Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB3278
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3278, 909 aa
1>>>pF1KB3278 909 - 909 aa - 909 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5923+/-0.000916; mu= 19.5297+/- 0.055
mean_var=69.5202+/-13.838, 0's: 0 Z-trim(105.5): 64 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.153822
statistics sampled from 8368 (8433) to 8368 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 3.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 938) 5712 1277.3 0
CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 885) 5709 1276.6 0
CCDS7032.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 901) 5709 1276.6 0
CCDS55354.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 943) 4476 1003.0 0
CCDS55355.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 906) 4473 1002.3 0
CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19 (1043) 934 216.9 1.5e-55
CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9 (1115) 928 215.6 4e-55
CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs108|chr19 (1336) 851 198.6 6.6e-50
CCDS82658.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 920) 835 195.0 5.6e-49
CCDS5048.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 908) 834 194.7 6.5e-49
CCDS42913.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 918) 827 193.2 1.9e-48
CCDS82659.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 949) 827 193.2 2e-48
CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1281) 826 193.0 3e-48
CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1464) 826 193.1 3.3e-48
CCDS5049.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 869) 822 192.1 3.9e-48
CCDS55045.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 892) 822 192.1 4e-48
CCDS8662.1 GRIN2B gene_id:2904|Hs108|chr12 (1484) 815 190.6 1.8e-47
CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 ( 873) 796 186.3 2.2e-46
CCDS32724.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 (1233) 796 186.4 2.9e-46
CCDS33530.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 905) 776 181.9 4.8e-45
CCDS416.1 GRIK3 gene_id:2899|Hs108|chr1 ( 919) 773 181.2 7.8e-45
CCDS82656.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 934) 768 180.1 1.7e-44
CCDS12595.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 980) 735 172.8 2.8e-42
CCDS77305.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 981) 723 170.1 1.8e-41
CCDS8433.1 GRIK4 gene_id:2900|Hs108|chr11 ( 956) 708 166.8 1.8e-40
CCDS3637.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 (1007) 626 148.6 5.5e-35
CCDS68758.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 ( 912) 590 140.6 1.3e-32
CCDS43275.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 836) 549 131.5 6.6e-30
CCDS3797.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 549 131.5 6.9e-30
CCDS43274.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 549 131.5 6.9e-30
CCDS31236.1 GRID1 gene_id:2894|Hs108|chr10 (1009) 547 131.1 1.1e-29
CCDS58986.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 826) 542 129.9 1.9e-29
CCDS58989.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 837) 542 129.9 1.9e-29
CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 542 129.9 2.1e-29
CCDS4322.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 542 129.9 2.1e-29
CCDS58988.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 542 129.9 2.1e-29
CCDS58987.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 542 129.9 2.1e-29
CCDS41706.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 884) 529 127.0 1.5e-28
CCDS8333.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 902) 529 127.0 1.5e-28
CCDS14605.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 362 90.0 2.2e-17
CCDS14604.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 362 90.0 2.2e-17
>>CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 (938 aa)
initn: 5709 init1: 5709 opt: 5712 Z-score: 6841.9 bits: 1277.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5712; 97.2% identity (98.1% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-888)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSTMRLLTLALLFSCSVARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 MSTMRLLTLALLFSCSVARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTAGFYRIPVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 NATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTAGFYRIPVLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIILLVSDDHEGRAAQKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIILLVSDDHEGRAAQKRL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 ETLLEERESKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEAKELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 ETLLEERESKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEAKELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGILGLQLINGKNESAHISDAVGVVAQAVHELLEKEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 TGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGILGLQLINGKNESAHISDAVGVVAQAVHELLEKEN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ITDPPRGCVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNLQNRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 ITDPPRGCVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNLQNRK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 KEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 DGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 LVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 LTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 EERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 EERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 VRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 VRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSH
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 ENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNAPATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIEIAYKRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 ENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNAPATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIEIAYKRH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 KDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQVGQATLRGLVPRARPGHGPPPSPKAVALALALVGRTG
