAAELRSRLRTLAEVLSRCSQNITETQESLS---SLNRELVK
480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 QEGTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAM
.. .::.....: :. :. :: ::::.. . :.::::::::.:: .. . : . .
NP_001 SRDQVHEDRSIQQIQCCLDKMNFIYKQFKKSRMRPGLGYNEEQIHKLDKVNFSHLAKRLL
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 THFTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETL
: .:::.::.: : . .: . . :..:
NP_001 QVFQEECVQKYQASLVTHGKRMRVVHETRNHLRLVGCSVAACNTEAQGVQESLSKHARAL
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 PQKMFTASSGIKHTMTPIYPSSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLT
NP_001 RGDEAAGI
650
>>NP_001180250 (OMIM: 605048) inhibitor of nuclear facto (631 aa)
initn: 1767 init1: 1570 opt: 1600 Z-score: 561.9 bits: 114.4 E(85289): 1.5e-24
Smith-Waterman score: 1841; 47.2% identity (72.8% similar) in 633 aa overlap (86-714:1-622)
60 70 80 90 100 110
pF1KB5 FEVLKKLNHKNIVKLFAIEEETTTRHKVLIMEFCPCGSLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIV
::.: ::: .::: : ::.::::.:::.:
NP_001 MEYCSSGSLLSVLESPENAFGLPEDEFLVV
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB5 LRDVVGGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSVYKLTDFGAARELEDDEQFVSLYG
:: ::.::::::::::::::::::::::..::.:::.::::::::::::.:::.:::.::
NP_001 LRCVVAGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRLVGEEGQSIYKLTDFGAARELDDDEKFVSVYG
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB5 TEEYLHPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFYHAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMY
::::::::::::::::: .:: .:.::::::::::.:::::::::: :: :::::::.::
NP_001 TEEYLHPDMYERAVLRKPQQKAFGVTVDLWSIGVTLYHAATGSLPFIPFGGPRRNKEIMY
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB5 KIITGKPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRGLQVLLTPVLANILEADQEKCWGF
.: : ::.:::.:.:. ::::..:: .:..:.:: ::: :.:.::::::..: :::::
NP_001 RITTEKPAGAIAGAQRRENGPLEWSYTLPITCQLSLGLQSQLVPILANILEVEQAKCWGF
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB5 DQFFAETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTATIFHELVYKQTKIISSNQELIYE
:::::::::::.:.:.:::::.: . :.::::..:: .::.: :.:::.. .:: ..:
NP_001 DQFFAETSDILQRVVVHVFSLSQAVLHHIYIHAHNTIAIFQEAVHKQTSVAPRHQEYLFE
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB5 GRRLVLEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGLIYEKISLPKVHPRYDLDGDASMA
:. ::::. :::. .:: .:. . : . ... ...:: :. ::..: . :
NP_001 GHLCVLEPSVSAQHIAHTTASSPLTLFSTAIPKGLAFRDPALDVPKFVPKVDLQADYNTA
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB5 KAITGVVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKDDYNETVHKKTEVVITLDFCIRNI
:.. :. : :.: .:: :::: .:..:..:... : .. ::. : . . .
NP_001 KGVLGAGYQALRLARALLDGQELMFRGLHWVMEVLQ----ATCRRTLEVARTSLLYLSSS
340 350 360 370 380
480 490 500 510 520 530
pF1KB5 EKTVKVYEKLMKI--NLEAAELGEISDIHTKLLRLSSSQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLA
: :.. .. . : :: ......: :. . .. . . :: ::
NP_001 LGT----ERFSSVAGTPEIQELKAAAELRSRLRTLAEVLSRCSQNITETQESLS---SLN
390 400 410 420 430
540 550 560 570 580 590
pF1KB5 DAWAHQEGTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDKAERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYH
.... .::.....: :. :. :: ::::.. . :.::::::::.:: .. .
NP_001 RELVKSRDQVHEDRSIQQIQCCLDKMNFIYKQFKKSRMRPGLGYNEEQIHKLDKVNFSHL
440 450 460 470 480 490
600 610 620 630 640 650
pF1KB5 ATKAMTHFTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQLLSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNE
: . . : .:::.::.: : . .: . . :..: . . . :.. :: ..
NP_001 AKRLLQVFQEECVQKYQASLVTHGKRMRVVHETRNHLRLVGCSVAACNTEAQGVQESLSK
500 510 520 530 540 550
660 670 680 690 700 710
pF1KB5 LQETLPQKMFTA-SSGIKHTMTPIYP-SSNTLVEMTLGMKKLKEEMEGVVKELAENNHIL
: : : .... ..: . . :: : : : .. : :..: : :. ....: .::.:.
NP_001 LLEELSHQLLQDRAKGAQASPPPIAPYPSPTRKDLLLHMQELCEGMKLLASDLLDNNRII
560 570 580 590 600 610
720
pF1KB5 ERFGSLTMDGGLRNVDCL
::.
