Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB5054
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB5054, 531 aa
1>>>pF1KB5054 531 - 531 aa - 531 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0387+/-0.00124; mu= 14.1912+/- 0.074
mean_var=66.9399+/-13.398, 0's: 0 Z-trim(100.6): 47 B-trim: 31 in 1/48
Lambda= 0.156759
statistics sampled from 6142 (6178) to 6142 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.19), width: 16
Scan time: 2.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 531) 3355 768.3 0
CCDS32617.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 530) 2952 677.2 1.3e-194
CCDS34640.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 486) 2682 616.1 2.9e-176
CCDS54105.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 485) 2325 535.4 5.8e-152
CCDS54106.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 493) 1654 383.6 2.8e-106
CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 545) 917 216.9 4.7e-56
CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 541) 859 203.8 4.1e-52
CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 520) 852 202.2 1.2e-51
CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 503) 848 201.3 2.1e-51
CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 539) 804 191.4 2.3e-48
CCDS30888.1 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 507) 775 184.8 2e-46
CCDS5269.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 556) 754 180.1 5.9e-45
CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 543) 711 170.4 4.9e-42
CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 499) 645 155.4 1.4e-37
CCDS82989.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 486) 641 154.5 2.6e-37
CCDS82990.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 448) 636 153.4 5.2e-37
CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 535) 621 150.0 6.5e-36
CCDS58711.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 509) 610 147.5 3.5e-35
CCDS54366.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 456) 550 133.9 3.8e-31
CCDS55843.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 488) 549 133.7 4.7e-31
CCDS68181.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 529) 521 127.4 4.1e-29
CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 548) 521 127.4 4.3e-29
CCDS43522.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 401) 480 118.1 2e-26
CCDS68180.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 475) 479 117.9 2.7e-26
CCDS42696.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 339) 412 102.7 7.1e-22
CCDS13738.1 CCT8L2 gene_id:150160|Hs108|chr22 ( 557) 288 74.7 3.2e-13
>>CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 (531 aa)
initn: 3355 init1: 3355 opt: 3355 Z-score: 4099.9 bits: 768.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3355; 99.8% identity (99.8% similar) in 531 aa overlap (1-531:1-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EGFEAAKEKALQFLEEVKVSREMDRETLIDVARTSLRTKVHAELADVLTEAVVDSILAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EGFEAAKEKALQFLEEVKVSREMDRETLIDVARTSLRTKVHAELADVLTEAVVDSILAIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KQDEPIDLFMIEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDACILTCNVSLEYE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS55 KQDEPIDLFMIEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAYILTCNVSLEYE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGFVVINQKGIDPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGFVVINQKGIDPF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SLDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SLDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAIDDGCVVPGAGAVEVAMAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAIDDGCVVPGAGAVEVAMAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKIQAEHSESGQLVGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKIQAEHSESGQLVGVD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB5 LNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLKG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLKG
490 500 510 520 530
>>CCDS32617.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 (530 aa)
initn: 2952 init1: 2952 opt: 2952 Z-score: 3607.4 bits: 677.2 E(32554): 1.3e-194
Smith-Waterman score: 2952; 85.8% identity (95.7% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
:::.:..: :::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MAAIKAVNSKAEVARARAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIT
:::: :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS32 NVLLDEMQIQHPTASLIAKVATAQDDVTGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EGFEAAKEKALQFLEEVKVSREMDRETLIDVARTSLRTKVHAELADVLTEAVVDSILAIK
::::::: :::. ::::::..:: :. :.:::::::.:::::::::::::.::::.::..
CCDS32 EGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRKILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVDSVLAVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KQDEPIDLFMIEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDACILTCNVSLEYE
. ::::::.:::::::: :::.::.:::::::::::::::::::: :: ::::::::
CCDS32 RPGYPIDLFMVEIMEMKHKLGTDTKLIQGLVLDHGARHPDMKKRVEDAFILICNVSLEYE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGFVVINQKGIDPF
:::::::::::.:::.:::::::::::::::.:::.:: :::..:.::::::::::::::
CCDS32 KTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFVVINQKGIDPF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SLDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
:::.:.:.::::::::::::::::.:::::.:.:::.::. :::::::::::::::::::
CCDS32 SLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAIDDGCVVPGAGAVEVAMAE
::::.: :: :::::.::::::::::.:::.::::::.::::.:::.::::::.::::::
CCDS32 TFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMVPGAGAIEVAMAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKIQAEHSESGQLVGVD
::. .: :.::::.::::::::::::::::::::.:.: ::::::.:::: :: ::::::
CCDS32 ALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQAEHVESKQLVGVD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB5 LNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLKG
::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLK
490 500 510 520 530
>>CCDS34640.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 (486 aa)
initn: 2671 init1: 2671 opt: 2682 Z-score: 3278.0 bits: 616.1 E(32554): 2.9e-176
Smith-Waterman score: 2982; 91.3% identity (91.3% similar) in 531 aa overlap (1-531:1-486)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIT
::::::: ::::::::
CCDS34 NVLLHEM---------------------------------------------GLHPRIIT
70
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EGFEAAKEKALQFLEEVKVSREMDRETLIDVARTSLRTKVHAELADVLTEAVVDSILAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EGFEAAKEKALQFLEEVKVSREMDRETLIDVARTSLRTKVHAELADVLTEAVVDSILAIK
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KQDEPIDLFMIEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDACILTCNVSLEYE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS34 KQDEPIDLFMIEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAYILTCNVSLEYE
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGFVVINQKGIDPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGFVVINQKGIDPF
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SLDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAIDDGCVVPGAGAVEVAMAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAIDDGCVVPGAGAVEVAMAE
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKIQAEHSESGQLVGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKIQAEHSESGQLVGVD
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530
pF1KB5 LNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLKG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLKG
440 450 460 470 480
>>CCDS54105.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 (485 aa)
initn: 2313 init1: 2313 opt: 2325 Z-score: 2841.7 bits: 535.4 E(32554): 5.8e-152
Smith-Waterman score: 2580; 77.5% identity (87.2% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
:::.:..: :::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAAIKAVNSKAEVARARAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIT
:::: :: :::::::.