::::::::::::::::::::::: .. ::.: . .:.. .::
CCDS70 KDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQDRKS------GRAEPDPKKKATFRAITSTLASSFKRR
850 860 870 880 890
pF1KB3 ARSHGQGQW
CCDS70 RSSKDTSTGGGRGALQNQKDTVLPRRAIEREEGQLQLCSRHRES
900 910 920 930
>>CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 (885 aa)
initn: 5709 init1: 5709 opt: 5709 Z-score: 6838.7 bits: 1276.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5709; 100.0% identity (100.0% similar) in 863 aa overlap (1-863:1-863)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSTMRLLTLALLFSCSVARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSTMRLLTLALLFSCSVARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTAGFYRIPVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTAGFYRIPVLG
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pF1KB3 LTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIILLVSDDHEGRAAQKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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190 200 210 220 230 240
pF1KB3 ETLLEERESKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEAKELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ETLLEERESKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEAKELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNM
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pF1KB3 TGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGILGLQLINGKNESAHISDAVGVVAQAVHELLEKEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGILGLQLINGKNESAHISDAVGVVAQAVHELLEKEN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ITDPPRGCVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNLQNRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ITDPPRGCVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNLQNRK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTC
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pF1KB3 KEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA
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490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTI
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550 560 570 580 590 600
pF1KB3 LVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDA
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pF1KB3 LTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LTLSSAMWFSWGVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRP
610 620 630 640 650 660
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pF1KB3 EERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 VRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSH
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 ENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNAPATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIEIAYKRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNAPATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIEIAYKRH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 KDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQVGQATLRGLVPRARPGHGPPPSPKAVALALALVGRTG
:::::::::::::::::::::::
CCDS43 KDARRKQMQLAFAAVNVWRKNLQQYHPTDITGPLNLSDPSVSTVV
850 860 870 880
>>CCDS7032.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 (901 aa)
initn: 5709 init1: 5709 opt: 5709 Z-score: 6838.5 bits: 1276.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5709; 100.0% identity (100.0% similar) in 863 aa overlap (1-863:1-863)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSTMRLLTLALLFSCSVARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 MSTMRLLTLALLFSCSVARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTAGFYRIPVLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 NATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTAGFYRIPVLG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIILLVSDDHEGRAAQKRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIILLVSDDHEGRAAQKRL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 ETLLEERESKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEAKELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 ETLLEERESKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEAKELEARVIILSASEDDAATVYRAAAMLNM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGILGLQLINGKNESAHISDAVGVVAQAVHELLEKEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 TGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGILGLQLINGKNESAHISDAVGVVAQAVHELLEKEN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ITDPPRGCVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNLQNRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 ITDPPRGCVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNLQNRK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LVQVGIYNGTHVIPNDRKIIWPGGETEKPRGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 KEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS55 IVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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. .:.. .::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFC
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CCDS55 IDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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CCDS55 STMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNAPATLTFENMAGVFML
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: : . :. : : ... ..:. :. : :.:. :.
CCDS32 AL-APRLPHNLSLELVVAAPPARDPASLTRGLCQALVPPGVAALLAFPEARPEL----LQ
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pF1KB3 VSYTAGFYRIPVLGLTTRMS---IYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHI
. . :. . :::.: : . . . . .::. :. . : .: ......:. .
CCDS32 LHFLAAATETPVLSLLRREARAPLGAPNPFHLQ-LHWASPLETLLDVLVAVLQAHAWEDV
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: . ..: : .: : : .. . ::.. : : .. : : .
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pF1KB3 VIILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYA--PDGILGLQLINGK
. :. . . :: .:. . : ::.: . .:: : : :.:.: .
CCDS32 EAPVPAAVLLGCDIARARRVLEAVPPGPHWLLGT-PLPPKALPTAGLPPGLLALGEVARP
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pF1KB3 NESAHISDAVGVVAQAVH---ELLEKENITDPPRGCVGNTNIWKTGP-----LFKRVLMS
: : : : .::.:. .. :. . : .: :. . .:: .. : : .
