Result of FASTA (omim) for
pFN21AB3246
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3246, 1042 aa
1>>>pF1KB3246 1042 - 1042 aa - 1042 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9802+/-0.000464; mu= 23.5626+/- 0.029
mean_var=66.2783+/-13.802, 0's: 0 Z-trim(109.3): 216 B-trim: 486 in 1/51
Lambda= 0.157539
statistics sampled from 17201 (17436) to 17201 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.534), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16
Scan time: 13.980
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_733765 (OMIM: 101900,108740,124200) sarcoplasmi (1042) 6865 1570.2 0
NP_001672 (OMIM: 101900,108740,124200) sarcoplasmi ( 997) 6510 1489.5 0
XP_005253945 (OMIM: 101900,108740,124200) PREDICTE ( 999) 6510 1489.5 0
XP_011536704 (OMIM: 101900,108740,124200) PREDICTE ( 999) 6510 1489.5 0
NP_004311 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/endop ( 994) 5599 1282.5 0
NP_775293 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/endop (1001) 5599 1282.5 0
XP_011522191 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1024) 5191 1189.8 0
XP_011522190 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1028) 5191 1189.8 0
NP_777618 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1029) 5191 1189.8 0
NP_777616 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1029) 5191 1189.8 0
XP_011522187 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1042) 5191 1189.8 0
NP_777615 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1043) 5191 1189.8 0
NP_777614 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1044) 5191 1189.8 0
NP_777613 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1052) 5191 1189.8 0
XP_016880181 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1062) 5191 1189.8 0
XP_011522186 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1069) 5191 1189.8 0
XP_011522184 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1084) 5191 1189.8 0
XP_011522183 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1114) 5191 1189.8 0
NP_777617 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic ( 998) 5183 1187.9 0
NP_005164 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic ( 999) 5183 1187.9 0
NP_001273004 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/en ( 869) 4930 1130.4 0
XP_016880182 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1020) 4793 1099.3 0
XP_011522194 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi ( 540) 2705 624.5 4.7e-178
XP_011510988 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 671) 723 174.1 2.3e-42
NP_001186113 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 903) 723 174.2 2.9e-42
NP_055197 (OMIM: 169600,604384) calcium-transporti ( 919) 723 174.2 2.9e-42
NP_001186108 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 919) 723 174.2 2.9e-42
NP_001186112 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 923) 723 174.2 2.9e-42
XP_005247415 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 933) 723 174.2 2.9e-42
NP_001001487 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 939) 723 174.2 2.9e-42
XP_016861653 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 939) 723 174.2 2.9e-42
NP_001186111 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 944) 723 174.2 3e-42
NP_001001486 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 949) 723 174.2 3e-42
XP_005247412 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 949) 723 174.2 3e-42
XP_005247413 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 949) 723 174.2 3e-42
NP_001186110 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 953) 723 174.2 3e-42
NP_001186109 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 973) 723 174.3 3e-42
XP_005247411 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 983) 723 174.3 3e-42
NP_001001485 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 888) 717 172.9 7.2e-42
NP_001186114 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 888) 717 172.9 7.2e-42
NP_001278383 (OMIM: 613082) calcium-transporting A ( 795) 687 166.0 7.5e-40
NP_055676 (OMIM: 613082) calcium-transporting ATPa ( 946) 687 166.1 8.6e-40
XP_011521789 (OMIM: 613082) PREDICTED: calcium-tra ( 632) 623 151.4 1.5e-35
NP_000695 (OMIM: 137216) potassium-transporting AT (1035) 563 137.9 2.8e-31
XP_011507884 (OMIM: 607321) PREDICTED: sodium/pota ( 970) 559 137.0 5e-31
NP_653300 (OMIM: 607321) sodium/potassium-transpor (1029) 559 137.0 5.3e-31
NP_000693 (OMIM: 104290,182340,602481) sodium/pota (1020) 511 126.1 1e-27
NP_001667 (OMIM: 182360) potassium-transporting AT (1039) 499 123.4 6.7e-27
NP_001172014 (OMIM: 182360) potassium-transporting (1045) 499 123.4 6.8e-27
XP_016856850 (OMIM: 182310) PREDICTED: sodium/pota ( 992) 493 122.0 1.7e-26
>>NP_733765 (OMIM: 101900,108740,124200) sarcoplasmic/en (1042 aa)
initn: 6865 init1: 6865 opt: 6865 Z-score: 8423.4 bits: 1570.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6865; 100.0% identity (100.0% similar) in 1042 aa overlap (1-1042:1-1042)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EYEPEMGKVYRQDRKSVQRIKAKDIVPGDIVEIAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 EYEPEMGKVYRQDRKSVQRIKAKDIVPGDIVEIAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 TGESVSVIKHTDPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 TGESVSVIKHTDPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ATEQERTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 ATEQERTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 MSVCRMFILDRVEGDTCSLNEFTITGSTYAPIGEVHKDDKPVNCHQYDGLVELATICALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 MSVCRMFILDRVEGDTCSLNEFTITGSTYAPIGEVHKDDKPVNCHQYDGLVELATICALC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 NDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVFDTELKGLSKIERANACNSVIKQLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 NDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVFDTELKGLSKIERANACNSVIKQLMK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 KEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSMSKMFVKGAPEGVIDRCTHIRVGSTKVPMTSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 KEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSMSKMFVKGAPEGVIDRCTHIRVGSTKVPMTSGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 KQKIMSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMHLEDSANFIKYETNLTFVGCVGMLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 KQKIMSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMHLEDSANFIKYETNLTFVGCVGMLD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 PPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQDEDVTSKAFTGREFDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 PPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQDEDVTSKAFTGREFDEL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 NPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 NPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 SGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 SGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAAL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 GFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 GFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 CYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 CYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMAL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 SVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 SVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 LNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPGKECVQPATKSCSFSACTDGISWPFVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_733 LNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPGKECVQPATKSCSFSACTDGISWPFVL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040