CCDS54 NVLLDEM---------------------------------------------GLHPRIIA
70
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EGFEAAKEKALQFLEEVKVSREMDRETLIDVARTSLRTKVHAELADVLTEAVVDSILAIK
::::::: :::. ::::::..:: :. :.:::::::.:::::::::::::.::::.::..
CCDS54 EGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRKILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVDSVLAVR
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KQDEPIDLFMIEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDACILTCNVSLEYE
. ::::::.:::::::: :::.::.:::::::::::::::::::: :: ::::::::
CCDS54 RPGYPIDLFMVEIMEMKHKLGTDTKLIQGLVLDHGARHPDMKKRVEDAFILICNVSLEYE
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGFVVINQKGIDPF
:::::::::::.:::.:::::::::::::::.:::.:: :::..:.::::::::::::::
CCDS54 KTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFVVINQKGIDPF
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SLDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
:::.:.:.::::::::::::::::.:::::.:.:::.::. :::::::::::::::::::
CCDS54 SLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAIDDGCVVPGAGAVEVAMAE
::::.: :: :::::.::::::::::.:::.::::::.::::.:::.::::::.::::::
CCDS54 TFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMVPGAGAIEVAMAE
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KB5 ALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKIQAEHSESGQLVGVD
::. .: :.::::.::::::::::::::::::::.:.: ::::::.:::: :: ::::::
CCDS54 ALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQAEHVESKQLVGVD
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530
pF1KB5 LNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLKG
::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLK
440 450 460 470 480
>>CCDS54106.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 (493 aa)
initn: 1683 init1: 1647 opt: 1654 Z-score: 2021.4 bits: 383.6 E(32554): 2.8e-106
Smith-Waterman score: 2645; 79.4% identity (89.1% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-493)
10 20 30 40 50 60
pF1KB5 MAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
:::.:..: :::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAAIKAVNSKAEVARARAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB5 NVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIT
:::: :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS54 NVLLDEMQIQHPTASLIAKVATAQDDVTGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB5 EGFEAAKEKALQFLEEVKVSREMDRETLIDVARTSLRTKVHAELADVLTEAVVDSILAIK
::::::: :::. ::::::..:: :. :.:::::::.:::::::::::::.::::.::..
CCDS54 EGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRKILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVDSVLAVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB5 KQDEPIDLFMIEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDACILTCNVSLEYE
. ::::::.:::::::: :::.
CCDS54 RPGYPIDLFMVEIMEMKHKLGTDTK-----------------------------------
190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB5 KTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGFVVINQKGIDPF
:::::::::.:::.:::::::::::::::.:::.:: :::..:.::::::::::::::
CCDS54 --EVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFVVINQKGIDPF
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB5 SLDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
:::.:.:.::::::::::::::::.:::::.:.:::.::. :::::::::::::::::::
CCDS54 SLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB5 TFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAIDDGCVVPGAGAVEVAMAE
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CCDS54 TFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMVPGAGAIEVAMAE
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::. .: :.::::.::::::::::::::::::::.:.: ::::::.:::: :: ::::::
CCDS54 ALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQAEHVESKQLVGVD
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530
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::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLK
450 460 470 480 490
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10 20 30 40 50
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: . : : : .: .:.. ::.::. . :..:: ::::. ::::.. : :
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.:.:::..:.:.:.:::.:. . ... .::. .:::::: ... ::.:. :. .. . .
CCDS11 VMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQM
60 70 80 90 100 110
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:: .. ... : . .. :..... .. : . .... .:. ::. .. ... . ..