NP_001 ERLNRVPAPPDV
620 630
>>XP_016858357 (OMIM: 605048) PREDICTED: inhibitor of nu (594 aa)
initn: 1597 init1: 1400 opt: 1430 Z-score: 506.7 bits: 104.1 E(85289): 1.7e-21
Smith-Waterman score: 1671; 46.0% identity (72.1% similar) in 596 aa overlap (123-714:1-585)
100 110 120 130 140 150
pF1KB5 SLYTVLEEPSNAYGLPESEFLIVLRDVVGGMNHLRENGIVHRDIKPGNIMRVIGEDGQSV
:::::::::::::::::::::..::.:::.
XP_016 MNHLRENGIVHRDIKPGNIMRLVGEEGQSI
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB5 YKLTDFGAARELEDDEQFVSLYGTEEYLHPDMYERAVLRKDHQKKYGATVDLWSIGVTFY
::::::::::::.:::.:::.::::::::::::::::::: .:: .:.::::::::::.:
XP_016 YKLTDFGAARELDDDEKFVSVYGTEEYLHPDMYERAVLRKPQQKAFGVTVDLWSIGVTLY
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB5 HAATGSLPFRPFEGPRRNKEVMYKIITGKPSGAISGVQKAENGPIDWSGDMPVSCSLSRG
::::::::: :: :::::::.::.: : ::.:::.:.:. ::::..:: .:..:.:: :
XP_016 HAATGSLPFIPFGGPRRNKEIMYRITTEKPAGAIAGAQRRENGPLEWSYTLPITCQLSLG
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB5 LQVLLTPVLANILEADQEKCWGFDQFFAETSDILHRMVIHVFSLQQMTAHKIYIHSYNTA
:: :.:.::::::..: ::::::::::::::::.:.:.:::::.: . :.::::..::
XP_016 LQSQLVPILANILEVEQAKCWGFDQFFAETSDILQRVVVHVFSLSQAVLHHIYIHAHNTI
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB5 TIFHELVYKQTKIISSNQELIYEGRRLVLEPGRLAQHFPKTTEENPIFVVSREPLNTIGL
.::.: :.:::.. .:: ..::. ::::. :::. .:: .:. . : . ...
XP_016 AIFQEAVHKQTSVAPRHQEYLFEGHLCVLEPSVSAQHIAHTTASSPLTLFSTAIPKGLAF
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB5 IYEKISLPKVHPRYDLDGDASMAKAITGVVCYACRIASTLLLYQELMRKGIRWLIELIKD
...:: :. ::..: . ::.. :. : :.: .:: :::: .:..:..:...
XP_016 RDPALDVPKFVPKVDLQADYNTAKGVLGAGYQALRLARALLDGQELMFRGLHWVMEVLQ-
280 290 300 310 320
460 470 480 490 500 510
pF1KB5 DYNETVHKKTEVVITLDFCIRNIEKTVKVYEKLMKI--NLEAAELGEISDIHTKLLRLSS
: .. ::. : . . . : :.. .. . : :: ......: :.
XP_016 ---ATCRRTLEVARTSLLYLSSSLGT----ERFSSVAGTPEIQELKAAAELRSRLRTLAE
330 340 350 360 370 380
520 530 540 550 560 570
pF1KB5 SQGTIETSLQDIDSRLSPGGSLADAWAHQEGTHPKDRNVEKLQVLLNCMTEIYYQFKKDK
. .. . . :: :: .... .::.....: :. :. :: ::::..
XP_016 VLSRCSQNITETQESLS---SLNRELVKSRDQVHEDRSIQQIQCCLDKMNFIYKQFKKSR
390 400 410 420 430
580 590 600 610 620 630
pF1KB5 AERRLAYNEEQIHKFDKQKLYYHATKAMTHFTDECVKKYEAFLNKSEEWIRKMLHLRKQL
. :.::::::::.:: .. . : . . : .:::.::.: : . .: . . :..:
XP_016 MRPGLGYNEEQIHKLDKVNFSHLAKRLLQVFQEECVQKYQASLVTHGKRMRVVHETRNHL
440 450 460 470 480 490
640 650 660 670 680
pF1KB5 LSLTNQCFDIEEEVSKYQEYTNELQETLPQKMFTA-SSGIKHTMTPIYP-SSNTLVEMTL
. . . :.. :: ..: : : .... ..: . . :: : : : .. :
XP_016 RLVGCSVAACNTEAQGVQESLSKLLEELSHQLLQDRAKGAQASPPPIAPYPSPTRKDLLL
500 510 520 530 540 550
690 700 710 720
pF1KB5 GMKKLKEEMEGVVKELAENNHILERFGSLTMDGGLRNVDCL
:..: : :. ....: .::.:.::.
XP_016 HMQELCEGMKLLASDLLDNNRIIERLNRVPAPPDV
560 570 580 590
729 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 09:52:23 2016 done: Sun Nov 6 09:52:24 2016
Total Scan time: 10.910 Total Display time: 0.150
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]