pF1KB3 LIMPLVIWVYSTDTNFSDMFWS
::::::::::::::::::::::
NP_733 LIMPLVIWVYSTDTNFSDMFWS
1030 1040
>>NP_001672 (OMIM: 101900,108740,124200) sarcoplasmic/en (997 aa)
initn: 6510 init1: 6510 opt: 6510 Z-score: 7987.6 bits: 1489.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6510; 100.0% identity (100.0% similar) in 993 aa overlap (1-993:1-993)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EYEPEMGKVYRQDRKSVQRIKAKDIVPGDIVEIAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EYEPEMGKVYRQDRKSVQRIKAKDIVPGDIVEIAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 TGESVSVIKHTDPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGESVSVIKHTDPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ATEQERTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATEQERTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
310 320 330 340 350 360
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pF1KB3 MSVCRMFILDRVEGDTCSLNEFTITGSTYAPIGEVHKDDKPVNCHQYDGLVELATICALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSVCRMFILDRVEGDTCSLNEFTITGSTYAPIGEVHKDDKPVNCHQYDGLVELATICALC
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVFDTELKGLSKIERANACNSVIKQLMK
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490 500 510 520 530 540
pF1KB3 KEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSMSKMFVKGAPEGVIDRCTHIRVGSTKVPMTSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSMSKMFVKGAPEGVIDRCTHIRVGSTKVPMTSGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 KQKIMSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMHLEDSANFIKYETNLTFVGCVGMLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KQKIMSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMHLEDSANFIKYETNLTFVGCVGMLD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 PPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQDEDVTSKAFTGREFDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQDEDVTSKAFTGREFDEL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 NPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 SGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAAL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 GFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 CYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMAL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 SVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 LNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPGKECVQPATKSCSFSACTDGISWPFVL
:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPAILE
970 980 990
1030 1040
pF1KB3 LIMPLVIWVYSTDTNFSDMFWS
>>XP_005253945 (OMIM: 101900,108740,124200) PREDICTED: s (999 aa)
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Smith-Waterman score: 6510; 100.0% identity (100.0% similar) in 993 aa overlap (1-993:1-993)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALK
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TGESVSVIKHTDPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 SGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAAL
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pF1KB3 GFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIG
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pF1KB3 CYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 SVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITP
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pF1KB3 LNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPGKECVQPATKSCSFSACTDGISWPFVL
:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPVLSSEL
970 980 990
1030 1040
pF1KB3 LIMPLVIWVYSTDTNFSDMFWS
>>XP_011536704 (OMIM: 101900,108740,124200) PREDICTED: s (999 aa)
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Smith-Waterman score: 6510; 100.0% identity (100.0% similar) in 993 aa overlap (1-993:1-993)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 TGESVSVIKHTDPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TGESVSVIKHTDPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMV
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pF1KB3 ATEQERTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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310 320 330 340 350 360
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pF1KB3 MSVCRMFILDRVEGDTCSLNEFTITGSTYAPIGEVHKDDKPVNCHQYDGLVELATICALC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSMSKMFVKGAPEGVIDRCTHIRVGSTKVPMTSGV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 PPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQDEDVTSKAFTGREFDEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 NPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAMG
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pF1KB3 SGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAAL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 GFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIG
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pF1KB3 CYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMAL
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pF1KB3 SVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 LNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPGKECVQPATKSCSFSACTDGISWPFVL
:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPVLSSEL
970 980 990
1030 1040
pF1KB3 LIMPLVIWVYSTDTNFSDMFWS
>>NP_004311 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/endoplasm (994 aa)
initn: 5597 init1: 2887 opt: 5599 Z-score: 6868.6 bits: 1282.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5599; 84.4% identity (95.3% similar) in 993 aa overlap (1-992:1-993)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDL
:: ::.::.:: :..:::.:.:::. .:::. :..: ::::::::::: ::::::::::
NP_004 MEAAHAKTTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRNLEKYGLNELPAEEGKTLWELVIEQFEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_004 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EYEPEMGKVYRQDRKSVQRIKAKDIVPGDIVEIAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSIL
::::::::::: ::::::::::.:::::::::.:::::::::::. .:::::::::::::
NP_004 EYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 TGESVSVIKHTDPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMV
:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:.:..:::.::::::::.:.