CCDS11 HPTVVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIAL
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:.. .. .. . ::. . .. .. :. ..::..... . :: :.. ...
CCDS11 DAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPR
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:. . ::::.: : .. . :. .... :...:.. . ::.:: :
CCDS11 IVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLK------PD---
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:::..:::. .. : . .:.:.::... . .:.. :::. .. ..: : .: ::
CCDS11 VVITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAG
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CCDS11 LLEIKKIGDEYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLV
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CCDS11 PGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRA
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CCDS11 KHTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKK
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530
pF1KB5 SLKG
CCDS11 KGDDQSRQGGAPDAGQE
530 540
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...:.:: :..:.: : . :.. :.... : .: : ::..:.:.: .:: :
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..:.. ..::. .. ....: .:. .:.. ::.::.:...:. ::.:
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: : . ..: : :.: . : .... :.: . ..: ...: :: . :..:
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CCDS38 TAEKLGFAGLVQEISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCV
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. .:.....:.. .: . .:.: :. : . . : .. ::: . : .. :
CCDS38 NPIQTMTEVRARQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQ-HVIETLIGKKQQISLATQMVRMI
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520 530
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: .:.: . : :
CCDS38 LKIDDIRKPGESEE
530 540
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.. ....: .:. .:.. ::.::.:...:. ::.: :.:::: ::
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:: .: : ... . :.:. . : : :.. .:. ...: : : . ..
CCDS82 TC--PFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKE-----TGAN----LA
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: : :.: . : .... :.: . ..: ...: :: . :..:. . :: ::::
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: ..: ..:. ::.:.: :.::..:.: :: . . : ...:.: ...: : :. ::
CCDS82 EISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVY
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pF1KB5 GAGAVEVAMAEALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKIQAE
:.::.:.. : :. .. . : ...:::::: .:: .:..:::.. .:.....:.
CCDS82 GGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRAR
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pF1KB5 H-SESGQLVGVD-LNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMS
. .: . .:.: :. : . . : .. ::: . : .. :: .:.: . : :
CCDS82 QVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQ-HVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGES
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530
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CCDS82 EE
520
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pF1KB5 MAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
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CCDS77 MAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDG
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CCDS77 ATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIA
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CCDS77 DGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIAVNAVL
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.. ....: .:. .:.. ::.::.:...:. ::.: :.:::: ::
CCDS77 -TVADMERRD--VDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKIAIL
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pF1KB5 TCNVSLEYEKTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGFVV
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CCDS77 TC--PFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKET-----GAN----LA
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pF1KB5 INQKGIDPFSLDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPDCLGHAGLVY
: : :.: . : .... :.: . ..: ...: :: . :..:. . :: ::::
CCDS77 ICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQ
270 280 290 300 310 320
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pF1KB5 EYTLG--EEKFTFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAIDDGCVVP
: ..: ..:. ::.:.: :.::..:.: :: . . : ...:.: ...: : :. ::
CCDS77 EISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVY
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pF1KB5 GAGAVEVAMAEALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKIQAE
:.::.:.. : :. .. . : ...:::::: .:: .:..:::.. .:.....:.
CCDS77 GGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRAR
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pF1KB5 H-SESGQLVGVD-LNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMS
. .: . .:.: :. : . . : .. ::: . : .. :: .:.: . : :
CCDS77 QVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQ-HVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGES
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CCDS77 EE
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CCDS33 PRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDGKG
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pF1KB5 DIKLTKDGNVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISE
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CCDS33 DVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLLQK
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pF1KB5 GLHPRIITEGFEAAKEKALQFLEEVKVSREM-DRETLIDVARTSLRTKVHAELADVLTEA
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CCDS33 GIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYSSLLSPM
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pF1KB5 VVDSILAI--KKQDEPIDLFMIEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAC
:.... . .:: :.:.. . : :..:::: . . . . ::: :
CCDS33 SVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGIT-RVEKAK
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pF1KB5 ILTCNVSLEYEKTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGF
: . : ::.... . .. . ..... :: .: . ::.: :. :.
CCDS33 IGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQI---KKTGCN------
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pF1KB5 VVINQKGI--DPFS---LDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPDCL
:.. ::.: : .: : :.: :.... .:...: . . : . .:... : :
CCDS33 VLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADML
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pF1KB5 GHAGLVYEYTL-GEEKFTFIEKCNNP-RSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAI
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CCDS33 GSAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLV
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pF1KB5 DDGCVVPGAGAVEVAMAEALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQET
.. :.:: :. .: : ... ...: . :.:::::. .::..::.:.:.. :
CCDS33 KKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPIST
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pF1KB5 LVKIQAEHSESGQLVGVDLNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIM
..... .:... . .:... : : : . :. . : : . .:: .:...
CCDS33 VTELRNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV
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pF1KB5 RAGMSSLKG
CCDS33 NTR
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