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... .: :: : . ... ... .... .:. : . . . . . . ::: .
CCDS32 TSF-QGRTGPVWVTGSSQVHMSRHFKVWSLR-RDPRGAPAWATVGSWRDGQLDLEPGGAS
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390 400 410 420 430 440
pF1KB3 EKP---RGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGP--ND
.: .: :. .:..::. ..:::... :: : :. . .: : ::
CCDS32 ARPPPPQGAQVWPKLRVVTLLEHPFVFARDPDEDGQC---------PAGQ-LCLDPGTND
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pF1KB3 TSP----------GSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVN
.. :: ... .::::.::::: .::. : .:..::.:::.:. .
CCDS32 SATLDALFAALANGSAPRALRKCCYGYCIDLLERLAEDTPFDFELYLVGDGKYGALR---
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.:.:..:.::.:.: : :. ..::. :.: ..:..:: .: :.:. . : .
CCDS32 ---DGRWTGLVGDLLAGRAHMAVTSFSINSARSQVVDFTSPFFSTSLGIMVRARDTASPI
510 520 530 540 550 560
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pF1KB3 DSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSW
.:: :.. . :: : ..:..:..: . . ::.: . ... ... :::. . .
CCDS32 GAFMWPLHWSTWLGVFAALHLTALFLTVYEWRSPYGLTPRG--RNRSTVFSYSSALNLCY
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pF1KB3 GVLLNSGIGEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPR
..:. .. .:. ..:.: .:: : .....:::::::: .: :. :...::.::.
CCDS32 AILFRRTVSSKTPKCPTGRLLMNLWAIFCLLVLSSYTANLAAVMVGDKTFEELSGIHDPK
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pF1KB3 LRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDN--KLHAF
:..:.. : ..:: .::.. :.... . :. ::..:. .. ... . .. ::.::
CCDS32 LHHPAQGFRFGTVWESSAEAYIKKS--FPDMHAHMRRHSAPTTPRGVAMLTSDPPKLNAF
690 700 710 720 730 740
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pF1KB3 IWDSAVLEFEAS--QKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMED
: :...:..:.: : :.:.:. : :.:::. ..:: .:.: : . . .::..
CCDS32 IMDKSLLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPQNSPLTSNLSEFISRYKSSGFIDL
750 760 770 780 790 800
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 LDKTWVRYQECDSRSNAPAT---LTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIEIAYKRHKDAR
: : .. : .: : . ... ..::.:.:. :. .... . : :. : :
CCDS32 LHDKWYKMVPCGKRVFAVTETLQMSIYHFAGLFVLLCLGLGSALLSSLGEHAFFRLALPR
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850 860 870 880 890 900
pF1KB3 -RKQMQLAFAAVNVWRKNLQVGQATLRGLVPRARPGHGPPPSPKAVALALALVGRTGARS
:: .: .
CCDS32 IRKGSRLQYWLHTSQKIHRALNTEPPEGSKEETAEAEPSGPEVEQQQQQQDQPTAPEGWK
870 880 890 900 910 920
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pF1KB3 NQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCEDLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTP
:::. .. . : :.: . : . .. .
CCDS67 AIEAGLGDLPLLPFSSPSSPWSSDPFSFLQSVCHTVVVQGVSALL-AFPQSQGEMMELDL
160 170 180 190 200 210
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 VSYTAGFYRIPVLGLTTR-MSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYSWNHIIL
:: . .:::.... . . :.. .::. : : ...: .. . .: .. :
CCDS67 VSLV---LHIPVISIVRHEFPRESQNPLHLQ-LSLENSLSSDADVTVSILTMNNWYNFSL
220 230 240 250 260
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: :.:.:..:.: : :.:.:. : :.:::. .:: :.: : . . .:::.
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