NP_004 TGESVSVIKHTEPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMA
190 200 210 220 230 240
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pF1KB3 ATEQERTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAV
::::..::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::::::::.:::::::::::
NP_004 ATEQDKTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICVAVWLINIGHFNDPVHGGSWFRGAIYYFKIAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 MSVCRMFILDRVEGDTCSLNEFTITGSTYAPIGEVHKDDKPVNCHQYDGLVELATICALC
::::.:::.:.:.:: : ::::.:::::::: ::: :.:::: :::::::::::::::
NP_004 MSVCKMFIIDKVDGDICLLNEFSITGSTYAPEGEVLKNDKPVRPGQYDGLVELATICALC
370 380 390 400 410 420
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pF1KB3 NDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVFDTELKGLSKIERANACNSVIKQLMK
:::.::.::::::::::::::::::: ::::::::.:....:::.::::::::::.::::
NP_004 NDSSLDFNEAKGVYEKVGEATETALTTLVEKMNVFNTDVRSLSKVERANACNSVIRQLMK
430 440 450 460 470 480
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pF1KB3 KEFTLEFSRDRKSMSVYCTPNKPSRTSM-SKMFVKGAPEGVIDRCTHIRVGSTKVPMTSG
::::::::::::::::::.: : ::... .:::::::::::::::...:::.:.::.:.
NP_004 KEFTLEFSRDRKSMSVYCSPAKSSRAAVGNKMFVKGAPEGVIDRCNYVRVGTTRVPLTGP
490 500 510 520 530 540
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pF1KB3 VKQKIMSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMHLEDSANFIKYETNLTFVGCVGML
::.:::.::.:::.: ::::::::::.:.: .:::: :.::: :..:::.::::: ::::
NP_004 VKEKIMAVIKEWGTGRDTLRCLALATRDTPPKREEMVLDDSARFLEYETDLTFVGVVGML
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 DPPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQDEDVTSKAFTGREFDE
:::: ::..:..:::.::::::::::::::::.::::::::::..:.:...:.::::::.
NP_004 DPPRKEVTGSIQLCRDAGIRVIMITGDNKGTAIAICRRIGIFGENEEVADRAYTGREFDD
610 620 630 640 650 660
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pF1KB3 LNPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAM
: . ::.:: : :::::::::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LPLAEQREACRRACCFARVEPSHKSKIVEYLQSYDEITAMTGDGVNDAPALKKAEIGIAM
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 LGFPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAI
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::.::::::::::::::.::
NP_004 LGLPEALIPVQLLWVNLVTDGLPATALGFNPPDLDIMDRPPRSPKEPLISGWLFFRYMAI
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 GCYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMA
: ::::::::::::::. :. ::.:.. ::.::.:: ::: :::.:: .::.: :::::
NP_004 GGYVGAATVGAAAWWFLYAEDGPHVNYSQLTHFMQCTEDNTHFEGIDCEVFEAPEPMTMA
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 LSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQIT
:::::::::::::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::.:::.::..
NP_004 LSVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWVNIWLLGSICLSMSLHFLILYVDPLPMIFKLR
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 PLNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPGKECVQPATKSCSFSACTDGISWPFV
:..:::::::::::::: .:: ::::::::::
NP_004 ALDLTQWLMVLKISLPVIGLDEILKFVARNYLEG
970 980 990
1020 1030 1040
pF1KB3 LLIMPLVIWVYSTDTNFSDMFWS
>>NP_775293 (OMIM: 108730,601003) sarcoplasmic/endoplasm (1001 aa)
initn: 5597 init1: 2887 opt: 5599 Z-score: 6868.6 bits: 1282.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5599; 84.4% identity (95.3% similar) in 993 aa overlap (1-992:1-993)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDL
:: ::.::.:: :..:::.:.:::. .:::. :..: ::::::::::: ::::::::::
NP_775 MEAAHAKTTEECLAYFGVSETTGLTPDQVKRNLEKYGLNELPAEEGKTLWELVIEQFEDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVANAIVGVWQERNAENAIEALK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_775 LVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILIANAIVGVWQERNAENAIEALK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EYEPEMGKVYRQDRKSVQRIKAKDIVPGDIVEIAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSIL
::::::::::: ::::::::::.:::::::::.:::::::::::. .:::::::::::::
NP_775 EYEPEMGKVYRADRKSVQRIKARDIVPGDIVEVAVGDKVPADIRILAIKSTTLRVDQSIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 TGESVSVIKHTDPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMV
:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:.:..:::.::::::::.:.
NP_775 TGESVSVIKHTEPVPDPRAVNQDKKNMLFSGTNIAAGKALGIVATTGVGTEIGKIRDQMA
190 200 210 220 230 240
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NP_775 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
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pF1KB3 GSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAA
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XP_011 GSGTAVAKSAAEMVLSDDNFASIVAAVEEGRAIYSNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAI
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XP_011 TPDHTGLASLK
1020
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NP_777 TGESVSVTKHTEAIPDPRAVNQDKKNMLFSGTNITSGKAVGVAVATGLHTELGKIRSQMA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]