Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB4854
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4854, 1226 aa
1>>>pF1KB4854 1226 - 1226 aa - 1226 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2377+/-0.000999; mu= -3.6602+/- 0.061
mean_var=280.4619+/-57.004, 0's: 0 Z-trim(113.9): 48 B-trim: 37 in 1/52
Lambda= 0.076584
statistics sampled from 14412 (14452) to 14412 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.444), width: 16
Scan time: 4.510
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226) 8159 915.6 0
CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251) 8034 901.8 0
CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218) 1312 159.1 6.4e-38
CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210) 1307 158.5 9.3e-38
CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163) 1142 140.3 2.8e-32
CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 1005 125.1 1.1e-27
CCDS55521.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX ( 952) 771 99.2 5.1e-20
CCDS78510.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 771 99.3 6.6e-20
CCDS14684.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1311) 771 99.3 6.7e-20
>>CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226 aa)
initn: 8159 init1: 8159 opt: 8159 Z-score: 4882.7 bits: 915.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8159; 99.9% identity (100.0% similar) in 1226 aa overlap (1-1226:1-1226)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 KGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 QPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTMGWQKAGHPPSDGQQRATQQGSLRTLLGDGVGRQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTMGWQKAGHPPSDGQQRATQQGSLRTLLGDGVGRQQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 QDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 CVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 SSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 PILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAP
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 GSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 NCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 KSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 APVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 APVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 HLPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HLPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 SSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 RPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGH
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 RDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 GPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 DHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNAS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 ALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVT
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220
pF1KB4 LHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
1210 1220
>>CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251 aa)
initn: 8132 init1: 8033 opt: 8034 Z-score: 4807.9 bits: 901.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8089; 97.9% identity (98.0% similar) in 1251 aa overlap (1-1226:1-1251)
10 20 30
pF1KB4 MDSFDLALLQEWDLESL-----------------------C--VYEPDRNALRRKERERR
::::::::::::::::: : :::::::::::::::::
CCDS33 MDSFDLALLQEWDLESLWGEDILNQRNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERR
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 NQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGV
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 PKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTMGWQKAGHPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTMGWQKAGHPP
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 SDGQQRATQQGSLRTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SDGQQRATQQGSLRTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQN
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 FPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 RAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKD
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 SQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDS
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 AVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSS
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 PEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS33 PEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQ
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 PSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENA
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB4 PAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRA
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB4 SHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQT
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730 740 750
pF1KB4 VAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLS
730 740 750 760 770 780
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pF1KB4 PLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALP
790 800 810 820 830 840
820 830 840 850 860 870
pF1KB4 KSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKM
850 860 870 880 890 900
880 890 900 910 920 930
pF1KB4 LRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAH
910 920 930 940 950 960
940 950 960 970 980 990
pF1KB4 NNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMV
970 980 990 1000 1010 1020
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB4 EKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB4 EDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB4 TPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYW
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1180 1190 1200 1210 1220
pF1KB4 EMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS
1210 1220 1230 1240 1250
>>CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218 aa)
initn: 1524 init1: 449 opt: 1312 Z-score: 794.3 bits: 159.1 E(32554): 6.4e-38
Smith-Waterman score: 1942; 34.8% identity (60.3% similar) in 1292 aa overlap (19-1220:14-1212)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTN
.:. ::: :: .:.::::::..:. .: . ::.:::::
CCDS54 MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTA
10 20 30 40 50
70 80 90 100
pF1KB4 KGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHL------VGVPK-PGVP------------
::::::.:::: ::::.:.:.::. .:. .: .: :: : .:
CCDS54 KGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFH
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140
pF1KB4 --------QTP------VNKIDEHF-VADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTM
.:: :..:... .:. :.. .:: . . . . : . . :.. :
CCDS54 TSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPS-LHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQE
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 GW----QKAGHPPSDGQQRATQQGSL-RTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPA
:. .: : .::.. :. : . :. .. .: . . .. . :: : .
CCDS54 GFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSP-VPPLSPIHSNQQTLPRTQG
180 190 200 210 220 230
210 220
pF1KB4 MAAKHSSS----GHC-----------------------------VQNFPP-SLASKPSLV
. :.:: :.: :.::: :: :: .
CCDS54 SSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAM
240 250 260 270 280 290
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 QQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPE-PARAKAKLSKFSI
::::::::::::::::::.:::.:: : .:: : . . :::::.:...
CCDS54 QQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE------DYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKM
300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 PKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGH
:.:. :.. :.:.. :::::..::: : :::.::..:. .::.:::::.:::: :::
CCDS54 PSQSVEQTYSNEVH-CVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVT
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 NNPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPN
.: :. :. .. .:. ..:: ::::::.::..:. . .:. .. :.:: :.
CCDS54 QNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPP----SSSA---PPS
410 420 430 440 450
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 CRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPAS
:.: .:. :::. : :.:::.::: :::.:::::.:: ..: . .:: :: .
CCDS54 APQSLPEPV-ASAHSSSAESESTSDSDSSS--DSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPT
460 470 480 490 500 510
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 SNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQPSLREK
.::::::.::.::. : :: .: .:.. : .. .. :. . : .
CCDS54 TNKWQLDNWLTKVSQPAAPP-------EGPRSTE---PPRRHPESKGS-----SDSATSQ
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: ..: : .:..:.: .. .:. .:. ::: ...:.
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1010 1020 1030 1040 1050 1060
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1130 1140 1150 1160 1170 1180
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CCDS76 NKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL
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CCDS55 IPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAP---AKPDHKETATKPKR
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.:. : .:: ::.:::.: . . : :. : . : : . . :
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:. . : :.::.. :.::: . .. ....... : : : .:. .: ::
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CCDS55 RYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNAS
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CCDS55 KVAQIPSPWVSNGKN--TPSPVSLNN--VSPINAMGNCNNG----P---VTIPQRIHHMA
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CCDS55 LRIDAHLL
950
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CCDS78 EFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPDIS
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CCDS78 PTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDP-SCVEEIL
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pF1KB4 REMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSML
:: :: .. : . : .: .. ...: :::
CCDS78 RE---------------------------SQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSML
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pF1KB4 EDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTS-----VPSSKGSSSSSSSGS
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CCDS78 EDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGG
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CCDS78 SGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKS
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pF1KB4 PILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKVP-DVCQ-PSL-REKEIKSTCKEEQRPRTAN
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CCDS78 FICGQNETP-METISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQ
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CCDS78 KIPETKALKHKLSTTSETVS----------------------QRTIGKKQPKKVEKNTST
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: . .:. ... :: . : .. . ::: : .. ::.. ::
CCDS78 DEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGP
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CCDS78 GKIVPKSREFIETDSSTSDSNTD------QEE-TLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEIC--G
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